SUBE - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SUBE - Minor extracellular protease Epr

UniProt:	P16396	Sequences: MKNMSCKLVVSVTLFFSFLTIGPLAHAQNSSEKEVIVVYKNKAGKETILDSDADVEQQYKHLPAVAVTADQETVKELKQDPDILYVENNVSFTAADSTDFKVLSDGTDTSDNFEQWNLEPIQVKQAWKAGLTGKNIKIAVIDSGISPHDDLSIAGGYSAVSYTSSYKDDNGHGTHVAGIIGAKHNGYGIDGIAPEAQIYAVKALDQNGSGDLQSLLQGIDWSIANRMDIVNMSLGTTSDSKILHDAVNKAYEQGVLLVAASGNDGNGKPVNYPAAYSSVVAVSATNEKNQLASFSTTGDEVEFSAPGTNITSTYLNQYYATGSGTSQATPHAAAMFALLKQRDPAETNVQLREEMRKNIVDLGTAGRDQQFGYGLIQYKAQATDSAYAAAEQAVKKAEQTKAQIDINKARELISQLPNSDAKTALHKRLDKVQSYRNVKDAKDKVAKAEKYKTQQTVDTAQTAINKLPNGTDKKNLQKRLDQVKRYIASKQAKDKVAKAEKSKKKTDVDSAQSAIGKLPASSEKTSLQKRLNKVKSTNLKTAQQSVSAAEKKSTDANAAKAQSAVNQLQAGKDKTALQKRLDKVKKKVAAAEAKKVETAKAKVKKAEKDKTKKSKTSAQSAVNQLKASNEKTKLQKRLNAVKPKK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	645 (543)
Sequences:	265 (248)
Seq/√Len:	10.6

BACSU - SUBE SUBV WPRA SUBF SUBT APRX
HALSA - Q9HNT7 Q9HMF2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
284_A	292_A	6.194	1.00
182_A	313_T	5.922	1.00
274_A	281_A	5.725	1.00
175_H	327_Q	5.438	1.00
335_M	378_Y	4.742	1.00
132_T	195_E	4.549	1.00
139_A	222_S	4.475	1.00
260_A	329_T	4.363	1.00
283_S	304_S	4.035	0.99
246_A	250_A	4.000	0.99
140_V	180_I	3.751	0.98
122_Q	377_Q	3.617	0.98
199_Y	227_M	3.591	0.98
175_H	312_S	3.585	0.98
223_I	255_V	3.363	0.97
335_M	376_I	3.318	0.97
178_G	312_S	3.282	0.96
159_A	221_W	3.250	0.96
138_I	180_I	3.201	0.96
150_D	182_A	3.030	0.94
40_K	84_L	3.017	0.94
133_G	193_A	2.960	0.93
179_I	331_H	2.907	0.93
231_N	273_P	2.903	0.93
174_T	315_L	2.688	0.89
59_Y	64_A	2.652	0.89
203_A	234_L	2.571	0.87
39_Y	65_V	2.524	0.86
158_S	166_Y	2.494	0.85
158_S	163_T	2.494	0.85
314_Y	320_A	2.455	0.84
204_L	261_S	2.396	0.83
339_L	351_L	2.348	0.82
176_V	234_L	2.336	0.81
223_I	250_A	2.314	0.81
358_N	381_Q	2.303	0.80
312_S	327_Q	2.286	0.80
284_A	294_F	2.271	0.79
121_I	280_V	2.250	0.79
150_D	313_T	2.196	0.77
322_G	327_Q	2.181	0.76
296_T	301_V	2.111	0.74
296_T	371_F	2.032	0.71
38_V	84_L	1.990	0.69
511_A	515_I	1.976	0.69
234_L	250_A	1.976	0.69
219_I	222_S	1.955	0.68
137_K	199_Y	1.930	0.67
301_V	371_F	1.912	0.66
177_A	203_A	1.898	0.66
219_I	250_A	1.861	0.64
133_G	296_T	1.817	0.62
204_L	210_G	1.811	0.62
201_V	225_N	1.799	0.61
137_K	197_Q	1.794	0.61
219_I	231_N	1.787	0.61
201_V	283_S	1.771	0.60
498_K	505_K	1.744	0.59
221_W	371_F	1.742	0.59
148_H	319_Y	1.735	0.58
259_A	279_V	1.734	0.58
562_Q	567_Q	1.731	0.58
566_N	571_G	1.728	0.58
301_V	367_R	1.715	0.57
140_V	218_G	1.705	0.57
258_V	329_T	1.702	0.57
172_H	326_S	1.699	0.57
