PTW3C - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTW3C - Putative PTS system glucosamine-specific EIICBA component

UniProt:	P39816	Sequences: MFKKAFQILQQLGRALMTPVAVLPAAGLLLRFGDKDLLNIPIIKDAGGVVFDNLPLIFAVGVAIGLAGGEGVAGLAAVIGYLILTVTLDNMGKLLGLQPPYEGAEHLIDMGVFGGIIIGLLAAYLYKRFSSIELHPVLGFFSGKRFVPIITSVSSLVIGVIFSFVWPLIQNGINAASSLIADSTVGLFFYATIYRLLIPFGLHHIFYTPFYFMMGEYTDPSTGNTVTGDLTRFFAGDPTAGRFMMGDFPYMIFCLPAVALAIIHTARPEKKKMISGVMISAALTSMLTGITEPVEFSFLFVAPVLYLINSILAGVIFVVCDLFHVRHGYTFSGGGIDYVLNYGLSTNGWVVIPVGIVFAFIYYYLFRFAILKWNLKTPGRETDEDGQNEEKAPVAKDQLAFHVLQALGGQQNIANLDACITRLRVTVHQPSQVCKDELKRLGAVGVLEVNNNFQAIFGTKSDALKDDIKTIMAGGVPATAAALDTVTDKPLKPDSDETFIYPIKGETVSLGDVPDQVFSEKMMGEGFAIIPSEGKVVAPADGEIVSIFPTKHAIGFMSAGGTEILIHVGIDTVKLNGEGFEAHVTSGQAVKQGELLLTFDLNYIKQHAASAITPVIFTNTSEEDLKHIQMK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	631 (613)
Sequences:	655 (407)
Seq/√Len:	16.4

ECOLI - PTW3C PTOCB PTGCB
BACSU - PTW3C PTG3C PTOCB PTWCB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
583_H	595_L	7.297	1.00
568_V	597_L	6.133	1.00
264_H	367_R	5.054	1.00
585_T	588_Q	4.676	1.00
257_A	359_A	4.670	1.00
603_Y	607_H	4.574	1.00
194_Y	247_D	4.440	1.00
559_A	589_A	4.407	1.00
521_K	525_E	4.335	1.00
504_K	533_E	4.316	1.00
581_E	598_T	4.125	1.00
543_E	589_A	4.014	1.00
48_G	52_D	3.947	1.00
262_I	278_M	3.934	1.00
545_V	557_M	3.875	1.00
435_K	448_E	3.838	1.00
267_R	382_T	3.716	1.00
265_T	371_L	3.481	0.99
541_D	592_Q	3.465	0.99
312_L	365_L	3.373	0.99
510_L	616_I	3.366	0.99
544_I	556_F	3.309	0.99
367_R	371_L	3.268	0.99
270_K	383_D	3.181	0.99
407_L	468_I	3.166	0.99
506_E	530_I	3.154	0.99
540_A	556_F	3.108	0.99
599_F	604_I	3.064	0.99
307_L	311_I	2.948	0.98
583_H	598_T	2.922	0.98
414_A	428_H	2.911	0.98
617_F	620_T	2.857	0.98
196_L	310_S	2.828	0.98
264_H	363_Y	2.815	0.98
247_D	329_Y	2.803	0.98
376_K	382_T	2.799	0.98
429_Q	432_Q	2.629	0.96
603_Y	608_A	2.625	0.96
591_K	594_E	2.614	0.96
513_V	528_A	2.597	0.96
547_I	582_A	2.496	0.95
535_K	595_L	2.492	0.95
582_A	597_L	2.489	0.95
352_I	356_I	2.480	0.95
194_Y	329_Y	2.469	0.95
265_T	367_R	2.469	0.95
563_E	619_N	2.439	0.94
275_S	279_I	2.437	0.94
568_V	599_F	2.437	0.94
516_Q	520_E	2.411	0.94
80_G	151_T	2.409	0.94
232_R	236_G	2.363	0.93
527_F	617_F	2.346	0.93
535_K	598_T	2.345	0.93
541_D	591_K	2.341	0.93
595_L	598_T	2.321	0.93
543_E	557_M	2.313	0.93
544_I	547_I	2.310	0.93
252_I	286_M	2.275	0.92
60_V	78_V	2.243	0.91
356_I	360_F	2.228	0.91
160_V	164_F	2.197	0.90
497_E	560_G	2.190	0.90
404_L	472_M	2.177	0.90
418_A	461_S	2.172	0.90
407_L	455_A	2.170	0.90
509_S	512_D	2.143	0.89
503_I	536_V	2.097	0.88
510_L	521_K	2.075	0.88
538_A	556_F	2.064	0.87
34_D	44_K	2.047	0.87
555_G	618_T	2.004	0.86
270_K	273_M	2.002	0.86
190_Y	306_Y	1.997	0.86
544_I	584_V	1.965	0.85
510_L	525_E	1.946	0.84
604_I	611_A	1.934	0.84
193_I	206_F	1.926	0.83
308_I	369_A	1.919	0.83
