PRKA - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PRKA - Protein PrkA

UniProt:	P39134	Sequences: MDILKKIEKYREEEQRLKWEGTFADYLEIIKENPMVAQSAHSRVFNMIKDSGIEEIDGRKKYSFFDRELFGLEESLERLVEEYFHPAAKRLDVRKRILLLMGPVSGGKSTLVTMLKKGLEAYTLTDNGAVYAIKGCPMHEDPLHLIPHHLRDDFYREYGIRIEGSLSPLNVMRLEEEYGGRIEDVKVERIFFSEDKRTGIGTFSPSDPKSQDIADLTGSIDFSTIAEYGSESDPRAYRFDGELNKANRGMMEFQEMLKCDEKFLWHLLSLTQEGNFKAGRFALISADELIVAHTNETEYRSFISNKKNEALHSRIIVMPVPYNLKVSEEERIYEKMIAESDVADVHIAPHTLKVAAMFSILTRLKEPKRSDIDLVKKMRLYDGESVEGYNSVDVEDMKKEYNDEGMSGIDPRYVINRISSTIIRKNMESINSLDVLRSLKEGLDQHPSISSEDRERYLNFISAARKEYDDIAKKEVQKAFVYSYEESAKTLMDNYLDNVEAYCNKNKLRDPLTGEEMNPDEKLMRSIEEQIGISENAKKAFREEILIRISAYARKGKRFDYNSHERLREAIQKKLFADLKDVVKITTSTKTPDEQQLKKVNEVVARLIDEHGYNSTSANELLKYVGSLLNR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	631 (605)
Sequences:	488 (169)
Seq/√Len:	6.9

ECOLI - YEAG
BACSU - PRKA
HALSA - Q9HRD4 Q9HRD5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
614_N	617_S	9.633	1.00
429_S	617_S	8.955	1.00
327_S	382_D	7.679	1.00
429_S	614_N	7.476	1.00
167_S	170_N	6.296	1.00
29_I	36_V	5.948	1.00
44_V	84_F	5.217	0.99
313_S	410_D	5.078	0.99
111_L	362_T	4.700	0.98
147_P	151_R	4.659	0.98
38_Q	46_N	4.626	0.98
62_Y	67_R	3.652	0.93
61_K	67_R	3.593	0.92
20_E	134_K	3.509	0.91
325_K	328_E	3.409	0.90
167_S	429_S	3.288	0.88
276_F	410_D	3.094	0.85
381_Y	404_E	3.076	0.84
64_F	67_R	3.069	0.84
130_V	192_F	3.066	0.84
362_T	623_K	2.827	0.79
173_R	177_E	2.812	0.78
63_S	67_R	2.792	0.78
165_S	250_M	2.693	0.75
61_K	64_F	2.677	0.75
181_R	184_D	2.672	0.75
167_S	614_N	2.658	0.74
383_G	388_G	2.613	0.73
132_A	135_G	2.588	0.72
167_S	617_S	2.575	0.72
62_Y	80_V	2.530	0.70
136_C	167_S	2.472	0.68
346_H	614_N	2.468	0.68
48_I	80_V	2.381	0.65
276_F	313_S	2.276	0.62
136_C	170_N	2.265	0.61
105_S	410_D	2.228	0.60
503_C	524_M	2.167	0.58
387_E	607_L	2.151	0.57
151_R	155_Y	2.143	0.57
121_A	365_K	2.125	0.56
67_R	353_K	2.125	0.56
216_L	479_A	2.118	0.56
360_I	460_F	2.109	0.56
388_G	567_L	2.068	0.54
105_S	351_T	2.030	0.53
362_T	417_R	2.029	0.52
326_V	382_D	2.019	0.52
321_P	333_Y	2.015	0.52
499_V	618_A	2.012	0.52
133_I	185_V	2.002	0.51
149_H	605_A	1.935	0.49
528_E	542_R	1.906	0.48
152_D	155_Y	1.894	0.47
269_S	410_D	1.876	0.47
137_P	264_L	1.858	0.46
255_E	310_A	1.831	0.45
254_Q	313_S	1.828	0.45
147_P	150_L	1.802	0.44
218_G	255_E	1.776	0.43
549_I	553_A	1.766	0.43
360_I	612_G	1.764	0.42
510_D	514_G	1.751	0.42
8_E	12_E	1.734	0.41
476_V	625_V	1.731	0.41
28_E	32_E	1.728	0.41
593_D	596_Q	1.718	0.41
140_E	170_N	1.717	0.41
418_I	435_V	1.715	0.41
25_D	356_A	1.715	0.41
497_D	501_A	1.709	0.40
175_E	196_K	1.705	0.40
356_A	361_L	1.705	0.40
375_V	378_M	1.702	0.40
61_K	66_D	1.694	0.40
400_E	611_H	1.678	0.39
35_M	46_N	1.674	0.39
90_R	161_R	1.670	0.39
318_M	388_G	1.659	0.39
11_R	15_Q	1.643	0.38
