RESC - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

RESC - Cytochrome c biogenesis protein ResC

UniProt:	P35162	Sequences: MAELSGNFLYAAFLVYLIAVPIFGGAIRGNKDKKGRPNRWANIGITLSIVGFFCHLGYFITRWAASGHAPVSNMFEFTTAFGMMLVLAFIILYFLYRLPSLGLFTLSIALLLIAYASMFPTDISPLIPSLQSNWLYIHVTTAALGQAILAISFVAGVIFLLKHVDQTKPSKKTFWLEAIMFILVTTVAFIAITSAFRLAGYEAEFNWVDKSKEKSVMVYEMPALVGPHQGELLTEGRMEPLVDLPALFSGRKVNTVIWSFGAGLVLYGALRLIIRKRISALLHPLVKNVNLDLVDEVGYRAVSIGFPIFTLGALIFAMIWAQLAWTRFWGWDPKEVWALITFLFYAAYLHLRLSRGWHGEKSAWLAVIGFAIIMFNLIFVNLVLAGLHSYA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	391 (389)
Sequences:	207 (153)
Seq/√Len:	7.8

BACSU - RESC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
142_A	313_A	8.157	1.00
274_I	281_L	5.944	1.00
8_F	57_G	5.345	1.00
172_K	360_E	4.363	0.98
195_A	199_A	3.862	0.96
60_I	64_A	3.644	0.95
270_L	274_I	3.145	0.89
282_L	286_V	3.134	0.89
180_M	279_S	3.106	0.89
162_K	291_L	2.999	0.87
163_H	291_L	2.928	0.85
81_F	152_S	2.926	0.85
146_Q	379_F	2.863	0.84
323_L	326_T	2.839	0.83
292_D	358_H	2.809	0.83
153_F	227_P	2.790	0.82
45_I	94_F	2.771	0.82
202_E	218_V	2.704	0.80
105_T	154_V	2.602	0.77
2_A	123_I	2.595	0.77
166_Q	277_R	2.576	0.77
80_A	153_F	2.567	0.76
227_P	254_N	2.542	0.76
145_G	308_I	2.528	0.75
225_V	257_I	2.470	0.73
153_F	254_N	2.468	0.73
166_Q	173_T	2.382	0.71
22_I	43_I	2.378	0.70
270_L	278_I	2.327	0.69
14_L	264_L	2.301	0.68
223_A	277_R	2.299	0.68
140_T	292_D	2.269	0.67
14_L	18_I	2.190	0.64
121_T	129_S	2.163	0.63
277_R	280_A	2.104	0.60
355_R	378_I	2.070	0.59
92_L	372_I	2.062	0.59
262_A	308_I	2.026	0.57
142_A	318_M	1.993	0.56
327_R	330_G	1.967	0.55
104_F	158_I	1.938	0.54
39_R	127_I	1.936	0.54
149_L	373_I	1.909	0.53
58_Y	65_A	1.868	0.51
225_V	253_V	1.850	0.50
379_F	383_V	1.847	0.50
83_M	140_T	1.831	0.50
306_F	341_T	1.822	0.49
192_I	221_M	1.815	0.49
49_I	90_I	1.803	0.48
248_F	253_V	1.760	0.47
142_A	145_G	1.756	0.47
87_L	348_Y	1.754	0.46
173_T	277_R	1.753	0.46
270_L	281_L	1.747	0.46
87_L	144_L	1.710	0.45
186_T	378_I	1.703	0.44
91_I	109_A	1.702	0.44
310_T	342_F	1.691	0.44
152_S	302_V	1.681	0.44
80_A	298_G	1.669	0.43
86_V	109_A	1.667	0.43
144_L	348_Y	1.663	0.43
181_F	264_L	1.657	0.43
11_A	54_C	1.652	0.42
12_A	255_T	1.648	0.42
78_T	378_I	1.634	0.42
10_Y	133_N	1.626	0.41
44_G	301_A	1.624	0.41
80_A	227_P	1.621	0.41
22_I	47_L	1.614	0.41
194_S	198_L	1.586	0.40
318_M	343_L	1.570	0.39
121_T	127_I	1.567	0.39
180_M	184_V	1.549	0.38
