BTR - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

BTR - HTH-type transcriptional activator Btr

UniProt:	P40408	Sequences: MQNAVIYQPVQIEYLKKTSDLFSEQQLADSFVLIFHLKGNGYISIGTNTNPLQKKTLYVCPPNETFGFTPAADGHIDACIIRLLSYIKETGQDIFTPCTESELAKLKLMNVSHIENLAVRLQELAALWNESSQLSQLKCVIEVQSLIYDLFTASLSDQTDTHSAIEKTKHYIETHADTKITLAQLSQMAGISAKHYSESFKKWTGQSVTEFITKTRITKAKRLMAKSNCKLKEIAHQTGYQDEFYFSRIFKKYTGCSPTSYMKKRRKKIAAYGRGTMGHLIPLHHIPFAAALHPKWTSYYYQHYSTDIPVQLSAYRFNEKWEENLYTLSQAEPDVIVSMDSISPEEQDRLNRIAEVMYLPSEESWRTHFLQTASFLKEESEAEKWLADYDQQTTAAKKTLQHVQGLRFLFLRLHKQNFYLAHNRSVREVFFGDLGFSSATTADTPSEQAISLENIANYQADCMMLFLFKEPETIAYYQQLQQTEAWQNLSAVRDNRVYLLSLDPWNEYSACGHERIVQQTVSLLSGDCP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	529 (486)
Sequences:	353 (307)
Seq/√Len:	13.9

BACSU - BTR

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
168_T	196_Y	6.530	1.00
370_L	383_E	5.641	1.00
172_I	215_T	5.334	1.00
219_K	222_R	4.543	1.00
512_G	516_I	4.052	1.00
172_I	212_I	3.933	1.00
392_Q	518_Q	3.755	0.99
409_L	460_A	3.679	0.99
486_W	492_V	3.638	0.99
243_E	246_F	3.457	0.99
486_W	491_A	3.441	0.99
374_S	379_E	3.270	0.98
509_S	516_I	3.257	0.98
408_F	436_F	3.109	0.98
492_V	497_V	3.078	0.98
372_T	376_L	3.070	0.98
270_A	328_L	3.047	0.98
396_A	517_V	2.998	0.97
232_K	243_E	2.920	0.97
249_I	252_K	2.880	0.96
234_I	262_M	2.710	0.95
279_H	510_A	2.702	0.95
366_R	433_D	2.677	0.95
406_L	462_C	2.652	0.94
383_E	387_A	2.583	0.93
509_S	512_G	2.576	0.93
192_S	195_H	2.570	0.93
366_R	390_D	2.567	0.93
289_A	331_A	2.565	0.93
389_Y	433_D	2.475	0.92
412_R	505_W	2.363	0.90
278_G	509_S	2.331	0.89
217_I	254_T	2.280	0.88
392_Q	514_E	2.272	0.88
458_Y	516_I	2.251	0.87
462_C	498_Y	2.222	0.87
59_V	62_P	2.202	0.86
458_Y	509_S	2.176	0.86
412_R	509_S	2.166	0.85
172_I	211_F	2.161	0.85
490_S	495_N	2.148	0.85
396_A	521_V	2.138	0.85
408_F	464_M	2.136	0.84
278_G	385_W	2.104	0.84
137_L	389_Y	2.091	0.83
460_A	509_S	2.061	0.82
420_L	463_M	2.050	0.82
425_S	428_E	2.042	0.82
436_F	462_C	2.030	0.81
268_K	288_F	2.022	0.81
385_W	510_A	2.006	0.80
272_Y	439_A	2.003	0.80
369_F	373_A	1.998	0.80
385_W	514_E	1.989	0.80
276_T	510_A	1.986	0.80
418_F	465_L	1.974	0.79
175_H	178_T	1.937	0.78
427_R	464_M	1.929	0.78
450_I	480_L	1.902	0.77
459_Q	509_S	1.901	0.77
505_W	509_S	1.865	0.75