413_Y	442_G	1.638	0.38
54_E	63_S	1.622	0.37
8_E	518_N	1.618	0.37
132_A	188_E	1.616	0.37
318_M	410_D	1.610	0.37
383_G	389_Y	1.600	0.37
296_E	510_D	1.596	0.36
58_G	62_Y	1.579	0.36
139_H	277_K	1.576	0.36
216_L	273_E	1.575	0.36
318_M	486_E	1.575	0.36
254_Q	410_D	1.574	0.36
365_K	407_S	1.574	0.36
25_D	557_K	1.569	0.35
362_T	610_E	1.560	0.35
201_G	234_P	1.545	0.35
360_I	380_L	1.542	0.34
290_I	384_E	1.541	0.34
322_Y	329_E	1.537	0.34
170_N	429_S	1.534	0.34
491_L	622_L	1.521	0.34
313_S	351_T	1.500	0.33
245_K	289_L	1.500	0.33
28_E	334_E	1.498	0.33
161_R	392_V	1.481	0.32
105_S	313_S	1.479	0.32
121_A	557_K	1.477	0.32
22_T	496_L	1.473	0.32
102_G	108_K	1.470	0.32
68_E	132_A	1.469	0.32
128_G	151_R	1.455	0.32
351_T	505_K	1.453	0.31
292_A	484_Y	1.451	0.31
90_R	459_N	1.450	0.31
156_R	362_T	1.448	0.31
329_E	363_R	1.418	0.30
194_E	281_F	1.417	0.30
12_E	605_A	1.412	0.30
62_Y	66_D	1.412	0.30
256_M	326_V	1.406	0.30
360_I	558_R	1.403	0.30
207_D	273_E	1.400	0.30
289_L	359_S	1.399	0.30
160_I	170_N	1.391	0.29
121_A	605_A	1.386	0.29
205_P	333_Y	1.386	0.29
357_M	378_M	1.382	0.29
9_K	13_E	1.379	0.29
152_D	461_I	1.378	0.29
234_P	310_A	1.365	0.29
92_D	283_L	1.359	0.28
137_P	541_F	1.357	0.28
264_L	310_A	1.353	0.28
119_L	200_I	1.351	0.28
409_I	517_M	1.351	0.28
141_D	160_I	1.349	0.28
168_P	264_L	1.347	0.28
170_N	614_N	1.345	0.28
46_N	362_T	1.344	0.28
430_I	457_Y	1.332	0.28
58_G	402_N	1.328	0.28
420_S	461_I	1.320	0.27
9_K	12_E	1.318	0.27
330_E	334_E	1.318	0.27
205_P	321_P	1.312	0.27
48_I	62_Y	1.311	0.27
515_E	590_K	1.308	0.27
19_W	157_E	1.303	0.27
242_E	461_I	1.282	0.26
377_K	404_E	1.282	0.26
58_G	394_V	1.275	0.26
27_L	292_A	1.274	0.26
11_R	409_I	1.273	0.26
362_T	457_Y	1.272	0.26
256_M	477_Q	1.268	0.26
379_R	384_E	1.261	0.26
150_L	155_Y	1.259	0.25
250_M	352_L	1.259	0.25
62_Y	364_L	1.250	0.25
365_K	403_D	1.244	0.25
99_L	257_L	1.242	0.25
244_N	478_K	1.240	0.25
441_E	607_L	1.236	0.25
247_N	287_D	1.235	0.25
409_I	501_A	1.235	0.25
67_R	289_L	1.232	0.25
264_L	541_F	1.228	0.25
280_R	317_V	1.226	0.25
350_H	353_K	1.223	0.24
380_L	517_M	1.220	0.24
128_G	277_K	1.219	0.24
550_S	553_A	1.217	0.24
141_D	617_S	1.216	0.24
532_G	617_S	1.211	0.24
532_G	614_N	1.210	0.24
81_E	121_A	1.209	0.24
334_E	560_D	1.209	0.24
147_P	152_D	1.203	0.24
269_S	313_S	1.200	0.24
274_G	359_S	1.190	0.24
597_L	601_N	1.187	0.23
85_H	179_G	1.184	0.23
248_R	287_D	1.182	0.23
396_D	607_L	1.180	0.23
508_L	607_L	1.180	0.23
225_I	239_F	1.176	0.23
205_P	412_R	1.176	0.23
201_G	380_L	1.168	0.23
545_I	597_L	1.165	0.23
63_S	66_D	1.162	0.23
90_R	475_E	1.157	0.23
115_L	118_G	1.156	0.23
207_D	216_L	1.156	0.23
523_L	584_K	1.154	0.23
558_R	605_A	1.152	0.23
594_E	598_K	1.143	0.22
405_G	495_Y	1.143	0.22
314_R	405_G	1.143	0.22
142_P	405_G	1.143	0.22
295_N	405_G	1.143	0.22
349_P	405_G	1.143	0.22
