EXPZ - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

EXPZ - Nucleotide-binding protein ExpZ

UniProt:	P39115	Sequences: MKEIVTLTNVSYEVKDQTVFKHVNASVQQGDIIGIIGKNGAGKSTLLHLIHNDLAPAQGQILRKDIKLALVEQETAAYSFADQTPAEKKLLEKWHVPLRDFHQLSGGEKLKARLAKGLSEDADLLLLDEPTNHLDEKSLQFLIQQLKHYNGTVILVSHDRYFLDEAATKIWSLEDQTLIEFKGNYSGYMKFREKKRLTQQREYEKQQKMVERIEAQMNGLASWSEKAHAQSTKKEGFKEYHRVKAKRTDAQIKSKQKRLEKELEKAKAEPVTPEYTVRFSIDTTHKTGKRFLEVQNVTKAFGERTLFKNANFTIQHGEKVAIIGPNGSGKTTLLNIILGQETAEGSVWVSPSANIGYLTQEVFDLPLEQTPEELFENETFKARGHVQNLMRHLGFTAAQWTEPIKHMSMGERVKIKLMAYILEEKDVLILDEPTNHLDLPSREQLEETLSQYSGTLLAVSHDRYFLEKTTNSKLVISNNGIEKQLNDVPSERNEREELRLKLETERQEVLGKLSFMTPNDKGYKELDQAFNELTKRIKELDHQDKKD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	547 (475)
Sequences:	221 (204)
Seq/√Len:	9.4

ECOLI - YHES UUP GSIA YBHF ETTA YEJF
BACSU - EXPZ YFMR YKPA YDIF YFMM YKOD
SULSO - Y1893 Y2030

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
390_M	400_W	4.261	0.99
153_V	159_D	3.932	0.98
156_V	159_D	3.929	0.98
160_R	163_L	3.810	0.98
47_L	126_L	3.134	0.93
294_V	297_V	3.116	0.93
438_D	441_S	3.077	0.92
432_E	461_H	3.051	0.92
151_G	157_S	2.979	0.91
107_G	327_G	2.957	0.91
151_G	159_D	2.878	0.90
47_L	156_V	2.670	0.85
150_N	157_S	2.605	0.84
330_K	360_Q	2.548	0.83
327_G	330_K	2.511	0.82
83_Q	90_L	2.474	0.81
324_G	327_G	2.462	0.80
155_L	159_D	2.439	0.80
163_L	167_A	2.426	0.79
330_K	431_D	2.404	0.79
105_S	327_G	2.393	0.78
327_G	431_D	2.386	0.78
153_V	163_L	2.378	0.78
324_G	329_G	2.339	0.77
327_G	408_S	2.312	0.76
434_T	437_L	2.298	0.75
375_F	390_M	2.296	0.75
37_G	43_K	2.239	0.73
112_A	332_T	2.185	0.71
39_N	414_K	2.169	0.71
107_G	329_G	2.160	0.70
107_G	330_K	2.158	0.70
433_P	461_H	2.142	0.70
151_G	155_L	2.141	0.70
107_G	324_G	2.116	0.69
129_E	158_H	2.109	0.69
431_D	461_H	2.073	0.67
107_G	408_S	2.069	0.67
10_V	339_G	2.060	0.67
107_G	431_D	2.039	0.66
37_G	42_G	2.029	0.65
151_G	158_H	1.986	0.64
90_L	93_K	1.979	0.63
170_I	177_T	1.964	0.63
296_N	309_N	1.943	0.62
321_A	470_T	1.925	0.61
119_S	377_N	1.917	0.61
87_E	119_S	1.892	0.60
434_T	438_D	1.859	0.58
109_K	433_P	1.856	0.58
111_K	332_T	1.855	0.58
152_T	158_H	1.851	0.58
434_T	444_Q	1.849	0.58
159_D	163_L	1.803	0.56
48_H	53_D	1.803	0.56
358_L	394_G	1.774	0.55