279_H	368_H	1.853	0.75
411_L	501_S	1.839	0.74
280_L	285_H	1.838	0.74
378_E	381_E	1.794	0.72
272_Y	291_A	1.789	0.72
228_N	261_Y	1.773	0.71
235_A	287_P	1.742	0.70
231_L	246_F	1.740	0.70
409_L	458_Y	1.739	0.70
433_D	513_H	1.728	0.69
104_A	107_K	1.727	0.69
182_L	209_T	1.723	0.69
143_V	211_F	1.716	0.69
389_Y	513_H	1.714	0.69
247_S	259_T	1.685	0.67
508_Y	513_H	1.683	0.67
240_Y	251_K	1.678	0.67
205_G	217_I	1.674	0.67
47_T	67_G	1.650	0.66
56_T	108_L	1.642	0.65
168_T	240_Y	1.641	0.65
195_H	289_A	1.640	0.65
183_A	410_F	1.637	0.65
513_H	516_I	1.611	0.64
421_A	427_R	1.606	0.63
489_L	497_V	1.606	0.63
206_Q	214_K	1.590	0.63
195_H	244_F	1.587	0.62
235_A	242_D	1.558	0.61
397_K	490_S	1.548	0.60
194_K	240_Y	1.531	0.60
421_A	425_S	1.530	0.59
34_I	212_I	1.525	0.59
483_T	489_L	1.524	0.59
276_T	516_I	1.517	0.59
506_N	512_G	1.498	0.58
196_Y	240_Y	1.488	0.57
500_L	505_W	1.483	0.57
365_W	458_Y	1.483	0.57
134_L	148_Y	1.481	0.57
184_Q	261_Y	1.471	0.56
52_L	306_T	1.470	0.56
182_L	197_S	1.469	0.56
269_I	389_Y	1.465	0.56
57_L	147_I	1.437	0.55
138_K	145_S	1.428	0.54
169_K	204_T	1.425	0.54
217_I	397_K	1.416	0.53
124_L	140_V	1.415	0.53
429_V	433_D	1.412	0.53
397_K	435_G	1.412	0.53
305_S	308_I	1.411	0.53
280_L	284_H	1.394	0.52
514_E	518_Q	1.390	0.52
336_I	354_A	1.389	0.52
512_G	521_V	1.384	0.52
244_F	247_S	1.380	0.51
172_I	399_T	1.370	0.51
247_S	257_S	1.347	0.50
43_I	215_T	1.341	0.49
221_K	243_E	1.337	0.49
33_L	189_A	1.329	0.49
220_A	246_F	1.320	0.48
397_K	420_L	1.313	0.48
34_I	64_E	1.313	0.48
202_K	331_A	1.310	0.48
368_H	500_L	1.305	0.47
208_V	246_F	1.288	0.46
150_L	384_K	1.279	0.46
62_P	493_R	1.278	0.46
368_H	425_S	1.278	0.46
137_L	386_L	1.272	0.46
424_R	429_V	1.271	0.46
43_I	210_E	1.265	0.45
33_L	167_K	1.260	0.45
506_N	516_I	1.253	0.45
233_E	394_T	1.253	0.45
484_E	496_R	1.251	0.45
48_N	172_I	1.249	0.44
253_Y	257_S	1.247	0.44
68_F	267_K	1.236	0.44
426_V	516_I	1.234	0.44
33_L	185_L	1.234	0.44
208_V	224_M	1.225	0.43
277_M	506_N	1.222	0.43
42_Y	150_L	1.219	0.43
373_A	425_S	1.216	0.43
199_S	234_I	1.216	0.43
463_M	491_A	1.214	0.43
205_G	245_Y	1.209	0.42
58_Y	210_E	1.205	0.42
260_S	288_F	1.204	0.42
150_L	418_F	1.204	0.42
114_I	326_Y	1.200	0.42
422_H	427_R	1.199	0.42
201_K	220_A	1.196	0.42
234_I	377_K	1.196	0.42
208_V	422_H	1.195	0.42
195_H	234_I	1.195	0.42
