YABN - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YABN - Uncharacterized protein YabN

UniProt:	P37556	Sequences: MAGKITVVGLGAGDMDQLTIGIHKLLTKADTLYVRTKDHPLIEELEKETKNIRFFDDIYEKHDQFEAVYEEIADILFEAARREDVVYAVPGHPFVAEKTVQLLTERQEKENVQVKVAGGQSFLDATFNVLQIDPIEGFQFVDAGTLSADELELRHHLIICQVYDQMTASEVKLTLMEKLPDDYEVVIVTAAGSRGEEIRTVPLFELDRNVALNNLTSVYIPPIKEEKLLYHEFSTFRSIIRELRGPNGCPWDKKQTHQSLKQYMIEECYELLEAIDEEDTDHMIEELGDVLLQVLLHAQIGEDEGYFTIDDVIKGISEKMVRRHPHVFKDVKVQDENDVLANWEDIKKAEKNTSESSLLDSVPKTLPALSKAAKLQKKAAKVGFDWEDVSDIWEKVSEEMKEFSSEVSEAPHEHNLKAEFGDILFALVNVARFYKIEPEEALTMTNDKFRRRFSYIEETAKEEGVELADMSLEDMDKLWNEAKETERRS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	489 (480)
Sequences:	357 (294)
Seq/√Len:	13.4

BACSU - YABN

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
271_L	283_M	7.699	1.00
239_I	317_S	7.167	1.00
476_D	480_N	5.238	1.00
184_E	200_T	4.761	1.00
34_V	42_I	4.456	1.00
186_V	200_T	4.443	1.00
460_A	467_L	4.393	1.00
188_V	191_A	3.964	1.00
37_K	46_E	3.621	0.99
388_D	391_D	3.520	0.99
322_R	346_I	3.466	0.99
460_A	470_M	3.349	0.99
396_V	426_A	3.331	0.98
460_A	475_M	3.247	0.98
459_T	462_E	3.155	0.98
260_L	263_Y	3.071	0.97
271_L	275_I	3.064	0.97
176_M	181_D	3.002	0.97
373_A	438_P	2.979	0.97
456_I	475_M	2.926	0.96
277_E	282_H	2.847	0.96
392_I	430_V	2.812	0.95
369_L	428_V	2.750	0.95
127_F	138_F	2.715	0.94
185_V	201_V	2.652	0.94
236_F	295_L	2.646	0.94
126_T	158_I	2.581	0.93
387_E	391_D	2.569	0.93
233_F	309_I	2.533	0.92
104_T	114_V	2.499	0.92
181_D	204_F	2.484	0.91
240_I	296_L	2.467	0.91
273_E	277_E	2.423	0.90
463_E	470_M	2.383	0.89
470_M	475_M	2.371	0.89
254_K	336_E	2.348	0.89
76_L	103_L	2.303	0.88
368_A	442_L	2.299	0.88
257_H	297_H	2.290	0.87
271_L	290_V	2.287	0.87
127_F	140_F	2.276	0.87
460_A	463_E	2.275	0.87
247_N	253_K	2.259	0.87
70_E	106_R	2.212	0.85
417_K	440_E	2.187	0.85
258_Q	278_E	2.183	0.85
187_I	201_V	2.180	0.85
397_S	404_S	2.178	0.85
55_F	75_I	2.175	0.84
455_Y	481_E	2.125	0.83
467_L	470_M	2.112	0.83
236_F	316_I	2.093	0.82
140_F	160_C	2.083	0.82
261_K	440_E	2.083	0.82
371_K	450_R	2.029	0.80
465_V	474_D	2.028	0.80
459_T	481_E	2.022	0.80
333_V	342_N	1.995	0.79
463_E	478_L	1.992	0.79
312_V	344_E	1.973	0.78
242_E	245_G	1.973	0.78