588_Q	594_E	1.881	0.82
50_V	79_I	1.876	0.82
514_P	612_I	1.864	0.81
196_L	250_Y	1.836	0.80
121_L	158_I	1.828	0.80
418_A	441_L	1.827	0.80
56_L	81_Y	1.827	0.80
578_E	607_H	1.825	0.80
153_V	157_V	1.823	0.80
192_T	307_L	1.823	0.80
523_M	617_F	1.779	0.78
263_I	271_K	1.764	0.77
547_I	586_S	1.757	0.77
403_V	457_F	1.731	0.76
161_I	165_V	1.683	0.74
497_E	558_S	1.661	0.73
232_R	237_D	1.655	0.73
404_L	416_L	1.652	0.73
620_T	623_E	1.650	0.72
514_P	610_S	1.641	0.72
194_Y	313_A	1.639	0.72
253_F	355_G	1.639	0.72
345_S	348_G	1.637	0.72
250_Y	313_A	1.622	0.71
110_M	173_I	1.619	0.71
187_L	321_D	1.619	0.71
56_L	78_V	1.610	0.71
10_Q	13_G	1.596	0.70
535_K	583_H	1.587	0.69
207_Y	329_Y	1.581	0.69
60_V	306_Y	1.558	0.68
363_Y	367_R	1.554	0.68
350_V	353_P	1.523	0.66
11_Q	127_K	1.509	0.65
85_T	107_L	1.491	0.64
564_I	616_I	1.479	0.64
441_L	461_S	1.470	0.63
617_F	623_E	1.468	0.63
511_G	521_K	1.466	0.63
125_L	154_S	1.461	0.63
192_T	310_S	1.455	0.62
338_Y	348_G	1.450	0.62
191_A	317_F	1.434	0.61
211_Y	251_M	1.430	0.61
192_T	196_L	1.429	0.61
344_L	348_G	1.426	0.61
207_Y	313_A	1.402	0.59
189_F	250_Y	1.402	0.59
540_A	558_S	1.395	0.59
28_L	32_F	1.392	0.59
318_V	329_Y	1.385	0.58
51_F	290_I	1.383	0.58
157_V	161_I	1.382	0.58
353_P	357_V	1.370	0.58
504_K	532_S	1.368	0.58
309_N	362_Y	1.367	0.57
304_V	308_I	1.363	0.57
139_G	290_I	1.363	0.57
429_Q	550_T	1.362	0.57
207_Y	247_D	1.358	0.57
96_G	101_Y	1.355	0.57
602_N	606_Q	1.352	0.57
223_G	228_G	1.351	0.57
399_L	460_K	1.339	0.56
17_M	204_H	1.333	0.56
213_M	217_Y	1.330	0.55
224_N	227_T	1.327	0.55
267_R	376_K	1.326	0.55
232_R	348_G	1.325	0.55
590_V	602_N	1.324	0.55
547_I	584_V	1.320	0.55
64_I	120_L	1.320	0.55
320_C	329_Y	1.310	0.54
120_L	124_Y	1.306	0.54
549_P	565_L	1.302	0.54
457_F	461_S	1.295	0.53
247_D	313_A	1.294	0.53
213_M	216_E	1.292	0.53
568_V	582_A	1.292	0.53
194_Y	250_Y	1.283	0.53
324_H	347_N	1.282	0.53
590_V	604_I	1.279	0.52
219_D	224_N	1.270	0.52
578_E	603_Y	1.264	0.51
597_L	609_A	1.262	0.51
260_L	264_H	1.261	0.51
183_S	186_G	1.249	0.51
101_Y	104_A	1.245	0.50
536_V	599_F	1.244	0.50
508_V	530_I	1.241	0.50
236_G	348_G	1.237	0.50
551_K	582_A	1.235	0.50
51_F	114_G	1.227	0.49
223_G	232_R	1.224	0.49
501_Y	529_I	1.215	0.49
190_Y	245_M	1.209	0.48
244_M	249_P	1.209	0.48
158_I	162_F	1.200	0.48
602_N	605_K	1.198	0.48
597_L	603_Y	1.197	0.48
216_E	221_S	1.194	0.47
50_V	57_I	1.193	0.47
534_G	599_F	1.187	0.47
170_Q	243_F	1.184	0.47
597_L	608_A	1.183	0.47
416_L	472_M	1.182	0.47
190_Y	326_R	1.178	0.46
264_H	371_L	1.176	0.46
232_R	238_P	1.173	0.46
132_I	146_F	1.171	0.46
462_D	468_I	1.171	0.46
219_D	222_T	1.165	0.46
9_L	12_L	1.159	0.45
416_L	425_V	1.159	0.45
523_M	620_T	1.158	0.45
266_A	377_T	1.158	0.45
542_G	556_F	1.158	0.45
232_R	345_S	1.156	0.45
196_L	313_A	1.155	0.45
585_T	605_K	1.149	0.45
188_F	192_T	1.146	0.45
187_L	242_R	1.145	0.44
361_I	365_L	1.137	0.44
