YGXB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YGXB - Uncharacterized protein YgxB

UniProt:	P37874	Sequences: MYEPARQKMIVSLGQEKIPPAHSSVCLLDKWVNTHHTTKKERYQLNVADVFSSYLSKLPNVIIALLVLLIGWAIAKIIEKAVYKGLSKTKIDDKLFAGKKPSRYSSEKVISKVVYFIALIIVFILFFNILHLTTVASPFVSMLSAIAAAIPSVLKAGLILLLGWAAASVLSFLVKKIGMKLNTSDKLRKWNLVSEGKDIHQAVNTASQIVFYLVLLVFLPGVLSSLKISGISGPFTNMMESVLAFLPKLFAAALIVLIGWLVARLVRDIITNFLASIGTERFAARMGLSIYLKDTSLSAVIGTIAYVLIMIPVVISALDQLDVAGISKPAVSMLNTILNMLPNIMIAIVLVLAGIWAGKWVKSMVSGLLHRAGFDSVLGKMGMEAGTPAKLSLSQVVGMIAQIIVILLFTAEALQIVRLHFLVEIATGIIAYLPNVLVAVFILGLGLYAGELVRKVLASMIKGQEFKSLAPIAKYTIIALAFFMALDQLGVAATIVNSAFIIVLSGFALAFGLSFGLGGKDFASRYLSTFERKMQNTEIEKNRKNQNPPNDM	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	552 (480)
Sequences:	149 (113)
Seq/√Len:	5.1

BACSU - YGXB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
280_E	298_S	4.967	0.97
170_L	214_V	4.399	0.94
519_G	527_L	4.162	0.92
122_V	126_F	3.998	0.90
370_H	375_D	3.655	0.86
346_I	412_E	3.099	0.74
264_R	306_Y	2.946	0.70
315_I	513_L	2.932	0.70
203_V	409_F	2.819	0.67
78_I	81_A	2.751	0.65
171_S	309_I	2.659	0.62
245_F	251_A	2.630	0.61
522_F	527_L	2.613	0.60
358_G	402_Q	2.550	0.58
257_L	261_L	2.495	0.57
316_S	319_D	2.476	0.56
105_S	109_V	2.456	0.55
78_I	115_Y	2.420	0.54
119_L	122_V	2.401	0.54
441_F	449_A	2.354	0.52
214_V	397_V	2.293	0.50
352_L	442_I	2.290	0.50
426_A	457_L	2.215	0.48
73_A	135_V	2.210	0.47
78_I	430_I	2.205	0.47
126_F	169_V	2.139	0.45
344_I	404_I	2.102	0.44
235_F	305_A	2.095	0.44
361_V	405_V	2.079	0.43
169_V	172_F	2.070	0.43
239_M	491_V	2.032	0.42
61_V	238_M	1.994	0.40
294_D	476_T	1.986	0.40
170_L	210_V	1.964	0.39
187_L	496_V	1.961	0.39
116_F	270_I	1.959	0.39
408_L	506_G	1.958	0.39
120_I	142_M	1.948	0.39
364_M	506_G	1.948	0.39
110_I	172_F	1.915	0.38
276_S	375_D	1.900	0.37
301_I	470_A	1.861	0.36
235_F	249_L	1.849	0.36
301_I	361_V	1.842	0.36
323_V	496_V	1.808	0.35
483_F	489_L	1.806	0.35
224_S	230_G	1.792	0.34
122_V	457_L	1.790	0.34
480_L	484_M	1.786	0.34
267_R	344_I	1.776	0.34
103_R	123_F	1.750	0.33
262_V	506_G	1.749	0.33
70_I	251_A	1.746	0.33
443_L	513_L	1.743	0.33
231_I	254_L	1.739	0.33
474_K	498_S	1.735	0.32
248_K	322_D	1.727	0.32
217_V	441_F	1.724	0.32
128_N	527_L	1.722	0.32
77_I	397_V	1.710	0.32
