SP4A - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SP4A - Stage IV sporulation protein A

UniProt:	P35149	Sequences: MEKVDIFKDIAERTGGDIYLGVVGAVRTGKSTFIKKFMELVVLPNISNEADRARAQDELPQSAAGKTIMTTEPKFVPNQAMSVHVSDGLDVNIRLVDCVGYTVPGAKGYEDENGPRMINTPWYEEPIPFHEAAEIGTRKVIQEHSTIGVVITTDGTIGDIARSDYIEAEERVIEELKEVGKPFIMVINSVRPYHPETEAMRQDLSEKYDIPVLAMSVESMRESDVLSVLREALYEFPVLEVNVNLPSWVMVLKENHWLRESYQESVKETVKDIKRLRDVDRVVGQFSEFEFIESAGLAGIELGQGVAEIDLYAPDHLYDQILKEVVGVEIRGRDHLLELMQDFAHAKTEYDQVSDALKMVKQTGYGIAAPALADMSLDEPEIIRQGSRFGVRLKAVAPSIHMIKVDVESEFAPIIGTEKQSEELVRYLMQDFEDDPLSIWNSDIFGRSLSSIVREGIQAKLSLMPENARYKLKETLERIINEGSGGLIAIIL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	492 (491)
Sequences:	435 (304)
Seq/√Len:	13.7

BACSU - SP4A

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
173_I	185_M	8.892	1.00
170_E	207_K	7.479	1.00
150_V	173_I	6.131	1.00
123_Y	127_I	5.772	1.00
216_S	219_S	4.814	1.00
187_I	212_V	4.258	1.00
186_V	215_M	3.821	0.99
215_M	228_V	3.781	0.99
201_R	214_A	3.671	0.99
63_A	71_T	3.643	0.99
63_A	69_M	3.639	0.99
194_H	197_T	3.385	0.99
187_I	201_R	3.162	0.98
147_I	232_A	3.132	0.98
405_V	473_K	3.112	0.98
35_K	71_T	3.052	0.97
185_M	210_I	2.955	0.97
301_E	304_Q	2.837	0.96
20_L	66_K	2.758	0.95
405_V	409_S	2.745	0.95
38_M	42_V	2.742	0.95
257_W	321_I	2.741	0.95
170_E	197_T	2.702	0.95
105_G	164_D	2.626	0.94
151_I	238_V	2.562	0.93
43_L	394_K	2.498	0.92
187_I	200_M	2.456	0.91
204_L	212_V	2.333	0.89
153_T	157_I	2.306	0.88
162_R	169_E	2.260	0.87
64_A	76_V	2.245	0.87
473_K	477_E	2.235	0.87
150_V	185_M	2.205	0.86
102_T	105_G	2.195	0.86
104_P	167_E	2.122	0.84
361_K	374_D	2.116	0.83
189_S	197_T	2.114	0.83
347_K	351_D	2.090	0.83
170_E	208_Y	2.072	0.82
82_S	90_D	2.065	0.82
479_I	485_G	2.047	0.81
410_E	447_R	2.022	0.80
360_V	402_M	1.974	0.79
360_V	400_I	1.969	0.79
38_M	59_L	1.959	0.78
39_E	71_T	1.955	0.78
238_V	273_I	1.940	0.77
82_S	92_N	1.940	0.77
259_R	384_R	1.927	0.77
411_F	489_A	1.925	0.77
353_V	411_F	1.891	0.76
146_T	175_E	1.872	0.75
341_Q	389_F	1.841	0.74
483_G	492_L	1.832	0.73
333_R	411_F	1.832	0.73
464_M	476_L	1.831	0.73
231_E	277_R	1.825	0.73
200_M	204_L	1.819	0.73
138_R	142_Q	1.812	0.72
177_K	183_F	1.791	0.71
344_A	391_V	1.784	0.71
193_Y	221_R	1.783	0.71
92_N	384_R	1.778	0.71
258_L	321_I	1.773	0.71