218_T	225_T	1.135	0.44
583_H	597_L	1.130	0.44
271_K	372_K	1.128	0.44
14_R	417_D	1.127	0.43
259_A	294_V	1.126	0.43
126_Y	241_G	1.124	0.43
568_V	613_T	1.122	0.43
320_C	325_V	1.121	0.43
554_I	596_L	1.118	0.43
579_G	603_Y	1.117	0.43
523_M	566_I	1.108	0.42
484_D	487_T	1.106	0.42
574_K	608_A	1.106	0.42
64_I	272_K	1.105	0.42
284_T	320_C	1.104	0.42
99_P	104_A	1.099	0.42
85_T	108_I	1.088	0.41
547_I	597_L	1.083	0.41
443_A	446_V	1.083	0.41
457_F	465_K	1.079	0.41
177_S	216_E	1.079	0.41
327_H	351_V	1.075	0.40
20_V	210_F	1.069	0.40
196_L	299_L	1.067	0.40
211_Y	332_S	1.066	0.40
509_S	566_I	1.063	0.40
251_M	285_S	1.061	0.40
523_M	618_T	1.060	0.40
215_G	229_D	1.060	0.40
23_L	63_A	1.057	0.39
15_A	66_L	1.053	0.39
284_T	287_L	1.050	0.39
11_Q	506_E	1.047	0.39
218_T	223_G	1.046	0.39
385_D	564_I	1.042	0.39
609_A	620_T	1.039	0.38
133_E	460_K	1.038	0.38
601_L	608_A	1.036	0.38
97_L	102_E	1.030	0.38
562_T	623_E	1.026	0.38
514_P	614_P	1.024	0.38
536_V	566_I	1.019	0.37
554_I	566_I	1.018	0.37
547_I	588_Q	1.017	0.37
226_V	235_A	1.015	0.37
599_F	613_T	1.015	0.37
556_F	596_L	1.014	0.37
96_G	102_E	1.013	0.37
543_E	592_Q	1.013	0.37
514_P	608_A	1.011	0.37
414_A	426_T	1.009	0.37
522_M	555_G	1.007	0.37
92_G	97_L	1.007	0.37
574_K	609_A	1.005	0.37
541_D	559_A	1.004	0.37
30_L	51_F	1.004	0.37
529_I	558_S	1.003	0.36
508_V	528_A	1.002	0.36
172_G	357_V	1.000	0.36
508_V	585_T	0.998	0.36
537_V	594_E	0.996	0.36
365_L	369_A	0.994	0.36
510_L	623_E	0.993	0.36
124_Y	129_F	0.992	0.36
113_F	281_A	0.992	0.36
461_S	468_I	0.987	0.36
190_Y	229_D	0.987	0.36
434_C	483_L	0.986	0.36
215_G	228_G	0.986	0.36
574_K	611_A	0.985	0.36
609_A	623_E	0.984	0.35
511_G	616_I	0.983	0.35
85_T	190_Y	0.978	0.35
318_V	322_L	0.978	0.35
113_F	209_P	0.977	0.35
37_L	40_I	0.976	0.35
229_D	239_T	0.976	0.35
97_L	100_P	0.975	0.35
483_L	486_V	0.974	0.35
402_H	437_E	0.972	0.35
566_I	615_V	0.970	0.35
257_A	363_Y	0.969	0.35
558_S	562_T	0.964	0.34
406_A	441_L	0.964	0.34
427_V	433_V	0.963	0.34
530_I	604_I	0.961	0.34
493_P	616_I	0.960	0.34
297_S	319_V	0.960	0.34
327_H	341_N	0.960	0.34
194_Y	306_Y	0.960	0.34
323_F	354_V	0.958	0.34
249_P	320_C	0.957	0.34
128_R	131_S	0.954	0.34
102_E	105_E	0.952	0.34
503_I	529_I	0.951	0.34
290_I	320_C	0.950	0.34
18_T	51_F	0.949	0.34
52_D	294_V	0.948	0.34
304_V	373_W	0.943	0.33
97_L	101_Y	0.943	0.33
111_G	170_Q	0.942	0.33
530_I	612_I	0.941	0.33
564_I	617_F	0.941	0.33
611_A	614_P	0.937	0.33
506_E	556_F	0.936	0.33
597_L	607_H	0.935	0.33
187_L	312_L	0.935	0.33
507_T	527_F	0.934	0.33
545_V	594_E	0.932	0.33
65_G	210_F	0.932	0.33
508_V	612_I	0.931	0.33
579_G	583_H	0.931	0.33
361_I	472_M	0.931	0.33
268_P	363_Y	0.923	0.32
129_F	294_V	0.922	0.32
608_A	620_T	0.919	0.32
122_A	151_T	0.917	0.32
418_A	462_D	0.916	0.32
213_M	227_T	0.915	0.32
504_K	566_I	0.913	0.32
536_V	611_A	0.912	0.32
228_G	232_R	0.912	0.32
29_L	43_I	0.912	0.32