98_G	109_V	1.701	0.32
439_A	489_L	1.676	0.31
165_A	177_I	1.657	0.30
251_A	320_Q	1.640	0.30
89_T	92_D	1.636	0.30
153_V	481_A	1.634	0.30
521_D	524_S	1.633	0.30
269_I	504_L	1.627	0.29
361_V	401_A	1.620	0.29
275_A	466_F	1.612	0.29
221_G	231_I	1.611	0.29
142_M	146_I	1.601	0.29
375_D	396_V	1.601	0.29
118_A	249_L	1.587	0.28
66_L	361_V	1.581	0.28
309_I	356_W	1.577	0.28
248_K	409_F	1.576	0.28
89_T	93_D	1.553	0.27
220_P	230_G	1.553	0.27
162_L	507_F	1.549	0.27
433_L	436_V	1.549	0.27
414_L	419_L	1.545	0.27
110_I	480_L	1.542	0.27
262_V	436_V	1.541	0.27
249_L	529_T	1.532	0.27
313_V	341_L	1.522	0.27
378_L	478_I	1.522	0.27
340_M	439_A	1.518	0.27
172_F	361_V	1.504	0.26
344_I	415_Q	1.501	0.26
368_L	436_V	1.498	0.26
310_M	416_I	1.492	0.26
162_L	198_D	1.491	0.26
258_I	261_L	1.491	0.26
186_K	209_I	1.488	0.26
94_K	467_K	1.485	0.26
221_G	251_A	1.483	0.26
187_L	287_G	1.482	0.26
354_G	409_F	1.473	0.25
94_K	344_I	1.470	0.25
170_L	445_L	1.470	0.25
127_F	395_Q	1.469	0.25
214_V	418_R	1.465	0.25
166_A	476_T	1.463	0.25
171_S	478_I	1.463	0.25
408_L	430_I	1.459	0.25
428_G	438_V	1.451	0.25
222_V	281_R	1.450	0.25
122_V	453_V	1.444	0.25
337_I	344_I	1.440	0.25
156_A	226_L	1.439	0.25
301_I	304_I	1.439	0.25
433_L	485_A	1.434	0.24
66_L	341_L	1.431	0.24
115_Y	121_I	1.418	0.24
343_N	371_R	1.416	0.24
183_T	344_I	1.412	0.24
529_T	535_Q	1.405	0.24
101_P	401_A	1.400	0.24
242_V	345_M	1.400	0.24
262_V	349_V	1.391	0.23
185_D	455_K	1.388	0.23
133_T	137_S	1.387	0.23
227_K	304_I	1.385	0.23
88_K	428_G	1.383	0.23
87_S	126_F	1.382	0.23
269_I	337_I	1.377	0.23
221_G	224_S	1.376	0.23
120_I	425_I	1.372	0.23
439_A	483_F	1.372	0.23
211_F	215_L	1.369	0.23
453_V	530_F	1.365	0.23
517_L	520_K	1.365	0.23
267_R	272_N	1.361	0.23
150_I	154_L	1.361	0.23
422_L	447_L	1.353	0.23
309_I	353_A	1.349	0.22
106_S	359_K	1.336	0.22
76_K	489_L	1.336	0.22
350_L	416_I	1.334	0.22
156_A	266_V	1.331	0.22
207_S	222_V	1.326	0.22
246_L	409_F	1.316	0.22
404_I	433_L	1.314	0.22
349_V	514_S	1.312	0.22
261_L	521_D	1.308	0.22
114_V	240_E	1.308	0.22
357_A	405_V	1.304	0.21
319_D	331_V	1.302	0.21
414_L	425_I	1.283	0.21
275_A	457_L	1.281	0.21
331_V	400_I	1.279	0.21
64_A	330_A	1.278	0.21
260_W	382_G	1.276	0.21
150_I	530_F	1.274	0.21
175_K	207_S	1.269	0.21
374_F	393_L	1.263	0.21
