TAGF - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

TAGF - CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase

UniProt:	P13485	Sequences: MSLVVDTNKRKQKGKSFYTEEQKKVMIENTVIKCILKSLKNNLGSLELLISIDSEHQFLEDYQLFLKLKERRSGTESEFPLQNTGSLEYKTEINAHVLPMPVEMGQTYDFYVEFRKKYEDAEQEPLLKRLSAEVNSIERAFHVDQTTELLILPYTTDKGNFSIKVKREAKIIRFDQIEISSEEISITGYAGYLSSENQYRIKNLNLILKKGGETPIEEKFPIKLERKTHGLENMRADGFVPELYDFEVKVPLKEIPFSNEKRYVYRLFMEYICNDDEGTDIQFNSTALVLGDRKNKLKGLVSIIKTNNAPVRYEVFKKKKKQTLGIRVNDYSLKTRMKYFIKGKKKRLVSKIKKITKMRNKLITKTYKSLFMMASRMPVKRKTVIFESFNGKQYSCNPRAIYEYMRENHPEYKMYWSVNKQYSAPFDEKGIPYINRLSLKWLFAMARAEYWVVNSRLPLWIPKPSHTTYLQTWHGTPLKRLAMDMEEVHMPGTNTKKYKRNFIKEASNWDYLISPNGYSTEIFTRAFQFNKTMIESGYPRNDFLHNDNNEETISLIKSRLNIPRDKKVILYAPTWRDDQFYAKGRYKFDLDLDLHQLRQELGNEYIVILRMHYLVAENFDLGPFEGFAYDFSAYEDIRELYMVSDLLITDYSSVFFDFANLKRPMLFFVPDIETYRDKLRGFYFDFEKEAPGPLVKTTEETIEAIKQISSPDYKLPVSFGPFYDKFCYLESGRSSEKVVNTVFKAE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	746 (696)
Sequences:	516 (450)
Seq/√Len:	17.1

BACSU - TAGF GGAB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
731_S	737_K	6.937	1.00
12_Q	49_L	5.883	1.00
84_T	87_L	5.635	1.00
477_P	538_Y	4.797	1.00
697_T	700_E	4.543	1.00
69_K	72_R	4.283	1.00
81_L	90_K	4.220	1.00
520_T	535_E	4.112	1.00
514_S	520_T	3.793	1.00
733_R	736_E	3.603	1.00
474_H	574_T	3.497	1.00
30_T	105_G	3.473	1.00
474_H	653_S	3.392	0.99
516_N	519_S	3.374	0.99
24_K	56_H	3.372	0.99
386_F	414_M	3.345	0.99
82_Q	172_I	3.277	0.99
736_E	740_N	3.197	0.99
43_L	47_E	3.184	0.99
37_K	87_L	3.104	0.99
383_T	415_Y	3.019	0.99
539_P	738_V	3.000	0.99
608_I	631_F	2.884	0.98
669_V	694_L	2.861	0.98
685_D	688_K	2.857	0.98
434_I	444_A	2.813	0.98
515_P	538_Y	2.773	0.98
474_H	612_H	2.747	0.98
26_M	30_T	2.730	0.97
567_K	605_Y	2.724	0.97
163_I	167_R	2.713	0.97
570_L	640_L	2.682	0.97
382_K	449_E	2.676	0.97
463_K	510_D	2.603	0.97
8_N	26_M	2.496	0.96
600_E	706_K	2.494	0.96
574_T	612_H	2.441	0.95
7_T	87_L	2.426	0.95
7_T	37_K	2.373	0.94
13_K	43_L	2.339	0.94
42_N	45_S	2.327	0.93
205_N	212_G	2.278	0.93
129_R	132_A	2.219	0.92
404_Y	407_E	2.218	0.92
20_E	55_E	2.214	0.92
41_N	76_E	2.196	0.91
50_I	68_L	2.185	0.91
734_S	737_K	2.131	0.90
479_K	574_T	2.128	0.90
542_D	692_G	2.116	0.90
383_T	448_A	2.099	0.89
475_G	657_D	2.098	0.89
42_N	68_L	2.097	0.89
698_T	701_T	2.088	0.89
398_P	401_I	2.084	0.89
449_E	468_T	2.083	0.89
37_K	84_T	2.078	0.89
261_K	264_V	2.065	0.88
658_F	661_L	2.050	0.88
399_R	690_A	2.047	0.88
592_L	701_T	2.046	0.88
479_K	681_G	2.035	0.88
159_G	174_F	2.019	0.87
9_K	39_L	2.006	0.87
10_R	22_Q	2.001	0.87
596_Q	699_E	1.983	0.86
105_G	109_D	1.982	0.86
473_W	636_D	1.962	0.86
396_C	540_R	1.936	0.85
606_I	629_Y	1.916	0.84
592_L	597_L	1.915	0.84
684_F	690_A	1.911	0.84
