HUTU - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

HUTU - Urocanate hydratase

UniProt:	P25503	Sequences: MTDVKKSIRANRGTELECLGWEQEAVLRMLRNNLDPEVAEKPEDLIVYGGIGKAARDWDAFHAIEHSLKTLKNDETLLVQSGKPVGMFRTHPQAPRVLLANSVLVPKWADWEHFHELEKKGLMMYGQMTAGSWIYIGSQGILQGTYETFAELARQHFGGSLKGTLTLTAGLGGMGGAQPLSVTMNEGVVIAVEVDEKRIDKRIETKYCDRKTASIEEALAWAEEAKLAGKPLSIALLGNAAEVHHTLLNRGVKIDIVTDQTSAHDPLIGYVPEGYSLDEADRLRQDTPELYVRLAKQSMKKHVEAMLAFQQKGSIVFDYGNNIRQVAKDEGLENAFDFPGFVPAYIRPLFCEGKGPFRWAALSGDPADIYRTDALLKELFPTNKALHRWIDMAQEKVTFQGLPSRICWLGYGERKKMGLAINELVRTGELKAPVVIGRDHLDCGSVASPNRETEAMKDGSDAVGDWAVLNALVNTAAGASWVSFHHGGGVGMGYSLHAGMVAVADGSELADERLARVLTSDPGMGIIRHADAGYERAVEVAKEQDIIVPMQK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	552 (541)
Sequences:	1186 (336)
Seq/√Len:	14.4

BACSU - HUTU
HALSA - HUTU

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
20_G	23_Q	4.977	1.00
41_K	44_D	4.798	1.00
208_C	235_A	3.981	1.00
182_V	187_G	3.881	1.00
200_D	204_E	3.809	1.00
426_R	511_D	3.747	1.00
371_R	429_E	3.722	0.99
210_R	221_W	3.579	0.99
371_R	424_L	3.470	0.99
468_V	484_F	3.461	0.99
152_L	256_I	3.435	0.99
123_M	463_V	3.211	0.98
290_L	294_L	3.196	0.98
142_L	397_V	3.165	0.98
430_L	434_V	3.160	0.98
67_S	87_M	3.155	0.98
57_D	60_A	3.094	0.98
282_R	286_D	3.081	0.98
206_K	398_T	3.041	0.98
113_H	116_E	2.891	0.97
216_E	250_R	2.850	0.97
242_E	273_E	2.833	0.97
19_L	72_K	2.825	0.96
167_L	244_H	2.821	0.96
225_A	232_L	2.780	0.96
162_K	229_G	2.725	0.96
196_E	200_D	2.718	0.96
86_G	527_I	2.650	0.95
308_A	312_K	2.649	0.95
27_L	65_E	2.626	0.95
246_T	250_R	2.595	0.94
190_I	222_A	2.552	0.94
246_T	249_N	2.546	0.94
100_A	103_V	2.544	0.94
31_R	65_E	2.536	0.93
477_A	520_S	2.520	0.93
464_G	496_L	2.444	0.92
167_L	309_F	2.423	0.92
290_L	293_R	2.423	0.92
245_H	301_K	2.394	0.91
22_E	480_S	2.394	0.91
217_E	221_W	2.381	0.91
424_L	430_L	2.352	0.91
200_D	211_K	2.333	0.90
12_R	37_E	2.320	0.90
375_L	420_A	2.311	0.90
212_T	221_W	2.308	0.90
426_R	508_E	2.290	0.89
323_I	338_F	2.256	0.89
224_E	228_A	2.248	0.88
70_T	547_I	2.232	0.88
138_S	142_L	2.192	0.87
116_E	120_K	2.175	0.87
165_L	252_V	2.166	0.86
169_A	240_A	2.158	0.86
58_W	61_F	2.139	0.86
383_N	413_E	2.136	0.86
182_V	189_V	2.107	0.85
443_C	526_I	2.078	0.84
196_E	211_K	2.072	0.84
188_V	234_I	2.051	0.83
334_N	337_D	2.050	0.83
165_L	222_A	2.035	0.83
63_A	66_H	2.031	0.83
93_Q	512_E	2.026	0.82
23_Q	26_V	2.024	0.82
300_K	332_L	2.016	0.82
156_H	315_I	2.009	0.82
8_I	61_F	2.002	0.82
9_R	12_R	1.997	0.81
365_D	431_K	1.969	0.80
287_T	290_L	1.964	0.80