146_I	244_A	1.262	0.21
239_M	244_A	1.256	0.20
109_V	380_K	1.253	0.20
127_F	288_L	1.245	0.20
85_G	224_S	1.243	0.20
136_A	214_V	1.242	0.20
406_I	409_F	1.239	0.20
90_K	93_D	1.238	0.20
142_M	412_E	1.237	0.20
149_A	281_R	1.235	0.20
265_L	273_F	1.234	0.20
120_I	384_E	1.233	0.20
208_Q	276_S	1.230	0.20
117_I	397_V	1.230	0.20
238_M	245_F	1.226	0.20
375_D	394_S	1.225	0.20
142_M	229_S	1.221	0.20
202_A	368_L	1.210	0.19
498_S	501_I	1.205	0.19
258_I	524_S	1.202	0.19
513_L	517_L	1.201	0.19
280_E	457_L	1.199	0.19
120_I	419_L	1.196	0.19
240_E	397_V	1.192	0.19
182_N	254_L	1.189	0.19
220_P	239_M	1.187	0.19
127_F	175_K	1.186	0.19
161_L	475_Y	1.185	0.19
222_V	504_L	1.185	0.19
116_F	136_A	1.184	0.19
109_V	433_L	1.183	0.19
350_L	412_E	1.179	0.19
75_A	510_A	1.178	0.19
267_R	338_L	1.174	0.19
211_F	384_E	1.161	0.18
405_V	440_V	1.152	0.18
228_I	305_A	1.149	0.18
203_V	354_G	1.147	0.18
411_A	453_V	1.145	0.18
424_E	440_V	1.143	0.18
69_L	161_L	1.142	0.18
63_I	147_A	1.139	0.18
261_L	464_Q	1.137	0.18
435_N	494_T	1.133	0.18
59_P	427_T	1.132	0.18
155_K	306_Y	1.126	0.18
100_K	341_L	1.123	0.18
251_A	261_L	1.122	0.18
286_M	366_S	1.121	0.18
221_G	245_F	1.121	0.18
63_I	126_F	1.121	0.18
436_V	485_A	1.115	0.18
360_W	506_G	1.113	0.18
80_K	153_V	1.109	0.17
116_F	323_V	1.109	0.17
82_V	250_F	1.106	0.17
79_E	142_M	1.105	0.17
483_F	512_G	1.104	0.17
81_A	470_A	1.100	0.17
466_F	482_F	1.097	0.17
425_I	428_G	1.094	0.17
170_L	400_I	1.093	0.17
70_I	375_D	1.090	0.17
444_G	453_V	1.090	0.17
258_I	335_N	1.090	0.17
220_P	224_S	1.088	0.17
118_A	208_Q	1.084	0.17
70_I	111_S	1.084	0.17
93_D	107_E	1.081	0.17
173_L	209_I	1.079	0.17
65_L	196_G	1.074	0.17
231_I	238_M	1.074	0.17
265_L	430_I	1.074	0.17
445_L	467_K	1.072	0.17
282_F	411_A	1.067	0.17
272_N	410_T	1.064	0.17
95_L	371_R	1.057	0.16
56_S	383_M	1.055	0.16
120_I	180_K	1.053	0.16
143_L	260_W	1.052	0.16
74_I	514_S	1.052	0.16
117_I	525_R	1.049	0.16
61_V	375_D	1.045	0.16
358_G	441_F	1.044	0.16
74_I	115_Y	1.043	0.16
149_A	225_S	1.039	0.16
172_F	182_N	1.039	0.16
174_V	207_S	1.037	0.16
240_E	445_L	1.035	0.16
188_R	481_A	1.032	0.16
153_V	257_L	1.030	0.16
139_F	297_L	1.025	0.16
284_A	400_I	1.025	0.16
278_G	373_G	1.023	0.16
356_W	359_K	1.018	0.16
341_L	384_E	1.018	0.16
228_I	236_T	1.017	0.16