113_N	151_I	1.765	0.70
116_R	420_Q	1.760	0.70
349_E	361_K	1.731	0.69
174_E	177_K	1.722	0.68
35_K	62_S	1.720	0.68
187_I	204_L	1.707	0.68
457_I	467_N	1.706	0.68
191_R	194_H	1.685	0.67
217_V	220_M	1.675	0.66
476_L	480_I	1.656	0.65
191_R	197_T	1.653	0.65
197_T	200_M	1.652	0.65
467_N	480_I	1.625	0.64
63_A	367_I	1.624	0.64
452_I	480_I	1.611	0.63
405_V	472_L	1.598	0.62
412_A	427_Y	1.591	0.62
33_F	37_F	1.587	0.62
25_A	443_D	1.587	0.62
102_T	109_Y	1.586	0.62
193_Y	223_S	1.584	0.62
418_E	422_E	1.577	0.61
173_I	277_R	1.572	0.61
447_R	452_I	1.554	0.60
157_I	190_V	1.528	0.59
186_V	228_V	1.509	0.58
353_V	405_V	1.507	0.58
415_I	447_R	1.499	0.57
319_D	489_A	1.485	0.56
234_Y	302_L	1.479	0.56
173_I	204_L	1.478	0.56
423_E	428_L	1.473	0.56
261_S	289_F	1.464	0.55
301_E	417_T	1.463	0.55
256_H	324_E	1.460	0.55
72_E	259_R	1.458	0.55
410_E	491_I	1.435	0.54
35_K	39_E	1.435	0.54
157_I	165_Y	1.432	0.54
234_Y	276_L	1.430	0.54
35_K	58_E	1.428	0.53
205_S	214_A	1.426	0.53
200_M	212_V	1.415	0.53
138_R	361_K	1.411	0.53
76_V	158_G	1.409	0.52
411_F	447_R	1.405	0.52
110_E	113_N	1.401	0.52
235_E	277_R	1.400	0.52
50_A	428_L	1.397	0.52
220_M	228_V	1.391	0.51
412_A	482_E	1.390	0.51
127_I	135_I	1.381	0.51
202_Q	206_E	1.380	0.51
265_S	289_F	1.369	0.50
102_T	130_H	1.367	0.50
129_F	212_V	1.364	0.50
46_I	81_M	1.363	0.50
333_R	489_A	1.357	0.50
452_I	459_A	1.356	0.50
43_L	56_Q	1.337	0.49
147_I	235_E	1.331	0.48
471_K	485_G	1.322	0.48
203_D	207_K	1.318	0.48
385_Q	461_L	1.312	0.47
95_L	201_R	1.306	0.47
468_A	487_L	1.301	0.47
409_S	473_K	1.299	0.47
134_E	171_R	1.289	0.46
177_K	373_A	1.285	0.46
443_D	489_A	1.273	0.45
185_M	212_V	1.270	0.45
367_I	444_I	1.269	0.45
101_Y	160_I	1.269	0.45
66_K	376_S	1.267	0.45
469_R	485_G	1.265	0.45
149_V	184_I	1.260	0.44
409_S	489_A	1.258	0.44
143_E	379_E	1.258	0.44
486_G	491_I	1.248	0.44
360_V	475_T	1.244	0.44
241_V	260_E	1.244	0.44
418_E	448_S	1.241	0.43
7_F	415_I	1.235	0.43
217_V	375_M	1.228	0.43
403_I	469_R	1.225	0.43
170_E	200_M	1.223	0.42
89_L	323_K	1.213	0.42
177_K	209_D	1.209	0.42
161_A	234_Y	1.209	0.42
249_V	375_M	1.207	0.42
276_L	280_D	1.197	0.41
410_E	482_E	1.192	0.41
421_S	428_L	1.192	0.41
421_S	492_L	1.191	0.41
464_M	479_I	1.191	0.41
170_E	187_I	1.179	0.40
464_M	480_I	1.177	0.40
71_T	129_F	1.175	0.40
202_Q	205_S	1.170	0.40