30_L	65_E	1.960	0.80
271_V	280_A	1.958	0.80
153_A	187_G	1.945	0.80
257_V	316_V	1.942	0.80
370_Y	394_Q	1.937	0.79
417_M	421_I	1.914	0.78
211_K	237_L	1.910	0.78
113_H	463_V	1.881	0.77
504_A	514_L	1.880	0.77
509_L	513_R	1.878	0.77
151_E	154_R	1.860	0.76
138_S	397_V	1.855	0.76
304_E	308_A	1.825	0.75
88_F	523_G	1.811	0.74
222_A	234_I	1.800	0.74
424_L	429_E	1.785	0.73
20_G	26_V	1.784	0.73
27_L	31_R	1.763	0.72
367_A	370_Y	1.760	0.72
502_A	514_L	1.757	0.72
151_E	155_Q	1.757	0.72
275_Y	294_L	1.744	0.72
423_E	427_T	1.742	0.71
306_M	316_V	1.739	0.71
296_K	326_V	1.739	0.71
199_I	237_L	1.721	0.70
484_F	496_L	1.717	0.70
308_A	311_Q	1.712	0.70
311_Q	334_N	1.706	0.70
248_L	308_A	1.705	0.70
192_V	244_H	1.699	0.69
245_H	249_N	1.695	0.69
88_F	473_V	1.694	0.69
236_L	243_V	1.692	0.69
165_L	190_I	1.681	0.69
73_N	92_P	1.677	0.68
79_V	133_W	1.666	0.68
471_A	484_F	1.647	0.67
188_V	222_A	1.644	0.67
294_L	297_Q	1.637	0.66
17_E	69_K	1.633	0.66
192_V	238_G	1.632	0.66
377_K	391_D	1.628	0.66
193_E	237_L	1.624	0.66
51_I	492_M	1.592	0.64
248_L	312_K	1.587	0.64
371_R	427_T	1.578	0.64
366_P	403_P	1.571	0.63
113_H	123_M	1.570	0.63
375_L	424_L	1.570	0.63
309_F	316_V	1.558	0.62
377_K	390_I	1.545	0.62
536_R	539_E	1.541	0.62
341_F	441_L	1.536	0.61
244_H	302_H	1.529	0.61
194_V	271_V	1.520	0.61
91_H	94_A	1.520	0.61
103_V	468_V	1.519	0.60
419_L	511_D	1.515	0.60
210_R	217_E	1.514	0.60
214_S	217_E	1.511	0.60
20_G	73_N	1.510	0.60
473_V	524_M	1.509	0.60
374_A	394_Q	1.506	0.60
171_L	208_C	1.501	0.60
171_L	193_E	1.500	0.59
196_E	213_A	1.498	0.59
500_M	514_L	1.483	0.59
212_T	218_A	1.470	0.58
192_V	243_V	1.462	0.57
110_D	113_H	1.458	0.57
153_A	161_L	1.453	0.57
67_S	77_L	1.453	0.57
40_E	173_G	1.452	0.57
166_T	256_I	1.439	0.56
490_V	495_S	1.434	0.56
165_L	226_K	1.433	0.56
273_E	301_K	1.431	0.56
103_V	496_L	1.423	0.55
183_T	209_D	1.382	0.53
415_K	519_T	1.379	0.53
25_A	503_V	1.378	0.53
376_L	417_M	1.378	0.53
266_P	299_M	1.370	0.52
307_L	332_L	1.357	0.52
104_L	117_L	1.356	0.52
221_W	232_L	1.355	0.52
223_E	226_K	1.349	0.51
199_I	211_K	1.347	0.51
325_Q	329_D	1.344	0.51
232_L	276_S	1.341	0.51
116_E	119_K	1.341	0.51
222_A	243_V	1.333	0.50
162_K	186_E	1.311	0.49
512_E	515_A	1.293	0.48
411_Y	523_G	1.292	0.48
219_L	243_V	1.281	0.48
171_L	237_L	1.280	0.47
248_L	309_F	1.278	0.47
92_P	509_L	1.277	0.47
524_M	527_I	1.274	0.47
134_I	437_G	1.272	0.47
477_A	502_A	1.265	0.47
380_F	409_L	1.265	0.47
190_I	247_L	1.264	0.47
103_V	484_F	1.262	0.46
179_P	191_A	1.256	0.46
374_A	378_E	1.251	0.46
