YUXG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YUXG - Uncharacterized oxidoreductase YuxG

UniProt:	P40747	Sequences: MVKHIWDSERAAQLPKGVEELVYRSNLIGSDRTVCNWGGGNTSMKTTEKDFRGREIEVMWVKGSGSDLATMKAHNFSGLKLDDIRPLIKRDQMPDEEMVDYLSHCMIDSKHPRPSIETLLHAFLPYKHVDHTHPDAIISICCADNGKQIAEDIYGNRFVWVPYVRPGFTLSKMIAEGVANNPHAELVLMEKHGLVTWGETSETCYQKTISIIQEAEQYINDRINQHEVFGGKRYQPLPEDKRKQILAGIMPVIRGAVSEEKKMILSYDDHDDVLEFVNSVQAPALSQIGAACPDHLVHTKRVPLYIDWNPETQDVHKLADLIKSGVETFTSEYQAYFTRNQQDGDQIFESAPRVILIPGIGMVNTGKSYAMSKVSGALYRRAIAVMKGATALGQFVSLHENESYHVEYWPLELYKLTLAPPEAEFSRKVALITGGAGGIGSAACRRFAAEGGHVIVADLNIEGAQKIAGEINDAYGKGRAMAVKMDVTKEEDVQSAFERAALAYGGIDIVVNNAGLATSSPFDETSLKEWNLNMNVLGTGYFLVAREAFKQMKHQNRGGSMVFVGSKNSVYAGKNASAYSSVKALETHLARCIAAEGGEFGIRVNSVLPDAVLQGSAIWGSSWREERAAAYGIEPDQLEEHYRKRTALLVNIYPEDIAEAIAFFASSKAEKTTGCMITVDGGVPAAFTR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	689 (669)
Sequences:	564 (243)
Seq/√Len:	9.4

BACSU - YUXG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
339_R	400_E	8.059	1.00
422_E	427_R	6.426	1.00
354_V	364_N	6.260	1.00
516_L	536_V	5.553	1.00
664_F	677_I	4.650	1.00
202_E	206_Q	4.036	0.99
157_R	214_E	3.781	0.98
644_K	649_L	3.560	0.97
157_R	185_E	3.550	0.97
251_P	254_R	3.493	0.96
25_S	42_T	3.433	0.96
432_I	456_V	3.427	0.96
153_I	218_Y	3.372	0.95
132_T	208_T	3.306	0.95
497_F	507_I	3.250	0.94
430_A	447_F	3.247	0.94
429_V	507_I	3.234	0.94
140_I	153_I	3.154	0.93
200_T	203_T	3.153	0.93
188_L	194_L	3.092	0.93
570_V	688_T	3.075	0.92
431_L	496_A	3.046	0.92
552_M	602_I	3.026	0.92
198_G	207_K	3.007	0.92
490_E	546_R	2.991	0.91
23_Y	27_L	2.984	0.91
455_I	500_A	2.950	0.91
47_T	57_E	2.925	0.90
549_F	597_G	2.862	0.89
49_K	55_E	2.851	0.89
251_P	255_G	2.842	0.89
489_K	492_D	2.804	0.88
47_T	55_E	2.786	0.88
334_Q	347_I	2.763	0.87
638_L	642_Y	2.714	0.87
490_E	527_L	2.708	0.86
354_V	379_Y	2.705	0.86
250_M	254_R	2.651	0.85
250_M	267_Y	2.640	0.85
334_Q	338_T	2.609	0.84
21_L	24_R	2.593	0.84
219_I	392_L	2.576	0.83
545_A	561_M	2.568	0.83
656_D	671_K	2.547	0.83
164_V	169_T	2.543	0.83
145_N	148_Q	2.523	0.82
450_E	662_A	2.479	0.81
447_F	661_I	2.476	0.81
94_P	97_E	2.471	0.81
567_K	627_R	2.387	0.78
250_M	363_V	2.369	0.78
75_N	195_V	2.335	0.77
57_E	85_R	2.319	0.76
446_R	662_A	2.311	0.76
347_I	350_S	2.285	0.75
331_S	550_K	2.274	0.75
401_N	405_H	2.255	0.74
24_R	130_D	2.252	0.74
284_A	435_G	2.232	0.73
461_I	465_Q	2.231	0.73
25_S	68_L	2.230	0.73
137_I	154_Y	2.227	0.73
140_I	218_Y	2.225	0.73
335_A	338_T	2.196	0.72
88_I	175_A	2.142	0.70
640_E	644_K	2.133	0.70
547_E	550_K	2.127	0.69
429_V	500_A	2.116	0.69
425_F	662_A	2.106	0.69
335_A	339_R	2.103	0.68
267_Y	363_V	2.072	0.67
660_A	679_V	2.069	0.67
627_R	630_A	2.063	0.67
534_M	581_S	2.061	0.67
564_V	661_I	2.039	0.66
130_D	204_C	2.037	0.66
176_E	180_N	2.023	0.65
100_D	109_S	2.005	0.65
684_P	687_F	1.996	0.64
21_L	130_D	1.992	0.64
523_D	553_K	1.986	0.64
273_V	362_M	1.982	0.64
347_I	570_V	1.964	0.63
314_D	317_K	1.960	0.63
23_Y	205_Y	1.893	0.60
590_A	606_S	1.881	0.59
200_T	432_I	1.859	0.58
637_Q	640_E	1.838	0.58
71_M	75_N	1.805	0.56
457_A	485_M	1.800	0.56
