PTG3C - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTG3C - PTS system glucose-specific EIICBA component

UniProt:	P20166	Sequences: MFKALFGVLQKIGRALMLPVAILPAAGILLAIGNAMQNKDMIQVLHFLSNDNVQLVAGVMESAGQIVFDNLPLLFAVGVAIGLANGDGVAGIAAIIGYLVMNVSMSAVLLANGTIPSDSVERAKFFTENHPAYVNMLGIPTLATGVFGGIIVGVLAALLFNRFYTIELPQYLGFFAGKRFVPIVTSISALILGLIMLVIWPPIQHGLNAFSTGLVEANPTLAAFIFGVIERSLIPFGLHHIFYSPFWYEFFSYKSAAGEIIRGDQRIFMAQIKDGVQLTAGTFMTGKYPFMMFGLPAAALAIYHEAKPQNKKLVAGIMGSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLFAIHCLFAGLSFMVMQLLNVKIGMTFSGGLIDYFLFGILPNRTAWWLVIPVGLGLAVIYYFGFRFAIRKFNLKTPGREDAAEETAAPGKTGEAGDLPYEILQAMGDQENIKHLDACITRLRVTVNDQKKVDKDRLKQLGASGVLEVGNNIQAIFGPRSDGLKTQMQDIIAGRKPRPEPKTSAQEEVGQQVEEVIAEPLQNEIGEEVFVSPITGEIHPITDVPDQVFSGKMMGDGFAILPSEGIVVSPVRGKILNVFPTKHAIGLQSDGGREILIHFGIDTVSLKGEGFTSFVSEGDRVEPGQKLLEVDLDAVKPNVPSLMTPIVFTNLAEGETVSIKASGSVNREQEDIVKIEK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	699 (661)
Sequences:	562 (348)
Seq/√Len:	13.5

ECOLI - PTW3C PTOCB
BACSU - PTG3C PTW3C PTOCB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
636_F	648_K	7.476	1.00
621_F	650_L	6.090	1.00
638_S	641_D	5.157	1.00
656_A	660_N	5.051	1.00
230_E	287_K	4.902	1.00
612_D	642_R	4.855	1.00
634_T	651_E	4.705	1.00
557_T	586_E	4.701	1.00
65_Q	69_D	4.648	1.00
302_I	318_M	4.530	1.00
596_K	642_R	4.479	1.00
574_K	578_D	4.374	1.00
304_H	409_R	4.241	1.00
652_V	657_V	4.052	1.00
597_I	609_L	4.030	1.00
297_A	401_A	3.997	1.00
598_L	610_Q	3.848	0.99
352_F	407_G	3.744	0.99
307_K	424_D	3.740	0.99
559_E	583_L	3.545	0.99
594_R	645_P	3.545	0.99
593_V	609_L	3.437	0.99
409_R	413_R	3.433	0.99
563_I	669_V	3.377	0.99
287_K	369_M	3.373	0.99
305_E	413_R	3.227	0.98
636_F	651_E	3.209	0.98
449_M	510_M	3.186	0.98
418_K	424_D	3.160	0.98
232_S	350_C	3.157	0.98
600_V	635_S	3.151	0.98
230_E	369_M	3.135	0.98
477_K	490_E	3.132	0.98
310_N	425_A	3.123	0.98
656_A	661_V	3.026	0.97
644_E	647_Q	2.982	0.97
456_K	470_N	2.918	0.96
635_S	650_L	2.773	0.95
315_A	319_G	2.718	0.95
616_E	672_N	2.693	0.94
398_L	402_V	2.689	0.94
305_E	409_R	2.679	0.94
670_F	673_L	2.664	0.94
648_K	651_E	2.661	0.94
566_V	581_A	2.633	0.94
194_L	198_V	2.610	0.93
597_I	600_V	2.554	0.93
569_Q	573_G	2.526	0.92
621_F	652_V	2.501	0.92
596_K	610_Q	2.478	0.91
292_M	326_F	2.455	0.91
580_F	670_F	2.444	0.91
226_F	346_F	2.361	0.89
347_A	351_L	2.349	0.89
192_L	196_M	2.337	0.89
657_V	664_L	2.330	0.89
155_L	192_L	2.327	0.88
232_S	290_F	2.310	0.88
588_I	648_K	2.304	0.88
588_I	651_E	2.241	0.86
594_R	644_E	2.213	0.86
556_I	589_V	2.208	0.86
562_P	565_D	2.201	0.85
34_N	61_E	2.188	0.85
77_V	95_I	2.138	0.84
243_Y	353_A	2.092	0.82
597_I	637_V	2.089	0.82
471_D	603_T	2.062	0.81
563_I	578_D	2.055	0.81
600_V	639_E	2.054	0.81
67_V	96_I	2.053	0.81
683_A	691_Q	2.049	0.81
563_I	574_K	2.049	0.81
550_E	613_G	2.048	0.81
304_H	405_Y	2.045	0.81
267_I	271_Q	2.036	0.80
392_L	395_P	2.033	0.80
446_L	514_I	2.014	0.80
300_L	304_H	1.962	0.78
303_Y	311_K	1.956	0.78
617_I	669_V	1.930	0.77
73_L	98_Y	1.917	0.76
163_F	334_L	1.883	0.75
228_V	350_C	1.860	0.74
559_E	686_S	1.852	0.74
