THIC - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

THIC - Phosphomethylpyrimidine synthase

UniProt:	P45740	Sequences: MQNNSVQQANISIMSSFSGSKKVYVEGSSSDIQVPMREIALSPTTGSFGEEENAPVRVYDTSGPYTDPEVTINIQEGLKPLRQKWITERGDVEEYEGRAIKPEDNGYKKAKPNVSYPGLKRKPLRAKAGQNVTQMHYAKKGIITPEMEFIAIREHVSPEFVRDEVASGRAIIPSNINHPESEPMIIGRNFHVKINANIGNSAVTSSIEEEVEKMTWAIRWGADTMMDLSTGKDIHTTREWIIRNCPVPVGTVPIYQALEKVNGVAEDLTWEIYRDTLIEQAEQGVDYFTIHAGVLLRYVPLTAKRTTGIVSRGGAIMAQWCLAHHQESFLYTHFEEICEIMKMYDIAFSLGDGLRPGSIADANDEAQFAELETLGELTQIAWKHDVQVMIEGPGHVPMHKIKENVDKQMDICKEAPFYTLGPLTTDIAPGYDHITSAIGAAMIGWYGTAMLCYVTPKEHLGLPNRDDVREGVITYKIAAHAADLAKGHPGAQIRDDALSKARFEFRWRDQFNLSLDPERALEYHDETLPAEGAKTAHFCSMCGPKFCSMRISQDIRDYAKKNDLSEAEAINKGLKEKAKEFVDTGSNLYQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	590 (567)
Sequences:	849 (173)
Seq/√Len:	7.2

ECOLI - THIC
BACSU - THIC
HALSA - THIC
SULSO - THIC1 THIC2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
225_M	249_V	5.454	1.00
39_I	58_V	5.249	0.99
577_K	580_E	5.051	0.99
341_M	348_F	4.926	0.99
150_I	165_V	4.897	0.99
165_V	172_I	4.843	0.99
469_R	519_R	4.790	0.99
171_I	347_A	4.786	0.99
470_E	519_R	4.728	0.99
372_E	407_K	4.197	0.97
335_E	383_K	4.156	0.97
335_E	380_I	3.893	0.96
131_N	342_K	3.519	0.92
22_K	66_T	3.461	0.92
339_E	384_H	3.253	0.89
92_V	124_L	3.241	0.89
29_S	88_E	3.182	0.88
464_N	526_E	2.915	0.83
402_K	406_D	2.865	0.82
102_P	106_G	2.827	0.81
470_E	474_T	2.811	0.80
194_I	472_V	2.799	0.80
21_K	38_E	2.777	0.79
335_E	384_H	2.766	0.79
508_R	521_L	2.762	0.79
106_G	236_T	2.699	0.77
398_M	442_M	2.697	0.77
492_Q	496_D	2.642	0.76
95_Y	106_G	2.625	0.75
277_L	337_I	2.620	0.75
53_N	500_K	2.610	0.75
288_F	337_I	2.595	0.74
136_H	385_D	2.575	0.74
98_R	104_D	2.570	0.74
264_V	267_D	2.562	0.73
35_P	149_F	2.555	0.73
328_S	332_T	2.505	0.72
277_L	288_F	2.473	0.71
98_R	106_G	2.464	0.70
306_T	360_A	2.463	0.70
474_T	477_I	2.462	0.70
326_Q	332_T	2.409	0.69
44_T	53_N	2.404	0.68
407_K	411_I	2.384	0.68
295_L	328_S	2.343	0.66
342_K	384_H	2.341	0.66
530_A	533_A	2.309	0.65
437_A	448_T	2.243	0.63
95_Y	104_D	2.240	0.63
131_N	136_H	2.229	0.62
555_I	558_Y	2.204	0.61
100_I	106_G	2.198	0.61
196_A	217_A	2.169	0.60
264_V	545_K	2.144	0.59
95_Y	100_I	2.138	0.59
296_L	325_H	2.125	0.58
150_I	185_I	2.096	0.57
95_Y	102_P	2.076	0.56
112_P	116_Y	2.055	0.56
174_S	181_S	2.055	0.56
31_D	88_E	2.024	0.54
374_L	390_I	2.022	0.54
398_M	401_I	2.018	0.54
28_S	88_E	2.017	0.54
512_N	521_L	1.998	0.53
359_I	492_Q	1.988	0.53
106_G	109_K	1.957	0.52
98_R	105_N	1.942	0.51
80_P	121_R	1.939	0.51
163_D	167_S	1.931	0.51
181_S	347_A	1.898	0.49
95_Y	99_A	1.885	0.49
100_I	104_D	1.880	0.49