204_S	311_L	1.123	0.22
295_N	495_Y	1.123	0.22
142_P	295_N	1.123	0.22
349_P	495_Y	1.123	0.22
295_N	314_R	1.123	0.22
142_P	495_Y	1.123	0.22
295_N	349_P	1.123	0.22
314_R	495_Y	1.123	0.22
314_R	349_P	1.123	0.22
142_P	314_R	1.123	0.22
142_P	349_P	1.123	0.22
8_E	156_R	1.119	0.22
211_Q	264_L	1.119	0.22
151_R	199_G	1.118	0.22
16_R	560_D	1.116	0.22
257_L	411_P	1.115	0.22
16_R	28_E	1.109	0.21
390_N	438_S	1.108	0.21
212_D	309_E	1.106	0.21
222_F	313_S	1.106	0.21
299_Y	303_I	1.101	0.21
289_L	292_A	1.100	0.21
141_D	614_N	1.098	0.21
501_A	574_K	1.096	0.21
140_E	617_S	1.094	0.21
24_A	615_S	1.094	0.21
232_S	277_K	1.090	0.21
616_T	620_E	1.086	0.21
165_S	341_D	1.084	0.21
303_I	311_L	1.082	0.21
104_V	211_Q	1.082	0.21
381_Y	544_E	1.082	0.21
61_K	73_E	1.081	0.21
154_F	339_E	1.081	0.21
173_R	179_G	1.080	0.21
351_T	410_D	1.079	0.21
103_P	108_K	1.078	0.21
120_E	193_S	1.077	0.21
510_D	515_E	1.072	0.20
14_E	362_T	1.071	0.20
105_S	269_S	1.061	0.20
163_E	166_L	1.060	0.20
66_D	152_D	1.060	0.20
431_N	504_N	1.058	0.20
48_I	396_D	1.054	0.20
12_E	250_M	1.052	0.20
140_E	144_H	1.047	0.20
459_N	463_A	1.047	0.20
274_G	544_E	1.045	0.20
431_N	574_K	1.045	0.20
202_T	411_P	1.045	0.20
145_L	185_V	1.043	0.20
292_A	337_I	1.043	0.20
20_E	25_D	1.041	0.20
254_Q	269_S	1.040	0.20
18_K	391_S	1.040	0.20
364_L	541_F	1.039	0.20
92_D	133_I	1.039	0.20
139_H	245_K	1.039	0.20
149_H	360_I	1.037	0.20
431_N	486_E	1.036	0.20
239_F	420_S	1.035	0.20
70_F	521_E	1.032	0.19
96_R	128_G	1.032	0.19
160_I	389_Y	1.031	0.19
393_D	593_D	1.031	0.19
31_K	154_F	1.030	0.19
382_D	568_R	1.029	0.19
508_L	539_K	1.026	0.19
189_R	281_F	1.025	0.19
210_S	243_L	1.025	0.19
19_W	263_F	1.024	0.19
41_H	231_E	1.023	0.19
234_P	255_E	1.023	0.19
170_N	617_S	1.023	0.19
252_E	293_H	1.021	0.19
166_L	362_T	1.020	0.19
237_Y	378_M	1.016	0.19
13_E	18_K	1.014	0.19
222_F	410_D	1.014	0.19
347_I	565_E	1.010	0.19
141_D	429_S	1.007	0.19
387_E	390_N	1.007	0.19
362_T	514_G	1.007	0.19
367_P	547_I	1.004	0.19
207_D	264_L	1.002	0.19
208_P	386_V	1.002	0.19
459_N	601_N	1.000	0.19
431_N	616_T	0.991	0.19
267_L	356_A	0.990	0.19
46_N	353_K	0.990	0.19
13_E	16_R	0.990	0.19
147_P	155_Y	0.989	0.18
520_D	525_R	0.988	0.18
12_E	148_H	0.983	0.18
193_S	439_L	0.983	0.18
59_R	63_S	0.982	0.18
390_N	532_G	0.980	0.18
58_G	61_K	0.971	0.18
94_R	246_A	0.971	0.18
401_Y	425_K	0.965	0.18
236_A	267_L	0.965	0.18
278_A	292_A	0.964	0.18
140_E	205_P	0.962	0.18
136_C	144_H	0.960	0.18
221_D	302_F	0.960	0.18
524_M	552_Y	0.958	0.18
71_G	102_G	0.958	0.18
282_A	400_E	0.957	0.18
427_M	557_K	0.954	0.18
276_F	359_S	0.950	0.18
69_L	86_P	0.949	0.18
87_A	104_V	0.949	0.18
475_E	523_L	0.948	0.18
180_G	302_F	0.946	0.18
254_Q	276_F	0.946	0.18
481_V	624_Y	0.946	0.18
198_T	246_A	0.946	0.18
161_R	341_D	0.946	0.18
16_R	25_D	0.944	0.17
362_T	430_I	0.943	0.17
