FADF - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FADF - Uncharacterized protein FadF

UniProt:	P45866	Sequences: MSGFLIANALLFLIVTAYAVYLFVYLVKTRLAYIKLGQKEQFDQRFKERLHAIWVNVFGQKKLLKDKKSGIIHVMFFYGFILVQFGAIDFIIKGLAPGRNLSLGPVYPAFTFFQEIVTFLILIAVGWAFYRRYIEKLVRLKRGFKAGLVLIFIGGLMLTVLLGNGMNLIWHEHGLSWSEPIASGIAFMLSGVGKTGAAVIFYIAWWIHLLFLLSFLVYVPQSKHAHLIAGPANVFFNRMESAGKLEKIDFTDETKESYGAGKIEDFRQSQLLDLYACVECGRCTNMCPATGTGKMLSPMDLILRLRDHLTEKGAAVTSRSPWVPAAAFRHTRGNQLAAASAGSGSQEAAAALDYNPSLIGDVITEEEIWACTTCRNCEDQCPVMNEHVDKIIDLRRYLVLTEGKMDSDAQRAMTSIERQGNPWGLNRKERENWRDEAPDAEIPTVKEMKKEGKEFEYLFWVGSMGSYDNRSQKIAISFAKLLNHAGVSFAILGNKEKNSGDTPRRLGNEFLFQELAEKNISEFEKNDVKKIVTIDPHAYNLFKNEYPDFGFEGEVYHHTEVLAELVKNGKLRPQHPLHETITFHDSCYLGRYNEVYDPPREILKAIPGVQLVEMERSRETGMCCGAGGGLMWMEEETGNRINVARTEQALAVNPSVISSGCPYCLTMLGDGTKAKEAEDQVKTYDVVELLAQSVLGADLKMGEKQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	705 (653)
Sequences:	830 (471)
Seq/√Len:	18.4

BACSU - FADF
HALSA - Q9HMZ3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
614_M	649_A	7.205	1.00
373_T	588_Y	6.417	1.00
562_L	690_L	6.408	1.00
481_L	562_L	6.308	1.00
481_L	690_L	5.987	1.00
684_Y	692_Q	4.036	1.00
564_E	568_N	4.035	1.00
481_L	694_V	3.891	1.00
495_K	526_N	3.606	1.00
429_E	432_N	3.514	1.00
590_G	596_Y	3.473	1.00
524_E	553_G	3.333	1.00
481_L	571_L	3.118	0.99
51_H	55_V	3.106	0.99
409_A	506_L	3.071	0.99
431_E	491_I	3.051	0.99
457_Y	561_V	3.015	0.99
639_N	644_A	2.967	0.99
497_K	518_K	2.945	0.99
459_F	475_A	2.940	0.99
647_E	675_K	2.925	0.99
165_G	185_I	2.908	0.99
366_E	370_A	2.891	0.99
253_E	256_E	2.890	0.99
415_S	424_G	2.835	0.98
530_K	554_E	2.827	0.98
590_G	621_G	2.797	0.98
169_I	197_A	2.760	0.98
436_E	476_I	2.681	0.98
245_L	392_I	2.680	0.98
304_R	367_E	2.633	0.97
597_D	618_R	2.582	0.97
463_S	498_N	2.559	0.97
264_E	312_K	2.554	0.97
459_F	478_F	2.548	0.97
560_E	595_V	2.529	0.97
573_P	690_L	2.529	0.97
463_S	538_A	2.526	0.97
535_D	538_A	2.503	0.97
456_E	530_K	2.491	0.96
368_I	394_L	2.435	0.96
520_I	524_E	2.431	0.96
366_E	637_T	2.418	0.96
79_G	121_I	2.398	0.96
86_G	114_Q	2.357	0.95
559_T	602_I	2.347	0.95
155_G	211_F	2.344	0.95
260_A	266_F	2.334	0.95
595_V	598_P	2.330	0.95
465_G	475_A	2.316	0.95
626_A	631_M	2.305	0.94
11_L	456_E	2.292	0.94
498_N	538_A	2.268	0.94
524_E	552_E	2.263	0.94
582_T	614_M	2.229	0.93
266_F	274_L	2.214	0.93
524_E	551_F	2.172	0.92
121_I	157_M	2.168	0.92
416_I	503_P	2.148	0.92
254_T	257_S	2.130	0.92
539_Y	560_E	2.129	0.92
457_Y	532_V	2.127	0.92
129_F	154_G	2.104	0.91
547_P	553_G	2.099	0.91
66_D	285_N	2.075	0.91
205_W	208_H	2.072	0.91
498_N	535_D	2.044	0.90
569_G	572_R	2.037	0.90
45_R	48_E	2.032	0.90
463_S	535_D	2.028	0.90
68_K	127_W	2.026	0.90
580_T	610_Q	2.020	0.89
292_T	644_A	2.011	0.89
459_F	479_A	2.009	0.89
352_L	355_N	2.000	0.89
646_T	671_G	1.983	0.88
199_V	203_I	1.967	0.88
218_Y	222_S	1.960	0.88
616_R	648_Q	1.941	0.87
52_A	237_N	1.921	0.87
478_F	534_I	1.920	0.87
164_N	182_A	1.920	0.87
148_L	152_F	1.915	0.87
373_T	392_I	1.901	0.86
482_L	532_V	1.870	0.85
580_T	612_V	1.861	0.85
