YYCA - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YYCA - Putative mannosyltransferase YycA

UniProt:	P37483	Sequences: MKTKRFDAALILILLAAAFLNTYHIWQDDTANQYYLAAVKSMTQSFHNFFYASFDPSGFVTVDKPPVVLWIQTIFALIFGVHTWSVIIPQALAGVGSVFLLYRMVKPTFGVGAARIAALVMALTPIAVAVSRTNNIDSMLVFTLLLGSTCLLRAVKQGKLVWLLTAFALIGLAFNMKMMQAFMVLPAFVLFYLIASRVSLKKKIGSLLLSLVLLTGLSLSWAIAVDSASSSSRPYVGSSQTNSVLELAFGYNGTERLFGQTTGLAKGDMNAAGGGNMQNQDNMQAPNGNGSSFSQNGNQSFGNHSQAPQPPNGQTGALNGGGGTPPTGGNGPGNGGPGGGGGKSVNMFGTGDPGPLRLFQSALSGQISWMLPFSLIGLLGAIISWYRDRRGHAAKMKETLFWAAWLVPVAGFFSIAGFFHQYYLIMLAPPIAALSGIGWYTMHRLYKNNKDWSSYLLPAAVLITAVFQVYILSAYTSQIGSVWMYVLGLLGLGITLALLMLKRSHPFSKLLTIISLCVLLLTPVYWSATPLLYGGNSVLPESGPQLKGSANGGNMFSSEVDSGLLSYLRKHNTGEEYLFATLTTVTAAPYIIYENESVMAMGGFNGTDPILTVSELKKLIKEGKVKYFLLSENNSGNSELVSWIKKNGKEITSDEYSGSSSSTNSVQGMRRGPGGESQQTLYLVE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	685 (648)
Sequences:	144 (114)
Seq/√Len:	4.5

BACSU - YYCA YKCB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
189_V	211_L	5.765	0.98
613_V	640_L	4.301	0.90
613_V	616_L	4.041	0.87
576_E	624_K	3.494	0.78
60_V	610_I	3.358	0.75
71_I	75_F	3.232	0.72
59_F	599_M	3.163	0.70
75_F	78_I	3.146	0.70
617_K	647_N	2.951	0.64
602_G	606_G	2.943	0.64
14_L	99_F	2.881	0.62
43_T	656_Y	2.850	0.61
616_L	640_L	2.725	0.58
21_N	93_A	2.702	0.57
45_S	223_I	2.668	0.56
72_Q	218_S	2.619	0.55
240_Q	246_E	2.616	0.54
135_N	248_A	2.545	0.52
97_S	145_L	2.533	0.52
96_G	142_F	2.497	0.51
600_A	611_L	2.475	0.50
367_I	374_S	2.467	0.50
240_Q	609_P	2.439	0.49
75_F	625_V	2.421	0.49
380_G	442_M	2.413	0.48
115_R	203_K	2.411	0.48
74_I	375_L	2.410	0.48
78_I	617_K	2.359	0.47
34_Y	238_S	2.343	0.46
579_F	590_Y	2.331	0.46
184_V	188_F	2.320	0.45
84_W	141_V	2.285	0.44
114_A	483_W	2.277	0.44
104_M	203_K	2.272	0.44
67_V	172_L	2.250	0.43
86_V	114_A	2.216	0.42
90_Q	141_V	2.216	0.42
529_T	533_Y	2.209	0.42
184_V	519_L	2.187	0.41
147_G	166_A	2.159	0.41
236_V	244_V	2.146	0.40
255_E	546_L	2.135	0.40
561_D	651_I	2.125	0.40
25_I	142_F	2.118	0.39
619_L	624_K	2.115	0.39
67_V	146_L	2.109	0.39
37_A	59_F	2.104	0.39
370_M	373_F	1.998	0.36
238_S	648_G	1.968	0.35
221_W	457_L	1.960	0.35
83_T	595_N	1.959	0.35
153_R	379_L	1.930	0.34
563_G	656_Y	1.919	0.34
166_A	563_G	1.912	0.34
17_A	468_Q	1.903	0.33
62_V	248_A	1.896	0.33
653_S	657_S	1.884	0.33
569_R	596_E	1.880	0.33
75_F	460_A	1.878	0.33
68_V	248_A	1.868	0.32
51_Y	215_T	1.862	0.32
53_S	436_G	1.843	0.32
465_A	527_S	1.837	0.32
230_S	334_N	1.834	0.31
48_N	83_T	1.823	0.31
74_I	78_I	1.798	0.31
74_I	236_V	1.796	0.30
601_M	648_G	1.791	0.30
25_I	84_W	1.776	0.30
144_L	180_Q	1.776	0.30
154_A	367_I	1.769	0.30
126_I	601_M	1.757	0.29
21_N	138_S	1.743	0.29
90_Q	533_Y	1.740	0.29
339_G	342_G	1.713	0.28
133_T	248_A	1.713	0.28
90_Q	139_M	1.709	0.28
69_L	182_F	1.706	0.28
214_L	443_H	1.698	0.28
34_Y	424_L	1.698	0.28
246_E	602_G	1.694	0.28
135_N	259_G	1.691	0.28
601_M	644_I	1.677	0.27
223_I	367_I	1.667	0.27
599_M	611_L	1.662	0.27
135_N	251_Y	1.657	0.27
141_V	203_K	1.655	0.27
