ROCB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ROCB - Protein RocB

UniProt:	P39635	Sequences: MQYTKISHMNPAERVEALTASLVSLSSVNGTVGEGTKADFIKEVITSYPYFQENPSHVWEQAIPNDPYKRKNIFAFIKGHGESRNTVIYHAHLDTVGIEDFGPLKDIAFDCEKLAEYFSRYEFDQDVQRDAKSGEWMFGRGSVDMQSGIAVHLANLLHFSENLETLPGNVLFMANPDEESQHSGILASISELNRLKKEKQLHYLAAINTDFITPLYDGDQTRYIYTGAAGKLLPCFYIYGREVHVGDTLAGIDPNFISSEITSRLHNNIHLAEKVEGELVLPPSCLYQRDNKESYNVQTAVSTSLYFNCFIYERTAKEMMDLLIEVTEEACRETEQKLSDYYEEYVKRANLPKKHLSWGIQVYSLEQYLEKLRNRGIDPEQCIEQTFKANEHLELRMRCFQAIEELQKLDPDQGAKVILFYAPPYLPHNYLKEDSARDQLLQHVIKEAADKTAESTGETFVFKKFFPYLADGSFLSLHETDGEIDSFIRNFPGWNMIGTIPFKDIRKLNIPSINMGVYGKDGHKWTERVYKPYTFHVLPLLIQQTTVHLLQSYRMTITAKEPKGEG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	566 (526)
Sequences:	365 (316)
Seq/√Len:	13.8

ECOLI - PEPD
BACSU - ROCB YQJN

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
108_A	111_C	6.076	1.00
260_E	263_S	4.930	1.00
108_A	114_L	4.737	1.00
110_D	113_K	4.511	1.00
111_C	114_L	4.396	1.00
102_G	108_A	4.108	1.00
264_R	333_E	4.101	1.00
254_P	303_T	3.901	1.00
314_R	322_L	3.794	0.99
264_R	329_E	3.726	0.99
98_I	109_F	3.707	0.99
49_P	52_Q	3.611	0.99
261_I	417_V	3.598	0.99
85_N	202_H	3.438	0.99
474_F	498_G	3.129	0.98
76_F	171_L	3.064	0.98
219_D	223_Y	2.986	0.97
108_A	112_E	2.978	0.97
124_D	303_T	2.962	0.97
205_A	549_L	2.960	0.97
78_K	199_K	2.870	0.96
152_H	209_T	2.737	0.95
129_R	132_K	2.722	0.95
16_E	531_K	2.612	0.94
130_D	520_K	2.608	0.94
228_A	470_A	2.543	0.93
128_Q	132_K	2.541	0.93
324_I	367_Q	2.540	0.93
191_E	194_R	2.523	0.92
85_N	204_L	2.507	0.92
129_R	536_H	2.487	0.92
87_V	277_G	2.442	0.91
255_N	288_Q	2.427	0.91
258_S	305_L	2.307	0.89
521_D	526_T	2.284	0.88
331_C	417_V	2.277	0.88
194_R	198_E	2.267	0.88
76_F	201_L	2.184	0.86
190_S	504_D	2.160	0.85
236_F	323_L	2.108	0.83
26_S	109_F	2.094	0.83
48_Y	153_L	2.055	0.82
41_I	153_L	2.051	0.82
20_A	112_E	2.034	0.81
42_K	46_T	2.032	0.81
117_Y	120_R	2.028	0.81
407_Q	416_K	2.019	0.81
88_I	510_I	1.987	0.79
95_T	109_F	1.975	0.79
266_H	300_A	1.970	0.79
428_H	465_F	1.949	0.78
343_E	347_K	1.863	0.75
235_C	420_F	1.862	0.75
142_S	529_V	1.854	0.74
223_Y	298_Q	1.852	0.74
53_E	274_K	1.840	0.74
269_I	341_Y	1.835	0.74
177_D	426_L	1.834	0.74
328_E	332_R	1.826	0.73
98_I	105_K	1.809	0.72
520_K	524_K	1.803	0.72
107_I	117_Y	1.794	0.72
317_K	367_Q	1.779	0.71
238_I	258_S	1.755	0.70
90_H	175_N	1.734	0.69
469_L	510_I	1.720	0.69
262_T	288_Q	1.706	0.68
182_H	426_L	1.699	0.68