523_F	551_F	1.854	0.85
126_G	154_G	1.850	0.85
133_Y	147_G	1.846	0.85
244_K	544_N	1.836	0.84
72_I	127_W	1.836	0.84
375_R	592_Y	1.831	0.84
119_F	181_I	1.821	0.84
294_K	638_G	1.787	0.82
320_S	323_V	1.763	0.82
122_L	157_M	1.759	0.81
413_M	508_N	1.757	0.81
520_I	549_F	1.749	0.81
50_L	235_F	1.744	0.81
421_N	424_G	1.729	0.80
262_K	265_D	1.724	0.80
521_S	524_E	1.723	0.80
150_L	153_I	1.718	0.80
478_F	532_V	1.693	0.79
602_I	690_L	1.691	0.79
547_P	551_F	1.674	0.78
170_W	197_A	1.658	0.77
481_L	602_I	1.644	0.77
158_L	193_G	1.623	0.76
631_M	642_N	1.607	0.75
470_R	665_L	1.607	0.75
46_F	235_F	1.606	0.75
294_K	635_E	1.599	0.75
168_L	186_A	1.585	0.74
656_V	689_L	1.582	0.74
12_F	206_W	1.578	0.74
365_E	404_K	1.563	0.73
208_H	215_F	1.561	0.73
481_L	687_V	1.561	0.73
484_H	694_V	1.560	0.73
373_T	388_V	1.553	0.72
514_E	517_E	1.548	0.72
166_M	189_L	1.543	0.72
305_L	689_L	1.540	0.72
250_F	256_E	1.537	0.72
506_L	629_G	1.537	0.72
370_A	637_T	1.537	0.72
512_F	516_A	1.536	0.72
417_E	508_N	1.536	0.72
87_A	160_V	1.526	0.71
481_L	691_A	1.524	0.71
271_L	274_L	1.519	0.71
452_G	488_S	1.518	0.71
122_L	154_G	1.504	0.70
76_F	128_A	1.503	0.70
42_F	268_Q	1.500	0.70
301_L	367_E	1.498	0.70
92_I	99_R	1.492	0.69
308_H	312_K	1.467	0.68
457_Y	530_K	1.462	0.68
201_F	205_W	1.449	0.67
294_K	508_N	1.448	0.67
469_N	472_Q	1.447	0.67
467_Y	660_G	1.428	0.66
227_L	231_P	1.424	0.66
556_Y	564_E	1.421	0.65
358_L	361_D	1.413	0.65
566_V	602_I	1.411	0.65
531_I	553_G	1.404	0.64
408_D	635_E	1.401	0.64
292_T	635_E	1.398	0.64
209_L	213_L	1.395	0.64
563_A	601_E	1.388	0.64
523_F	553_G	1.388	0.64
582_T	649_A	1.385	0.63
559_T	686_V	1.385	0.63
642_N	671_G	1.385	0.63
34_I	275_Y	1.380	0.63
602_I	686_V	1.376	0.63
87_A	208_H	1.376	0.63
596_Y	618_R	1.367	0.62
523_F	528_V	1.366	0.62
434_R	437_A	1.355	0.62
646_T	657_I	1.349	0.61
518_K	521_S	1.344	0.61
420_G	497_K	1.342	0.61
456_E	532_V	1.340	0.61
430_R	496_E	1.338	0.61
191_G	197_A	1.332	0.60
38_Q	265_D	1.327	0.60
431_E	434_R	1.326	0.60
263_I	305_L	1.325	0.60
212_L	216_L	1.323	0.60
20_V	24_V	1.319	0.59
639_N	647_E	1.312	0.59
26_L	217_V	1.300	0.58
284_T	290_T	1.300	0.58
56_N	384_M	1.296	0.58
64_L	70_G	1.292	0.58
292_T	508_N	1.291	0.58
160_V	164_N	1.290	0.58
270_Q	393_D	1.286	0.57
413_M	506_L	1.283	0.57
566_V	690_L	1.281	0.57
222_S	231_P	1.279	0.57
487_V	565_L	1.277	0.57
567_K	601_E	1.268	0.56
357_S	361_D	1.263	0.56
506_L	602_I	1.262	0.56
562_L	602_I	1.262	0.56
126_G	130_Y	1.260	0.56
443_P	488_S	1.251	0.55
281_G	299_M	1.248	0.55
351_A	354_Y	1.246	0.55
111_T	164_N	1.245	0.55
295_M	366_E	1.243	0.55
354_Y	358_L	1.242	0.55
166_M	200_I	1.227	0.54
539_Y	543_K	1.217	0.53
264_E	314_A	1.211	0.53
577_L	693_S	1.206	0.53
615_E	648_Q	1.204	0.52
230_G	383_V	1.204	0.52
544_N	593_N	1.202	0.52
18_Y	597_D	1.201	0.52
118_T	160_V	1.199	0.52
201_F	208_H	1.198	0.52
393_D	396_R	1.192	0.52
159_T	208_H	1.190	0.52
80_F	215_F	1.185	0.51
257_S	265_D	1.180	0.51
17_A	24_V	1.179	0.51
242_A	592_Y	1.176	0.51
484_H	573_P	1.172	0.50
215_F	224_H	1.164	0.50
463_S	499_S	1.163	0.50