388_G	485_E	0.943	0.17
39_S	42_S	0.942	0.17
263_F	277_K	0.942	0.17
32_E	455_E	0.938	0.17
267_L	311_L	0.937	0.17
430_I	475_E	0.936	0.17
267_L	329_E	0.936	0.17
205_P	332_I	0.936	0.17
34_P	157_E	0.935	0.17
607_L	618_A	0.933	0.17
252_E	296_E	0.932	0.17
57_D	341_D	0.931	0.17
576_F	600_V	0.930	0.17
218_G	310_A	0.929	0.17
12_E	149_H	0.928	0.17
28_E	156_R	0.927	0.17
189_R	263_F	0.927	0.17
330_E	594_E	0.927	0.17
34_P	128_G	0.925	0.17
105_S	357_M	0.924	0.17
262_K	434_D	0.924	0.17
225_I	390_N	0.919	0.17
441_E	514_G	0.913	0.17
109_S	377_K	0.912	0.17
96_R	209_K	0.910	0.17
257_L	294_T	0.907	0.17
22_T	558_R	0.906	0.17
87_A	298_E	0.905	0.17
79_L	338_A	0.904	0.17
116_K	293_H	0.903	0.17
315_I	484_Y	0.902	0.17
42_S	435_V	0.899	0.17
173_R	185_V	0.896	0.16
579_L	596_Q	0.896	0.16
285_S	418_I	0.894	0.16
606_R	610_E	0.893	0.16
168_P	255_E	0.893	0.16
325_K	452_E	0.893	0.16
88_A	234_P	0.891	0.16
48_I	607_L	0.890	0.16
186_K	457_Y	0.889	0.16
21_G	163_E	0.888	0.16
75_S	509_R	0.887	0.16
318_M	590_K	0.886	0.16
483_S	606_R	0.884	0.16
473_K	625_V	0.883	0.16
108_K	405_G	0.883	0.16
280_R	593_D	0.882	0.16
102_G	363_R	0.879	0.16
331_R	598_K	0.878	0.16
120_E	410_D	0.878	0.16
209_K	299_Y	0.877	0.16
33_N	148_H	0.874	0.16
274_G	557_K	0.873	0.16
168_P	309_E	0.871	0.16
571_I	621_L	0.870	0.16
98_L	320_V	0.869	0.16
374_L	589_T	0.868	0.16
362_T	501_A	0.865	0.16
108_K	495_Y	0.865	0.16
108_K	295_N	0.865	0.16
108_K	142_P	0.865	0.16
108_K	314_R	0.865	0.16
108_K	349_P	0.865	0.16
327_S	461_I	0.864	0.16
12_E	459_N	0.861	0.16
247_N	322_Y	0.861	0.16
255_E	272_Q	0.860	0.16
404_E	544_E	0.857	0.16
488_A	571_I	0.855	0.16
413_Y	543_E	0.854	0.16
299_Y	307_K	0.854	0.16
117_K	334_E	0.849	0.15
351_T	354_V	0.849	0.15
351_T	432_S	0.842	0.15
26_Y	75_S	0.839	0.15
252_E	333_Y	0.838	0.15
168_P	310_A	0.838	0.15
97_I	290_I	0.835	0.15
32_E	334_E	0.835	0.15
59_R	320_V	0.832	0.15
166_L	287_D	0.832	0.15
18_K	565_E	0.831	0.15
424_R	511_P	0.829	0.15
578_D	596_Q	0.825	0.15
350_H	478_K	0.825	0.15
256_M	262_K	0.825	0.15
271_T	418_I	0.824	0.15
178_Y	331_R	0.824	0.15
510_D	513_T	0.823	0.15
341_D	515_E	0.823	0.15
254_Q	359_S	0.822	0.15
444_D	515_E	0.821	0.15
339_E	569_E	0.820	0.15
41_H	488_A	0.818	0.15
210_S	270_L	0.817	0.15
242_E	358_F	0.817	0.15
121_A	148_H	0.817	0.15
534_S	571_I	0.816	0.15
301_S	599_K	0.814	0.15
12_E	452_E	0.813	0.15
33_N	540_A	0.813	0.15
460_F	569_E	0.812	0.15
273_E	544_E	0.810	0.15
378_M	557_K	0.810	0.15
304_S	509_R	0.808	0.15
147_P	329_E	0.808	0.15
475_E	486_E	0.806	0.15
598_K	605_A	0.805	0.15
241_G	520_D	0.803	0.15
342_V	383_G	0.803	0.15
364_L	501_A	0.802	0.15
78_R	460_F	0.801	0.15
96_R	331_R	0.800	0.15
341_D	418_I	0.800	0.15
121_A	334_E	0.799	0.15
109_S	322_Y	0.798	0.15
196_K	360_I	0.798	0.15
360_I	452_E	0.796	0.14
15_Q	595_Q	0.795	0.14
444_D	486_E	0.794	0.14