257_A	274_D	1.842	0.73
348_I	411_A	1.836	0.73
81_I	154_V	1.825	0.72
673_L	676_G	1.824	0.72
567_P	665_M	1.815	0.72
394_I	398_L	1.809	0.72
243_Y	287_K	1.802	0.71
576_M	670_F	1.791	0.71
631_E	660_N	1.784	0.71
243_Y	369_M	1.782	0.71
379_F	383_I	1.773	0.70
460_A	503_S	1.749	0.69
219_P	222_A	1.748	0.69
471_D	474_K	1.742	0.69
591_S	609_L	1.721	0.68
97_G	185_T	1.711	0.67
608_G	671_T	1.692	0.66
10_Q	13_G	1.687	0.66
557_T	689_R	1.676	0.66
265_Q	268_F	1.674	0.66
557_T	688_N	1.672	0.65
446_L	458_L	1.667	0.65
441_L	502_R	1.667	0.65
600_V	637_V	1.661	0.65
643_V	657_V	1.661	0.65
449_M	497_A	1.654	0.65
261_I	270_A	1.647	0.64
557_T	585_S	1.616	0.63
304_H	413_R	1.614	0.63
74_L	369_M	1.610	0.62
191_I	195_I	1.606	0.62
641_D	647_Q	1.604	0.62
550_E	611_S	1.603	0.62
167_E	502_R	1.585	0.61
230_E	243_Y	1.579	0.61
567_P	663_S	1.574	0.61
17_M	240_H	1.572	0.60
655_D	658_K	1.570	0.60
154_V	158_L	1.569	0.60
631_E	656_A	1.569	0.60
290_F	353_A	1.551	0.59
358_M	369_M	1.537	0.59
255_S	259_E	1.509	0.57
460_A	483_L	1.503	0.57
230_E	353_A	1.497	0.57
230_E	360_M	1.493	0.56
203_I	694_I	1.491	0.56
68_F	330_I	1.490	0.56
572_S	694_I	1.488	0.56
561_H	583_L	1.485	0.56
383_I	390_W	1.471	0.55
576_M	671_T	1.457	0.54
159_L	188_S	1.453	0.54
403_I	407_G	1.445	0.54
228_V	232_S	1.444	0.54
621_F	635_S	1.433	0.53
69_D	334_L	1.416	0.52
28_I	32_I	1.410	0.52
187_I	191_I	1.408	0.52
310_N	313_L	1.407	0.52
682_K	696_K	1.405	0.52
575_M	608_G	1.403	0.52
223_A	361_Q	1.397	0.51
195_I	199_I	1.396	0.51
445_I	499_F	1.392	0.51
252_S	256_A	1.388	0.51
74_L	232_S	1.382	0.50
311_K	414_K	1.377	0.50
287_K	360_M	1.349	0.49
602_P	618_L	1.345	0.49
588_I	636_F	1.344	0.48
462_I	503_S	1.344	0.48
230_E	346_F	1.340	0.48
287_K	353_A	1.339	0.48
223_A	282_T	1.330	0.48
275_G	387_R	1.329	0.48
580_F	694_I	1.326	0.48
230_E	290_F	1.324	0.47
385_P	390_W	1.314	0.47
595_G	609_L	1.310	0.47
510_M	513_I	1.291	0.46
160_F	281_G	1.285	0.45
249_E	252_S	1.281	0.45
302_I	337_S	1.269	0.44
567_P	661_V	1.268	0.44
206_G	399_G	1.264	0.44
427_E	617_I	1.263	0.44
30_L	68_F	1.254	0.44
225_I	290_F	1.245	0.43
144_T	207_L	1.242	0.43
250_F	253_Y	1.241	0.43
293_F	397_G	1.240	0.43
269_M	288_Y	1.239	0.43
621_F	666_T	1.238	0.43
643_V	655_D	1.235	0.43
307_K	418_K	1.228	0.42
458_L	514_I	1.227	0.42
395_P	399_G	1.226	0.42
224_F	228_V	1.212	0.42
386_N	390_W	1.210	0.41
657_V	695_V	1.208	0.41
5_L	424_D	1.205	0.41
593_V	611_S	1.195	0.41
655_D	659_P	1.195	0.41
687_V	691_Q	1.191	0.40
27_G	68_F	1.191	0.40
159_L	184_V	1.190	0.40
554_S	687_V	1.188	0.40
363_L	396_V	1.183	0.40
297_A	398_L	1.182	0.40
102_N	141_T	1.178	0.40
344_V	399_G	1.176	0.40
546_E	669_V	1.175	0.40
232_S	353_A	1.173	0.40
230_E	352_F	1.172	0.39
627_S	662_P	1.168	0.39
82_G	246_F	1.164	0.39
439_G	644_E	1.157	0.39
650_L	662_P	1.151	0.38
563_I	575_M	1.146	0.38
230_E	350_C	1.145	0.38
98_Y	596_K	1.143	0.38
135_N	138_G	1.142	0.38
229_I	242_F	1.142	0.38
330_I	360_M	1.142	0.38
324_T	327_L	1.140	0.38
39_K	42_I	1.140	0.38
609_L	649_L	1.139	0.38
288_Y	291_M	1.139	0.38
226_F	366_K	1.131	0.37
162_R	165_T	1.130	0.37
228_V	347_A	1.128	0.37