365_W	433_D	1.191	0.41
517_V	523_L	1.179	0.41
172_I	344_P	1.173	0.40
143_V	484_E	1.170	0.40
276_T	361_S	1.166	0.40
178_T	475_A	1.161	0.40
123_E	400_L	1.161	0.40
347_Q	351_N	1.160	0.40
204_T	247_S	1.148	0.39
359_L	464_M	1.147	0.39
327_T	518_Q	1.145	0.39
270_A	365_W	1.145	0.39
143_V	281_I	1.139	0.39
168_T	213_T	1.129	0.38
513_H	517_V	1.126	0.38
368_H	433_D	1.125	0.38
41_G	333_P	1.119	0.38
447_E	458_Y	1.116	0.37
409_L	442_A	1.111	0.37
337_V	379_E	1.110	0.37
222_R	233_E	1.110	0.37
288_F	334_D	1.105	0.37
387_A	392_Q	1.103	0.37
134_L	149_D	1.099	0.37
431_F	439_A	1.096	0.36
463_M	502_L	1.094	0.36
166_E	281_I	1.089	0.36
337_V	427_R	1.087	0.36
62_P	83_L	1.085	0.36
271_A	277_M	1.085	0.36
176_A	353_I	1.080	0.36
182_L	249_I	1.077	0.36
347_Q	356_V	1.075	0.35
205_G	210_E	1.072	0.35
124_L	171_Y	1.071	0.35
368_H	509_S	1.065	0.35
289_A	381_E	1.064	0.35
227_S	337_V	1.063	0.35
438_S	443_D	1.060	0.35
325_L	328_L	1.058	0.35
261_Y	394_T	1.055	0.34
171_Y	175_H	1.054	0.34
277_M	458_Y	1.053	0.34
213_T	463_M	1.051	0.34
57_L	121_L	1.048	0.34
510_A	513_H	1.047	0.34
278_G	419_Y	1.036	0.34
368_H	466_F	1.035	0.33
205_G	272_Y	1.033	0.33
207_S	230_K	1.030	0.33
486_W	497_V	1.029	0.33
129_N	143_V	1.025	0.33
195_H	240_Y	1.024	0.33
470_E	503_D	1.021	0.33
248_R	438_S	1.014	0.32
147_I	180_I	1.014	0.32
451_S	462_C	1.013	0.32
217_I	466_F	1.011	0.32
283_L	287_P	1.010	0.32
412_R	516_I	1.008	0.32
425_S	506_N	1.006	0.32
231_L	360_P	1.005	0.32
272_Y	323_E	1.000	0.32
172_I	219_K	0.995	0.32
61_P	83_L	0.994	0.32
143_V	390_D	0.993	0.31
60_C	224_M	0.993	0.31
373_A	376_L	0.992	0.31
245_Y	249_I	0.987	0.31
140_V	171_Y	0.987	0.31
385_W	458_Y	0.986	0.31
465_L	480_L	0.985	0.31
116_N	137_L	0.984	0.31
196_Y	234_I	0.984	0.31
205_G	243_E	0.983	0.31
421_A	508_Y	0.982	0.31
209_T	246_F	0.980	0.31
233_E	348_D	0.977	0.31
34_I	53_Q	0.976	0.31
386_L	510_A	0.975	0.31
31_F	62_P	0.974	0.31
45_I	475_A	0.974	0.31
182_L	208_V	0.971	0.30
368_H	426_V	0.967	0.30
34_I	143_V	0.965	0.30
129_N	178_T	0.964	0.30
64_E	369_F	0.963	0.30
171_Y	394_T	0.960	0.30
280_L	364_S	0.960	0.30
291_A	365_W	0.958	0.30
240_Y	356_V	0.958	0.30
466_F	516_I	0.956	0.30
88_K	217_I	0.954	0.30
368_H	421_A	0.954	0.30
167_K	252_K	0.954	0.30
172_I	462_C	0.953	0.30
170_H	217_I	0.952	0.30
397_K	434_L	0.952	0.30