169_I	335_G	0.912	0.32
545_V	616_I	0.910	0.32
162_F	271_K	0.909	0.32
183_S	192_T	0.907	0.31
507_T	564_I	0.901	0.31
544_I	564_I	0.899	0.31
20_V	278_M	0.898	0.31
215_G	240_A	0.897	0.31
364_Y	368_F	0.896	0.31
250_Y	329_Y	0.896	0.31
534_G	563_E	0.894	0.31
329_Y	333_G	0.893	0.31
57_I	173_I	0.893	0.31
510_L	582_A	0.887	0.30
31_R	35_K	0.885	0.30
20_V	176_A	0.884	0.30
319_V	323_F	0.883	0.30
210_F	301_V	0.881	0.30
74_G	196_L	0.881	0.30
306_Y	352_I	0.875	0.30
45_D	87_T	0.874	0.30
125_L	150_I	0.873	0.30
77_A	306_Y	0.871	0.30
556_F	570_I	0.871	0.30
64_I	70_E	0.871	0.30
398_Q	519_S	0.871	0.30
583_H	591_K	0.870	0.30
520_E	589_A	0.865	0.29
502_P	614_P	0.865	0.29
27_G	209_P	0.863	0.29
421_T	531_P	0.863	0.29
541_D	594_E	0.863	0.29
579_G	607_H	0.861	0.29
557_M	596_L	0.857	0.29
30_L	132_I	0.857	0.29
503_I	566_I	0.855	0.29
548_F	573_V	0.854	0.29
115_G	119_G	0.853	0.29
534_G	604_I	0.852	0.29
554_I	557_M	0.852	0.29
555_G	565_L	0.852	0.29
27_G	330_T	0.851	0.29
271_K	324_H	0.850	0.29
420_I	461_S	0.850	0.29
530_I	605_K	0.850	0.29
525_E	620_T	0.848	0.29
447_L	456_I	0.843	0.28
308_I	312_L	0.841	0.28
16_L	126_Y	0.840	0.28
369_A	373_W	0.838	0.28
517_V	551_K	0.837	0.28
342_Y	348_G	0.836	0.28
92_G	102_E	0.836	0.28
244_M	320_C	0.836	0.28
530_I	603_Y	0.834	0.28
232_R	240_A	0.829	0.28
484_D	489_K	0.828	0.28
263_I	275_S	0.828	0.28
583_H	613_T	0.826	0.27
501_Y	620_T	0.826	0.27
161_I	414_A	0.826	0.27
537_V	595_L	0.825	0.27
281_A	302_A	0.824	0.27
504_K	534_G	0.823	0.27
420_I	457_F	0.820	0.27
196_L	307_L	0.820	0.27
215_G	232_R	0.820	0.27
523_M	608_A	0.818	0.27
422_R	454_Q	0.817	0.27
5_A	382_T	0.816	0.27
260_L	265_T	0.816	0.27
182_D	271_K	0.816	0.27
405_Q	566_I	0.816	0.27
249_P	316_I	0.815	0.27
607_H	610_S	0.814	0.27
32_F	171_N	0.813	0.27
118_I	155_S	0.809	0.27
184_T	318_V	0.809	0.27
211_Y	334_G	0.809	0.27
155_S	349_W	0.808	0.27
81_Y	543_E	0.807	0.27
492_K	616_I	0.807	0.27
583_H	594_E	0.807	0.27
455_A	461_S	0.806	0.27
510_L	522_M	0.806	0.27
83_I	320_C	0.805	0.27
28_L	57_I	0.802	0.26
478_A	481_A	0.802	0.26
265_T	363_Y	0.801	0.26
88_L	374_N	0.800	0.26
512_D	611_A	0.799	0.26
335_G	468_I	0.797	0.26
592_Q	596_L	0.797	0.26
165_V	268_P	0.796	0.26
230_L	233_F	0.792	0.26
564_I	596_L	0.792	0.26
260_L	367_R	0.792	0.26
556_F	619_N	0.792	0.26
21_A	53_N	0.791	0.26
522_M	527_F	0.791	0.26
117_I	350_V	0.791	0.26
468_I	471_I	0.789	0.26
211_Y	333_G	0.789	0.26
194_Y	312_L	0.788	0.26
57_I	413_I	0.787	0.26
223_G	226_V	0.787	0.26
205_I	240_A	0.786	0.26
69_G	416_L	0.786	0.26
609_A	617_F	0.785	0.26
150_I	622_E	0.785	0.26
177_S	217_Y	0.783	0.26
480_A	490_P	0.782	0.25
189_F	329_Y	0.781	0.25
510_L	617_F	0.779	0.25
33_G	47_G	0.779	0.25
397_D	591_K	0.778	0.25
194_Y	207_Y	0.778	0.25
519_S	530_I	0.777	0.25
31_R	38_L	0.776	0.25
288_T	459_T	0.774	0.25
247_D	306_Y	0.774	0.25
498_T	617_F	0.773	0.25
522_M	529_I	0.771	0.25