210_S	214_E	1.795	0.56
607_V	661_I	1.786	0.55
444_C	456_V	1.779	0.55
246_L	250_M	1.771	0.55
46_T	422_E	1.768	0.54
17_G	127_K	1.764	0.54
242_R	269_D	1.764	0.54
568_N	645_R	1.764	0.54
246_L	267_Y	1.737	0.53
273_V	383_I	1.727	0.53
661_I	668_K	1.711	0.52
149_I	218_Y	1.704	0.52
531_N	539_T	1.690	0.51
145_N	454_V	1.689	0.51
283_P	429_V	1.687	0.51
442_A	655_E	1.685	0.51
531_N	535_N	1.681	0.51
482_A	575_N	1.673	0.50
521_P	524_E	1.672	0.50
436_A	467_I	1.658	0.50
446_R	450_E	1.658	0.50
614_Q	617_A	1.656	0.49
573_G	580_S	1.654	0.49
592_C	613_L	1.651	0.49
481_M	503_A	1.636	0.49
216_E	220_N	1.634	0.49
437_G	517_A	1.616	0.48
672_T	678_T	1.609	0.47
246_L	423_A	1.604	0.47
15_P	19_E	1.600	0.47
99_V	130_D	1.597	0.47
446_R	659_E	1.597	0.47
311_E	314_D	1.596	0.47
553_K	600_F	1.592	0.47
218_Y	486_D	1.588	0.46
436_A	482_A	1.587	0.46
612_V	645_R	1.585	0.46
196_T	211_I	1.575	0.46
487_V	575_N	1.575	0.46
461_I	482_A	1.567	0.46
254_R	258_S	1.564	0.45
457_A	483_V	1.562	0.45
342_Q	405_H	1.537	0.44
156_N	184_A	1.536	0.44
194_L	208_T	1.530	0.44
27_L	205_Y	1.519	0.43
634_E	637_Q	1.509	0.43
494_Q	547_E	1.509	0.43
140_I	202_E	1.503	0.43
281_Q	284_A	1.497	0.42
28_I	349_E	1.496	0.42
118_T	294_D	1.492	0.42
106_M	114_P	1.491	0.42
573_G	632_G	1.479	0.42
254_R	257_V	1.477	0.42
425_F	660_A	1.471	0.41
537_L	582_V	1.443	0.40
465_Q	482_A	1.434	0.40
481_M	510_V	1.429	0.40
59_M	426_S	1.425	0.39
398_L	656_D	1.424	0.39
530_W	631_Y	1.420	0.39
672_T	675_C	1.415	0.39
46_T	427_R	1.411	0.39
148_Q	271_D	1.410	0.39
262_K	428_K	1.409	0.39
433_T	627_R	1.408	0.39
191_K	396_V	1.407	0.39
282_A	305_Y	1.396	0.38
624_R	635_P	1.396	0.38
598_G	647_A	1.392	0.38
433_T	567_K	1.371	0.37
181_N	331_S	1.367	0.37
462_E	495_S	1.360	0.37
646_T	683_V	1.356	0.37
591_R	687_F	1.340	0.36
213_Q	217_Q	1.334	0.36
613_L	619_W	1.331	0.35
576_A	592_C	1.326	0.35
456_V	464_A	1.326	0.35
185_E	214_E	1.325	0.35
217_Q	221_D	1.324	0.35
528_K	532_L	1.321	0.35
220_N	449_A	1.313	0.35
601_G	610_D	1.311	0.35
328_T	331_S	1.311	0.35
236_P	278_N	1.310	0.35
270_H	429_V	1.307	0.35
158_F	211_I	1.305	0.34
298_H	414_Y	1.303	0.34
525_T	578_A	1.293	0.34
630_A	635_P	1.288	0.34
246_L	269_D	1.288	0.34
568_N	588_H	1.287	0.34
483_V	494_Q	1.275	0.33
610_D	645_R	1.275	0.33
327_E	331_S	1.272	0.33
117_E	163_Y	1.272	0.33
180_N	343_D	1.266	0.33
116_I	165_R	1.264	0.33
606_S	688_T	1.254	0.32
588_H	593_I	1.251	0.32
203_T	524_E	1.248	0.32
568_N	609_P	1.246	0.32
320_D	324_S	1.243	0.32
71_M	76_F	1.241	0.32
652_I	657_I	1.240	0.32
28_I	585_L	1.239	0.32
558_G	627_R	1.233	0.32
249_I	253_I	1.223	0.31
27_L	208_T	1.222	0.31
533_N	541_Y	1.219	0.31
246_L	360_I	1.211	0.31
116_I	290_A	1.211	0.31
246_L	363_V	1.209	0.31
410_P	413_L	1.208	0.31
573_G	598_G	1.207	0.31
101_Y	597_G	1.204	0.31
628_A	631_Y	1.202	0.30
148_Q	199_E	1.202	0.30
253_I	443_A	1.197	0.30
501_A	551_Q	1.196	0.30
663_F	669_A	1.196	0.30
172_K	305_Y	1.194	0.30
523_D	596_E	1.194	0.30
204_C	598_G	1.192	0.30
486_D	662_A	1.187	0.30
20_E	151_E	1.182	0.30
25_S	76_F	1.174	0.29
124_L	179_A	1.173	0.29
36_N	292_C	1.172	0.29
34_V	204_C	1.171	0.29
573_G	646_T	1.168	0.29