124_L	227_S	0.944	0.29
425_S	517_V	0.943	0.29
240_Y	360_P	0.941	0.29
500_L	519_Q	0.939	0.29
182_L	439_A	0.937	0.29
196_Y	208_V	0.936	0.29
466_F	500_L	0.935	0.29
68_F	150_L	0.935	0.29
436_F	494_D	0.933	0.29
269_I	280_L	0.930	0.29
270_A	331_A	0.929	0.29
81_I	291_A	0.927	0.28
244_F	500_L	0.926	0.28
267_K	334_D	0.926	0.28
189_A	243_E	0.924	0.28
376_L	386_L	0.924	0.28
206_Q	465_L	0.921	0.28
181_T	210_E	0.920	0.28
81_I	393_T	0.919	0.28
45_I	269_I	0.919	0.28
40_N	53_Q	0.918	0.28
331_A	365_W	0.915	0.28
368_H	385_W	0.911	0.28
137_L	357_M	0.906	0.28
143_V	232_K	0.905	0.28
512_G	517_V	0.904	0.27
355_E	410_F	0.900	0.27
383_E	498_Y	0.900	0.27
201_K	424_R	0.896	0.27
480_L	486_W	0.894	0.27
438_S	510_A	0.894	0.27
41_G	154_S	0.894	0.27
412_R	425_S	0.893	0.27
132_S	387_A	0.891	0.27
268_K	424_R	0.890	0.27
421_A	466_F	0.888	0.27
224_M	426_V	0.885	0.27
195_H	271_A	0.883	0.27
171_Y	227_S	0.881	0.26
143_V	367_T	0.879	0.26
46_G	263_K	0.878	0.26
205_G	400_L	0.878	0.26
83_L	198_E	0.876	0.26
280_L	517_V	0.874	0.26
293_H	328_L	0.871	0.26
509_S	513_H	0.870	0.26
390_D	420_L	0.870	0.26
228_N	348_D	0.869	0.26
302_Q	305_S	0.868	0.26
197_S	369_F	0.860	0.26
261_Y	491_A	0.857	0.25
152_T	217_I	0.855	0.25
412_R	421_A	0.854	0.25
234_I	503_D	0.854	0.25
55_K	140_V	0.852	0.25
191_I	290_A	0.851	0.25
81_I	171_Y	0.850	0.25
34_I	356_V	0.849	0.25
371_Q	374_S	0.849	0.25
173_E	220_A	0.848	0.25
174_T	240_Y	0.844	0.25
216_R	224_M	0.844	0.25
278_G	458_Y	0.841	0.25
389_Y	393_T	0.841	0.25
425_S	505_W	0.839	0.25
230_K	233_E	0.839	0.25
438_S	442_A	0.838	0.25
202_K	349_R	0.838	0.25
500_L	509_S	0.837	0.25
383_E	488_N	0.836	0.25
260_S	435_G	0.836	0.25
69_T	450_I	0.834	0.25
195_H	232_K	0.834	0.25
409_L	498_Y	0.830	0.24
33_L	39_G	0.829	0.24
137_L	290_A	0.826	0.24
180_I	233_E	0.826	0.24
516_I	521_V	0.825	0.24
272_Y	277_M	0.825	0.24
158_Q	169_K	0.824	0.24
271_A	372_T	0.824	0.24
41_G	174_T	0.824	0.24
66_F	144_Q	0.824	0.24
250_F	258_P	0.822	0.24
449_A	495_N	0.821	0.24
274_R	373_A	0.819	0.24
396_A	434_L	0.815	0.24
196_Y	446_S	0.812	0.24
168_T	359_L	0.811	0.24
368_H	427_R	0.810	0.24
41_G	263_K	0.810	0.24
211_F	220_A	0.808	0.24
137_L	254_T	0.807	0.23
425_S	459_Q	0.806	0.23
172_I	388_D	0.805	0.23
95_F	117_L	0.805	0.23
429_V	513_H	0.805	0.23
117_L	146_L	0.802	0.23
