NASB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

NASB - Assimilatory nitrate reductase electron transfer subunit

UniProt:	P42433	Sequences: MKKQRLVLAGNGMAGIRCIEEVLKLNRHMFEIVIFGSEPHPNYNRILLSSVLQGEASLDDITLNSKDWYDKHGITLYTGETVIQIDTDQQQVITDRKRTLSYDKLIVATGSSPHILPIPGADKKGVYGFRTIEDCQALMNMAQHFQKAAVIGAGLLGLEAAVGLQHLGMDVSVIHHSAGIMQKQLDQTAARLLQTELEQKGLTFLLEKDTVSISGATKADRIHFKDGSSLKADLIVMAAGVKPNIELAVSAGIKVNRGIIVNDFMQTSEPNIYAVGECAEHNGTVYGLVAPLYEQGKALASHICGVPCEEYQGSAPSAALKIAGIDVWSAGKIQEDERTTSIKIYDEQAGVYKKALFVDDKLAGVILFGDTRDKQRLLDSLLKQRDISIAKKQIIEPETSGPLFESMPSSETICQCNTVTKGAIEDAVHTNSLTTVEEVKHCTKATGSCGGCKPLVEDLLRYMTNSEYTKPASTPSFCSCTDFTEDDIIAELQRRPFTNPAEVMNQLDWKTKNGCSTCVPAIQYYLEMLYPGFVQPEPATEETCILIPQMYGGRTNAEQLRTIANIIEAYSIPDVSITHGQRLKLSGIKPADLPNMKKDLKMPVYTNEHRHALQSIKACTCGQNRSIQQLAAQIERQLEMLPLPAPISISLSCETDCTEAALQDVGAIRTQAGWDIHIGGVRGTHARSGALFCVTENEDSTAGMIKGLIQYYRETAHYLEGVHQWIDRLGIVHIREVLFEEDLRAQLLESLQTDLSLIQNPTVETGAYKKG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	771 (756)
Sequences:	1369 (681)
Seq/√Len:	24.8

ECOLI - NIRB
BACSU - NASB NASD

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
569_A	599_D	5.999	1.00
262_N	266_Q	5.937	1.00
87_T	269_E	5.838	1.00
630_L	698_E	5.309	1.00
697_N	700_S	5.189	1.00
736_E	740_E	4.811	1.00
558_E	568_E	4.760	1.00
497_F	503_V	4.446	1.00
550_M	555_T	4.343	1.00
90_Q	271_N	4.342	1.00
80_E	96_R	4.282	1.00
172_S	205_L	4.150	1.00
687_R	690_A	3.904	1.00
759_Q	764_E	3.869	1.00
633_Q	698_E	3.780	1.00
752_Q	756_S	3.780	1.00
9_A	107_V	3.750	1.00
435_T	438_E	3.720	1.00
91_Q	99_T	3.685	1.00
550_M	577_I	3.531	1.00
439_V	460_L	3.498	1.00
104_K	271_N	3.481	1.00
149_A	232_A	3.454	1.00
580_G	615_S	3.446	1.00
162_V	166_H	3.420	1.00
598_K	602_M	3.331	1.00
561_R	564_A	3.244	1.00
417_N	448_S	3.240	1.00
151_I	222_I	3.190	1.00
763_V	767_A	3.169	1.00
87_T	272_I	3.080	1.00
256_N	280_E	3.050	1.00
5_R	31_E	3.048	1.00
565_N	568_E	3.045	1.00
618_A	631_A	3.027	1.00
424_I	439_V	2.986	1.00
732_V	735_R	2.985	1.00
428_V	460_L	2.947	1.00
149_A	174_I	2.915	1.00
413_I	459_L	2.892	1.00
665_V	708_L	2.862	1.00
5_R	33_V	2.834	1.00
263_D	281_H	2.800	0.99
254_K	268_S	2.784	0.99
80_E	98_R	2.773	0.99
263_D	282_N	2.740	0.99
93_I	99_T	2.737	0.99
570_Y	599_D	2.672	0.99
208_K	224_F	2.606	0.99
269_E	272_I	2.582	0.99
39_P	133_E	2.553	0.99
704_M	739_F	2.548	0.99
170_D	203_T	2.456	0.99
554_R	632_A	2.412	0.98
212_S	223_H	2.410	0.98
446_T	453_K	2.373	0.98
253_I	272_I	2.350	0.98
85_I	107_V	2.346	0.98
8_L	19_I	2.319	0.98
559_Q	562_T	2.295	0.98
80_E	94_T	2.269	0.98
676_I	704_M	2.268	0.98
643_L	647_I	2.257	0.97
299_L	303_I	2.237	0.97
35_F	82_V	2.234	0.97
720_E	728_R	2.228	0.97
273_Y	302_H	2.195	0.97
35_F	100_L	2.183	0.97
495_R	506_Q	2.176	0.97
84_Q	93_I	2.173	0.97
223_H	229_S	2.173	0.97
690_A	726_I	2.167	0.97
253_I	269_E	2.165	0.97
86_D	89_Q	2.164	0.97
731_I	735_R	2.160	0.97
51_V	136_Q	2.114	0.96
457_E	461_R	2.101	0.96
426_D	430_T	2.099	0.96
81_T	95_D	2.093	0.96
214_S	221_R	2.087	0.96
409_S	422_G	2.084	0.96
589_K	592_D	2.068	0.96
330_A	365_V	2.066	0.96
311_Y	314_S	2.038	0.95
35_F	94_T	2.019	0.95
9_A	82_V	2.013	0.95
734_I	738_L	2.004	0.95
649_I	665_V	2.002	0.95
25_L	301_S	2.001	0.95
522_I	526_L	1.990	0.95
678_I	692_F	1.981	0.94
11_N	69_Y	1.951	0.94
280_E	285_V	1.951	0.94
4_Q	104_K	1.948	0.94
16_I	34_I	1.946	0.94
114_H	239_A	1.943	0.94
301_S	306_V	1.934	0.94
561_R	565_N	1.930	0.94
107_V	259_I	1.923	0.94
246_E	250_S	1.918	0.93
36_G	82_V	1.913	0.93
629_Q	633_Q	1.904	0.93