140_I	504_Y	1.161	0.29
437_G	518_T	1.158	0.29
558_G	567_K	1.155	0.29
431_L	507_I	1.151	0.29
265_L	365_T	1.148	0.28
35_C	117_E	1.144	0.28
102_L	113_R	1.142	0.28
137_I	553_K	1.138	0.28
123_F	194_L	1.136	0.28
464_A	468_A	1.136	0.28
568_N	643_R	1.133	0.28
145_N	393_G	1.131	0.28
159_V	184_A	1.130	0.28
441_S	445_R	1.129	0.28
501_A	507_I	1.126	0.28
675_C	678_T	1.121	0.27
528_K	536_V	1.121	0.27
386_M	578_A	1.115	0.27
147_K	162_P	1.111	0.27
176_E	264_I	1.109	0.27
560_S	597_G	1.106	0.27
27_L	34_V	1.105	0.27
266_S	364_N	1.101	0.27
623_W	627_R	1.099	0.27
592_C	611_A	1.097	0.27
587_T	676_M	1.096	0.27
597_G	669_A	1.089	0.26
204_C	486_D	1.088	0.26
686_A	689_R	1.086	0.26
247_A	250_M	1.085	0.26
169_T	173_M	1.085	0.26
429_V	547_E	1.084	0.26
137_I	215_A	1.079	0.26
246_L	329_F	1.077	0.26
244_Q	310_P	1.077	0.26
186_L	298_H	1.075	0.26
570_V	678_T	1.074	0.26
612_V	679_V	1.073	0.26
129_V	471_I	1.071	0.26
592_C	624_R	1.068	0.26
460_N	608_L	1.056	0.25
611_A	619_W	1.055	0.25
127_K	199_E	1.055	0.25
330_T	351_A	1.053	0.25
425_F	667_S	1.053	0.25
622_S	685_A	1.051	0.25
199_E	461_I	1.049	0.25
285_L	386_M	1.049	0.25
157_R	511_V	1.045	0.25
91_D	95_D	1.044	0.25
432_I	660_A	1.038	0.25
218_Y	222_R	1.038	0.25
360_I	369_Y	1.037	0.25
452_G	504_Y	1.037	0.25
435_G	456_V	1.036	0.25
291_A	385_V	1.031	0.24
627_R	631_Y	1.031	0.24
570_V	587_T	1.030	0.24
124_L	173_M	1.030	0.24
494_Q	498_E	1.028	0.24
432_I	444_C	1.027	0.24
533_N	542_F	1.026	0.24
302_V	332_E	1.023	0.24
31_D	139_S	1.017	0.24
71_M	195_V	1.012	0.24
564_V	611_A	1.011	0.24
66_S	165_R	1.010	0.24
59_M	71_M	1.007	0.24
238_P	241_K	1.000	0.23
144_D	495_S	0.999	0.23
56_I	219_I	0.998	0.23
428_K	557_R	0.998	0.23
530_W	564_V	0.997	0.23
249_I	255_G	0.995	0.23
619_W	688_T	0.995	0.23
290_A	395_F	0.994	0.23
567_K	630_A	0.994	0.23
50_D	56_I	0.990	0.23
321_L	324_S	0.989	0.23
70_T	246_L	0.989	0.23
533_N	537_L	0.989	0.23
87_L	358_P	0.978	0.23
24_R	194_L	0.977	0.23
606_S	619_W	0.977	0.23
578_A	596_E	0.977	0.23
568_N	612_V	0.974	0.23
619_W	624_R	0.972	0.23
447_F	670_E	0.971	0.23
58_V	548_A	0.971	0.23
84_I	492_D	0.971	0.23
147_K	390_T	0.970	0.22
24_R	204_C	0.970	0.22
173_M	176_E	0.969	0.22
349_E	353_R	0.967	0.22
310_P	315_V	0.962	0.22
394_Q	489_K	0.962	0.22
538_G	581_S	0.959	0.22
355_I	365_T	0.958	0.22
602_I	628_A	0.958	0.22
168_F	411_L	0.956	0.22
265_L	291_A	0.954	0.22
294_D	298_H	0.954	0.22
552_M	593_I	0.953	0.22
35_C	377_A	0.952	0.22
527_L	539_T	0.951	0.22
22_V	25_S	0.950	0.22
490_E	547_E	0.945	0.22
129_V	392_L	0.944	0.22
266_S	372_S	0.941	0.22
573_G	651_N	0.941	0.22
597_G	604_V	0.939	0.22
197_W	385_V	0.938	0.21
652_I	681_G	0.936	0.21
388_G	588_H	0.935	0.21
307_D	347_I	0.934	0.21
598_G	683_V	0.931	0.21
50_D	355_I	0.931	0.21
525_T	537_L	0.930	0.21
147_K	151_E	0.929	0.21
114_P	598_G	0.927	0.21
348_F	413_L	0.927	0.21
523_D	649_L	0.926	0.21
563_F	610_D	0.924	0.21
271_D	350_S	0.922	0.21
338_T	462_E	0.921	0.21
315_V	466_K	0.920	0.21
366_G	464_A	0.920	0.21
288_I	397_S	0.920	0.21
618_I	623_W	0.918	0.21
54_R	86_P	0.918	0.21
273_V	277_V	0.916	0.21
429_V	510_V	0.914	0.21
578_A	604_V	0.914	0.21