54_R	61_Q	1.164	0.39
429_M	457_I	1.153	0.39
319_D	407_V	1.152	0.39
414_I	439_I	1.151	0.39
156_T	202_Q	1.137	0.38
218_E	318_Y	1.137	0.38
12_E	389_F	1.136	0.38
276_L	300_I	1.132	0.38
455_E	478_R	1.131	0.38
363_T	477_E	1.127	0.38
399_S	464_M	1.122	0.37
255_N	260_E	1.119	0.37
346_A	351_D	1.119	0.37
20_L	149_V	1.119	0.37
389_F	422_E	1.114	0.37
76_V	333_R	1.111	0.37
444_I	456_G	1.110	0.37
379_E	429_M	1.106	0.37
7_F	25_A	1.104	0.36
116_R	327_G	1.102	0.36
119_N	126_P	1.097	0.36
240_E	397_A	1.097	0.36
297_L	307_A	1.095	0.36
231_E	307_A	1.095	0.36
197_T	212_V	1.090	0.36
61_Q	69_M	1.090	0.36
150_V	203_D	1.088	0.36
443_D	482_E	1.088	0.36
242_N	306_V	1.085	0.35
177_K	210_I	1.080	0.35
411_F	421_S	1.078	0.35
375_M	417_T	1.078	0.35
94_R	258_L	1.076	0.35
85_V	280_D	1.072	0.35
222_E	389_F	1.069	0.35
206_E	213_L	1.064	0.34
28_T	103_V	1.064	0.34
382_I	421_S	1.063	0.34
96_V	337_L	1.062	0.34
81_M	292_I	1.059	0.34
185_M	200_M	1.056	0.34
444_I	474_E	1.054	0.34
156_T	197_T	1.053	0.34
482_E	491_I	1.053	0.34
102_T	415_I	1.051	0.34
319_D	411_F	1.049	0.34
171_R	232_A	1.049	0.34
179_V	306_V	1.047	0.34
212_V	324_E	1.045	0.34
324_E	473_K	1.045	0.34
125_E	394_K	1.045	0.34
63_A	228_V	1.043	0.33
261_S	265_S	1.042	0.33
425_V	448_S	1.040	0.33
159_D	167_E	1.039	0.33
51_D	457_I	1.038	0.33
50_A	53_A	1.035	0.33
412_A	491_I	1.032	0.33
107_K	318_Y	1.031	0.33
151_I	217_V	1.030	0.33
249_V	388_R	1.023	0.32
69_M	116_R	1.023	0.32
259_R	478_R	1.022	0.32
398_P	404_K	1.020	0.32
425_V	442_S	1.018	0.32
6_I	240_E	1.013	0.32
54_R	67_T	1.012	0.32
266_V	302_L	1.008	0.32
439_I	453_V	1.006	0.32
109_Y	387_S	0.999	0.31
399_S	405_V	0.995	0.31
351_D	354_S	0.992	0.31
368_A	489_A	0.992	0.31
36_K	191_R	0.992	0.31
319_D	333_R	0.992	0.31
160_I	374_D	0.991	0.31
42_V	58_E	0.990	0.31
341_Q	469_R	0.989	0.31
58_E	61_Q	0.983	0.31
111_D	143_E	0.983	0.31
468_A	474_E	0.977	0.30
85_V	92_N	0.977	0.30
151_I	295_A	0.973	0.30
20_L	205_S	0.970	0.30
382_I	457_I	0.964	0.30
109_Y	130_H	0.962	0.30
327_G	482_E	0.957	0.29
475_T	486_G	0.956	0.29
35_K	61_Q	0.954	0.29
414_I	453_V	0.954	0.29
227_S	392_R	0.954	0.29
82_S	88_G	0.950	0.29
247_S	482_E	0.947	0.29
41_V	394_K	0.940	0.29
325_V	337_L	0.937	0.29
173_I	212_V	0.935	0.28
468_A	478_R	0.932	0.28
277_R	352_Q	0.932	0.28
42_V	61_Q	0.931	0.28