12_Y	411_E	1.768	0.54
178_L	394_G	1.768	0.54
360_Q	408_S	1.764	0.54
158_H	410_G	1.761	0.54
155_L	171_W	1.737	0.53
329_G	360_Q	1.725	0.52
372_E	383_R	1.724	0.52
153_V	157_S	1.714	0.52
116_K	419_A	1.713	0.52
360_Q	431_D	1.709	0.52
151_G	156_V	1.709	0.52
186_S	212_R	1.705	0.52
105_S	329_G	1.704	0.52
327_G	360_Q	1.691	0.51
417_L	445_L	1.686	0.51
154_I	158_H	1.677	0.50
27_V	33_I	1.676	0.50
327_G	461_H	1.673	0.50
435_N	441_S	1.663	0.50
324_G	330_K	1.657	0.49
435_N	438_D	1.642	0.49
151_G	163_L	1.634	0.48
331_T	429_I	1.632	0.48
105_S	408_S	1.622	0.48
228_H	231_S	1.621	0.48
54_L	411_E	1.617	0.48
437_L	441_S	1.610	0.47
329_G	408_S	1.601	0.47
409_M	414_K	1.597	0.47
155_L	158_H	1.593	0.47
303_E	320_V	1.589	0.46
158_H	438_D	1.584	0.46
475_V	479_N	1.578	0.46
414_K	435_N	1.571	0.46
108_E	116_K	1.563	0.45
106_G	360_Q	1.561	0.45
438_D	444_Q	1.558	0.45
345_G	455_T	1.551	0.45
324_G	408_S	1.549	0.45
293_E	296_N	1.546	0.45
299_K	336_I	1.539	0.44
13_E	24_N	1.534	0.44
14_V	45_T	1.531	0.44
105_S	330_K	1.531	0.44
330_K	408_S	1.528	0.44
44_S	256_Q	1.526	0.44
293_E	427_V	1.525	0.44
320_V	474_L	1.524	0.44
39_N	326_N	1.518	0.43
105_S	324_G	1.507	0.43
372_E	376_E	1.504	0.43
408_S	431_D	1.491	0.42
289_K	292_L	1.484	0.42
150_N	155_L	1.482	0.42
35_I	478_N	1.473	0.41
275_Y	278_R	1.468	0.41
152_T	160_R	1.463	0.41
107_G	360_Q	1.452	0.40
87_E	376_E	1.449	0.40
39_N	435_N	1.441	0.40
257_K	260_E	1.418	0.39
118_L	429_I	1.418	0.39
238_K	241_H	1.415	0.39
20_F	176_Q	1.414	0.39
324_G	431_D	1.411	0.39
40_G	43_K	1.403	0.38
292_L	427_V	1.397	0.38
170_I	334_L	1.395	0.38
155_L	167_A	1.393	0.38
111_K	117_G	1.392	0.38
24_N	50_I	1.392	0.38
157_S	161_Y	1.389	0.38
209_M	224_S	1.384	0.38
433_P	459_V	1.383	0.38
427_V	481_I	1.382	0.38
107_G	461_H	1.378	0.37
153_V	160_R	1.376	0.37
105_S	135_D	1.375	0.37
9_N	24_N	1.374	0.37
160_R	164_D	1.372	0.37
20_F	41_A	1.370	0.37
119_S	376_E	1.370	0.37
277_V	280_S	1.367	0.37
105_S	431_D	1.366	0.37
33_I	455_T	1.360	0.37
339_G	365_L	1.353	0.36
17_Q	384_G	1.324	0.35
113_R	409_M	1.324	0.35
336_I	423_E	1.323	0.35
437_L	444_Q	1.320	0.35
135_D	330_K	1.316	0.35
275_Y	281_I	1.300	0.34
135_D	327_G	1.298	0.34
290_R	293_E	1.290	0.34
329_G	431_D	1.285	0.34
49_L	129_E	1.282	0.33