82_G	113_I	1.547	0.38
206_N	231_E	1.524	0.37
46_T	167_T	1.504	0.37
116_A	286_V	1.469	0.35
29_G	348_Y	1.463	0.35
273_I	282_L	1.462	0.35
80_A	254_N	1.458	0.35
47_L	260_F	1.445	0.34
111_L	323_L	1.430	0.34
74_M	140_T	1.430	0.34
195_A	198_L	1.427	0.34
313_A	318_M	1.424	0.34
224_L	242_V	1.404	0.33
367_V	374_M	1.373	0.32
44_G	50_V	1.371	0.32
25_G	28_R	1.367	0.32
26_A	342_F	1.367	0.32
151_I	234_T	1.360	0.31
358_H	374_M	1.357	0.31
120_P	310_T	1.351	0.31
191_A	199_A	1.351	0.31
79_T	82_G	1.326	0.30
132_S	297_V	1.325	0.30
215_S	221_M	1.315	0.30
71_V	103_L	1.302	0.29
244_L	248_F	1.300	0.29
183_L	264_L	1.295	0.29
23_F	75_F	1.293	0.29
19_A	276_K	1.292	0.29
55_H	252_K	1.291	0.29
34_K	257_I	1.282	0.29
223_A	237_R	1.281	0.29
192_I	262_A	1.280	0.29
244_L	249_S	1.262	0.28
27_I	30_N	1.259	0.28
242_V	253_V	1.258	0.28
148_I	373_I	1.250	0.28
172_K	179_I	1.249	0.28
187_V	193_T	1.246	0.28
17_L	373_I	1.242	0.27
204_E	278_I	1.240	0.27
179_I	193_T	1.231	0.27
203_A	239_E	1.227	0.27
65_A	123_I	1.225	0.27
81_F	118_M	1.213	0.27
10_Y	124_S	1.209	0.26
88_A	240_P	1.200	0.26
81_F	302_V	1.195	0.26
58_Y	103_L	1.192	0.26
111_L	118_M	1.186	0.26
87_L	379_F	1.182	0.26
173_T	280_A	1.178	0.25
166_Q	280_A	1.177	0.25
59_F	79_T	1.177	0.25
159_F	363_A	1.161	0.25
81_F	348_Y	1.161	0.25
225_V	244_L	1.159	0.25
178_A	182_I	1.155	0.25
22_I	161_L	1.154	0.25
184_V	224_L	1.154	0.25
105_T	140_T	1.150	0.25
144_L	303_S	1.148	0.25
239_E	289_V	1.143	0.24
48_S	86_V	1.143	0.24
6_G	129_S	1.142	0.24
7_N	44_G	1.141	0.24
298_G	301_A	1.139	0.24
6_G	280_A	1.137	0.24
48_S	106_L	1.137	0.24
344_F	351_L	1.136	0.24
59_F	83_M	1.134	0.24
55_H	150_A	1.132	0.24
108_I	346_A	1.131	0.24
318_M	384_L	1.119	0.24
348_Y	379_F	1.118	0.24
147_A	170_S	1.118	0.24
150_A	342_F	1.117	0.24
84_M	144_L	1.113	0.24
162_K	249_S	1.107	0.23
197_R	200_G	1.106	0.23
110_L	147_A	1.101	0.23
140_T	252_K	1.100	0.23
147_A	348_Y	1.094	0.23
180_M	294_V	1.086	0.23
237_R	278_I	1.082	0.23
8_F	75_F	1.080	0.23
30_N	161_L	1.077	0.22
87_L	279_S	1.075	0.22
112_L	146_Q	1.071	0.22
152_S	193_T	1.069	0.22
58_Y	71_V	1.066	0.22
157_V	161_L	1.064	0.22
226_G	240_P	1.064	0.22
8_F	250_G	1.062	0.22
151_I	168_K	1.061	0.22
85_L	187_V	1.058	0.22
75_F	238_M	1.057	0.22
202_E	253_V	1.054	0.22
78_T	116_A	1.053	0.22
134_W	139_V	1.053	0.22
48_S	147_A	1.046	0.22
108_I	197_R	1.038	0.21
181_F	204_E	1.037	0.21
2_A	326_T	1.034	0.21
10_Y	136_Y	1.020	0.21
176_L	358_H	1.020	0.21