390_D	463_M	0.801	0.23
338_S	419_Y	0.795	0.23
133_Q	217_I	0.794	0.23
136_Q	369_F	0.793	0.23
279_H	386_L	0.789	0.23
464_M	517_V	0.785	0.23
386_L	390_D	0.784	0.23
238_T	380_S	0.782	0.23
52_L	213_T	0.782	0.23
411_L	458_Y	0.782	0.23
271_A	419_Y	0.780	0.22
30_S	44_S	0.779	0.22
145_S	164_A	0.779	0.22
375_F	512_G	0.777	0.22
360_P	495_N	0.776	0.22
294_P	504_P	0.774	0.22
349_R	441_T	0.772	0.22
425_S	516_I	0.770	0.22
124_L	488_N	0.768	0.22
142_E	261_Y	0.768	0.22
142_E	246_F	0.767	0.22
246_F	481_Q	0.766	0.22
286_I	397_K	0.765	0.22
368_H	512_G	0.765	0.22
395_A	399_T	0.764	0.22
233_E	342_I	0.764	0.22
210_E	231_L	0.762	0.22
38_K	77_D	0.761	0.22
217_I	432_G	0.761	0.22
175_H	484_E	0.761	0.22
290_A	372_T	0.761	0.22
421_A	447_E	0.761	0.22
207_S	390_D	0.760	0.22
171_Y	483_T	0.759	0.22
48_N	261_Y	0.758	0.22
222_R	226_K	0.758	0.22
218_T	325_L	0.757	0.22
141_I	417_N	0.757	0.22
172_I	364_S	0.755	0.22
185_L	221_K	0.755	0.22
449_A	520_T	0.754	0.21
359_L	513_H	0.754	0.21
512_G	519_Q	0.753	0.21
278_G	506_N	0.753	0.21
282_P	389_Y	0.753	0.21
211_F	245_Y	0.752	0.21
328_L	350_L	0.751	0.21
379_E	397_K	0.750	0.21
271_A	368_H	0.750	0.21
365_W	369_F	0.750	0.21
276_T	360_P	0.750	0.21
483_T	486_W	0.750	0.21
439_A	447_E	0.747	0.21
153_A	493_R	0.745	0.21
329_S	464_M	0.743	0.21
171_Y	391_Q	0.741	0.21
210_E	245_Y	0.741	0.21
294_P	373_A	0.740	0.21
83_L	144_Q	0.740	0.21
91_G	94_I	0.740	0.21
181_T	430_F	0.740	0.21
225_A	235_A	0.739	0.21
101_S	172_I	0.739	0.21
300_Y	305_S	0.737	0.21
134_L	453_E	0.736	0.21
67_G	172_I	0.736	0.21
368_H	424_R	0.735	0.21
146_L	205_G	0.734	0.21
278_G	289_A	0.734	0.21
271_A	345_E	0.733	0.21
59_V	83_L	0.731	0.21
45_I	50_N	0.729	0.21
234_I	266_R	0.729	0.21
141_I	144_Q	0.728	0.21
103_L	220_A	0.726	0.20
207_S	397_K	0.724	0.20
137_L	165_I	0.723	0.20
365_W	421_A	0.723	0.20
172_I	193_A	0.723	0.20
127_L	480_L	0.720	0.20
466_F	519_Q	0.720	0.20
281_I	455_I	0.717	0.20
385_W	400_L	0.716	0.20
393_T	409_L	0.714	0.20
256_C	263_K	0.712	0.20
138_K	148_Y	0.711	0.20
387_A	498_Y	0.711	0.20
357_M	516_I	0.711	0.20
364_S	463_M	0.708	0.20
328_L	373_A	0.704	0.20
502_L	506_N	0.704	0.20
26_Q	29_D	0.703	0.20
168_T	191_I	0.702	0.20
268_K	285_H	0.700	0.20
140_V	207_S	0.699	0.20
190_G	359_L	0.693	0.19
39_G	251_K	0.692	0.19
491_A	498_Y	0.692	0.19