61_K	71_E	1.939	0.77
33_Y	79_A	1.912	0.76
130_L	198_I	1.880	0.74
260_L	300_I	1.859	0.74
4_K	113_Q	1.842	0.73
231_H	314_K	1.840	0.73
189_T	213_N	1.826	0.72
8_V	86_V	1.821	0.72
5_I	80_A	1.819	0.72
290_V	294_V	1.818	0.72
34_V	88_A	1.796	0.71
176_M	204_F	1.791	0.71
284_I	301_G	1.771	0.70
375_L	446_N	1.758	0.69
187_I	209_N	1.755	0.69
336_E	340_L	1.748	0.69
345_D	348_K	1.742	0.68
105_E	109_K	1.737	0.68
341_A	349_A	1.719	0.67
107_Q	114_V	1.718	0.67
30_D	83_E	1.715	0.67
193_S	197_E	1.691	0.66
19_T	120_Q	1.686	0.66
187_I	218_V	1.642	0.64
271_L	287_L	1.620	0.63
16_D	21_G	1.620	0.63
199_R	209_N	1.607	0.62
260_L	283_M	1.583	0.61
16_D	24_K	1.574	0.60
206_L	218_V	1.569	0.60
420_F	427_L	1.558	0.59
107_Q	111_N	1.557	0.59
146_L	159_I	1.553	0.59
320_M	339_V	1.539	0.58
15_M	23_H	1.532	0.58
15_M	44_E	1.519	0.57
153_L	179_L	1.517	0.57
190_A	193_S	1.496	0.56
118_G	214_N	1.472	0.55
69_Y	97_E	1.467	0.55
113_Q	220_I	1.466	0.55
92_H	124_D	1.449	0.54
264_M	268_C	1.446	0.54
372_A	423_I	1.444	0.53
472_L	476_D	1.422	0.52
4_K	115_K	1.421	0.52
261_K	417_K	1.404	0.51
95_V	122_F	1.402	0.51
372_A	396_V	1.398	0.51
254_K	344_E	1.385	0.50
284_I	303_D	1.383	0.50
233_F	313_I	1.380	0.50
378_K	438_P	1.378	0.50
92_H	190_A	1.378	0.50
143_A	445_T	1.374	0.50
273_E	313_I	1.361	0.49
62_H	71_E	1.361	0.49
470_M	478_L	1.353	0.49
396_V	423_I	1.348	0.48
395_K	398_E	1.344	0.48
33_Y	340_L	1.342	0.48
180_P	183_Y	1.342	0.48
423_I	426_A	1.342	0.48
263_Y	320_M	1.329	0.47
254_K	265_I	1.319	0.47
179_L	310_D	1.312	0.46
44_E	47_K	1.309	0.46
154_R	410_A	1.305	0.46
25_L	86_V	1.294	0.46
298_A	322_R	1.291	0.45
309_I	313_I	1.279	0.45
386_W	476_D	1.272	0.44
467_L	478_L	1.269	0.44
385_D	426_A	1.269	0.44
280_T	284_I	1.265	0.44
58_I	71_E	1.264	0.44
236_F	370_S	1.256	0.44
475_M	478_L	1.255	0.43
236_F	317_S	1.254	0.43
334_Q	338_D	1.251	0.43
392_I	433_F	1.248	0.43
126_T	188_V	1.241	0.43
238_S	242_E	1.240	0.43
57_D	75_I	1.235	0.42
389_V	433_F	1.227	0.42
34_V	167_T	1.225	0.42
263_Y	300_I	1.222	0.42
277_E	364_K	1.212	0.41
473_E	476_D	1.212	0.41
318_E	338_D	1.211	0.41
298_A	312_V	1.205	0.41
236_F	375_L	1.204	0.41
400_M	423_I	1.200	0.41
242_E	298_A	1.188	0.40
273_E	282_H	1.181	0.40
396_V	410_A	1.178	0.40
403_F	420_F	1.175	0.39