427_M	560_D	0.791	0.14
111_L	391_S	0.791	0.14
243_L	262_K	0.788	0.14
269_S	320_V	0.788	0.14
236_A	255_E	0.787	0.14
186_K	362_T	0.786	0.14
88_A	310_A	0.786	0.14
190_I	454_R	0.786	0.14
34_P	103_P	0.785	0.14
167_S	371_D	0.784	0.14
150_L	153_D	0.783	0.14
244_N	593_D	0.782	0.14
304_S	499_V	0.782	0.14
105_S	254_Q	0.781	0.14
74_E	334_E	0.779	0.14
579_L	616_T	0.779	0.14
28_E	362_T	0.778	0.14
9_K	18_K	0.778	0.14
53_I	560_D	0.778	0.14
40_A	520_D	0.776	0.14
152_D	394_V	0.776	0.14
405_G	408_G	0.774	0.14
25_D	250_M	0.773	0.14
242_E	411_P	0.772	0.14
74_E	398_K	0.770	0.14
84_F	472_A	0.769	0.14
431_N	475_E	0.767	0.14
120_E	147_P	0.766	0.14
74_E	356_A	0.766	0.14
333_Y	572_Q	0.766	0.14
24_A	343_A	0.765	0.14
211_Q	310_A	0.764	0.14
202_T	257_L	0.764	0.14
177_E	403_D	0.764	0.14
199_G	329_E	0.764	0.14
285_S	432_S	0.762	0.14
244_N	491_L	0.762	0.14
223_S	438_S	0.761	0.14
327_S	352_L	0.759	0.14
50_D	462_S	0.759	0.14
103_P	408_G	0.758	0.14
257_L	263_F	0.757	0.14
16_R	35_M	0.756	0.14
142_P	408_G	0.755	0.14
295_N	408_G	0.755	0.14
349_P	408_G	0.755	0.14
314_R	408_G	0.755	0.14
408_G	495_Y	0.755	0.14
351_T	459_N	0.754	0.14
474_K	484_Y	0.752	0.14
65_F	102_G	0.752	0.14
266_H	313_S	0.751	0.14
38_Q	265_W	0.751	0.14
137_P	168_P	0.751	0.14
457_Y	539_K	0.749	0.14
237_Y	251_M	0.749	0.14
271_T	289_L	0.749	0.14
87_A	137_P	0.749	0.14
285_S	410_D	0.748	0.14
92_D	285_S	0.746	0.14
98_L	221_D	0.746	0.14
444_D	454_R	0.745	0.14
40_A	290_I	0.745	0.14
199_G	322_Y	0.744	0.14
449_I	569_E	0.742	0.13
194_E	578_D	0.742	0.13
373_D	463_A	0.742	0.13
250_M	594_E	0.742	0.13
149_H	327_S	0.741	0.13
33_N	304_S	0.740	0.13
79_L	217_T	0.740	0.13
290_I	382_D	0.739	0.13
290_I	328_E	0.738	0.13
389_Y	394_V	0.736	0.13
558_R	594_E	0.735	0.13
430_I	436_L	0.735	0.13
266_H	410_D	0.733	0.13
149_H	454_R	0.733	0.13
417_R	554_R	0.732	0.13
109_S	128_G	0.732	0.13
578_D	616_T	0.730	0.13
28_E	63_S	0.729	0.13
96_R	299_Y	0.729	0.13
68_E	135_G	0.728	0.13
179_G	250_M	0.728	0.13
443_L	499_V	0.727	0.13
622_L	626_G	0.726	0.13
30_I	304_S	0.722	0.13
148_H	343_A	0.720	0.13
15_Q	331_R	0.718	0.13
24_A	360_I	0.718	0.13
491_L	593_D	0.718	0.13
87_A	381_Y	0.717	0.13
44_V	48_I	0.715	0.13
120_E	332_I	0.715	0.13
59_R	362_T	0.715	0.13
337_I	580_K	0.713	0.13
24_A	605_A	0.713	0.13
165_S	418_I	0.712	0.13
139_H	330_E	0.711	0.13
524_M	535_E	0.711	0.13
362_T	560_D	0.711	0.13
101_M	515_E	0.709	0.13
264_L	273_E	0.709	0.13
433_L	440_K	0.707	0.13
38_Q	42_S	0.706	0.13
490_T	499_V	0.706	0.13
501_A	593_D	0.706	0.13
137_P	216_L	0.705	0.13
530_Q	577_A	0.705	0.13
409_I	452_E	0.705	0.13
17_L	150_L	0.705	0.13
61_K	74_E	0.705	0.13
41_H	417_R	0.702	0.13
608_I	615_S	0.700	0.13
417_R	442_G	0.697	0.13
260_D	311_L	0.696	0.13
186_K	496_L	0.696	0.13
582_V	585_I	0.695	0.13
276_F	285_S	0.695	0.13
414_V	449_I	0.694	0.13
121_A	178_Y	0.694	0.13