292_A	308_T	1.698	0.57
141_I	210_G	1.686	0.56
220_D	253_Q	1.648	0.54
223_I	230_V	1.647	0.54
260_A	264_D	1.642	0.54
192_I	228_D	1.641	0.54
553_S	556_A	1.617	0.53
218_G	283_S	1.613	0.53
556_A	563_S	1.606	0.52
135_N	193_A	1.597	0.52
234_L	259_A	1.594	0.52
136_I	229_I	1.587	0.51
363_G	366_G	1.539	0.49
559_A	562_Q	1.533	0.49
176_V	231_N	1.522	0.48
284_A	323_S	1.521	0.48
346_E	350_Q	1.511	0.48
138_I	337_A	1.507	0.48
227_M	255_V	1.498	0.47
552_K	558_A	1.495	0.47
183_K	296_T	1.494	0.47
467_L	471_T	1.491	0.47
458_D	477_Q	1.481	0.46
175_H	178_G	1.476	0.46
172_H	330_P	1.475	0.46
175_H	306_P	1.475	0.46
210_G	331_H	1.468	0.46
555_D	565_V	1.466	0.46
121_I	331_H	1.462	0.45
303_F	376_I	1.460	0.45
230_V	250_A	1.451	0.45
361_D	368_D	1.449	0.45
566_N	572_K	1.448	0.45
465_N	468_P	1.444	0.45
182_A	349_V	1.424	0.44
302_E	307_G	1.418	0.43
566_N	577_L	1.417	0.43
219_I	234_L	1.411	0.43
142_D	173_G	1.410	0.43
360_V	377_Q	1.409	0.43
471_T	477_Q	1.406	0.43
262_G	326_S	1.401	0.43
154_A	197_Q	1.376	0.41
367_R	373_Y	1.362	0.41
453_T	456_T	1.356	0.41
176_V	273_P	1.355	0.40
87_E	334_A	1.345	0.40
558_A	577_L	1.342	0.40
296_T	300_E	1.338	0.40
298_G	312_S	1.326	0.39
122_Q	208_G	1.318	0.39
564_A	571_G	1.315	0.39
223_I	234_L	1.310	0.38
567_Q	571_G	1.300	0.38
562_Q	565_V	1.292	0.38
221_W	296_T	1.291	0.38
284_A	375_L	1.284	0.37
338_L	378_Y	1.284	0.37
559_A	563_S	1.283	0.37
562_Q	571_G	1.279	0.37
215_L	234_L	1.275	0.37
498_K	504_K	1.270	0.37
159_A	225_N	1.270	0.37
557_N	566_N	1.269	0.37
133_G	301_V	1.269	0.37
319_Y	337_A	1.265	0.36
302_E	312_S	1.264	0.36
496_V	513_S	1.263	0.36
219_I	246_A	1.259	0.36
571_G	575_T	1.257	0.36
430_D	443_D	1.256	0.36
260_A	274_A	1.256	0.36
179_I	296_T	1.255	0.36
272_Y	281_A	1.254	0.36
485_R	490_K	1.247	0.36
176_V	203_A	1.244	0.36
569_Q	573_D	1.242	0.35
292_A	323_S	1.242	0.35
565_V	572_K	1.240	0.35
146_S	282_V	1.239	0.35
567_Q	576_A	1.237	0.35
303_F	307_G	1.237	0.35
146_S	327_Q	1.231	0.35
275_A	352_R	1.231	0.35
498_K	501_K	1.229	0.35
172_H	262_G	1.226	0.35
168_D	171_G	1.216	0.34
552_K	555_D	1.215	0.34
221_W	297_T	1.214	0.34
221_W	225_N	1.212	0.34
560_K	566_N	1.205	0.34
567_Q	577_L	1.204	0.34
150_D	391_E	1.201	0.34
557_N	564_A	1.200	0.34
484_K	493_K	1.199	0.34
203_A	232_M	1.196	0.33
145_I	200_A	1.196	0.33
174_T	208_G	1.193	0.33
236_T	292_A	1.193	0.33
508_V	515_I	1.189	0.33
77_L	80_D	1.189	0.33
133_G	235_G	1.188	0.33
59_Y	66_A	1.188	0.33
536_S	539_L	1.185	0.33
201_V	373_Y	1.182	0.33
227_M	250_A	1.181	0.33
158_S	315_L	1.179	0.33
199_Y	223_I	1.176	0.33
468_P	483_V	1.176	0.33