412_R	507_E	0.692	0.19
31_F	46_G	0.691	0.19
210_E	519_Q	0.690	0.19
168_T	478_Q	0.688	0.19
508_Y	512_G	0.688	0.19
60_C	259_T	0.686	0.19
385_W	523_L	0.686	0.19
287_P	439_A	0.684	0.19
221_K	400_L	0.682	0.19
374_S	511_C	0.676	0.19
477_Y	481_Q	0.675	0.19
359_L	483_T	0.674	0.19
464_M	520_T	0.673	0.19
37_L	377_K	0.673	0.19
67_G	198_E	0.671	0.19
152_T	337_V	0.671	0.19
83_L	196_Y	0.669	0.19
255_G	491_A	0.666	0.18
290_A	369_F	0.666	0.18
465_L	515_R	0.664	0.18
390_D	444_T	0.664	0.18
275_G	368_H	0.663	0.18
50_N	145_S	0.662	0.18
114_I	196_Y	0.662	0.18
196_Y	203_W	0.662	0.18
254_T	282_P	0.661	0.18
168_T	185_L	0.661	0.18
68_F	93_D	0.660	0.18
269_I	397_K	0.659	0.18
217_I	248_R	0.656	0.18
242_D	278_G	0.656	0.18
372_T	508_Y	0.655	0.18
143_V	344_P	0.655	0.18
176_A	215_T	0.654	0.18
363_E	367_T	0.652	0.18
462_C	488_N	0.651	0.18
408_F	434_L	0.651	0.18
220_A	289_A	0.648	0.18
79_C	228_N	0.648	0.18
387_A	390_D	0.647	0.18
165_I	289_A	0.647	0.18
185_L	492_V	0.645	0.18
410_F	466_F	0.642	0.18
232_K	355_E	0.641	0.18
137_L	232_K	0.639	0.18
290_A	412_R	0.638	0.18
365_W	509_S	0.638	0.18
39_G	455_I	0.638	0.18
34_I	43_I	0.637	0.18
51_P	81_I	0.636	0.17
33_L	141_I	0.635	0.17
375_F	397_K	0.635	0.17
290_A	396_A	0.631	0.17
138_K	463_M	0.631	0.17
43_I	100_E	0.631	0.17
233_E	440_T	0.629	0.17
191_I	243_E	0.628	0.17
185_L	257_S	0.628	0.17
219_K	379_E	0.627	0.17
131_S	436_F	0.627	0.17
240_Y	368_H	0.627	0.17
210_E	276_T	0.626	0.17
246_F	516_I	0.623	0.17
342_I	356_V	0.622	0.17
219_K	392_Q	0.621	0.17
52_L	248_R	0.621	0.17
152_T	269_I	0.620	0.17
38_K	357_M	0.619	0.17
80_I	140_V	0.619	0.17
147_I	437_S	0.619	0.17
121_L	289_A	0.618	0.17
458_Y	463_M	0.618	0.17
58_Y	230_K	0.617	0.17
210_E	400_L	0.617	0.17
29_D	453_E	0.615	0.17
433_D	508_Y	0.614	0.17
120_R	393_T	0.612	0.17
103_L	352_R	0.611	0.17
278_G	460_A	0.610	0.17
368_H	408_F	0.610	0.17
216_R	258_P	0.610	0.17
234_I	257_S	0.608	0.17
465_L	497_V	0.607	0.17
334_D	406_L	0.607	0.17
213_T	243_E	0.606	0.17
190_G	247_S	0.606	0.17
357_M	521_V	0.605	0.17
239_G	258_P	0.604	0.17
468_F	506_N	0.602	0.16
215_T	257_S	0.602	0.16
211_F	451_S	0.602	0.16
433_D	517_V	0.599	0.16
396_A	433_D	0.598	0.16
333_P	356_V	0.598	0.16
386_L	389_Y	0.597	0.16
88_K	464_M	0.596	0.16
365_W	412_R	0.596	0.16
402_H	406_L	0.596	0.16