126_F	173_L	1.017	0.16
228_I	232_S	1.017	0.16
119_L	173_L	1.016	0.16
250_F	309_I	1.014	0.16
507_F	511_F	1.013	0.16
175_K	253_A	1.012	0.16
341_L	414_L	1.010	0.16
221_G	225_S	1.010	0.16
54_Y	536_N	1.009	0.16
157_G	361_V	1.008	0.16
302_G	496_V	1.004	0.16
127_F	525_R	1.002	0.15
217_V	416_I	1.001	0.15
69_L	79_E	1.001	0.15
340_M	506_G	1.000	0.15
442_I	456_V	0.999	0.15
206_A	521_D	0.988	0.15
74_I	169_V	0.986	0.15
155_K	445_L	0.986	0.15
118_A	131_H	0.984	0.15
101_P	265_L	0.982	0.15
119_L	341_L	0.978	0.15
254_L	476_T	0.972	0.15
213_L	392_S	0.971	0.15
241_S	366_S	0.969	0.15
525_R	528_S	0.967	0.15
182_N	335_N	0.962	0.15
235_F	397_V	0.961	0.15
274_L	478_I	0.960	0.15
501_I	512_G	0.955	0.15
60_N	83_Y	0.952	0.15
509_L	512_G	0.951	0.15
301_I	434_P	0.949	0.15
80_K	84_K	0.949	0.15
520_K	529_T	0.948	0.15
307_V	344_I	0.945	0.15
337_I	349_V	0.944	0.15
139_F	242_V	0.942	0.14
359_K	426_A	0.940	0.14
296_S	460_M	0.938	0.14
95_L	336_T	0.936	0.14
467_K	513_L	0.936	0.14
160_L	215_L	0.932	0.14
77_I	87_S	0.931	0.14
283_A	374_F	0.930	0.14
348_I	352_L	0.929	0.14
299_A	514_S	0.929	0.14
185_D	188_R	0.927	0.14
245_F	513_L	0.922	0.14
105_S	147_A	0.919	0.14
142_M	332_S	0.907	0.14
70_I	121_I	0.904	0.14
209_I	242_V	0.902	0.14
88_K	176_K	0.901	0.14
149_A	470_A	0.900	0.14
162_L	353_A	0.897	0.14
90_K	449_A	0.896	0.14
294_D	357_A	0.896	0.14
270_I	273_F	0.894	0.14
177_I	319_D	0.894	0.14
176_K	384_E	0.894	0.14
146_I	220_P	0.889	0.14
50_V	457_L	0.889	0.14
145_A	153_V	0.886	0.14
201_Q	248_K	0.885	0.14
282_F	344_I	0.884	0.14
434_P	501_I	0.884	0.14
135_V	240_E	0.884	0.14
405_V	456_V	0.880	0.14
165_A	170_L	0.880	0.14
120_I	406_I	0.879	0.13
145_A	249_L	0.877	0.13
410_T	527_L	0.876	0.13
213_L	497_N	0.874	0.13
91_I	313_V	0.871	0.13
406_I	449_A	0.871	0.13
289_S	313_V	0.869	0.13
269_I	344_I	0.867	0.13
61_V	354_G	0.863	0.13
76_K	110_I	0.863	0.13
253_A	441_F	0.861	0.13
224_S	229_S	0.859	0.13
503_V	511_F	0.858	0.13
116_F	139_F	0.857	0.13
70_I	128_N	0.857	0.13
176_K	442_I	0.857	0.13
438_V	485_A	0.856	0.13
166_A	221_G	0.855	0.13
361_V	365_V	0.854	0.13
209_I	300_V	0.851	0.13
119_L	123_F	0.849	0.13
355_I	475_Y	0.848	0.13
231_I	419_L	0.848	0.13
53_S	78_I	0.847	0.13
175_K	353_A	0.847	0.13
316_S	506_G	0.846	0.13
210_V	288_L	0.845	0.13
115_Y	122_V	0.843	0.13