16_A	170_I	1.643	0.27
325_P	335_G	1.632	0.26
421_Q	541_E	1.625	0.26
334_N	496_L	1.615	0.26
72_Q	220_S	1.614	0.26
195_A	227_S	1.613	0.26
330_N	333_G	1.597	0.26
370_M	526_W	1.593	0.25
412_F	416_A	1.585	0.25
493_G	659_S	1.584	0.25
61_T	194_I	1.575	0.25
107_P	537_S	1.573	0.25
237_G	608_D	1.565	0.25
550_A	636_G	1.559	0.25
45_S	390_R	1.532	0.24
40_K	56_P	1.526	0.24
52_A	214_L	1.522	0.24
72_Q	90_Q	1.520	0.24
584_T	611_L	1.506	0.23
37_A	599_M	1.504	0.23
229_S	538_V	1.499	0.23
237_G	257_L	1.495	0.23
72_Q	424_L	1.494	0.23
281_D	324_T	1.494	0.23
372_P	433_A	1.491	0.23
262_T	605_N	1.489	0.23
180_Q	426_M	1.487	0.23
247_L	357_R	1.487	0.23
56_P	522_T	1.484	0.23
142_F	530_P	1.484	0.23
371_L	644_I	1.480	0.23
586_T	631_S	1.479	0.23
56_P	594_E	1.477	0.23
71_I	625_V	1.475	0.23
133_T	259_G	1.471	0.23
115_R	590_Y	1.469	0.23
123_L	513_I	1.465	0.23
332_P	375_L	1.464	0.23
141_V	425_I	1.461	0.23
72_Q	217_L	1.460	0.22
534_G	589_P	1.457	0.22
383_I	565_L	1.456	0.22
30_T	443_H	1.452	0.22
25_I	590_Y	1.448	0.22
30_T	595_N	1.443	0.22
183_M	597_S	1.442	0.22
60_V	73_T	1.433	0.22
365_G	616_L	1.432	0.22
126_I	532_L	1.430	0.22
409_V	430_P	1.429	0.22
525_Y	536_N	1.425	0.22
351_G	418_F	1.421	0.22
25_I	360_Q	1.419	0.22
325_P	459_A	1.419	0.22
61_T	236_V	1.419	0.22
105_V	548_G	1.413	0.22
427_L	635_S	1.412	0.21
226_D	238_S	1.407	0.21
16_A	119_L	1.404	0.21
46_F	73_T	1.401	0.21
194_I	386_Y	1.394	0.21
184_V	244_V	1.392	0.21
472_L	610_I	1.388	0.21
143_T	531_L	1.388	0.21
526_W	529_T	1.387	0.21
367_I	599_M	1.384	0.21
21_N	91_A	1.382	0.21
56_P	584_T	1.378	0.21
254_T	258_F	1.374	0.21
96_G	530_P	1.371	0.21
259_G	416_A	1.370	0.21
163_L	230_S	1.363	0.20
493_G	571_H	1.362	0.20
133_T	251_Y	1.362	0.20
184_V	442_M	1.362	0.20
87_I	533_Y	1.360	0.20
36_L	86_V	1.356	0.20
164_L	338_G	1.356	0.20
48_N	58_G	1.354	0.20
157_Q	180_Q	1.351	0.20
37_A	56_P	1.350	0.20
106_K	238_S	1.349	0.20
25_I	470_Y	1.347	0.20
611_L	619_L	1.347	0.20
321_G	501_L	1.345	0.20
126_I	443_H	1.342	0.20
260_Q	443_H	1.337	0.20
54_F	599_M	1.336	0.20
368_S	526_W	1.334	0.20
22_T	619_L	1.327	0.20
517_C	657_S	1.326	0.20
72_Q	93_A	1.324	0.20
37_A	584_T	1.324	0.20
69_L	136_I	1.321	0.20
193_L	461_V	1.319	0.20
599_M	602_G	1.316	0.20
95_V	594_E	1.314	0.20
213_L	329_G	1.311	0.19
197_R	238_S	1.305	0.19
465_A	468_Q	1.305	0.19
302_G	327_T	1.304	0.19
73_T	479_I	1.302	0.19
216_G	549_S	1.293	0.19
307_A	489_L	1.292	0.19
184_V	342_G	1.290	0.19
255_E	377_G	1.290	0.19
17_A	353_P	1.284	0.19
241_T	580_A	1.282	0.19
651_I	658_G	1.278	0.19
101_L	410_A	1.274	0.19
330_N	459_A	1.272	0.19
237_G	530_P	1.271	0.19
107_P	161_V	1.268	0.19
27_Q	104_M	1.266	0.19
129_A	408_P	1.266	0.19
613_V	617_K	1.265	0.19
183_M	237_G	1.263	0.19
173_A	495_T	1.262	0.19
266_K	651_I	1.256	0.18
526_W	567_Y	1.254	0.18
96_G	360_Q	1.253	0.18
36_L	346_N	1.252	0.18
377_G	441_T	1.251	0.18
71_I	143_T	1.248	0.18
224_A	297_G	1.247	0.18
425_I	592_I	1.245	0.18
563_G	642_S	1.245	0.18
74_I	77_L	1.241	0.18
240_Q	600_A	1.237	0.18