469_V	475_V	1.128	0.37
287_K	346_F	1.125	0.37
597_I	696_K	1.122	0.37
184_V	187_I	1.121	0.37
597_I	623_I	1.120	0.37
360_M	365_V	1.119	0.37
658_K	688_N	1.117	0.37
135_N	139_I	1.116	0.37
680_S	684_S	1.115	0.37
91_G	232_S	1.111	0.36
360_M	369_M	1.110	0.36
232_S	369_M	1.106	0.36
576_M	673_L	1.106	0.36
271_Q	274_D	1.103	0.36
594_R	612_D	1.100	0.36
166_I	180_F	1.099	0.36
619_I	667_P	1.093	0.36
226_F	264_D	1.090	0.35
407_G	411_A	1.087	0.35
227_G	357_F	1.086	0.35
77_V	346_F	1.085	0.35
225_I	232_S	1.080	0.35
627_S	664_L	1.080	0.35
561_H	665_M	1.079	0.35
74_L	287_K	1.079	0.35
499_F	507_K	1.077	0.35
73_L	137_L	1.076	0.35
458_L	467_V	1.076	0.35
306_A	419_T	1.074	0.35
359_V	363_L	1.074	0.35
73_L	95_I	1.073	0.35
378_Y	390_W	1.070	0.34
199_I	478_D	1.069	0.34
612_D	691_Q	1.068	0.34
406_F	410_F	1.067	0.34
597_I	617_I	1.066	0.34
308_P	311_K	1.064	0.34
610_Q	649_L	1.064	0.34
483_L	503_S	1.063	0.34
173_G	330_I	1.060	0.34
570_V	604_K	1.058	0.34
232_S	243_Y	1.057	0.34
564_T	574_K	1.055	0.34
334_L	677_E	1.051	0.33
463_T	584_P	1.045	0.33
453_E	474_K	1.045	0.33
344_V	348_I	1.042	0.33
14_R	459_D	1.042	0.33
650_L	661_V	1.039	0.33
604_K	635_S	1.033	0.33
556_I	582_I	1.030	0.32
223_A	342_A	1.026	0.32
32_I	36_M	1.025	0.32
536_E	539_I	1.022	0.32
621_F	679_V	1.021	0.32
36_M	57_A	1.012	0.32
563_I	635_S	1.004	0.31
583_L	657_V	1.004	0.31
228_V	290_F	1.002	0.31
567_P	667_P	0.999	0.31
632_G	660_N	0.999	0.31
259_E	262_R	0.998	0.31
186_S	288_Y	0.997	0.31
563_I	676_G	0.997	0.31
265_Q	271_Q	0.996	0.31
243_Y	290_F	0.994	0.31
583_L	656_A	0.994	0.31
67_V	232_S	0.988	0.31
554_S	582_I	0.986	0.30
576_M	608_G	0.985	0.30
575_M	582_I	0.984	0.30
348_I	352_F	0.981	0.30
617_I	670_F	0.979	0.30
287_K	352_F	0.978	0.30
287_K	350_C	0.975	0.30
537_E	540_A	0.974	0.30
607_I	649_L	0.972	0.30
290_F	369_M	0.969	0.30
284_M	289_P	0.963	0.29
464_R	496_Q	0.962	0.29
230_E	339_L	0.961	0.29
225_I	369_M	0.960	0.29
67_V	344_V	0.957	0.29
587_G	657_V	0.956	0.29
600_V	641_D	0.955	0.29
300_L	409_R	0.954	0.29
232_S	287_K	0.954	0.29
11_K	559_E	0.952	0.29
369_M	373_G	0.952	0.29
588_I	681_I	0.949	0.29
449_M	467_V	0.946	0.29
96_I	152_V	0.944	0.29
563_I	670_F	0.944	0.29
227_G	286_G	0.943	0.29
138_G	142_L	0.942	0.29
21_A	286_G	0.941	0.28
536_E	540_A	0.938	0.28
596_K	645_P	0.937	0.28
528_Q	537_E	0.935	0.28
290_F	347_A	0.934	0.28
11_K	161_N	0.931	0.28
632_G	656_A	0.929	0.28
561_H	581_A	0.928	0.28
589_V	652_V	0.928	0.28
582_I	611_S	0.925	0.28
308_P	405_Y	0.923	0.28
187_I	190_L	0.920	0.28
287_K	290_F	0.919	0.28
303_Y	315_A	0.914	0.27
415_F	647_Q	0.913	0.27
289_P	346_F	0.912	0.27
199_I	308_P	0.911	0.27
650_L	660_N	0.909	0.27
289_P	349_H	0.908	0.27
289_P	360_M	0.907	0.27
16_L	25_A	0.906	0.27
245_P	370_T	0.905	0.27
621_F	649_L	0.903	0.27
204_Q	283_F	0.902	0.27
559_E	685_G	0.901	0.27
81_I	312_K	0.900	0.27
152_V	196_M	0.900	0.27
163_F	668_I	0.898	0.27
681_I	684_S	0.896	0.27
211_S	252_S	0.895	0.27
81_I	305_E	0.895	0.27
423_E	428_E	0.893	0.26
436_G	478_D	0.892	0.26
29_L	60_M	0.891	0.26
567_P	632_G	0.891	0.26
226_F	229_I	0.891	0.26
382_G	390_W	0.890	0.26
152_V	192_L	0.889	0.26
