SP5R - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SP5R - Stage V sporulation protein R

UniProt:	P37875	Sequences: MNAEEKKGLQRAIEEITEIAKGFGLDFYPMRYEICPAEIIYTFGAYGMPTRFSHWSFGKQFHKMKLHYDLGLSKIYELVINSDPCYAFLLDSNSLIQNKLIVAHVLAHCDFFKNNCRFQNTKRDMVESMAATAERIKHYEQVHGIKEVESFLDAILSIQEHIDPSLVRPKLQWSVDDEEEEIEEAATPYDDLWSLDEKKPKKQVKKSKKPFPPRPEKDILLFIEEHSRELEPWQRDILTMMREEMLYFWPQLETKIMNEGWASYWHQRIIRELDLTSDEAIEFAKLNAGVVQPSKTGINPYYLGLKIFEDIEKRYNNPTEEMKKMGVQPDSGREKMFEVREIESDISFIRNYLTKELVMREDLYLFQKQGRDYKIIDKQWKSVRDQLVSMRVNGGFPYLTVNDGDYMKNNELYIKHWYEGIELDLKYLEKVLPYLFQLWGRSVHIESVLEDKEVMFSYDGKGVHRRYL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	468 (451)
Sequences:	679 (325)
Seq/√Len:	15.3

ECOLI - YCGB
BACSU - SP5R

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
356_E	360_R	6.655	1.00
399_L	414_I	5.698	1.00
158_I	435_L	5.486	1.00
26_D	113_K	5.062	1.00
358_V	383_V	4.894	1.00
418_Y	422_E	4.483	1.00
136_I	237_I	4.308	1.00
329_P	335_K	4.286	1.00
96_I	283_F	3.838	1.00
308_F	336_M	3.646	1.00
154_A	437_Q	3.628	1.00
29_P	83_D	3.621	1.00
19_I	22_G	3.510	0.99
331_S	334_E	3.205	0.99
24_G	334_E	3.153	0.99
223_I	238_L	3.060	0.98
337_F	341_E	2.996	0.98
22_G	272_E	2.907	0.98
377_D	382_S	2.853	0.97
40_I	64_M	2.834	0.97
154_A	434_Y	2.813	0.97
420_G	423_L	2.804	0.97
416_H	447_S	2.803	0.97
357_L	360_R	2.751	0.97
413_Y	446_E	2.738	0.96
261_W	265_W	2.691	0.96
320_E	324_K	2.667	0.96
312_E	316_N	2.665	0.96
83_D	124_D	2.639	0.96
307_I	311_I	2.624	0.95
418_Y	423_L	2.550	0.95
15_E	18_E	2.507	0.94
313_K	360_R	2.504	0.94
333_R	337_F	2.428	0.93
24_G	337_F	2.408	0.93
257_M	311_I	2.406	0.93
419_E	423_L	2.392	0.93
23_F	272_E	2.363	0.92
18_E	22_G	2.311	0.91
343_E	352_Y	2.304	0.91
370_G	421_I	2.291	0.91
291_V	302_Y	2.284	0.91
143_H	147_E	2.235	0.90
132_T	240_M	2.202	0.89
150_S	437_Q	2.189	0.89
402_N	415_K	2.164	0.88
19_I	273_L	2.121	0.87
298_I	352_Y	2.106	0.87
307_I	357_L	2.094	0.86
335_K	352_Y	2.050	0.85
147_E	150_S	2.027	0.84
302_Y	306_K	2.027	0.84
415_K	446_E	1.983	0.83
311_I	314_R	1.962	0.82
264_Y	312_E	1.929	0.81
110_D	261_W	1.917	0.81
136_I	240_M	1.909	0.80
65_K	69_D	1.892	0.80
147_E	152_L	1.888	0.80
85_C	109_C	1.872	0.79
219_I	435_L	1.844	0.78
19_I	269_I	1.832	0.78
255_K	395_G	1.804	0.76
392_V	396_F	1.800	0.76
430_K	433_P	1.773	0.75
324_K	377_D	1.764	0.75
278_D	416_H	1.754	0.74
320_E	323_K	1.751	0.74
151_F	234_Q	1.737	0.74
283_F	287_N	1.728	0.73