514_S	535_E	1.889	0.83
398_P	472_T	1.881	0.83
72_R	75_T	1.870	0.83
386_F	405_M	1.869	0.83
91_T	104_M	1.866	0.83
675_Y	681_G	1.861	0.82
405_M	414_M	1.846	0.82
512_L	538_Y	1.846	0.82
512_L	523_F	1.844	0.82
401_I	739_V	1.840	0.82
660_N	727_C	1.814	0.81
384_V	412_Y	1.797	0.80
127_L	132_A	1.794	0.80
54_S	68_L	1.786	0.80
44_G	69_K	1.780	0.79
399_R	403_E	1.780	0.79
541_N	657_D	1.778	0.79
475_G	575_W	1.777	0.79
699_E	702_I	1.777	0.79
37_K	65_F	1.774	0.79
665_M	668_F	1.770	0.79
404_Y	408_N	1.757	0.79
78_E	96_H	1.756	0.79
453_V	469_Y	1.752	0.78
49_L	71_R	1.745	0.78
396_C	513_I	1.738	0.78
536_S	738_V	1.729	0.77
416_W	610_R	1.729	0.77
473_W	519_S	1.724	0.77
53_D	66_L	1.722	0.77
77_S	94_N	1.712	0.77
477_P	519_S	1.707	0.76
416_W	484_D	1.688	0.76
574_T	652_S	1.676	0.75
397_N	474_H	1.646	0.74
470_L	738_V	1.644	0.74
476_T	516_N	1.643	0.74
415_Y	434_I	1.639	0.73
77_S	96_H	1.639	0.73
479_K	683_Y	1.636	0.73
99_P	104_M	1.631	0.73
264_V	267_L	1.627	0.73
474_H	652_S	1.617	0.72
538_Y	730_E	1.611	0.72
14_G	45_S	1.610	0.72
695_V	698_T	1.605	0.72
42_N	47_E	1.601	0.72
686_F	690_A	1.597	0.71
476_T	519_S	1.589	0.71
390_N	456_R	1.587	0.71
695_V	701_T	1.586	0.71
398_P	416_W	1.572	0.70
646_L	705_I	1.570	0.70
644_S	658_F	1.561	0.70
7_T	11_K	1.560	0.70
388_S	395_S	1.555	0.69
416_W	472_T	1.550	0.69
31_V	35_I	1.546	0.69
18_Y	64_L	1.540	0.69
124_E	129_R	1.527	0.68
84_T	90_K	1.527	0.68
394_Y	572_A	1.525	0.68
26_M	93_I	1.521	0.68
475_G	652_S	1.516	0.67
246_F	251_P	1.515	0.67
475_G	612_H	1.506	0.67
31_V	36_L	1.500	0.66
389_F	512_L	1.498	0.66
271_Y	274_N	1.495	0.66
398_P	454_N	1.495	0.66
567_K	604_E	1.486	0.66
243_L	247_E	1.477	0.65
612_H	653_S	1.477	0.65
126_L	132_A	1.476	0.65
394_Y	399_R	1.463	0.64
475_G	574_T	1.461	0.64
484_D	525_R	1.455	0.64
386_F	398_P	1.443	0.63
456_R	505_E	1.438	0.63
50_I	66_L	1.433	0.63
538_Y	613_Y	1.432	0.63
454_N	509_W	1.428	0.63
127_L	130_L	1.428	0.63
448_A	546_N	1.427	0.62
389_F	454_N	1.420	0.62
52_I	56_H	1.418	0.62
410_P	430_G	1.416	0.62
110_F	198_Q	1.415	0.62
240_V	244_Y	1.411	0.62
380_K	701_T	1.408	0.61
574_T	653_S	1.405	0.61
12_Q	71_R	1.404	0.61
698_T	702_I	1.400	0.61
479_K	675_Y	1.400	0.61
538_Y	571_Y	1.394	0.61
457_L	469_Y	1.391	0.60
11_K	73_S	1.385	0.60
474_H	538_Y	1.384	0.60
15_K	210_K	1.378	0.60
389_F	636_D	1.376	0.60
438_S	475_G	1.376	0.60
691_P	722_F	1.375	0.59
385_I	448_A	1.374	0.59
400_A	638_R	1.373	0.59
476_T	538_Y	1.360	0.59
612_H	652_S	1.352	0.58
387_E	436_R	1.339	0.57
125_P	128_K	1.339	0.57
12_Q	95_A	1.337	0.57
397_N	616_A	1.330	0.57
522_I	683_Y	1.326	0.57
11_K	76_E	1.325	0.57
671_D	675_Y	1.320	0.56
240_V	246_F	1.316	0.56
242_E	250_V	1.315	0.56
244_Y	247_E	1.314	0.56
477_P	515_P	1.313	0.56
125_P	129_R	1.311	0.56