45_S	116_I	1.237	0.18
45_S	487_L	1.232	0.18
115_R	360_Q	1.232	0.18
199_S	527_S	1.231	0.18
127_A	425_I	1.231	0.18
146_L	468_Q	1.231	0.18
467_F	471_I	1.228	0.18
57_S	430_P	1.228	0.18
17_A	21_N	1.226	0.18
34_Y	53_S	1.224	0.18
17_A	118_A	1.221	0.18
147_G	576_E	1.219	0.18
584_T	599_M	1.211	0.18
285_A	309_Q	1.211	0.18
268_D	646_K	1.208	0.18
530_P	534_G	1.204	0.17
135_N	243_S	1.202	0.17
383_I	490_L	1.199	0.17
264_L	554_N	1.198	0.17
36_L	135_N	1.197	0.17
56_P	599_M	1.196	0.17
115_R	170_I	1.192	0.17
582_L	640_L	1.191	0.17
454_S	460_A	1.187	0.17
251_Y	580_A	1.185	0.17
316_G	325_P	1.185	0.17
135_N	138_S	1.183	0.17
214_L	219_L	1.178	0.17
46_F	431_I	1.176	0.17
40_K	163_L	1.174	0.17
140_L	253_G	1.171	0.17
351_G	368_S	1.168	0.17
162_W	240_Q	1.167	0.17
435_S	556_F	1.161	0.17
82_H	142_F	1.158	0.17
447_K	509_K	1.157	0.17
114_A	567_Y	1.155	0.17
28_D	166_A	1.154	0.17
599_M	606_G	1.150	0.17
45_S	303_N	1.149	0.17
95_V	612_T	1.148	0.17
54_F	59_F	1.143	0.16
102_Y	144_L	1.142	0.16
258_F	605_N	1.142	0.16
60_V	528_A	1.141	0.16
25_I	96_G	1.139	0.16
376_I	651_I	1.137	0.16
165_T	210_S	1.135	0.16
59_F	611_L	1.133	0.16
358_L	363_L	1.130	0.16
51_Y	219_L	1.129	0.16
59_F	600_A	1.127	0.16
43_T	403_A	1.126	0.16
36_L	248_A	1.126	0.16
351_G	526_W	1.126	0.16
72_Q	213_L	1.124	0.16
370_M	489_L	1.124	0.16
653_S	658_G	1.122	0.16
69_L	533_Y	1.121	0.16
32_N	247_L	1.120	0.16
32_N	357_R	1.120	0.16
435_S	652_T	1.117	0.16
196_S	407_V	1.112	0.16
216_G	528_A	1.111	0.16
50_F	93_A	1.111	0.16
40_K	44_Q	1.109	0.16
351_G	628_F	1.108	0.16
594_E	597_S	1.107	0.16
210_S	451_D	1.107	0.16
127_A	579_F	1.106	0.16
85_S	248_A	1.103	0.16
412_F	418_F	1.103	0.16
8_A	45_S	1.101	0.16
179_M	520_L	1.100	0.16
38_A	167_F	1.098	0.16
376_I	664_N	1.096	0.16
74_I	619_L	1.094	0.16
217_L	220_S	1.094	0.16
576_E	622_E	1.094	0.16
50_F	72_Q	1.092	0.16
652_T	656_Y	1.088	0.16
77_L	616_L	1.087	0.16
62_V	135_N	1.086	0.15
127_A	166_A	1.084	0.15
222_A	604_F	1.083	0.15
626_K	644_I	1.082	0.15
17_A	182_F	1.078	0.15
378_L	403_A	1.078	0.15
87_I	90_Q	1.075	0.15
115_R	167_F	1.075	0.15
25_I	530_P	1.073	0.15
243_S	251_Y	1.071	0.15
145_L	529_T	1.071	0.15
467_F	626_K	1.071	0.15
231_S	650_E	1.069	0.15
37_A	367_I	1.065	0.15
107_P	167_F	1.064	0.15
258_F	607_T	1.062	0.15
7_D	248_A	1.057	0.15
231_S	615_E	1.057	0.15
208_L	489_L	1.057	0.15
170_I	203_K	1.056	0.15
328_G	647_N	1.053	0.15
10_L	38_A	1.051	0.15
33_Q	584_T	1.050	0.15
115_R	398_E	1.049	0.15
44_Q	518_V	1.049	0.15
123_L	657_S	1.046	0.15
347_M	350_T	1.044	0.15
175_N	226_D	1.043	0.15
373_F	565_L	1.043	0.15
121_M	203_K	1.037	0.15
84_W	90_Q	1.037	0.15
492_L	629_L	1.034	0.15
269_M	487_L	1.033	0.15
132_R	422_Y	1.031	0.15
44_Q	480_G	1.030	0.15
123_L	439_W	1.030	0.15
24_H	219_L	1.030	0.15
356_L	411_G	1.025	0.15
34_Y	358_L	1.019	0.14
95_V	159_K	1.019	0.14
22_T	91_A	1.016	0.14
555_M	588_A	1.016	0.14
92_L	371_L	1.015	0.14
95_V	163_L	1.015	0.14
56_P	59_F	1.015	0.14
556_F	559_E	1.013	0.14
236_V	476_T	1.008	0.14
497_A	625_V	1.007	0.14