266_P	326_V	1.243	0.45
26_V	480_S	1.240	0.45
257_V	309_F	1.230	0.45
10_A	402_L	1.229	0.45
161_L	187_G	1.227	0.45
328_K	333_E	1.226	0.44
107_K	494_Y	1.226	0.44
221_W	230_K	1.225	0.44
537_A	541_A	1.224	0.44
472_L	475_T	1.217	0.44
326_V	329_D	1.210	0.44
195_D	198_R	1.210	0.44
93_Q	509_L	1.210	0.44
479_A	482_V	1.200	0.43
179_P	233_S	1.198	0.43
153_A	160_S	1.195	0.43
509_L	512_E	1.188	0.42
53_K	118_E	1.185	0.42
219_L	247_L	1.175	0.42
109_A	486_H	1.169	0.41
72_K	87_M	1.169	0.41
150_A	185_N	1.166	0.41
380_F	417_M	1.165	0.41
88_F	527_I	1.156	0.41
443_C	524_M	1.152	0.41
371_R	430_L	1.152	0.41
192_V	245_H	1.151	0.40
508_E	512_E	1.149	0.40
28_R	402_L	1.147	0.40
66_H	70_T	1.146	0.40
160_S	186_E	1.143	0.40
51_I	118_E	1.129	0.39
118_E	492_M	1.126	0.39
338_F	344_A	1.126	0.39
61_F	434_V	1.118	0.39
8_I	31_R	1.117	0.39
425_V	430_L	1.113	0.38
71_L	87_M	1.094	0.37
115_H	118_E	1.077	0.37
55_A	64_I	1.075	0.36
511_D	515_A	1.070	0.36
11_N	31_R	1.065	0.36
213_A	217_E	1.062	0.36
60_A	83_K	1.061	0.36
276_S	279_E	1.055	0.35
168_T	191_A	1.054	0.35
166_T	182_V	1.049	0.35
348_P	351_C	1.046	0.35
360_A	404_S	1.044	0.35
390_I	421_I	1.040	0.35
166_T	187_G	1.040	0.35
381_P	387_H	1.031	0.34
201_K	204_E	1.030	0.34
540_V	544_Q	1.024	0.34
58_W	65_E	1.015	0.33
421_I	436_I	1.012	0.33
379_L	420_A	1.012	0.33
248_L	253_K	1.010	0.33
244_H	257_V	1.009	0.33
232_L	396_K	1.007	0.33
183_T	189_V	1.007	0.33
74_D	92_P	1.004	0.33
190_I	214_S	1.004	0.33
61_F	65_E	1.001	0.33
104_L	110_D	0.998	0.33
199_I	235_A	0.994	0.32
508_E	511_D	0.993	0.32
192_V	257_V	0.989	0.32
182_V	188_V	0.988	0.32
306_M	338_F	0.985	0.32
21_W	24_E	0.982	0.32
31_R	61_F	0.979	0.32
329_D	494_Y	0.978	0.32
392_M	395_E	0.975	0.32
18_C	24_E	0.973	0.31
23_Q	73_N	0.971	0.31
375_L	421_I	0.968	0.31
367_A	431_K	0.965	0.31
125_Y	495_S	0.960	0.31
72_K	75_E	0.956	0.31
280_A	291_Y	0.956	0.31
153_A	185_N	0.951	0.30
18_C	69_K	0.950	0.30
192_V	241_A	0.949	0.30
107_K	110_D	0.946	0.30
325_Q	494_Y	0.945	0.30
253_K	309_F	0.943	0.30
210_R	232_L	0.940	0.30
41_K	46_I	0.939	0.30
223_E	227_L	0.939	0.30
527_I	546_I	0.938	0.30
293_R	297_Q	0.937	0.30
216_E	246_T	0.936	0.30
473_V	527_I	0.935	0.30
242_E	274_G	0.933	0.30
424_L	427_T	0.933	0.30
243_V	246_T	0.932	0.30
167_L	257_V	0.931	0.29
51_I	115_H	0.930	0.29
167_L	247_L	0.928	0.29
182_V	186_E	0.925	0.29
242_E	245_H	0.924	0.29
131_G	318_D	0.923	0.29
183_T	396_K	0.923	0.29
206_K	395_E	0.921	0.29
216_E	503_V	0.921	0.29
80_Q	469_L	0.920	0.29
113_H	120_K	0.920	0.29
165_L	188_V	0.918	0.29