133_G	341_Q	1.169	0.32
558_A	562_Q	1.168	0.32
172_H	233_S	1.165	0.32
535_K	546_V	1.164	0.32
337_A	341_Q	1.163	0.32
151_L	174_T	1.162	0.32
284_A	308_T	1.161	0.32
283_S	297_T	1.161	0.32
568_L	572_K	1.159	0.32
259_A	296_T	1.152	0.32
464_I	467_L	1.151	0.32
142_D	374_G	1.151	0.32
120_P	179_I	1.150	0.32
510_S	574_K	1.147	0.31
232_M	259_A	1.147	0.31
259_A	272_Y	1.146	0.31
250_A	254_G	1.144	0.31
460_A	464_I	1.143	0.31
145_I	295_S	1.143	0.31
508_V	518_L	1.142	0.31
301_V	373_Y	1.139	0.31
282_V	307_G	1.137	0.31
148_H	312_S	1.133	0.31
561_A	571_G	1.129	0.31
274_A	370_Q	1.126	0.31
300_E	371_F	1.124	0.31
551_K	561_A	1.121	0.30
128_K	335_M	1.121	0.30
557_N	563_S	1.116	0.30
356_R	373_Y	1.116	0.30
135_N	228_D	1.114	0.30
568_L	574_K	1.113	0.30
477_Q	481_D	1.112	0.30
551_K	571_G	1.112	0.30
178_G	325_T	1.110	0.30
175_H	322_G	1.108	0.30
201_V	221_W	1.108	0.30
461_Q	509_D	1.107	0.30
230_V	257_L	1.107	0.30
564_A	568_L	1.103	0.30
222_S	257_L	1.100	0.30
459_T	476_L	1.097	0.29
560_K	570_A	1.094	0.29
546_V	562_Q	1.093	0.29
34_E	66_A	1.092	0.29
148_H	300_E	1.085	0.29
298_G	307_G	1.081	0.29
453_T	457_V	1.081	0.29
461_Q	465_N	1.081	0.29
565_V	568_L	1.078	0.29
552_K	567_Q	1.074	0.29
561_A	567_Q	1.073	0.29
489_S	524_K	1.071	0.28
315_L	327_Q	1.070	0.28
368_D	373_Y	1.068	0.28
291_L	295_S	1.066	0.28
155_G	199_Y	1.063	0.28
460_A	463_A	1.060	0.28
60_K	247_V	1.059	0.28
557_N	569_Q	1.057	0.28
361_D	366_G	1.054	0.28
234_L	257_L	1.053	0.28
59_Y	67_V	1.053	0.28
188_G	313_T	1.052	0.28
190_D	274_A	1.051	0.28
562_Q	568_L	1.049	0.28
272_Y	294_F	1.048	0.28
118_L	122_Q	1.047	0.28
343_D	346_E	1.046	0.27
116_W	169_D	1.045	0.27
142_D	324_G	1.045	0.27
143_S	298_G	1.042	0.27
197_Q	369_Q	1.040	0.27
542_A	548_A	1.040	0.27
203_A	222_S	1.040	0.27
466_K	473_K	1.039	0.27
221_W	227_M	1.037	0.27
172_H	324_G	1.034	0.27
346_E	361_D	1.034	0.27
138_I	216_L	1.034	0.27
233_S	330_P	1.032	0.27
140_V	252_E	1.031	0.27
313_T	320_A	1.027	0.27
524_K	562_Q	1.025	0.27
522_S	536_S	1.021	0.27
230_V	255_V	1.021	0.27
159_A	371_F	1.020	0.27
532_N	539_L	1.019	0.26
135_N	296_T	1.019	0.26
540_K	552_K	1.013	0.26
204_L	278_S	1.012	0.26
552_K	562_Q	1.005	0.26
219_I	223_I	1.004	0.26
86_V	182_A	1.002	0.26
223_I	246_A	1.001	0.26
249_K	284_A	0.995	0.26
159_A	368_D	0.993	0.26
559_A	574_K	0.992	0.25
540_K	543_Q	0.990	0.25
179_I	312_S	0.989	0.25
459_T	484_K	0.987	0.25
562_Q	577_L	0.986	0.25
133_G	228_D	0.986	0.25
250_A	257_L	0.985	0.25
562_Q	566_N	0.984	0.25
276_Y	302_E	0.981	0.25
226_R	347_T	0.979	0.25
189_I	313_T	0.978	0.25
230_V	234_L	0.978	0.25
283_S	368_D	0.974	0.25