86_S	230_R	0.930	0.28
294_S	312_Y	0.928	0.28
68_I	135_I	0.924	0.28
78_N	387_S	0.924	0.28
187_I	197_T	0.924	0.28
201_R	369_A	0.920	0.28
212_V	321_I	0.920	0.28
66_K	138_R	0.918	0.28
134_E	453_V	0.915	0.28
52_R	180_G	0.910	0.27
270_V	382_I	0.908	0.27
179_V	476_L	0.908	0.27
151_I	262_Y	0.907	0.27
143_E	373_A	0.907	0.27
389_F	404_K	0.907	0.27
260_E	264_E	0.906	0.27
171_R	433_E	0.906	0.27
15_G	51_D	0.905	0.27
403_I	473_K	0.903	0.27
454_R	474_E	0.903	0.27
432_F	461_L	0.900	0.27
465_P	483_G	0.897	0.27
419_K	422_E	0.894	0.27
76_V	314_P	0.892	0.27
459_A	462_S	0.891	0.27
63_A	472_L	0.890	0.27
149_V	277_R	0.888	0.26
103_V	160_I	0.887	0.26
53_A	56_Q	0.887	0.26
438_S	442_S	0.884	0.26
6_I	47_S	0.884	0.26
90_D	347_K	0.884	0.26
46_I	350_Y	0.882	0.26
405_V	463_L	0.881	0.26
178_E	272_D	0.881	0.26
322_L	340_M	0.877	0.26
448_S	461_L	0.870	0.26
307_A	392_R	0.869	0.26
225_V	244_N	0.868	0.26
249_V	252_L	0.868	0.26
67_T	111_D	0.867	0.26
465_P	468_A	0.866	0.26
317_L	476_L	0.864	0.25
113_N	185_M	0.864	0.25
391_V	412_A	0.862	0.25
368_A	411_F	0.860	0.25
84_H	203_D	0.860	0.25
254_E	384_R	0.856	0.25
63_A	425_V	0.856	0.25
331_R	335_H	0.855	0.25
443_D	447_R	0.854	0.25
354_S	358_K	0.850	0.25
91_V	277_R	0.850	0.25
41_V	225_V	0.847	0.25
39_E	151_I	0.847	0.25
115_P	436_P	0.846	0.25
109_Y	263_Q	0.844	0.25
145_S	156_T	0.841	0.25
96_V	255_N	0.840	0.25
63_A	363_T	0.839	0.24
109_Y	113_N	0.839	0.24
262_Y	304_Q	0.839	0.24
187_I	214_A	0.838	0.24
336_L	350_Y	0.837	0.24
35_K	63_A	0.837	0.24
142_Q	392_R	0.837	0.24
95_L	384_R	0.836	0.24
173_I	328_V	0.835	0.24
255_N	309_I	0.833	0.24
111_D	319_D	0.832	0.24
119_N	277_R	0.830	0.24
101_Y	393_L	0.830	0.24
160_I	428_L	0.829	0.24
419_K	450_S	0.825	0.24
226_L	361_K	0.824	0.24
40_L	389_F	0.824	0.24
250_M	334_D	0.823	0.24
63_A	67_T	0.822	0.24
217_V	313_A	0.820	0.24
5_D	91_V	0.820	0.24
385_Q	395_A	0.819	0.24
232_A	409_S	0.816	0.24
39_E	135_I	0.815	0.24
220_M	225_V	0.811	0.23
393_L	468_A	0.811	0.23
217_V	302_L	0.810	0.23
318_Y	438_S	0.808	0.23
224_D	451_S	0.808	0.23
360_V	473_K	0.802	0.23
422_E	426_R	0.802	0.23
424_L	447_R	0.801	0.23
34_I	71_T	0.801	0.23
359_M	437_L	0.800	0.23
185_M	205_S	0.798	0.23
379_E	424_L	0.796	0.23
232_A	415_I	0.796	0.23
318_Y	421_S	0.795	0.23
106_A	485_G	0.795	0.23
392_R	484_S	0.793	0.23