563_D	569_A	1.870	0.48
167_S	414_E	1.860	0.48
405_V	409_M	1.845	0.47
131_N	384_H	1.840	0.47
95_Y	98_R	1.826	0.47
191_H	476_K	1.824	0.47
469_R	473_I	1.817	0.46
207_I	237_T	1.814	0.46
136_H	342_K	1.792	0.45
39_I	494_R	1.787	0.45
409_M	414_E	1.787	0.45
103_E	106_G	1.767	0.44
372_E	411_I	1.762	0.44
217_A	222_A	1.755	0.44
334_F	350_L	1.750	0.44
196_A	225_M	1.730	0.43
106_G	116_Y	1.709	0.42
188_R	409_M	1.709	0.42
100_I	105_N	1.704	0.42
317_M	328_S	1.704	0.42
27_G	152_I	1.697	0.42
191_H	488_H	1.689	0.41
574_L	578_A	1.681	0.41
148_E	152_I	1.679	0.41
160_F	189_N	1.670	0.41
365_E	372_E	1.667	0.41
269_T	272_I	1.641	0.40
350_L	374_L	1.639	0.40
136_H	140_K	1.616	0.39
466_D	470_E	1.615	0.39
171_I	389_M	1.611	0.39
315_A	551_I	1.608	0.38
498_L	514_S	1.605	0.38
225_M	245_C	1.604	0.38
519_R	522_E	1.597	0.38
38_E	57_R	1.596	0.38
28_S	32_I	1.585	0.38
95_Y	105_N	1.576	0.37
301_L	365_E	1.575	0.37
22_K	149_F	1.574	0.37
95_Y	236_T	1.569	0.37
358_S	424_T	1.554	0.36
27_G	148_E	1.554	0.36
171_I	515_L	1.546	0.36
295_L	298_Y	1.525	0.35
102_P	116_Y	1.524	0.35
20_S	37_R	1.520	0.35
469_R	518_E	1.514	0.35
102_P	105_N	1.501	0.35
378_T	382_W	1.488	0.34
135_M	342_K	1.484	0.34
25_V	152_I	1.470	0.33
290_I	337_I	1.469	0.33
500_K	504_E	1.466	0.33
428_A	435_T	1.456	0.33
189_N	409_M	1.451	0.33
80_P	83_Q	1.439	0.32
91_D	137_Y	1.432	0.32
28_S	31_D	1.431	0.32
295_L	369_A	1.424	0.32
334_F	374_L	1.419	0.32
437_A	474_T	1.408	0.31
442_M	446_Y	1.406	0.31
508_R	512_N	1.404	0.31
100_I	116_Y	1.402	0.31
306_T	358_S	1.402	0.31
196_A	222_A	1.397	0.31
102_P	236_T	1.395	0.31
579_K	583_D	1.389	0.31
408_Q	488_H	1.385	0.31
578_A	582_V	1.384	0.31
348_F	384_H	1.364	0.30
44_T	55_P	1.353	0.29
407_K	410_D	1.349	0.29
97_G	104_D	1.346	0.29
12_S	15_S	1.340	0.29
16_S	219_R	1.337	0.29
525_D	534_K	1.334	0.29
524_H	540_S	1.326	0.29
104_D	236_T	1.325	0.29
473_I	477_I	1.324	0.29
368_F	407_K	1.319	0.28
41_L	54_A	1.315	0.28
273_Y	472_V	1.312	0.28
150_I	172_I	1.310	0.28
41_L	55_P	1.306	0.28
191_H	469_R	1.306	0.28
98_R	102_P	1.293	0.28
23_V	36_M	1.288	0.27
174_S	347_A	1.282	0.27
102_P	109_K	1.278	0.27
440_A	475_Y	1.263	0.27
112_P	115_S	1.260	0.27
100_I	236_T	1.256	0.26
266_E	319_Q	1.255	0.26
328_S	474_T	1.252	0.26
105_N	236_T	1.250	0.26
126_A	145_P	1.247	0.26
323_A	332_T	1.246	0.26
273_Y	332_T	1.243	0.26
245_C	249_V	1.236	0.26
359_I	484_L	1.231	0.26
41_L	56_V	1.228	0.26
106_G	112_P	1.224	0.25
196_A	245_C	1.224	0.25
242_I	359_I	1.219	0.25
132_V	136_H	1.218	0.25
113_N	116_Y	1.214	0.25
469_R	522_E	1.208	0.25
552_S	558_Y	1.206	0.25
396_V	408_Q	1.200	0.25
93_E	125_R	1.200	0.25
401_I	424_T	1.197	0.25
379_Q	413_K	1.197	0.25