191_D	263_S	1.666	0.70
231_E	407_M	1.639	0.69
89_L	261_W	1.629	0.69
13_I	102_V	1.621	0.68
135_R	236_D	1.614	0.68
13_I	106_L	1.605	0.67
19_I	272_E	1.582	0.66
32_Y	101_I	1.572	0.66
204_V	274_D	1.554	0.65
308_F	311_I	1.549	0.65
11_R	14_E	1.543	0.64
196_D	401_V	1.537	0.64
110_D	340_R	1.527	0.63
419_E	424_D	1.523	0.63
275_L	279_E	1.492	0.62
184_E	190_D	1.490	0.61
19_I	275_L	1.484	0.61
94_S	237_I	1.465	0.60
24_G	333_R	1.462	0.60
28_Y	123_R	1.461	0.60
183_E	187_T	1.452	0.59
349_I	360_R	1.439	0.59
449_L	452_K	1.439	0.59
110_D	265_W	1.422	0.58
327_V	331_S	1.417	0.57
60_Q	431_V	1.411	0.57
151_F	155_I	1.406	0.57
96_I	270_I	1.400	0.56
329_P	352_Y	1.390	0.56
220_L	241_M	1.390	0.56
71_G	224_E	1.389	0.56
312_E	333_R	1.377	0.55
322_M	327_V	1.373	0.55
325_M	331_S	1.372	0.55
318_P	321_E	1.368	0.55
285_K	374_K	1.366	0.55
400_T	417_W	1.360	0.54
302_Y	361_E	1.333	0.53
147_E	234_Q	1.325	0.52
29_P	291_V	1.323	0.52
85_C	222_F	1.320	0.52
292_Q	349_I	1.312	0.52
9_L	418_Y	1.306	0.51
367_Q	383_V	1.296	0.51
139_Y	236_D	1.289	0.50
289_G	350_R	1.287	0.50
414_I	435_L	1.277	0.50
194_S	197_E	1.277	0.50
38_E	165_S	1.272	0.49
17_T	27_F	1.270	0.49
51_R	57_F	1.264	0.49
66_L	70_L	1.254	0.48
37_A	288_A	1.248	0.48
81_N	251_Q	1.243	0.48
15_E	274_D	1.242	0.48
220_L	238_L	1.241	0.47
147_E	435_L	1.233	0.47
268_R	271_R	1.232	0.47
199_K	401_V	1.232	0.47
101_I	287_N	1.231	0.47
117_R	344_S	1.222	0.46
287_N	366_F	1.215	0.46
23_F	265_W	1.213	0.46
13_I	17_T	1.206	0.46
257_M	308_F	1.205	0.45
28_Y	85_C	1.204	0.45
306_K	361_E	1.202	0.45
137_K	431_V	1.202	0.45
267_Q	287_N	1.195	0.45
333_R	336_M	1.194	0.45
190_D	195_L	1.184	0.44
355_K	359_M	1.184	0.44
101_I	286_L	1.180	0.44
420_G	424_D	1.178	0.44
60_Q	447_S	1.171	0.44
221_L	224_E	1.171	0.44
411_E	444_H	1.171	0.44
9_L	89_L	1.170	0.43
360_R	363_L	1.168	0.43
335_K	339_V	1.160	0.43
270_I	275_L	1.157	0.43
261_W	340_R	1.154	0.43
224_E	235_R	1.149	0.42
169_P	264_Y	1.148	0.42
65_K	306_K	1.148	0.42
212_P	261_W	1.136	0.42
183_E	216_E	1.135	0.42
66_L	252_L	1.125	0.41
255_K	423_L	1.118	0.41
358_V	363_L	1.117	0.41
110_D	337_F	1.113	0.40
310_D	314_R	1.110	0.40
202_K	205_K	1.108	0.40
306_K	309_E	1.097	0.39
74_K	102_V	1.091	0.39
198_K	201_K	1.090	0.39
30_M	109_C	1.089	0.39
51_R	294_S	1.084	0.39
185_A	188_P	1.084	0.39
9_L	435_L	1.083	0.39
19_I	357_L	1.083	0.39
53_S	133_A	1.082	0.39
209_K	213_P	1.082	0.39
319_T	322_M	1.077	0.38