561_A	569_Q	0.971	0.25
499_A	503_K	0.969	0.25
554_T	557_N	0.967	0.25
201_V	356_R	0.967	0.25
168_D	202_K	0.965	0.25
89_N	94_A	0.963	0.24
471_T	481_D	0.963	0.24
132_T	194_P	0.961	0.24
193_A	337_A	0.960	0.24
565_V	577_L	0.958	0.24
541_T	547_S	0.958	0.24
330_P	374_G	0.955	0.24
548_A	557_N	0.955	0.24
194_P	301_V	0.955	0.24
477_Q	482_Q	0.955	0.24
280_V	302_E	0.953	0.24
461_Q	471_T	0.952	0.24
145_I	377_Q	0.950	0.24
565_V	570_A	0.945	0.24
180_I	280_V	0.944	0.24
455_Q	458_D	0.941	0.24
551_K	560_K	0.940	0.24
458_D	465_N	0.939	0.24
272_Y	301_V	0.937	0.24
202_K	423_T	0.936	0.24
222_S	230_V	0.935	0.23
130_G	195_E	0.935	0.23
155_G	227_M	0.934	0.23
205_D	251_Y	0.931	0.23
570_A	577_L	0.931	0.23
534_V	549_A	0.929	0.23
232_M	273_P	0.928	0.23
559_A	567_Q	0.927	0.23
198_I	269_P	0.924	0.23
444_K	447_K	0.924	0.23
543_Q	565_V	0.923	0.23
148_H	313_T	0.922	0.23
551_K	557_N	0.917	0.23
262_G	324_G	0.917	0.23
236_T	261_S	0.915	0.23
469_N	489_S	0.914	0.23
245_D	249_K	0.913	0.23
562_Q	570_A	0.911	0.23
112_N	117_N	0.909	0.23
439_K	445_V	0.909	0.23
131_L	341_Q	0.907	0.23
566_N	569_Q	0.904	0.22
500_E	514_A	0.903	0.22
234_L	368_D	0.901	0.22
543_Q	548_A	0.901	0.22
144_G	338_L	0.900	0.22
512_Q	536_S	0.900	0.22
541_T	569_Q	0.899	0.22
500_E	505_K	0.893	0.22
557_N	562_Q	0.889	0.22
39_Y	80_D	0.889	0.22
150_D	181_G	0.887	0.22
478_K	487_I	0.887	0.22
142_D	326_S	0.885	0.22
308_T	337_A	0.881	0.22
218_G	267_G	0.879	0.22
547_S	564_A	0.878	0.22
227_M	311_T	0.878	0.22
232_M	250_A	0.875	0.22
539_L	575_T	0.874	0.21
538_N	546_V	0.874	0.21
204_L	318_Y	0.874	0.21
214_S	217_Q	0.872	0.21
302_E	305_A	0.871	0.21
483_V	490_K	0.870	0.21
117_N	331_H	0.868	0.21
118_L	247_V	0.864	0.21
542_A	546_V	0.864	0.21
133_G	196_A	0.864	0.21
253_Q	268_K	0.864	0.21
236_T	273_P	0.863	0.21
438_V	444_K	0.863	0.21
532_N	567_Q	0.863	0.21
453_T	463_A	0.862	0.21
175_H	305_A	0.859	0.21
548_A	560_K	0.859	0.21
565_V	576_A	0.859	0.21
182_A	185_N	0.857	0.21
279_V	301_V	0.857	0.21
468_P	482_Q	0.856	0.21
94_A	258_V	0.855	0.21
181_G	192_I	0.853	0.21
313_T	319_Y	0.850	0.21
462_T	493_K	0.848	0.21
250_A	368_D	0.848	0.21
329_T	333_A	0.844	0.21
568_L	573_D	0.843	0.21
340_K	359_I	0.841	0.20
521_S	536_S	0.840	0.20
476_L	489_S	0.839	0.20
505_K	516_G	0.836	0.20
135_N	301_V	0.832	0.20
360_V	380_A	0.832	0.20
210_G	214_S	0.828	0.20
559_A	570_A	0.826	0.20
179_I	327_Q	0.826	0.20
231_N	381_Q	0.826	0.20
549_A	555_D	0.825	0.20
176_V	232_M	0.825	0.20
173_G	374_G	0.824	0.20
221_W	369_Q	0.822	0.20
558_A	572_K	0.821	0.20
45_K	86_V	0.817	0.20
59_Y	62_L	0.817	0.20