131_T	433_P	1.270	0.33
134_L	462_D	1.268	0.33
114_L	395_F	1.266	0.33
153_V	156_V	1.257	0.32
109_K	319_K	1.256	0.32
185_Y	188_Y	1.254	0.32
131_T	376_E	1.250	0.32
322_I	447_E	1.249	0.32
119_S	453_S	1.246	0.32
40_G	360_Q	1.246	0.32
68_L	308_K	1.243	0.32
79_S	429_I	1.239	0.32
220_L	224_S	1.239	0.32
142_L	430_L	1.237	0.32
107_G	111_K	1.229	0.31
372_E	422_L	1.228	0.31
190_K	198_T	1.218	0.31
164_D	167_A	1.211	0.31
239_E	243_V	1.207	0.31
105_S	432_E	1.204	0.30
219_G	225_E	1.200	0.30
208_K	212_R	1.198	0.30
331_T	469_T	1.198	0.30
211_E	222_S	1.195	0.30
117_G	332_T	1.194	0.30
448_T	451_Q	1.193	0.30
129_E	414_K	1.193	0.30
152_T	159_D	1.191	0.30
213_I	218_N	1.191	0.30
187_G	429_I	1.183	0.30
54_L	417_L	1.182	0.30
135_D	461_H	1.178	0.29
154_I	159_D	1.169	0.29
215_A	221_A	1.167	0.29
35_I	71_V	1.163	0.29
292_L	445_L	1.159	0.29
156_V	162_F	1.157	0.29
158_H	408_S	1.155	0.29
90_L	94_W	1.150	0.28
410_G	438_D	1.148	0.28
174_E	186_S	1.146	0.28
430_L	434_T	1.142	0.28
330_K	432_E	1.141	0.28
10_V	49_L	1.138	0.28
213_I	224_S	1.137	0.28
333_L	449_L	1.133	0.28
192_R	196_R	1.132	0.28
44_S	146_L	1.130	0.28
154_I	164_D	1.129	0.28
327_G	432_E	1.129	0.28
10_V	14_V	1.128	0.28
215_A	222_S	1.128	0.28
188_Y	195_K	1.128	0.28
108_E	143_I	1.127	0.28
101_F	320_V	1.127	0.28
154_I	167_A	1.126	0.28
212_R	223_W	1.125	0.28
101_F	337_I	1.115	0.27
37_G	40_G	1.110	0.27
107_G	135_D	1.109	0.27
158_H	163_L	1.107	0.27
435_N	439_L	1.104	0.27
41_A	426_D	1.100	0.27
131_T	326_N	1.095	0.27
151_G	160_R	1.095	0.27
40_G	73_Q	1.092	0.26
43_K	128_D	1.091	0.26
155_L	161_Y	1.087	0.26
356_G	420_Y	1.085	0.26
375_F	388_N	1.085	0.26
410_G	434_T	1.081	0.26
106_G	332_T	1.078	0.26
135_D	431_D	1.069	0.26
298_T	314_I	1.068	0.26
413_V	433_P	1.068	0.26
173_L	333_L	1.057	0.25
106_G	408_S	1.053	0.25
294_V	312_F	1.048	0.25
27_V	61_I	1.043	0.25
51_H	70_L	1.042	0.25
209_M	212_R	1.041	0.25
371_P	375_F	1.035	0.24
434_T	441_S	1.033	0.24
160_R	167_A	1.032	0.24
7_L	10_V	1.024	0.24
331_T	417_L	1.019	0.24
52_N	422_L	1.018	0.24
322_I	429_I	1.008	0.24
116_K	415_I	1.005	0.24
49_L	377_N	0.996	0.23
91_L	94_W	0.993	0.23
430_L	460_S	0.993	0.23
254_S	259_L	0.991	0.23
153_V	158_H	0.990	0.23
329_G	461_H	0.983	0.23
206_Q	216_Q	0.981	0.23
17_Q	27_V	0.981	0.23