156_L	159_T	1.163	0.50
508_N	635_E	1.160	0.50
55_V	61_K	1.159	0.50
487_V	564_E	1.157	0.50
364_T	367_E	1.147	0.49
180_P	184_G	1.143	0.49
256_E	400_L	1.143	0.49
432_N	435_D	1.142	0.49
300_D	304_R	1.142	0.49
351_A	355_N	1.142	0.49
60_Q	78_Y	1.140	0.48
423_W	631_M	1.139	0.48
107_Y	205_W	1.138	0.48
480_K	691_A	1.137	0.48
163_G	166_M	1.136	0.48
128_A	150_L	1.135	0.48
302_I	387_H	1.135	0.48
618_R	621_G	1.130	0.48
212_L	224_H	1.127	0.48
503_P	658_S	1.123	0.47
457_Y	556_Y	1.123	0.47
114_Q	160_V	1.120	0.47
260_A	265_D	1.118	0.47
459_F	532_V	1.117	0.47
11_L	521_S	1.116	0.47
443_P	489_F	1.114	0.47
215_F	223_K	1.113	0.47
558_H	687_V	1.110	0.47
409_A	413_M	1.109	0.47
160_V	163_G	1.109	0.47
373_T	531_I	1.107	0.46
416_I	502_T	1.107	0.46
670_D	673_K	1.107	0.46
116_I	180_P	1.106	0.46
293_G	301_L	1.105	0.46
481_L	566_V	1.105	0.46
161_L	181_I	1.105	0.46
622_M	648_Q	1.104	0.46
164_N	167_N	1.103	0.46
416_I	515_L	1.102	0.46
46_F	50_L	1.099	0.46
401_T	408_D	1.097	0.46
414_T	418_R	1.097	0.46
208_H	212_L	1.095	0.46
534_I	559_T	1.094	0.46
460_W	523_F	1.088	0.45
499_S	538_A	1.088	0.45
445_V	490_A	1.084	0.45
462_G	662_P	1.084	0.45
22_L	32_A	1.083	0.45
86_G	160_V	1.083	0.45
672_T	683_T	1.082	0.45
260_A	393_D	1.082	0.45
91_I	213_L	1.081	0.45
578_H	610_Q	1.080	0.45
44_Q	49_R	1.079	0.45
42_F	49_R	1.076	0.44
475_A	630_L	1.072	0.44
353_D	356_P	1.070	0.44
454_E	488_S	1.067	0.44
354_Y	360_G	1.065	0.44
495_K	525_K	1.063	0.44
189_L	193_G	1.061	0.44
286_M	620_T	1.058	0.43
161_L	169_I	1.056	0.43
564_E	578_H	1.053	0.43
644_A	648_Q	1.053	0.43
289_A	298_P	1.051	0.43
13_L	95_L	1.047	0.43
72_I	128_A	1.046	0.43
232_A	236_F	1.045	0.43
252_D	255_K	1.043	0.42
520_I	551_F	1.038	0.42
208_H	213_L	1.036	0.42
462_G	538_A	1.035	0.42
127_W	131_R	1.032	0.42
164_N	179_E	1.031	0.42
375_R	491_I	1.030	0.42
533_T	549_F	1.029	0.42
274_L	305_L	1.028	0.42
468_D	666_T	1.027	0.41
413_M	503_P	1.024	0.41
160_V	224_H	1.021	0.41
82_L	117_V	1.018	0.41
474_I	659_S	1.012	0.41
56_N	61_K	1.011	0.41
236_F	621_G	1.007	0.40
426_N	429_E	1.006	0.40
352_L	356_P	1.006	0.40
319_R	323_V	0.997	0.40
524_E	570_K	0.997	0.40
441_E	483_N	0.994	0.40
530_K	556_Y	0.994	0.40
158_L	210_L	0.992	0.39
293_G	370_A	0.990	0.39
408_D	508_N	0.989	0.39
443_P	487_V	0.988	0.39
269_S	273_D	0.987	0.39
270_Q	390_K	0.985	0.39
523_F	531_I	0.985	0.39
261_G	397_Y	0.985	0.39
462_G	509_E	0.984	0.39
508_N	671_G	0.981	0.39
622_M	655_S	0.979	0.39
530_K	561_V	0.975	0.38
208_H	220_P	0.975	0.38
428_K	494_N	0.974	0.38
204_A	216_L	0.972	0.38
401_T	586_S	0.971	0.38
75_M	120_L	0.971	0.38
75_M	124_A	0.970	0.38
445_V	455_F	0.969	0.38
211_F	214_S	0.969	0.38
478_F	506_L	0.968	0.38
586_S	671_G	0.967	0.38
406_D	422_P	0.966	0.38
468_D	684_Y	0.965	0.38
219_V	385_N	0.964	0.38
78_Y	223_K	0.963	0.38
484_H	691_A	0.963	0.38
573_P	693_S	0.960	0.38
614_M	652_V	0.960	0.38
650_L	654_P	0.956	0.37
483_N	489_F	0.956	0.37
49_R	239_M	0.955	0.37
579_E	656_V	0.953	0.37
394_L	398_L	0.953	0.37
278_V	385_N	0.950	0.37
445_V	495_K	0.950	0.37
470_R	688_E	0.948	0.37
233_N	273_D	0.947	0.37