32_E	75_S	0.693	0.13
201_G	228_Y	0.691	0.13
486_E	574_K	0.691	0.13
282_A	545_I	0.689	0.13
57_D	148_H	0.689	0.13
34_P	147_P	0.688	0.13
206_S	286_A	0.688	0.13
64_F	201_G	0.688	0.13
427_M	605_A	0.687	0.13
221_D	238_R	0.686	0.13
143_L	319_P	0.685	0.12
203_F	299_Y	0.683	0.12
203_F	277_K	0.682	0.12
492_M	518_N	0.681	0.12
501_A	509_R	0.681	0.12
132_A	237_Y	0.681	0.12
384_E	438_S	0.680	0.12
116_K	288_E	0.679	0.12
96_R	294_T	0.679	0.12
354_V	432_S	0.678	0.12
79_L	250_M	0.678	0.12
431_N	547_I	0.677	0.12
92_D	418_I	0.676	0.12
515_E	624_Y	0.676	0.12
109_S	310_A	0.676	0.12
153_D	160_I	0.675	0.12
410_D	447_P	0.675	0.12
211_Q	216_L	0.675	0.12
228_Y	610_E	0.674	0.12
164_G	189_R	0.674	0.12
330_E	597_L	0.674	0.12
103_P	109_S	0.673	0.12
31_K	100_L	0.673	0.12
148_H	152_D	0.672	0.12
246_A	361_L	0.671	0.12
342_V	418_I	0.671	0.12
298_E	510_D	0.670	0.12
29_I	407_S	0.670	0.12
234_P	612_G	0.669	0.12
107_G	358_F	0.668	0.12
603_V	621_L	0.667	0.12
215_D	292_A	0.667	0.12
221_D	231_E	0.665	0.12
63_S	192_F	0.664	0.12
46_N	621_L	0.664	0.12
182_I	455_E	0.664	0.12
286_A	564_H	0.664	0.12
342_V	508_L	0.664	0.12
100_L	333_Y	0.663	0.12
568_R	623_K	0.663	0.12
285_S	313_S	0.662	0.12
79_L	84_F	0.661	0.12
25_D	428_E	0.660	0.12
118_G	171_V	0.660	0.12
348_A	432_S	0.658	0.12
189_R	202_T	0.658	0.12
339_E	518_N	0.657	0.12
64_F	480_F	0.656	0.12
461_I	507_K	0.656	0.12
392_V	438_S	0.655	0.12
121_A	156_R	0.654	0.12
67_R	409_I	0.653	0.12
294_T	492_M	0.652	0.12
316_I	326_V	0.651	0.12
200_I	264_L	0.651	0.12
67_R	390_N	0.650	0.12
120_E	205_P	0.649	0.12
439_L	606_R	0.649	0.12
8_E	330_E	0.649	0.12
70_F	328_E	0.647	0.12
80_V	216_L	0.647	0.12
57_D	117_K	0.646	0.12
443_L	553_A	0.646	0.12
32_E	153_D	0.645	0.12
45_F	418_I	0.644	0.12
147_P	322_Y	0.644	0.12
515_E	587_T	0.643	0.12
34_P	109_S	0.641	0.12
212_D	216_L	0.641	0.12
318_M	398_K	0.641	0.12
289_L	337_I	0.640	0.12
105_S	215_D	0.639	0.12
67_R	121_A	0.638	0.12
398_K	509_R	0.638	0.12
128_G	189_R	0.637	0.12
76_L	398_K	0.637	0.12
287_D	520_D	0.637	0.12
364_L	458_L	0.636	0.12
481_V	488_A	0.636	0.12
322_Y	363_R	0.635	0.12
156_R	451_S	0.635	0.12
97_I	107_G	0.635	0.12
91_L	95_K	0.634	0.12
259_C	266_H	0.633	0.12
67_R	343_A	0.633	0.12
379_R	594_E	0.632	0.12
572_Q	612_G	0.632	0.12
350_H	497_D	0.631	0.12
334_E	610_E	0.631	0.12
200_I	273_E	0.629	0.12
139_H	328_E	0.629	0.12
99_L	411_P	0.628	0.12
97_I	243_L	0.628	0.12
140_E	614_N	0.628	0.12
342_V	470_D	0.628	0.12
64_F	422_I	0.627	0.12
216_L	544_E	0.627	0.12
164_G	491_L	0.626	0.12
296_E	299_Y	0.626	0.12
362_T	460_F	0.626	0.12
579_L	597_L	0.626	0.12
32_E	516_E	0.625	0.12
120_E	322_Y	0.625	0.12
140_E	167_S	0.624	0.12
175_E	499_V	0.624	0.12
231_E	273_E	0.622	0.11
168_P	234_P	0.622	0.11
141_D	170_N	0.622	0.11
25_D	149_H	0.622	0.11
36_V	79_L	0.621	0.11
173_R	403_D	0.620	0.11