312_F	458_A	0.981	0.23
195_K	198_T	0.976	0.23
233_K	249_D	0.973	0.23
154_I	314_I	0.972	0.22
22_H	454_G	0.972	0.22
203_Y	212_R	0.971	0.22
269_E	274_E	0.971	0.22
109_K	347_V	0.970	0.22
105_S	360_Q	0.966	0.22
254_S	260_E	0.962	0.22
73_Q	466_L	0.958	0.22
326_N	465_F	0.958	0.22
239_E	244_K	0.958	0.22
439_L	444_Q	0.956	0.22
83_Q	87_E	0.955	0.22
156_V	375_F	0.954	0.22
410_G	414_K	0.953	0.22
134_L	321_A	0.953	0.22
7_L	332_T	0.953	0.22
158_H	437_L	0.948	0.22
45_T	410_G	0.946	0.22
214_E	221_A	0.945	0.22
54_L	358_L	0.944	0.22
329_G	332_T	0.943	0.22
105_S	461_H	0.943	0.22
274_E	280_S	0.940	0.22
34_G	326_N	0.940	0.22
111_K	327_G	0.940	0.22
131_T	377_N	0.938	0.21
39_N	129_E	0.935	0.21
307_F	310_A	0.933	0.21
393_L	457_L	0.928	0.21
119_S	173_L	0.928	0.21
226_K	246_K	0.927	0.21
216_Q	220_L	0.926	0.21
99_R	429_I	0.926	0.21
428_L	464_Y	0.926	0.21
213_I	220_L	0.923	0.21
383_R	390_M	0.923	0.21
334_L	429_I	0.918	0.21
324_G	461_H	0.917	0.21
39_N	465_F	0.916	0.21
161_Y	165_E	0.908	0.21
107_G	432_E	0.907	0.21
40_G	44_S	0.907	0.21
42_G	128_D	0.906	0.21
435_N	462_D	0.906	0.21
114_L	296_N	0.904	0.20
131_T	393_L	0.903	0.20
37_G	128_D	0.901	0.20
334_L	459_V	0.900	0.20
323_I	362_V	0.896	0.20
203_Y	206_Q	0.893	0.20
40_G	105_S	0.890	0.20
44_S	126_L	0.886	0.20
191_F	194_K	0.884	0.20
15_K	425_K	0.884	0.20
477_S	482_E	0.883	0.20
20_F	419_A	0.882	0.20
87_E	377_N	0.881	0.20
207_Q	216_Q	0.880	0.20
365_L	449_L	0.876	0.20
252_I	255_K	0.875	0.20
327_G	332_T	0.875	0.20
216_Q	227_A	0.874	0.20
330_K	461_H	0.874	0.20
331_T	426_D	0.873	0.20
83_Q	147_K	0.872	0.20
35_I	456_L	0.867	0.19
211_E	229_A	0.867	0.19
126_L	156_V	0.867	0.19
318_E	471_N	0.866	0.19
27_V	345_G	0.863	0.19
139_L	159_D	0.862	0.19
64_K	333_L	0.862	0.19
323_I	479_N	0.857	0.19
28_Q	65_D	0.857	0.19
238_K	245_A	0.856	0.19
111_K	432_E	0.855	0.19
40_G	330_K	0.855	0.19
258_R	279_F	0.853	0.19
206_Q	213_I	0.853	0.19
182_K	481_I	0.847	0.19
135_D	432_E	0.846	0.19
441_S	444_Q	0.845	0.19
190_K	193_E	0.844	0.19
282_D	309_N	0.840	0.19
113_R	414_K	0.838	0.19
49_L	158_H	0.838	0.19
36_I	183_G	0.837	0.19
223_W	231_S	0.837	0.19
128_D	329_G	0.837	0.19
40_G	327_G	0.836	0.19
217_M	221_A	0.836	0.19
267_K	275_Y	0.834	0.19
435_N	444_Q	0.832	0.18
183_G	188_Y	0.832	0.18