298_A	404_K	0.790	0.23
204_L	321_I	0.790	0.23
424_L	456_G	0.787	0.22
172_V	465_P	0.786	0.22
54_R	58_E	0.786	0.22
424_L	457_I	0.785	0.22
409_S	443_D	0.783	0.22
113_N	211_P	0.783	0.22
83_V	251_V	0.782	0.22
367_I	492_L	0.781	0.22
279_V	402_M	0.781	0.22
171_R	175_E	0.780	0.22
320_Q	404_K	0.779	0.22
205_S	314_P	0.778	0.22
443_D	467_N	0.777	0.22
424_L	440_W	0.775	0.22
395_A	464_M	0.774	0.22
45_N	211_P	0.774	0.22
160_I	164_D	0.774	0.22
96_V	215_M	0.773	0.22
274_K	354_S	0.771	0.22
64_A	417_T	0.768	0.22
293_E	358_K	0.768	0.22
318_Y	457_I	0.766	0.22
164_D	329_E	0.765	0.22
112_E	127_I	0.764	0.22
105_G	130_H	0.764	0.22
2_E	184_I	0.762	0.22
471_K	479_I	0.762	0.22
159_D	205_S	0.760	0.21
318_Y	375_M	0.758	0.21
52_R	478_R	0.758	0.21
319_D	368_A	0.757	0.21
66_K	474_E	0.757	0.21
425_V	478_R	0.756	0.21
234_Y	249_V	0.752	0.21
229_L	332_G	0.752	0.21
216_S	469_R	0.747	0.21
49_E	83_V	0.747	0.21
58_E	71_T	0.746	0.21
400_I	474_E	0.744	0.21
259_R	275_R	0.743	0.21
203_D	309_I	0.743	0.21
98_C	141_I	0.742	0.21
353_V	357_L	0.741	0.21
11_A	266_V	0.741	0.21
350_Y	357_L	0.738	0.21
194_H	231_E	0.733	0.21
461_L	479_I	0.732	0.20
372_L	375_M	0.730	0.20
426_R	455_E	0.730	0.20
212_V	449_L	0.725	0.20
109_Y	262_Y	0.725	0.20
452_I	457_I	0.725	0.20
105_G	266_V	0.725	0.20
82_S	243_V	0.724	0.20
109_Y	129_F	0.721	0.20
178_E	209_D	0.721	0.20
76_V	421_S	0.720	0.20
41_V	418_E	0.718	0.20
314_P	404_K	0.718	0.20
388_R	414_I	0.718	0.20
12_E	433_E	0.717	0.20
61_Q	71_T	0.717	0.20
111_D	262_Y	0.716	0.20
138_R	225_V	0.715	0.20
28_T	448_S	0.715	0.20
353_V	400_I	0.714	0.20
11_A	17_D	0.714	0.20
119_N	303_G	0.713	0.20
372_L	465_P	0.712	0.20
213_L	253_K	0.711	0.20
191_R	196_E	0.711	0.20
8_K	227_S	0.710	0.20
98_C	140_V	0.709	0.20
184_I	212_V	0.709	0.20
397_A	465_P	0.707	0.20
178_E	392_R	0.705	0.20
41_V	307_A	0.704	0.20
93_I	455_E	0.704	0.20
217_V	326_V	0.704	0.20
131_E	388_R	0.703	0.19
340_M	472_L	0.702	0.19
59_L	80_A	0.702	0.19
10_I	18_I	0.702	0.19
48_N	474_E	0.702	0.19
257_W	324_E	0.701	0.19
359_M	462_S	0.700	0.19
427_Y	472_L	0.700	0.19
418_E	475_T	0.699	0.19
243_V	259_R	0.699	0.19
172_V	488_I	0.697	0.19
405_V	489_A	0.696	0.19
344_A	384_R	0.695	0.19
377_L	439_I	0.694	0.19
433_E	449_L	0.694	0.19
251_V	467_N	0.693	0.19
113_N	292_I	0.693	0.19
103_V	410_E	0.691	0.19