81_L	122_A	0.914	0.21
343_D	547_E	0.914	0.21
194_L	314_D	0.912	0.21
559_G	627_R	0.912	0.21
564_V	612_V	0.911	0.21
530_W	603_R	0.911	0.21
437_G	617_A	0.909	0.21
85_R	487_V	0.909	0.21
68_L	366_G	0.908	0.21
124_L	129_V	0.907	0.21
137_I	198_G	0.905	0.21
116_I	406_V	0.904	0.20
582_V	586_E	0.902	0.20
571_Y	685_A	0.901	0.20
526_S	529_E	0.899	0.20
116_I	645_R	0.898	0.20
448_A	528_K	0.896	0.20
149_I	387_K	0.896	0.20
256_A	323_K	0.894	0.20
124_L	149_I	0.890	0.20
609_P	619_W	0.889	0.20
459_L	482_A	0.889	0.20
59_M	200_T	0.889	0.20
400_E	435_G	0.889	0.20
188_L	670_E	0.887	0.20
49_K	151_E	0.886	0.20
233_R	280_V	0.885	0.20
20_E	23_Y	0.885	0.20
103_S	114_P	0.880	0.20
498_E	502_L	0.879	0.20
626_E	630_A	0.879	0.20
541_Y	592_C	0.878	0.20
576_A	611_A	0.877	0.20
146_G	512_N	0.877	0.20
304_L	322_I	0.877	0.20
456_V	517_A	0.877	0.20
209_I	216_E	0.876	0.20
161_V	174_I	0.874	0.20
135_D	381_R	0.874	0.20
577_S	592_C	0.873	0.20
82_D	221_D	0.871	0.20
619_W	643_R	0.871	0.20
324_S	491_E	0.870	0.20
460_N	633_I	0.869	0.20
592_C	643_R	0.868	0.19
541_Y	586_E	0.867	0.19
38_G	517_A	0.866	0.19
252_V	256_A	0.865	0.19
533_N	582_V	0.861	0.19
562_V	661_I	0.860	0.19
569_S	587_T	0.859	0.19
148_Q	320_D	0.858	0.19
614_Q	654_P	0.858	0.19
134_P	160_W	0.857	0.19
164_V	173_M	0.856	0.19
459_L	580_S	0.856	0.19
120_L	125_P	0.855	0.19
255_G	258_S	0.853	0.19
578_A	649_L	0.853	0.19
370_A	374_V	0.851	0.19
244_Q	327_E	0.849	0.19
432_I	604_V	0.849	0.19
119_L	397_S	0.849	0.19
609_P	661_I	0.848	0.19
571_Y	683_V	0.847	0.19
119_L	393_G	0.847	0.19
576_A	643_R	0.847	0.19
513_N	563_F	0.846	0.19
291_A	296_L	0.846	0.19
95_D	112_P	0.845	0.19
580_S	592_C	0.845	0.19
77_S	340_N	0.842	0.19
49_K	214_E	0.839	0.19
154_Y	211_I	0.838	0.19
99_V	416_L	0.835	0.19
140_I	222_R	0.834	0.19
31_D	213_Q	0.834	0.19
546_R	602_I	0.833	0.19
114_P	161_V	0.832	0.18
249_I	254_R	0.830	0.18
530_W	612_V	0.828	0.18
374_V	669_A	0.827	0.18
198_G	238_P	0.827	0.18
90_R	551_Q	0.826	0.18
135_D	618_I	0.824	0.18
117_E	377_A	0.824	0.18
77_S	83_D	0.824	0.18
33_T	286_S	0.822	0.18
260_E	327_E	0.821	0.18
23_Y	202_E	0.821	0.18
608_L	627_R	0.821	0.18
439_I	603_R	0.820	0.18
162_P	471_I	0.820	0.18
125_P	205_Y	0.820	0.18
208_T	292_C	0.819	0.18
327_E	507_I	0.819	0.18
260_E	316_H	0.819	0.18
552_M	600_F	0.817	0.18
68_L	219_I	0.816	0.18
464_A	480_A	0.814	0.18
218_Y	565_G	0.812	0.18
565_G	569_S	0.812	0.18
374_V	510_V	0.812	0.18
435_G	463_G	0.811	0.18
618_I	627_R	0.807	0.18
516_L	532_L	0.806	0.18
548_A	660_A	0.806	0.18
140_I	482_A	0.805	0.18
577_S	580_S	0.805	0.18
568_N	580_S	0.801	0.18
590_A	619_W	0.800	0.18
297_V	414_Y	0.799	0.18
512_N	541_Y	0.797	0.18
400_E	601_G	0.796	0.18
455_I	510_V	0.794	0.17
537_L	639_E	0.794	0.17
559_G	567_K	0.794	0.17
250_M	370_A	0.794	0.17
81_L	100_D	0.792	0.17
108_D	649_L	0.791	0.17
27_L	665_A	0.790	0.17
542_F	546_R	0.789	0.17
268_D	363_V	0.788	0.17
51_F	54_R	0.786	0.17
113_R	414_Y	0.784	0.17
68_L	299_T	0.784	0.17
564_V	580_S	0.782	0.17
28_I	78_G	0.782	0.17
431_L	521_P	0.780	0.17
582_V	684_P	0.780	0.17
316_H	501_A	0.780	0.17
606_S	672_T	0.779	0.17
347_I	565_G	0.778	0.17
52_R	83_D	0.777	0.17