152_T	156_V	0.832	0.18
233_K	427_V	0.830	0.18
253_K	256_Q	0.829	0.18
153_V	164_D	0.826	0.18
116_K	413_V	0.826	0.18
233_K	322_I	0.824	0.18
322_I	385_H	0.823	0.18
255_K	258_R	0.822	0.18
87_E	368_E	0.821	0.18
309_N	480_G	0.818	0.18
44_S	231_S	0.818	0.18
131_T	357_Y	0.817	0.18
133_H	436_H	0.815	0.18
152_T	155_L	0.813	0.18
391_R	444_Q	0.812	0.18
105_S	111_K	0.807	0.18
211_E	224_S	0.802	0.18
73_Q	127_L	0.801	0.18
297_V	310_A	0.799	0.18
116_K	340_Q	0.798	0.18
111_K	413_V	0.797	0.18
187_G	334_L	0.796	0.18
45_T	414_K	0.796	0.18
240_Y	248_T	0.795	0.17
326_N	435_N	0.795	0.17
230_Q	233_K	0.794	0.17
216_Q	223_W	0.791	0.17
216_Q	232_T	0.790	0.17
390_M	395_F	0.789	0.17
270_P	273_P	0.789	0.17
318_E	474_L	0.788	0.17
373_E	424_E	0.787	0.17
252_I	257_K	0.787	0.17
142_L	389_L	0.787	0.17
13_E	428_L	0.786	0.17
83_Q	119_S	0.785	0.17
119_S	147_K	0.785	0.17
108_E	375_F	0.783	0.17
49_L	99_R	0.782	0.17
184_N	193_E	0.780	0.17
91_L	418_M	0.780	0.17
43_K	59_G	0.778	0.17
325_P	368_E	0.778	0.17
318_E	472_S	0.777	0.17
182_K	202_E	0.775	0.17
151_G	429_I	0.775	0.17
133_H	465_F	0.774	0.17
214_E	226_K	0.773	0.17
278_R	283_T	0.773	0.17
269_E	272_T	0.773	0.17
337_I	370_T	0.772	0.17
285_H	347_V	0.767	0.17
11_S	173_L	0.766	0.17
46_L	61_I	0.762	0.17
212_R	220_L	0.762	0.17
128_D	330_K	0.762	0.17
133_H	395_F	0.761	0.17
326_N	393_L	0.760	0.17
37_G	44_S	0.760	0.17
332_T	432_E	0.759	0.17
14_V	377_N	0.758	0.17
34_G	377_N	0.756	0.17
230_Q	297_V	0.756	0.17
207_Q	218_N	0.752	0.16
147_K	377_N	0.751	0.16
445_L	449_L	0.751	0.16
327_G	331_T	0.751	0.16
225_E	243_V	0.751	0.16
292_L	417_L	0.750	0.16
454_G	462_D	0.750	0.16
32_I	322_I	0.749	0.16
128_D	431_D	0.746	0.16
215_A	226_K	0.741	0.16
128_D	324_G	0.741	0.16
49_L	371_P	0.741	0.16
128_D	327_G	0.740	0.16
90_L	326_N	0.740	0.16
108_E	376_E	0.739	0.16
314_I	336_I	0.738	0.16
131_T	414_K	0.738	0.16
478_N	483_K	0.736	0.16
9_N	22_H	0.734	0.16
324_G	360_Q	0.733	0.16
132_N	413_V	0.732	0.16
358_L	420_Y	0.731	0.16
243_V	249_D	0.731	0.16
224_S	227_A	0.731	0.16
130_P	133_H	0.730	0.16
114_L	432_E	0.730	0.16
305_T	449_L	0.721	0.16
259_L	262_E	0.719	0.16
159_D	462_D	0.718	0.16
20_F	39_N	0.718	0.16
207_Q	210_V	0.717	0.16
135_D	360_Q	0.716	0.16
223_W	244_K	0.715	0.16