133_E	136_P	0.771	0.25
485_T	488_D	0.770	0.25
64_I	265_T	0.770	0.25
96_G	99_P	0.770	0.25
510_L	545_V	0.770	0.25
61_G	253_F	0.769	0.25
57_I	329_Y	0.767	0.25
485_T	491_L	0.766	0.25
394_V	436_D	0.766	0.25
54_L	112_V	0.766	0.25
79_I	118_I	0.762	0.25
415_N	426_T	0.761	0.25
605_K	611_A	0.760	0.24
603_Y	609_A	0.760	0.24
441_L	457_F	0.760	0.24
70_E	126_Y	0.757	0.24
436_D	519_S	0.756	0.24
217_Y	232_R	0.756	0.24
368_F	372_K	0.756	0.24
207_Y	230_L	0.756	0.24
229_D	241_G	0.753	0.24
31_R	34_D	0.753	0.24
325_V	333_G	0.753	0.24
540_A	564_I	0.751	0.24
313_A	329_Y	0.750	0.24
100_P	104_A	0.749	0.24
510_L	557_M	0.749	0.24
556_F	563_E	0.748	0.24
247_D	320_C	0.748	0.24
249_P	306_Y	0.746	0.24
480_A	484_D	0.746	0.24
285_S	315_V	0.745	0.24
140_F	148_P	0.743	0.24
317_F	327_H	0.742	0.24
258_V	362_Y	0.741	0.24
600_D	603_Y	0.738	0.24
544_I	605_K	0.737	0.24
407_L	425_V	0.737	0.24
171_N	175_A	0.736	0.23
247_D	299_L	0.736	0.23
490_P	501_Y	0.734	0.23
310_S	410_Q	0.733	0.23
373_W	594_E	0.733	0.23
503_I	614_P	0.732	0.23
532_S	576_N	0.727	0.23
301_V	374_N	0.726	0.23
581_E	597_L	0.726	0.23
211_Y	246_G	0.723	0.23
80_G	122_A	0.722	0.23
474_G	477_P	0.722	0.23
41_P	44_K	0.720	0.23
401_F	405_Q	0.720	0.23
251_M	333_G	0.720	0.23
266_A	278_M	0.719	0.23
228_G	240_A	0.718	0.23
27_G	51_F	0.718	0.23
30_L	34_D	0.717	0.23
501_Y	589_A	0.717	0.23
568_V	596_L	0.716	0.23
429_Q	563_E	0.714	0.23
187_L	329_Y	0.714	0.23
32_F	50_V	0.712	0.22
523_M	555_G	0.712	0.22
550_T	613_T	0.711	0.22
425_V	455_A	0.711	0.22
579_G	595_L	0.711	0.22
610_S	614_P	0.710	0.22
267_R	369_A	0.709	0.22
161_I	559_A	0.709	0.22
264_H	349_W	0.708	0.22
546_S	586_S	0.707	0.22
57_I	196_L	0.706	0.22
234_F	341_N	0.705	0.22
187_L	192_T	0.705	0.22
194_Y	299_L	0.703	0.22
46_A	152_S	0.702	0.22
545_V	586_S	0.702	0.22
248_F	251_M	0.699	0.22
418_A	464_L	0.698	0.22
187_L	302_A	0.698	0.22
516_Q	537_V	0.695	0.22
517_V	548_F	0.694	0.22
550_T	592_Q	0.693	0.22
490_P	509_S	0.691	0.22
207_Y	310_S	0.691	0.22
486_V	489_K	0.691	0.22
230_L	346_T	0.691	0.22
411_Q	589_A	0.691	0.22
99_P	103_G	0.690	0.22
148_P	288_T	0.689	0.22
169_I	235_A	0.688	0.22
13_G	65_G	0.687	0.21
566_I	614_P	0.685	0.21
610_S	620_T	0.685	0.21
163_S	306_Y	0.685	0.21
217_Y	240_A	0.685	0.21
252_I	338_Y	0.683	0.21
83_I	244_M	0.683	0.21
418_A	455_A	0.683	0.21
326_R	346_T	0.682	0.21
510_L	613_T	0.682	0.21
356_I	359_A	0.682	0.21
480_A	483_L	0.680	0.21
509_S	519_S	0.678	0.21
482_A	489_K	0.677	0.21
320_C	354_V	0.677	0.21
268_P	271_K	0.677	0.21
386_G	390_E	0.676	0.21
560_G	596_L	0.675	0.21
278_M	377_T	0.675	0.21
538_A	541_D	0.675	0.21
18_T	64_I	0.674	0.21
557_M	589_A	0.674	0.21
138_L	294_V	0.673	0.21
517_V	520_E	0.673	0.21
333_G	351_V	0.672	0.21
610_S	613_T	0.672	0.21
504_K	536_V	0.670	0.21
527_F	562_T	0.669	0.21
126_Y	144_K	0.668	0.21
404_L	471_I	0.668	0.21
243_F	287_L	0.668	0.21
254_C	258_V	0.668	0.21