210_K	249_S	1.019	0.21
158_I	293_L	1.015	0.21
289_V	371_A	1.012	0.21
376_N	379_F	1.010	0.21
136_Y	140_T	1.007	0.21
185_T	221_M	1.006	0.21
162_K	298_G	0.995	0.20
129_S	146_Q	0.987	0.20
169_P	195_A	0.987	0.20
164_V	182_I	0.984	0.20
7_N	11_A	0.984	0.20
170_S	361_K	0.972	0.20
33_K	290_N	0.970	0.20
6_G	117_S	0.970	0.20
17_L	81_F	0.968	0.20
223_A	361_K	0.957	0.19
74_M	118_M	0.953	0.19
373_I	376_N	0.950	0.19
109_A	379_F	0.950	0.19
203_A	232_L	0.949	0.19
175_W	293_L	0.948	0.19
197_R	241_L	0.945	0.19
112_L	181_F	0.944	0.19
85_L	108_I	0.944	0.19
4_L	383_V	0.942	0.19
129_S	326_T	0.938	0.19
4_L	261_G	0.936	0.19
223_A	232_L	0.933	0.19
7_N	168_K	0.932	0.19
111_L	187_V	0.930	0.19
83_M	106_L	0.926	0.19
97_R	151_I	0.926	0.19
163_H	298_G	0.926	0.19
260_F	264_L	0.925	0.19
87_L	249_S	0.923	0.18
173_T	223_A	0.922	0.18
223_A	235_E	0.921	0.18
44_G	355_R	0.919	0.18
6_G	82_G	0.918	0.18
199_A	262_A	0.915	0.18
71_V	322_Q	0.915	0.18
336_V	339_L	0.914	0.18
257_I	353_L	0.908	0.18
261_G	355_R	0.908	0.18
93_Y	281_L	0.907	0.18
51_G	361_K	0.907	0.18
148_I	308_I	0.906	0.18
124_S	133_N	0.900	0.18
122_D	278_I	0.899	0.18
253_V	368_I	0.896	0.18
132_S	139_V	0.896	0.18
165_D	385_A	0.893	0.18
187_V	190_I	0.890	0.18
40_W	318_M	0.884	0.18
4_L	57_G	0.884	0.18
243_D	342_F	0.883	0.18
131_Q	363_A	0.881	0.17
39_R	46_T	0.880	0.17
42_N	103_L	0.879	0.17
50_V	180_M	0.878	0.17
378_I	384_L	0.877	0.17
84_M	147_A	0.876	0.17
53_F	220_E	0.875	0.17
162_K	210_K	0.874	0.17
247_L	378_I	0.874	0.17
55_H	322_Q	0.873	0.17
265_V	269_A	0.872	0.17
143_A	313_A	0.872	0.17
113_I	346_A	0.870	0.17
223_A	383_V	0.870	0.17
52_F	90_I	0.869	0.17
39_R	129_S	0.860	0.17
82_G	315_I	0.858	0.17
179_I	371_A	0.857	0.17
106_L	383_V	0.851	0.17
234_T	238_M	0.849	0.17
180_M	225_V	0.848	0.17
146_Q	371_A	0.844	0.17
122_D	190_I	0.838	0.16
178_A	361_K	0.836	0.16
257_I	383_V	0.836	0.16
124_S	355_R	0.835	0.16
169_P	225_V	0.830	0.16
148_I	173_T	0.826	0.16
54_C	147_A	0.825	0.16
145_G	310_T	0.819	0.16
85_L	110_L	0.818	0.16
122_D	216_V	0.817	0.16
180_M	283_H	0.816	0.16
190_I	342_F	0.815	0.16
101_L	120_P	0.810	0.16
121_T	289_V	0.809	0.16
86_V	118_M	0.808	0.16
242_V	286_V	0.808	0.16
207_W	326_T	0.807	0.16
185_T	260_F	0.807	0.16
18_I	64_A	0.806	0.16
14_L	121_T	0.805	0.16
193_T	371_A	0.803	0.16
64_A	109_A	0.800	0.16
39_R	326_T	0.798	0.16
24_G	48_S	0.797	0.16
162_K	303_S	0.797	0.16
343_L	384_L	0.796	0.16
21_P	29_G	0.789	0.15
244_L	250_G	0.789	0.15