303_V	323_I	0.915	0.29
371_R	431_K	0.914	0.29
362_L	435_V	0.913	0.29
203_I	211_K	0.908	0.28
423_E	429_E	0.906	0.28
103_V	464_G	0.906	0.28
443_C	540_V	0.904	0.28
325_Q	450_N	0.903	0.28
164_T	255_D	0.900	0.28
53_K	216_E	0.900	0.28
27_L	30_L	0.900	0.28
468_V	496_L	0.899	0.28
293_R	508_E	0.897	0.28
23_Q	480_S	0.897	0.28
328_K	334_N	0.893	0.28
64_I	77_L	0.887	0.28
123_M	492_M	0.886	0.27
234_I	381_P	0.885	0.27
83_K	531_D	0.883	0.27
262_S	269_G	0.879	0.27
457_K	535_E	0.877	0.27
167_L	240_A	0.877	0.27
190_I	234_I	0.875	0.27
91_H	513_R	0.875	0.27
371_R	375_L	0.868	0.27
214_S	221_W	0.866	0.27
240_A	323_I	0.865	0.27
419_L	426_R	0.864	0.27
67_S	547_I	0.863	0.26
271_V	281_D	0.863	0.26
168_T	189_V	0.862	0.26
67_S	70_T	0.862	0.26
50_G	96_R	0.860	0.26
186_E	231_P	0.858	0.26
448_S	490_V	0.851	0.26
142_L	201_K	0.850	0.26
219_L	246_T	0.848	0.26
75_E	87_M	0.841	0.26
8_I	58_W	0.841	0.26
210_R	224_E	0.839	0.25
21_W	28_R	0.837	0.25
242_E	301_K	0.836	0.25
152_L	157_F	0.835	0.25
153_A	164_T	0.831	0.25
102_S	123_M	0.830	0.25
196_E	237_L	0.830	0.25
295_A	300_K	0.824	0.25
390_I	496_L	0.824	0.25
27_L	69_K	0.823	0.25
339_P	344_A	0.822	0.25
530_A	538_V	0.820	0.25
468_V	471_A	0.818	0.25
369_I	399_F	0.817	0.25
118_E	463_V	0.816	0.25
304_E	332_L	0.815	0.24
179_P	208_C	0.814	0.24
93_Q	513_R	0.813	0.24
179_P	425_V	0.813	0.24
212_T	217_E	0.812	0.24
242_E	247_L	0.811	0.24
182_V	185_N	0.809	0.24
206_K	396_K	0.808	0.24
126_G	489_G	0.808	0.24
215_I	236_L	0.807	0.24
411_Y	519_T	0.806	0.24
375_L	379_L	0.805	0.24
153_A	484_F	0.804	0.24
29_M	435_V	0.802	0.24
198_R	262_S	0.801	0.24
253_K	314_S	0.798	0.24
74_D	89_R	0.795	0.24
13_G	21_W	0.795	0.24
248_L	305_A	0.794	0.24
142_L	323_I	0.794	0.24
101_N	131_G	0.794	0.24
128_M	448_S	0.794	0.24
297_Q	539_E	0.785	0.23
371_R	374_A	0.785	0.23
90_T	473_V	0.783	0.23
20_G	480_S	0.781	0.23
26_V	481_W	0.778	0.23
160_S	185_N	0.778	0.23
451_R	491_G	0.776	0.23
351_C	437_G	0.775	0.23
375_L	417_M	0.775	0.23
156_H	317_F	0.775	0.23
11_N	17_E	0.774	0.23
423_E	511_D	0.773	0.23
244_H	316_V	0.771	0.23
262_S	338_F	0.769	0.23
241_A	245_H	0.768	0.23
39_A	49_G	0.768	0.23
280_A	284_R	0.768	0.23
138_S	323_I	0.767	0.23
283_L	434_V	0.767	0.23
472_L	484_F	0.766	0.23
215_I	219_L	0.763	0.22
372_T	421_I	0.763	0.22
411_Y	520_S	0.760	0.22
292_V	296_K	0.759	0.22
18_C	193_E	0.756	0.22
409_L	417_M	0.755	0.22
427_T	430_L	0.755	0.22
360_A	535_E	0.755	0.22
192_V	236_L	0.751	0.22
341_F	408_W	0.751	0.22
304_E	333_E	0.750	0.22
418_G	518_L	0.750	0.22
87_M	339_P	0.748	0.22