310_D	313_K	1.074	0.38
307_I	384_R	1.073	0.38
375_I	378_K	1.072	0.38
31_R	56_S	1.071	0.38
200_P	452_K	1.055	0.37
324_K	357_L	1.041	0.36
119_Q	323_K	1.038	0.36
395_G	447_S	1.038	0.36
238_L	344_S	1.033	0.36
48_M	59_K	1.032	0.36
216_E	285_K	1.028	0.36
337_F	340_R	1.027	0.36
60_Q	137_K	1.026	0.36
117_R	409_N	1.022	0.35
264_Y	332_G	1.019	0.35
254_T	283_F	1.015	0.35
436_F	452_K	1.013	0.35
121_T	251_Q	1.012	0.35
327_V	330_D	1.011	0.35
60_Q	252_L	1.010	0.35
223_I	352_Y	1.010	0.35
257_M	348_F	1.007	0.35
179_E	204_V	1.002	0.34
35_C	98_N	1.001	0.34
18_E	21_K	1.001	0.34
17_T	269_I	1.000	0.34
147_E	231_E	0.999	0.34
245_M	252_L	0.999	0.34
78_L	255_K	0.995	0.34
71_G	235_R	0.994	0.34
34_I	328_Q	0.994	0.34
31_R	42_T	0.993	0.34
209_K	352_Y	0.992	0.34
87_A	261_W	0.989	0.34
151_F	375_I	0.986	0.34
220_L	242_R	0.981	0.33
51_R	292_Q	0.981	0.33
289_G	361_E	0.974	0.33
155_I	211_F	0.974	0.33
32_Y	50_T	0.972	0.33
322_M	325_M	0.970	0.33
89_L	265_W	0.968	0.33
101_I	344_S	0.968	0.33
155_I	344_S	0.965	0.33
384_R	388_V	0.962	0.32
112_F	251_Q	0.961	0.32
33_E	47_G	0.959	0.32
138_H	204_V	0.959	0.32
75_I	163_D	0.952	0.32
50_T	433_P	0.952	0.32
160_E	189_Y	0.951	0.32
363_L	371_R	0.950	0.32
56_S	82_S	0.947	0.32
51_R	244_E	0.947	0.32
88_F	98_N	0.946	0.32
107_A	166_L	0.946	0.32
152_L	220_L	0.943	0.31
10_Q	40_I	0.942	0.31
107_A	310_D	0.942	0.31
137_K	386_Q	0.940	0.31
245_M	364_Y	0.932	0.31
278_D	297_G	0.928	0.31
44_G	442_S	0.928	0.31
46_Y	51_R	0.923	0.31
429_E	435_L	0.920	0.30
204_V	403_D	0.919	0.30
24_G	95_L	0.913	0.30
350_R	357_L	0.911	0.30
244_E	312_E	0.910	0.30
201_K	453_E	0.906	0.30
24_G	323_K	0.905	0.30
162_I	313_K	0.904	0.30
53_S	428_L	0.903	0.30
451_D	454_V	0.903	0.30
375_I	442_S	0.900	0.29
291_V	367_Q	0.899	0.29
29_P	231_E	0.897	0.29
317_N	451_D	0.895	0.29
30_M	87_A	0.894	0.29
298_I	367_Q	0.891	0.29
36_P	307_I	0.886	0.29
237_I	395_G	0.885	0.29
171_L	350_R	0.883	0.29
51_R	435_L	0.882	0.29
12_A	16_I	0.882	0.29
29_P	303_L	0.880	0.28
32_Y	70_L	0.878	0.28
205_K	276_T	0.874	0.28
74_K	286_L	0.874	0.28
238_L	274_D	0.873	0.28
37_A	415_K	0.872	0.28
291_V	355_K	0.867	0.28
237_I	381_K	0.866	0.28
12_A	34_I	0.866	0.28
68_Y	80_I	0.865	0.28
71_G	291_V	0.864	0.28
176_D	200_P	0.856	0.27
366_F	375_I	0.856	0.27
20_A	144_G	0.856	0.27
99_K	279_E	0.855	0.27
419_E	422_E	0.851	0.27
205_K	435_L	0.846	0.27
164_P	288_A	0.844	0.27
101_I	253_E	0.842	0.27
119_Q	324_K	0.840	0.27