267_G	283_S	0.814	0.20
235_G	330_P	0.813	0.20
546_V	549_A	0.810	0.20
538_N	549_A	0.808	0.19
261_S	278_S	0.808	0.19
142_D	172_H	0.808	0.19
201_V	371_F	0.806	0.19
541_T	552_K	0.800	0.19
553_S	558_A	0.800	0.19
382_A	385_S	0.799	0.19
174_T	325_T	0.799	0.19
229_I	256_L	0.797	0.19
172_H	328_A	0.797	0.19
236_T	308_T	0.797	0.19
172_H	260_A	0.796	0.19
478_K	515_I	0.795	0.19
200_A	231_N	0.793	0.19
541_T	557_N	0.790	0.19
158_S	174_T	0.788	0.19
165_S	210_G	0.786	0.19
220_D	232_M	0.786	0.19
473_K	478_K	0.786	0.19
554_T	572_K	0.785	0.19
300_E	312_S	0.784	0.19
459_T	462_T	0.784	0.19
225_N	356_R	0.784	0.19
546_V	551_K	0.783	0.19
124_K	127_W	0.782	0.19
570_A	576_A	0.779	0.19
273_P	298_G	0.778	0.19
116_W	120_P	0.777	0.19
143_S	273_P	0.775	0.18
222_S	234_L	0.775	0.18
562_Q	569_Q	0.773	0.18
261_S	308_T	0.773	0.18
554_T	562_Q	0.771	0.18
247_V	352_R	0.770	0.18
133_G	297_T	0.769	0.18
158_S	219_I	0.767	0.18
538_N	551_K	0.766	0.18
255_V	259_A	0.765	0.18
268_K	331_H	0.765	0.18
478_K	489_S	0.764	0.18
175_H	298_G	0.764	0.18
256_L	363_G	0.763	0.18
124_K	329_T	0.763	0.18
542_A	558_A	0.762	0.18
161_S	234_L	0.762	0.18
456_T	465_N	0.762	0.18
469_N	475_N	0.762	0.18
216_L	284_A	0.761	0.18
156_G	246_A	0.761	0.18
149_D	199_Y	0.760	0.18
146_S	161_S	0.760	0.18
151_L	350_Q	0.759	0.18
459_T	463_A	0.758	0.18
77_L	84_L	0.756	0.18
173_G	324_G	0.754	0.18
222_S	250_A	0.751	0.18
205_D	351_L	0.751	0.18
457_V	485_R	0.747	0.18
500_E	517_K	0.747	0.18
554_T	568_L	0.746	0.18
332_A	381_Q	0.746	0.18
263_N	324_G	0.746	0.18
569_Q	578_Q	0.744	0.18
222_S	226_R	0.744	0.18
461_Q	470_G	0.743	0.18
508_V	556_A	0.741	0.18
476_L	481_D	0.741	0.18
275_A	388_A	0.741	0.18
202_K	276_Y	0.740	0.18
175_H	179_I	0.740	0.18
551_K	577_L	0.739	0.17
178_G	327_Q	0.737	0.17
326_S	330_P	0.737	0.17
541_T	576_A	0.736	0.17
236_T	264_D	0.735	0.17
470_G	477_Q	0.734	0.17
476_L	487_I	0.734	0.17
256_L	348_N	0.734	0.17
333_A	343_D	0.733	0.17
506_T	510_S	0.729	0.17
231_N	331_H	0.728	0.17
540_K	550_E	0.727	0.17
298_G	302_E	0.726	0.17
470_G	481_D	0.725	0.17
40_K	87_E	0.725	0.17
144_G	326_S	0.724	0.17
161_S	271_N	0.724	0.17
302_E	306_P	0.723	0.17
222_S	232_M	0.723	0.17
553_S	560_K	0.721	0.17
477_Q	485_R	0.720	0.17
449_E	514_A	0.719	0.17
547_S	560_K	0.719	0.17
265_G	274_A	0.719	0.17
496_V	511_A	0.717	0.17
36_I	212_L	0.717	0.17
567_Q	570_A	0.716	0.17
295_S	359_I	0.716	0.17
191_G	324_G	0.716	0.17
499_A	510_S	0.715	0.17
135_N	297_T	0.715	0.17
235_G	326_S	0.713	0.17
512_Q	519_P	0.713	0.17
305_A	310_I	0.710	0.17
183_K	197_Q	0.709	0.17
436_R	446_A	0.708	0.17
230_V	355_M	0.707	0.17