451_S	485_A	0.595	0.16
289_A	356_V	0.594	0.16
25_Q	233_E	0.594	0.16
215_T	496_R	0.594	0.16
173_E	211_F	0.594	0.16
288_F	490_S	0.593	0.16
141_I	153_A	0.593	0.16
366_R	386_L	0.593	0.16
392_Q	400_L	0.592	0.16
500_L	506_N	0.591	0.16
335_V	348_D	0.591	0.16
147_I	399_T	0.591	0.16
137_L	148_Y	0.591	0.16
344_P	347_Q	0.591	0.16
81_I	88_K	0.589	0.16
111_V	377_K	0.587	0.16
120_R	146_L	0.587	0.16
140_V	144_Q	0.586	0.16
78_A	379_E	0.586	0.16
431_F	438_S	0.585	0.16
350_L	435_G	0.585	0.16
92_Q	497_V	0.585	0.16
420_L	450_I	0.583	0.16
34_I	148_Y	0.583	0.16
256_C	496_R	0.583	0.16
52_L	58_Y	0.582	0.16
191_I	240_Y	0.581	0.16
464_M	505_W	0.580	0.16
427_R	520_T	0.578	0.16
107_K	196_Y	0.578	0.16
165_I	195_H	0.578	0.16
251_K	510_A	0.578	0.16
59_V	107_K	0.577	0.16
83_L	86_Y	0.577	0.16
182_L	276_T	0.576	0.16
338_S	425_S	0.576	0.16
239_G	333_P	0.576	0.16
379_E	390_D	0.576	0.16
504_P	507_E	0.574	0.16
60_C	196_Y	0.574	0.16
272_Y	507_E	0.573	0.16
36_H	39_G	0.573	0.16
448_Q	455_I	0.573	0.16
271_A	425_S	0.571	0.16
308_I	314_A	0.571	0.16
43_I	102_E	0.570	0.16
68_F	95_F	0.570	0.16
338_S	408_F	0.570	0.16
274_R	278_G	0.570	0.16
117_L	147_I	0.569	0.16
54_K	187_Q	0.569	0.16
275_G	361_S	0.568	0.15
385_W	389_Y	0.568	0.15
269_I	497_V	0.567	0.15
178_T	376_L	0.567	0.15
57_L	500_L	0.566	0.15
44_S	67_G	0.566	0.15
427_R	446_S	0.566	0.15
214_K	397_K	0.566	0.15
411_L	521_V	0.566	0.15
513_H	520_T	0.566	0.15
326_Y	335_V	0.565	0.15
208_V	333_P	0.565	0.15
139_C	289_A	0.565	0.15
248_R	280_L	0.564	0.15
271_A	304_Y	0.564	0.15
196_Y	505_W	0.563	0.15
132_S	374_S	0.563	0.15
278_G	410_F	0.562	0.15
425_S	429_V	0.562	0.15
34_I	184_Q	0.562	0.15
61_P	172_I	0.562	0.15
212_I	332_E	0.561	0.15
505_W	508_Y	0.561	0.15
210_E	393_T	0.558	0.15
35_F	57_L	0.558	0.15
61_P	66_F	0.553	0.15
126_A	172_I	0.553	0.15
80_I	223_L	0.553	0.15
180_I	259_T	0.553	0.15
278_G	361_S	0.552	0.15
180_I	283_L	0.551	0.15
62_P	107_K	0.550	0.15
207_S	327_T	0.549	0.15
175_H	261_Y	0.548	0.15
145_S	155_L	0.548	0.15
320_K	509_S	0.547	0.15
347_Q	518_Q	0.546	0.15
233_E	257_S	0.545	0.15
34_I	78_A	0.545	0.15
53_Q	76_I	0.545	0.15
212_I	372_T	0.545	0.15
135_S	369_F	0.544	0.15
185_L	211_F	0.543	0.15
198_E	292_L	0.543	0.15
145_S	149_D	0.543	0.15
331_A	513_H	0.543	0.15
408_F	520_T	0.542	0.15
326_Y	329_S	0.541	0.15