36_P	94_S	0.838	0.27
250_P	266_H	0.838	0.27
207_S	210_P	0.837	0.27
32_Y	362_D	0.835	0.26
223_I	435_L	0.835	0.26
203_Q	219_I	0.832	0.26
321_E	326_G	0.829	0.26
81_N	112_F	0.828	0.26
81_N	254_T	0.827	0.26
39_I	131_A	0.825	0.26
54_H	58_G	0.824	0.26
331_S	437_Q	0.822	0.26
352_Y	435_L	0.820	0.26
136_I	433_P	0.818	0.26
372_D	454_V	0.817	0.26
133_A	350_R	0.811	0.25
28_Y	57_F	0.811	0.25
5_E	143_H	0.811	0.25
179_E	201_K	0.810	0.25
223_I	438_L	0.810	0.25
39_I	43_F	0.809	0.25
63_K	255_K	0.809	0.25
74_K	101_I	0.806	0.25
19_I	23_F	0.806	0.25
265_W	340_R	0.805	0.25
222_F	247_Y	0.802	0.25
71_G	386_Q	0.801	0.25
270_I	280_A	0.800	0.25
160_E	396_F	0.799	0.25
363_L	445_I	0.794	0.25
219_I	334_E	0.793	0.25
292_Q	370_G	0.791	0.25
263_S	306_K	0.791	0.25
243_E	343_E	0.789	0.24
323_K	331_S	0.788	0.24
23_F	237_I	0.788	0.24
50_T	308_F	0.787	0.24
265_W	441_R	0.786	0.24
14_E	455_M	0.785	0.24
70_L	391_R	0.783	0.24
19_I	94_S	0.782	0.24
35_C	48_M	0.782	0.24
112_F	255_K	0.777	0.24
363_L	414_I	0.775	0.24
114_N	395_G	0.773	0.24
251_Q	254_T	0.773	0.24
253_E	394_G	0.772	0.24
23_F	341_E	0.770	0.24
185_A	189_Y	0.770	0.24
95_L	275_L	0.770	0.24
151_F	187_T	0.768	0.24
228_R	288_A	0.768	0.24
92_S	327_V	0.768	0.24
201_K	372_D	0.766	0.24
36_P	133_A	0.765	0.23
435_L	443_V	0.765	0.23
146_K	150_S	0.764	0.23
202_K	320_E	0.764	0.23
81_N	255_K	0.762	0.23
190_D	193_W	0.762	0.23
114_N	388_V	0.762	0.23
165_S	168_R	0.756	0.23
201_K	237_I	0.754	0.23
334_E	337_F	0.749	0.23
8_G	126_V	0.748	0.23
176_D	430_K	0.747	0.23
310_D	359_M	0.745	0.23
36_P	190_D	0.744	0.23
138_H	453_E	0.743	0.23
177_D	197_E	0.742	0.23
34_I	211_F	0.742	0.23
199_K	202_K	0.741	0.23
173_W	219_I	0.738	0.22
60_Q	63_K	0.738	0.22
388_V	432_L	0.737	0.22
102_V	170_K	0.733	0.22
238_L	431_V	0.732	0.22
44_G	114_N	0.731	0.22
96_I	167_V	0.731	0.22
288_A	431_V	0.731	0.22
189_Y	369_Q	0.730	0.22
38_E	273_L	0.730	0.22
298_I	363_L	0.729	0.22
432_L	435_L	0.729	0.22
315_Y	327_V	0.727	0.22
76_Y	251_Q	0.727	0.22
124_D	366_F	0.725	0.22
418_Y	424_D	0.721	0.22
74_K	344_S	0.721	0.22
418_Y	447_S	0.721	0.22
298_I	455_M	0.719	0.22
63_K	263_S	0.718	0.22
132_T	243_E	0.718	0.22
35_C	297_G	0.718	0.22
337_F	447_S	0.717	0.22
176_D	435_L	0.714	0.21
149_E	153_D	0.714	0.21
187_T	350_R	0.712	0.21
183_E	210_P	0.711	0.21
312_E	332_G	0.710	0.21
7_K	34_I	0.709	0.21
309_E	350_R	0.707	0.21
124_D	444_H	0.707	0.21
147_E	425_L	0.706	0.21
308_F	393_N	0.705	0.21