259_S	441_L	1.699	0.68
135_E	532_P	1.693	0.67
261_I	291_N	1.693	0.67
33_G	95_T	1.686	0.67
260_E	333_E	1.685	0.67
292_K	298_Q	1.674	0.66
451_K	544_Q	1.669	0.66
318_E	332_R	1.650	0.65
170_V	303_T	1.649	0.65
205_A	444_V	1.639	0.65
426_L	472_G	1.637	0.65
19_T	210_D	1.625	0.64
113_K	116_E	1.622	0.64
46_T	58_V	1.622	0.64
210_D	468_Y	1.605	0.63
207_I	513_I	1.604	0.63
266_H	468_Y	1.590	0.62
444_V	448_A	1.585	0.62
537_V	541_L	1.582	0.62
175_N	182_H	1.577	0.62
383_I	454_E	1.576	0.61
143_V	210_D	1.570	0.61
151_V	542_I	1.568	0.61
396_R	522_G	1.567	0.61
238_I	305_L	1.559	0.61
21_S	44_V	1.554	0.60
219_D	298_Q	1.552	0.60
185_I	210_D	1.551	0.60
259_S	296_N	1.549	0.60
72_N	210_D	1.543	0.60
242_E	298_Q	1.543	0.60
533_Y	537_V	1.526	0.59
142_S	195_L	1.520	0.59
38_A	93_L	1.517	0.58
131_A	170_V	1.501	0.58
93_L	149_I	1.497	0.57
173_M	296_N	1.489	0.57
223_Y	420_F	1.481	0.57
175_N	426_L	1.475	0.56
168_G	282_P	1.473	0.56
95_T	210_D	1.468	0.56
44_V	153_L	1.464	0.56
261_I	419_L	1.462	0.56
41_I	156_L	1.457	0.55
255_N	285_C	1.447	0.55
253_D	300_A	1.434	0.54
210_D	213_T	1.433	0.54
211_F	468_Y	1.431	0.54
155_N	546_T	1.427	0.54
424_P	427_P	1.421	0.53
298_Q	308_N	1.419	0.53
126_D	129_R	1.407	0.53
373_R	380_E	1.405	0.52
197_K	507_K	1.400	0.52
229_A	469_L	1.396	0.52
173_M	188_S	1.391	0.52
292_K	295_Y	1.384	0.51
225_Y	298_Q	1.382	0.51
147_S	529_V	1.379	0.51
170_V	542_I	1.377	0.51
79_G	168_G	1.370	0.51
302_S	404_E	1.364	0.50
248_T	281_L	1.355	0.50
261_I	277_G	1.355	0.50
125_Q	128_Q	1.353	0.50
147_S	153_L	1.343	0.49
61_Q	191_E	1.340	0.49
298_Q	420_F	1.337	0.49
193_N	507_K	1.327	0.48
41_I	245_V	1.327	0.48
177_D	517_V	1.320	0.48
120_R	128_Q	1.319	0.48
450_D	454_E	1.317	0.48
116_E	119_S	1.314	0.48
102_G	111_C	1.310	0.47
236_F	417_V	1.307	0.47
145_M	519_G	1.305	0.47
296_N	396_R	1.296	0.47
533_Y	538_L	1.295	0.47
158_H	543_Q	1.292	0.46
72_N	175_N	1.291	0.46
327_T	417_V	1.282	0.46
25_L	37_K	1.282	0.46
117_Y	194_R	1.268	0.45
125_Q	129_R	1.266	0.45
79_G	83_S	1.264	0.45
379_P	382_C	1.258	0.45
91_A	174_A	1.257	0.45
104_L	114_L	1.256	0.44
224_I	443_H	1.253	0.44
447_E	548_H	1.244	0.44
383_I	503_K	1.241	0.44
93_L	174_A	1.241	0.44
106_D	110_D	1.240	0.44
147_S	310_F	1.236	0.43
189_I	474_F	1.226	0.43
96_V	244_H	1.222	0.43
89_Y	123_F	1.219	0.43
42_K	58_V	1.219	0.43
107_I	116_E	1.219	0.43
26_S	461_V	1.211	0.42
26_S	98_I	1.207	0.42
177_D	182_H	1.203	0.42
177_D	472_G	1.201	0.42
290_D	295_Y	1.196	0.41