317_F	351_V	0.667	0.21
249_P	309_N	0.667	0.21
377_T	380_R	0.667	0.21
173_I	211_Y	0.666	0.21
57_I	123_A	0.665	0.21
617_F	624_D	0.665	0.21
266_A	271_K	0.664	0.21
386_G	602_N	0.663	0.21
230_L	348_G	0.663	0.21
229_D	232_R	0.663	0.21
233_F	341_N	0.661	0.20
608_A	611_A	0.660	0.20
528_A	612_I	0.659	0.20
576_N	612_I	0.659	0.20
446_V	455_A	0.659	0.20
231_T	234_F	0.658	0.20
206_F	209_P	0.658	0.20
579_G	610_S	0.657	0.20
497_E	617_F	0.656	0.20
562_T	624_D	0.654	0.20
457_F	468_I	0.654	0.20
194_Y	325_V	0.653	0.20
108_I	170_Q	0.653	0.20
543_E	586_S	0.653	0.20
247_D	318_V	0.650	0.20
257_A	338_Y	0.649	0.20
370_I	377_T	0.649	0.20
612_I	616_I	0.648	0.20
597_L	610_S	0.647	0.20
229_D	243_F	0.647	0.20
38_L	232_R	0.646	0.20
273_M	319_V	0.645	0.20
304_V	357_V	0.645	0.20
25_A	354_V	0.644	0.20
523_M	571_D	0.643	0.20
169_I	432_Q	0.643	0.20
52_D	107_L	0.642	0.20
181_A	320_C	0.642	0.20
483_L	487_T	0.641	0.20
37_L	81_Y	0.640	0.20
595_L	604_I	0.640	0.20
557_M	595_L	0.639	0.20
176_A	193_I	0.639	0.20
335_G	592_Q	0.637	0.20
68_G	308_I	0.637	0.20
435_K	439_K	0.637	0.20
418_A	457_F	0.637	0.20
194_Y	309_N	0.636	0.20
534_G	601_L	0.634	0.19
27_G	317_F	0.633	0.19
28_L	173_I	0.633	0.19
189_F	196_L	0.632	0.19
57_I	223_G	0.631	0.19
190_Y	238_P	0.631	0.19
582_A	586_S	0.630	0.19
196_L	329_Y	0.629	0.19
150_I	153_V	0.629	0.19
551_K	597_L	0.628	0.19
607_H	613_T	0.628	0.19
251_M	332_S	0.627	0.19
247_D	250_Y	0.627	0.19
592_Q	595_L	0.626	0.19
493_P	547_I	0.626	0.19
472_M	544_I	0.625	0.19
285_S	364_Y	0.623	0.19
244_M	248_F	0.623	0.19
494_D	564_I	0.623	0.19
297_S	329_Y	0.623	0.19
563_E	618_T	0.623	0.19
533_E	586_S	0.622	0.19
576_N	605_K	0.622	0.19
503_I	599_F	0.621	0.19
520_E	591_K	0.621	0.19
194_Y	320_C	0.621	0.19
463_A	466_D	0.620	0.19
34_D	37_L	0.618	0.19
128_R	391_K	0.618	0.19
246_G	298_F	0.618	0.19
584_V	596_L	0.617	0.19
479_T	482_A	0.617	0.19
501_Y	504_K	0.616	0.19
544_I	570_I	0.614	0.19
152_S	306_Y	0.614	0.19
491_L	606_Q	0.614	0.19
21_A	341_N	0.613	0.19
481_A	487_T	0.613	0.19
28_L	277_V	0.612	0.19
209_P	330_T	0.612	0.19
544_I	590_V	0.611	0.19
72_V	299_L	0.611	0.19
514_P	579_G	0.610	0.19
574_K	622_E	0.609	0.19
508_V	605_K	0.608	0.18
287_L	336_I	0.608	0.18
25_A	358_F	0.608	0.18
541_D	558_S	0.607	0.18
257_A	285_S	0.607	0.18
12_L	180_I	0.607	0.18
503_I	578_E	0.606	0.18
196_L	207_Y	0.606	0.18
360_F	364_Y	0.605	0.18
551_K	620_T	0.605	0.18
6_F	10_Q	0.604	0.18
62_V	306_Y	0.604	0.18
426_T	430_P	0.604	0.18
243_F	309_N	0.603	0.18
218_T	221_S	0.602	0.18
272_K	275_S	0.602	0.18
16_L	144_K	0.600	0.18
594_E	598_T	0.600	0.18
20_V	205_I	0.599	0.18
217_Y	229_D	0.599	0.18
290_I	299_L	0.597	0.18
188_F	317_F	0.596	0.18
153_V	156_L	0.596	0.18
247_D	312_L	0.595	0.18
169_I	384_E	0.595	0.18
568_V	608_A	0.595	0.18
434_C	538_A	0.594	0.18
420_I	441_L	0.594	0.18
111_G	114_G	0.594	0.18
599_F	609_A	0.593	0.18
96_G	484_D	0.592	0.18