34_I	199_K	0.702	0.21
252_L	285_K	0.701	0.21
20_A	27_F	0.699	0.21
81_N	121_T	0.697	0.21
178_E	349_I	0.695	0.21
40_I	143_H	0.692	0.21
419_E	428_L	0.692	0.21
389_S	421_I	0.690	0.21
374_K	428_L	0.689	0.21
276_T	454_V	0.688	0.20
436_F	447_S	0.688	0.20
395_G	416_H	0.688	0.20
7_K	10_Q	0.687	0.20
425_L	449_L	0.687	0.20
113_K	234_Q	0.687	0.20
423_L	428_L	0.686	0.20
167_V	264_Y	0.685	0.20
48_M	56_S	0.685	0.20
252_L	395_G	0.684	0.20
39_I	247_Y	0.683	0.20
207_S	288_A	0.683	0.20
47_G	54_H	0.682	0.20
220_L	227_S	0.680	0.20
57_F	234_Q	0.680	0.20
198_K	435_L	0.679	0.20
286_L	344_S	0.678	0.20
219_I	420_G	0.675	0.20
220_L	320_E	0.674	0.20
8_G	95_L	0.674	0.20
402_N	432_L	0.674	0.20
12_A	99_K	0.674	0.20
123_R	290_V	0.673	0.20
44_G	245_M	0.671	0.20
405_D	408_K	0.670	0.20
228_R	408_K	0.670	0.20
272_E	416_H	0.668	0.20
443_V	451_D	0.668	0.20
43_F	82_S	0.667	0.20
60_Q	278_D	0.666	0.20
60_Q	337_F	0.666	0.20
92_S	315_Y	0.665	0.20
114_N	337_F	0.665	0.20
99_K	393_N	0.664	0.20
412_L	432_L	0.664	0.20
34_I	205_K	0.663	0.20
381_K	445_I	0.661	0.20
322_M	361_E	0.661	0.20
174_S	241_M	0.661	0.20
319_T	356_E	0.658	0.19
60_Q	66_L	0.657	0.19
422_E	447_S	0.657	0.19
150_S	428_L	0.656	0.19
125_M	247_Y	0.655	0.19
165_S	409_N	0.655	0.19
15_E	22_G	0.654	0.19
383_V	453_E	0.652	0.19
383_V	451_D	0.648	0.19
352_Y	451_D	0.648	0.19
150_S	154_A	0.646	0.19
181_E	184_E	0.645	0.19
132_T	267_Q	0.645	0.19
389_S	394_G	0.643	0.19
308_F	398_Y	0.643	0.19
232_P	435_L	0.642	0.19
146_K	402_N	0.641	0.19
106_L	261_W	0.639	0.19
201_K	204_V	0.638	0.19
24_G	219_I	0.636	0.19
71_G	74_K	0.636	0.19
252_L	396_F	0.636	0.19
29_P	290_V	0.634	0.19
74_K	379_Q	0.634	0.19
325_M	329_P	0.633	0.19
113_K	348_F	0.631	0.18
152_L	241_M	0.631	0.18
224_E	321_E	0.630	0.18
9_L	44_G	0.629	0.18
7_K	328_Q	0.629	0.18
201_K	324_K	0.628	0.18
65_K	385_D	0.628	0.18
327_V	361_E	0.627	0.18
209_K	382_S	0.625	0.18
102_V	363_L	0.625	0.18
23_F	273_L	0.625	0.18
268_R	385_D	0.624	0.18
124_D	442_S	0.623	0.18
82_S	85_C	0.623	0.18
22_G	201_K	0.622	0.18
251_Q	255_K	0.621	0.18
53_S	130_A	0.620	0.18
92_S	129_M	0.619	0.18
52_F	81_N	0.617	0.18
87_A	447_S	0.616	0.18
205_K	209_K	0.614	0.18
11_R	405_D	0.611	0.18
16_I	95_L	0.610	0.18
56_S	90_L	0.609	0.18
267_Q	305_L	0.609	0.18
234_Q	431_V	0.609	0.18
274_D	358_V	0.607	0.18
151_F	281_I	0.605	0.18
203_Q	450_E	0.605	0.18
38_E	355_K	0.604	0.18
49_P	93_N	0.603	0.18
82_S	290_V	0.602	0.17