109_K	116_Y	1.195	0.25
12_S	472_V	1.194	0.25
206_S	237_T	1.194	0.25
303_A	553_Q	1.193	0.25
473_I	519_R	1.191	0.25
99_A	106_G	1.184	0.24
525_D	540_S	1.175	0.24
100_I	109_K	1.173	0.24
135_M	442_M	1.172	0.24
73_N	76_E	1.164	0.24
214_M	448_T	1.162	0.24
335_E	342_K	1.157	0.24
408_Q	413_K	1.154	0.23
86_I	91_D	1.154	0.23
189_N	414_E	1.151	0.23
58_V	494_R	1.148	0.23
97_G	123_P	1.132	0.23
136_H	384_H	1.129	0.23
306_T	500_K	1.125	0.23
101_K	104_D	1.125	0.23
131_N	383_K	1.117	0.22
342_K	385_D	1.112	0.22
294_V	348_F	1.108	0.22
192_V	482_A	1.108	0.22
444_G	473_I	1.106	0.22
581_F	589_Y	1.106	0.22
99_A	102_P	1.106	0.22
334_F	390_I	1.105	0.22
399_H	408_Q	1.103	0.22
155_H	319_Q	1.102	0.22
131_N	385_D	1.101	0.22
297_R	328_S	1.101	0.22
95_Y	103_E	1.101	0.22
559_A	569_A	1.096	0.22
472_V	530_A	1.095	0.22
99_A	104_D	1.095	0.22
98_R	103_E	1.093	0.22
212_E	465_R	1.088	0.22
165_V	444_G	1.088	0.22
341_M	437_A	1.082	0.22
472_V	514_S	1.082	0.22
171_I	388_V	1.081	0.21
136_H	386_V	1.081	0.21
525_D	536_A	1.079	0.21
319_Q	587_N	1.078	0.21
217_A	400_K	1.078	0.21
237_T	504_E	1.077	0.21
225_M	247_V	1.076	0.21
519_R	523_Y	1.073	0.21
585_G	589_Y	1.068	0.21
347_A	437_A	1.064	0.21
553_Q	557_D	1.061	0.21
103_E	109_K	1.060	0.21
399_H	496_D	1.059	0.21
534_K	540_S	1.055	0.21
86_I	137_Y	1.055	0.21
551_I	555_I	1.054	0.21
87_T	92_V	1.053	0.21
27_G	32_I	1.052	0.21
86_I	181_S	1.038	0.20
400_K	448_T	1.036	0.20
288_F	341_M	1.033	0.20
525_D	529_P	1.030	0.20
216_W	220_W	1.026	0.20
131_N	341_M	1.023	0.20
558_Y	569_A	1.023	0.20
25_V	36_M	1.023	0.20
129_G	145_P	1.022	0.20
176_I	494_R	1.020	0.20
33_Q	125_R	1.019	0.20
13_I	465_R	1.018	0.20
307_T	358_S	1.017	0.20
100_I	103_E	1.008	0.20
157_S	215_T	1.005	0.20
44_T	500_K	1.003	0.20
204_T	214_M	1.002	0.19
296_L	322_L	1.001	0.19
342_K	383_K	0.998	0.19
37_R	65_Y	0.995	0.19
470_E	518_E	0.994	0.19
322_L	325_H	0.992	0.19
38_E	55_P	0.989	0.19
302_T	556_R	0.988	0.19
529_P	534_K	0.987	0.19
396_V	405_V	0.979	0.19
150_I	437_A	0.978	0.19
43_P	53_N	0.977	0.19
102_P	112_P	0.973	0.19
301_L	369_A	0.972	0.19
555_I	559_A	0.971	0.19
116_Y	236_T	0.971	0.19
135_M	172_I	0.970	0.19
32_I	64_P	0.968	0.19
191_H	399_H	0.968	0.19
95_Y	123_P	0.967	0.19
319_Q	554_D	0.965	0.19
294_V	298_Y	0.963	0.19
140_K	342_K	0.957	0.18
23_V	57_R	0.955	0.18
550_R	555_I	0.955	0.18
101_K	105_N	0.950	0.18
126_A	386_V	0.948	0.18
157_S	409_M	0.945	0.18
101_K	106_G	0.942	0.18
434_I	448_T	0.938	0.18
98_R	236_T	0.938	0.18
332_T	384_H	0.938	0.18
408_Q	496_D	0.936	0.18
508_R	550_R	0.935	0.18
574_L	577_K	0.933	0.18
65_Y	72_I	0.932	0.18
442_M	445_W	0.931	0.18
350_L	390_I	0.929	0.18
135_M	382_W	0.928	0.18