477_S	570_K	1.005	0.14
69_L	87_I	1.004	0.14
246_E	600_A	1.004	0.14
65_P	247_L	1.001	0.14
65_P	357_R	1.001	0.14
52_A	625_V	0.998	0.14
310_P	507_F	0.996	0.14
597_S	638_S	0.988	0.14
370_M	514_I	0.988	0.14
163_L	196_S	0.988	0.14
208_L	311_P	0.988	0.14
415_I	418_F	0.988	0.14
463_I	538_V	0.987	0.14
237_G	656_Y	0.986	0.14
284_Q	312_N	0.986	0.14
33_Q	391_G	0.985	0.14
315_T	327_T	0.984	0.14
599_M	610_I	0.981	0.14
146_L	588_A	0.978	0.14
321_G	335_G	0.974	0.14
407_V	532_L	0.973	0.14
229_S	262_T	0.971	0.14
7_D	36_L	0.969	0.14
50_F	347_M	0.969	0.14
275_G	279_N	0.968	0.14
56_P	611_L	0.968	0.14
25_I	115_R	0.963	0.14
92_L	351_G	0.959	0.14
598_V	643_W	0.959	0.14
37_A	611_L	0.958	0.14
169_L	468_Q	0.958	0.14
109_F	145_L	0.957	0.14
527_S	656_Y	0.956	0.14
243_S	248_A	0.955	0.14
17_A	128_V	0.955	0.14
363_L	408_P	0.950	0.13
238_S	244_V	0.950	0.13
424_L	536_N	0.949	0.13
225_V	436_G	0.947	0.13
378_L	527_S	0.944	0.13
284_Q	321_G	0.943	0.13
40_K	582_L	0.942	0.13
417_G	572_N	0.942	0.13
38_A	418_F	0.941	0.13
211_L	349_G	0.941	0.13
267_G	551_N	0.938	0.13
201_K	561_D	0.935	0.13
275_G	618_K	0.935	0.13
231_S	303_N	0.930	0.13
43_T	73_T	0.928	0.13
141_V	153_R	0.927	0.13
169_L	601_M	0.926	0.13
377_G	546_L	0.926	0.13
418_F	628_F	0.926	0.13
304_H	342_G	0.926	0.13
24_H	27_Q	0.925	0.13
321_G	331_G	0.925	0.13
346_N	368_S	0.925	0.13
461_V	481_S	0.925	0.13
48_N	131_S	0.922	0.13
495_T	503_R	0.922	0.13
601_M	640_L	0.921	0.13
204_I	645_K	0.921	0.13
51_Y	453_S	0.920	0.13
609_P	658_G	0.918	0.13
482_V	538_V	0.918	0.13
54_F	602_G	0.917	0.13
133_T	416_A	0.915	0.13
211_L	421_Q	0.915	0.13
370_M	468_Q	0.914	0.13
14_L	640_L	0.913	0.13
567_Y	626_K	0.911	0.13
47_H	401_F	0.910	0.13
116_I	419_F	0.910	0.13
230_S	313_G	0.910	0.13
182_F	455_Y	0.908	0.13
175_N	247_L	0.908	0.13
175_N	357_R	0.908	0.13
90_Q	218_S	0.905	0.13
25_I	156_K	0.905	0.13
376_I	659_S	0.904	0.13
616_L	628_F	0.904	0.13
130_V	573_T	0.904	0.13
164_L	235_Y	0.902	0.13
255_E	258_F	0.902	0.13
144_L	183_M	0.901	0.13
163_L	465_A	0.901	0.13
584_T	594_E	0.901	0.13
196_S	659_S	0.900	0.13
117_A	573_T	0.899	0.13
228_A	308_P	0.898	0.13
127_A	590_Y	0.898	0.13
529_T	578_L	0.897	0.13
85_S	183_M	0.897	0.13
446_Y	458_P	0.896	0.13
210_S	573_T	0.895	0.13
169_L	337_P	0.894	0.13
477_S	649_K	0.894	0.13
229_S	345_V	0.894	0.13
73_T	114_A	0.894	0.13
106_K	403_A	0.892	0.13
569_R	621_K	0.891	0.13
618_K	639_E	0.889	0.13
228_A	581_T	0.889	0.13
68_V	135_N	0.888	0.13
121_M	583_T	0.888	0.13
156_K	210_S	0.887	0.13
482_V	486_V	0.887	0.13
192_Y	214_L	0.885	0.13
211_L	568_L	0.884	0.13
300_S	376_I	0.884	0.13
86_V	191_F	0.883	0.13
43_T	607_T	0.883	0.13
568_L	627_Y	0.881	0.12
460_A	493_G	0.881	0.12
26_W	142_F	0.880	0.12
30_T	69_L	0.880	0.12
82_H	127_A	0.878	0.12
46_F	495_T	0.877	0.12
120_V	370_M	0.877	0.12
330_N	444_R	0.876	0.12
278_Q	440_Y	0.873	0.12
36_L	68_V	0.869	0.12
33_Q	196_S	0.869	0.12
217_L	268_D	0.868	0.12
300_S	303_N	0.867	0.12
115_R	248_A	0.866	0.12
126_I	535_G	0.866	0.12
210_S	224_A	0.864	0.12