420_Q	472_L	0.690	0.19
422_E	432_F	0.688	0.19
221_R	224_D	0.688	0.19
131_E	484_S	0.685	0.19
7_F	319_D	0.684	0.19
159_D	190_V	0.684	0.19
313_A	367_I	0.684	0.19
295_A	466_E	0.679	0.19
270_V	457_I	0.679	0.19
86_S	384_R	0.679	0.19
115_P	421_S	0.677	0.19
214_A	369_A	0.677	0.19
342_D	407_V	0.675	0.19
110_E	130_H	0.675	0.19
221_R	285_Q	0.675	0.19
405_V	421_S	0.674	0.19
196_E	345_H	0.674	0.19
321_I	465_P	0.674	0.19
24_G	27_R	0.673	0.18
463_L	489_A	0.673	0.18
431_D	463_L	0.673	0.18
452_I	489_A	0.672	0.18
254_E	340_M	0.672	0.18
171_R	351_D	0.669	0.18
333_R	447_R	0.668	0.18
124_E	279_V	0.667	0.18
160_I	383_I	0.663	0.18
377_L	388_R	0.663	0.18
190_V	428_L	0.662	0.18
290_E	351_D	0.659	0.18
407_V	447_R	0.654	0.18
40_L	222_E	0.653	0.18
359_M	368_A	0.649	0.18
167_E	290_E	0.647	0.18
435_D	483_G	0.646	0.18
12_E	266_V	0.645	0.18
399_S	453_V	0.643	0.18
260_E	384_R	0.642	0.18
389_F	426_R	0.641	0.17
365_Y	469_R	0.641	0.17
235_E	404_K	0.639	0.17
59_L	486_G	0.636	0.17
201_R	205_S	0.635	0.17
76_V	303_G	0.635	0.17
245_L	384_R	0.634	0.17
216_S	400_I	0.634	0.17
259_R	307_A	0.632	0.17
119_N	201_R	0.632	0.17
385_Q	418_E	0.632	0.17
15_G	348_T	0.630	0.17
101_Y	312_Y	0.630	0.17
67_T	116_R	0.630	0.17
94_R	164_D	0.628	0.17
190_V	214_A	0.626	0.17
89_L	377_L	0.626	0.17
263_Q	307_A	0.625	0.17
250_M	403_I	0.624	0.17
406_D	473_K	0.622	0.17
258_L	456_G	0.621	0.17
114_G	467_N	0.620	0.17
184_I	199_A	0.618	0.17
253_K	338_E	0.618	0.17
309_I	475_T	0.617	0.17
39_E	113_N	0.617	0.17
405_V	411_F	0.617	0.17
7_F	467_N	0.616	0.17
131_E	164_D	0.616	0.17
344_A	407_V	0.616	0.17
240_E	256_H	0.616	0.17
415_I	457_I	0.616	0.17
293_E	340_M	0.615	0.17
110_E	149_V	0.615	0.17
206_E	335_H	0.614	0.17
442_S	448_S	0.614	0.17
88_G	459_A	0.611	0.17
160_I	394_K	0.611	0.17
415_I	420_Q	0.610	0.17
84_H	213_L	0.610	0.17
109_Y	456_G	0.609	0.17
41_V	385_Q	0.609	0.17
129_F	456_G	0.609	0.17
375_M	421_S	0.609	0.17
411_F	443_D	0.608	0.16
63_A	216_S	0.607	0.16
167_E	417_T	0.607	0.16
463_L	476_L	0.607	0.16
290_E	307_A	0.606	0.16
375_M	455_E	0.606	0.16
104_P	323_K	0.606	0.16
58_E	69_M	0.606	0.16
209_D	276_L	0.605	0.16
48_N	117_M	0.604	0.16
417_T	424_L	0.603	0.16
4_V	224_D	0.603	0.16
428_L	465_P	0.602	0.16
102_T	164_D	0.602	0.16
35_K	435_D	0.601	0.16
375_M	428_L	0.601	0.16
28_T	117_M	0.601	0.16