41_P	76_L	1.894	0.93
77_Y	98_R	1.888	0.93
711_Y	733_H	1.880	0.93
89_Q	99_T	1.872	0.93
17_R	21_E	1.867	0.93
125_G	141_M	1.856	0.92
57_S	60_D	1.853	0.92
194_Q	198_E	1.848	0.92
23_L	32_I	1.839	0.92
64_N	68_W	1.839	0.92
561_R	568_E	1.836	0.92
747_L	750_S	1.836	0.92
677_H	689_G	1.830	0.92
555_T	559_Q	1.830	0.92
4_Q	29_M	1.829	0.92
147_K	170_D	1.820	0.92
82_V	94_T	1.813	0.91
563_I	583_L	1.812	0.91
7_V	100_L	1.807	0.91
502_E	506_Q	1.789	0.91
679_G	726_I	1.765	0.90
547_I	610_R	1.753	0.90
259_I	278_C	1.749	0.90
580_G	584_K	1.747	0.90
669_R	674_W	1.744	0.90
726_I	734_I	1.738	0.89
665_V	705_I	1.737	0.89
547_I	584_K	1.730	0.89
80_E	95_D	1.694	0.88
346_D	349_A	1.694	0.88
641_L	709_I	1.688	0.88
123_K	220_D	1.682	0.88
436_V	456_V	1.680	0.88
94_T	98_R	1.663	0.87
37_S	244_N	1.662	0.87
612_A	643_L	1.658	0.87
760_N	763_V	1.648	0.87
208_K	226_D	1.644	0.87
584_K	615_S	1.643	0.87
87_T	253_I	1.642	0.87
598_K	766_G	1.632	0.86
559_Q	563_I	1.631	0.86
741_E	744_R	1.627	0.86
572_I	596_M	1.623	0.86
460_L	464_T	1.608	0.85
335_E	339_T	1.608	0.85
562_T	601_K	1.605	0.85
708_L	726_I	1.601	0.85
6_L	30_F	1.589	0.85
477_F	521_A	1.583	0.84
729_L	734_I	1.581	0.84
35_F	77_Y	1.578	0.84
557_A	567_I	1.565	0.84
211_V	225_K	1.561	0.84
119_P	212_S	1.553	0.83
557_A	575_V	1.520	0.82
633_Q	699_D	1.516	0.82
425_E	463_M	1.515	0.82
687_R	727_D	1.512	0.82
19_I	23_L	1.509	0.81
453_K	456_V	1.505	0.81
550_M	563_I	1.503	0.81
299_L	302_H	1.503	0.81
679_G	708_L	1.498	0.81
700_S	704_M	1.494	0.81
572_I	588_I	1.482	0.80
14_A	292_L	1.475	0.80
249_V	255_V	1.472	0.80
746_Q	749_E	1.471	0.80
733_H	737_V	1.461	0.79
379_D	383_K	1.460	0.79
87_T	251_A	1.459	0.79
562_T	602_M	1.455	0.79
693_C	696_E	1.455	0.79
85_I	272_I	1.454	0.79
5_R	101_S	1.451	0.79
641_L	754_D	1.443	0.78
433_L	438_E	1.441	0.78
89_Q	93_I	1.436	0.78
222_I	235_I	1.433	0.78
18_C	275_V	1.432	0.78
266_Q	273_Y	1.428	0.78
67_D	70_D	1.424	0.77
263_D	310_E	1.416	0.77
678_I	726_I	1.413	0.77
464_T	469_T	1.410	0.77
127_Y	141_M	1.398	0.76
80_E	83_I	1.395	0.76
149_A	222_I	1.394	0.76
498_T	530_Y	1.393	0.76
463_M	466_S	1.390	0.76
711_Y	715_T	1.380	0.75
592_D	595_N	1.380	0.75
567_I	572_I	1.379	0.75
634_I	650_S	1.369	0.75
547_I	580_G	1.366	0.74
328_W	371_T	1.356	0.74
487_D	490_A	1.354	0.74
681_V	723_H	1.353	0.74
30_F	303_I	1.347	0.73
17_R	417_N	1.343	0.73
674_W	698_E	1.339	0.73
37_S	81_T	1.327	0.72
360_D	386_D	1.322	0.72
47_L	50_S	1.318	0.72
68_W	72_H	1.317	0.72
464_T	468_Y	1.316	0.72
11_N	15_G	1.299	0.71
260_I	280_E	1.296	0.70
64_N	67_D	1.293	0.70
499_N	502_E	1.292	0.70
562_T	603_P	1.291	0.70
281_H	286_Y	1.288	0.70
353_K	373_D	1.283	0.70
174_I	207_E	1.283	0.70
490_A	494_R	1.279	0.69
55_E	60_D	1.272	0.69
18_C	106_I	1.270	0.69
387_I	391_K	1.270	0.69
215_G	220_D	1.266	0.69
633_Q	674_W	1.260	0.68
405_E	462_Y	1.257	0.68
412_T	418_T	1.254	0.68
162_V	323_A	1.254	0.68
266_Q	302_H	1.254	0.68
54_G	60_D	1.251	0.68
327_V	368_F	1.250	0.68
550_M	632_A	1.247	0.67
192_L	225_K	1.243	0.67
123_K	215_G	1.242	0.67
417_N	444_K	1.235	0.67
214_S	223_H	1.230	0.66
566_I	585_L	1.221	0.66
434_T	438_E	1.219	0.66
500_P	504_M	1.217	0.65
566_I	596_M	1.215	0.65
678_I	734_I	1.210	0.65
692_F	739_F	1.206	0.65
550_M	559_Q	1.204	0.65
36_G	40_H	1.204	0.65
407_M	411_E	1.203	0.64
533_F	765_T	1.202	0.64
13_M	293_Y	1.201	0.64
739_F	744_R	1.200	0.64
584_K	650_S	1.197	0.64
503_V	522_I	1.181	0.63
115_I	118_I	1.180	0.63
87_T	271_N	1.178	0.63
205_L	208_K	1.177	0.63
433_L	439_V	1.175	0.63
667_A	701_T	1.166	0.62