564_A	572_K	0.706	0.17
487_I	501_K	0.706	0.17
143_S	391_E	0.704	0.17
558_A	561_A	0.703	0.17
464_I	478_K	0.703	0.17
150_D	250_A	0.702	0.16
25_A	59_Y	0.701	0.16
330_P	337_A	0.700	0.16
229_I	346_E	0.700	0.16
566_N	576_A	0.699	0.16
567_Q	575_T	0.699	0.16
194_P	298_G	0.698	0.16
271_N	293_S	0.698	0.16
558_A	568_L	0.696	0.16
193_A	254_G	0.695	0.16
488_A	495_K	0.694	0.16
559_A	566_N	0.693	0.16
553_S	574_K	0.693	0.16
270_V	351_L	0.693	0.16
549_A	553_S	0.692	0.16
53_A	77_L	0.692	0.16
283_S	369_Q	0.692	0.16
175_H	310_I	0.691	0.16
566_N	570_A	0.689	0.16
505_K	510_S	0.687	0.16
25_A	63_P	0.686	0.16
440_D	447_K	0.686	0.16
561_A	568_L	0.686	0.16
302_E	327_Q	0.685	0.16
246_A	255_V	0.685	0.16
556_A	564_A	0.684	0.16
297_T	301_V	0.684	0.16
368_D	371_F	0.684	0.16
303_F	423_T	0.684	0.16
541_T	559_A	0.683	0.16
551_K	562_Q	0.683	0.16
314_Y	346_E	0.682	0.16
233_S	324_G	0.682	0.16
193_A	228_D	0.682	0.16
151_L	291_L	0.680	0.16
146_S	158_S	0.680	0.16
262_G	372_G	0.680	0.16
259_A	371_F	0.679	0.16
133_G	371_F	0.677	0.16
504_K	536_S	0.677	0.16
524_K	542_A	0.675	0.16
271_N	296_T	0.674	0.16
203_A	231_N	0.673	0.16
174_T	205_D	0.673	0.16
219_I	232_M	0.672	0.16
554_T	571_G	0.671	0.16
204_L	234_L	0.670	0.16
142_D	262_G	0.669	0.16
545_S	563_S	0.668	0.16
553_S	562_Q	0.668	0.16
124_K	177_A	0.667	0.16
561_A	574_K	0.667	0.16
550_E	558_A	0.667	0.16
352_R	371_F	0.667	0.16
537_T	551_K	0.667	0.16
458_D	462_T	0.666	0.16
490_K	493_K	0.665	0.16
183_K	201_V	0.665	0.16
475_N	504_K	0.663	0.16
127_W	130_G	0.663	0.16
63_P	74_V	0.663	0.16
155_G	283_S	0.662	0.15
284_A	328_A	0.661	0.15
123_V	478_K	0.661	0.15
570_A	578_Q	0.660	0.15
228_D	267_G	0.659	0.15
158_S	217_Q	0.657	0.15
268_K	289_N	0.656	0.15
66_A	304_S	0.656	0.15
564_A	575_T	0.655	0.15
542_A	560_K	0.654	0.15
109_T	185_N	0.654	0.15
234_L	246_A	0.653	0.15
226_R	281_A	0.652	0.15
176_V	298_G	0.652	0.15
543_Q	553_S	0.650	0.15
560_K	568_L	0.650	0.15
234_L	269_P	0.650	0.15
556_A	571_G	0.650	0.15
516_G	537_T	0.649	0.15
551_K	555_D	0.649	0.15
482_Q	485_R	0.647	0.15
174_T	297_T	0.647	0.15
182_A	390_A	0.646	0.15
497_A	504_K	0.646	0.15
548_A	555_D	0.644	0.15
259_A	367_R	0.644	0.15
85_Y	89_N	0.644	0.15
179_I	250_A	0.643	0.15
338_L	358_N	0.642	0.15
163_T	166_Y	0.641	0.15
197_Q	308_T	0.641	0.15
439_K	444_K	0.640	0.15
549_A	554_T	0.640	0.15
536_S	554_T	0.637	0.15
558_A	566_N	0.636	0.15
306_P	310_I	0.634	0.15
38_V	357_K	0.632	0.15
461_Q	490_K	0.632	0.15
470_G	478_K	0.631	0.15
62_L	140_V	0.631	0.15
260_A	430_D	0.630	0.15
150_D	340_K	0.630	0.15
123_V	202_K	0.629	0.15
460_A	470_G	0.629	0.15