183_A	416_Q	0.541	0.15
242_D	467_L	0.541	0.15
219_K	370_L	0.540	0.15
377_K	498_Y	0.540	0.15
453_E	518_Q	0.539	0.15
76_I	438_S	0.538	0.15
182_L	196_Y	0.537	0.15
177_D	181_T	0.537	0.15
269_I	409_L	0.535	0.15
365_W	429_V	0.535	0.15
339_M	447_E	0.534	0.15
147_I	215_T	0.534	0.15
114_I	518_Q	0.534	0.15
393_T	454_N	0.533	0.15
278_G	412_R	0.533	0.15
240_Y	314_A	0.533	0.15
284_H	335_V	0.532	0.14
27_L	160_D	0.532	0.14
479_Q	496_R	0.531	0.14
230_K	313_S	0.531	0.14
79_C	143_V	0.531	0.14
185_L	372_T	0.530	0.14
146_L	329_S	0.529	0.14
270_A	519_Q	0.527	0.14
221_K	360_P	0.524	0.14
300_Y	468_F	0.523	0.14
124_L	494_D	0.522	0.14
187_Q	452_L	0.522	0.14
144_Q	207_S	0.522	0.14
220_A	261_Y	0.521	0.14
386_L	424_R	0.521	0.14
164_A	194_K	0.520	0.14
196_Y	260_S	0.520	0.14
427_R	447_E	0.519	0.14
231_L	376_L	0.517	0.14
365_W	508_Y	0.516	0.14
301_Y	305_S	0.516	0.14
221_K	505_W	0.516	0.14
276_T	400_L	0.516	0.14
78_A	134_L	0.515	0.14
458_Y	505_W	0.515	0.14
368_H	373_A	0.515	0.14
430_F	436_F	0.515	0.14
335_V	458_Y	0.515	0.14
240_Y	385_W	0.514	0.14
426_V	506_N	0.513	0.14
499_L	520_T	0.513	0.14
407_R	435_G	0.513	0.14
184_Q	233_E	0.512	0.14
366_R	513_H	0.512	0.14
113_H	209_T	0.511	0.14
174_T	324_N	0.511	0.14
366_R	463_M	0.511	0.14
172_I	455_I	0.511	0.14
68_F	109_M	0.510	0.14
393_T	434_L	0.510	0.14
410_F	516_I	0.509	0.14
26_Q	30_S	0.509	0.14
314_A	319_E	0.509	0.14
71_A	372_T	0.509	0.14
172_I	210_E	0.508	0.14
419_Y	512_G	0.507	0.14
409_L	414_H	0.507	0.14
184_Q	191_I	0.507	0.14
43_I	78_A	0.506	0.14
286_I	450_I	0.506	0.14
428_E	502_L	0.506	0.14
199_S	233_E	0.504	0.14
361_S	368_H	0.504	0.14
72_A	380_S	0.503	0.14
365_W	373_A	0.503	0.14
509_S	517_V	0.502	0.14
92_Q	450_I	0.502	0.14
275_G	386_L	0.501	0.14
277_M	502_L	0.501	0.14
277_M	368_H	0.501	0.14
322_E	432_G	0.500	0.14
422_H	440_T	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3g9qA	1	0.4688	100	0.737	Contact Map
4pm4A	1	0.5142	100	0.74	Contact Map
3tefA	1	0.5047	100	0.741	Contact Map
1efdN	1	0.4783	100	0.741	Contact Map
3lhsA	1	0.5236	100	0.742	Contact Map
3r5tA	1	0.5198	100	0.742	Contact Map
3tnyA	1	0.5161	100	0.744	Contact Map
4b8yA	1	0.5066	100	0.747	Contact Map
3mwfA	1	0.5198	100	0.747	Contact Map
4mx8A	1	0.5274	100	0.747	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0131 seconds.