164_L	236_V	1.166	0.62
715_T	729_L	1.164	0.62
667_A	705_I	1.161	0.62
629_Q	734_I	1.157	0.61
19_I	68_W	1.156	0.61
647_I	709_I	1.153	0.61
563_I	650_S	1.151	0.61
681_V	722_V	1.146	0.61
187_Q	191_R	1.145	0.61
21_E	297_K	1.142	0.60
60_D	63_L	1.141	0.60
682_R	723_H	1.140	0.60
630_L	667_A	1.134	0.60
413_I	428_V	1.132	0.60
259_I	280_E	1.128	0.59
555_T	577_I	1.126	0.59
176_H	209_D	1.124	0.59
326_D	371_T	1.123	0.59
633_Q	702_A	1.121	0.59
176_H	182_Q	1.118	0.59
649_I	667_A	1.117	0.59
210_T	222_I	1.117	0.59
67_D	71_K	1.110	0.58
715_T	725_W	1.109	0.58
210_T	235_I	1.109	0.58
609_H	615_S	1.108	0.58
219_A	235_I	1.108	0.58
403_L	406_S	1.107	0.58
115_I	128_G	1.105	0.58
387_I	395_I	1.102	0.58
34_I	76_L	1.101	0.57
84_Q	250_S	1.101	0.57
64_N	69_Y	1.100	0.57
10_G	13_M	1.099	0.57
40_H	132_I	1.098	0.57
334_Q	366_I	1.096	0.57
151_I	235_I	1.094	0.57
22_V	303_I	1.092	0.57
90_Q	338_R	1.088	0.57
11_N	42_N	1.085	0.56
559_Q	605_Y	1.081	0.56
630_L	674_W	1.077	0.56
557_A	568_E	1.076	0.56
630_L	633_Q	1.075	0.56
577_I	583_L	1.073	0.56
209_D	225_K	1.071	0.55
390_A	393_Q	1.069	0.55
283_G	346_D	1.068	0.55
116_L	237_M	1.064	0.55
429_H	467_E	1.063	0.55
475_P	484_T	1.063	0.55
745_A	749_E	1.061	0.55
6_L	24_K	1.060	0.55
746_Q	750_S	1.057	0.54
422_G	426_D	1.055	0.54
126_V	237_M	1.055	0.54
335_E	341_S	1.053	0.54
83_I	95_D	1.050	0.54
440_K	453_K	1.040	0.53
62_T	68_W	1.039	0.53
178_A	187_Q	1.036	0.53
645_A	686_A	1.023	0.52
113_P	238_A	1.023	0.52
253_I	268_S	1.023	0.52
132_I	136_Q	1.022	0.52
491_E	507_L	1.022	0.52
404_F	413_I	1.021	0.52
77_Y	80_E	1.016	0.51
491_E	495_R	1.013	0.51
179_G	187_Q	1.012	0.51
33_V	77_Y	1.011	0.51
699_D	703_G	1.010	0.51
228_S	563_I	1.009	0.51
104_K	273_Y	1.007	0.51
215_G	219_A	1.003	0.50
177_S	182_Q	1.003	0.50
22_V	304_C	1.002	0.50
30_F	304_C	1.001	0.50
153_A	180_I	1.001	0.50
564_A	618_A	0.999	0.50
138_L	234_L	0.997	0.50
626_S	629_Q	0.996	0.50
500_P	522_I	0.996	0.50
515_C	518_C	0.995	0.50
68_W	74_I	0.995	0.50
132_I	353_K	0.993	0.50
19_I	69_Y	0.992	0.50
521_A	525_Y	0.991	0.50
94_T	100_L	0.991	0.50
214_S	217_T	0.991	0.50
273_Y	299_L	0.989	0.49
580_G	609_H	0.989	0.49
482_D	510_K	0.986	0.49
330_A	378_L	0.986	0.49
26_N	29_M	0.982	0.49
736_E	742_D	0.982	0.49
562_T	566_I	0.982	0.49
562_T	565_N	0.981	0.49
738_L	744_R	0.981	0.49
665_V	701_T	0.981	0.49
701_T	705_I	0.981	0.49
31_E	75_T	0.978	0.49
23_L	26_N	0.976	0.49
570_Y	595_N	0.974	0.48
704_M	748_L	0.972	0.48
567_I	596_M	0.971	0.48
11_N	76_L	0.967	0.48
40_H	133_E	0.966	0.48
146_Q	233_D	0.963	0.48
82_V	92_V	0.963	0.48
8_L	16_I	0.958	0.47
552_G	632_A	0.955	0.47
564_A	568_E	0.953	0.47
232_A	235_I	0.953	0.47
489_I	750_S	0.950	0.47
687_R	726_I	0.950	0.47
492_L	525_Y	0.947	0.46
682_R	722_V	0.943	0.46
475_P	487_D	0.941	0.46
37_S	246_E	0.940	0.46
436_V	446_T	0.939	0.46
429_H	463_M	0.938	0.46
174_I	189_A	0.938	0.46
189_A	368_F	0.936	0.46
191_R	194_Q	0.936	0.46
197_L	202_L	0.934	0.46
118_I	210_T	0.930	0.45
142_A	169_M	0.930	0.45
501_A	504_M	0.926	0.45
489_I	529_L	0.923	0.45
105_L	247_L	0.919	0.44
82_V	100_L	0.918	0.44
33_V	75_T	0.917	0.44
446_T	454_P	0.917	0.44
497_F	522_I	0.915	0.44
192_L	345_Y	0.913	0.44
344_I	351_V	0.910	0.44
474_T	487_D	0.907	0.44
221_R	229_S	0.907	0.44
735_R	739_F	0.907	0.44
68_W	126_V	0.906	0.44
185_L	371_T	0.906	0.44
640_M	758_I	0.906	0.44
165_Q	202_L	0.906	0.44
355_A	362_L	0.905	0.43
62_T	67_D	0.905	0.43
533_F	536_P	0.902	0.43
332_K	356_L	0.902	0.43
175_H	182_Q	0.901	0.43
739_F	748_L	0.900	0.43