32_L	86_V	1.174	0.39
456_I	470_M	1.174	0.39
126_T	130_L	1.173	0.39
298_A	431_A	1.171	0.39
47_K	272_L	1.169	0.39
34_V	38_D	1.169	0.39
94_F	104_T	1.169	0.39
79_A	82_R	1.168	0.39
301_G	306_Y	1.167	0.39
342_N	346_I	1.167	0.39
179_L	418_A	1.163	0.39
455_Y	482_A	1.160	0.39
20_I	273_E	1.153	0.38
264_M	272_L	1.152	0.38
313_I	381_K	1.150	0.38
29_A	32_L	1.147	0.38
363_P	370_S	1.143	0.38
455_Y	459_T	1.140	0.38
19_T	23_H	1.137	0.37
459_T	478_L	1.130	0.37
367_P	437_E	1.126	0.37
5_I	53_R	1.126	0.37
467_L	475_M	1.126	0.37
406_E	430_V	1.125	0.37
477_K	481_E	1.123	0.37
406_E	415_N	1.113	0.36
371_K	447_D	1.111	0.36
18_L	26_L	1.106	0.36
50_K	394_E	1.102	0.36
363_P	374_K	1.100	0.36
456_I	460_A	1.100	0.36
153_L	178_K	1.099	0.36
185_V	206_L	1.096	0.35
393_W	407_V	1.096	0.35
262_Q	440_E	1.094	0.35
129_V	198_I	1.086	0.35
90_P	93_P	1.085	0.35
95_V	204_F	1.085	0.35
312_V	338_D	1.078	0.35
285_E	315_G	1.075	0.34
403_F	416_L	1.074	0.34
429_N	432_R	1.071	0.34
456_I	463_E	1.070	0.34
423_I	445_T	1.060	0.34
38_D	214_N	1.057	0.34
417_K	444_M	1.047	0.33
402_E	419_E	1.046	0.33
126_T	320_M	1.042	0.33
339_V	346_I	1.038	0.33
378_K	472_L	1.032	0.32
290_V	320_M	1.028	0.32
387_E	431_A	1.021	0.32
260_L	339_V	1.018	0.32
362_V	396_V	1.018	0.32
5_I	19_T	1.010	0.31
275_I	283_M	1.008	0.31
50_K	340_L	1.005	0.31
18_L	253_K	1.005	0.31
46_E	52_I	1.004	0.31
129_V	220_I	0.999	0.31
7_V	76_L	0.990	0.30
154_R	170_E	0.987	0.30
460_A	478_L	0.987	0.30
466_E	469_D	0.982	0.30
53_R	80_A	0.978	0.30
14_D	17_Q	0.973	0.30
141_V	146_L	0.972	0.30
240_I	339_V	0.968	0.29
240_I	295_L	0.966	0.29
396_V	430_V	0.965	0.29
64_Q	67_A	0.965	0.29
72_I	87_Y	0.964	0.29
12_A	118_G	0.960	0.29
105_E	253_K	0.960	0.29
402_E	422_D	0.960	0.29
283_M	363_P	0.958	0.29
138_F	214_N	0.958	0.29
96_A	161_Q	0.956	0.29
271_L	294_V	0.947	0.29
470_M	474_D	0.940	0.28
132_I	436_I	0.939	0.28
424_L	442_L	0.939	0.28
268_C	393_W	0.938	0.28
32_L	265_I	0.933	0.28
407_V	416_L	0.923	0.28
206_L	259_S	0.922	0.27
331_V	342_N	0.918	0.27
126_T	217_S	0.915	0.27
330_D	481_E	0.913	0.27
394_E	397_S	0.911	0.27
330_D	451_R	0.907	0.27
33_Y	469_D	0.906	0.27
298_A	346_I	0.905	0.27
107_Q	110_E	0.901	0.27
245_G	303_D	0.899	0.27
58_I	75_I	0.896	0.26
104_T	131_Q	0.893	0.26
403_F	423_I	0.888	0.26