560_I	580_F	0.888	0.26
67_V	74_L	0.887	0.26
184_V	188_S	0.885	0.26
247_W	291_M	0.884	0.26
537_E	542_P	0.884	0.26
540_A	631_E	0.883	0.26
353_A	369_M	0.880	0.26
267_I	390_W	0.876	0.26
670_F	676_G	0.873	0.26
680_S	694_I	0.873	0.26
266_R	269_M	0.871	0.26
302_I	341_V	0.871	0.26
607_I	610_Q	0.871	0.26
99_L	137_L	0.869	0.25
96_I	439_G	0.868	0.25
243_Y	339_L	0.865	0.25
603_T	666_T	0.864	0.25
158_L	163_F	0.863	0.25
440_D	572_S	0.860	0.25
681_I	685_G	0.859	0.25
587_G	652_V	0.857	0.25
203_I	375_L	0.856	0.25
287_K	339_L	0.855	0.25
598_L	647_Q	0.855	0.25
136_M	139_I	0.853	0.25
375_L	617_I	0.853	0.25
139_I	142_L	0.853	0.25
102_N	142_L	0.848	0.25
554_S	673_L	0.847	0.25
186_S	346_F	0.847	0.25
611_S	623_I	0.846	0.25
247_W	374_G	0.844	0.24
365_V	392_L	0.842	0.24
478_D	572_S	0.841	0.24
28_I	74_L	0.838	0.24
297_A	325_S	0.837	0.24
662_P	673_L	0.836	0.24
569_Q	645_P	0.835	0.24
74_L	230_E	0.834	0.24
300_L	305_E	0.833	0.24
636_F	647_Q	0.833	0.24
284_M	288_Y	0.833	0.24
627_S	661_V	0.829	0.24
289_P	356_S	0.828	0.24
469_V	576_M	0.825	0.24
68_F	324_T	0.825	0.24
171_Y	217_A	0.824	0.24
582_I	681_I	0.824	0.24
318_M	342_A	0.823	0.24
31_A	385_P	0.823	0.24
23_L	80_A	0.823	0.24
497_A	503_S	0.821	0.24
184_V	269_M	0.820	0.24
21_A	24_P	0.820	0.24
230_E	365_V	0.818	0.23
565_D	664_L	0.818	0.23
173_G	499_F	0.818	0.23
35_A	41_M	0.817	0.23
440_D	639_E	0.817	0.23
134_V	143_A	0.817	0.23
74_L	190_L	0.816	0.23
653_D	656_A	0.815	0.23
145_G	204_Q	0.814	0.23
20_V	246_F	0.814	0.23
556_I	619_I	0.811	0.23
638_S	658_K	0.810	0.23
632_G	636_F	0.809	0.23
77_V	690_E	0.809	0.23
186_S	284_M	0.808	0.23
632_G	663_S	0.807	0.23
272_I	387_R	0.807	0.23
670_F	694_I	0.806	0.23
216_E	311_K	0.806	0.23
20_V	318_M	0.804	0.23
265_Q	269_M	0.801	0.23
590_V	647_Q	0.801	0.23
619_I	666_T	0.800	0.23
559_E	609_L	0.800	0.23
525_T	541_E	0.798	0.23
415_F	559_E	0.798	0.23
398_L	401_A	0.797	0.23
228_V	353_A	0.796	0.23
650_L	656_A	0.796	0.23
576_M	619_I	0.796	0.23
16_L	160_F	0.796	0.23
522_E	525_T	0.795	0.23
298_A	404_Y	0.794	0.23
247_W	286_G	0.793	0.22
580_F	681_I	0.792	0.22
287_K	358_M	0.791	0.22
596_K	639_E	0.791	0.22
269_M	272_I	0.790	0.22
636_F	650_L	0.789	0.22
62_S	104_S	0.789	0.22
282_T	366_K	0.786	0.22
648_K	690_E	0.786	0.22
493_N	572_S	0.785	0.22
539_I	544_Q	0.784	0.22
447_Q	619_I	0.783	0.22
476_D	591_S	0.782	0.22
352_F	355_L	0.782	0.22
251_F	280_A	0.781	0.22
37_Q	57_A	0.780	0.22
478_D	539_I	0.780	0.22
367_I	382_G	0.779	0.22
678_T	686_S	0.777	0.22
100_V	162_R	0.777	0.22
654_L	661_V	0.775	0.22
527_A	596_K	0.774	0.22
263_G	267_I	0.771	0.22
623_I	664_L	0.771	0.22
271_Q	390_W	0.769	0.22
162_R	613_G	0.768	0.22
537_E	544_Q	0.768	0.22
155_L	248_Y	0.767	0.22
325_S	572_S	0.767	0.22
658_K	664_L	0.767	0.22
223_A	369_M	0.766	0.22
460_A	497_A	0.766	0.22
98_Y	106_S	0.765	0.21
441_L	483_L	0.764	0.21
230_E	337_S	0.763	0.21
413_R	418_K	0.763	0.21
264_D	281_G	0.762	0.21
585_S	688_N	0.761	0.21
608_G	618_L	0.760	0.21
42_I	59_V	0.759	0.21
411_A	415_F	0.759	0.21
647_Q	669_V	0.756	0.21
18_L	81_I	0.755	0.21
195_I	683_A	0.755	0.21
555_P	667_P	0.755	0.21