148_H	301_V	0.626	0.15
454_Q	486_Y	0.625	0.15
80_D	83_I	0.624	0.15
306_P	331_H	0.624	0.15
435_Y	441_A	0.624	0.15
143_S	176_V	0.623	0.15
544_Q	548_A	0.621	0.14
192_I	308_T	0.619	0.14
544_Q	560_K	0.619	0.14
541_T	548_A	0.618	0.14
233_S	328_A	0.618	0.14
342_R	382_A	0.618	0.14
226_R	255_V	0.618	0.14
235_G	328_A	0.617	0.14
204_L	308_T	0.616	0.14
141_I	370_Q	0.616	0.14
255_V	281_A	0.615	0.14
305_A	327_Q	0.615	0.14
192_I	334_A	0.615	0.14
126_A	192_I	0.614	0.14
170_N	331_H	0.614	0.14
236_T	274_A	0.610	0.14
65_V	389_A	0.609	0.14
572_K	575_T	0.608	0.14
229_I	255_V	0.608	0.14
533_K	574_K	0.608	0.14
159_A	201_V	0.607	0.14
232_M	257_L	0.606	0.14
283_S	409_A	0.604	0.14
259_A	301_V	0.604	0.14
188_G	238_S	0.604	0.14
545_S	548_A	0.602	0.14
156_G	371_F	0.602	0.14
250_A	331_H	0.601	0.14
544_Q	572_K	0.601	0.14
329_T	334_A	0.600	0.14
219_I	273_P	0.600	0.14
175_H	302_E	0.600	0.14
531_L	535_K	0.599	0.14
550_E	557_N	0.599	0.14
343_D	354_E	0.597	0.14
564_A	574_K	0.596	0.14
179_I	230_V	0.595	0.14
373_Y	376_I	0.595	0.14
561_A	576_A	0.595	0.14
564_A	570_A	0.594	0.14
233_S	325_T	0.592	0.14
324_G	374_G	0.592	0.14
59_Y	187_Y	0.592	0.14
86_V	151_L	0.592	0.14
567_Q	578_Q	0.590	0.14
203_A	273_P	0.589	0.14
210_G	215_L	0.587	0.14
548_A	575_T	0.587	0.14
199_Y	375_L	0.587	0.14
324_G	372_G	0.585	0.14
560_K	572_K	0.585	0.14
39_Y	360_V	0.583	0.14
180_I	196_A	0.583	0.14
201_V	352_R	0.582	0.14
183_K	287_E	0.581	0.14
546_V	571_G	0.580	0.14
547_S	556_A	0.579	0.14
509_D	513_S	0.579	0.14
173_G	326_S	0.579	0.14
215_L	232_M	0.579	0.14
556_A	577_L	0.577	0.13
566_N	578_Q	0.577	0.13
539_L	544_Q	0.577	0.13
428_R	437_N	0.575	0.13
361_D	373_Y	0.575	0.13
197_Q	359_I	0.574	0.13
174_T	267_G	0.574	0.13
527_L	539_L	0.573	0.13
427_K	431_K	0.573	0.13
549_A	561_A	0.572	0.13
170_N	244_H	0.571	0.13
280_V	342_R	0.571	0.13
502_S	505_K	0.569	0.13
541_T	544_Q	0.569	0.13
197_Q	221_W	0.569	0.13
554_T	564_A	0.568	0.13
138_I	338_L	0.568	0.13
563_S	570_A	0.568	0.13
154_A	221_W	0.567	0.13
263_N	326_S	0.567	0.13
116_W	371_F	0.566	0.13
548_A	553_S	0.565	0.13
497_A	502_S	0.565	0.13
453_T	477_Q	0.565	0.13
51_S	62_L	0.563	0.13
138_I	358_N	0.562	0.13
201_V	280_V	0.562	0.13
148_H	178_G	0.561	0.13
261_S	291_L	0.559	0.13
459_T	493_K	0.558	0.13
231_N	276_Y	0.557	0.13
114_E	179_I	0.556	0.13
254_G	399_Q	0.555	0.13
488_A	492_A	0.554	0.13
169_D	216_L	0.554	0.13
539_L	562_Q	0.553	0.13
558_A	565_V	0.553	0.13
156_G	250_A	0.552	0.13
536_S	547_S	0.551	0.13
469_N	491_Q	0.551	0.13
568_L	575_T	0.548	0.13
191_G	326_S	0.548	0.13
490_K	500_E	0.548	0.13