118_I	121_A	0.899	0.43
483_F	507_L	0.898	0.43
407_M	413_I	0.896	0.43
692_F	708_L	0.895	0.43
19_I	32_I	0.894	0.43
656_D	668_I	0.894	0.43
14_A	52_L	0.893	0.43
190_A	630_L	0.893	0.43
142_A	286_Y	0.891	0.42
16_I	19_I	0.890	0.42
474_T	484_T	0.889	0.42
430_T	433_L	0.886	0.42
559_Q	566_I	0.886	0.42
6_L	18_C	0.886	0.42
645_A	682_R	0.886	0.42
514_G	518_C	0.883	0.42
613_L	634_I	0.882	0.42
630_L	669_R	0.880	0.42
8_L	18_C	0.880	0.42
662_L	682_R	0.879	0.42
13_M	292_L	0.876	0.41
551_Y	639_E	0.876	0.41
636_R	639_E	0.874	0.41
125_G	219_A	0.871	0.41
678_I	738_L	0.868	0.41
212_S	303_I	0.867	0.41
181_M	210_T	0.865	0.41
91_Q	101_S	0.865	0.41
81_T	96_R	0.864	0.41
588_I	596_M	0.864	0.41
606_T	640_M	0.864	0.41
174_I	222_I	0.863	0.40
362_L	738_L	0.862	0.40
50_S	55_E	0.859	0.40
343_K	692_F	0.858	0.40
634_I	667_A	0.857	0.40
647_I	705_I	0.856	0.40
264_F	302_H	0.856	0.40
9_A	89_Q	0.855	0.40
9_A	32_I	0.854	0.40
733_H	736_E	0.852	0.40
224_F	228_S	0.850	0.40
36_G	76_L	0.849	0.40
478_C	515_C	0.849	0.40
391_K	397_P	0.848	0.39
559_Q	585_L	0.847	0.39
595_N	598_K	0.841	0.39
417_N	456_V	0.836	0.39
555_T	563_I	0.836	0.39
483_F	491_E	0.834	0.38
440_K	446_T	0.828	0.38
185_L	189_A	0.826	0.38
84_Q	91_Q	0.825	0.38
83_I	246_E	0.825	0.38
428_V	671_Q	0.824	0.38
478_C	518_C	0.822	0.38
753_T	756_S	0.822	0.38
194_Q	206_L	0.821	0.38
367_L	373_D	0.821	0.38
650_S	705_I	0.818	0.37
39_P	132_I	0.816	0.37
559_Q	575_V	0.815	0.37
491_E	506_Q	0.815	0.37
539_A	545_I	0.814	0.37
698_E	701_T	0.814	0.37
36_G	78_T	0.813	0.37
197_L	204_F	0.813	0.37
647_I	665_V	0.812	0.37
616_I	651_L	0.810	0.37
104_K	266_Q	0.810	0.37
173_V	202_L	0.808	0.37
6_L	303_I	0.804	0.36
42_N	135_C	0.801	0.36
754_D	758_I	0.800	0.36
195_T	734_I	0.799	0.36
202_L	323_A	0.799	0.36
598_K	767_A	0.797	0.36
7_V	35_F	0.797	0.36
49_S	166_H	0.796	0.36
88_D	93_I	0.795	0.36
23_L	36_G	0.795	0.36
162_V	165_Q	0.794	0.36
378_L	382_L	0.794	0.36
106_I	299_L	0.793	0.36
140_N	143_Q	0.792	0.36
747_L	751_L	0.791	0.36
496_P	502_E	0.790	0.36
21_E	25_L	0.787	0.35
650_S	662_L	0.784	0.35
753_T	757_L	0.782	0.35
633_Q	636_R	0.782	0.35
214_S	220_D	0.782	0.35
489_I	493_Q	0.780	0.35
286_Y	311_Y	0.779	0.35
361_K	384_Q	0.778	0.35
264_F	310_E	0.776	0.35
8_L	34_I	0.776	0.35
556_N	572_I	0.774	0.34
22_V	53_Q	0.774	0.34
112_S	244_N	0.773	0.34
645_A	681_V	0.772	0.34
306_V	310_E	0.772	0.34
390_A	397_P	0.771	0.34
759_Q	767_A	0.771	0.34
586_S	628_Q	0.770	0.34
11_N	34_I	0.769	0.34
8_L	15_G	0.769	0.34
492_L	503_V	0.768	0.34
79_G	384_Q	0.763	0.34
163_G	292_L	0.762	0.34
534_V	537_E	0.761	0.34
493_Q	529_L	0.761	0.34
91_Q	100_L	0.760	0.34
533_F	537_E	0.760	0.34
26_N	304_C	0.759	0.34
221_R	231_K	0.757	0.33
175_H	238_A	0.756	0.33
246_E	702_A	0.756	0.33
32_I	731_I	0.755	0.33
568_E	599_D	0.753	0.33
404_F	459_L	0.753	0.33
92_V	102_Y	0.752	0.33
81_T	246_E	0.750	0.33
547_I	586_S	0.748	0.33
549_Q	626_S	0.746	0.33
521_A	526_L	0.745	0.33
86_D	262_N	0.744	0.33
132_I	202_L	0.742	0.32
33_V	100_L	0.742	0.32
686_A	723_H	0.741	0.32
9_A	12_G	0.740	0.32
137_A	230_L	0.740	0.32
733_H	742_D	0.740	0.32
558_E	569_A	0.739	0.32
630_L	704_M	0.739	0.32
478_C	514_G	0.739	0.32
149_A	758_I	0.739	0.32
41_P	590_P	0.738	0.32
357_F	387_I	0.738	0.32
715_T	737_V	0.738	0.32
550_M	605_Y	0.738	0.32
609_H	649_I	0.737	0.32
210_T	213_I	0.737	0.32
570_Y	596_M	0.737	0.32
563_I	585_L	0.736	0.32
517_T	718_Y	0.736	0.32
262_N	273_Y	0.735	0.32
333_I	356_L	0.735	0.32
738_L	751_L	0.735	0.32
533_F	538_P	0.734	0.32
317_S	381_L	0.734	0.32