98_L	129_S	0.788	0.15
210_K	250_G	0.788	0.15
45_I	123_I	0.787	0.15
207_W	238_M	0.787	0.15
137_I	322_Q	0.777	0.15
261_G	265_V	0.776	0.15
92_L	213_E	0.776	0.15
100_S	268_G	0.776	0.15
78_T	186_T	0.775	0.15
313_A	342_F	0.775	0.15
113_I	141_T	0.768	0.15
195_A	368_I	0.765	0.15
49_I	144_L	0.764	0.15
255_T	378_I	0.763	0.15
55_H	74_M	0.760	0.15
23_F	171_K	0.760	0.15
8_F	363_A	0.760	0.15
103_L	355_R	0.759	0.15
184_V	253_V	0.755	0.15
154_V	178_A	0.755	0.15
148_I	170_S	0.754	0.15
249_S	379_F	0.754	0.15
315_I	362_S	0.753	0.15
32_D	92_L	0.752	0.15
88_A	145_G	0.752	0.15
144_L	225_V	0.752	0.15
81_F	293_L	0.750	0.15
38_N	229_Q	0.749	0.15
131_Q	323_L	0.749	0.15
14_L	348_Y	0.748	0.15
78_T	174_F	0.747	0.15
24_G	162_K	0.745	0.15
121_T	343_L	0.745	0.15
69_A	278_I	0.744	0.14
80_A	143_A	0.743	0.14
118_M	302_V	0.743	0.14
248_F	323_L	0.742	0.14
110_L	124_S	0.742	0.14
74_M	83_M	0.740	0.14
127_I	291_L	0.739	0.14
217_M	225_V	0.737	0.14
122_D	209_D	0.735	0.14
193_T	197_R	0.735	0.14
74_M	81_F	0.735	0.14
39_R	121_T	0.734	0.14
124_S	293_L	0.731	0.14
302_V	379_F	0.727	0.14
83_M	310_T	0.725	0.14
41_A	233_L	0.725	0.14
42_N	50_V	0.724	0.14
223_A	238_M	0.723	0.14
223_A	379_F	0.721	0.14
165_D	280_A	0.719	0.14
142_A	207_W	0.719	0.14
161_L	204_E	0.716	0.14
53_F	199_A	0.715	0.14
55_H	80_A	0.714	0.14
123_I	273_I	0.713	0.14
220_E	279_S	0.713	0.14
185_T	264_L	0.710	0.14
71_V	306_F	0.709	0.14
7_N	171_K	0.708	0.14
43_I	114_A	0.706	0.14
34_K	187_V	0.706	0.14
149_L	305_G	0.705	0.14
91_I	280_A	0.705	0.14
174_F	225_V	0.705	0.14
103_L	179_I	0.704	0.14
66_S	129_S	0.702	0.14
253_V	257_I	0.701	0.14
77_F	342_F	0.700	0.14
45_I	48_S	0.699	0.14
60_I	294_V	0.696	0.14
140_T	144_L	0.694	0.14
206_N	214_K	0.693	0.13
77_F	297_V	0.691	0.13
103_L	154_V	0.690	0.13
79_T	346_A	0.689	0.13
133_N	136_Y	0.688	0.13
81_F	110_L	0.687	0.13
52_F	84_M	0.685	0.13
4_L	237_R	0.683	0.13
161_L	298_G	0.683	0.13
35_G	288_N	0.682	0.13
129_S	291_L	0.682	0.13
180_M	195_A	0.680	0.13
39_R	94_F	0.680	0.13
131_Q	188_A	0.680	0.13
202_E	306_F	0.679	0.13
9_L	75_F	0.678	0.13
285_L	347_A	0.678	0.13
54_C	279_S	0.675	0.13
310_T	315_I	0.675	0.13
362_S	377_L	0.669	0.13
362_S	367_V	0.667	0.13
141_T	373_I	0.665	0.13
250_G	293_L	0.664	0.13
136_Y	326_T	0.664	0.13
15_V	80_A	0.657	0.13
273_I	361_K	0.656	0.13
15_V	202_E	0.656	0.13
104_F	254_N	0.656	0.13
11_A	19_A	0.653	0.13
10_Y	137_I	0.652	0.13
54_C	391_A	0.648	0.13
38_N	129_S	0.646	0.13