78_E	94_N	1.304	0.55
477_P	509_W	1.303	0.55
21_E	26_M	1.295	0.55
416_W	519_S	1.294	0.55
390_N	613_Y	1.290	0.55
315_V	318_K	1.288	0.54
696_K	700_E	1.288	0.54
675_Y	683_Y	1.286	0.54
388_S	399_R	1.281	0.54
484_D	610_R	1.270	0.53
219_K	222_I	1.270	0.53
67_K	83_N	1.268	0.53
648_I	653_S	1.267	0.53
645_D	734_S	1.267	0.53
23_K	35_I	1.265	0.53
538_Y	541_N	1.265	0.53
48_L	55_E	1.264	0.53
102_V	106_Q	1.258	0.53
440_K	443_F	1.255	0.52
592_L	661_L	1.252	0.52
478_L	484_D	1.250	0.52
11_K	22_Q	1.250	0.52
45_S	71_R	1.243	0.52
225_E	228_T	1.240	0.52
456_R	509_W	1.239	0.51
36_L	70_E	1.235	0.51
453_V	613_Y	1.231	0.51
248_V	252_L	1.231	0.51
456_R	485_M	1.231	0.51
381_R	449_E	1.230	0.51
387_E	391_G	1.228	0.51
397_N	540_R	1.226	0.51
13_K	71_R	1.226	0.51
50_I	54_S	1.224	0.51
516_N	522_I	1.222	0.50
695_V	704_A	1.221	0.50
394_Y	422_Y	1.220	0.50
594_L	727_C	1.220	0.50
394_Y	403_E	1.216	0.50
610_R	613_Y	1.215	0.50
398_P	402_Y	1.211	0.50
471_Q	482_A	1.209	0.50
463_K	478_L	1.203	0.49
473_W	682_F	1.200	0.49
641_Y	654_V	1.194	0.49
386_F	416_W	1.191	0.49
383_T	444_A	1.190	0.49
26_M	36_L	1.189	0.48
14_G	46_L	1.187	0.48
222_I	225_E	1.185	0.48
69_K	75_T	1.182	0.48
477_P	523_F	1.181	0.48
398_P	484_D	1.181	0.48
379_V	466_H	1.176	0.48
484_D	509_W	1.172	0.47
396_C	670_P	1.167	0.47
542_D	732_G	1.165	0.47
9_K	112_V	1.159	0.47
13_K	47_E	1.152	0.46
278_G	281_I	1.150	0.46
540_R	544_L	1.143	0.46
395_S	538_Y	1.143	0.46
463_K	541_N	1.138	0.45
481_L	615_V	1.135	0.45
163_I	166_K	1.134	0.45
479_K	653_S	1.133	0.45
47_E	96_H	1.131	0.45
607_V	625_E	1.130	0.45
394_Y	538_Y	1.127	0.45
46_L	56_H	1.126	0.45
475_G	481_L	1.122	0.44
454_N	472_T	1.118	0.44
399_R	686_F	1.118	0.44
148_E	151_I	1.114	0.44
471_Q	538_Y	1.113	0.44
571_Y	601_L	1.112	0.44
416_W	454_N	1.111	0.44
399_R	425_P	1.108	0.44
469_Y	614_L	1.105	0.43
15_K	95_A	1.103	0.43
119_E	123_Q	1.101	0.43
477_P	571_Y	1.101	0.43
514_S	633_A	1.100	0.43
659_A	665_M	1.100	0.43
666_L	703_E	1.100	0.43
87_L	163_I	1.099	0.43
519_S	538_Y	1.099	0.43
141_F	144_D	1.096	0.43
45_S	49_L	1.095	0.43
183_E	187_T	1.094	0.43
541_N	722_F	1.094	0.43
591_D	670_P	1.090	0.43
43_L	96_H	1.089	0.43
121_A	124_E	1.088	0.42
451_W	610_R	1.087	0.42
387_E	469_Y	1.087	0.42
388_S	391_G	1.085	0.42
227_K	230_G	1.085	0.42
731_S	734_S	1.084	0.42
456_R	481_L	1.084	0.42
621_L	628_A	1.083	0.42
509_W	641_Y	1.081	0.42
472_T	538_Y	1.080	0.42
386_F	451_W	1.079	0.42
602_G	606_I	1.079	0.42
523_F	723_Y	1.078	0.42
453_V	456_R	1.076	0.42
394_Y	473_W	1.076	0.42
27_I	56_H	1.071	0.41
12_Q	53_D	1.070	0.41
478_L	681_G	1.067	0.41
193_L	705_I	1.067	0.41
396_C	454_N	1.065	0.41
10_R	19_T	1.064	0.41
16_S	62_Y	1.063	0.41
454_N	538_Y	1.061	0.41
415_Y	444_A	1.060	0.41
389_F	456_R	1.057	0.41
125_P	130_L	1.054	0.41