63_I	506_G	0.842	0.13
283_A	391_L	0.840	0.13
226_L	398_G	0.840	0.13
396_V	470_A	0.840	0.13
213_L	298_S	0.837	0.13
139_F	163_G	0.836	0.13
439_A	509_L	0.836	0.13
257_L	400_I	0.833	0.13
360_W	408_L	0.831	0.13
83_Y	357_A	0.829	0.13
157_G	279_T	0.829	0.13
184_S	350_L	0.829	0.13
95_L	122_V	0.827	0.13
498_S	512_G	0.826	0.13
93_D	121_I	0.824	0.13
94_K	337_I	0.822	0.13
315_I	502_I	0.820	0.13
174_V	256_V	0.819	0.13
176_K	182_N	0.818	0.13
274_L	280_E	0.818	0.13
436_V	442_I	0.816	0.13
294_D	316_S	0.813	0.13
320_Q	406_I	0.811	0.12
117_I	476_T	0.810	0.12
122_V	148_A	0.809	0.12
123_F	397_V	0.808	0.12
73_A	524_S	0.808	0.12
242_V	246_L	0.807	0.12
132_L	287_G	0.806	0.12
483_F	501_I	0.806	0.12
411_A	506_G	0.805	0.12
340_M	349_V	0.805	0.12
119_L	445_L	0.804	0.12
135_V	375_D	0.803	0.12
266_V	309_I	0.803	0.12
350_L	512_G	0.801	0.12
482_F	513_L	0.801	0.12
59_P	170_L	0.799	0.12
260_W	507_F	0.799	0.12
475_Y	509_L	0.794	0.12
436_V	439_A	0.794	0.12
349_V	442_I	0.793	0.12
442_I	482_F	0.792	0.12
92_D	314_V	0.792	0.12
106_S	123_F	0.792	0.12
124_I	465_E	0.790	0.12
157_G	289_S	0.789	0.12
55_L	276_S	0.788	0.12
261_L	405_V	0.787	0.12
185_D	203_V	0.786	0.12
66_L	158_L	0.786	0.12
210_V	477_I	0.784	0.12
312_P	358_G	0.784	0.12
233_G	270_I	0.783	0.12
360_W	496_V	0.782	0.12
179_M	430_I	0.781	0.12
243_L	436_V	0.780	0.12
253_A	353_A	0.780	0.12
78_I	261_L	0.779	0.12
109_V	343_N	0.778	0.12
279_T	352_L	0.777	0.12
268_D	293_K	0.775	0.12
115_Y	314_V	0.774	0.12
143_L	531_E	0.774	0.12
276_S	489_L	0.773	0.12
358_G	491_V	0.773	0.12
235_F	262_V	0.773	0.12
109_V	264_R	0.772	0.12
239_M	397_V	0.769	0.12
319_D	506_G	0.769	0.12
123_F	360_W	0.769	0.12
182_N	185_D	0.768	0.12
98_G	105_S	0.768	0.12
443_L	517_L	0.767	0.12
471_P	503_V	0.766	0.12
68_L	89_T	0.765	0.12
146_I	159_I	0.764	0.12
237_N	240_E	0.763	0.12
222_V	269_I	0.759	0.12
188_R	268_D	0.759	0.12
170_L	392_S	0.759	0.12
128_N	356_W	0.759	0.12
128_N	519_G	0.758	0.12
207_S	215_L	0.755	0.12
124_I	150_I	0.754	0.12
459_S	488_Q	0.754	0.12
162_L	429_I	0.752	0.12
227_K	350_L	0.751	0.12
69_L	97_A	0.748	0.12
348_I	416_I	0.748	0.12
162_L	288_L	0.745	0.12
404_I	448_Y	0.743	0.12
416_I	422_L	0.742	0.12
181_L	187_L	0.742	0.12
176_K	265_L	0.740	0.11
152_S	513_L	0.739	0.11
411_A	414_L	0.737	0.11