91_A	152_H	1.195	0.41
77_I	159_F	1.194	0.41
228_A	258_S	1.194	0.41
84_R	202_H	1.193	0.41
427_P	473_S	1.191	0.41
424_P	498_G	1.188	0.41
370_E	374_N	1.182	0.41
92_H	144_D	1.182	0.41
92_H	523_H	1.182	0.41
178_E	523_H	1.182	0.41
92_H	178_E	1.182	0.41
144_D	178_E	1.182	0.41
144_D	523_H	1.182	0.41
170_V	343_E	1.178	0.40
147_S	299_T	1.177	0.40
143_V	213_T	1.171	0.40
146_Q	498_G	1.169	0.40
205_A	441_L	1.168	0.40
170_V	500_I	1.168	0.40
308_N	535_F	1.168	0.40
399_C	493_G	1.165	0.40
57_H	78_K	1.163	0.40
16_E	505_I	1.156	0.39
37_K	149_I	1.155	0.39
116_E	129_R	1.154	0.39
140_R	473_S	1.153	0.39
15_V	88_I	1.152	0.39
45_I	156_L	1.152	0.39
171_L	201_L	1.147	0.39
21_S	40_F	1.147	0.39
210_D	266_H	1.146	0.39
107_I	118_F	1.146	0.39
233_L	469_L	1.140	0.38
210_D	253_D	1.138	0.38
274_K	279_L	1.138	0.38
54_N	443_H	1.135	0.38
54_N	224_I	1.134	0.38
524_K	541_L	1.133	0.38
424_P	474_F	1.130	0.38
384_E	546_T	1.124	0.38
181_Q	296_N	1.119	0.37
418_I	478_H	1.116	0.37
469_L	473_S	1.116	0.37
199_K	203_Y	1.109	0.37
242_E	396_R	1.106	0.37
196_K	203_Y	1.104	0.37
307_F	475_L	1.098	0.36
321_D	385_Q	1.086	0.36
175_N	210_D	1.082	0.36
49_P	366_E	1.080	0.35
38_A	60_E	1.078	0.35
41_I	276_E	1.073	0.35
473_S	528_R	1.072	0.35
446_K	450_D	1.067	0.35
279_L	348_R	1.064	0.35
69_K	318_E	1.058	0.34
118_F	123_F	1.056	0.34
255_N	298_Q	1.054	0.34
93_L	534_T	1.053	0.34
54_N	340_D	1.052	0.34
185_I	281_L	1.048	0.34
320_M	500_I	1.042	0.34
115_A	134_G	1.039	0.33
166_L	253_D	1.038	0.33
257_I	334_T	1.038	0.33
298_Q	518_Y	1.037	0.33
319_M	322_L	1.035	0.33
14_R	157_L	1.033	0.33
168_G	203_Y	1.031	0.33
271_L	326_V	1.030	0.33
62_A	71_K	1.027	0.33
365_L	546_T	1.025	0.33
208_N	246_G	1.022	0.33
167_P	329_E	1.018	0.32
126_D	195_L	1.011	0.32
120_R	279_L	1.008	0.32
129_R	367_Q	1.006	0.32
19_T	95_T	1.006	0.32
90_H	182_H	1.006	0.32
105_K	108_A	1.006	0.32
181_Q	529_V	1.003	0.32
146_Q	182_H	1.003	0.32
426_L	468_Y	1.001	0.32
231_K	519_G	0.996	0.31
182_H	469_L	0.993	0.31
242_E	522_G	0.990	0.31
123_F	131_A	0.988	0.31
228_A	316_A	0.984	0.31
253_D	468_Y	0.981	0.31
254_P	358_W	0.980	0.31
127_V	131_A	0.976	0.30
415_A	421_Y	0.975	0.30
99_E	500_I	0.974	0.30
544_Q	547_V	0.973	0.30
73_I	305_L	0.970	0.30
37_K	93_L	0.969	0.30
296_N	529_V	0.969	0.30
25_L	40_F	0.968	0.30
235_C	400_F	0.961	0.30
63_I	183_S	0.960	0.30
26_S	87_V	0.953	0.29
376_G	380_E	0.953	0.29
175_N	472_G	0.949	0.29
261_I	327_T	0.949	0.29
101_F	142_S	0.949	0.29
210_D	281_L	0.946	0.29