408_P	411_E	0.732	0.32
611_H	620_T	0.732	0.32
497_F	507_L	0.728	0.32
329_S	333_I	0.727	0.31
311_Y	315_A	0.726	0.31
19_I	34_I	0.726	0.31
362_L	380_S	0.726	0.31
196_E	199_Q	0.725	0.31
179_G	190_A	0.724	0.31
282_N	311_Y	0.724	0.31
302_H	308_C	0.723	0.31
149_A	206_L	0.723	0.31
425_E	428_V	0.723	0.31
270_P	678_I	0.722	0.31
391_K	395_I	0.722	0.31
59_D	67_D	0.721	0.31
576_S	584_K	0.721	0.31
148_A	164_L	0.720	0.31
183_K	265_M	0.720	0.31
492_L	529_L	0.720	0.31
646_P	655_T	0.719	0.31
343_K	602_M	0.715	0.31
248_A	259_I	0.715	0.31
661_A	677_H	0.715	0.31
444_K	447_G	0.714	0.31
528_M	713_R	0.714	0.31
69_Y	72_H	0.713	0.31
351_V	498_T	0.713	0.31
162_V	200_K	0.713	0.31
455_L	463_M	0.713	0.31
562_T	599_D	0.713	0.31
641_L	647_I	0.712	0.31
93_I	251_A	0.712	0.31
37_S	113_P	0.711	0.30
63_L	67_D	0.711	0.30
570_Y	602_M	0.710	0.30
535_Q	538_P	0.709	0.30
341_S	347_E	0.709	0.30
708_L	716_A	0.709	0.30
23_L	73_G	0.708	0.30
341_S	354_K	0.707	0.30
384_Q	389_I	0.707	0.30
32_I	503_V	0.707	0.30
5_R	766_G	0.707	0.30
114_H	117_P	0.707	0.30
49_S	142_A	0.707	0.30
476_S	484_T	0.707	0.30
23_L	72_H	0.707	0.30
665_V	676_I	0.706	0.30
162_V	202_L	0.706	0.30
185_L	202_L	0.706	0.30
266_Q	269_E	0.703	0.30
42_N	69_Y	0.703	0.30
540_T	649_I	0.702	0.30
661_A	686_A	0.702	0.30
614_Q	646_P	0.701	0.30
668_I	688_S	0.701	0.30
20_E	68_W	0.701	0.30
41_P	78_T	0.700	0.30
175_H	323_A	0.699	0.30
176_H	222_I	0.697	0.30
9_A	438_E	0.697	0.30
738_L	748_L	0.696	0.30
720_E	733_H	0.696	0.30
174_I	224_F	0.694	0.29
196_E	325_I	0.694	0.29
563_I	713_R	0.694	0.29
266_Q	298_A	0.692	0.29
281_H	314_S	0.692	0.29
496_P	530_Y	0.692	0.29
37_S	360_D	0.692	0.29
174_I	232_A	0.691	0.29
325_I	674_W	0.690	0.29
30_F	104_K	0.689	0.29
4_Q	26_N	0.689	0.29
389_I	395_I	0.688	0.29
126_V	183_K	0.688	0.29
690_A	727_D	0.688	0.29
147_K	233_D	0.687	0.29
645_A	719_L	0.687	0.29
36_G	69_Y	0.687	0.29
132_I	585_L	0.687	0.29
428_V	433_L	0.686	0.29
286_Y	313_G	0.686	0.29
327_V	451_G	0.684	0.29
289_V	293_Y	0.684	0.29
14_A	163_G	0.684	0.29
646_P	657_C	0.684	0.29
73_G	340_T	0.683	0.29
497_F	506_Q	0.682	0.29
36_G	64_N	0.681	0.29
59_D	65_S	0.681	0.29
6_L	22_V	0.680	0.29
547_I	615_S	0.679	0.29
332_K	363_A	0.679	0.29
668_I	686_A	0.679	0.29
281_H	311_Y	0.678	0.29
9_A	77_Y	0.678	0.29
393_Q	397_P	0.678	0.29
220_D	229_S	0.678	0.29
526_L	536_P	0.677	0.28
549_Q	613_L	0.676	0.28
252_G	255_V	0.676	0.28
192_L	424_I	0.675	0.28
21_E	36_G	0.675	0.28
145_F	218_K	0.674	0.28
428_V	448_S	0.673	0.28
90_Q	104_K	0.673	0.28
390_A	399_T	0.673	0.28
748_L	751_L	0.672	0.28
719_L	741_E	0.672	0.28
659_E	663_Q	0.672	0.28
750_S	754_D	0.672	0.28
145_F	233_D	0.671	0.28
7_V	227_G	0.670	0.28
30_F	106_I	0.669	0.28
415_Q	624_N	0.668	0.28
561_R	583_L	0.666	0.28
269_E	273_Y	0.666	0.28
200_K	323_A	0.666	0.28
36_G	94_T	0.666	0.28
551_Y	636_R	0.666	0.28
546_L	570_Y	0.665	0.28
621_C	653_C	0.665	0.28
641_L	665_V	0.664	0.28
7_V	92_V	0.664	0.28
555_T	713_R	0.663	0.28
650_S	690_A	0.663	0.28
708_L	715_T	0.663	0.28
749_E	753_T	0.662	0.28
188_T	207_E	0.661	0.28
11_N	77_Y	0.660	0.27
490_A	733_H	0.659	0.27
65_S	71_K	0.658	0.27
241_V	531_P	0.658	0.27
82_V	221_R	0.658	0.27
340_T	356_L	0.656	0.27
211_V	223_H	0.656	0.27
477_F	488_I	0.655	0.27
598_K	699_D	0.655	0.27
58_L	62_T	0.652	0.27
503_V	592_D	0.652	0.27
118_I	690_A	0.651	0.27
5_R	11_N	0.650	0.27
15_G	42_N	0.650	0.27
655_T	659_E	0.650	0.27
492_L	522_I	0.649	0.27
255_V	306_V	0.649	0.27
49_S	69_Y	0.649	0.27
428_V	436_V	0.648	0.27
477_F	517_T	0.647	0.27