530_I	611_A	0.592	0.18
68_G	457_F	0.591	0.18
322_L	538_A	0.591	0.18
222_T	236_G	0.591	0.18
597_L	614_P	0.591	0.18
543_E	559_A	0.590	0.18
558_S	566_I	0.590	0.18
570_I	611_A	0.590	0.18
255_L	258_V	0.589	0.18
212_F	230_L	0.589	0.18
78_V	306_Y	0.588	0.18
91_M	160_V	0.588	0.18
398_Q	586_S	0.587	0.18
528_A	614_P	0.587	0.18
312_L	335_G	0.587	0.18
478_A	485_T	0.585	0.18
547_I	596_L	0.585	0.18
173_I	176_A	0.585	0.18
559_A	621_S	0.585	0.18
364_Y	510_L	0.584	0.18
595_L	617_F	0.583	0.18
488_D	603_Y	0.582	0.18
262_I	301_V	0.582	0.18
389_E	393_P	0.581	0.18
32_F	196_L	0.581	0.18
263_I	348_G	0.581	0.18
216_E	242_R	0.580	0.18
503_I	541_D	0.580	0.18
247_D	327_H	0.580	0.18
332_S	362_Y	0.580	0.18
506_E	532_S	0.579	0.17
282_A	285_S	0.579	0.17
582_A	585_T	0.578	0.17
236_G	345_S	0.577	0.17
514_P	525_E	0.577	0.17
29_L	82_L	0.577	0.17
254_C	362_Y	0.577	0.17
527_F	614_P	0.576	0.17
278_M	302_A	0.576	0.17
176_A	179_L	0.576	0.17
523_M	546_S	0.575	0.17
257_A	356_I	0.574	0.17
129_F	615_V	0.574	0.17
545_V	582_A	0.574	0.17
187_L	207_Y	0.573	0.17
262_I	274_I	0.571	0.17
84_L	299_L	0.571	0.17
262_I	297_S	0.571	0.17
522_M	609_A	0.570	0.17
139_G	457_F	0.570	0.17
155_S	457_F	0.570	0.17
341_N	348_G	0.570	0.17
245_M	326_R	0.570	0.17
138_L	433_V	0.569	0.17
68_G	127_K	0.569	0.17
130_S	351_V	0.569	0.17
325_V	361_I	0.569	0.17
519_S	543_E	0.569	0.17
267_R	545_V	0.568	0.17
5_A	79_I	0.567	0.17
411_Q	432_Q	0.567	0.17
413_I	478_A	0.567	0.17
444_V	457_F	0.566	0.17
513_V	540_A	0.565	0.17
71_G	332_S	0.565	0.17
31_R	353_P	0.565	0.17
126_Y	229_D	0.564	0.17
516_Q	591_K	0.563	0.17
343_G	348_G	0.563	0.17
486_V	491_L	0.563	0.17
532_S	606_Q	0.562	0.17
96_G	100_P	0.561	0.17
156_L	581_E	0.560	0.17
517_V	538_A	0.559	0.17
265_T	382_T	0.559	0.17
483_L	606_Q	0.558	0.17
369_A	537_V	0.557	0.17
80_G	441_L	0.557	0.17
406_A	418_A	0.556	0.17
87_T	205_I	0.553	0.17
436_D	585_T	0.553	0.17
509_S	596_L	0.552	0.17
519_S	527_F	0.552	0.17
252_I	355_G	0.552	0.17
503_I	613_T	0.552	0.17
223_G	240_A	0.551	0.17
457_F	464_L	0.550	0.17
479_T	486_V	0.550	0.17
13_G	210_F	0.550	0.17
508_V	513_V	0.550	0.17
491_L	602_N	0.550	0.17
547_I	599_F	0.550	0.17
21_A	148_P	0.550	0.17
602_N	607_H	0.549	0.16
456_I	616_I	0.548	0.16
99_P	128_R	0.548	0.16
290_I	330_T	0.548	0.16
544_I	624_D	0.547	0.16
488_D	492_K	0.547	0.16
45_D	48_G	0.547	0.16
601_L	607_H	0.547	0.16
255_L	288_T	0.547	0.16
621_S	624_D	0.546	0.16
188_F	315_V	0.546	0.16
275_S	342_Y	0.546	0.16
129_F	364_Y	0.545	0.16
21_A	246_G	0.545	0.16
320_C	326_R	0.545	0.16
545_V	606_Q	0.545	0.16
546_S	619_N	0.545	0.16
520_E	533_E	0.544	0.16
128_R	560_G	0.544	0.16
255_L	417_D	0.543	0.16
499_F	507_T	0.543	0.16
251_M	316_I	0.543	0.16
264_H	268_P	0.542	0.16
252_I	340_L	0.542	0.16
416_L	465_K	0.542	0.16
215_G	239_T	0.542	0.16
274_I	614_P	0.541	0.16
35_K	44_K	0.540	0.16
455_A	464_L	0.538	0.16
53_N	111_G	0.537	0.16