239_F	242_E	1.051	0.40
478_L	683_Y	1.051	0.40
577_D	727_C	1.047	0.40
88_E	112_V	1.046	0.40
386_F	401_I	1.044	0.40
472_T	541_N	1.043	0.40
641_Y	661_L	1.039	0.40
599_Q	628_A	1.039	0.40
389_F	473_W	1.038	0.40
394_Y	519_S	1.038	0.40
463_K	477_P	1.032	0.39
31_V	108_Y	1.032	0.39
597_L	667_F	1.030	0.39
25_V	29_N	1.029	0.39
474_H	575_W	1.028	0.39
20_E	24_K	1.027	0.39
19_T	49_L	1.025	0.39
473_W	670_P	1.024	0.39
598_R	627_F	1.024	0.39
399_R	636_D	1.020	0.39
544_L	641_Y	1.018	0.38
385_I	658_F	1.017	0.38
15_K	18_Y	1.017	0.38
472_T	727_C	1.016	0.38
475_G	653_S	1.011	0.38
43_L	77_S	1.009	0.38
457_L	482_A	1.006	0.38
288_L	291_G	1.004	0.38
676_R	679_L	1.003	0.38
401_I	405_M	0.997	0.37
413_K	440_K	0.995	0.37
80_P	97_V	0.994	0.37
544_L	661_L	0.991	0.37
440_K	444_A	0.991	0.37
478_L	519_S	0.989	0.37
119_E	124_E	0.988	0.37
453_V	457_L	0.987	0.37
460_W	463_K	0.987	0.37
471_Q	526_A	0.985	0.37
519_S	523_F	0.981	0.36
266_R	272_I	0.981	0.36
448_A	719_F	0.980	0.36
662_K	719_F	0.977	0.36
474_H	540_R	0.977	0.36
48_L	51_S	0.976	0.36
396_C	575_W	0.974	0.36
47_E	71_R	0.973	0.36
221_P	224_L	0.973	0.36
29_N	78_E	0.973	0.36
397_N	513_I	0.973	0.36
472_T	476_T	0.973	0.36
10_R	26_M	0.972	0.36
454_N	691_P	0.968	0.36
212_G	668_F	0.968	0.36
44_G	76_E	0.968	0.36
578_D	679_L	0.967	0.36
515_P	655_F	0.966	0.36
675_Y	722_F	0.965	0.35
451_W	614_L	0.965	0.35
69_K	79_F	0.965	0.35
19_T	25_V	0.964	0.35
120_D	124_E	0.964	0.35
656_F	661_L	0.963	0.35
390_N	455_S	0.961	0.35
309_A	320_K	0.959	0.35
61_D	64_L	0.958	0.35
13_K	45_S	0.954	0.35
396_C	638_R	0.954	0.35
120_D	123_Q	0.950	0.35
485_M	523_F	0.949	0.35
395_S	454_N	0.948	0.35
476_T	727_C	0.948	0.35
667_F	690_A	0.948	0.35
24_K	28_E	0.946	0.34
387_E	398_P	0.943	0.34
60_E	63_Q	0.941	0.34
27_I	61_D	0.940	0.34
413_K	432_P	0.938	0.34
80_P	96_H	0.935	0.34
174_F	177_I	0.933	0.34
659_A	722_F	0.933	0.34
511_Y	742_V	0.932	0.34
94_N	97_V	0.932	0.34
605_Y	713_Y	0.932	0.34
161_F	174_F	0.931	0.34
659_A	684_F	0.927	0.33
647_L	658_F	0.926	0.33
267_L	270_E	0.926	0.33
572_A	680_R	0.926	0.33
607_V	613_Y	0.923	0.33
509_W	512_L	0.920	0.33
58_F	82_Q	0.919	0.33
477_P	512_L	0.918	0.33
454_N	519_S	0.917	0.33
426_F	429_K	0.917	0.33
651_Y	671_D	0.916	0.33
152_L	155_T	0.916	0.33
19_T	40_K	0.915	0.33
477_P	514_S	0.914	0.33
389_F	396_C	0.912	0.33
475_G	506_A	0.910	0.33
402_Y	429_K	0.909	0.32
111_Y	160_N	0.907	0.32
479_K	516_N	0.907	0.32
665_M	695_V	0.905	0.32
453_V	686_F	0.904	0.32
14_G	47_E	0.902	0.32
479_K	571_Y	0.901	0.32
200_R	208_L	0.899	0.32
388_S	637_I	0.897	0.32
67_K	79_F	0.897	0.32
396_C	544_L	0.896	0.32
41_N	72_R	0.896	0.32
571_Y	691_P	0.896	0.32
455_S	638_R	0.896	0.32
132_A	135_N	0.895	0.32
88_E	107_T	0.894	0.32
377_M	380_K	0.891	0.32