167_L	346_I	0.747	0.22
65_E	69_K	0.745	0.22
18_C	23_Q	0.744	0.22
271_V	291_Y	0.742	0.22
18_C	27_L	0.742	0.22
282_R	287_T	0.741	0.22
464_G	492_M	0.738	0.21
169_A	189_V	0.738	0.21
474_N	517_V	0.738	0.21
152_L	248_L	0.737	0.21
322_N	494_Y	0.733	0.21
377_K	387_H	0.731	0.21
544_Q	547_I	0.729	0.21
387_H	391_D	0.728	0.21
279_E	282_R	0.726	0.21
164_T	182_V	0.726	0.21
457_K	538_V	0.725	0.21
196_E	277_L	0.723	0.21
24_E	28_R	0.721	0.21
502_A	507_S	0.721	0.21
376_L	383_N	0.720	0.21
319_Y	451_R	0.720	0.21
448_S	451_R	0.713	0.21
540_V	543_E	0.712	0.21
125_Y	468_V	0.712	0.21
367_A	371_R	0.708	0.20
431_K	434_V	0.708	0.20
420_A	423_E	0.708	0.20
507_S	511_D	0.707	0.20
100_A	496_L	0.707	0.20
415_K	419_L	0.707	0.20
98_L	471_A	0.707	0.20
221_W	234_I	0.707	0.20
341_F	351_C	0.705	0.20
274_G	297_Q	0.702	0.20
247_L	254_I	0.700	0.20
348_P	352_E	0.700	0.20
162_K	227_L	0.699	0.20
378_E	508_E	0.699	0.20
193_E	502_A	0.698	0.20
390_I	523_G	0.697	0.20
275_Y	283_L	0.695	0.20
149_F	475_T	0.695	0.20
15_E	168_T	0.692	0.20
390_I	417_M	0.692	0.20
92_P	475_T	0.689	0.20
241_A	257_V	0.688	0.20
156_H	513_R	0.687	0.20
283_L	290_L	0.686	0.20
421_I	480_S	0.686	0.20
132_S	481_W	0.686	0.20
132_S	483_S	0.684	0.20
208_C	421_I	0.684	0.20
17_E	27_L	0.682	0.19
44_D	173_G	0.681	0.19
204_E	374_A	0.681	0.19
480_S	496_L	0.680	0.19
210_R	214_S	0.680	0.19
231_P	396_K	0.678	0.19
152_L	345_Y	0.678	0.19
37_E	204_E	0.678	0.19
319_Y	452_E	0.677	0.19
443_C	473_V	0.676	0.19
57_D	83_K	0.676	0.19
89_R	515_A	0.676	0.19
160_S	164_T	0.676	0.19
303_V	327_A	0.676	0.19
106_P	464_G	0.675	0.19
204_E	211_K	0.675	0.19
257_V	305_A	0.671	0.19
187_G	222_A	0.671	0.19
317_F	484_F	0.670	0.19
49_G	52_G	0.670	0.19
284_R	291_Y	0.669	0.19
354_K	443_C	0.669	0.19
192_V	360_A	0.669	0.19
53_K	62_H	0.669	0.19
86_G	524_M	0.668	0.19
46_I	483_S	0.666	0.19
205_T	398_T	0.664	0.19
245_H	298_S	0.664	0.19
371_R	420_A	0.663	0.19
115_H	119_K	0.663	0.19
106_P	171_L	0.663	0.19
298_S	383_N	0.662	0.19
31_R	348_P	0.662	0.19
228_A	434_V	0.661	0.19
273_E	298_S	0.660	0.19
222_A	226_K	0.660	0.19
49_G	127_Q	0.660	0.19
536_R	540_V	0.660	0.19
504_A	511_D	0.659	0.19
9_R	162_K	0.657	0.19
287_T	293_R	0.657	0.19
235_A	533_G	0.656	0.19
473_V	520_S	0.656	0.19
192_V	305_A	0.656	0.19
253_K	312_K	0.655	0.19
106_P	486_H	0.654	0.19
53_K	115_H	0.653	0.18
79_V	287_T	0.652	0.18
295_A	299_M	0.651	0.18
208_C	237_L	0.650	0.18
380_F	413_E	0.650	0.18
213_A	221_W	0.648	0.18
262_S	318_D	0.648	0.18
166_T	258_T	0.648	0.18
93_Q	502_A	0.647	0.18