427_T	504_L	0.736	0.11
276_S	299_A	0.735	0.11
242_V	372_A	0.734	0.11
316_S	494_T	0.733	0.11
111_S	528_S	0.731	0.11
225_S	521_D	0.728	0.11
320_Q	439_A	0.728	0.11
433_L	489_L	0.727	0.11
115_Y	504_L	0.727	0.11
65_L	361_V	0.726	0.11
154_L	449_A	0.726	0.11
65_L	77_I	0.726	0.11
119_L	415_Q	0.724	0.11
417_V	474_K	0.723	0.11
88_K	444_G	0.722	0.11
157_G	284_A	0.719	0.11
64_A	130_L	0.718	0.11
294_D	445_L	0.715	0.11
123_F	325_G	0.715	0.11
188_R	230_G	0.714	0.11
72_W	122_V	0.713	0.11
60_N	427_T	0.713	0.11
113_V	475_Y	0.713	0.11
145_A	368_L	0.711	0.11
161_L	441_F	0.711	0.11
409_F	512_G	0.710	0.11
231_I	268_D	0.710	0.11
442_I	487_D	0.706	0.11
415_Q	507_F	0.705	0.11
440_V	527_L	0.704	0.11
82_V	261_L	0.703	0.11
61_V	131_H	0.702	0.11
228_I	501_I	0.701	0.11
128_N	268_D	0.699	0.11
76_K	419_L	0.699	0.11
215_L	344_I	0.698	0.11
188_R	383_M	0.697	0.11
262_V	514_S	0.697	0.11
225_S	300_V	0.696	0.11
110_I	133_T	0.694	0.11
239_M	380_K	0.693	0.11
174_V	331_V	0.691	0.11
143_L	422_L	0.690	0.11
276_S	377_V	0.689	0.11
460_M	471_P	0.689	0.11
119_L	169_V	0.688	0.11
221_G	230_G	0.687	0.11
98_G	380_K	0.687	0.11
400_I	493_A	0.686	0.11
65_L	335_N	0.685	0.11
256_V	530_F	0.683	0.11
254_L	396_V	0.682	0.11
476_T	504_L	0.681	0.11
215_L	304_I	0.680	0.11
267_R	395_Q	0.680	0.11
284_A	331_V	0.678	0.11
352_L	445_L	0.677	0.11
261_L	337_I	0.677	0.11
52_S	133_T	0.676	0.11
54_Y	467_K	0.673	0.11
174_V	436_V	0.670	0.11
166_A	491_V	0.667	0.11
131_H	279_T	0.667	0.11
494_T	527_L	0.667	0.11
69_L	339_N	0.666	0.11
70_I	514_S	0.665	0.11
278_G	473_A	0.665	0.11
211_F	214_V	0.665	0.11
300_V	313_V	0.664	0.11
171_S	208_Q	0.664	0.11
270_I	413_A	0.664	0.11
217_V	321_L	0.663	0.11
227_K	491_V	0.662	0.10
521_D	528_S	0.662	0.10
82_V	262_V	0.661	0.10
120_I	254_L	0.661	0.10
243_L	274_L	0.659	0.10
153_V	166_A	0.659	0.10
314_V	503_V	0.658	0.10
58_L	524_S	0.657	0.10
237_N	519_G	0.656	0.10
56_S	165_A	0.655	0.10
212_Y	512_G	0.652	0.10
119_L	343_N	0.652	0.10
72_W	119_L	0.652	0.10
143_L	306_Y	0.652	0.10
412_E	415_Q	0.651	0.10
217_V	392_S	0.649	0.10
408_L	494_T	0.649	0.10
350_L	439_A	0.647	0.10
337_I	454_R	0.646	0.10
141_S	244_A	0.646	0.10
282_F	521_D	0.645	0.10
225_S	242_V	0.644	0.10
111_S	289_S	0.643	0.10
158_L	248_K	0.642	0.10
295_T	300_V	0.640	0.10