433_G	659_P	0.753	0.21
581_A	665_M	0.753	0.21
553_V	645_P	0.752	0.21
373_G	393_V	0.751	0.21
87_D	341_V	0.750	0.21
344_V	415_F	0.748	0.21
164_Y	393_V	0.748	0.21
163_F	406_F	0.748	0.21
669_V	694_I	0.746	0.21
206_G	591_S	0.746	0.21
578_D	673_L	0.744	0.21
538_V	686_S	0.744	0.21
550_E	680_S	0.742	0.21
563_I	602_P	0.742	0.21
378_Y	393_V	0.740	0.21
62_S	69_D	0.739	0.21
583_L	665_M	0.739	0.21
526_S	586_E	0.738	0.21
652_V	666_T	0.738	0.21
462_I	483_L	0.738	0.21
547_I	694_I	0.737	0.20
13_G	82_G	0.736	0.20
655_D	685_G	0.735	0.20
350_C	355_L	0.734	0.20
502_R	506_L	0.732	0.20
162_R	220_T	0.732	0.20
321_A	342_A	0.731	0.20
137_L	141_T	0.730	0.20
539_I	549_E	0.729	0.20
226_F	363_L	0.729	0.20
583_L	658_K	0.729	0.20
20_V	210_F	0.728	0.20
212_T	379_F	0.728	0.20
213_G	217_A	0.728	0.20
268_F	300_L	0.728	0.20
6_F	10_Q	0.727	0.20
52_N	56_V	0.727	0.20
257_A	334_L	0.726	0.20
296_P	404_Y	0.725	0.20
563_I	666_T	0.724	0.20
663_S	666_T	0.723	0.20
101_M	339_L	0.723	0.20
591_S	594_R	0.718	0.20
69_D	552_F	0.716	0.20
160_F	178_K	0.716	0.20
499_F	503_S	0.715	0.20
557_T	587_G	0.715	0.20
636_F	644_E	0.715	0.20
367_I	393_V	0.713	0.20
524_K	538_V	0.711	0.20
298_A	343_P	0.710	0.20
232_S	358_M	0.710	0.20
578_D	661_V	0.710	0.20
470_N	546_E	0.710	0.20
89_V	393_V	0.709	0.20
359_V	362_L	0.709	0.20
95_I	346_F	0.708	0.19
224_F	357_F	0.708	0.19
362_L	379_F	0.708	0.19
33_G	64_G	0.707	0.19
98_Y	312_K	0.707	0.19
339_L	353_A	0.706	0.19
604_K	671_T	0.705	0.19
223_A	352_F	0.705	0.19
68_F	148_G	0.702	0.19
31_A	252_S	0.701	0.19
353_A	393_V	0.701	0.19
514_I	517_R	0.700	0.19
540_A	659_P	0.700	0.19
223_A	228_V	0.699	0.19
269_M	370_T	0.699	0.19
285_T	366_K	0.698	0.19
469_V	687_V	0.698	0.19
524_K	617_I	0.698	0.19
591_S	682_K	0.697	0.19
324_T	360_M	0.696	0.19
358_M	439_G	0.696	0.19
29_L	99_L	0.696	0.19
11_K	506_L	0.696	0.19
27_G	370_T	0.695	0.19
569_Q	623_I	0.694	0.19
223_A	317_I	0.694	0.19
264_D	284_M	0.693	0.19
585_S	589_V	0.693	0.19
541_E	659_P	0.692	0.19
596_K	612_D	0.692	0.19
32_I	205_H	0.692	0.19
334_L	557_T	0.691	0.19
599_N	639_E	0.691	0.19
431_A	536_E	0.689	0.19
311_K	634_T	0.689	0.19
666_T	690_E	0.687	0.19
359_V	395_P	0.686	0.19
585_S	629_K	0.686	0.19
396_V	399_G	0.685	0.19
336_F	632_G	0.685	0.19
444_E	479_R	0.684	0.19
77_V	359_V	0.683	0.19
615_R	676_G	0.683	0.19
347_A	406_F	0.681	0.19
573_G	642_R	0.680	0.19
264_D	283_F	0.680	0.19
98_Y	563_I	0.679	0.19
411_A	590_V	0.679	0.19
570_V	694_I	0.679	0.19
664_L	667_P	0.679	0.19
573_G	669_V	0.679	0.19
498_I	669_V	0.678	0.19
444_E	482_Q	0.678	0.19
560_I	617_I	0.677	0.18
563_I	598_L	0.677	0.18
222_A	226_F	0.675	0.18
172_L	334_L	0.675	0.18
477_K	481_K	0.675	0.18
104_S	241_I	0.674	0.18
272_I	278_L	0.672	0.18
660_N	663_S	0.672	0.18
611_S	615_R	0.671	0.18
290_F	339_L	0.671	0.18
251_F	264_D	0.670	0.18
16_L	33_G	0.670	0.18
360_M	376_I	0.667	0.18
609_L	623_I	0.667	0.18
560_I	591_S	0.666	0.18
505_G	508_T	0.666	0.18
320_S	507_K	0.666	0.18
615_R	694_I	0.666	0.18
655_D	680_S	0.665	0.18
225_I	417_L	0.665	0.18
572_S	588_I	0.665	0.18
107_A	334_L	0.664	0.18
582_I	587_G	0.664	0.18