224_D	405_V	0.601	0.16
420_Q	427_Y	0.600	0.16
203_D	241_V	0.600	0.16
68_I	153_T	0.599	0.16
126_P	262_Y	0.598	0.16
414_I	456_G	0.598	0.16
83_V	91_V	0.598	0.16
111_D	409_S	0.598	0.16
141_I	176_L	0.598	0.16
383_I	449_L	0.597	0.16
14_T	398_P	0.597	0.16
7_F	411_F	0.597	0.16
43_L	90_D	0.597	0.16
49_E	216_S	0.597	0.16
66_K	406_D	0.596	0.16
85_V	215_M	0.595	0.16
166_I	206_E	0.595	0.16
90_D	359_M	0.595	0.16
166_I	479_I	0.595	0.16
435_D	455_E	0.594	0.16
476_L	488_I	0.594	0.16
185_M	204_L	0.593	0.16
219_S	474_E	0.593	0.16
117_M	276_L	0.592	0.16
392_R	405_V	0.592	0.16
406_D	477_E	0.591	0.16
127_I	131_E	0.590	0.16
428_L	482_E	0.590	0.16
177_K	197_T	0.589	0.16
342_D	347_K	0.589	0.16
212_V	424_L	0.589	0.16
125_E	145_S	0.589	0.16
107_K	368_A	0.588	0.16
375_M	450_S	0.588	0.16
36_K	403_I	0.585	0.16
427_Y	447_R	0.585	0.16
95_L	239_L	0.584	0.16
326_V	344_A	0.584	0.16
35_K	43_L	0.584	0.16
375_M	393_L	0.583	0.16
184_I	277_R	0.583	0.16
42_V	54_R	0.582	0.16
242_N	266_V	0.582	0.16
222_E	394_K	0.581	0.16
84_H	174_E	0.581	0.16
365_Y	401_H	0.581	0.16
410_E	486_G	0.581	0.16
408_E	492_L	0.580	0.16
278_D	431_D	0.580	0.16
350_Y	378_D	0.580	0.16
198_E	331_R	0.579	0.16
104_P	164_D	0.579	0.16
299_G	435_D	0.578	0.16
147_I	176_L	0.577	0.16
172_V	429_M	0.576	0.16
20_L	40_L	0.576	0.16
115_P	484_S	0.576	0.16
330_I	336_L	0.575	0.16
79_Q	368_A	0.573	0.15
109_Y	311_L	0.573	0.15
191_R	247_S	0.572	0.15
51_D	180_G	0.571	0.15
268_E	294_S	0.571	0.15
238_V	327_G	0.570	0.15
7_F	478_R	0.569	0.15
259_R	263_Q	0.568	0.15
198_E	378_D	0.566	0.15
78_N	469_R	0.564	0.15
199_A	203_D	0.563	0.15
279_V	307_A	0.563	0.15
197_T	214_A	0.562	0.15
93_I	369_A	0.561	0.15
117_M	395_A	0.561	0.15
185_M	314_P	0.559	0.15
300_I	464_M	0.559	0.15
175_E	393_L	0.559	0.15
185_M	322_L	0.559	0.15
68_I	360_V	0.559	0.15
199_A	255_N	0.558	0.15
468_A	488_I	0.557	0.15
409_S	477_E	0.557	0.15
419_K	442_S	0.556	0.15
116_R	415_I	0.556	0.15
267_K	374_D	0.555	0.15
253_K	292_I	0.554	0.15
88_G	402_M	0.553	0.15
449_L	492_L	0.553	0.15
159_D	415_I	0.553	0.15
72_E	405_V	0.553	0.15
105_G	110_E	0.552	0.15
193_Y	219_S	0.551	0.15
183_F	210_I	0.549	0.15
293_E	314_P	0.548	0.15
429_M	461_L	0.548	0.15
379_E	486_G	0.548	0.15
319_D	405_V	0.548	0.15
295_A	383_I	0.547	0.15
258_L	320_Q	0.546	0.15
92_N	125_E	0.545	0.15