167_L	566_I	0.645	0.27
577_I	632_A	0.643	0.27
597_K	648_S	0.643	0.27
562_T	606_T	0.643	0.27
286_Y	436_V	0.642	0.26
378_L	451_G	0.640	0.26
751_L	755_L	0.640	0.26
662_L	686_A	0.640	0.26
281_H	728_R	0.640	0.26
531_P	534_V	0.638	0.26
596_M	599_D	0.638	0.26
418_T	695_T	0.637	0.26
278_C	713_R	0.636	0.26
214_S	229_S	0.636	0.26
634_I	702_A	0.635	0.26
611_H	622_G	0.634	0.26
541_E	630_L	0.634	0.26
7_V	10_G	0.634	0.26
7_V	12_G	0.634	0.26
52_L	163_G	0.632	0.26
79_G	254_K	0.632	0.26
706_K	748_L	0.632	0.26
605_Y	734_I	0.632	0.26
215_G	221_R	0.631	0.26
15_G	275_V	0.631	0.26
201_G	222_I	0.631	0.26
66_K	78_T	0.631	0.26
615_S	650_S	0.631	0.26
8_L	12_G	0.630	0.26
327_V	584_K	0.630	0.26
286_Y	314_S	0.630	0.26
222_I	230_L	0.630	0.26
9_A	702_A	0.630	0.26
278_C	366_I	0.629	0.26
124_K	357_F	0.629	0.26
713_R	754_D	0.627	0.26
429_H	439_V	0.626	0.26
19_I	83_I	0.626	0.26
409_S	426_D	0.626	0.26
391_K	396_E	0.626	0.26
451_G	654_E	0.626	0.26
428_V	549_Q	0.625	0.26
645_A	708_L	0.624	0.25
187_Q	538_P	0.624	0.25
439_V	456_V	0.624	0.25
49_S	543_T	0.623	0.25
637_Q	686_A	0.623	0.25
91_Q	140_N	0.622	0.25
493_Q	750_S	0.621	0.25
90_Q	268_S	0.621	0.25
580_G	608_E	0.620	0.25
638_L	706_K	0.620	0.25
261_V	281_H	0.620	0.25
322_I	327_V	0.619	0.25
6_L	630_L	0.619	0.25
330_A	382_L	0.619	0.25
412_T	540_T	0.618	0.25
36_G	125_G	0.617	0.25
441_H	690_A	0.616	0.25
90_Q	95_D	0.616	0.25
106_I	275_V	0.615	0.25
404_F	458_D	0.614	0.25
149_A	199_Q	0.613	0.25
661_A	685_H	0.613	0.25
172_S	676_I	0.612	0.25
36_G	53_Q	0.612	0.25
608_E	615_S	0.612	0.25
32_I	74_I	0.612	0.25
82_V	282_N	0.611	0.25
136_Q	139_M	0.611	0.25
492_L	623_Q	0.611	0.25
36_G	272_I	0.611	0.25
7_V	13_M	0.611	0.25
121_A	702_A	0.610	0.25
457_E	765_T	0.610	0.25
601_K	765_T	0.610	0.25
83_I	251_A	0.609	0.25
52_L	55_E	0.608	0.25
325_I	675_D	0.608	0.25
622_G	657_C	0.608	0.25
521_A	612_A	0.607	0.25
503_V	507_L	0.607	0.25
93_I	256_N	0.607	0.25
49_S	290_A	0.606	0.24
229_S	298_A	0.606	0.24
172_S	208_K	0.605	0.24
595_N	599_D	0.605	0.24
529_L	690_A	0.604	0.24
203_T	206_L	0.604	0.24
556_N	567_I	0.602	0.24
11_N	49_S	0.602	0.24
362_L	387_I	0.602	0.24
579_H	659_E	0.601	0.24
738_L	757_L	0.601	0.24
225_K	228_S	0.600	0.24
413_I	455_L	0.600	0.24
172_S	203_T	0.599	0.24
648_S	655_T	0.599	0.24
646_P	659_E	0.598	0.24
113_P	247_L	0.597	0.24
513_N	720_E	0.597	0.24
16_I	44_N	0.596	0.24
99_T	598_K	0.595	0.24
530_Y	533_F	0.595	0.24
17_R	246_E	0.595	0.24
576_S	579_H	0.594	0.24
317_S	444_K	0.593	0.24
354_K	718_Y	0.592	0.24
142_A	167_L	0.592	0.24
555_T	632_A	0.592	0.24
64_N	74_I	0.592	0.24
382_L	385_R	0.591	0.24
489_I	713_R	0.591	0.24
85_I	92_V	0.591	0.24
238_A	323_A	0.591	0.24
9_A	74_I	0.590	0.24
622_G	659_E	0.590	0.24
24_K	372_R	0.589	0.24
151_I	237_M	0.589	0.24
179_G	183_K	0.589	0.24
167_L	451_G	0.588	0.24
114_H	731_I	0.588	0.24
249_V	738_L	0.588	0.24
608_E	611_H	0.588	0.24
335_E	625_R	0.588	0.24
495_R	733_H	0.587	0.23
745_A	748_L	0.587	0.23
254_K	260_I	0.587	0.23
611_H	617_K	0.586	0.23
611_H	655_T	0.586	0.23
116_L	121_A	0.586	0.23
213_I	221_R	0.584	0.23
425_E	429_H	0.584	0.23
129_F	319_A	0.584	0.23
565_N	599_D	0.584	0.23
147_K	231_K	0.584	0.23
52_L	292_L	0.583	0.23
395_I	557_A	0.582	0.23
579_H	608_E	0.582	0.23
379_D	411_E	0.582	0.23
42_N	421_K	0.581	0.23
764_E	767_A	0.581	0.23
622_G	655_T	0.581	0.23
63_L	68_W	0.581	0.23
539_A	617_K	0.581	0.23
393_Q	399_T	0.581	0.23
433_L	460_L	0.580	0.23
6_L	532_G	0.580	0.23
579_H	622_G	0.579	0.23
86_D	93_I	0.578	0.23