662_P	676_G	0.663	0.18
489_L	554_S	0.663	0.18
269_M	312_K	0.663	0.18
94_A	346_F	0.663	0.18
41_M	63_A	0.661	0.18
524_K	528_Q	0.661	0.18
607_I	619_I	0.661	0.18
102_N	226_F	0.661	0.18
196_M	311_K	0.661	0.18
636_F	666_T	0.661	0.18
443_Y	510_M	0.660	0.18
576_M	661_V	0.658	0.18
99_L	166_I	0.657	0.18
210_F	229_I	0.657	0.18
98_Y	102_N	0.656	0.18
525_T	537_E	0.656	0.18
433_G	638_S	0.655	0.18
195_I	612_D	0.654	0.18
594_R	647_Q	0.654	0.18
443_Y	447_Q	0.653	0.18
453_E	642_R	0.652	0.18
413_R	642_R	0.652	0.18
307_K	598_L	0.651	0.18
20_V	241_I	0.651	0.18
351_L	615_R	0.651	0.18
342_A	443_Y	0.650	0.18
223_A	287_K	0.649	0.18
425_A	598_L	0.648	0.18
189_A	391_W	0.647	0.18
219_P	285_T	0.647	0.18
456_K	468_T	0.647	0.18
192_L	685_G	0.646	0.18
223_A	243_Y	0.645	0.17
78_G	82_G	0.645	0.17
186_S	289_P	0.644	0.17
74_L	208_N	0.644	0.17
162_R	416_N	0.644	0.17
243_Y	350_C	0.642	0.17
207_L	210_F	0.641	0.17
664_L	683_A	0.640	0.17
15_A	97_G	0.640	0.17
195_I	456_K	0.639	0.17
475_V	497_A	0.639	0.17
349_H	369_M	0.639	0.17
79_V	632_G	0.638	0.17
230_E	278_L	0.638	0.17
650_L	667_P	0.638	0.17
453_E	687_V	0.637	0.17
219_P	361_Q	0.637	0.17
28_I	207_L	0.636	0.17
77_V	337_S	0.635	0.17
633_F	649_L	0.635	0.17
162_R	657_V	0.634	0.17
205_H	209_A	0.634	0.17
663_S	667_P	0.633	0.17
62_S	65_Q	0.633	0.17
372_S	404_Y	0.633	0.17
22_I	488_V	0.632	0.17
551_V	696_K	0.632	0.17
22_I	375_L	0.631	0.17
272_I	276_V	0.631	0.17
554_S	572_S	0.631	0.17
537_E	586_E	0.629	0.17
291_M	295_L	0.629	0.17
18_L	382_G	0.628	0.17
36_M	40_D	0.628	0.17
576_M	649_L	0.627	0.17
528_Q	547_I	0.627	0.17
314_V	667_P	0.626	0.17
283_F	349_H	0.626	0.17
63_A	73_L	0.626	0.17
23_L	92_I	0.625	0.17
609_L	672_N	0.625	0.17
483_L	499_F	0.625	0.17
158_L	162_R	0.624	0.17
98_Y	141_T	0.624	0.17
208_N	497_A	0.624	0.17
290_F	356_S	0.624	0.17
316_G	492_G	0.624	0.17
562_P	572_S	0.624	0.17
468_T	472_Q	0.623	0.17
67_V	98_Y	0.623	0.17
455_I	491_V	0.623	0.17
230_E	358_M	0.622	0.17
276_V	387_R	0.621	0.17
79_V	346_F	0.621	0.17
98_Y	486_S	0.620	0.17
402_V	406_F	0.620	0.17
330_I	353_A	0.620	0.17
24_P	182_P	0.619	0.17
99_L	185_T	0.619	0.17
287_K	367_I	0.619	0.17
6_F	9_L	0.619	0.17
65_Q	103_V	0.618	0.17
30_L	34_N	0.618	0.17
649_L	690_E	0.617	0.17
616_E	671_T	0.617	0.17
598_L	669_V	0.617	0.17
284_M	360_M	0.616	0.17
42_I	54_Q	0.616	0.17
68_F	269_M	0.615	0.17
455_I	514_I	0.615	0.17
458_L	489_L	0.615	0.17
585_S	686_S	0.615	0.17
196_M	520_R	0.615	0.17
656_A	662_P	0.614	0.17
358_M	362_L	0.614	0.17
295_L	459_D	0.613	0.17
42_I	53_V	0.613	0.17
635_S	662_P	0.612	0.16
203_I	474_K	0.611	0.16
160_F	264_D	0.611	0.16
609_L	616_E	0.611	0.16
617_I	659_P	0.608	0.16
10_Q	84_A	0.607	0.16
551_V	670_F	0.607	0.16
283_F	314_V	0.607	0.16
227_G	247_W	0.607	0.16
228_V	243_Y	0.607	0.16
590_V	611_S	0.606	0.16
573_G	644_E	0.605	0.16
648_K	670_F	0.604	0.16
526_S	689_R	0.604	0.16
448_A	483_L	0.604	0.16
473_K	629_K	0.604	0.16
504_D	510_M	0.604	0.16
352_F	406_F	0.603	0.16
432_P	542_P	0.603	0.16
89_V	339_L	0.603	0.16
594_R	689_R	0.602	0.16
296_P	377_D	0.601	0.16
24_P	320_S	0.601	0.16
575_M	662_P	0.600	0.16
11_K	685_G	0.600	0.16