162_K	228_A	0.645	0.18
267_L	292_V	0.645	0.18
188_V	232_L	0.645	0.18
416_K	424_L	0.644	0.18
379_L	417_M	0.644	0.18
275_Y	282_R	0.644	0.18
100_A	241_A	0.643	0.18
454_E	469_L	0.643	0.18
310_Q	314_S	0.642	0.18
148_T	319_Y	0.641	0.18
419_L	423_E	0.641	0.18
72_K	193_E	0.641	0.18
51_I	123_M	0.640	0.18
153_A	182_V	0.639	0.18
451_R	478_G	0.638	0.18
325_Q	328_K	0.638	0.18
169_A	192_V	0.638	0.18
445_S	529_H	0.637	0.18
193_E	328_K	0.636	0.18
215_I	503_V	0.636	0.18
47_V	54_A	0.635	0.18
376_L	420_A	0.634	0.18
22_E	503_V	0.634	0.18
262_S	372_T	0.633	0.18
273_E	305_A	0.633	0.18
325_Q	330_E	0.632	0.18
162_K	230_K	0.632	0.18
202_R	406_I	0.631	0.18
60_A	193_E	0.631	0.18
191_A	199_I	0.631	0.18
480_S	503_V	0.629	0.18
182_V	191_A	0.628	0.18
219_L	226_K	0.627	0.18
156_H	345_Y	0.626	0.18
131_G	485_H	0.626	0.18
16_L	27_L	0.625	0.18
220_A	294_L	0.625	0.18
319_Y	491_G	0.624	0.18
194_V	243_V	0.624	0.18
46_I	252_V	0.623	0.18
43_E	242_E	0.623	0.18
435_V	481_W	0.621	0.17
159_G	289_E	0.621	0.17
173_G	262_S	0.620	0.17
111_W	469_L	0.620	0.17
134_I	348_P	0.619	0.17
300_K	304_E	0.617	0.17
167_L	219_L	0.617	0.17
240_A	244_H	0.616	0.17
481_W	501_V	0.616	0.17
271_V	284_R	0.615	0.17
302_H	306_M	0.615	0.17
221_W	224_E	0.614	0.17
157_F	314_S	0.614	0.17
283_L	291_Y	0.613	0.17
160_S	182_V	0.612	0.17
403_P	454_E	0.611	0.17
217_E	234_I	0.611	0.17
157_F	315_I	0.610	0.17
31_R	58_W	0.610	0.17
192_V	229_G	0.608	0.17
74_D	535_E	0.608	0.17
291_Y	322_N	0.608	0.17
199_I	203_I	0.607	0.17
23_Q	27_L	0.606	0.17
100_A	468_V	0.606	0.17
86_G	262_S	0.606	0.17
282_R	293_R	0.606	0.17
411_Y	540_V	0.605	0.17
148_T	452_E	0.605	0.17
244_H	309_F	0.605	0.17
25_A	215_I	0.605	0.17
241_A	305_A	0.604	0.17
289_E	297_Q	0.603	0.17
171_L	199_I	0.603	0.17
361_A	369_I	0.603	0.17
171_L	269_G	0.603	0.17
118_E	123_M	0.603	0.17
219_L	305_A	0.599	0.17
156_H	322_N	0.598	0.17
194_V	280_A	0.597	0.17
437_G	501_V	0.597	0.17
348_P	532_A	0.597	0.17
354_K	477_A	0.597	0.17
155_Q	344_A	0.596	0.17
300_K	430_L	0.593	0.17
535_E	539_E	0.592	0.17
85_V	454_E	0.592	0.17
245_H	248_L	0.591	0.17
90_T	477_A	0.590	0.16
390_I	464_G	0.589	0.16
354_K	417_M	0.588	0.16
316_V	338_F	0.585	0.16
165_L	189_V	0.585	0.16
86_G	417_M	0.584	0.16
379_L	421_I	0.584	0.16
215_I	247_L	0.583	0.16
452_E	491_G	0.583	0.16
219_L	248_L	0.582	0.16
182_V	222_A	0.582	0.16
360_A	437_G	0.581	0.16
440_H	451_R	0.581	0.16
96_R	127_Q	0.581	0.16
167_L	316_V	0.581	0.16
128_M	141_I	0.580	0.16
468_V	472_L	0.580	0.16
464_G	484_F	0.580	0.16
157_F	256_I	0.579	0.16
419_L	515_A	0.579	0.16