483_S	493_D	0.619	0.11
52_G	166_L	0.619	0.11
243_L	532_G	0.617	0.11
89_K	341_D	0.616	0.11
332_I	410_D	0.615	0.11
210_S	224_T	0.615	0.11
441_E	459_N	0.615	0.11
321_P	332_I	0.614	0.11
61_K	479_A	0.611	0.11
596_Q	616_T	0.610	0.11
166_L	501_A	0.607	0.11
249_G	363_R	0.607	0.11
491_L	596_Q	0.605	0.11
59_R	75_S	0.605	0.11
26_Y	62_Y	0.604	0.11
84_F	527_I	0.602	0.11
351_T	371_D	0.602	0.11
33_N	227_E	0.601	0.11
216_L	234_P	0.600	0.11
134_K	334_E	0.600	0.11
23_F	365_K	0.600	0.11
39_S	285_S	0.599	0.11
215_D	432_S	0.597	0.11
12_E	362_T	0.597	0.11
372_I	563_S	0.597	0.11
203_F	472_A	0.597	0.11
307_K	472_A	0.595	0.11
217_T	239_F	0.595	0.11
332_I	412_R	0.594	0.11
97_I	505_K	0.594	0.11
222_F	292_A	0.592	0.11
300_R	481_V	0.592	0.11
151_R	400_E	0.591	0.11
198_T	557_K	0.591	0.11
196_K	454_R	0.588	0.11
501_A	519_P	0.588	0.11
216_L	255_E	0.586	0.11
73_E	85_H	0.585	0.11
156_R	343_A	0.585	0.11
36_V	75_S	0.584	0.11
8_E	63_S	0.584	0.11
25_D	558_R	0.583	0.11
31_K	398_K	0.582	0.11
143_L	556_G	0.582	0.11
11_R	183_E	0.581	0.11
76_L	479_A	0.581	0.11
12_E	568_R	0.581	0.11
362_T	604_V	0.581	0.11
593_D	620_E	0.581	0.11
236_A	240_D	0.580	0.11
214_A	432_S	0.579	0.11
65_F	71_G	0.579	0.11
53_I	598_K	0.578	0.11
11_R	503_C	0.577	0.11
215_D	464_A	0.577	0.11
94_R	374_L	0.577	0.11
9_K	75_S	0.576	0.11
277_K	578_D	0.576	0.11
254_Q	283_L	0.575	0.11
421_T	497_D	0.574	0.11
210_S	413_Y	0.574	0.11
269_S	447_P	0.574	0.11
11_R	163_E	0.574	0.11
206_S	279_G	0.573	0.11
345_V	424_R	0.573	0.11
143_L	541_F	0.571	0.11
96_R	411_P	0.571	0.11
280_R	431_N	0.570	0.11
270_L	564_H	0.570	0.11
60_K	356_A	0.569	0.11
161_R	459_N	0.569	0.11
137_P	310_A	0.567	0.11
362_T	507_K	0.566	0.11
26_Y	30_I	0.566	0.11
428_E	607_L	0.565	0.11
178_Y	185_V	0.564	0.11
290_I	375_V	0.564	0.11
298_E	302_F	0.564	0.11
388_G	560_D	0.563	0.11
354_V	447_P	0.563	0.11
148_H	155_Y	0.563	0.11
545_I	614_N	0.562	0.11
236_A	310_A	0.562	0.11
504_N	547_I	0.561	0.11
10_Y	182_I	0.561	0.11
25_D	165_S	0.561	0.11
65_F	363_R	0.560	0.11
212_D	221_D	0.559	0.11
496_L	510_D	0.558	0.11
35_M	360_I	0.558	0.11
227_E	362_T	0.557	0.11
461_I	614_N	0.557	0.11
366_E	459_N	0.557	0.11
78_R	289_L	0.556	0.11
95_K	310_A	0.556	0.11
83_Y	98_L	0.555	0.10
58_G	64_F	0.554	0.10
556_G	572_Q	0.553	0.10
34_P	108_K	0.553	0.10
61_K	178_Y	0.552	0.10
25_D	63_S	0.552	0.10
425_K	615_S	0.552	0.10
40_A	156_R	0.551	0.10
287_D	465_R	0.550	0.10
346_H	617_S	0.549	0.10
355_A	464_A	0.549	0.10
410_D	432_S	0.547	0.10
345_V	443_L	0.546	0.10
119_L	199_G	0.546	0.10
53_I	499_V	0.546	0.10
109_S	333_Y	0.546	0.10
274_G	410_D	0.546	0.10
451_S	508_L	0.544	0.10
338_A	478_K	0.543	0.10
425_K	430_I	0.543	0.10
147_P	520_D	0.543	0.10
15_Q	382_D	0.542	0.10
465_R	484_Y	0.542	0.10
12_E	153_D	0.542	0.10
290_I	310_A	0.542	0.10
41_H	47_M	0.541	0.10
47_M	411_P	0.541	0.10