75_T	446_E	0.715	0.16
150_N	154_I	0.714	0.16
119_S	143_I	0.714	0.16
127_L	430_L	0.714	0.16
113_R	125_L	0.712	0.15
382_A	385_H	0.712	0.15
458_A	470_T	0.711	0.15
154_I	174_E	0.710	0.15
44_S	338_L	0.709	0.15
76_A	129_E	0.709	0.15
118_L	138_S	0.708	0.15
222_S	240_Y	0.708	0.15
270_P	279_F	0.707	0.15
277_V	282_D	0.706	0.15
434_T	443_E	0.705	0.15
155_L	163_L	0.705	0.15
24_N	102_H	0.705	0.15
273_P	284_T	0.705	0.15
133_H	414_K	0.705	0.15
179_I	427_V	0.704	0.15
131_T	138_S	0.703	0.15
224_S	245_A	0.701	0.15
321_A	372_E	0.701	0.15
332_T	461_H	0.700	0.15
114_L	135_D	0.700	0.15
126_L	137_K	0.699	0.15
129_E	438_D	0.699	0.15
105_S	128_D	0.696	0.15
223_W	232_T	0.696	0.15
157_S	449_L	0.692	0.15
152_T	167_A	0.692	0.15
142_L	478_N	0.691	0.15
17_Q	61_I	0.691	0.15
438_D	442_R	0.690	0.15
171_W	455_T	0.690	0.15
301_F	459_V	0.689	0.15
157_S	163_L	0.687	0.15
35_I	178_L	0.687	0.15
128_D	135_D	0.686	0.15
50_I	183_G	0.685	0.15
410_G	437_L	0.684	0.15
158_H	168_T	0.683	0.15
40_G	431_D	0.681	0.15
264_E	273_P	0.681	0.15
22_H	112_A	0.680	0.15
112_A	294_V	0.680	0.15
143_I	362_V	0.680	0.15
138_S	146_L	0.679	0.15
130_P	173_L	0.676	0.15
183_G	421_I	0.674	0.15
61_I	306_L	0.674	0.15
367_L	375_F	0.672	0.15
253_K	259_L	0.671	0.15
213_I	233_K	0.671	0.15
436_H	441_S	0.671	0.15
116_K	339_G	0.669	0.14
131_T	158_H	0.668	0.14
238_K	242_R	0.667	0.14
129_E	331_T	0.667	0.14
449_L	458_A	0.667	0.14
12_Y	17_Q	0.666	0.14
80_F	143_I	0.665	0.14
34_G	54_L	0.665	0.14
303_E	337_I	0.664	0.14
106_G	423_E	0.664	0.14
135_D	329_G	0.663	0.14
254_S	261_K	0.659	0.14
374_L	413_V	0.659	0.14
107_G	128_D	0.658	0.14
115_A	422_L	0.656	0.14
449_L	476_I	0.655	0.14
182_K	455_T	0.654	0.14
148_H	451_Q	0.653	0.14
40_G	135_D	0.653	0.14
68_L	373_E	0.650	0.14
324_G	332_T	0.649	0.14
217_M	226_K	0.647	0.14
228_H	234_K	0.647	0.14
318_E	347_V	0.646	0.14
213_I	223_W	0.644	0.14
321_A	461_H	0.644	0.14
23_V	417_L	0.642	0.14
222_S	229_A	0.638	0.14
101_F	370_T	0.637	0.14
177_T	240_Y	0.637	0.14
214_E	233_K	0.637	0.14
19_V	417_L	0.636	0.14
208_K	220_L	0.635	0.14
376_E	453_S	0.633	0.14
68_L	73_Q	0.633	0.14
186_S	225_E	0.633	0.14
337_I	452_Y	0.632	0.14
153_V	170_I	0.632	0.14
42_G	360_Q	0.631	0.14
15_K	45_T	0.631	0.14
40_G	408_S	0.629	0.14
408_S	461_H	0.625	0.14