150_A	172_K	0.777	0.17
561_M	593_I	0.776	0.17
249_I	636_D	0.776	0.17
432_I	548_A	0.775	0.17
155_G	284_A	0.775	0.17
95_D	291_A	0.773	0.17
568_N	619_W	0.772	0.17
545_A	563_F	0.770	0.17
79_L	645_R	0.769	0.17
354_V	375_S	0.769	0.17
512_N	646_T	0.767	0.17
339_R	522_F	0.767	0.17
179_A	493_V	0.766	0.17
179_A	489_K	0.765	0.17
517_A	676_M	0.764	0.17
576_A	631_Y	0.764	0.17
518_T	546_R	0.763	0.17
317_K	328_T	0.763	0.17
250_M	253_I	0.762	0.17
99_V	411_L	0.761	0.17
134_P	382_A	0.761	0.17
564_V	609_P	0.760	0.17
23_Y	136_A	0.760	0.17
459_L	536_V	0.759	0.17
610_D	627_R	0.759	0.17
571_Y	612_V	0.759	0.17
95_D	117_E	0.759	0.17
17_G	485_M	0.758	0.17
217_Q	634_E	0.757	0.17
435_G	461_I	0.757	0.17
125_P	195_V	0.756	0.17
613_L	678_T	0.754	0.16
87_L	295_H	0.754	0.16
320_D	332_E	0.753	0.16
430_A	452_G	0.752	0.16
618_I	628_A	0.752	0.16
244_Q	248_G	0.752	0.16
129_V	454_V	0.752	0.16
328_T	499_R	0.752	0.16
271_D	328_T	0.750	0.16
338_T	341_Q	0.750	0.16
624_R	639_E	0.748	0.16
17_G	46_T	0.746	0.16
24_R	36_N	0.745	0.16
538_G	592_C	0.738	0.16
580_S	645_R	0.737	0.16
20_E	75_N	0.736	0.16
66_S	93_M	0.736	0.16
36_N	116_I	0.735	0.16
530_W	609_P	0.734	0.16
55_E	283_P	0.734	0.16
98_M	215_A	0.734	0.16
151_E	156_N	0.731	0.16
157_R	210_S	0.730	0.16
81_L	168_F	0.730	0.16
575_N	599_E	0.729	0.16
68_L	132_T	0.729	0.16
30_S	339_R	0.729	0.16
124_L	630_A	0.728	0.16
124_L	354_V	0.727	0.16
433_T	513_N	0.726	0.16
442_A	550_K	0.725	0.16
353_R	366_G	0.724	0.16
357_I	363_V	0.724	0.16
569_S	676_M	0.724	0.16
335_A	432_I	0.723	0.16
402_E	412_E	0.722	0.16
530_W	645_R	0.722	0.16
306_I	498_E	0.722	0.16
196_T	507_I	0.721	0.16
337_F	346_Q	0.720	0.16
132_T	163_Y	0.720	0.16
189_M	608_L	0.718	0.16
313_Q	317_K	0.717	0.16
19_E	390_T	0.717	0.16
66_S	96_E	0.717	0.16
539_T	564_V	0.716	0.16
147_K	462_E	0.713	0.16
589_L	656_D	0.713	0.16
146_G	250_M	0.713	0.16
577_S	589_L	0.712	0.15
331_S	334_Q	0.712	0.15
592_C	620_G	0.712	0.15
379_Y	438_G	0.712	0.15
493_V	561_M	0.709	0.15
465_Q	469_G	0.707	0.15
176_E	495_S	0.707	0.15
313_Q	316_H	0.707	0.15
545_A	593_I	0.706	0.15
356_L	379_Y	0.706	0.15
247_A	454_V	0.705	0.15
337_F	348_F	0.704	0.15
148_Q	461_I	0.704	0.15
243_K	247_A	0.703	0.15
127_K	218_Y	0.703	0.15
576_A	619_W	0.703	0.15
324_S	462_E	0.701	0.15
151_E	248_G	0.701	0.15
175_A	581_S	0.698	0.15
588_H	609_P	0.697	0.15
481_M	500_A	0.697	0.15
66_S	296_L	0.695	0.15
417_T	629_A	0.695	0.15
485_M	553_K	0.694	0.15
241_K	469_G	0.693	0.15
538_G	635_P	0.691	0.15
127_K	489_K	0.690	0.15
276_F	383_I	0.689	0.15
573_G	610_D	0.689	0.15
40_G	43_S	0.688	0.15
40_G	62_K	0.688	0.15
40_G	64_S	0.688	0.15
40_G	65_G	0.688	0.15
41_N	62_K	0.688	0.15
41_N	64_S	0.688	0.15
41_N	65_G	0.688	0.15
43_S	62_K	0.688	0.15
43_S	64_S	0.688	0.15
43_S	65_G	0.688	0.15
62_K	65_G	0.688	0.15
91_D	117_E	0.688	0.15
490_E	513_N	0.688	0.15
84_I	436_A	0.688	0.15
136_A	215_A	0.688	0.15
436_A	496_A	0.688	0.15
617_A	672_T	0.685	0.15
163_Y	291_A	0.684	0.15
247_A	501_A	0.684	0.15
57_E	342_Q	0.682	0.15
367_K	561_M	0.681	0.15
592_C	597_G	0.681	0.15
21_L	402_E	0.681	0.15
186_L	414_Y	0.680	0.15
149_I	392_L	0.680	0.15