543_L	612_D	0.599	0.16
307_K	346_F	0.599	0.16
203_I	270_A	0.599	0.16
478_D	638_S	0.599	0.16
557_T	619_I	0.598	0.16
267_I	280_A	0.597	0.16
538_V	583_L	0.596	0.16
12_I	154_V	0.596	0.16
457_H	468_T	0.595	0.16
207_L	213_G	0.594	0.16
199_I	540_A	0.594	0.16
564_T	686_S	0.594	0.16
563_I	599_N	0.593	0.16
350_C	452_Q	0.593	0.16
349_H	404_Y	0.593	0.16
74_L	101_M	0.591	0.16
171_Y	319_G	0.591	0.16
171_Y	176_A	0.591	0.16
244_S	248_Y	0.590	0.16
30_L	148_G	0.590	0.16
71_L	146_V	0.588	0.16
449_M	457_H	0.588	0.16
580_F	615_R	0.587	0.16
596_K	640_G	0.586	0.16
299_A	334_L	0.586	0.16
247_W	372_S	0.585	0.16
599_N	672_N	0.585	0.16
360_M	446_L	0.584	0.16
182_P	263_G	0.584	0.16
95_I	609_L	0.584	0.16
576_M	618_L	0.584	0.16
11_K	449_M	0.583	0.16
287_K	365_V	0.583	0.16
610_Q	639_E	0.583	0.16
295_L	328_T	0.583	0.16
628_L	631_E	0.582	0.16
9_L	12_I	0.581	0.16
598_L	639_E	0.580	0.16
189_A	499_F	0.580	0.16
543_L	659_P	0.578	0.16
157_A	584_P	0.578	0.16
557_T	631_E	0.577	0.15
30_L	166_I	0.577	0.15
23_L	368_G	0.577	0.15
429_T	572_S	0.576	0.15
565_D	609_L	0.576	0.15
247_W	373_G	0.576	0.15
635_S	639_E	0.576	0.15
29_L	66_I	0.575	0.15
522_E	651_E	0.574	0.15
203_I	208_N	0.574	0.15
35_A	57_A	0.573	0.15
11_K	152_V	0.573	0.15
242_F	287_K	0.572	0.15
316_G	663_S	0.572	0.15
433_G	597_I	0.571	0.15
603_T	629_K	0.571	0.15
272_I	381_F	0.571	0.15
325_S	400_L	0.571	0.15
582_I	617_I	0.570	0.15
590_V	648_K	0.570	0.15
214_L	244_S	0.568	0.15
561_H	638_S	0.567	0.15
199_I	545_N	0.565	0.15
617_I	642_R	0.565	0.15
264_D	349_H	0.565	0.15
225_I	230_E	0.565	0.15
226_F	394_I	0.565	0.15
441_L	462_I	0.563	0.15
289_P	376_I	0.563	0.15
610_Q	642_R	0.561	0.15
304_H	406_F	0.561	0.15
551_V	692_E	0.561	0.15
398_L	470_N	0.561	0.15
548_G	678_T	0.560	0.15
552_F	594_R	0.560	0.15
506_L	510_M	0.559	0.15
210_F	213_G	0.559	0.15
355_L	359_V	0.559	0.15
86_G	160_F	0.558	0.15
6_F	480_L	0.558	0.15
572_S	583_L	0.558	0.15
192_L	217_A	0.558	0.15
89_V	243_Y	0.557	0.15
243_Y	393_V	0.556	0.15
642_R	649_L	0.556	0.15
556_I	667_P	0.556	0.15
42_I	57_A	0.556	0.15
556_I	621_F	0.556	0.15
242_F	339_L	0.555	0.15
215_V	226_F	0.555	0.15
164_Y	266_R	0.555	0.15
223_A	366_K	0.555	0.15
328_T	459_D	0.554	0.15
573_G	586_E	0.553	0.15
21_A	26_A	0.553	0.15
246_F	341_V	0.552	0.15
539_I	546_E	0.552	0.15
267_I	277_Q	0.552	0.15
387_R	390_W	0.552	0.15
161_N	510_M	0.551	0.15
476_D	669_V	0.551	0.15
366_K	388_T	0.550	0.15
350_C	353_A	0.550	0.15
344_V	347_A	0.550	0.15
603_T	623_I	0.548	0.15
291_M	372_S	0.548	0.15
563_I	610_Q	0.548	0.15
412_I	419_T	0.548	0.15
15_A	83_L	0.548	0.15
58_G	163_F	0.547	0.15
471_D	616_E	0.546	0.15
359_V	384_L	0.546	0.15
330_I	370_T	0.546	0.15
275_G	389_A	0.546	0.15
87_D	384_L	0.545	0.15
604_K	673_L	0.544	0.15
226_F	278_L	0.544	0.15
616_E	657_V	0.544	0.15
663_S	673_L	0.543	0.15
573_G	627_S	0.543	0.15
307_K	426_A	0.541	0.14
523_P	526_S	0.541	0.14
148_G	324_T	0.541	0.14
323_L	501_P	0.540	0.14
567_P	650_L	0.539	0.14
232_S	339_L	0.539	0.14
241_I	280_A	0.537	0.14
302_I	314_V	0.537	0.14
427_E	482_Q	0.537	0.14
576_M	624_D	0.537	0.14
294_G	404_Y	0.536	0.14