185_I	206_S	0.927	0.18
254_I	294_V	0.926	0.18
399_H	442_M	0.923	0.18
583_D	588_L	0.923	0.18
137_Y	385_D	0.922	0.18
16_S	66_T	0.921	0.18
578_A	588_L	0.920	0.18
131_N	348_F	0.920	0.18
277_L	290_I	0.920	0.18
335_E	348_F	0.915	0.17
294_V	498_L	0.915	0.17
529_P	536_A	0.914	0.17
171_I	382_W	0.912	0.17
21_K	40_A	0.910	0.17
448_T	555_I	0.909	0.17
104_D	109_K	0.908	0.17
43_P	273_Y	0.908	0.17
140_K	339_E	0.908	0.17
72_I	336_E	0.905	0.17
27_G	31_D	0.904	0.17
158_P	401_I	0.903	0.17
400_K	496_D	0.902	0.17
528_L	540_S	0.902	0.17
551_I	559_A	0.901	0.17
135_M	434_I	0.900	0.17
145_P	148_E	0.898	0.17
572_K	575_K	0.897	0.17
29_S	33_Q	0.897	0.17
411_I	448_T	0.897	0.17
380_I	390_I	0.894	0.17
473_I	526_E	0.893	0.17
265_A	319_Q	0.888	0.17
206_S	209_E	0.888	0.17
27_G	145_P	0.879	0.17
319_Q	409_M	0.879	0.17
124_L	272_I	0.878	0.17
91_D	181_S	0.878	0.17
298_Y	373_T	0.877	0.17
464_N	559_A	0.875	0.17
532_G	535_T	0.874	0.17
273_Y	341_M	0.873	0.17
194_I	214_M	0.870	0.16
550_R	554_D	0.868	0.16
45_T	53_N	0.868	0.16
498_L	552_S	0.863	0.16
294_V	341_M	0.861	0.16
235_H	279_E	0.860	0.16
26_E	33_Q	0.856	0.16
525_D	538_F	0.854	0.16
86_I	92_V	0.853	0.16
172_I	427_I	0.851	0.16
429_P	498_L	0.850	0.16
296_L	537_H	0.850	0.16
325_H	581_F	0.849	0.16
414_E	445_W	0.845	0.16
296_L	551_I	0.844	0.16
135_M	150_I	0.842	0.16
156_V	550_R	0.841	0.16
191_H	299_V	0.837	0.16
466_D	519_R	0.835	0.16
336_E	339_E	0.834	0.16
472_V	532_G	0.828	0.16
204_T	332_T	0.827	0.16
429_P	435_T	0.826	0.16
126_A	385_D	0.823	0.15
83_Q	87_T	0.819	0.15
106_G	115_S	0.819	0.15
343_M	347_A	0.817	0.15
214_M	470_E	0.815	0.15
319_Q	550_R	0.815	0.15
142_I	337_I	0.813	0.15
12_S	17_F	0.812	0.15
273_Y	290_I	0.812	0.15
390_I	408_Q	0.811	0.15
39_I	466_D	0.810	0.15
39_I	217_A	0.807	0.15
582_V	587_N	0.806	0.15
563_D	570_I	0.806	0.15
434_I	470_E	0.805	0.15
103_E	236_T	0.805	0.15
559_A	563_D	0.804	0.15
56_V	490_G	0.804	0.15
97_G	106_G	0.804	0.15
86_I	89_R	0.803	0.15
135_M	448_T	0.803	0.15
427_I	515_L	0.798	0.15
167_S	192_V	0.796	0.15
19_G	219_R	0.794	0.15
135_M	165_V	0.794	0.15
401_I	414_E	0.793	0.15
579_K	582_V	0.793	0.15
409_M	445_W	0.793	0.15
235_H	276_T	0.792	0.15
524_H	534_K	0.791	0.15
66_T	219_R	0.789	0.15
143_I	333_H	0.786	0.15
35_P	107_Y	0.785	0.15
524_H	528_L	0.784	0.15
242_I	347_A	0.783	0.15
102_P	117_P	0.782	0.15
100_I	117_P	0.782	0.15
140_K	267_D	0.781	0.15
220_W	270_W	0.780	0.15
105_N	109_K	0.778	0.15
575_K	583_D	0.776	0.15
95_Y	116_Y	0.774	0.14
529_P	540_S	0.774	0.14
341_M	472_V	0.774	0.14
273_Y	488_H	0.770	0.14
103_E	110_A	0.770	0.14
103_E	496_D	0.766	0.14
95_Y	112_P	0.765	0.14
581_F	585_G	0.765	0.14
191_H	519_R	0.764	0.14