114_L	208_N	0.946	0.29
175_N	424_P	0.944	0.29
48_Y	63_I	0.944	0.29
281_L	468_Y	0.942	0.29
166_L	323_L	0.942	0.29
140_R	427_P	0.938	0.29
316_A	487_F	0.935	0.29
256_F	534_T	0.935	0.29
100_D	292_K	0.929	0.28
53_E	482_G	0.928	0.28
59_W	191_E	0.928	0.28
318_E	321_D	0.927	0.28
261_I	485_D	0.924	0.28
187_A	419_L	0.924	0.28
385_Q	482_G	0.923	0.28
504_D	507_K	0.923	0.28
19_T	142_S	0.923	0.28
529_V	540_L	0.922	0.28
29_N	95_T	0.922	0.28
265_L	307_F	0.922	0.28
104_L	108_A	0.921	0.28
273_E	312_Y	0.921	0.28
369_L	373_R	0.919	0.28
159_F	257_I	0.919	0.28
95_T	164_E	0.918	0.28
185_I	211_F	0.917	0.28
316_A	320_M	0.916	0.28
143_V	468_Y	0.916	0.28
185_I	233_L	0.914	0.28
269_I	272_A	0.913	0.28
94_D	230_G	0.912	0.28
94_D	527_E	0.912	0.28
230_G	527_E	0.912	0.28
94_D	179_E	0.912	0.28
179_E	230_G	0.912	0.28
179_E	527_E	0.912	0.28
286_L	290_D	0.910	0.28
237_Y	403_I	0.910	0.28
54_N	373_R	0.903	0.27
46_T	53_E	0.902	0.27
124_D	291_N	0.899	0.27
423_P	472_G	0.898	0.27
87_V	205_A	0.896	0.27
159_F	529_V	0.895	0.27
236_F	484_I	0.893	0.27
29_N	533_Y	0.892	0.27
89_Y	149_I	0.887	0.27
34_E	519_G	0.883	0.26
382_C	385_Q	0.880	0.26
236_F	327_T	0.877	0.26
215_L	463_K	0.875	0.26
177_D	514_N	0.875	0.26
236_F	258_S	0.874	0.26
107_I	110_D	0.871	0.26
140_R	528_R	0.870	0.26
37_K	73_I	0.868	0.26
244_H	523_H	0.866	0.26
92_H	244_H	0.866	0.26
144_D	244_H	0.866	0.26
178_E	244_H	0.866	0.26
453_A	459_T	0.865	0.26
197_K	321_D	0.864	0.26
503_K	507_K	0.861	0.25
34_E	240_G	0.859	0.25
184_G	240_G	0.858	0.25
200_Q	359_G	0.854	0.25
99_E	315_T	0.853	0.25
210_D	312_Y	0.851	0.25
186_L	426_L	0.851	0.25
177_D	183_S	0.850	0.25
149_I	172_F	0.849	0.25
13_E	489_R	0.845	0.25
85_N	391_E	0.845	0.25
87_V	320_M	0.843	0.25
185_I	426_L	0.841	0.25
424_P	473_S	0.837	0.25
167_P	252_I	0.837	0.25
368_Y	372_L	0.836	0.24
127_V	130_D	0.836	0.24
227_G	295_Y	0.832	0.24
336_Q	340_D	0.831	0.24
147_S	175_N	0.831	0.24
150_A	195_L	0.831	0.24
261_I	345_Y	0.831	0.24
41_I	522_G	0.831	0.24
435_S	438_D	0.826	0.24
45_I	153_L	0.826	0.24
223_Y	242_E	0.825	0.24
25_L	88_I	0.822	0.24
135_E	507_K	0.821	0.24
116_E	125_Q	0.819	0.24
18_L	406_L	0.817	0.24
242_E	245_V	0.816	0.24
428_H	501_P	0.813	0.24
253_D	266_H	0.811	0.23
318_E	344_E	0.809	0.23
225_Y	308_N	0.809	0.23
79_G	515_M	0.808	0.23
532_P	549_L	0.807	0.23
149_I	514_N	0.804	0.23
38_A	91_A	0.802	0.23
273_E	279_L	0.802	0.23
219_D	396_R	0.801	0.23
178_E	516_G	0.801	0.23
144_D	516_G	0.801	0.23
516_G	523_H	0.801	0.23