248_F	251_R	0.646	0.13
18_I	264_L	0.642	0.13
114_A	257_I	0.639	0.13
181_F	308_I	0.638	0.12
87_L	303_S	0.636	0.12
250_G	318_M	0.635	0.12
20_V	234_T	0.635	0.12
15_V	122_D	0.634	0.12
166_Q	169_P	0.633	0.12
38_N	261_G	0.632	0.12
112_L	231_E	0.630	0.12
240_P	347_A	0.629	0.12
22_I	205_F	0.629	0.12
164_V	200_G	0.629	0.12
127_I	215_S	0.628	0.12
79_T	385_A	0.627	0.12
78_T	154_V	0.626	0.12
147_A	190_I	0.625	0.12
131_Q	355_R	0.625	0.12
46_T	202_E	0.622	0.12
367_V	377_L	0.622	0.12
57_G	75_F	0.621	0.12
231_E	282_L	0.621	0.12
28_R	371_A	0.619	0.12
206_N	244_L	0.619	0.12
182_I	225_V	0.618	0.12
180_M	241_L	0.617	0.12
44_G	198_L	0.615	0.12
145_G	227_P	0.615	0.12
336_V	374_M	0.614	0.12
92_L	383_V	0.614	0.12
40_W	206_N	0.611	0.12
17_L	69_A	0.609	0.12
242_V	264_L	0.608	0.12
184_V	188_A	0.608	0.12
48_S	77_F	0.606	0.12
100_S	211_S	0.605	0.12
212_K	274_I	0.604	0.12
291_L	298_G	0.603	0.12
140_T	166_Q	0.603	0.12
190_I	250_G	0.602	0.12
68_H	351_L	0.600	0.12
57_G	199_A	0.600	0.12
43_I	243_D	0.600	0.12
79_T	113_I	0.599	0.12
65_A	360_E	0.598	0.12
78_T	97_R	0.596	0.12
22_I	44_G	0.596	0.12
28_R	302_V	0.596	0.12
247_L	250_G	0.593	0.12
65_A	84_M	0.592	0.12
171_K	187_V	0.591	0.12
59_F	375_F	0.590	0.12
66_S	187_V	0.589	0.12
303_S	348_Y	0.589	0.12
180_M	204_E	0.587	0.12
246_A	249_S	0.587	0.12
8_F	228_H	0.587	0.12
114_A	225_V	0.587	0.12
18_I	23_F	0.586	0.12
181_F	199_A	0.586	0.12
66_S	186_T	0.586	0.12
65_A	346_A	0.582	0.12
187_V	383_V	0.581	0.12
169_P	361_K	0.580	0.12
26_A	109_A	0.579	0.11
255_T	259_S	0.579	0.11
24_G	100_S	0.578	0.11
221_M	229_Q	0.577	0.11
109_A	249_S	0.577	0.11
121_T	355_R	0.577	0.11
41_A	99_P	0.576	0.11
44_G	178_A	0.576	0.11
12_A	105_T	0.575	0.11
20_V	148_I	0.574	0.11
310_T	354_S	0.574	0.11
89_F	101_L	0.573	0.11
156_G	298_G	0.571	0.11
12_A	171_K	0.571	0.11
25_G	302_V	0.570	0.11
118_M	152_S	0.569	0.11
54_C	116_A	0.569	0.11
121_T	379_F	0.566	0.11
87_L	233_L	0.566	0.11
45_I	109_A	0.566	0.11
50_V	294_V	0.566	0.11
238_M	372_I	0.566	0.11
2_A	38_N	0.566	0.11
165_D	168_K	0.565	0.11
45_I	86_V	0.565	0.11
178_A	279_S	0.564	0.11
242_V	248_F	0.562	0.11
199_A	287_K	0.562	0.11
77_F	313_A	0.560	0.11
189_F	366_A	0.559	0.11
373_I	379_F	0.559	0.11
81_F	194_S	0.559	0.11
16_Y	145_G	0.559	0.11
115_Y	266_L	0.558	0.11
133_N	235_E	0.557	0.11
39_R	45_I	0.557	0.11
18_I	348_Y	0.557	0.11
235_E	371_A	0.556	0.11
242_V	257_I	0.556	0.11
213_E	342_F	0.555	0.11
168_K	210_K	0.554	0.11