109_K	112_P	0.762	0.14
202_A	472_V	0.761	0.14
427_I	476_K	0.760	0.14
401_I	405_V	0.759	0.14
155_H	496_D	0.759	0.14
434_I	437_A	0.758	0.14
100_I	112_P	0.757	0.14
222_A	318_A	0.754	0.14
37_R	60_D	0.753	0.14
87_T	124_L	0.751	0.14
43_P	55_P	0.750	0.14
296_L	315_A	0.749	0.14
189_N	405_V	0.748	0.14
358_S	552_S	0.746	0.14
16_S	19_G	0.743	0.14
407_K	514_S	0.738	0.14
214_M	225_M	0.738	0.14
102_P	115_S	0.736	0.14
524_H	536_A	0.734	0.14
358_S	555_I	0.733	0.14
74_I	152_I	0.733	0.14
108_K	236_T	0.733	0.14
150_I	442_M	0.731	0.14
171_I	242_I	0.730	0.14
212_E	333_H	0.729	0.14
374_L	384_H	0.729	0.14
53_N	236_T	0.726	0.14
131_N	386_V	0.726	0.14
235_H	256_Q	0.726	0.14
348_F	396_V	0.726	0.14
104_D	108_K	0.724	0.14
437_A	472_V	0.724	0.14
17_F	574_L	0.723	0.14
372_E	413_K	0.720	0.13
385_D	545_K	0.720	0.13
536_A	540_S	0.719	0.13
342_K	348_F	0.717	0.13
386_V	490_G	0.716	0.13
444_G	484_L	0.715	0.13
388_V	408_Q	0.714	0.13
476_K	557_D	0.714	0.13
95_Y	109_K	0.711	0.13
102_P	107_Y	0.708	0.13
281_A	346_I	0.708	0.13
577_K	581_F	0.706	0.13
160_F	409_M	0.705	0.13
91_D	385_D	0.705	0.13
30_S	33_Q	0.703	0.13
382_W	413_K	0.703	0.13
26_E	57_R	0.703	0.13
132_V	385_D	0.703	0.13
92_V	343_M	0.701	0.13
104_D	112_P	0.697	0.13
498_L	577_K	0.697	0.13
414_E	444_G	0.697	0.13
215_T	365_E	0.697	0.13
12_S	194_I	0.697	0.13
269_T	274_R	0.694	0.13
163_D	328_S	0.694	0.13
18_S	58_V	0.694	0.13
56_V	493_I	0.693	0.13
167_S	204_T	0.692	0.13
176_I	288_F	0.691	0.13
498_L	513_L	0.690	0.13
106_G	117_P	0.689	0.13
36_M	148_E	0.688	0.13
33_Q	379_Q	0.688	0.13
181_S	328_S	0.688	0.13
484_L	497_A	0.687	0.13
143_I	465_R	0.683	0.13
574_L	580_E	0.683	0.13
297_R	369_A	0.683	0.13
81_L	514_S	0.682	0.13
41_L	498_L	0.680	0.13
172_I	333_H	0.680	0.13
155_H	532_G	0.679	0.13
328_S	535_T	0.679	0.13
405_V	430_G	0.679	0.13
380_I	384_H	0.679	0.13
27_G	36_M	0.679	0.13
317_M	574_L	0.678	0.13
136_H	171_I	0.676	0.13
572_K	583_D	0.673	0.13
569_A	576_E	0.673	0.13
92_V	194_I	0.673	0.13
441_A	445_W	0.672	0.13
143_I	427_I	0.671	0.13
390_I	411_I	0.670	0.13
281_A	341_M	0.670	0.13
254_I	552_S	0.670	0.13
273_Y	336_E	0.670	0.13
413_K	488_H	0.669	0.13
143_I	304_K	0.669	0.13
167_S	326_Q	0.669	0.13
398_M	446_Y	0.669	0.13
527_T	540_S	0.669	0.13
572_K	576_E	0.668	0.13
70_V	79_K	0.668	0.13
112_P	117_P	0.668	0.13
281_A	343_M	0.667	0.13
155_H	490_G	0.667	0.13
123_P	237_T	0.666	0.13
44_T	469_R	0.665	0.13
22_K	65_Y	0.665	0.13
131_N	335_E	0.664	0.12
25_V	96_E	0.663	0.12
95_Y	117_P	0.661	0.12
114_V	117_P	0.659	0.12
113_N	117_P	0.657	0.12
140_K	385_D	0.657	0.12
167_S	466_D	0.657	0.12
150_I	472_V	0.657	0.12
53_N	237_T	0.656	0.12
99_A	236_T	0.655	0.12