579_H	597_K	0.578	0.23
747_L	755_L	0.578	0.23
579_H	655_T	0.578	0.23
297_K	330_A	0.577	0.23
708_L	722_V	0.577	0.23
6_L	32_I	0.577	0.23
625_R	630_L	0.577	0.23
344_I	407_M	0.577	0.23
687_R	724_Q	0.577	0.23
286_Y	417_N	0.576	0.23
138_L	424_I	0.576	0.23
14_A	293_Y	0.576	0.23
119_P	141_M	0.575	0.23
217_T	254_K	0.574	0.23
610_R	622_G	0.574	0.23
621_C	657_C	0.573	0.23
181_M	193_L	0.572	0.23
75_T	79_G	0.572	0.23
602_M	765_T	0.572	0.23
65_S	68_W	0.571	0.23
738_L	746_Q	0.571	0.23
20_E	24_K	0.571	0.23
608_E	655_T	0.570	0.23
90_Q	264_F	0.570	0.23
424_I	550_M	0.569	0.23
354_K	442_C	0.569	0.23
482_D	511_T	0.569	0.23
462_Y	466_S	0.568	0.23
613_L	626_S	0.568	0.23
608_E	659_E	0.568	0.23
617_K	657_C	0.567	0.22
625_R	698_E	0.567	0.22
517_T	546_L	0.567	0.22
155_L	576_S	0.566	0.22
617_K	721_G	0.566	0.22
525_Y	717_H	0.566	0.22
547_I	612_A	0.566	0.22
113_P	128_G	0.565	0.22
738_L	741_E	0.564	0.22
417_N	607_N	0.564	0.22
253_I	363_A	0.564	0.22
255_V	260_I	0.564	0.22
645_A	722_V	0.564	0.22
11_N	68_W	0.563	0.22
661_A	689_G	0.563	0.22
468_Y	473_S	0.563	0.22
639_E	754_D	0.562	0.22
665_V	723_H	0.562	0.22
14_A	18_C	0.562	0.22
54_G	57_S	0.562	0.22
627_I	658_T	0.562	0.22
121_A	237_M	0.561	0.22
547_I	650_S	0.560	0.22
4_Q	30_F	0.559	0.22
128_G	494_R	0.559	0.22
261_V	294_E	0.559	0.22
85_I	105_L	0.559	0.22
132_I	139_M	0.559	0.22
223_H	227_G	0.559	0.22
361_K	386_D	0.558	0.22
318_A	615_S	0.558	0.22
251_A	702_A	0.558	0.22
606_T	638_L	0.557	0.22
597_K	617_K	0.556	0.22
104_K	302_H	0.556	0.22
557_A	686_A	0.555	0.22
562_T	569_A	0.555	0.22
672_A	695_T	0.555	0.22
286_Y	733_H	0.554	0.22
541_E	665_V	0.554	0.22
501_A	505_N	0.554	0.22
355_A	605_Y	0.554	0.22
486_D	717_H	0.554	0.22
313_G	367_L	0.553	0.22
69_Y	425_E	0.553	0.22
217_T	220_D	0.553	0.22
519_V	729_L	0.553	0.22
617_K	655_T	0.552	0.22
617_K	622_G	0.552	0.22
597_K	608_E	0.552	0.22
205_L	266_Q	0.552	0.22
373_D	484_T	0.551	0.22
413_I	420_T	0.551	0.22
268_S	272_I	0.551	0.22
608_E	622_G	0.551	0.22
104_K	272_I	0.550	0.22
351_V	372_R	0.550	0.22
637_Q	706_K	0.550	0.22
77_Y	228_S	0.549	0.22
167_L	647_I	0.549	0.22
282_N	313_G	0.549	0.22
174_I	208_K	0.549	0.22
224_F	540_T	0.548	0.22
384_Q	393_Q	0.548	0.22
185_L	281_H	0.547	0.21
141_M	259_I	0.547	0.21
9_A	92_V	0.547	0.21
295_Q	464_T	0.546	0.21
675_D	694_V	0.546	0.21
614_Q	659_E	0.546	0.21
174_I	571_S	0.546	0.21
272_I	702_A	0.545	0.21
55_E	418_T	0.545	0.21
265_M	294_E	0.545	0.21
652_S	658_T	0.544	0.21
514_G	725_W	0.544	0.21
547_I	578_T	0.544	0.21
641_L	689_G	0.543	0.21
92_V	492_L	0.543	0.21
300_A	439_V	0.543	0.21
561_R	618_A	0.543	0.21
52_L	222_I	0.543	0.21
31_E	543_T	0.542	0.21
26_N	199_Q	0.541	0.21
236_V	650_S	0.541	0.21
318_A	612_A	0.541	0.21
147_K	205_L	0.540	0.21
31_E	231_K	0.540	0.21
514_G	520_P	0.539	0.21
135_C	638_L	0.539	0.21
60_D	67_D	0.539	0.21
597_K	611_H	0.538	0.21
562_T	604_V	0.538	0.21
145_F	272_I	0.538	0.21
196_E	202_L	0.538	0.21
620_T	648_S	0.538	0.21
244_N	607_N	0.537	0.21
24_K	71_K	0.537	0.21
82_V	505_N	0.537	0.21
102_Y	269_E	0.537	0.21
650_S	685_H	0.536	0.21
648_S	721_G	0.536	0.21
432_S	438_E	0.536	0.21
144_H	541_E	0.535	0.21
353_K	456_V	0.535	0.21
679_G	736_E	0.535	0.21
87_T	254_K	0.535	0.21
18_C	299_L	0.535	0.21
235_I	766_G	0.534	0.21
608_E	620_T	0.534	0.21
753_T	758_I	0.533	0.21
391_K	394_I	0.532	0.21
481_T	524_Y	0.532	0.21
753_T	764_E	0.532	0.21
618_A	751_L	0.531	0.21
617_K	648_S	0.531	0.21
230_L	439_V	0.531	0.21
488_I	525_Y	0.531	0.21
620_T	655_T	0.531	0.21
298_A	312_Q	0.531	0.21