268_R	333_R	0.602	0.17
415_K	448_V	0.602	0.17
210_P	399_L	0.602	0.17
180_E	383_V	0.600	0.17
156_L	379_Q	0.600	0.17
49_P	55_W	0.600	0.17
129_M	253_E	0.598	0.17
202_K	453_E	0.598	0.17
187_T	269_I	0.598	0.17
319_T	360_R	0.597	0.17
194_S	220_L	0.597	0.17
252_L	416_H	0.596	0.17
152_L	176_D	0.596	0.17
46_Y	395_G	0.593	0.17
320_E	356_E	0.592	0.17
21_K	202_K	0.592	0.17
179_E	198_K	0.591	0.17
322_M	331_S	0.589	0.17
75_I	99_K	0.588	0.17
238_L	375_I	0.588	0.17
273_L	403_D	0.587	0.17
76_Y	80_I	0.587	0.17
52_F	251_Q	0.587	0.17
373_Y	376_I	0.587	0.17
322_M	408_K	0.587	0.17
110_D	114_N	0.586	0.17
23_F	261_W	0.586	0.17
276_T	444_H	0.586	0.17
228_R	322_M	0.585	0.17
94_S	454_V	0.585	0.17
21_K	449_L	0.585	0.17
270_I	454_V	0.585	0.17
287_N	298_I	0.584	0.17
50_T	350_R	0.584	0.17
199_K	209_K	0.584	0.17
281_I	291_V	0.584	0.17
229_E	408_K	0.583	0.17
221_L	225_E	0.583	0.17
220_L	313_K	0.583	0.17
285_K	308_F	0.582	0.17
70_L	291_V	0.582	0.17
164_P	364_Y	0.582	0.17
76_Y	112_F	0.578	0.17
223_I	448_V	0.578	0.17
192_L	405_D	0.576	0.17
146_K	382_S	0.576	0.17
86_Y	109_C	0.575	0.17
315_Y	335_K	0.575	0.17
419_E	440_G	0.575	0.17
87_A	154_A	0.575	0.17
11_R	238_L	0.574	0.17
198_K	206_K	0.574	0.17
160_E	252_L	0.574	0.17
176_D	180_E	0.574	0.17
38_E	42_T	0.572	0.17
337_F	422_E	0.572	0.17
170_K	206_K	0.572	0.17
21_K	451_D	0.569	0.16
173_W	176_D	0.569	0.16
24_G	393_N	0.569	0.16
73_S	86_Y	0.569	0.16
273_L	438_L	0.567	0.16
399_L	435_L	0.567	0.16
275_L	436_F	0.567	0.16
14_E	323_K	0.564	0.16
24_G	226_H	0.564	0.16
256_I	332_G	0.564	0.16
179_E	317_N	0.563	0.16
87_A	338_E	0.562	0.16
182_I	190_D	0.561	0.16
40_I	145_I	0.560	0.16
87_A	365_L	0.560	0.16
10_Q	320_E	0.559	0.16
62_H	447_S	0.559	0.16
244_E	291_V	0.558	0.16
176_D	358_V	0.557	0.16
177_D	241_M	0.556	0.16
265_W	411_E	0.556	0.16
225_E	240_M	0.555	0.16
181_E	226_H	0.555	0.16
161_H	275_L	0.552	0.16
361_E	384_R	0.552	0.16
308_F	373_Y	0.552	0.16
204_V	219_I	0.550	0.16
50_T	363_L	0.550	0.16
229_E	407_M	0.549	0.16
70_L	101_I	0.548	0.16
183_E	451_D	0.547	0.16
60_Q	395_G	0.547	0.16
56_S	391_R	0.546	0.16
11_R	450_E	0.544	0.16
119_Q	341_E	0.544	0.16
201_K	281_I	0.544	0.16
236_D	239_T	0.544	0.16
225_E	325_M	0.544	0.16
146_K	453_E	0.544	0.16
177_D	181_E	0.543	0.16
142_V	145_I	0.542	0.16
161_H	350_R	0.541	0.16
446_E	453_E	0.541	0.16
121_T	283_F	0.541	0.16
444_H	450_E	0.540	0.16
181_E	194_S	0.539	0.16
158_I	368_K	0.539	0.16