146_A	279_E	0.946	0.37
95_L	160_V	0.946	0.37
423_W	464_M	0.936	0.36
184_G	521_S	0.932	0.36
509_E	662_P	0.931	0.36
524_E	547_P	0.930	0.36
194_K	198_A	0.929	0.36
112_F	180_P	0.927	0.36
146_A	160_V	0.925	0.35
617_S	639_N	0.924	0.35
460_W	499_S	0.924	0.35
301_L	391_I	0.922	0.35
408_D	413_M	0.920	0.35
155_G	207_I	0.919	0.35
559_T	563_A	0.918	0.35
476_I	479_A	0.917	0.35
118_T	161_L	0.917	0.35
434_R	476_I	0.915	0.35
154_G	158_L	0.910	0.35
179_E	182_A	0.910	0.35
60_Q	234_V	0.909	0.35
422_P	664_C	0.907	0.34
224_H	227_L	0.906	0.34
564_E	567_K	0.904	0.34
150_L	208_H	0.903	0.34
417_E	635_E	0.897	0.34
185_I	612_V	0.897	0.34
601_E	604_K	0.895	0.34
463_S	663_Y	0.894	0.34
188_M	552_E	0.894	0.34
301_L	305_L	0.894	0.34
224_H	275_Y	0.893	0.34
650_L	675_K	0.892	0.34
531_I	555_V	0.890	0.34
356_P	361_D	0.886	0.33
415_S	650_L	0.886	0.33
251_T	256_E	0.885	0.33
146_A	223_K	0.884	0.33
119_F	165_G	0.884	0.33
266_F	394_L	0.883	0.33
48_E	51_H	0.882	0.33
193_G	196_G	0.881	0.33
422_P	538_A	0.881	0.33
92_I	96_A	0.881	0.33
309_L	539_Y	0.881	0.33
396_R	504_R	0.877	0.33
45_R	195_T	0.874	0.33
391_I	394_L	0.873	0.33
464_M	631_M	0.871	0.32
159_T	207_I	0.869	0.32
104_G	131_R	0.868	0.32
654_P	657_I	0.867	0.32
596_Y	621_G	0.866	0.32
160_V	167_N	0.866	0.32
437_A	476_I	0.865	0.32
52_A	56_N	0.864	0.32
269_S	272_L	0.863	0.32
433_W	461_V	0.862	0.32
201_F	204_A	0.858	0.32
13_L	275_Y	0.858	0.32
24_V	28_K	0.857	0.32
496_E	505_R	0.854	0.32
258_Y	605_A	0.853	0.31
201_F	212_L	0.852	0.31
406_D	535_D	0.852	0.31
562_L	694_V	0.852	0.31
467_Y	641_I	0.850	0.31
266_F	393_D	0.849	0.31
460_W	558_H	0.848	0.31
519_N	546_Y	0.847	0.31
474_I	477_S	0.847	0.31
622_M	644_A	0.846	0.31
11_L	254_T	0.846	0.31
205_W	215_F	0.842	0.31
436_E	516_A	0.842	0.31
471_S	474_I	0.842	0.31
159_T	211_F	0.842	0.31
611_L	615_E	0.841	0.31
230_G	399_V	0.839	0.31
77_F	215_F	0.838	0.31
460_W	490_A	0.837	0.31
478_F	481_L	0.833	0.30
10_L	81_I	0.833	0.30
292_T	408_D	0.832	0.30
223_K	227_L	0.832	0.30
485_A	565_L	0.832	0.30
81_I	85_F	0.831	0.30
242_A	594_E	0.831	0.30
413_M	671_G	0.830	0.30
60_Q	224_H	0.827	0.30
294_K	417_E	0.827	0.30
82_L	113_F	0.822	0.30
28_K	32_A	0.821	0.30
463_S	502_T	0.821	0.30
353_D	358_L	0.820	0.30
687_V	694_V	0.818	0.30
160_V	182_A	0.817	0.30
71_I	676_E	0.816	0.30
508_N	638_G	0.813	0.29
87_A	114_Q	0.812	0.29
571_L	694_V	0.812	0.29
480_K	695_L	0.812	0.29
394_L	397_Y	0.811	0.29
408_D	630_L	0.809	0.29
154_G	562_L	0.807	0.29
426_N	467_Y	0.807	0.29
37_G	271_L	0.807	0.29
563_A	567_K	0.805	0.29
86_G	205_W	0.804	0.29
171_H	174_G	0.804	0.29
13_L	167_N	0.804	0.29
295_M	637_T	0.803	0.29
139_R	142_R	0.803	0.29
28_K	31_L	0.803	0.29
633_M	637_T	0.802	0.29
443_P	551_F	0.801	0.29
434_R	441_E	0.799	0.29
452_G	455_F	0.799	0.29
445_V	526_N	0.798	0.29
523_F	552_E	0.797	0.29
308_H	362_V	0.796	0.29
205_W	216_L	0.795	0.28
602_I	615_E	0.793	0.28
177_W	180_P	0.793	0.28
378_E	683_T	0.792	0.28
204_A	212_L	0.792	0.28
170_W	201_F	0.792	0.28
563_A	602_I	0.791	0.28
502_T	535_D	0.790	0.28
195_T	214_S	0.789	0.28
657_I	664_C	0.787	0.28