212_E	281_A	0.655	0.12
181_S	336_E	0.653	0.12
155_H	191_H	0.653	0.12
20_S	58_V	0.653	0.12
148_E	267_D	0.650	0.12
157_S	496_D	0.649	0.12
74_I	466_D	0.649	0.12
237_T	500_K	0.648	0.12
13_I	215_T	0.647	0.12
326_Q	407_K	0.647	0.12
325_H	545_K	0.646	0.12
435_T	474_T	0.645	0.12
111_K	114_V	0.644	0.12
534_K	538_F	0.644	0.12
64_P	69_E	0.643	0.12
332_T	490_G	0.643	0.12
347_A	552_S	0.640	0.12
437_A	578_A	0.640	0.12
301_L	437_A	0.639	0.12
37_R	62_S	0.638	0.12
277_L	560_K	0.638	0.12
170_A	190_F	0.637	0.12
214_M	218_I	0.637	0.12
472_V	523_Y	0.637	0.12
53_N	496_D	0.637	0.12
401_I	442_M	0.636	0.12
277_L	405_V	0.635	0.12
53_N	207_I	0.634	0.12
18_S	37_R	0.634	0.12
109_K	236_T	0.633	0.12
484_L	496_D	0.633	0.12
27_G	33_Q	0.632	0.12
56_V	136_H	0.632	0.12
103_E	448_T	0.632	0.12
100_I	496_D	0.631	0.12
126_A	343_M	0.630	0.12
508_R	530_A	0.630	0.12
578_A	584_T	0.628	0.12
114_V	118_G	0.627	0.12
105_N	108_K	0.626	0.12
88_E	587_N	0.626	0.12
219_R	518_E	0.625	0.12
19_G	508_R	0.625	0.12
65_Y	208_E	0.624	0.12
338_C	348_F	0.624	0.12
62_S	66_T	0.623	0.12
65_Y	334_F	0.623	0.12
203_V	294_V	0.623	0.12
66_T	149_F	0.622	0.12
117_P	239_E	0.621	0.12
249_V	424_T	0.621	0.12
518_E	521_L	0.619	0.12
33_Q	69_E	0.619	0.12
522_E	557_D	0.619	0.12
74_I	208_E	0.617	0.12
145_P	152_I	0.616	0.12
124_L	127_K	0.615	0.12
514_S	522_E	0.614	0.12
325_H	589_Y	0.613	0.12
25_V	341_M	0.613	0.12
17_F	578_A	0.612	0.12
56_V	156_V	0.610	0.12
214_M	472_V	0.610	0.12
334_F	380_I	0.609	0.12
13_I	17_F	0.609	0.12
508_R	531_E	0.608	0.12
298_Y	322_L	0.608	0.12
137_Y	148_E	0.607	0.12
202_A	232_K	0.606	0.12
259_E	270_W	0.605	0.12
136_H	145_P	0.603	0.11
218_I	262_N	0.602	0.11
99_A	105_N	0.602	0.11
341_M	384_H	0.602	0.11
17_F	219_R	0.601	0.11
158_P	518_E	0.601	0.11
405_V	408_Q	0.600	0.11
296_L	581_F	0.600	0.11
56_V	317_M	0.600	0.11
54_A	514_S	0.600	0.11
165_V	410_D	0.598	0.11
42_S	55_P	0.598	0.11
39_I	174_S	0.597	0.11
234_I	329_F	0.597	0.11
233_D	469_R	0.597	0.11
129_G	339_E	0.595	0.11
341_M	445_W	0.594	0.11
139_K	521_L	0.594	0.11
405_V	577_K	0.593	0.11
103_E	116_Y	0.592	0.11
100_I	107_Y	0.592	0.11
191_H	273_Y	0.591	0.11
99_A	103_E	0.591	0.11
378_T	389_M	0.590	0.11
15_S	207_I	0.589	0.11
580_E	584_T	0.587	0.11
25_V	38_E	0.587	0.11
559_A	562_N	0.586	0.11
116_Y	119_L	0.585	0.11
434_I	498_L	0.585	0.11
41_L	496_D	0.583	0.11
117_P	236_T	0.582	0.11
155_H	530_A	0.582	0.11
98_R	109_K	0.582	0.11
470_E	473_I	0.582	0.11
245_C	265_A	0.582	0.11
180_E	329_F	0.581	0.11
339_E	385_D	0.581	0.11
61_T	514_S	0.581	0.11
295_L	500_K	0.580	0.11
337_I	341_M	0.579	0.11
126_A	129_G	0.578	0.11
12_S	215_T	0.578	0.11
399_H	406_D	0.578	0.11