149_D	232_E	0.887	0.26
386_W	429_N	0.886	0.26
21_G	92_H	0.886	0.26
83_E	195_G	0.885	0.26
356_S	360_D	0.881	0.26
7_V	32_L	0.880	0.26
399_E	422_D	0.879	0.26
318_E	322_R	0.879	0.26
40_P	215_L	0.873	0.25
158_I	316_I	0.870	0.25
16_D	46_E	0.868	0.25
271_L	303_D	0.868	0.25
125_A	129_V	0.868	0.25
454_S	458_E	0.868	0.25
302_E	308_T	0.865	0.25
126_T	191_A	0.863	0.25
95_V	159_I	0.862	0.25
284_I	480_N	0.858	0.25
391_D	445_T	0.858	0.25
199_R	212_L	0.855	0.25
52_I	125_A	0.855	0.25
14_D	406_E	0.854	0.25
269_Y	367_P	0.854	0.25
272_L	313_I	0.853	0.25
28_K	400_M	0.851	0.25
37_K	282_H	0.851	0.25
268_C	459_T	0.848	0.24
349_A	458_E	0.845	0.24
389_V	430_V	0.843	0.24
245_G	253_K	0.843	0.24
321_V	426_A	0.837	0.24
170_E	332_K	0.837	0.24
19_T	41_L	0.837	0.24
385_D	425_F	0.834	0.24
183_Y	223_I	0.833	0.24
268_C	290_V	0.833	0.24
284_I	290_V	0.831	0.24
80_A	321_V	0.831	0.24
410_A	430_V	0.828	0.24
284_I	401_K	0.824	0.24
132_I	179_L	0.823	0.24
419_E	422_D	0.822	0.23
78_E	447_D	0.822	0.23
321_V	462_E	0.822	0.23
372_A	385_D	0.820	0.23
375_L	450_R	0.819	0.23
235_T	298_A	0.818	0.23
355_E	361_S	0.817	0.23
115_K	462_E	0.815	0.23
470_M	480_N	0.814	0.23
17_Q	119_G	0.812	0.23
105_E	272_L	0.812	0.23
80_A	85_V	0.812	0.23
7_V	114_V	0.809	0.23
244_R	303_D	0.806	0.23
335_D	338_D	0.804	0.23
287_L	291_L	0.803	0.23
99_T	294_V	0.802	0.23
373_A	405_S	0.801	0.23
12_A	189_T	0.799	0.23
114_V	408_S	0.797	0.23
73_A	436_I	0.797	0.23
333_V	424_L	0.795	0.22
394_E	474_D	0.795	0.22
47_K	461_K	0.794	0.22
7_V	103_L	0.794	0.22
415_N	418_A	0.793	0.22
153_L	232_E	0.792	0.22
373_A	437_E	0.790	0.22
268_C	316_I	0.790	0.22
447_D	471_S	0.786	0.22
396_V	460_A	0.785	0.22
240_I	263_Y	0.784	0.22
253_K	375_L	0.783	0.22
178_K	231_H	0.782	0.22
170_E	277_E	0.782	0.22
212_L	295_L	0.781	0.22
78_E	81_R	0.781	0.22
19_T	22_I	0.778	0.22
367_P	372_A	0.776	0.22
92_H	96_A	0.775	0.22
223_I	254_K	0.774	0.22
419_E	449_F	0.773	0.22
348_K	435_K	0.772	0.22
5_I	372_A	0.770	0.22
392_I	406_E	0.766	0.21
330_D	468_A	0.766	0.21
355_E	360_D	0.765	0.21
42_I	52_I	0.764	0.21
396_V	427_L	0.763	0.21
370_S	475_M	0.757	0.21
85_V	435_K	0.757	0.21
4_K	32_L	0.757	0.21
93_P	161_Q	0.755	0.21
239_I	333_V	0.754	0.21
218_V	334_Q	0.753	0.21