92_H	516_G	0.801	0.23
335_E	359_G	0.799	0.23
213_T	521_D	0.798	0.23
14_R	17_A	0.798	0.23
207_I	532_P	0.796	0.23
238_I	257_I	0.796	0.23
150_A	250_A	0.794	0.23
188_S	534_T	0.792	0.23
118_F	131_A	0.792	0.23
197_K	270_H	0.790	0.23
213_T	517_V	0.789	0.23
185_I	524_K	0.786	0.23
327_T	513_I	0.781	0.22
148_G	516_G	0.778	0.22
397_M	401_Q	0.778	0.22
149_I	174_A	0.776	0.22
91_A	146_Q	0.775	0.22
22_L	251_G	0.771	0.22
21_S	101_F	0.770	0.22
186_L	302_S	0.769	0.22
109_F	126_D	0.767	0.22
53_E	377_I	0.765	0.22
295_Y	471_D	0.764	0.22
175_N	296_N	0.763	0.22
305_L	463_K	0.758	0.22
240_G	516_G	0.757	0.21
41_I	180_S	0.757	0.21
401_Q	443_H	0.756	0.21
61_Q	74_F	0.756	0.21
37_K	491_F	0.755	0.21
59_W	74_F	0.754	0.21
429_N	517_V	0.754	0.21
57_H	200_Q	0.753	0.21
46_T	125_Q	0.747	0.21
211_F	253_D	0.747	0.21
276_E	482_G	0.747	0.21
273_E	428_H	0.746	0.21
426_L	474_F	0.744	0.21
261_I	307_F	0.743	0.21
232_L	316_A	0.742	0.21
161_E	406_L	0.742	0.21
172_F	226_T	0.741	0.21
52_Q	153_L	0.740	0.21
140_R	182_H	0.740	0.21
237_Y	465_F	0.740	0.21
227_G	244_H	0.739	0.21
119_S	132_K	0.739	0.21
26_S	65_N	0.737	0.21
126_D	326_V	0.736	0.21
295_Y	519_G	0.733	0.21
87_V	444_V	0.733	0.21
107_I	365_L	0.733	0.21
424_P	520_K	0.732	0.21
105_K	401_Q	0.731	0.21
426_L	469_L	0.731	0.21
65_N	332_R	0.731	0.21
374_N	482_G	0.726	0.20
96_V	178_E	0.725	0.20
92_H	96_V	0.725	0.20
96_V	144_D	0.725	0.20
96_V	523_H	0.725	0.20
52_Q	443_H	0.724	0.20
182_H	429_N	0.724	0.20
477_L	484_I	0.723	0.20
255_N	267_N	0.722	0.20
295_Y	308_N	0.720	0.20
205_A	474_F	0.720	0.20
370_E	544_Q	0.717	0.20
29_N	175_N	0.717	0.20
236_F	396_R	0.716	0.20
418_I	546_T	0.716	0.20
511_P	519_G	0.713	0.20
47_S	53_E	0.712	0.20
321_D	447_E	0.712	0.20
423_P	474_F	0.711	0.20
87_V	476_S	0.711	0.20
261_I	500_I	0.710	0.20
396_R	518_Y	0.709	0.20
49_P	193_N	0.708	0.20
29_N	186_L	0.708	0.20
34_E	295_Y	0.707	0.20
342_Y	346_V	0.706	0.20
91_A	172_F	0.704	0.20
466_F	473_S	0.704	0.20
132_K	273_E	0.703	0.20
161_E	348_R	0.702	0.20
371_K	412_D	0.702	0.20
292_K	425_Y	0.701	0.20
13_E	135_E	0.701	0.20
236_F	245_V	0.701	0.20
299_T	307_F	0.700	0.19
96_V	184_G	0.699	0.19
315_T	458_E	0.696	0.19
259_S	262_T	0.696	0.19
180_S	213_T	0.695	0.19
13_E	53_E	0.694	0.19
124_D	249_L	0.693	0.19
177_D	185_I	0.693	0.19
200_Q	417_V	0.692	0.19
24_S	254_P	0.692	0.19
33_G	475_L	0.691	0.19
173_M	505_I	0.691	0.19
52_Q	129_R	0.691	0.19
325_E	454_E	0.689	0.19
60_E	270_H	0.689	0.19
325_E	359_G	0.688	0.19