25_V	57_R	0.577	0.11
341_M	407_K	0.577	0.11
108_K	118_G	0.577	0.11
254_I	317_M	0.576	0.11
329_F	419_T	0.576	0.11
135_M	444_G	0.575	0.11
26_E	31_D	0.575	0.11
127_K	242_I	0.575	0.11
380_I	383_K	0.575	0.11
208_E	441_A	0.575	0.11
294_V	353_G	0.575	0.11
100_I	115_S	0.574	0.11
555_I	570_I	0.574	0.11
243_R	329_F	0.573	0.11
466_D	469_R	0.573	0.11
39_I	192_V	0.572	0.11
578_A	581_F	0.571	0.11
236_T	496_D	0.570	0.11
534_K	537_H	0.569	0.11
322_L	554_D	0.569	0.11
136_H	464_N	0.569	0.11
319_Q	405_V	0.569	0.11
12_S	465_R	0.569	0.11
32_I	494_R	0.568	0.11
165_V	202_A	0.567	0.11
398_M	441_A	0.567	0.11
35_P	532_G	0.567	0.11
158_P	571_N	0.567	0.11
525_D	528_L	0.567	0.11
165_V	278_I	0.567	0.11
465_R	470_E	0.566	0.11
325_H	585_G	0.566	0.11
208_E	477_I	0.566	0.11
84_K	88_E	0.566	0.11
31_D	214_M	0.566	0.11
232_K	533_A	0.565	0.11
115_S	236_T	0.565	0.11
299_V	427_I	0.565	0.11
98_R	496_D	0.564	0.11
167_S	399_H	0.564	0.11
160_F	405_V	0.564	0.11
204_T	474_T	0.564	0.11
236_T	386_V	0.563	0.11
107_Y	112_P	0.563	0.11
171_I	522_E	0.563	0.11
62_S	423_L	0.563	0.11
300_P	552_S	0.562	0.11
339_E	383_K	0.562	0.11
56_V	383_K	0.562	0.11
398_M	438_I	0.561	0.11
22_K	62_S	0.560	0.11
573_G	581_F	0.560	0.11
65_Y	70_V	0.559	0.11
17_F	466_D	0.559	0.11
94_E	122_K	0.558	0.11
104_D	110_A	0.557	0.11
486_K	509_D	0.557	0.11
341_M	530_A	0.557	0.11
181_S	218_I	0.557	0.11
470_E	477_I	0.556	0.11
118_G	532_G	0.555	0.11
400_K	472_V	0.554	0.11
105_N	116_Y	0.554	0.11
194_I	514_S	0.553	0.11
577_K	582_V	0.553	0.11
270_W	274_R	0.553	0.11
332_T	341_M	0.553	0.11
104_D	107_Y	0.552	0.11
135_M	385_D	0.552	0.11
374_L	411_I	0.552	0.11
209_E	217_A	0.552	0.11
302_T	540_S	0.551	0.11
407_K	413_K	0.551	0.11
306_T	317_M	0.551	0.11
271_E	466_D	0.551	0.11
109_K	115_S	0.550	0.11
53_N	492_Q	0.550	0.11
234_I	443_I	0.550	0.11
60_D	65_Y	0.550	0.11
80_P	117_P	0.550	0.11
273_Y	408_Q	0.549	0.11
53_N	504_E	0.549	0.11
242_I	522_E	0.549	0.11
571_N	575_K	0.549	0.11
405_V	411_I	0.549	0.11
29_S	35_P	0.548	0.11
29_S	155_H	0.547	0.11
403_E	410_D	0.546	0.11
262_N	267_D	0.545	0.11
220_W	259_E	0.545	0.11
156_V	191_H	0.544	0.11
135_M	341_M	0.544	0.11
148_E	328_S	0.544	0.11
33_Q	88_E	0.544	0.11
275_D	496_D	0.543	0.11
494_R	500_K	0.543	0.11
152_I	176_I	0.543	0.11
573_G	585_G	0.542	0.11
157_S	319_Q	0.540	0.11
27_G	158_P	0.540	0.11
276_T	279_E	0.539	0.11
271_E	403_E	0.538	0.10
133_T	383_K	0.537	0.10
524_H	527_T	0.536	0.10
18_S	87_T	0.536	0.10
19_G	70_V	0.536	0.10
584_T	587_N	0.536	0.10
56_V	552_S	0.535	0.10
235_H	321_C	0.534	0.10
319_Q	559_A	0.534	0.10
408_Q	411_I	0.534	0.10
23_V	498_L	0.534	0.10
115_S	496_D	0.533	0.10
286_D	424_T	0.532	0.10