161_Q	192_G	0.753	0.21
13_G	18_L	0.753	0.21
12_A	213_N	0.752	0.21
71_E	74_D	0.746	0.21
58_I	259_S	0.745	0.21
16_D	27_T	0.745	0.21
58_I	62_H	0.743	0.21
122_F	159_I	0.742	0.21
388_D	447_D	0.740	0.20
125_A	370_S	0.740	0.20
334_Q	480_N	0.738	0.20
316_I	467_L	0.736	0.20
98_K	167_T	0.736	0.20
12_A	160_C	0.734	0.20
159_I	204_F	0.734	0.20
118_G	127_F	0.733	0.20
395_K	402_E	0.733	0.20
95_V	181_D	0.733	0.20
69_Y	163_Y	0.732	0.20
271_L	366_L	0.732	0.20
126_T	268_C	0.731	0.20
73_A	158_I	0.731	0.20
67_A	315_G	0.729	0.20
23_H	48_E	0.727	0.20
156_H	296_L	0.727	0.20
344_E	358_L	0.727	0.20
402_E	421_G	0.726	0.20
117_A	374_K	0.724	0.20
341_A	345_D	0.721	0.20
393_W	427_L	0.721	0.20
158_I	217_S	0.720	0.20
389_V	434_Y	0.720	0.20
152_E	156_H	0.719	0.20
19_T	212_L	0.715	0.20
247_N	473_E	0.715	0.20
118_G	138_F	0.714	0.20
300_I	320_M	0.714	0.20
447_D	480_N	0.714	0.20
456_I	459_T	0.713	0.20
240_I	320_M	0.713	0.20
391_D	475_M	0.712	0.20
425_F	429_N	0.710	0.19
108_E	131_Q	0.710	0.19
127_F	164_D	0.709	0.19
67_A	423_I	0.708	0.19
458_E	461_K	0.706	0.19
345_D	426_A	0.706	0.19
429_N	448_K	0.705	0.19
274_A	277_E	0.704	0.19
456_I	481_E	0.704	0.19
199_R	211_A	0.703	0.19
351_K	378_K	0.703	0.19
294_V	463_E	0.703	0.19
379_A	385_D	0.701	0.19
367_P	378_K	0.700	0.19
360_D	454_S	0.698	0.19
79_A	218_V	0.697	0.19
158_I	365_T	0.696	0.19
237_R	303_D	0.695	0.19
334_Q	388_D	0.693	0.19
97_E	161_Q	0.692	0.19
21_G	135_I	0.691	0.19
376_Q	432_R	0.691	0.19
53_R	362_V	0.690	0.19
202_P	292_L	0.690	0.19
314_K	318_E	0.689	0.19
179_L	303_D	0.689	0.19
102_L	220_I	0.689	0.19
290_V	473_E	0.689	0.19
374_K	437_E	0.688	0.19
230_Y	235_T	0.688	0.19
28_K	67_A	0.687	0.19
280_T	301_G	0.686	0.19
86_V	459_T	0.685	0.19
8_V	42_I	0.684	0.19
94_F	167_T	0.679	0.18
99_T	435_K	0.679	0.18
92_H	193_S	0.678	0.18
182_D	484_E	0.678	0.18
259_S	474_D	0.678	0.18
46_E	471_S	0.677	0.18
75_I	79_A	0.677	0.18
138_F	164_D	0.674	0.18
417_K	469_D	0.674	0.18
114_V	253_K	0.674	0.18
263_Y	339_V	0.674	0.18
21_G	124_D	0.673	0.18
79_A	435_K	0.673	0.18
150_E	182_D	0.673	0.18
378_K	445_T	0.672	0.18
317_S	321_V	0.672	0.18
24_K	390_S	0.672	0.18
321_V	372_A	0.670	0.18
357_S	360_D	0.670	0.18
15_M	48_E	0.669	0.18
271_L	274_A	0.669	0.18
143_A	146_L	0.666	0.18