199_K	391_E	0.687	0.19
185_I	234_P	0.687	0.19
211_F	266_H	0.686	0.19
295_Y	473_S	0.686	0.19
19_T	533_Y	0.686	0.19
182_H	228_A	0.685	0.19
217_D	247_D	0.684	0.19
505_I	508_L	0.684	0.19
125_Q	261_I	0.683	0.19
231_K	471_D	0.680	0.19
56_S	318_E	0.679	0.19
36_T	113_K	0.678	0.19
393_L	401_Q	0.678	0.19
197_K	325_E	0.678	0.19
144_D	527_E	0.677	0.19
178_E	230_G	0.677	0.19
144_D	230_G	0.677	0.19
144_D	179_E	0.677	0.19
523_H	527_E	0.677	0.19
92_H	179_E	0.677	0.19
230_G	523_H	0.677	0.19
92_H	230_G	0.677	0.19
178_E	527_E	0.677	0.19
179_E	523_H	0.677	0.19
94_D	523_H	0.677	0.19
94_D	178_E	0.677	0.19
94_D	144_D	0.677	0.19
92_H	527_E	0.677	0.19
143_V	211_F	0.677	0.19
53_E	344_E	0.677	0.19
377_I	381_Q	0.676	0.19
184_G	244_H	0.675	0.19
223_Y	492_P	0.670	0.18
153_L	336_Q	0.670	0.18
90_H	429_N	0.669	0.18
23_V	27_S	0.669	0.18
258_S	394_E	0.668	0.18
52_Q	195_L	0.668	0.18
32_V	200_Q	0.667	0.18
19_T	150_A	0.667	0.18
242_E	308_N	0.666	0.18
43_E	103_P	0.666	0.18
91_A	438_D	0.665	0.18
258_S	303_T	0.665	0.18
134_G	513_I	0.664	0.18
518_Y	533_Y	0.664	0.18
91_A	239_Y	0.663	0.18
38_A	73_I	0.663	0.18
79_G	91_A	0.663	0.18
51_F	195_L	0.662	0.18
95_T	407_Q	0.662	0.18
34_E	145_M	0.660	0.18
224_I	408_K	0.660	0.18
91_A	331_C	0.659	0.18
295_Y	427_P	0.657	0.18
185_I	296_N	0.656	0.18
128_Q	313_E	0.655	0.18
98_I	505_I	0.655	0.18
417_V	531_K	0.654	0.18
43_E	343_E	0.654	0.18
113_K	125_Q	0.651	0.18
273_E	335_E	0.651	0.18
152_H	310_F	0.651	0.18
146_Q	231_K	0.650	0.18
272_A	345_Y	0.650	0.18
381_Q	385_Q	0.650	0.18
56_S	321_D	0.650	0.18
231_K	295_Y	0.650	0.18
196_K	505_I	0.647	0.18
468_Y	476_S	0.646	0.18
321_D	503_K	0.646	0.18
52_Q	122_E	0.645	0.18
88_I	116_E	0.644	0.18
261_I	305_L	0.644	0.18
96_V	227_G	0.643	0.18
219_D	522_G	0.643	0.18
107_I	111_C	0.642	0.18
79_G	217_D	0.640	0.18
24_S	334_T	0.640	0.18
34_E	251_G	0.640	0.18
419_L	439_Q	0.639	0.17
425_Y	469_L	0.639	0.17
53_E	374_N	0.639	0.17
147_S	534_T	0.638	0.17
56_S	350_N	0.638	0.17
162_N	166_L	0.638	0.17
39_D	42_K	0.635	0.17
79_G	260_E	0.635	0.17
196_K	199_K	0.635	0.17
309_C	418_I	0.633	0.17
182_H	517_V	0.631	0.17
21_S	375_R	0.630	0.17
427_P	466_F	0.629	0.17
72_N	299_T	0.629	0.17
145_M	473_S	0.628	0.17
29_N	142_S	0.627	0.17
34_E	516_G	0.626	0.17
128_Q	321_D	0.624	0.17
223_Y	396_R	0.623	0.17
211_F	312_Y	0.623	0.17
368_Y	468_Y	0.623	0.17
296_N	426_L	0.623	0.17
77_I	168_G	0.622	0.17
254_P	404_E	0.622	0.17
235_C	541_L	0.622	0.17
135_E	534_T	0.622	0.17