96_F	530_F	0.639	0.10
214_V	375_D	0.638	0.10
368_L	406_I	0.637	0.10
438_V	442_I	0.636	0.10
228_I	287_G	0.636	0.10
444_G	451_E	0.634	0.10
162_L	241_S	0.631	0.10
154_L	509_L	0.631	0.10
511_F	530_F	0.630	0.10
211_F	450_G	0.627	0.10
467_K	478_I	0.627	0.10
117_I	265_L	0.627	0.10
121_I	433_L	0.626	0.10
62_I	468_S	0.624	0.10
409_F	434_P	0.623	0.10
180_K	341_L	0.622	0.10
230_G	359_K	0.622	0.10
53_S	244_A	0.620	0.10
102_S	222_V	0.618	0.10
314_V	370_H	0.618	0.10
276_S	530_F	0.618	0.10
503_V	535_Q	0.618	0.10
61_V	239_M	0.617	0.10
88_K	311_I	0.616	0.10
233_G	240_E	0.616	0.10
133_T	324_A	0.615	0.10
82_V	357_A	0.614	0.10
70_I	525_R	0.614	0.10
173_L	384_E	0.614	0.10
172_F	177_I	0.612	0.10
171_S	242_V	0.612	0.10
162_L	237_N	0.612	0.10
90_K	222_V	0.611	0.10
430_I	479_A	0.611	0.10
240_E	536_N	0.610	0.10
330_A	452_L	0.610	0.10
241_S	494_T	0.609	0.10
113_V	294_D	0.609	0.10
144_S	249_L	0.608	0.10
59_P	62_I	0.606	0.10
432_Y	438_V	0.606	0.10
235_F	431_A	0.605	0.10
267_R	365_V	0.604	0.10
184_S	503_V	0.600	0.10
123_F	524_S	0.598	0.10
296_S	375_D	0.598	0.10
422_L	478_I	0.596	0.10
283_A	447_L	0.596	0.10
169_V	177_I	0.596	0.10
92_D	447_L	0.596	0.10
450_G	501_I	0.596	0.10
187_L	372_A	0.593	0.10
118_A	383_M	0.593	0.10
222_V	303_T	0.592	0.10
448_Y	472_I	0.592	0.10
352_L	525_R	0.592	0.10
273_F	437_L	0.591	0.10
129_I	173_L	0.590	0.10
103_R	239_M	0.588	0.10
62_I	154_L	0.588	0.10
337_I	430_I	0.588	0.10
408_L	425_I	0.587	0.10
360_W	494_T	0.587	0.10
109_V	456_V	0.583	0.10
213_L	452_L	0.581	0.10
448_Y	489_L	0.581	0.10
264_R	299_A	0.581	0.10
331_V	406_I	0.580	0.10
444_G	470_A	0.579	0.10
223_L	228_I	0.577	0.09
165_A	200_H	0.575	0.09
212_Y	325_G	0.575	0.09
304_I	313_V	0.574	0.09
312_P	318_L	0.573	0.09
111_S	390_K	0.573	0.09
243_L	298_S	0.572	0.09
378_L	534_M	0.571	0.09
119_L	464_Q	0.571	0.09
134_T	445_L	0.571	0.09
279_T	357_A	0.569	0.09
440_V	524_S	0.569	0.09
131_H	169_V	0.569	0.09
408_L	415_Q	0.569	0.09
265_L	341_L	0.568	0.09
82_V	114_V	0.567	0.09
354_G	405_V	0.567	0.09
58_L	294_D	0.567	0.09
350_L	513_L	0.567	0.09
349_V	357_A	0.566	0.09
70_I	171_S	0.566	0.09
69_L	298_S	0.566	0.09
56_S	262_V	0.564	0.09
162_L	222_V	0.564	0.09
186_K	396_V	0.563	0.09
276_S	506_G	0.562	0.09
91_I	411_A	0.562	0.09
64_A	223_L	0.559	0.09