334_L	474_L	0.625	0.14
25_A	354_N	0.625	0.14
56_P	61_I	0.625	0.14
106_G	117_G	0.623	0.14
348_W	457_L	0.623	0.14
455_T	462_D	0.622	0.13
218_N	231_S	0.621	0.13
23_V	198_T	0.621	0.13
273_P	282_D	0.620	0.13
125_L	133_H	0.619	0.13
332_T	458_A	0.619	0.13
357_Y	365_L	0.619	0.13
218_N	225_E	0.617	0.13
173_L	464_Y	0.616	0.13
437_L	443_E	0.616	0.13
128_D	432_E	0.613	0.13
292_L	299_K	0.613	0.13
438_D	443_E	0.611	0.13
250_A	287_T	0.611	0.13
254_S	257_K	0.609	0.13
157_S	433_P	0.609	0.13
264_E	268_A	0.607	0.13
47_L	50_I	0.607	0.13
215_A	244_K	0.607	0.13
40_G	107_G	0.605	0.13
237_F	243_V	0.605	0.13
22_H	320_V	0.604	0.13
229_A	238_K	0.604	0.13
292_L	374_L	0.601	0.13
111_K	324_G	0.601	0.13
25_A	297_V	0.600	0.13
212_R	217_M	0.599	0.13
45_T	124_L	0.598	0.13
210_V	234_K	0.597	0.13
7_L	386_V	0.596	0.13
390_M	448_T	0.596	0.13
146_L	432_E	0.595	0.13
129_E	132_N	0.593	0.13
407_M	418_M	0.592	0.13
76_A	131_T	0.591	0.13
362_V	457_L	0.590	0.13
218_N	223_W	0.588	0.13
243_V	246_K	0.588	0.13
331_T	431_D	0.587	0.13
435_N	442_R	0.587	0.13
39_N	433_P	0.587	0.13
213_I	222_S	0.586	0.13
226_K	238_K	0.586	0.13
180_E	188_Y	0.585	0.13
186_S	190_K	0.583	0.13
214_E	224_S	0.582	0.13
308_K	338_L	0.582	0.13
20_F	465_F	0.582	0.13
311_N	358_L	0.581	0.13
170_I	188_Y	0.580	0.13
76_A	142_L	0.579	0.13
153_V	415_I	0.578	0.13
136_E	143_I	0.576	0.13
188_Y	191_F	0.576	0.13
96_V	362_V	0.575	0.13
69_A	122_A	0.575	0.13
146_L	461_H	0.574	0.13
226_K	232_T	0.573	0.13
250_A	261_K	0.571	0.12
159_D	442_R	0.568	0.12
209_M	229_A	0.568	0.12
192_R	195_K	0.568	0.12
50_I	156_V	0.567	0.12
219_G	235_E	0.567	0.12
46_L	430_L	0.562	0.12
157_S	462_D	0.561	0.12
297_V	311_N	0.560	0.12
164_D	186_S	0.560	0.12
458_A	475_V	0.560	0.12
251_Q	261_K	0.559	0.12
310_A	473_K	0.559	0.12
332_T	431_D	0.558	0.12
45_T	367_L	0.557	0.12
28_Q	61_I	0.557	0.12
302_G	444_Q	0.555	0.12
288_G	428_L	0.555	0.12
308_K	355_I	0.554	0.12
413_V	420_Y	0.554	0.12
27_V	146_L	0.553	0.12
132_N	371_P	0.552	0.12
87_E	143_I	0.551	0.12
177_T	186_S	0.550	0.12
321_A	332_T	0.549	0.12
116_K	345_G	0.548	0.12
399_Q	404_I	0.547	0.12
410_G	425_K	0.547	0.12
262_E	265_K	0.546	0.12
214_E	222_S	0.545	0.12
113_R	331_T	0.545	0.12
56_P	422_L	0.545	0.12
326_N	414_K	0.544	0.12
33_I	36_I	0.544	0.12