737_V	744_R	0.530	0.21
41_P	66_K	0.530	0.21
566_I	713_R	0.530	0.21
202_L	238_A	0.529	0.21
662_L	723_H	0.529	0.21
413_I	532_G	0.528	0.21
294_E	314_S	0.528	0.21
597_K	655_T	0.528	0.21
675_D	688_S	0.527	0.21
149_A	230_L	0.527	0.21
648_S	663_Q	0.527	0.21
300_A	304_C	0.526	0.20
562_T	570_Y	0.526	0.20
115_I	239_A	0.525	0.20
209_D	213_I	0.525	0.20
41_P	62_T	0.525	0.20
119_P	275_V	0.524	0.20
36_G	81_T	0.524	0.20
427_A	443_T	0.524	0.20
661_A	687_R	0.524	0.20
139_M	142_A	0.524	0.20
609_H	709_I	0.523	0.20
590_P	759_Q	0.523	0.20
148_A	323_A	0.523	0.20
140_N	435_T	0.523	0.20
579_H	620_T	0.522	0.20
623_Q	655_T	0.522	0.20
714_E	750_S	0.522	0.20
417_N	690_A	0.522	0.20
254_K	338_R	0.521	0.20
11_N	281_H	0.521	0.20
88_D	435_T	0.521	0.20
614_Q	721_G	0.521	0.20
317_S	327_V	0.521	0.20
256_N	585_L	0.520	0.20
40_H	62_T	0.520	0.20
84_Q	251_A	0.520	0.20
51_V	138_L	0.520	0.20
74_I	735_R	0.520	0.20
194_Q	745_A	0.520	0.20
62_T	395_I	0.519	0.20
463_M	468_Y	0.519	0.20
511_T	752_Q	0.519	0.20
210_T	367_L	0.519	0.20
145_F	234_L	0.519	0.20
185_L	464_T	0.519	0.20
4_Q	298_A	0.519	0.20
198_E	235_I	0.517	0.20
5_R	24_K	0.517	0.20
27_R	740_E	0.517	0.20
35_F	354_K	0.517	0.20
683_G	721_G	0.517	0.20
453_K	457_E	0.517	0.20
224_F	541_E	0.517	0.20
439_V	490_A	0.516	0.20
365_V	381_L	0.515	0.20
592_D	634_I	0.515	0.20
643_L	709_I	0.515	0.20
190_A	541_E	0.515	0.20
417_N	460_L	0.515	0.20
661_A	724_Q	0.515	0.20
682_R	715_T	0.515	0.20
233_D	411_E	0.515	0.20
586_S	642_P	0.515	0.20
26_N	73_G	0.514	0.20
485_E	642_P	0.514	0.20
607_N	760_N	0.514	0.20
307_P	738_L	0.514	0.20
608_E	648_S	0.514	0.20
132_I	246_E	0.514	0.20
146_Q	170_D	0.514	0.20
167_L	377_L	0.513	0.20
698_E	702_A	0.513	0.20
54_G	547_I	0.513	0.20
261_V	286_Y	0.513	0.20
241_V	739_F	0.513	0.20
219_A	405_E	0.513	0.20
170_D	197_L	0.512	0.20
597_K	620_T	0.512	0.20
380_S	396_E	0.512	0.20
121_A	147_K	0.511	0.20
663_Q	721_G	0.511	0.20
655_T	721_G	0.511	0.20
469_T	472_A	0.511	0.20
64_N	425_E	0.510	0.20
36_G	68_W	0.510	0.20
665_V	692_F	0.510	0.20
106_I	457_E	0.510	0.20
608_E	617_K	0.509	0.20
384_Q	387_I	0.509	0.20
567_I	585_L	0.509	0.20
132_I	138_L	0.509	0.20
5_R	75_T	0.508	0.20
204_F	585_L	0.508	0.20
594_P	640_M	0.508	0.20
176_H	224_F	0.507	0.20
272_I	558_E	0.507	0.20
656_D	660_A	0.507	0.20
9_A	422_G	0.506	0.20
620_T	659_E	0.506	0.20
118_I	239_A	0.506	0.20
678_I	731_I	0.506	0.20
340_T	601_K	0.505	0.19
59_D	62_T	0.505	0.19
199_Q	271_N	0.505	0.19
404_F	421_K	0.505	0.19
272_I	556_N	0.505	0.19
148_A	314_S	0.504	0.19
143_Q	436_V	0.504	0.19
264_F	308_C	0.503	0.19
96_R	99_T	0.503	0.19
578_T	584_K	0.503	0.19
354_K	732_V	0.503	0.19
406_S	711_Y	0.503	0.19
52_L	171_V	0.503	0.19
195_T	198_E	0.502	0.19
16_I	74_I	0.502	0.19
539_A	648_S	0.502	0.19
528_M	534_V	0.502	0.19
62_T	74_I	0.502	0.19
281_H	313_G	0.502	0.19
295_Q	566_I	0.502	0.19
79_G	272_I	0.501	0.19
257_R	270_P	0.501	0.19
580_G	647_I	0.501	0.19
732_V	736_E	0.501	0.19
386_D	735_R	0.500	0.19
228_S	250_S	0.500	0.19
648_S	653_C	0.500	0.19

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3lxdA	1	0.5175	100	0.805	Contact Map
3kljA	1	0.4903	100	0.808	Contact Map
1q1rA	1	0.5279	100	0.809	Contact Map
3fg2P	1	0.5136	100	0.809	Contact Map
2gqwA	2	0.5045	100	0.809	Contact Map
3ef6A	1	0.511	100	0.812	Contact Map
1xhcA	1	0.4488	100	0.815	Contact Map
3iwaA	2	0.4773	100	0.823	Contact Map
2v3aA	1	0.4929	100	0.823	Contact Map
1m6iA	1	0.4981	100	0.827	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0168 seconds.