416_K	430_L	0.579	0.16
230_K	395_E	0.578	0.16
46_I	103_V	0.578	0.16
78_L	483_S	0.577	0.16
301_K	304_E	0.576	0.16
50_G	132_S	0.576	0.16
56_R	61_F	0.574	0.16
217_E	378_E	0.573	0.16
290_L	416_K	0.573	0.16
378_E	543_E	0.573	0.16
168_T	193_E	0.573	0.16
85_V	484_F	0.573	0.16
10_A	28_R	0.572	0.16
79_V	94_A	0.572	0.16
397_V	413_E	0.572	0.16
522_P	529_H	0.571	0.16
114_F	317_F	0.571	0.16
210_R	293_R	0.571	0.16
182_V	421_I	0.571	0.16
46_I	387_H	0.570	0.16
379_L	416_K	0.570	0.16
12_R	364_G	0.570	0.16
164_T	187_G	0.569	0.16
134_I	501_V	0.569	0.16
227_L	297_Q	0.569	0.16
317_F	425_V	0.569	0.16
450_N	494_Y	0.568	0.16
450_N	463_V	0.567	0.16
376_L	390_I	0.566	0.16
94_A	490_V	0.565	0.16
15_E	92_P	0.565	0.16
88_F	430_L	0.565	0.16
46_I	281_D	0.564	0.16
213_A	237_L	0.564	0.16
222_A	417_M	0.563	0.16
408_W	441_L	0.563	0.16
152_L	434_V	0.561	0.16
290_L	304_E	0.561	0.16
384_K	391_D	0.561	0.16
418_G	500_M	0.561	0.16
51_I	268_I	0.560	0.16
41_K	173_G	0.560	0.16
76_T	239_N	0.560	0.16
208_C	211_K	0.559	0.16
262_S	406_I	0.559	0.16
142_L	398_T	0.559	0.16
141_I	451_R	0.558	0.16
153_A	243_V	0.558	0.16
210_R	230_K	0.557	0.16
46_I	51_I	0.557	0.16
293_R	304_E	0.557	0.16
192_V	302_H	0.557	0.16
312_K	374_A	0.557	0.16
217_E	230_K	0.556	0.15
92_P	513_R	0.555	0.15
53_K	57_D	0.554	0.15
245_H	305_A	0.554	0.15
161_L	188_V	0.554	0.15
51_I	326_V	0.553	0.15
218_A	236_L	0.553	0.15
473_V	547_I	0.553	0.15
128_M	451_R	0.553	0.15
141_I	372_T	0.552	0.15
128_M	319_Y	0.552	0.15
215_I	250_R	0.552	0.15
282_R	427_T	0.551	0.15
372_T	379_L	0.551	0.15
124_M	132_S	0.551	0.15
134_I	351_C	0.551	0.15
196_E	214_S	0.551	0.15
192_V	316_V	0.550	0.15
237_L	298_S	0.550	0.15
221_W	228_A	0.550	0.15
169_A	244_H	0.550	0.15
167_L	222_A	0.550	0.15
160_S	287_T	0.549	0.15
299_M	323_I	0.548	0.15
127_Q	497_H	0.548	0.15
131_G	501_V	0.548	0.15
253_K	431_K	0.548	0.15
26_V	503_V	0.547	0.15
185_N	421_I	0.546	0.15
216_E	219_L	0.546	0.15
212_T	236_L	0.545	0.15
70_T	87_M	0.544	0.15
149_F	408_W	0.543	0.15
314_S	377_K	0.543	0.15
46_I	173_G	0.543	0.15
293_R	535_E	0.543	0.15
380_F	426_R	0.542	0.15
448_S	491_G	0.542	0.15
448_S	452_E	0.541	0.15
25_A	432_A	0.539	0.15
123_M	532_A	0.539	0.15
85_V	468_V	0.538	0.15
154_R	158_G	0.538	0.15
26_V	99_L	0.538	0.15
57_D	214_S	0.538	0.15
241_A	246_T	0.537	0.15
193_E	211_K	0.537	0.15
210_R	228_A	0.536	0.15
99_L	124_M	0.536	0.15
238_G	305_A	0.536	0.15
73_N	155_Q	0.536	0.15
248_L	297_Q	0.535	0.15
20_G	28_R	0.534	0.15
169_A	507_S	0.533	0.15
349_L	419_L	0.533	0.15