590_G	618_R	0.785	0.28
210_L	219_V	0.784	0.28
60_Q	115_E	0.783	0.28
456_E	556_Y	0.782	0.28
558_H	658_S	0.778	0.28
122_L	367_E	0.778	0.28
208_H	223_K	0.778	0.28
186_A	520_I	0.777	0.28
523_F	542_F	0.777	0.28
540_N	593_N	0.776	0.28
152_F	542_F	0.776	0.28
156_L	219_V	0.776	0.28
121_I	224_H	0.774	0.27
111_T	179_E	0.772	0.27
89_D	95_L	0.771	0.27
245_L	473_K	0.770	0.27
89_D	160_V	0.770	0.27
403_G	475_A	0.768	0.27
157_M	224_H	0.768	0.27
79_G	528_V	0.768	0.27
652_V	671_G	0.767	0.27
13_L	160_V	0.767	0.27
422_P	558_H	0.766	0.27
474_I	538_A	0.765	0.27
368_I	460_W	0.765	0.27
459_F	465_G	0.764	0.27
40_E	236_F	0.763	0.27
295_M	370_A	0.763	0.27
47_K	50_L	0.763	0.27
16_T	91_I	0.762	0.27
578_H	605_A	0.762	0.27
563_A	596_Y	0.761	0.27
195_T	254_T	0.761	0.27
593_N	686_V	0.761	0.27
502_T	543_K	0.760	0.27
81_I	186_A	0.760	0.27
66_D	139_R	0.759	0.27
312_K	650_L	0.758	0.27
205_W	218_Y	0.757	0.27
300_D	368_I	0.757	0.27
87_A	212_L	0.755	0.26
362_V	531_I	0.751	0.26
505_R	545_E	0.750	0.26
210_L	603_L	0.748	0.26
213_L	216_L	0.748	0.26
461_V	466_S	0.748	0.26
459_F	534_I	0.746	0.26
499_S	641_I	0.746	0.26
80_F	223_K	0.743	0.26
596_Y	619_E	0.743	0.26
233_N	269_S	0.741	0.26
426_N	432_N	0.739	0.26
467_Y	564_E	0.738	0.26
116_I	247_K	0.738	0.26
74_V	78_Y	0.737	0.26
180_P	183_S	0.737	0.26
214_S	218_Y	0.737	0.26
275_Y	310_T	0.736	0.26
556_Y	561_V	0.735	0.26
649_A	657_I	0.732	0.25
45_R	235_F	0.730	0.25
197_A	213_L	0.730	0.25
251_T	401_T	0.729	0.25
419_Q	426_N	0.728	0.25
12_F	94_G	0.727	0.25
465_G	631_M	0.727	0.25
153_I	224_H	0.727	0.25
118_T	157_M	0.726	0.25
493_G	588_Y	0.726	0.25
238_R	389_D	0.726	0.25
131_R	140_L	0.726	0.25
392_I	588_Y	0.725	0.25
49_R	235_F	0.724	0.25
267_R	270_Q	0.724	0.25
489_F	612_V	0.724	0.25
165_G	189_L	0.724	0.25
245_L	249_D	0.723	0.25
190_S	193_G	0.722	0.25
214_S	693_S	0.721	0.25
247_K	548_D	0.718	0.25
351_A	357_S	0.717	0.25
116_I	120_L	0.717	0.25
185_I	188_M	0.715	0.25
508_N	641_I	0.712	0.24
401_T	497_K	0.710	0.24
292_T	634_E	0.710	0.24
603_L	692_Q	0.709	0.24
630_L	633_M	0.708	0.24
83_V	117_V	0.708	0.24
477_S	570_K	0.707	0.24
34_I	37_G	0.704	0.24
83_V	164_N	0.704	0.24
115_E	164_N	0.704	0.24
118_T	146_A	0.703	0.24
402_E	408_D	0.703	0.24
153_I	160_V	0.701	0.24
88_I	101_L	0.700	0.24
606_I	611_L	0.699	0.24
559_T	606_I	0.698	0.24
257_S	261_G	0.698	0.24
454_E	530_K	0.697	0.24
284_T	303_L	0.697	0.24
65_K	380_Q	0.696	0.24
200_I	249_D	0.695	0.24
113_F	126_G	0.694	0.24
180_P	186_A	0.694	0.24
153_I	157_M	0.693	0.24
205_W	212_L	0.693	0.24
586_S	648_Q	0.692	0.24
629_G	659_S	0.692	0.24
386_E	614_M	0.689	0.23
366_E	388_V	0.689	0.23
78_Y	115_E	0.688	0.23
422_P	463_S	0.685	0.23
167_N	182_A	0.684	0.23
104_G	160_V	0.684	0.23
641_I	664_C	0.683	0.23
422_P	498_N	0.683	0.23
165_G	186_A	0.682	0.23
436_E	693_S	0.682	0.23
234_V	384_M	0.682	0.23
355_N	359_I	0.682	0.23
50_L	254_T	0.681	0.23
417_E	663_Y	0.681	0.23
267_R	520_I	0.681	0.23
498_N	663_Y	0.680	0.23
17_A	21_Y	0.679	0.23
38_Q	257_S	0.676	0.23
475_A	478_F	0.676	0.23
83_V	160_V	0.674	0.23
392_I	487_V	0.673	0.23