47_T	391_A	0.680	0.15
462_E	465_Q	0.680	0.15
599_E	604_V	0.679	0.15
21_L	204_C	0.679	0.15
37_W	75_N	0.678	0.15
140_I	444_C	0.677	0.15
31_D	284_A	0.676	0.15
139_S	410_P	0.676	0.15
533_N	546_R	0.675	0.15
152_D	452_G	0.674	0.15
124_L	175_A	0.674	0.15
575_N	587_T	0.674	0.15
112_P	573_G	0.673	0.15
609_P	631_Y	0.673	0.15
140_I	152_D	0.673	0.15
296_L	345_D	0.672	0.15
541_Y	613_L	0.671	0.15
319_A	554_H	0.671	0.15
277_V	356_L	0.671	0.15
151_E	240_D	0.670	0.15
243_K	246_L	0.670	0.15
568_N	611_A	0.668	0.14
314_D	318_L	0.668	0.14
570_V	672_T	0.666	0.14
526_S	677_I	0.665	0.14
18_V	78_G	0.665	0.14
517_A	533_N	0.665	0.14
52_R	56_I	0.665	0.14
372_S	433_T	0.662	0.14
214_E	329_F	0.662	0.14
198_G	203_T	0.660	0.14
570_V	575_N	0.660	0.14
127_K	200_T	0.659	0.14
151_E	317_K	0.659	0.14
151_E	489_K	0.658	0.14
201_S	432_I	0.658	0.14
145_N	396_V	0.658	0.14
147_K	152_D	0.658	0.14
319_A	323_K	0.658	0.14
565_G	628_A	0.658	0.14
258_S	557_R	0.658	0.14
120_L	205_Y	0.656	0.14
200_T	598_G	0.656	0.14
108_D	504_Y	0.656	0.14
240_D	498_E	0.656	0.14
248_G	465_Q	0.655	0.14
565_G	580_S	0.655	0.14
573_G	627_R	0.655	0.14
538_G	585_L	0.652	0.14
244_Q	493_V	0.651	0.14
398_L	585_L	0.651	0.14
25_S	299_T	0.650	0.14
147_K	668_K	0.650	0.14
545_A	615_G	0.650	0.14
59_M	81_L	0.649	0.14
625_E	635_P	0.648	0.14
660_A	664_F	0.647	0.14
563_F	592_C	0.647	0.14
292_C	386_M	0.647	0.14
61_V	66_S	0.646	0.14
392_L	550_K	0.646	0.14
96_E	128_H	0.646	0.14
139_S	385_V	0.646	0.14
332_E	335_A	0.644	0.14
366_G	570_V	0.644	0.14
433_T	610_D	0.643	0.14
367_K	419_A	0.643	0.14
356_L	455_I	0.641	0.14
176_E	528_K	0.640	0.14
59_M	595_A	0.639	0.14
246_L	251_P	0.639	0.14
69_A	186_L	0.638	0.14
84_I	315_V	0.637	0.14
528_K	677_I	0.636	0.14
589_L	668_K	0.635	0.14
517_A	592_C	0.635	0.14
479_R	482_A	0.634	0.14
495_S	499_R	0.633	0.14
34_V	212_I	0.632	0.14
401_N	432_I	0.632	0.14
23_Y	58_V	0.629	0.14
103_S	113_R	0.629	0.14
135_D	568_N	0.629	0.14
320_D	491_E	0.627	0.14
139_S	358_P	0.627	0.14
429_V	564_V	0.626	0.14
21_L	76_F	0.626	0.14
499_R	503_A	0.624	0.14
317_K	449_A	0.624	0.14
437_G	677_I	0.624	0.14
438_G	654_P	0.624	0.14
109_S	118_T	0.623	0.14
603_R	648_L	0.623	0.14
66_S	95_D	0.623	0.14
469_G	498_E	0.623	0.14
567_K	608_L	0.622	0.14
573_G	683_V	0.622	0.14
248_G	258_S	0.621	0.13
383_I	398_L	0.619	0.13
276_F	379_Y	0.618	0.13
165_R	420_P	0.617	0.13
245_I	471_I	0.617	0.13
586_E	592_C	0.617	0.13
581_S	585_L	0.617	0.13
340_N	511_V	0.617	0.13
96_E	119_L	0.616	0.13
50_D	54_R	0.616	0.13
180_N	354_V	0.616	0.13
265_L	363_V	0.614	0.13
643_R	669_A	0.614	0.13
304_L	559_G	0.613	0.13
646_T	681_G	0.612	0.13
55_E	431_L	0.612	0.13
520_S	643_R	0.611	0.13
312_T	316_H	0.610	0.13
277_V	429_V	0.610	0.13
78_G	681_G	0.610	0.13
49_K	662_A	0.609	0.13
79_L	604_V	0.609	0.13
581_S	684_P	0.608	0.13
270_H	273_V	0.607	0.13
533_N	592_C	0.606	0.13
513_N	546_R	0.606	0.13
128_H	197_W	0.606	0.13
527_L	531_N	0.605	0.13
497_F	548_A	0.605	0.13
427_R	522_F	0.605	0.13
497_F	647_A	0.604	0.13
627_R	652_I	0.603	0.13
313_Q	321_L	0.603	0.13
582_V	618_I	0.603	0.13
565_G	659_E	0.602	0.13
432_I	677_I	0.601	0.13