554_S	557_T	0.536	0.14
96_I	202_P	0.535	0.14
265_Q	388_T	0.535	0.14
180_F	628_L	0.535	0.14
74_L	583_L	0.533	0.14
350_C	360_M	0.533	0.14
486_S	681_I	0.533	0.14
617_I	666_T	0.532	0.14
145_G	320_S	0.532	0.14
581_A	667_P	0.532	0.14
287_K	349_H	0.532	0.14
391_W	394_I	0.532	0.14
86_G	376_I	0.532	0.14
29_L	78_G	0.532	0.14
629_K	649_L	0.531	0.14
234_I	380_L	0.530	0.14
643_V	648_K	0.530	0.14
173_G	483_L	0.530	0.14
575_M	580_F	0.529	0.14
264_D	279_T	0.529	0.14
135_N	248_Y	0.529	0.14
21_A	229_I	0.529	0.14
271_Q	382_G	0.528	0.14
83_L	155_L	0.528	0.14
586_E	591_S	0.528	0.14
662_P	670_F	0.527	0.14
651_E	691_Q	0.527	0.14
91_G	302_I	0.527	0.14
243_Y	265_Q	0.527	0.14
316_G	632_G	0.527	0.14
292_M	380_L	0.526	0.14
249_E	262_R	0.526	0.14
50_N	54_Q	0.526	0.14
572_S	659_P	0.526	0.14
544_Q	582_I	0.525	0.14
171_Y	302_I	0.525	0.14
98_Y	277_Q	0.524	0.14
415_F	664_L	0.524	0.14
615_R	677_E	0.524	0.14
604_K	634_T	0.524	0.14
230_E	349_H	0.523	0.14
220_T	358_M	0.523	0.14
249_E	370_T	0.523	0.14
367_I	381_F	0.523	0.14
580_F	695_V	0.522	0.14
375_L	445_I	0.521	0.14
81_I	555_P	0.520	0.14
645_P	649_L	0.520	0.14
346_F	394_I	0.520	0.14
302_I	342_A	0.519	0.14
74_L	157_A	0.519	0.14
629_K	696_K	0.519	0.14
286_G	357_F	0.519	0.14
559_E	684_S	0.518	0.14
433_G	541_E	0.518	0.14
563_I	694_I	0.518	0.14
375_L	645_P	0.518	0.14
173_G	641_D	0.518	0.14
661_V	673_L	0.517	0.14
473_K	591_S	0.516	0.14
593_V	617_I	0.516	0.14
155_L	504_D	0.515	0.14
147_F	245_P	0.513	0.14
602_P	657_V	0.513	0.14
655_D	684_S	0.513	0.14
54_Q	162_R	0.513	0.14
447_Q	659_P	0.513	0.14
562_P	619_I	0.513	0.14
537_E	546_E	0.512	0.14
580_F	604_K	0.512	0.14
275_G	385_P	0.512	0.14
589_V	664_L	0.512	0.14
182_P	328_T	0.511	0.14
365_V	373_G	0.511	0.14
686_S	689_R	0.511	0.14
244_S	352_F	0.511	0.14
410_F	413_R	0.510	0.14
483_L	576_M	0.510	0.14
570_V	580_F	0.510	0.14
499_F	510_M	0.509	0.14
448_A	572_S	0.509	0.14
81_I	190_L	0.508	0.14
495_I	563_I	0.508	0.14
145_G	280_A	0.508	0.14
525_T	528_Q	0.508	0.14
100_V	230_E	0.508	0.14
600_V	652_V	0.507	0.14
645_P	658_K	0.507	0.14
236_F	501_P	0.507	0.14
61_E	273_K	0.507	0.14
81_I	455_I	0.506	0.14
72_P	455_I	0.506	0.14
543_L	562_P	0.506	0.14
89_V	507_K	0.506	0.14
267_I	382_G	0.506	0.14
602_P	670_F	0.506	0.14
602_P	616_E	0.506	0.14
155_L	302_I	0.505	0.14
347_A	403_I	0.504	0.14
677_E	687_V	0.504	0.14
173_G	252_S	0.504	0.14
541_E	629_K	0.504	0.14
84_A	191_I	0.503	0.14
297_A	378_Y	0.503	0.14
460_A	506_L	0.503	0.14
473_K	694_I	0.503	0.14
474_K	694_I	0.502	0.13
192_L	416_N	0.502	0.13
456_K	565_D	0.501	0.13
261_I	359_V	0.501	0.13
196_M	394_I	0.500	0.13
42_I	106_S	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ourB	1	0.2146	100	0.81	Contact Map
1f3zA	2	0.2146	100	0.81	Contact Map
2gprA	1	0.2203	100	0.81	Contact Map
1ax3A	1	0.2318	100	0.815	Contact Map
3qnqA	2	0.5608	100	0.815	Contact Map
1ibaA	1	0.1116	99.9	0.913	Contact Map
3bp3A	1	0.1159	99.9	0.914	Contact Map
3ipjA	1	0.133	99.9	0.92	Contact Map
1dczA	1	0.1102	98.6	0.963	Contact Map
2d5dA	1	0.1001	98.5	0.964	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0162 seconds.