30_M	101_I	0.538	0.15
206_K	417_W	0.538	0.15
189_Y	193_W	0.537	0.15
11_R	22_G	0.537	0.15
150_S	213_P	0.536	0.15
20_A	349_I	0.536	0.15
46_Y	383_V	0.536	0.15
110_D	344_S	0.536	0.15
178_E	226_H	0.535	0.15
298_I	307_I	0.534	0.15
307_I	310_D	0.534	0.15
268_R	272_E	0.534	0.15
170_K	349_I	0.534	0.15
209_K	389_S	0.533	0.15
201_K	206_K	0.532	0.15
8_G	116_C	0.532	0.15
63_K	189_Y	0.532	0.15
315_Y	330_D	0.531	0.15
119_Q	328_Q	0.531	0.15
317_N	419_E	0.531	0.15
212_P	340_R	0.530	0.15
44_G	252_L	0.530	0.15
188_P	192_L	0.529	0.15
221_L	303_L	0.528	0.15
272_E	447_S	0.527	0.15
169_P	360_R	0.526	0.15
53_S	62_H	0.526	0.15
83_D	367_Q	0.525	0.15
173_W	179_E	0.525	0.15
309_E	378_K	0.524	0.15
28_Y	109_C	0.524	0.15
314_R	354_T	0.524	0.15
36_P	452_K	0.523	0.15
80_I	251_Q	0.523	0.15
256_I	265_W	0.523	0.15
32_Y	131_A	0.522	0.15
44_G	163_D	0.522	0.15
105_V	218_D	0.522	0.15
71_G	147_E	0.520	0.15
255_K	298_I	0.520	0.15
201_K	231_E	0.519	0.15
133_A	244_E	0.519	0.15
18_E	158_I	0.519	0.15
431_V	435_L	0.519	0.15
248_F	266_H	0.518	0.15
5_E	383_V	0.518	0.15
343_E	351_N	0.517	0.15
138_H	324_K	0.516	0.15
103_A	222_F	0.516	0.15
206_K	317_N	0.515	0.15
152_L	165_S	0.515	0.15
175_V	452_K	0.515	0.15
5_E	378_K	0.514	0.15
270_I	279_E	0.514	0.15
124_D	263_S	0.514	0.15
173_W	220_L	0.513	0.15
68_Y	81_N	0.513	0.15
217_K	249_W	0.512	0.15
252_L	447_S	0.512	0.15
26_D	341_E	0.512	0.15
177_D	185_A	0.511	0.15
14_E	375_I	0.511	0.15
50_T	133_A	0.510	0.15
306_K	357_L	0.509	0.15
283_F	347_S	0.509	0.15
46_Y	309_E	0.508	0.15
315_Y	322_M	0.508	0.15
8_G	437_Q	0.507	0.15
322_M	438_L	0.506	0.15
39_I	125_M	0.506	0.15
170_K	263_S	0.504	0.15
9_L	349_I	0.504	0.15
67_H	419_E	0.504	0.15
80_I	121_T	0.503	0.14
102_V	278_D	0.502	0.14
176_D	203_Q	0.502	0.14
208_K	320_E	0.502	0.14
102_V	142_V	0.501	0.14
40_I	126_V	0.501	0.14
317_N	425_L	0.501	0.14
334_E	448_V	0.501	0.14
91_D	297_G	0.501	0.14
141_Q	383_V	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cqbA	4	0.188	71.5	0.979	Contact Map
3rjoA	1	0.1154	24.6	0.984	Contact Map
4il3A	1	0.4209	23.1	0.984	Contact Map
4g54A	1	0.1132	22.9	0.984	Contact Map
3c7aA	1	0.3162	20.8	0.985	Contact Map
1i76A	1	0.2756	20.2	0.985	Contact Map
4qhjA	2	0.2222	13.5	0.986	Contact Map
3nkqA	1	0.1047	13.4	0.986	Contact Map
4aw6A	2	0.3419	13.3	0.986	Contact Map
4xctA	1	0.2863	11.8	0.986	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.012 seconds.