156_T	161_F	0.889	0.31
518_Y	522_I	0.887	0.31
416_W	675_Y	0.886	0.31
122_E	125_P	0.886	0.31
17_F	38_S	0.885	0.31
42_N	50_I	0.883	0.31
126_L	130_L	0.883	0.31
405_M	522_I	0.881	0.31
473_W	512_L	0.880	0.31
145_Q	148_E	0.878	0.31
55_E	60_E	0.878	0.31
25_V	45_S	0.878	0.31
403_E	667_F	0.878	0.31
389_F	477_P	0.876	0.31
388_S	398_P	0.876	0.31
13_K	42_N	0.875	0.31
519_S	727_C	0.873	0.31
388_S	394_Y	0.871	0.31
567_K	645_D	0.871	0.31
572_A	610_R	0.871	0.31
472_T	610_R	0.869	0.30
205_N	208_L	0.868	0.30
477_P	484_D	0.868	0.30
185_S	189_Y	0.868	0.30
17_F	39_L	0.866	0.30
43_L	94_N	0.864	0.30
477_P	516_N	0.863	0.30
463_K	722_F	0.860	0.30
597_L	647_L	0.860	0.30
662_K	723_Y	0.859	0.30
109_D	348_L	0.859	0.30
580_F	586_Y	0.858	0.30
160_N	700_E	0.857	0.30
434_I	648_I	0.857	0.30
64_L	70_E	0.855	0.30
438_S	657_D	0.855	0.30
540_R	652_S	0.850	0.29
571_Y	610_R	0.849	0.29
517_G	728_Y	0.848	0.29
269_M	272_I	0.846	0.29
59_L	64_L	0.844	0.29
474_H	576_R	0.843	0.29
399_R	402_Y	0.841	0.29
77_S	80_P	0.840	0.29
572_A	676_R	0.839	0.29
484_D	655_F	0.838	0.29
388_S	454_N	0.837	0.29
282_Q	285_S	0.835	0.29
107_T	160_N	0.835	0.29
35_I	66_L	0.833	0.29
39_L	44_G	0.832	0.29
389_F	392_K	0.832	0.29
426_F	665_M	0.830	0.28
389_F	682_F	0.829	0.28
43_L	97_V	0.828	0.28
214_T	217_E	0.827	0.28
576_R	652_S	0.826	0.28
415_Y	436_R	0.825	0.28
9_K	84_T	0.824	0.28
691_P	727_C	0.823	0.28
455_S	482_A	0.823	0.28
327_R	331_Y	0.822	0.28
666_L	697_T	0.822	0.28
613_Y	637_I	0.820	0.28
389_F	393_Q	0.820	0.28
538_Y	743_F	0.819	0.28
455_S	512_L	0.818	0.28
485_M	507_S	0.817	0.28
416_W	538_Y	0.815	0.28
580_F	670_P	0.814	0.28
388_S	472_T	0.814	0.28
66_L	69_K	0.814	0.28
125_P	132_A	0.814	0.28
479_K	655_F	0.812	0.28
517_G	532_T	0.810	0.28
279_T	328_V	0.810	0.28
268_F	271_Y	0.803	0.27
47_E	78_E	0.803	0.27
20_E	56_H	0.802	0.27
448_A	705_I	0.802	0.27
667_F	726_F	0.799	0.27
665_M	686_F	0.798	0.27
127_L	131_S	0.797	0.27
471_Q	682_F	0.797	0.27
182_E	185_S	0.796	0.27
141_F	145_Q	0.795	0.27
570_L	642_M	0.794	0.27
451_W	469_Y	0.791	0.27
478_L	675_Y	0.790	0.27
473_W	538_Y	0.790	0.27
80_P	94_N	0.790	0.27
153_P	158_K	0.790	0.27
26_M	59_L	0.789	0.27
402_Y	433_Y	0.788	0.26
388_S	527_F	0.787	0.26
207_I	211_G	0.787	0.26
459_L	505_E	0.786	0.26
450_Y	468_T	0.786	0.26
178_E	182_E	0.785	0.26
455_S	614_L	0.785	0.26
667_F	722_F	0.784	0.26
265_Y	271_Y	0.784	0.26
602_G	727_C	0.783	0.26
473_W	541_N	0.782	0.26
523_F	655_F	0.780	0.26
455_S	538_Y	0.780	0.26
224_L	227_K	0.779	0.26
675_Y	685_D	0.779	0.26
577_D	610_R	0.779	0.26
679_L	682_F	0.779	0.26
516_N	538_Y	0.778	0.26
366_T	731_S	0.777	0.26
416_W	634_Y	0.775	0.26
76_E	156_T	0.775	0.26
84_T	101_P	0.772	0.26
571_Y	722_F	0.772	0.26
222_I	227_K	0.771	0.26
240_V	243_L	0.771	0.26