311_I	319_V	0.537	0.16
334_G	346_T	0.536	0.16
258_V	309_N	0.535	0.16
71_G	173_I	0.534	0.16
192_T	313_A	0.534	0.16
351_V	465_K	0.534	0.16
566_I	613_T	0.533	0.16
592_Q	605_K	0.533	0.16
124_Y	128_R	0.533	0.16
76_A	147_V	0.533	0.16
576_N	596_L	0.533	0.16
582_A	609_A	0.532	0.16
18_T	132_I	0.532	0.16
60_V	352_I	0.532	0.16
487_T	596_L	0.530	0.16
217_Y	238_P	0.530	0.16
304_V	374_N	0.529	0.16
617_F	621_S	0.529	0.16
485_T	492_K	0.528	0.16
389_E	484_D	0.528	0.16
47_G	75_L	0.528	0.16
523_M	624_D	0.528	0.16
139_G	216_E	0.527	0.16
581_E	591_K	0.527	0.16
546_S	617_F	0.527	0.16
128_R	581_E	0.527	0.16
267_R	301_V	0.527	0.16
8_I	124_Y	0.526	0.16
517_V	522_M	0.526	0.16
440_R	622_E	0.525	0.16
196_L	318_V	0.525	0.16
247_D	309_N	0.525	0.16
246_G	334_G	0.525	0.16
110_M	114_G	0.525	0.16
537_V	558_S	0.524	0.16
499_F	527_F	0.524	0.16
57_I	89_D	0.523	0.16
92_G	104_A	0.523	0.16
491_L	529_I	0.523	0.16
247_D	325_V	0.522	0.16
500_I	538_A	0.522	0.16
428_H	493_P	0.522	0.16
256_P	337_D	0.522	0.16
99_P	102_E	0.522	0.16
55_P	129_F	0.521	0.16
247_D	310_S	0.520	0.16
207_Y	212_F	0.520	0.16
260_L	263_I	0.519	0.16
416_L	447_L	0.519	0.16
158_I	264_H	0.519	0.16
564_I	606_Q	0.519	0.16
156_L	302_A	0.518	0.16
294_V	473_A	0.518	0.16
190_Y	353_P	0.518	0.16
383_D	557_M	0.517	0.15
254_C	309_N	0.516	0.15
500_I	560_G	0.515	0.15
517_V	527_F	0.515	0.15
354_V	357_V	0.514	0.15
392_A	484_D	0.514	0.15
506_E	512_D	0.514	0.15
558_S	570_I	0.513	0.15
217_Y	327_H	0.512	0.15
62_V	240_A	0.512	0.15
586_S	611_A	0.512	0.15
283_L	459_T	0.511	0.15
603_Y	621_S	0.511	0.15
391_K	480_A	0.511	0.15
209_P	281_A	0.511	0.15
480_A	488_D	0.510	0.15
319_V	322_L	0.510	0.15
447_L	501_Y	0.510	0.15
519_S	535_K	0.509	0.15
517_V	523_M	0.509	0.15
21_A	294_V	0.509	0.15
482_A	557_M	0.508	0.15
510_L	549_P	0.507	0.15
20_V	262_I	0.507	0.15
84_L	108_I	0.506	0.15
306_Y	361_I	0.506	0.15
165_V	436_D	0.505	0.15
534_G	549_P	0.505	0.15
285_S	519_S	0.505	0.15
62_V	233_F	0.505	0.15
88_L	107_L	0.505	0.15
590_V	595_L	0.504	0.15
549_P	604_I	0.504	0.15
244_M	247_D	0.503	0.15
109_D	200_F	0.503	0.15
543_E	565_L	0.503	0.15
78_V	245_M	0.503	0.15
57_I	208_T	0.503	0.15
386_G	490_P	0.503	0.15
31_R	333_G	0.503	0.15
429_Q	476_V	0.503	0.15
61_G	355_G	0.502	0.15
390_E	489_K	0.501	0.15
31_R	110_M	0.501	0.15
39_N	302_A	0.501	0.15
558_S	623_E	0.501	0.15
148_P	280_S	0.501	0.15
391_K	606_Q	0.500	0.15
66_L	348_G	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ourB	1	0.2155	100	0.79	Contact Map
1f3zA	2	0.2155	100	0.791	Contact Map
2gprA	1	0.2235	100	0.792	Contact Map
3qnqA	2	0.5927	100	0.793	Contact Map
1ax3A	1	0.233	100	0.797	Contact Map
1ibaA	1	0.1236	99.9	0.903	Contact Map
3bp3A	1	0.1284	99.9	0.905	Contact Map
3ipjA	1	0.1474	99.9	0.91	Contact Map
1dczA	1	0.1125	97.7	0.966	Contact Map
2d5dA	1	0.1014	97.6	0.967	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0145 seconds.