483_N	547_P	0.671	0.23
372_T	588_Y	0.671	0.23
203_I	552_E	0.670	0.23
372_T	533_T	0.670	0.23
201_F	215_F	0.670	0.23
630_L	635_E	0.668	0.22
547_P	552_E	0.667	0.22
163_G	204_A	0.667	0.22
479_A	489_F	0.667	0.22
83_V	87_A	0.665	0.22
161_L	182_A	0.664	0.22
275_Y	468_D	0.662	0.22
58_F	603_L	0.662	0.22
123_I	126_G	0.661	0.22
80_F	386_E	0.660	0.22
255_K	258_Y	0.660	0.22
13_L	34_I	0.659	0.22
86_G	208_H	0.659	0.22
606_I	609_V	0.658	0.22
562_L	573_P	0.657	0.22
421_N	425_L	0.657	0.22
32_A	679_D	0.657	0.22
543_K	549_F	0.657	0.22
394_L	401_T	0.657	0.22
126_G	566_V	0.656	0.22
247_K	549_F	0.656	0.22
244_K	247_K	0.655	0.22
373_T	619_E	0.655	0.22
79_G	85_F	0.654	0.22
455_F	490_A	0.654	0.22
603_L	684_Y	0.654	0.22
108_P	182_A	0.652	0.22
240_E	481_L	0.652	0.22
49_R	268_Q	0.648	0.22
30_R	225_A	0.646	0.22
294_K	634_E	0.645	0.21
249_D	252_D	0.645	0.21
170_W	686_V	0.644	0.21
266_F	390_K	0.644	0.21
28_K	123_I	0.642	0.21
284_T	297_S	0.642	0.21
273_D	417_E	0.641	0.21
54_W	399_V	0.641	0.21
498_N	664_C	0.641	0.21
44_Q	239_M	0.641	0.21
635_E	638_G	0.641	0.21
351_A	358_L	0.640	0.21
236_F	443_P	0.640	0.21
481_L	515_L	0.639	0.21
276_A	618_R	0.639	0.21
690_L	694_V	0.638	0.21
422_P	634_E	0.637	0.21
512_F	542_F	0.637	0.21
366_E	598_P	0.636	0.21
463_S	664_C	0.636	0.21
128_A	234_V	0.635	0.21
646_T	650_L	0.634	0.21
86_G	110_F	0.634	0.21
130_Y	134_I	0.633	0.21
352_L	357_S	0.632	0.21
459_F	657_I	0.632	0.21
566_V	647_E	0.631	0.21
496_E	504_R	0.631	0.21
573_P	694_V	0.631	0.21
250_F	255_K	0.629	0.21
204_A	208_H	0.627	0.21
151_I	155_G	0.627	0.21
123_I	181_I	0.626	0.21
422_P	658_S	0.626	0.21
19_A	207_I	0.625	0.21
294_K	671_G	0.625	0.21
42_F	386_E	0.624	0.21
579_E	655_S	0.624	0.21
535_D	558_H	0.623	0.21
200_I	204_A	0.622	0.21
482_L	565_L	0.622	0.21
403_G	465_G	0.622	0.21
470_R	669_G	0.622	0.21
46_F	571_L	0.621	0.21
499_S	663_Y	0.620	0.20
16_T	19_A	0.620	0.20
293_G	366_E	0.620	0.20
645_R	667_M	0.619	0.20
689_L	692_Q	0.618	0.20
682_K	692_Q	0.618	0.20
379_D	621_G	0.617	0.20
152_F	224_H	0.617	0.20
426_N	617_S	0.616	0.20
22_L	39_K	0.616	0.20
116_I	119_F	0.615	0.20
163_G	216_L	0.615	0.20
378_E	390_K	0.615	0.20
536_P	589_L	0.615	0.20
14_I	43_D	0.614	0.20
609_V	681_V	0.614	0.20
386_E	616_R	0.613	0.20
476_I	602_I	0.613	0.20
388_V	588_Y	0.613	0.20
292_T	638_G	0.612	0.20
279_E	598_P	0.612	0.20
542_F	555_V	0.611	0.20
305_L	633_M	0.611	0.20
152_F	166_M	0.609	0.20
464_M	658_S	0.609	0.20
193_G	200_I	0.609	0.20
65_K	659_S	0.608	0.20
498_N	502_T	0.608	0.20
554_E	564_E	0.607	0.20
118_T	163_G	0.607	0.20
255_K	400_L	0.607	0.20
409_A	629_G	0.607	0.20
404_K	544_N	0.607	0.20
417_E	511_L	0.607	0.20
164_N	168_L	0.606	0.20
631_M	638_G	0.606	0.20
75_M	576_P	0.606	0.20
12_F	131_R	0.606	0.20
26_L	211_F	0.606	0.20
109_A	113_F	0.605	0.20
119_F	621_G	0.604	0.20
691_A	694_V	0.604	0.20
473_K	476_I	0.602	0.20
666_T	671_G	0.602	0.20
145_K	221_Q	0.602	0.20
294_K	631_M	0.601	0.20
501_D	558_H	0.600	0.20
562_L	566_V	0.600	0.20
494_N	657_I	0.599	0.20
58_F	110_F	0.599	0.20
369_W	395_R	0.599	0.20