456_T	479_R	0.548	0.13
549_A	560_K	0.548	0.13
298_G	305_A	0.546	0.13
478_K	492_A	0.545	0.13
151_L	160_V	0.545	0.13
130_G	133_G	0.545	0.13
556_A	561_A	0.544	0.13
485_R	492_A	0.544	0.13
551_K	570_A	0.544	0.13
132_T	286_N	0.543	0.13
178_G	313_T	0.541	0.13
298_G	306_P	0.541	0.13
454_Q	472_D	0.541	0.13
466_K	471_T	0.540	0.13
550_E	563_S	0.540	0.13
271_N	327_Q	0.539	0.13
179_I	264_D	0.539	0.13
303_F	460_A	0.538	0.13
210_G	292_A	0.537	0.13
568_L	571_G	0.537	0.13
151_L	342_R	0.536	0.13
402_A	406_I	0.536	0.13
472_D	487_I	0.536	0.13
562_Q	576_A	0.535	0.13
389_A	414_S	0.534	0.13
539_L	557_N	0.533	0.13
205_D	211_D	0.533	0.13
474_K	481_D	0.531	0.13
291_L	304_S	0.531	0.13
83_I	363_G	0.531	0.13
194_P	296_T	0.530	0.12
476_L	484_K	0.530	0.12
564_A	567_Q	0.530	0.12
81_P	84_L	0.529	0.12
454_Q	463_A	0.528	0.12
160_V	382_A	0.528	0.12
140_V	334_A	0.528	0.12
513_S	532_N	0.526	0.12
356_R	367_R	0.526	0.12
83_I	358_N	0.525	0.12
151_L	306_P	0.525	0.12
552_K	574_K	0.525	0.12
542_A	572_K	0.525	0.12
564_A	578_Q	0.524	0.12
299_D	357_K	0.524	0.12
218_G	325_T	0.523	0.12
37_V	226_R	0.523	0.12
557_N	571_G	0.522	0.12
182_A	189_I	0.521	0.12
539_L	547_S	0.521	0.12
182_A	391_E	0.521	0.12
465_N	486_Y	0.521	0.12
270_V	298_G	0.519	0.12
220_D	249_K	0.518	0.12
548_A	554_T	0.518	0.12
527_L	564_A	0.518	0.12
561_A	564_A	0.518	0.12
144_G	172_H	0.518	0.12
210_G	258_V	0.517	0.12
497_A	510_S	0.517	0.12
192_I	291_L	0.516	0.12
477_Q	491_Q	0.515	0.12
183_K	284_A	0.515	0.12
182_A	199_Y	0.515	0.12
551_K	569_Q	0.515	0.12
481_D	484_K	0.514	0.12
543_Q	575_T	0.512	0.12
90_V	305_A	0.510	0.12
197_Q	225_N	0.510	0.12
264_D	296_T	0.510	0.12
554_T	561_A	0.509	0.12
568_L	577_L	0.508	0.12
466_K	470_G	0.508	0.12
552_K	564_A	0.508	0.12
542_A	577_L	0.506	0.12
231_N	250_A	0.506	0.12
303_F	335_M	0.505	0.12
261_S	273_P	0.505	0.12
142_D	263_N	0.504	0.12
201_V	296_T	0.504	0.12
60_K	139_A	0.504	0.12
156_G	200_A	0.503	0.12
570_A	573_D	0.503	0.12
292_A	311_T	0.502	0.12
146_S	322_G	0.502	0.12
555_D	566_N	0.501	0.12
510_S	533_K	0.501	0.12
250_A	296_T	0.500	0.12
45_K	48_I	0.500	0.12
230_V	273_P	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3whiA	2	0.538	100	0.431	Contact Map
3wiuA	2	0.5457	100	0.451	Contact Map
3t41A	1	0.538	100	0.466	Contact Map
3afgA	1	0.7225	100	0.469	Contact Map
4tr2A	2	0.5426	100	0.474	Contact Map
1r6vA	1	0.8837	100	0.476	Contact Map
1xf1A	2	0.6078	100	0.499	Contact Map
1gciA	1	0.4171	100	0.504	Contact Map
4mzdA	1	0.414	100	0.506	Contact Map
1r0rE	1	0.4186	100	0.512	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0146 seconds.