269_E	276_T	0.543	0.12
218_N	221_A	0.543	0.12
139_L	337_I	0.543	0.12
96_V	101_F	0.542	0.12
244_K	253_K	0.542	0.12
338_L	459_V	0.538	0.12
13_E	417_L	0.538	0.12
44_S	47_L	0.537	0.12
5_V	9_N	0.536	0.12
434_T	439_L	0.535	0.12
163_L	169_K	0.535	0.12
69_A	338_L	0.535	0.12
176_Q	183_G	0.534	0.12
98_L	144_Q	0.534	0.12
91_L	430_L	0.534	0.12
109_K	389_L	0.532	0.12
110_L	331_T	0.531	0.12
425_K	452_Y	0.531	0.12
339_G	374_L	0.531	0.12
135_D	408_S	0.529	0.12
162_F	391_R	0.529	0.12
331_T	473_K	0.529	0.12
45_T	158_H	0.529	0.12
132_N	358_L	0.527	0.12
192_R	198_T	0.527	0.12
172_S	180_E	0.526	0.12
251_Q	256_Q	0.526	0.12
408_S	438_D	0.526	0.12
111_K	115_A	0.525	0.12
31_D	124_L	0.524	0.12
107_G	332_T	0.524	0.12
270_P	284_T	0.522	0.12
383_R	422_L	0.522	0.12
209_M	247_R	0.522	0.12
326_N	332_T	0.522	0.12
125_L	423_E	0.521	0.12
340_Q	470_T	0.521	0.12
155_L	160_R	0.521	0.12
133_H	433_P	0.520	0.12
142_L	373_E	0.519	0.11
174_E	178_L	0.519	0.11
171_W	178_L	0.518	0.11
207_Q	228_H	0.518	0.11
272_T	277_V	0.518	0.11
152_T	413_V	0.518	0.11
173_L	358_L	0.518	0.11
212_R	235_E	0.518	0.11
152_T	404_I	0.518	0.11
109_K	148_H	0.517	0.11
172_S	459_V	0.516	0.11
38_K	421_I	0.515	0.11
157_S	171_W	0.515	0.11
381_K	424_E	0.515	0.11
323_I	328_S	0.515	0.11
108_E	326_N	0.513	0.11
76_A	377_N	0.512	0.11
312_F	406_H	0.512	0.11
427_V	437_L	0.512	0.11
296_N	349_V	0.511	0.11
106_G	445_L	0.510	0.11
79_S	445_L	0.510	0.11
16_D	34_G	0.510	0.11
300_A	305_T	0.509	0.11
53_D	93_K	0.509	0.11
168_T	476_I	0.507	0.11
147_K	325_P	0.507	0.11
163_L	185_Y	0.506	0.11
124_L	294_V	0.505	0.11
31_D	478_N	0.503	0.11
427_V	434_T	0.503	0.11
42_G	59_G	0.503	0.11
464_Y	483_K	0.502	0.11
143_I	377_N	0.502	0.11
215_A	231_S	0.502	0.11
39_N	54_L	0.501	0.11
212_R	224_S	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4q9hA	1	0.8537	100	0.375	Contact Map
4f4cA	1	0.8647	100	0.378	Contact Map
4finA	2	0.8775	100	0.414	Contact Map
2iw3A	2	0.766	100	0.458	Contact Map
1yqtA	1	0.83	100	0.493	Contact Map
3ozxA	1	0.841	100	0.495	Contact Map
3bk7A	1	0.8446	100	0.498	Contact Map
3j16B	1	0.8391	100	0.514	Contact Map
3ux8A	2	0.7441	100	0.536	Contact Map
2vf7A	2	0.7697	100	0.61	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0139 seconds.