86_P	454_V	0.601	0.13
211_I	550_K	0.601	0.13
270_H	660_A	0.599	0.13
280_V	329_F	0.599	0.13
124_L	281_Q	0.598	0.13
117_E	337_F	0.598	0.13
47_T	432_I	0.598	0.13
163_Y	377_A	0.598	0.13
360_I	392_L	0.597	0.13
81_L	202_E	0.597	0.13
228_V	327_E	0.596	0.13
437_G	630_A	0.595	0.13
480_A	532_L	0.595	0.13
26_N	35_C	0.594	0.13
435_G	497_F	0.592	0.13
510_V	561_M	0.592	0.13
127_K	154_Y	0.592	0.13
103_S	108_D	0.591	0.13
468_A	482_A	0.591	0.13
247_A	429_V	0.591	0.13
50_D	60_W	0.590	0.13
214_E	222_R	0.590	0.13
541_Y	678_T	0.590	0.13
354_V	470_E	0.589	0.13
581_S	588_H	0.589	0.13
129_V	600_F	0.589	0.13
187_V	640_E	0.587	0.13
79_L	418_L	0.587	0.13
471_I	482_A	0.587	0.13
221_D	272_D	0.584	0.13
112_P	163_Y	0.584	0.13
49_K	315_V	0.583	0.13
609_P	612_V	0.582	0.13
580_S	643_R	0.582	0.13
215_A	416_L	0.580	0.13
299_T	378_L	0.580	0.13
571_Y	592_C	0.578	0.13
491_E	557_R	0.577	0.13
429_V	459_L	0.577	0.13
202_E	272_D	0.577	0.13
163_Y	191_K	0.576	0.13
48_E	57_E	0.576	0.13
486_D	489_K	0.576	0.13
565_G	606_S	0.575	0.13
385_V	555_Q	0.575	0.13
328_T	554_H	0.575	0.13
117_E	378_L	0.574	0.13
534_M	570_V	0.574	0.13
198_G	598_G	0.574	0.13
462_E	471_I	0.573	0.13
99_V	295_H	0.573	0.13
29_G	40_G	0.571	0.12
29_G	41_N	0.571	0.12
29_G	43_S	0.571	0.12
29_G	62_K	0.571	0.12
29_G	64_S	0.571	0.12
29_G	65_G	0.571	0.12
117_E	348_F	0.571	0.12
251_P	354_V	0.571	0.12
66_S	117_E	0.571	0.12
512_N	595_A	0.571	0.12
331_S	492_D	0.569	0.12
461_I	532_L	0.569	0.12
555_Q	559_G	0.568	0.12
411_L	416_L	0.568	0.12
469_G	655_E	0.568	0.12
232_K	252_V	0.567	0.12
340_N	401_N	0.567	0.12
398_L	589_L	0.566	0.12
233_R	498_E	0.566	0.12
490_E	618_I	0.566	0.12
660_A	677_I	0.566	0.12
317_K	484_K	0.566	0.12
160_W	382_A	0.565	0.12
127_K	465_Q	0.565	0.12
23_Y	46_T	0.564	0.12
66_S	402_E	0.563	0.12
145_N	467_I	0.563	0.12
665_A	686_A	0.563	0.12
66_S	77_S	0.563	0.12
119_L	398_L	0.563	0.12
406_V	419_A	0.563	0.12
552_M	580_S	0.562	0.12
442_A	628_A	0.562	0.12
623_W	645_R	0.562	0.12
610_D	648_L	0.561	0.12
96_E	419_A	0.561	0.12
368_S	427_R	0.560	0.12
185_E	207_K	0.560	0.12
463_G	492_D	0.558	0.12
305_Y	426_S	0.558	0.12
113_R	395_F	0.557	0.12
357_I	597_G	0.557	0.12
117_E	296_L	0.556	0.12
47_T	528_K	0.556	0.12
206_Q	278_N	0.555	0.12
349_E	460_N	0.555	0.12
27_L	58_V	0.555	0.12
627_R	648_L	0.555	0.12
91_D	96_E	0.555	0.12
394_Q	550_K	0.554	0.12
595_A	683_V	0.554	0.12
76_F	106_M	0.554	0.12
107_I	111_H	0.553	0.12
278_N	367_K	0.553	0.12
342_Q	401_N	0.553	0.12
639_E	651_N	0.553	0.12
151_E	553_K	0.552	0.12
568_N	631_Y	0.552	0.12
21_L	36_N	0.551	0.12
533_N	563_F	0.551	0.12
663_F	666_S	0.551	0.12
19_E	507_I	0.551	0.12
270_H	380_R	0.551	0.12
357_I	666_S	0.551	0.12
31_D	48_E	0.551	0.12
78_G	573_G	0.550	0.12
66_S	413_L	0.550	0.12
567_K	610_D	0.549	0.12
82_D	218_Y	0.548	0.12
410_P	417_T	0.548	0.12
119_L	194_L	0.547	0.12
609_P	645_R	0.546	0.12
124_L	180_N	0.546	0.12
232_K	235_Q	0.546	0.12
366_G	606_S	0.546	0.12
240_D	394_Q	0.545	0.12
433_T	618_I	0.544	0.12
372_S	614_Q	0.544	0.12
249_I	319_A	0.544	0.12
347_I	471_I	0.544	0.12
366_G	688_T	0.542	0.12
112_P	353_R	0.542	0.12
613_L	617_A	0.542	0.12