94_G	224_H	0.598	0.20
162_L	575_H	0.598	0.20
279_E	307_D	0.596	0.20
443_P	483_N	0.596	0.20
542_F	630_L	0.596	0.20
570_K	639_N	0.596	0.20
512_F	581_I	0.595	0.19
616_R	622_M	0.595	0.19
383_V	648_Q	0.595	0.19
643_V	674_A	0.595	0.19
208_H	218_Y	0.595	0.19
246_E	250_F	0.594	0.19
423_W	686_V	0.594	0.19
532_V	620_T	0.594	0.19
483_N	529_K	0.593	0.19
60_Q	121_I	0.592	0.19
156_L	208_H	0.592	0.19
635_E	671_G	0.591	0.19
62_K	70_G	0.591	0.19
386_E	649_A	0.590	0.19
185_I	196_G	0.590	0.19
652_V	664_C	0.590	0.19
122_L	156_L	0.590	0.19
96_A	116_I	0.590	0.19
294_K	408_D	0.590	0.19
112_F	119_F	0.589	0.19
387_H	557_H	0.589	0.19
417_E	422_P	0.589	0.19
238_R	660_G	0.588	0.19
16_T	20_V	0.587	0.19
406_D	518_K	0.586	0.19
118_T	207_I	0.586	0.19
217_V	231_P	0.586	0.19
48_E	239_M	0.584	0.19
191_G	195_T	0.584	0.19
586_S	621_G	0.583	0.19
139_R	541_L	0.582	0.19
509_E	642_N	0.582	0.19
418_R	510_F	0.582	0.19
53_I	235_F	0.582	0.19
188_M	693_S	0.580	0.19
460_W	630_L	0.580	0.19
571_L	690_L	0.580	0.19
167_N	208_H	0.579	0.19
156_L	212_L	0.579	0.19
567_K	605_A	0.579	0.19
390_K	586_S	0.578	0.19
684_Y	689_L	0.578	0.19
201_F	217_V	0.577	0.19
475_A	564_E	0.577	0.19
626_A	642_N	0.577	0.19
563_A	686_V	0.577	0.19
258_Y	265_D	0.577	0.19
40_E	527_D	0.577	0.19
423_W	642_N	0.576	0.19
121_I	160_V	0.576	0.19
181_I	185_I	0.575	0.19
659_S	683_T	0.574	0.19
87_A	167_N	0.574	0.19
120_L	196_G	0.574	0.19
84_Q	88_I	0.574	0.19
358_L	373_T	0.573	0.19
115_E	150_L	0.572	0.19
236_F	267_R	0.572	0.19
36_L	316_V	0.572	0.19
380_Q	620_T	0.572	0.19
604_K	611_L	0.571	0.19
269_S	638_G	0.570	0.19
126_G	129_F	0.570	0.19
603_L	668_L	0.570	0.19
419_Q	560_E	0.569	0.18
137_L	666_T	0.569	0.18
190_S	195_T	0.569	0.18
638_G	649_A	0.568	0.18
302_I	654_P	0.567	0.18
222_S	232_A	0.567	0.18
368_I	491_I	0.567	0.18
68_K	629_G	0.566	0.18
465_G	534_I	0.566	0.18
124_A	258_Y	0.566	0.18
79_G	161_L	0.566	0.18
26_L	118_T	0.565	0.18
57_V	86_G	0.565	0.18
580_T	654_P	0.565	0.18
540_N	544_N	0.565	0.18
540_N	649_A	0.564	0.18
50_L	109_A	0.562	0.18
27_V	481_L	0.561	0.18
442_I	479_A	0.560	0.18
79_G	543_K	0.559	0.18
248_I	457_Y	0.559	0.18
77_F	223_K	0.559	0.18
657_I	681_V	0.559	0.18
641_I	687_V	0.559	0.18
396_R	509_E	0.559	0.18
603_L	606_I	0.558	0.18
181_I	184_G	0.557	0.18
387_H	671_G	0.557	0.18
378_E	389_D	0.557	0.18
129_F	363_I	0.557	0.18
111_T	178_S	0.555	0.18
163_G	212_L	0.555	0.18
198_A	204_A	0.555	0.18
659_S	665_L	0.554	0.18
109_A	582_T	0.553	0.18
379_D	515_L	0.552	0.18
252_D	256_E	0.552	0.18
186_A	212_L	0.552	0.18
454_E	527_D	0.552	0.18
522_E	526_N	0.550	0.18
117_V	167_N	0.550	0.18
508_N	528_V	0.550	0.18
218_Y	227_L	0.549	0.18
159_T	231_P	0.549	0.18
62_K	488_S	0.549	0.18
650_L	681_V	0.548	0.18
497_K	503_P	0.548	0.18
531_I	551_F	0.548	0.18
213_L	220_P	0.547	0.18
267_R	368_I	0.547	0.18
515_L	596_Y	0.547	0.18
474_I	665_L	0.547	0.18
602_I	610_Q	0.546	0.18
672_T	681_V	0.546	0.18
247_K	306_R	0.546	0.18
530_K	564_E	0.545	0.18
421_N	467_Y	0.544	0.18
20_V	577_L	0.544	0.18
160_V	208_H	0.543	0.18
577_L	655_S	0.543	0.18
185_I	195_T	0.543	0.18