196_K	524_K	0.621	0.17
388_K	485_D	0.621	0.17
398_R	402_A	0.621	0.17
485_D	507_K	0.620	0.17
172_F	229_A	0.618	0.17
106_D	156_L	0.618	0.17
311_I	534_T	0.615	0.17
498_G	501_P	0.615	0.17
337_K	341_Y	0.615	0.17
13_E	450_D	0.614	0.17
45_I	58_V	0.614	0.17
482_G	485_D	0.614	0.17
277_G	375_R	0.614	0.17
454_E	485_D	0.611	0.17
126_D	156_L	0.610	0.17
141_G	251_G	0.610	0.17
87_V	263_S	0.610	0.17
90_H	172_F	0.609	0.17
54_N	190_S	0.608	0.17
41_I	449_A	0.607	0.17
219_D	225_Y	0.607	0.17
441_L	547_V	0.606	0.16
101_F	535_F	0.606	0.16
276_E	499_T	0.605	0.16
43_E	56_S	0.605	0.16
95_T	299_T	0.603	0.16
247_D	250_A	0.603	0.16
73_I	522_G	0.602	0.16
91_A	213_T	0.602	0.16
196_K	374_N	0.602	0.16
458_E	508_L	0.601	0.16
45_I	317_K	0.601	0.16
368_Y	426_L	0.601	0.16
86_T	201_L	0.599	0.16
253_D	284_S	0.599	0.16
410_D	472_G	0.597	0.16
251_G	427_P	0.597	0.16
285_C	307_F	0.597	0.16
197_K	485_D	0.596	0.16
132_K	259_S	0.596	0.16
125_Q	132_K	0.593	0.16
120_R	195_L	0.592	0.16
119_S	125_Q	0.592	0.16
55_P	274_K	0.591	0.16
397_M	441_L	0.589	0.16
444_V	549_L	0.587	0.16
42_K	60_E	0.587	0.16
214_P	396_R	0.587	0.16
46_T	381_Q	0.586	0.16
234_P	526_T	0.586	0.16
296_N	472_G	0.586	0.16
273_E	487_F	0.585	0.16
117_Y	273_E	0.585	0.16
311_I	428_H	0.585	0.16
420_F	518_Y	0.583	0.16
183_S	186_L	0.583	0.16
175_N	180_S	0.582	0.16
266_H	426_L	0.582	0.16
57_H	541_L	0.581	0.16
325_E	440_L	0.581	0.16
216_Y	219_D	0.580	0.16
87_V	549_L	0.579	0.16
172_F	209_T	0.579	0.16
159_F	213_T	0.578	0.16
132_K	135_E	0.578	0.16
52_Q	120_R	0.577	0.16
129_R	503_K	0.575	0.16
233_L	467_P	0.574	0.16
111_C	341_Y	0.574	0.16
52_Q	56_S	0.571	0.15
372_L	410_D	0.570	0.15
162_N	165_T	0.570	0.15
175_N	423_P	0.570	0.15
145_M	295_Y	0.570	0.15
296_N	493_G	0.569	0.15
34_E	231_K	0.569	0.15
53_E	197_K	0.569	0.15
91_A	410_D	0.568	0.15
175_N	185_I	0.568	0.15
180_S	502_F	0.566	0.15
266_H	281_L	0.564	0.15
325_E	328_E	0.564	0.15
186_L	469_L	0.564	0.15
56_S	328_E	0.564	0.15
209_T	517_V	0.564	0.15
235_C	529_V	0.563	0.15
146_Q	511_P	0.563	0.15
41_I	60_E	0.563	0.15
26_S	41_I	0.562	0.15
204_L	343_E	0.562	0.15
468_Y	517_V	0.560	0.15
208_N	535_F	0.559	0.15
135_E	325_E	0.558	0.15
47_S	62_A	0.558	0.15
148_G	541_L	0.557	0.15
280_V	312_Y	0.557	0.15
213_T	468_Y	0.557	0.15
20_A	40_F	0.555	0.15
329_E	381_Q	0.554	0.15
41_I	181_Q	0.554	0.15
43_E	549_L	0.553	0.15
328_E	459_T	0.552	0.15
474_F	522_G	0.552	0.15
446_K	483_E	0.550	0.15
52_Q	454_E	0.550	0.15
238_I	518_Y	0.549	0.15