106_G	182_I	0.541	0.10
449_I	453_D	0.540	0.10
222_F	283_L	0.539	0.10
239_F	267_L	0.537	0.10
26_Y	140_E	0.537	0.10
277_K	625_V	0.536	0.10
128_G	147_P	0.536	0.10
89_K	360_I	0.536	0.10
359_S	410_D	0.535	0.10
216_L	309_E	0.535	0.10
303_I	554_R	0.535	0.10
151_R	277_K	0.534	0.10
109_S	329_E	0.534	0.10
504_N	509_R	0.534	0.10
258_K	302_F	0.533	0.10
109_S	151_R	0.532	0.10
59_R	156_R	0.532	0.10
78_R	161_R	0.532	0.10
523_L	624_Y	0.532	0.10
485_E	607_L	0.532	0.10
102_G	329_E	0.531	0.10
233_D	538_K	0.530	0.10
10_Y	251_M	0.530	0.10
134_K	230_S	0.530	0.10
8_E	593_D	0.529	0.10
218_G	273_E	0.528	0.10
428_E	616_T	0.527	0.10
330_E	344_D	0.527	0.10
287_D	445_Q	0.527	0.10
333_Y	410_D	0.525	0.10
351_T	599_K	0.525	0.10
402_N	489_K	0.524	0.10
273_E	432_S	0.524	0.10
104_V	299_Y	0.524	0.10
263_F	294_T	0.524	0.10
109_S	252_E	0.523	0.10
56_I	384_E	0.523	0.10
620_E	626_G	0.522	0.10
155_Y	471_I	0.522	0.10
206_S	270_L	0.522	0.10
16_R	63_S	0.522	0.10
179_G	353_K	0.522	0.10
293_H	576_F	0.522	0.10
105_S	447_P	0.522	0.10
70_F	304_S	0.521	0.10
228_Y	595_Q	0.519	0.10
334_E	338_A	0.518	0.10
330_E	362_T	0.518	0.10
239_F	419_S	0.517	0.10
30_I	508_L	0.517	0.10
512_L	611_H	0.517	0.10
61_K	327_S	0.515	0.10
311_L	564_H	0.514	0.10
35_M	334_E	0.514	0.10
397_M	443_L	0.514	0.10
262_K	276_F	0.514	0.10
14_E	373_D	0.514	0.10
338_A	610_E	0.514	0.10
227_E	461_I	0.513	0.10
574_K	626_G	0.513	0.10
179_G	453_D	0.513	0.10
365_K	401_Y	0.513	0.10
168_P	293_H	0.512	0.10
168_P	218_G	0.511	0.10
36_V	232_S	0.511	0.10
212_D	381_Y	0.511	0.10
238_R	294_T	0.510	0.10
320_V	509_R	0.510	0.10
188_E	562_N	0.510	0.10
547_I	579_L	0.510	0.10
189_R	257_L	0.509	0.10
116_K	252_E	0.509	0.10
237_Y	267_L	0.508	0.10
93_V	99_L	0.508	0.10
119_L	197_R	0.507	0.10
99_L	128_G	0.507	0.10
36_V	46_N	0.507	0.10
291_V	611_H	0.507	0.10
254_Q	285_S	0.507	0.10
97_I	567_L	0.506	0.10
135_G	184_D	0.506	0.10
240_D	311_L	0.506	0.10
164_G	258_K	0.505	0.10
507_K	531_I	0.505	0.10
153_D	157_E	0.504	0.10
255_E	264_L	0.504	0.10
177_E	185_V	0.504	0.10
63_S	558_R	0.503	0.10
350_H	394_V	0.503	0.10
117_K	615_S	0.503	0.10
510_D	517_M	0.502	0.10
384_E	389_Y	0.502	0.10
128_G	257_L	0.501	0.10
33_N	394_V	0.501	0.10
538_K	559_F	0.501	0.10
97_I	224_T	0.501	0.10
103_P	332_I	0.501	0.10
217_T	397_M	0.501	0.10
267_L	625_V	0.500	0.10
218_G	234_P	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1g8pA	1	0.4612	99.5	0.931	Contact Map
2r44A	1	0.4754	99.3	0.938	Contact Map
4r7yA	3	0.5182	99.2	0.94	Contact Map
1g41A	3	0.4548	99.2	0.94	Contact Map
3pxiA	3	0.4532	99.2	0.94	Contact Map
3k1jA	4	0.6926	99.2	0.941	Contact Map
1ofhA	3	0.4311	99.1	0.942	Contact Map
3ja82	1	0.5483	99.1	0.942	Contact Map
3sylA	2	0.4279	99.1	0.944	Contact Map
1um8A	1	0.3914	99	0.944	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0251 seconds.