28_E	55_E	0.769	0.26
469_Y	613_Y	0.769	0.26
55_E	109_D	0.768	0.26
203_N	208_L	0.768	0.26
594_L	698_T	0.768	0.26
588_F	609_L	0.767	0.26
7_T	39_L	0.766	0.25
23_K	31_V	0.765	0.25
397_N	670_P	0.764	0.25
396_C	580_F	0.763	0.25
479_K	484_D	0.763	0.25
41_N	52_I	0.762	0.25
43_L	71_R	0.762	0.25
512_L	539_P	0.762	0.25
11_K	15_K	0.758	0.25
394_Y	484_D	0.757	0.25
516_N	727_C	0.757	0.25
388_S	541_N	0.756	0.25
546_N	638_R	0.755	0.25
25_V	97_V	0.755	0.25
387_E	454_N	0.754	0.25
116_K	644_S	0.754	0.25
420_K	467_T	0.753	0.25
107_T	111_Y	0.751	0.25
145_Q	149_L	0.749	0.25
471_Q	514_S	0.747	0.25
481_L	613_Y	0.747	0.25
24_K	46_L	0.747	0.25
476_T	670_P	0.747	0.25
43_L	92_E	0.747	0.25
417_S	441_W	0.745	0.25
545_H	660_N	0.745	0.25
454_N	523_F	0.745	0.25
262_R	265_Y	0.745	0.25
703_E	712_D	0.744	0.24
264_V	271_Y	0.743	0.24
473_W	591_D	0.743	0.24
481_L	656_F	0.741	0.24
268_F	700_E	0.741	0.24
13_K	49_L	0.740	0.24
20_E	52_I	0.740	0.24
712_D	717_V	0.739	0.24
537_G	612_H	0.738	0.24
297_L	313_Y	0.738	0.24
631_F	734_S	0.738	0.24
395_S	682_F	0.738	0.24
477_P	681_G	0.737	0.24
578_D	693_P	0.737	0.24
17_F	88_E	0.735	0.24
233_N	236_A	0.735	0.24
399_R	416_W	0.735	0.24
42_N	49_L	0.733	0.24
485_M	538_Y	0.733	0.24
454_N	655_F	0.732	0.24
636_D	729_L	0.732	0.24
308_N	311_V	0.732	0.24
514_S	517_G	0.731	0.24
540_R	612_H	0.731	0.24
127_L	138_E	0.730	0.24
463_K	509_W	0.730	0.24
575_W	612_H	0.730	0.24
25_V	43_L	0.728	0.24
485_M	514_S	0.728	0.24
220_F	224_L	0.726	0.24
152_L	158_K	0.725	0.24
85_G	113_E	0.725	0.24
541_N	732_G	0.725	0.24
610_R	691_P	0.724	0.24
224_L	230_G	0.723	0.24
542_D	731_S	0.722	0.24
153_P	159_G	0.721	0.23
418_V	426_F	0.721	0.23
390_N	505_E	0.720	0.23
132_A	452_V	0.719	0.23
481_L	538_Y	0.719	0.23
456_R	638_R	0.719	0.23
610_R	645_D	0.719	0.23
124_E	128_K	0.718	0.23
481_L	661_L	0.712	0.23
477_P	485_M	0.712	0.23
389_F	484_D	0.711	0.23
126_L	137_I	0.711	0.23
451_W	456_R	0.710	0.23
398_P	519_S	0.707	0.23
266_R	269_M	0.707	0.23
514_S	640_L	0.707	0.23
527_F	541_N	0.707	0.23
9_K	286_T	0.705	0.23
517_G	535_E	0.705	0.23
226_R	230_G	0.704	0.23
78_E	173_R	0.703	0.23
448_A	646_L	0.703	0.23
29_N	97_V	0.703	0.23
172_I	175_D	0.703	0.23
22_Q	89_Y	0.700	0.23
464_P	479_K	0.700	0.23
184_I	188_G	0.700	0.23
87_L	90_K	0.699	0.23
455_S	477_P	0.699	0.23
399_R	473_W	0.696	0.22
43_L	80_P	0.696	0.22
454_N	541_N	0.693	0.22
239_F	251_P	0.693	0.22
405_M	569_I	0.693	0.22
394_Y	454_N	0.692	0.22
473_W	523_F	0.692	0.22
399_R	426_F	0.692	0.22
176_Q	181_S	0.690	0.22
510_D	675_Y	0.690	0.22
25_V	47_E	0.689	0.22
261_K	738_V	0.687	0.22
21_E	53_D	0.687	0.22
100_M	111_Y	0.687	0.22
64_L	79_F	0.687	0.22
514_S	533_M	0.686	0.22
37_K	85_G	0.685	0.22
471_Q	670_P	0.684	0.22
471_Q	509_W	0.684	0.22
544_L	654_V	0.684	0.22