52_R	287_S	0.544	0.15
173_I	326_V	0.544	0.15
425_V	457_I	0.544	0.15
143_E	297_L	0.543	0.15
113_N	209_D	0.542	0.15
35_K	54_R	0.542	0.15
252_L	256_H	0.542	0.15
156_T	189_S	0.542	0.15
230_R	278_D	0.542	0.15
195_P	314_P	0.541	0.15
247_S	409_S	0.541	0.15
375_M	431_D	0.541	0.15
186_V	240_E	0.540	0.15
219_S	224_D	0.540	0.15
178_E	309_I	0.539	0.15
313_A	317_L	0.536	0.14
20_L	387_S	0.536	0.14
124_E	272_D	0.536	0.14
206_E	309_I	0.534	0.14
383_I	456_G	0.534	0.14
102_T	457_I	0.533	0.14
302_L	448_S	0.533	0.14
35_K	55_A	0.533	0.14
85_V	217_V	0.532	0.14
72_E	491_I	0.532	0.14
91_V	328_V	0.531	0.14
365_Y	409_S	0.530	0.14
241_V	313_A	0.530	0.14
393_L	455_E	0.529	0.14
450_S	468_A	0.529	0.14
6_I	50_A	0.529	0.14
7_F	102_T	0.529	0.14
156_T	294_S	0.529	0.14
101_Y	483_G	0.528	0.14
449_L	483_G	0.527	0.14
374_D	377_L	0.526	0.14
115_P	388_R	0.524	0.14
479_I	490_I	0.524	0.14
264_E	290_E	0.523	0.14
112_E	268_E	0.520	0.14
170_E	206_E	0.517	0.14
63_A	343_F	0.516	0.14
412_A	415_I	0.515	0.14
107_K	111_D	0.515	0.14
37_F	186_V	0.514	0.14
377_L	385_Q	0.514	0.14
421_S	465_P	0.514	0.14
66_K	367_I	0.513	0.14
48_N	63_A	0.513	0.14
156_T	200_M	0.512	0.14
450_S	478_R	0.511	0.14
353_V	436_P	0.511	0.14
23_V	181_K	0.510	0.14
249_V	266_V	0.510	0.14
40_L	225_V	0.510	0.14
76_V	190_V	0.510	0.14
76_V	292_I	0.509	0.14
194_H	203_D	0.509	0.14
84_H	241_V	0.509	0.14
214_A	281_R	0.509	0.14
357_L	476_L	0.508	0.14
49_E	125_E	0.508	0.14
47_S	408_E	0.507	0.14
477_E	491_I	0.507	0.14
332_G	484_S	0.506	0.14
102_T	126_P	0.506	0.14
198_E	422_E	0.506	0.14
204_L	211_P	0.505	0.14
112_E	323_K	0.505	0.14
157_I	351_D	0.505	0.14
255_N	329_E	0.504	0.14
323_K	449_L	0.504	0.14
204_L	241_V	0.504	0.14
111_D	232_A	0.503	0.14
172_V	175_E	0.502	0.14
185_M	193_Y	0.501	0.14
92_N	207_K	0.501	0.14
56_Q	76_V	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3qq5A	3	0.6077	99.6	0.93	Contact Map
2akaB	1	0.5122	99.1	0.947	Contact Map
1wf3A	1	0.5671	99.1	0.949	Contact Map
3t34A	2	0.5854	99	0.95	Contact Map
1egaA	2	0.5589	98.9	0.952	Contact Map
1jwyB	1	0.4675	98.7	0.954	Contact Map
2e87A	1	0.4126	98.7	0.954	Contact Map
2erxA	1	0.3333	98.7	0.955	Contact Map
3ibyA	1	0.4614	98.7	0.955	Contact Map
3ievA	1	0.5711	98.7	0.955	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0128 seconds.