295_H	411_L	0.541	0.12
92_Q	169_T	0.541	0.12
250_M	258_S	0.540	0.12
460_N	655_E	0.540	0.12
112_P	132_T	0.539	0.12
225_Q	283_P	0.539	0.12
368_S	607_V	0.539	0.12
238_P	304_L	0.538	0.12
152_D	222_R	0.537	0.12
517_A	563_F	0.537	0.12
283_P	449_A	0.537	0.12
588_H	687_F	0.537	0.12
201_S	447_F	0.537	0.12
424_E	507_I	0.537	0.12
75_N	421_P	0.536	0.12
104_H	109_S	0.536	0.12
163_Y	296_L	0.536	0.12
276_F	362_M	0.536	0.12
570_V	613_L	0.535	0.12
442_A	595_A	0.535	0.12
158_F	425_F	0.535	0.12
203_T	536_V	0.535	0.12
35_C	163_Y	0.534	0.12
392_L	614_Q	0.534	0.12
607_V	678_T	0.533	0.12
58_V	201_S	0.533	0.12
199_E	320_D	0.532	0.12
298_H	404_Y	0.532	0.12
513_N	567_K	0.532	0.12
194_L	485_M	0.532	0.12
429_V	466_K	0.531	0.12
27_L	204_C	0.531	0.12
317_K	465_Q	0.531	0.12
613_L	664_F	0.530	0.12
537_L	541_Y	0.529	0.12
49_K	221_D	0.529	0.12
253_I	370_A	0.529	0.12
355_I	391_A	0.529	0.12
531_N	659_E	0.529	0.12
82_D	634_E	0.528	0.12
162_P	435_G	0.528	0.12
626_E	629_A	0.528	0.12
59_M	108_D	0.527	0.12
331_S	637_Q	0.526	0.12
213_Q	216_E	0.526	0.12
144_D	394_Q	0.526	0.12
564_V	592_C	0.526	0.12
537_L	572_A	0.526	0.12
140_I	459_L	0.525	0.12
18_V	681_G	0.525	0.12
570_V	661_I	0.524	0.12
85_R	674_G	0.524	0.12
562_V	609_P	0.523	0.12
107_I	377_A	0.523	0.12
218_Y	489_K	0.523	0.12
177_G	245_I	0.522	0.12
253_I	636_D	0.522	0.12
35_C	91_D	0.522	0.12
249_I	492_D	0.521	0.12
173_M	435_G	0.521	0.12
512_N	565_G	0.521	0.12
310_P	496_A	0.520	0.12
293_P	412_E	0.520	0.12
324_S	329_F	0.520	0.12
61_V	195_V	0.520	0.12
247_A	256_A	0.519	0.12
312_T	319_A	0.519	0.12
126_Y	197_W	0.518	0.11
661_I	678_T	0.518	0.11
24_R	165_R	0.516	0.11
147_K	190_E	0.516	0.11
617_A	678_T	0.516	0.11
57_E	127_K	0.516	0.11
378_L	381_R	0.516	0.11
248_G	655_E	0.516	0.11
512_N	683_V	0.515	0.11
63_G	67_D	0.514	0.11
50_D	154_Y	0.514	0.11
219_I	465_Q	0.514	0.11
663_F	668_K	0.513	0.11
53_G	569_S	0.513	0.11
224_N	283_P	0.513	0.11
291_A	418_L	0.512	0.11
427_R	464_A	0.512	0.11
105_C	645_R	0.511	0.11
337_F	345_D	0.511	0.11
573_G	681_G	0.511	0.11
240_D	494_Q	0.511	0.11
620_G	624_R	0.511	0.11
537_L	613_L	0.511	0.11
291_A	406_V	0.510	0.11
564_V	576_A	0.510	0.11
302_V	400_E	0.510	0.11
367_K	427_R	0.509	0.11
586_E	589_L	0.509	0.11
610_D	628_A	0.508	0.11
421_P	459_L	0.508	0.11
119_L	413_L	0.507	0.11
567_K	611_A	0.506	0.11
436_A	459_L	0.505	0.11
237_L	494_Q	0.505	0.11
537_L	618_I	0.505	0.11
310_P	331_S	0.505	0.11
148_Q	151_E	0.503	0.11
174_I	189_M	0.503	0.11
433_T	573_G	0.502	0.11
445_R	552_M	0.502	0.11
323_K	338_T	0.502	0.11
447_F	562_V	0.502	0.11
220_N	248_G	0.501	0.11
117_E	413_L	0.500	0.11
127_K	500_A	0.500	0.11
252_V	501_A	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2et6A	1	0.3425	100	0.807	Contact Map
3gk3A	4	0.3541	100	0.812	Contact Map
3wtcA	4	0.3759	100	0.812	Contact Map
3lf2A	4	0.3788	100	0.814	Contact Map
1zemA	4	0.3701	100	0.814	Contact Map
4nbrA	2	0.3803	100	0.814	Contact Map
2z1nA	4	0.3527	100	0.815	Contact Map
4nimA	4	0.3353	100	0.815	Contact Map
1gegA	5	0.3716	100	0.815	Contact Map
4trrA	4	0.3774	100	0.815	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0152 seconds.