115_R	579_F	0.863	0.12
71_I	139_M	0.862	0.12
163_L	202_K	0.862	0.12
51_Y	621_K	0.862	0.12
25_I	537_S	0.861	0.12
280_Q	659_S	0.859	0.12
117_A	444_R	0.858	0.12
360_Q	579_F	0.857	0.12
227_S	236_V	0.857	0.12
591_I	595_N	0.856	0.12
50_F	71_I	0.853	0.12
95_V	442_M	0.852	0.12
199_S	340_G	0.852	0.12
71_I	90_Q	0.852	0.12
126_I	455_Y	0.852	0.12
100_L	168_A	0.851	0.12
36_L	416_A	0.848	0.12
281_D	637_N	0.848	0.12
464_T	537_S	0.846	0.12
166_A	579_F	0.846	0.12
85_S	576_E	0.846	0.12
577_Y	619_L	0.845	0.12
48_N	60_V	0.844	0.12
87_I	468_Q	0.842	0.12
330_N	336_G	0.842	0.12
468_Q	607_T	0.841	0.12
364_S	479_I	0.841	0.12
584_T	600_A	0.837	0.12
167_F	180_Q	0.836	0.12
90_Q	122_A	0.835	0.12
131_S	595_N	0.835	0.12
50_F	220_S	0.834	0.12
565_L	629_L	0.834	0.12
152_L	437_I	0.833	0.12
430_P	490_L	0.833	0.12
87_I	529_T	0.832	0.12
134_N	247_L	0.832	0.12
134_N	357_R	0.832	0.12
475_Y	526_W	0.832	0.12
107_P	115_R	0.831	0.12
151_L	452_W	0.825	0.12
164_L	301_F	0.824	0.12
218_S	537_S	0.823	0.12
90_Q	143_T	0.822	0.12
36_L	583_T	0.822	0.12
600_A	606_G	0.821	0.12
462_L	494_I	0.821	0.12
91_A	122_A	0.820	0.12
147_G	310_P	0.820	0.12
51_Y	240_Q	0.819	0.12
379_L	492_L	0.819	0.12
156_K	590_Y	0.815	0.12
236_V	446_Y	0.814	0.12
162_W	251_Y	0.814	0.12
209_L	212_V	0.812	0.12
12_L	632_E	0.812	0.12
26_W	579_F	0.812	0.12
168_A	198_V	0.811	0.12
491_G	625_V	0.810	0.12
85_S	167_F	0.810	0.12
154_A	204_I	0.810	0.12
337_P	427_L	0.810	0.12
164_L	583_T	0.809	0.12
317_A	442_M	0.808	0.12
465_A	589_P	0.808	0.12
184_V	650_E	0.805	0.12
62_V	259_G	0.805	0.12
68_V	133_T	0.804	0.11
93_A	139_M	0.802	0.11
30_T	36_L	0.800	0.11
251_Y	544_P	0.799	0.11
321_G	466_V	0.799	0.11
36_L	107_P	0.797	0.11
407_V	576_E	0.796	0.11
193_L	349_G	0.795	0.11
165_T	215_T	0.794	0.11
83_T	109_F	0.793	0.11
249_F	259_G	0.793	0.11
378_L	644_I	0.790	0.11
191_F	544_P	0.788	0.11
321_G	324_T	0.788	0.11
304_H	309_Q	0.787	0.11
65_P	540_P	0.785	0.11
407_V	464_T	0.785	0.11
15_L	653_S	0.784	0.11
160_L	163_L	0.784	0.11
59_F	622_E	0.784	0.11
28_D	90_Q	0.783	0.11
562_S	639_E	0.783	0.11
304_H	318_L	0.781	0.11
409_V	425_I	0.781	0.11
328_G	338_G	0.780	0.11
484_M	489_L	0.776	0.11
83_T	141_V	0.776	0.11
106_K	401_F	0.776	0.11
107_P	248_A	0.776	0.11
163_L	623_G	0.776	0.11
248_A	251_Y	0.775	0.11
93_A	424_L	0.773	0.11
16_A	595_N	0.772	0.11
26_W	590_Y	0.772	0.11
351_G	416_A	0.771	0.11
107_P	426_M	0.771	0.11
336_G	551_N	0.770	0.11
53_S	139_M	0.769	0.11
297_G	521_L	0.769	0.11
379_L	576_E	0.767	0.11
349_G	541_E	0.766	0.11
133_T	626_K	0.766	0.11
262_T	607_T	0.765	0.11
349_G	421_Q	0.764	0.11
173_A	465_A	0.763	0.11
97_S	363_L	0.763	0.11
360_Q	590_Y	0.761	0.11
373_F	439_W	0.760	0.11
345_V	595_N	0.760	0.11
274_G	277_M	0.758	0.11
493_G	502_K	0.755	0.11
355_P	590_Y	0.754	0.11
33_Q	440_Y	0.754	0.11
362_A	455_Y	0.754	0.11
127_A	398_E	0.754	0.11
333_G	552_G	0.754	0.11
421_Q	539_L	0.754	0.11
339_G	647_N	0.753	0.11
69_L	83_T	0.753	0.11
194_I	492_L	0.753	0.11
277_M	493_G	0.752	0.11
167_F	397_K	0.751	0.11
455_Y	652_T	0.751	0.11