28_K	31_T	0.666	0.18
43_E	46_E	0.666	0.18
141_V	262_Q	0.664	0.18
15_M	189_T	0.664	0.18
123_L	127_F	0.664	0.18
445_T	470_M	0.662	0.18
459_T	470_M	0.661	0.18
465_V	468_A	0.659	0.18
81_R	356_S	0.657	0.18
264_M	290_V	0.657	0.18
242_E	253_K	0.656	0.18
360_D	446_N	0.655	0.18
206_L	342_N	0.654	0.18
185_V	220_I	0.653	0.18
380_A	410_A	0.647	0.17
41_L	189_T	0.647	0.17
19_T	169_S	0.646	0.17
210_V	303_D	0.643	0.17
93_P	97_E	0.642	0.17
391_D	456_I	0.641	0.17
395_K	419_E	0.641	0.17
402_E	449_F	0.640	0.17
143_A	160_C	0.639	0.17
384_F	399_E	0.639	0.17
70_E	223_I	0.639	0.17
104_T	191_A	0.639	0.17
167_T	170_E	0.638	0.17
315_G	334_Q	0.637	0.17
212_L	475_M	0.637	0.17
90_P	161_Q	0.634	0.17
402_E	452_R	0.634	0.17
395_K	449_F	0.634	0.17
18_L	105_E	0.634	0.17
23_H	469_D	0.633	0.17
70_E	262_Q	0.633	0.17
112_V	143_A	0.633	0.17
69_Y	93_P	0.631	0.17
384_F	422_D	0.630	0.17
54_F	315_G	0.629	0.17
260_L	309_I	0.629	0.17
420_F	433_F	0.628	0.17
245_G	259_S	0.627	0.17
385_D	396_V	0.626	0.17
69_Y	215_L	0.625	0.17
47_K	78_E	0.625	0.17
361_S	375_L	0.625	0.17
426_A	480_N	0.622	0.17
204_F	428_V	0.622	0.17
76_L	377_K	0.621	0.17
438_P	466_E	0.621	0.17
298_A	406_E	0.618	0.17
155_H	193_S	0.618	0.17
156_H	219_Y	0.617	0.17
118_G	213_N	0.616	0.17
146_L	340_L	0.615	0.16
257_H	311_D	0.614	0.16
104_T	320_M	0.612	0.16
64_Q	428_V	0.612	0.16
31_T	85_V	0.611	0.16
461_K	469_D	0.611	0.16
8_V	184_E	0.610	0.16
81_R	112_V	0.610	0.16
4_K	436_I	0.609	0.16
200_T	435_K	0.607	0.16
63_D	85_V	0.605	0.16
32_L	108_E	0.605	0.16
57_D	463_E	0.605	0.16
97_E	215_L	0.604	0.16
94_F	415_N	0.604	0.16
418_A	430_V	0.604	0.16
151_L	277_E	0.604	0.16
395_K	422_D	0.602	0.16
8_V	345_D	0.601	0.16
160_C	217_S	0.600	0.16
25_L	272_L	0.600	0.16
463_E	467_L	0.599	0.16
419_E	452_R	0.598	0.16
374_K	438_P	0.597	0.16
376_Q	385_D	0.597	0.16
18_L	24_K	0.596	0.16
71_E	75_I	0.593	0.16
102_L	159_I	0.593	0.16
400_M	445_T	0.591	0.16
103_L	377_K	0.591	0.16
250_P	339_V	0.589	0.16
450_R	454_S	0.589	0.16
298_A	309_I	0.588	0.16
34_V	465_V	0.588	0.16
74_D	78_E	0.588	0.16
206_L	294_V	0.587	0.16
22_I	212_L	0.585	0.16
52_I	467_L	0.583	0.16
238_S	406_E	0.582	0.16
114_V	128_N	0.581	0.16
338_D	360_D	0.581	0.16
50_K	405_S	0.581	0.16
264_M	271_L	0.581	0.16
67_A	82_R	0.579	0.15