52_Q	385_Q	0.548	0.15
381_Q	504_D	0.547	0.15
149_I	334_T	0.547	0.15
273_E	311_I	0.547	0.15
149_I	487_F	0.547	0.15
168_G	249_L	0.546	0.15
93_L	159_F	0.545	0.15
129_R	457_G	0.545	0.15
331_C	372_L	0.545	0.15
55_P	275_V	0.545	0.15
422_A	474_F	0.542	0.15
327_T	330_A	0.541	0.15
227_G	519_G	0.539	0.15
312_Y	465_F	0.539	0.15
315_T	403_I	0.539	0.15
202_H	495_N	0.538	0.15
413_Q	418_I	0.538	0.15
143_V	159_F	0.537	0.15
477_L	505_I	0.536	0.15
224_I	326_V	0.535	0.14
243_V	299_T	0.534	0.14
21_S	25_L	0.534	0.14
249_L	267_N	0.534	0.14
485_D	489_R	0.534	0.14
273_E	287_Y	0.533	0.14
23_V	142_S	0.532	0.14
131_A	155_N	0.532	0.14
526_T	535_F	0.531	0.14
187_A	217_D	0.530	0.14
140_R	145_M	0.529	0.14
259_S	477_L	0.528	0.14
69_K	197_K	0.527	0.14
138_F	526_T	0.527	0.14
102_G	172_F	0.527	0.14
294_S	524_K	0.527	0.14
17_A	540_L	0.527	0.14
208_N	475_L	0.526	0.14
22_L	293_E	0.526	0.14
90_H	472_G	0.526	0.14
15_V	296_N	0.526	0.14
87_V	388_K	0.524	0.14
168_G	323_L	0.522	0.14
197_K	317_K	0.521	0.14
365_L	450_D	0.520	0.14
153_L	475_L	0.520	0.14
341_Y	345_Y	0.519	0.14
428_H	470_A	0.519	0.14
125_Q	389_A	0.518	0.14
185_I	472_G	0.518	0.14
122_E	198_E	0.518	0.14
225_Y	245_V	0.517	0.14
72_N	181_Q	0.514	0.14
104_L	269_I	0.514	0.14
155_N	229_A	0.514	0.14
140_R	511_P	0.514	0.14
17_A	52_Q	0.512	0.14
311_I	404_E	0.512	0.14
16_E	95_T	0.511	0.14
398_R	422_A	0.510	0.14
324_I	328_E	0.509	0.14
118_F	310_F	0.509	0.14
150_A	154_A	0.509	0.14
253_D	293_E	0.508	0.14
320_M	421_Y	0.508	0.14
234_P	521_D	0.508	0.14
255_N	292_K	0.507	0.14
253_D	267_N	0.507	0.14
227_G	475_L	0.506	0.14
144_D	227_G	0.506	0.14
92_H	227_G	0.506	0.14
178_E	227_G	0.506	0.14
227_G	523_H	0.506	0.14
371_K	374_N	0.505	0.14
122_E	125_Q	0.504	0.14
74_F	173_M	0.504	0.14
32_V	387_F	0.504	0.14
95_T	298_Q	0.503	0.14
70_R	292_K	0.503	0.14
404_E	441_L	0.503	0.14
73_I	531_K	0.503	0.14
58_V	319_M	0.503	0.14
219_D	518_Y	0.503	0.14
227_G	528_R	0.502	0.14
321_D	446_K	0.502	0.14
247_D	505_I	0.501	0.14
474_F	501_P	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qyvA	2	0.765	100	0.74	Contact Map
3mruA	1	0.8057	100	0.753	Contact Map
3pfoA	2	0.7014	100	0.759	Contact Map
3iszA	2	0.6484	100	0.763	Contact Map
4pqaA	2	0.6555	100	0.767	Contact Map
3ifeA	2	0.6873	100	0.772	Contact Map
3rzaA	2	0.6396	100	0.774	Contact Map
3gb0A	2	0.6449	100	0.778	Contact Map
2f7vA	2	0.6201	100	0.78	Contact Map
1cg2A	4	0.6714	100	0.78	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.