30_T	189_V	0.749	0.11
59_F	584_T	0.748	0.11
219_L	513_I	0.748	0.11
143_T	176_M	0.748	0.11
228_A	524_V	0.747	0.11
615_E	662_S	0.747	0.11
43_T	47_H	0.747	0.11
25_I	572_N	0.743	0.11
100_L	188_F	0.743	0.11
581_T	605_N	0.743	0.11
236_V	379_L	0.742	0.11
144_L	244_V	0.740	0.11
148_S	381_A	0.740	0.11
4_K	120_V	0.740	0.11
327_T	569_R	0.740	0.11
266_K	664_N	0.738	0.11
205_G	375_L	0.737	0.11
162_W	173_A	0.737	0.11
112_G	609_P	0.736	0.11
123_L	150_C	0.734	0.11
119_L	170_I	0.733	0.11
105_V	189_V	0.732	0.11
437_I	509_K	0.732	0.11
255_E	527_S	0.729	0.11
491_G	527_S	0.728	0.11
173_A	581_T	0.727	0.11
467_F	483_W	0.725	0.11
236_V	477_S	0.725	0.11
24_H	40_K	0.724	0.11
180_Q	427_L	0.723	0.11
202_K	205_G	0.723	0.11
17_A	649_K	0.722	0.11
114_A	597_S	0.722	0.11
468_Q	519_L	0.722	0.11
9_A	635_S	0.720	0.10
44_Q	48_N	0.719	0.10
184_V	491_G	0.719	0.10
194_I	333_G	0.718	0.10
151_L	426_M	0.718	0.10
381_A	601_M	0.718	0.10
16_A	342_G	0.716	0.10
26_W	87_I	0.713	0.10
139_M	176_M	0.713	0.10
46_F	52_A	0.713	0.10
114_A	367_I	0.713	0.10
132_R	145_L	0.712	0.10
594_E	599_M	0.712	0.10
32_N	132_R	0.712	0.10
42_M	88_I	0.708	0.10
139_M	619_L	0.708	0.10
463_I	664_N	0.708	0.10
262_T	459_A	0.707	0.10
313_G	321_G	0.706	0.10
215_T	375_L	0.704	0.10
279_N	298_N	0.703	0.10
46_F	224_A	0.701	0.10
37_A	150_C	0.700	0.10
210_S	541_E	0.698	0.10
150_C	169_L	0.698	0.10
176_M	629_L	0.698	0.10
527_S	632_E	0.698	0.10
138_S	251_Y	0.695	0.10
164_L	349_G	0.695	0.10
116_I	120_V	0.694	0.10
229_S	264_L	0.693	0.10
117_A	513_I	0.693	0.10
254_T	605_N	0.692	0.10
180_Q	272_A	0.691	0.10
227_S	238_S	0.689	0.10
465_A	582_L	0.689	0.10
426_M	648_G	0.688	0.10
71_I	93_A	0.688	0.10
71_I	341_G	0.687	0.10
142_F	360_Q	0.687	0.10
32_N	422_Y	0.685	0.10
133_T	415_I	0.685	0.10
435_S	489_L	0.684	0.10
32_N	65_P	0.684	0.10
120_V	240_Q	0.684	0.10
114_A	346_N	0.683	0.10
188_F	649_K	0.683	0.10
557_S	592_I	0.683	0.10
120_V	232_S	0.682	0.10
231_S	660_S	0.681	0.10
555_M	631_S	0.680	0.10
174_F	405_W	0.679	0.10
175_N	408_P	0.679	0.10
350_T	417_G	0.678	0.10
50_F	537_S	0.678	0.10
378_L	648_G	0.677	0.10
430_P	452_W	0.676	0.10
259_G	348_F	0.676	0.10
45_S	370_M	0.676	0.10
221_W	244_V	0.675	0.10
50_F	218_S	0.674	0.10
194_I	230_S	0.672	0.10
146_L	589_P	0.671	0.10
372_P	587_A	0.670	0.10
322_G	493_G	0.669	0.10
22_T	159_K	0.669	0.10
117_A	575_E	0.667	0.10
279_N	319_N	0.664	0.10
40_K	599_M	0.663	0.10
435_S	656_Y	0.662	0.10
37_A	194_I	0.662	0.10
13_I	119_L	0.661	0.10
328_G	486_V	0.661	0.10
470_Y	590_Y	0.661	0.10
502_K	571_H	0.660	0.10
280_Q	314_Q	0.659	0.10
212_V	217_L	0.657	0.10
596_E	648_G	0.657	0.10
50_F	424_L	0.656	0.10
143_T	237_G	0.653	0.10
98_V	489_L	0.653	0.10
190_L	415_I	0.653	0.10
282_N	440_Y	0.653	0.10
474_A	518_V	0.652	0.10
52_A	251_Y	0.652	0.10
169_L	437_I	0.651	0.10
522_T	569_R	0.651	0.10
32_N	540_P	0.651	0.10
360_Q	425_I	0.651	0.10
351_G	544_P	0.650	0.10
11_I	297_G	0.650	0.10
56_P	622_E	0.648	0.10
17_A	251_Y	0.648	0.10
185_L	376_I	0.646	0.10
568_L	594_E	0.646	0.10