396_C	453_V	0.684	0.22
398_P	509_W	0.683	0.22
519_S	660_N	0.683	0.22
645_D	722_F	0.679	0.22
207_I	437_L	0.678	0.22
371_F	447_R	0.678	0.22
456_R	655_F	0.676	0.22
667_F	692_G	0.676	0.22
523_F	577_D	0.675	0.22
185_S	188_G	0.674	0.22
481_L	682_F	0.673	0.21
669_V	690_A	0.673	0.21
469_Y	485_M	0.673	0.21
43_L	49_L	0.672	0.21
479_K	691_P	0.671	0.21
474_H	479_K	0.670	0.21
388_S	519_S	0.670	0.21
18_Y	41_N	0.670	0.21
47_E	76_E	0.668	0.21
35_I	41_N	0.668	0.21
225_E	230_G	0.666	0.21
172_I	177_I	0.666	0.21
384_V	645_D	0.666	0.21
734_S	739_V	0.665	0.21
653_S	683_Y	0.665	0.21
391_G	398_P	0.665	0.21
479_K	482_A	0.664	0.21
707_Q	717_V	0.664	0.21
394_Y	416_W	0.663	0.21
220_F	223_K	0.663	0.21
472_T	675_Y	0.663	0.21
37_K	63_Q	0.663	0.21
160_N	166_K	0.662	0.21
136_S	140_A	0.661	0.21
471_Q	479_K	0.661	0.21
601_L	607_V	0.661	0.21
475_G	509_W	0.656	0.21
160_N	165_V	0.656	0.21
610_R	675_Y	0.656	0.21
568_V	608_I	0.656	0.21
387_E	416_W	0.655	0.21
279_T	285_S	0.655	0.21
469_Y	473_W	0.653	0.21
25_V	78_E	0.652	0.21
73_S	185_S	0.652	0.21
360_N	546_N	0.651	0.21
469_Y	508_N	0.650	0.21
456_R	613_Y	0.650	0.21
104_M	108_Y	0.649	0.21
406_R	717_V	0.649	0.21
239_F	246_F	0.649	0.21
128_K	134_V	0.648	0.20
670_P	675_Y	0.648	0.20
454_N	475_G	0.648	0.20
21_E	83_N	0.647	0.20
98_L	569_I	0.647	0.20
88_E	308_N	0.647	0.20
266_R	273_C	0.647	0.20
667_F	691_P	0.647	0.20
405_M	410_P	0.646	0.20
219_K	223_K	0.645	0.20
25_V	96_H	0.645	0.20
656_F	683_Y	0.645	0.20
632_S	647_L	0.645	0.20
472_T	730_E	0.641	0.20
484_D	535_E	0.641	0.20
472_T	519_S	0.641	0.20
43_L	95_A	0.641	0.20
516_N	523_F	0.640	0.20
538_Y	670_P	0.640	0.20
15_K	21_E	0.640	0.20
448_A	621_L	0.639	0.20
396_C	613_Y	0.639	0.20
252_L	255_I	0.638	0.20
371_F	378_P	0.637	0.20
540_R	661_L	0.637	0.20
135_N	138_E	0.636	0.20
323_T	329_N	0.636	0.20
13_K	29_N	0.635	0.20
402_Y	541_N	0.635	0.20
209_K	221_P	0.634	0.20
71_R	76_E	0.634	0.20
630_D	722_F	0.634	0.20
390_N	453_V	0.632	0.20
162_S	166_K	0.632	0.20
704_A	707_Q	0.632	0.20
456_R	523_F	0.631	0.20
158_K	162_S	0.631	0.20
264_V	268_F	0.631	0.20
672_I	682_F	0.630	0.20
7_T	84_T	0.630	0.20
254_E	274_N	0.629	0.20
481_L	586_Y	0.628	0.20
13_K	72_R	0.627	0.20
403_E	527_F	0.627	0.20
484_D	681_G	0.627	0.20
582_A	593_D	0.627	0.20
11_K	23_K	0.627	0.20
24_K	27_I	0.626	0.20
484_D	683_Y	0.626	0.20
289_V	293_R	0.625	0.20
128_K	133_E	0.624	0.20
400_A	684_F	0.624	0.20
653_S	661_L	0.624	0.20
166_K	173_R	0.623	0.20
547_D	599_Q	0.622	0.19
123_Q	126_L	0.621	0.19
573_P	576_R	0.621	0.19
473_W	568_V	0.620	0.19
89_Y	726_F	0.619	0.19
571_Y	670_P	0.619	0.19
476_T	681_G	0.619	0.19
516_N	579_Q	0.618	0.19
516_N	520_T	0.618	0.19
112_V	673_E	0.617	0.19
89_Y	103_E	0.616	0.19
478_L	509_W	0.615	0.19
390_N	459_L	0.615	0.19