53_I	57_V	0.542	0.17
462_G	471_S	0.542	0.17
386_E	590_G	0.542	0.17
472_Q	535_D	0.541	0.17
62_K	65_K	0.541	0.17
364_T	477_S	0.541	0.17
144_F	148_L	0.540	0.17
266_F	271_L	0.540	0.17
443_P	567_K	0.540	0.17
378_E	387_H	0.540	0.17
215_F	218_Y	0.539	0.17
90_F	163_G	0.539	0.17
196_G	487_V	0.539	0.17
101_L	299_M	0.538	0.17
562_L	581_I	0.537	0.17
262_K	266_F	0.537	0.17
290_T	368_I	0.537	0.17
405_M	498_N	0.536	0.17
409_A	633_M	0.535	0.17
552_E	570_K	0.535	0.17
502_T	506_L	0.534	0.17
404_K	548_D	0.534	0.17
436_E	658_S	0.534	0.17
167_N	201_F	0.533	0.17
114_Q	208_H	0.533	0.17
285_N	302_I	0.532	0.17
394_L	410_Q	0.531	0.17
29_T	47_K	0.531	0.17
154_G	215_F	0.531	0.17
284_T	405_M	0.531	0.17
160_V	275_Y	0.531	0.17
436_E	594_E	0.531	0.17
81_I	564_E	0.530	0.17
481_L	487_V	0.529	0.17
401_T	405_M	0.529	0.17
120_L	660_G	0.529	0.17
87_A	163_G	0.529	0.17
399_V	413_M	0.528	0.17
156_L	220_P	0.528	0.17
379_D	415_S	0.527	0.17
420_G	467_Y	0.527	0.17
529_K	568_N	0.527	0.17
24_V	580_T	0.525	0.17
360_G	473_K	0.524	0.17
53_I	467_Y	0.523	0.17
533_T	536_P	0.523	0.17
658_S	686_V	0.523	0.17
656_V	684_Y	0.523	0.17
499_S	535_D	0.523	0.17
422_P	663_Y	0.523	0.17
630_L	641_I	0.522	0.17
149_V	651_A	0.522	0.17
527_D	530_K	0.522	0.17
117_V	225_A	0.522	0.17
264_E	650_L	0.521	0.17
478_F	629_G	0.519	0.17
666_T	670_D	0.519	0.17
628_G	667_M	0.519	0.17
493_G	501_D	0.519	0.17
468_D	475_A	0.518	0.17
111_T	159_T	0.517	0.17
531_I	589_L	0.517	0.17
28_K	570_K	0.517	0.17
468_D	472_Q	0.516	0.17
244_K	253_E	0.516	0.17
84_Q	87_A	0.515	0.17
501_D	535_D	0.515	0.17
295_M	367_E	0.515	0.17
445_V	592_Y	0.515	0.17
608_G	614_M	0.515	0.17
34_I	160_V	0.514	0.17
399_V	430_R	0.514	0.17
149_V	224_H	0.514	0.17
17_A	28_K	0.513	0.16
669_G	673_K	0.513	0.16
386_E	424_G	0.512	0.16
538_A	630_L	0.512	0.16
191_G	196_G	0.512	0.16
423_W	634_E	0.511	0.16
125_V	154_G	0.510	0.16
302_I	305_L	0.509	0.16
420_G	643_V	0.508	0.16
647_E	651_A	0.507	0.16
125_V	150_L	0.507	0.16
236_F	489_F	0.507	0.16
405_M	463_S	0.507	0.16
408_D	417_E	0.507	0.16
456_E	527_D	0.507	0.16
227_L	375_R	0.507	0.16
28_K	75_M	0.506	0.16
145_K	218_Y	0.506	0.16
218_Y	224_H	0.505	0.16
17_A	158_L	0.505	0.16
502_T	544_N	0.504	0.16
631_M	635_E	0.504	0.16
566_V	686_V	0.504	0.16
671_G	674_A	0.503	0.16
474_I	551_F	0.503	0.16
186_A	583_F	0.502	0.16
354_Y	359_I	0.502	0.16
93_K	167_N	0.502	0.16
506_L	633_M	0.502	0.16
229_A	272_L	0.501	0.16
38_Q	267_R	0.501	0.16
493_G	664_C	0.501	0.16
626_A	669_G	0.501	0.16
607_P	693_S	0.501	0.16
45_R	75_M	0.500	0.16
413_M	416_I	0.500	0.16
42_F	269_S	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3kwlA	1	0.6213	100	0.8	Contact Map
3cf4A	2	0.756	100	0.868	Contact Map
1q16C	2	0.3149	100	0.875	Contact Map
3c8yA	1	0.5844	100	0.895	Contact Map
2bs2B	1	0.3206	99.5	0.947	Contact Map
1kf6B	1	0.3333	99.5	0.948	Contact Map
2wdqB	1	0.3064	99.2	0.953	Contact Map
1hfeL	2	0.4695	99.2	0.954	Contact Map
2h88B	1	0.3021	99.1	0.955	Contact Map
4uquA	2	0.4723	99.1	0.957	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0148 seconds.