536_N	571_H	0.645	0.10
660_S	664_N	0.645	0.10
47_H	238_S	0.645	0.10
208_L	267_G	0.644	0.10
629_L	664_N	0.644	0.10
391_G	466_V	0.643	0.10
85_S	648_G	0.643	0.10
183_M	426_M	0.643	0.10
69_L	141_V	0.643	0.10
115_R	142_F	0.643	0.10
22_T	154_A	0.642	0.10
65_P	175_N	0.641	0.10
50_F	91_A	0.641	0.10
318_L	335_G	0.640	0.10
445_L	495_T	0.640	0.10
96_G	628_F	0.640	0.10
194_I	646_K	0.640	0.10
230_S	302_G	0.640	0.10
32_N	134_N	0.639	0.10
93_A	218_S	0.636	0.10
145_L	178_M	0.636	0.10
611_L	622_E	0.636	0.10
56_P	461_V	0.634	0.10
79_F	241_T	0.633	0.10
501_L	552_G	0.633	0.10
212_V	223_I	0.632	0.10
317_A	500_M	0.630	0.09
178_M	577_Y	0.629	0.09
11_I	617_K	0.628	0.09
581_T	589_P	0.628	0.09
298_N	486_V	0.626	0.09
564_L	599_M	0.625	0.09
335_G	444_R	0.625	0.09
580_A	625_V	0.625	0.09
133_T	425_I	0.624	0.09
62_V	69_L	0.623	0.09
36_L	115_R	0.623	0.09
83_T	542_S	0.623	0.09
142_F	592_I	0.623	0.09
228_A	472_L	0.622	0.09
133_T	243_S	0.621	0.09
532_L	618_K	0.620	0.09
56_P	602_G	0.620	0.09
21_N	149_T	0.619	0.09
200_L	346_N	0.619	0.09
52_A	135_N	0.619	0.09
331_G	618_K	0.618	0.09
219_L	323_G	0.617	0.09
202_K	518_V	0.617	0.09
47_H	348_F	0.617	0.09
367_I	584_T	0.617	0.09
459_A	512_T	0.617	0.09
548_G	601_M	0.617	0.09
60_V	136_I	0.615	0.09
79_F	134_N	0.615	0.09
491_G	626_K	0.615	0.09
117_A	604_F	0.615	0.09
111_V	194_I	0.613	0.09
25_I	656_Y	0.611	0.09
486_V	657_S	0.611	0.09
332_P	646_K	0.611	0.09
39_V	472_L	0.610	0.09
364_S	467_F	0.610	0.09
218_S	424_L	0.609	0.09
62_V	544_P	0.609	0.09
25_I	82_H	0.608	0.09
265_A	610_I	0.608	0.09
184_V	459_A	0.608	0.09
301_F	331_G	0.608	0.09
618_K	635_S	0.608	0.09
217_L	317_A	0.608	0.09
76_A	433_A	0.607	0.09
19_F	259_G	0.603	0.09
549_S	638_S	0.603	0.09
141_V	237_G	0.602	0.09
112_G	264_L	0.601	0.09
9_A	30_T	0.600	0.09
87_I	91_A	0.598	0.09
297_G	302_G	0.598	0.09
99_F	370_M	0.596	0.09
108_T	385_W	0.596	0.09
521_L	629_L	0.596	0.09
505_H	516_L	0.595	0.09
238_S	347_M	0.595	0.09
273_G	459_A	0.594	0.09
180_Q	539_L	0.593	0.09
92_L	132_R	0.592	0.09
90_Q	406_L	0.592	0.09
129_A	175_N	0.592	0.09
535_G	541_E	0.590	0.09
602_G	611_L	0.590	0.09
261_T	521_L	0.590	0.09
137_D	177_K	0.590	0.09
594_E	611_L	0.588	0.09
95_V	407_V	0.588	0.09
122_A	436_G	0.588	0.09
605_N	652_T	0.587	0.09
176_M	538_V	0.587	0.09
51_Y	595_N	0.587	0.09
401_F	442_M	0.586	0.09
421_Q	616_L	0.586	0.09
154_A	602_G	0.585	0.09
203_K	622_E	0.583	0.09
170_I	355_P	0.582	0.09
594_E	622_E	0.581	0.09
87_I	141_V	0.581	0.09
359_F	598_V	0.580	0.09
23_Y	471_I	0.579	0.09
365_G	565_L	0.579	0.09
78_I	460_A	0.578	0.09
612_T	618_K	0.577	0.09
385_W	471_I	0.577	0.09
11_I	654_D	0.577	0.09
34_Y	47_H	0.577	0.09
38_A	120_V	0.577	0.09
285_A	516_L	0.577	0.09
266_K	329_G	0.576	0.09
500_M	507_F	0.576	0.09
50_F	122_A	0.574	0.09
59_F	238_S	0.573	0.09
185_L	510_L	0.573	0.09
176_M	531_L	0.572	0.09
54_F	600_A	0.571	0.09
47_H	347_M	0.569	0.09
146_L	584_T	0.569	0.09
442_M	649_K	0.569	0.09
173_A	218_S	0.567	0.09
303_N	329_G	0.565	0.09
156_K	170_I	0.565	0.09