135_M	378_T	0.531	0.10
218_I	540_S	0.531	0.10
527_T	534_K	0.530	0.10
328_S	369_A	0.530	0.10
157_S	160_F	0.530	0.10
437_A	555_I	0.529	0.10
142_I	155_H	0.529	0.10
329_F	443_I	0.529	0.10
437_A	470_E	0.529	0.10
185_I	190_F	0.529	0.10
22_K	35_P	0.529	0.10
380_I	402_K	0.528	0.10
36_M	86_I	0.528	0.10
140_K	369_A	0.526	0.10
156_V	445_W	0.526	0.10
469_R	577_K	0.526	0.10
496_D	578_A	0.525	0.10
38_E	41_L	0.525	0.10
20_S	288_F	0.525	0.10
295_L	527_T	0.525	0.10
171_I	407_K	0.525	0.10
300_P	318_A	0.524	0.10
299_V	514_S	0.524	0.10
574_L	588_L	0.524	0.10
581_F	588_L	0.524	0.10
54_A	399_H	0.523	0.10
326_Q	465_R	0.523	0.10
95_Y	115_S	0.523	0.10
575_K	588_L	0.523	0.10
424_T	492_Q	0.523	0.10
222_A	225_M	0.523	0.10
13_I	16_S	0.523	0.10
334_F	411_I	0.522	0.10
171_I	384_H	0.522	0.10
112_P	236_T	0.522	0.10
266_E	550_R	0.522	0.10
180_E	243_R	0.521	0.10
332_T	342_K	0.521	0.10
83_Q	92_V	0.520	0.10
304_K	557_D	0.520	0.10
191_H	578_A	0.519	0.10
131_N	135_M	0.519	0.10
586_S	589_Y	0.519	0.10
273_Y	348_F	0.518	0.10
321_C	553_Q	0.518	0.10
218_I	529_P	0.518	0.10
189_N	319_Q	0.517	0.10
577_K	589_Y	0.517	0.10
365_E	413_K	0.516	0.10
555_I	560_K	0.515	0.10
557_D	561_K	0.515	0.10
203_V	222_A	0.515	0.10
465_R	496_D	0.514	0.10
427_I	526_E	0.514	0.10
14_M	17_F	0.513	0.10
216_W	270_W	0.513	0.10
165_V	484_L	0.512	0.10
139_K	298_Y	0.512	0.10
29_S	76_E	0.511	0.10
369_A	410_D	0.511	0.10
157_S	405_V	0.511	0.10
386_V	500_K	0.511	0.10
97_G	105_N	0.511	0.10
265_A	474_T	0.510	0.10
44_T	442_M	0.510	0.10
106_G	389_M	0.509	0.10
145_P	578_A	0.508	0.10
192_V	378_T	0.508	0.10
131_N	472_V	0.508	0.10
180_E	234_I	0.507	0.10
188_R	319_Q	0.507	0.10
474_T	494_R	0.507	0.10
275_D	333_H	0.507	0.10
109_K	217_A	0.507	0.10
277_L	341_M	0.507	0.10
518_E	522_E	0.507	0.10
322_L	537_H	0.507	0.10
217_A	523_Y	0.507	0.10
214_M	332_T	0.506	0.10
155_H	409_M	0.505	0.10
204_T	527_T	0.504	0.10
150_I	335_E	0.504	0.10
497_A	506_R	0.504	0.10
339_E	342_K	0.503	0.10
27_G	68_P	0.503	0.10
249_V	552_S	0.502	0.10
272_I	575_K	0.502	0.10
215_T	219_R	0.501	0.10
343_M	514_S	0.501	0.10
552_S	578_A	0.501	0.10
383_K	588_L	0.501	0.10
156_V	165_V	0.500	0.10
262_N	328_S	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3epoA	2	0.8508	100	0.175	Contact Map
4s28A	2	0.8729	100	0.234	Contact Map
3wqoA	2	0.3915	40.5	0.99	Contact Map
1qtwA	1	0.3983	36.2	0.99	Contact Map
1icpA	1	0.4508	33.9	0.99	Contact Map
3fysA	1	0.0678	33	0.99	Contact Map
3s4oA	1	0.2593	21.3	0.991	Contact Map
2yciX	2	0.3949	20.9	0.991	Contact Map
3p6lA	2	0.378	18.1	0.991	Contact Map
1i60A	1	0.4051	15.2	0.992	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0144 seconds.