365_L	378_I	0.554	0.11
224_L	253_V	0.553	0.11
26_A	182_I	0.553	0.11
35_G	178_A	0.552	0.11
67_G	144_L	0.551	0.11
210_K	291_L	0.551	0.11
14_L	162_K	0.550	0.11
209_D	248_F	0.548	0.11
18_I	136_Y	0.547	0.11
20_V	286_V	0.547	0.11
61_T	104_F	0.547	0.11
74_M	80_A	0.546	0.11
124_S	290_N	0.544	0.11
27_I	232_L	0.544	0.11
94_F	178_A	0.544	0.11
182_I	198_L	0.543	0.11
56_L	129_S	0.543	0.11
244_L	247_L	0.541	0.11
169_P	192_I	0.541	0.11
129_S	356_G	0.541	0.11
185_T	188_A	0.540	0.11
124_S	178_A	0.540	0.11
204_E	216_V	0.540	0.11
213_E	257_I	0.540	0.11
240_P	377_L	0.540	0.11
161_L	261_G	0.539	0.11
55_H	301_A	0.538	0.11
272_L	361_K	0.537	0.11
10_Y	81_F	0.534	0.11
200_G	220_E	0.533	0.11
192_I	268_G	0.533	0.11
101_L	310_T	0.533	0.11
167_T	187_V	0.531	0.11
123_I	173_T	0.530	0.11
54_C	74_M	0.529	0.11
211_S	308_I	0.529	0.11
232_L	287_K	0.529	0.11
112_L	378_I	0.528	0.11
149_L	194_S	0.527	0.11
146_Q	154_V	0.526	0.11
28_R	81_F	0.526	0.11
77_F	252_K	0.525	0.11
87_L	326_T	0.525	0.11
52_F	86_V	0.525	0.11
318_M	339_L	0.524	0.11
168_K	231_E	0.524	0.11
17_L	20_V	0.524	0.11
257_I	265_V	0.522	0.11
71_V	105_T	0.522	0.11
83_M	147_A	0.522	0.11
66_S	166_Q	0.522	0.11
97_R	368_I	0.521	0.11
85_L	190_I	0.521	0.11
14_L	212_K	0.520	0.11
3_E	211_S	0.520	0.11
24_G	194_S	0.520	0.11
204_E	218_V	0.518	0.11
356_G	363_A	0.518	0.11
158_I	302_V	0.518	0.11
223_A	266_L	0.517	0.11
23_F	200_G	0.517	0.11
12_A	93_Y	0.514	0.10
92_L	179_I	0.514	0.10
124_S	264_L	0.513	0.10
42_N	97_R	0.513	0.10
144_L	294_V	0.513	0.10
83_M	175_W	0.513	0.10
216_V	224_L	0.511	0.10
183_L	371_A	0.511	0.10
132_S	144_L	0.511	0.10
161_L	250_G	0.510	0.10
342_F	360_E	0.509	0.10
289_V	383_V	0.509	0.10
36_R	270_L	0.508	0.10
54_C	163_H	0.508	0.10
87_L	121_T	0.508	0.10
210_K	301_A	0.507	0.10
140_T	227_P	0.506	0.10
43_I	56_L	0.505	0.10
140_T	153_F	0.503	0.10
117_S	280_A	0.501	0.10
249_S	291_L	0.501	0.10
54_C	140_T	0.501	0.10
245_P	367_V	0.500	0.10
97_R	326_T	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4jq6A	3	0.4604	28.1	0.983	Contact Map
1zcdA	1	0.2327	12.1	0.985	Contact Map
4hyjA	2	0.509	11.6	0.986	Contact Map
2jafA	3	0.5192	11.2	0.986	Contact Map
3qapA	1	0.4936	10.7	0.986	Contact Map
4fbzA	3	0.5473	9.1	0.986	Contact Map
1b9uA	1	0.087	8.1	0.987	Contact Map
3wxwA	1	0.1816	6.9	0.987	Contact Map
1xioA	2	0.509	6.5	0.987	Contact Map
4knfA	3	0.4962	6.4	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0108 seconds.