32_N	58_G	0.562	0.09
244_V	516_L	0.561	0.09
172_L	179_M	0.561	0.09
121_M	404_A	0.560	0.09
50_F	222_A	0.560	0.09
28_D	44_Q	0.560	0.09
142_F	581_T	0.560	0.09
561_D	576_E	0.560	0.09
324_T	489_L	0.559	0.09
140_L	429_P	0.559	0.09
253_G	429_P	0.559	0.09
219_L	642_S	0.559	0.09
233_R	242_N	0.559	0.09
524_V	573_T	0.558	0.09
75_F	451_D	0.557	0.09
222_A	244_V	0.557	0.09
28_D	67_V	0.557	0.09
236_V	474_A	0.557	0.09
96_G	581_T	0.556	0.09
60_V	480_G	0.556	0.09
121_M	214_L	0.555	0.09
96_G	529_T	0.554	0.09
48_N	331_G	0.553	0.09
214_L	499_L	0.552	0.09
208_L	639_E	0.552	0.09
208_L	517_C	0.551	0.09
46_F	198_V	0.550	0.09
251_Y	412_F	0.550	0.09
588_A	626_K	0.549	0.09
81_V	86_V	0.549	0.09
368_S	544_P	0.549	0.09
26_W	360_Q	0.547	0.09
232_S	497_A	0.547	0.09
241_T	248_A	0.547	0.09
91_A	365_G	0.545	0.09
60_V	108_T	0.544	0.09
332_P	662_S	0.544	0.09
27_Q	382_I	0.543	0.09
185_L	548_G	0.543	0.09
32_N	175_N	0.542	0.09
462_L	571_H	0.542	0.09
310_P	615_E	0.541	0.09
172_L	205_G	0.541	0.09
232_S	586_T	0.540	0.09
378_L	444_R	0.540	0.09
483_W	525_Y	0.539	0.09
135_N	348_F	0.539	0.09
21_N	424_L	0.538	0.09
36_L	191_F	0.538	0.09
619_L	622_E	0.538	0.09
229_S	240_Q	0.538	0.09
453_S	517_C	0.537	0.09
368_S	412_F	0.536	0.09
583_T	635_S	0.536	0.09
47_H	518_V	0.536	0.09
388_D	547_K	0.535	0.09
202_K	320_G	0.532	0.09
549_S	634_N	0.531	0.08
631_S	636_G	0.531	0.08
59_F	522_T	0.531	0.08
122_A	268_D	0.531	0.08
611_L	624_K	0.530	0.08
14_L	84_W	0.530	0.08
368_S	418_F	0.530	0.08
488_G	528_A	0.530	0.08
412_F	567_Y	0.529	0.08
170_I	594_E	0.529	0.08
446_Y	514_I	0.528	0.08
117_A	511_L	0.527	0.08
412_F	525_Y	0.527	0.08
82_H	475_Y	0.525	0.08
228_A	232_S	0.525	0.08
248_A	412_F	0.525	0.08
78_I	331_G	0.525	0.08
30_T	430_P	0.525	0.08
236_V	460_A	0.523	0.08
436_G	604_F	0.523	0.08
215_T	571_H	0.522	0.08
284_Q	344_S	0.522	0.08
345_V	659_S	0.520	0.08
167_F	248_A	0.519	0.08
162_W	599_M	0.519	0.08
17_A	156_K	0.518	0.08
501_L	596_E	0.518	0.08
93_A	222_A	0.518	0.08
573_T	577_Y	0.517	0.08
75_F	393_A	0.516	0.08
558_S	584_T	0.516	0.08
139_M	232_S	0.513	0.08
73_T	128_V	0.512	0.08
189_V	421_Q	0.510	0.08
66_P	142_F	0.510	0.08
202_K	516_L	0.508	0.08
60_V	118_A	0.507	0.08
85_S	179_M	0.506	0.08
134_N	259_G	0.505	0.08
52_A	580_A	0.505	0.08
43_T	69_L	0.505	0.08
578_L	638_S	0.505	0.08
84_W	336_G	0.505	0.08
106_K	114_A	0.504	0.08
520_L	624_K	0.503	0.08
212_V	282_N	0.502	0.08
194_I	645_K	0.501	0.08
7_D	107_P	0.501	0.08
300_S	308_P	0.501	0.08
579_F	592_I	0.501	0.08
184_V	329_G	0.500	0.08
322_G	499_L	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3wajA	1	0.7182	100	0.904	Contact Map
3rceA	1	0.7182	99.9	0.921	Contact Map
4maaA	1	0.1869	41.2	0.988	Contact Map
4nv5A	1	0.3504	30.8	0.989	Contact Map
1z4hA	1	0.0934	22.6	0.989	Contact Map
1y6uA	1	0.0569	21.4	0.99	Contact Map
4j2nA	4	0.0788	18.6	0.99	Contact Map
2e18A	2	0.1766	17.4	0.99	Contact Map
2rddB	1	0.054	16.7	0.99	Contact Map
2z73A	2	0.2818	15.6	0.99	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0161 seconds.