157_G	441_F	0.559	0.09
111_S	372_A	0.558	0.09
225_S	268_D	0.558	0.09
109_V	472_I	0.558	0.09
419_L	454_R	0.557	0.09
232_S	235_F	0.557	0.09
62_I	472_I	0.557	0.09
250_F	458_A	0.556	0.09
341_L	419_L	0.556	0.09
359_K	529_T	0.554	0.09
350_L	417_V	0.553	0.09
106_S	118_A	0.553	0.09
364_M	509_L	0.553	0.09
63_I	408_L	0.552	0.09
152_S	476_T	0.551	0.09
166_A	475_Y	0.551	0.09
232_S	483_F	0.548	0.09
362_K	481_A	0.548	0.09
232_S	509_L	0.548	0.09
67_V	409_F	0.547	0.09
330_A	334_L	0.547	0.09
108_K	458_A	0.545	0.09
325_G	483_F	0.545	0.09
70_I	95_L	0.543	0.09
84_K	87_S	0.543	0.09
321_L	504_L	0.542	0.09
104_Y	344_I	0.541	0.09
326_I	497_N	0.541	0.09
250_F	529_T	0.541	0.09
94_K	124_I	0.539	0.09
406_I	491_V	0.535	0.09
250_F	269_I	0.534	0.09
231_I	264_R	0.533	0.09
227_K	532_R	0.533	0.09
106_S	356_W	0.531	0.09
401_A	504_L	0.530	0.09
270_I	437_L	0.529	0.09
203_V	270_I	0.528	0.09
232_S	501_I	0.528	0.09
432_Y	496_V	0.528	0.09
62_I	157_G	0.527	0.09
439_A	506_G	0.526	0.09
81_A	161_L	0.525	0.09
447_L	478_I	0.525	0.09
309_I	355_I	0.524	0.09
400_I	429_I	0.523	0.09
143_L	447_L	0.522	0.09
79_E	348_I	0.522	0.09
112_K	265_L	0.520	0.09
456_V	496_V	0.520	0.09
94_K	456_V	0.519	0.09
178_G	206_A	0.519	0.09
113_V	183_T	0.519	0.09
166_A	217_V	0.517	0.09
65_L	359_K	0.517	0.09
264_R	281_R	0.516	0.09
91_I	141_S	0.516	0.09
101_P	115_Y	0.516	0.09
307_V	312_P	0.515	0.09
279_T	396_V	0.513	0.09
149_A	152_S	0.512	0.09
102_S	356_W	0.511	0.09
106_S	188_R	0.510	0.09
187_L	315_I	0.510	0.09
154_L	536_N	0.510	0.09
98_G	472_I	0.508	0.09
59_P	380_K	0.507	0.09
248_K	439_A	0.506	0.09
397_V	400_I	0.505	0.09
181_L	403_I	0.503	0.09
258_I	273_F	0.502	0.09
264_R	324_A	0.502	0.09
434_P	512_G	0.502	0.09
346_I	350_L	0.501	0.09
246_L	350_L	0.501	0.09
238_M	261_L	0.500	0.09
111_S	478_I	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4hw9A	3	0.2047	97	0.965	Contact Map
5ajiA	3	0.2192	96.4	0.967	Contact Map
3udcA	3	0.2083	94.3	0.972	Contact Map
3tx3A	2	0.3188	22.1	0.985	Contact Map
1j4nA	4	0.3822	15.7	0.986	Contact Map
2zz9A	3	0.3442	11	0.987	Contact Map
2kncA	1	0.0942	9.1	0.988	Contact Map
2dbhA	1	0.1105	6.8	0.988	Contact Map
3h8kB	1	0.0217	5.2	0.989	Contact Map
2l16A	1	0.087	5.2	0.989	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0127 seconds.