184_M	244_H	0.533	0.15
228_A	535_E	0.531	0.15
166_T	222_A	0.531	0.15
20_G	71_L	0.531	0.15
213_A	216_E	0.531	0.15
222_A	247_L	0.531	0.15
132_S	318_D	0.531	0.15
151_E	500_M	0.530	0.15
235_A	507_S	0.529	0.15
141_I	262_S	0.529	0.15
93_Q	430_L	0.529	0.15
33_N	128_M	0.529	0.15
375_L	381_P	0.528	0.15
442_D	525_G	0.528	0.15
254_I	284_R	0.528	0.15
464_G	523_G	0.528	0.15
22_E	73_N	0.527	0.15
115_H	463_V	0.527	0.15
228_A	395_E	0.526	0.15
244_H	247_L	0.525	0.15
200_D	282_R	0.525	0.15
74_D	457_K	0.525	0.15
22_E	509_L	0.523	0.15
426_R	507_S	0.523	0.15
275_Y	279_E	0.523	0.15
88_F	417_M	0.522	0.15
106_P	481_W	0.522	0.15
44_D	206_K	0.522	0.15
39_A	407_C	0.522	0.15
158_G	543_E	0.521	0.14
148_T	353_G	0.521	0.14
214_S	512_E	0.520	0.14
269_G	322_N	0.520	0.14
481_W	517_V	0.520	0.14
435_V	501_V	0.519	0.14
79_V	99_L	0.519	0.14
254_I	322_N	0.519	0.14
165_L	223_E	0.519	0.14
376_L	394_Q	0.518	0.14
86_G	546_I	0.518	0.14
76_T	471_A	0.518	0.14
88_F	376_L	0.517	0.14
195_D	281_D	0.517	0.14
215_I	305_A	0.516	0.14
18_C	222_A	0.516	0.14
340_G	529_H	0.516	0.14
319_Y	353_G	0.516	0.14
40_E	341_F	0.516	0.14
187_G	234_I	0.516	0.14
235_A	309_F	0.516	0.14
353_G	452_E	0.516	0.14
312_K	416_K	0.515	0.14
432_A	435_V	0.515	0.14
120_K	430_L	0.515	0.14
225_A	288_P	0.515	0.14
46_I	79_V	0.514	0.14
268_I	284_R	0.514	0.14
167_L	184_M	0.514	0.14
476_A	502_A	0.513	0.14
58_W	62_H	0.513	0.14
188_V	391_D	0.513	0.14
108_W	462_A	0.512	0.14
226_K	300_K	0.511	0.14
37_E	110_D	0.511	0.14
162_K	370_Y	0.511	0.14
413_E	417_M	0.511	0.14
303_V	338_F	0.511	0.14
351_C	441_L	0.511	0.14
431_K	547_I	0.510	0.14
452_E	478_G	0.510	0.14
190_I	231_P	0.509	0.14
152_L	314_S	0.509	0.14
101_N	128_M	0.509	0.14
219_L	236_L	0.509	0.14
226_K	252_V	0.506	0.14
116_E	123_M	0.506	0.14
437_G	481_W	0.505	0.14
343_P	501_V	0.505	0.14
437_G	483_S	0.505	0.14
210_R	216_E	0.504	0.14
138_S	299_M	0.503	0.14
197_K	507_S	0.502	0.14
171_L	211_K	0.502	0.14
240_A	430_L	0.502	0.14
230_K	249_N	0.501	0.14
127_Q	491_G	0.501	0.14
184_M	240_A	0.501	0.14
19_L	120_K	0.500	0.14
290_L	543_E	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2fknA	2	0.9891	100	0.014	Contact Map
1uwkA	2	0.9946	100	0.015	Contact Map
1x87A	2	0.9257	100	0.017	Contact Map
3p2yA	2	0.5362	65.3	0.986	Contact Map
1wmaA	1	0.3841	65.2	0.986	Contact Map
1x13A	2	0.5362	63.2	0.986	Contact Map
4r1nA	2	0.4275	60.5	0.986	Contact Map
2wzmA	1	0.462	55.1	0.987	Contact Map
3gdhA	1	0.3551	53.5	0.987	Contact Map
1wekA	5	0.3188	52.6	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.