51_N	435_K	0.578	0.15
28_K	414_H	0.578	0.15
97_E	192_G	0.578	0.15
69_Y	90_P	0.577	0.15
73_A	197_E	0.577	0.15
125_A	191_A	0.576	0.15
15_M	20_I	0.575	0.15
51_N	67_A	0.575	0.15
35_R	93_P	0.575	0.15
179_L	433_F	0.575	0.15
392_I	426_A	0.575	0.15
208_R	435_K	0.574	0.15
397_S	473_E	0.574	0.15
92_H	191_A	0.574	0.15
81_R	110_E	0.574	0.15
196_E	468_A	0.572	0.15
24_K	47_K	0.571	0.15
407_V	415_N	0.570	0.15
110_E	182_D	0.570	0.15
19_T	397_S	0.570	0.15
35_R	90_P	0.569	0.15
30_D	290_V	0.569	0.15
422_D	452_R	0.569	0.15
185_V	363_P	0.568	0.15
401_K	405_S	0.568	0.15
69_Y	161_Q	0.567	0.15
260_L	320_M	0.565	0.15
179_L	218_V	0.565	0.15
62_H	340_L	0.564	0.15
43_E	375_L	0.564	0.15
338_D	413_E	0.563	0.15
62_H	67_A	0.563	0.15
185_V	468_A	0.563	0.15
316_I	461_K	0.562	0.15
90_P	133_D	0.562	0.15
73_A	388_D	0.562	0.15
344_E	437_E	0.562	0.15
133_D	161_Q	0.562	0.15
77_F	112_V	0.561	0.15
124_D	378_K	0.560	0.15
274_A	290_V	0.560	0.15
346_I	431_A	0.560	0.15
344_E	368_A	0.560	0.15
145_T	480_N	0.559	0.15
53_R	79_A	0.558	0.15
73_A	333_V	0.558	0.15
6_T	115_K	0.556	0.15
114_V	235_T	0.555	0.15
33_Y	468_A	0.555	0.15
336_E	368_A	0.555	0.15
368_A	417_K	0.555	0.15
94_F	116_V	0.555	0.15
242_E	247_N	0.554	0.15
24_K	185_V	0.554	0.15
376_Q	429_N	0.552	0.15
21_G	190_A	0.552	0.15
157_L	340_L	0.552	0.15
12_A	214_N	0.552	0.15
33_Y	473_E	0.551	0.15
226_E	351_K	0.551	0.15
134_P	192_G	0.550	0.15
181_D	340_L	0.549	0.15
293_Q	297_H	0.548	0.15
105_E	113_Q	0.548	0.15
399_E	452_R	0.547	0.15
426_A	475_M	0.547	0.15
318_E	471_S	0.546	0.15
260_L	287_L	0.546	0.15
235_T	242_E	0.545	0.15
67_A	354_S	0.545	0.15
287_L	339_V	0.545	0.15
7_V	25_L	0.545	0.15
69_Y	192_G	0.544	0.15
54_F	77_F	0.544	0.15
361_S	469_D	0.544	0.15
204_F	481_E	0.543	0.14
84_D	471_S	0.542	0.14
5_I	187_I	0.542	0.14
333_V	339_V	0.542	0.14
370_S	436_I	0.542	0.14
263_Y	293_Q	0.540	0.14
127_F	160_C	0.539	0.14
312_V	424_L	0.539	0.14
43_E	81_R	0.538	0.14
382_V	425_F	0.538	0.14
425_F	449_F	0.537	0.14
41_L	157_L	0.535	0.14
138_F	160_C	0.535	0.14
468_A	473_E	0.535	0.14
19_T	478_L	0.535	0.14
309_I	339_V	0.534	0.14
143_A	470_M	0.534	0.14
103_L	305_G	0.534	0.14
93_P	163_Y	0.534	0.14
87_Y	192_G	0.533	0.14
363_P	368_A	0.533	0.14
5_I	362_V	0.533	0.14
330_D	400_M	0.533	0.14
116_V	238_S	0.532	0.14
96_A	134_P	0.532	0.14
93_P	133_D	0.532	0.14
170_E	259_S	0.532	0.14
398_E	452_R	0.531	0.14
22_I	394_E	0.530	0.14
64_Q	410_A	0.530	0.14
62_H	68_V	0.530	0.14
118_G	233_F	0.530	0.14
268_C	455_Y	0.529	0.14
327_V	377_K	0.528	0.14
176_M	433_F	0.527	0.14
6_T	318_E	0.527	0.14
425_F	472_L	0.527	0.14
21_G	24_K	0.527	0.14
22_I	116_V	0.526	0.14
141_V	212_L	0.526	0.14
170_E	445_T	0.525	0.14
304_E	362_V	0.524	0.14
159_I	437_E	0.523	0.14
395_K	476_D	0.522	0.14
201_V	282_H	0.522	0.14
7_V	415_N	0.522	0.14
295_L	316_I	0.521	0.14
394_E	465_V	0.521	0.14
112_V	264_M	0.520	0.14
114_V	397_S	0.520	0.14
388_D	394_E	0.520	0.14
129_V	151_L	0.519	0.14
273_E	405_S	0.519	0.14
154_R	226_E	0.518	0.14
15_M	50_K	0.518	0.14
218_V	318_E	0.518	0.14
217_S	396_V	0.518	0.14
199_R	245_G	0.517	0.14
133_D	215_L	0.517	0.14
376_Q	428_V	0.516	0.14
19_T	186_V	0.516	0.14
312_V	435_K	0.516	0.14
140_F	231_H	0.515	0.14
423_I	451_R	0.515	0.14
24_K	318_E	0.515	0.14
164_D	214_N	0.515	0.14
97_E	122_F	0.515	0.14
160_C	295_L	0.514	0.14
295_L	298_A	0.514	0.14
362_V	367_P	0.514	0.14
368_A	439_E	0.514	0.14
218_V	277_E	0.513	0.14
120_Q	296_L	0.513	0.14
82_R	401_K	0.513	0.14
47_K	85_V	0.513	0.14
275_I	462_E	0.511	0.14
109_K	335_D	0.510	0.14
112_V	290_V	0.510	0.14
85_V	103_L	0.510	0.14
165_Q	313_I	0.508	0.14
368_A	463_E	0.508	0.14
84_D	290_V	0.508	0.14
277_E	336_E	0.507	0.14
333_V	337_N	0.505	0.14
53_R	335_D	0.505	0.14
43_E	86_V	0.504	0.13
315_G	411_P	0.504	0.13
299_Q	359_L	0.504	0.13
185_V	366_L	0.503	0.13
92_H	121_S	0.503	0.13
193_S	436_I	0.503	0.13
33_Y	117_A	0.502	0.13
136_E	240_I	0.502	0.13
139_Q	214_N	0.502	0.13
385_D	429_N	0.502	0.13
233_F	381_K	0.502	0.13
403_F	460_A	0.501	0.13
90_P	97_E	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3craA	2	0.4928	100	0.541	Contact Map
2yxhA	2	0.2352	100	0.848	Contact Map
1wdeA	2	0.5194	100	0.876	Contact Map
2qbuA	2	0.4294	100	0.876	Contact Map
1ve2A	2	0.4499	100	0.877	Contact Map
2yboA	2	0.4499	99.9	0.882	Contact Map
2e0nA	2	0.4519	99.9	0.882	Contact Map
1s4dA	4	0.4888	99.9	0.884	Contact Map
4e16A	2	0.4274	99.9	0.885	Contact Map
1pjqA	2	0.4642	99.9	0.888	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0128 seconds.