170_K	173_R	0.614	0.19
267_L	273_C	0.614	0.19
711_P	715_L	0.614	0.19
666_L	695_V	0.613	0.19
388_S	539_P	0.613	0.19
43_L	181_S	0.613	0.19
161_F	689_E	0.612	0.19
394_Y	670_P	0.612	0.19
120_D	125_P	0.612	0.19
389_F	482_A	0.611	0.19
384_V	388_S	0.611	0.19
22_Q	40_K	0.611	0.19
396_C	519_S	0.611	0.19
454_N	613_Y	0.611	0.19
416_W	477_P	0.610	0.19
445_M	621_L	0.610	0.19
397_N	538_Y	0.610	0.19
35_I	40_K	0.610	0.19
692_G	731_S	0.610	0.19
156_T	162_S	0.609	0.19
540_R	574_T	0.609	0.19
569_I	646_L	0.609	0.19
377_M	439_L	0.608	0.19
476_T	594_L	0.608	0.19
477_P	481_L	0.607	0.19
481_L	655_F	0.607	0.19
441_W	475_G	0.606	0.19
51_S	62_Y	0.606	0.19
658_F	663_R	0.606	0.19
39_L	76_E	0.604	0.19
31_V	40_K	0.604	0.19
296_K	440_K	0.604	0.19
445_M	448_A	0.603	0.19
23_K	56_H	0.602	0.19
368_K	625_E	0.601	0.19
22_Q	93_I	0.601	0.19
312_R	318_K	0.601	0.19
730_E	734_S	0.600	0.19
23_K	79_F	0.600	0.19
388_S	473_W	0.600	0.19
143_V	150_L	0.599	0.19
588_F	670_P	0.599	0.19
416_W	441_W	0.598	0.19
445_M	577_D	0.598	0.19
395_S	473_W	0.597	0.19
654_V	683_Y	0.597	0.19
36_L	56_H	0.597	0.19
15_K	73_S	0.596	0.19
590_L	698_T	0.596	0.19
156_T	166_K	0.596	0.19
135_N	139_R	0.596	0.19
596_Q	666_L	0.596	0.19
176_Q	180_S	0.595	0.18
10_R	93_I	0.594	0.18
129_R	136_S	0.593	0.18
24_K	67_K	0.593	0.18
169_A	700_E	0.593	0.18
566_K	606_I	0.592	0.18
200_R	382_K	0.591	0.18
270_E	274_N	0.590	0.18
129_R	135_N	0.590	0.18
176_Q	179_I	0.590	0.18
258_S	264_V	0.590	0.18
519_S	541_N	0.589	0.18
539_P	610_R	0.589	0.18
14_G	44_G	0.589	0.18
472_T	509_W	0.589	0.18
24_K	54_S	0.589	0.18
680_R	734_S	0.588	0.18
27_I	60_E	0.587	0.18
395_S	477_P	0.587	0.18
476_T	606_I	0.586	0.18
680_R	722_F	0.586	0.18
10_R	38_S	0.586	0.18
12_Q	74_G	0.586	0.18
259_N	273_C	0.585	0.18
200_R	203_N	0.585	0.18
120_D	132_A	0.584	0.18
40_K	93_I	0.584	0.18
514_S	727_C	0.584	0.18
184_I	190_A	0.583	0.18
404_Y	544_L	0.583	0.18
7_T	103_E	0.582	0.18
416_W	727_C	0.582	0.18
455_S	615_V	0.582	0.18
384_V	519_S	0.581	0.18
162_S	181_S	0.581	0.18
123_Q	128_K	0.581	0.18
129_R	137_I	0.581	0.18
693_P	711_P	0.581	0.18
289_V	296_K	0.581	0.18
476_T	523_F	0.579	0.18
416_W	658_F	0.578	0.18
309_A	326_I	0.578	0.18
402_Y	572_A	0.578	0.18
21_E	98_L	0.577	0.18
469_Y	538_Y	0.577	0.18
522_I	670_P	0.577	0.18
30_T	85_G	0.577	0.18
96_H	207_I	0.575	0.18
722_F	734_S	0.575	0.18
453_V	505_E	0.574	0.18
294_K	326_I	0.573	0.18
165_V	466_H	0.572	0.18
608_I	691_P	0.571	0.18
541_N	571_Y	0.571	0.18
153_P	156_T	0.571	0.18
26_M	66_L	0.571	0.18
43_L	76_E	0.569	0.18
397_N	667_F	0.567	0.18
126_L	129_R	0.566	0.17
509_W	535_E	0.566	0.17
541_N	614_L	0.566	0.17
386_F	402_Y	0.565	0.17
441_W	729_L	0.565	0.17
471_Q	484_D	0.565	0.17
471_Q	541_N	0.565	0.17
387_E	417_S	0.563	0.17
318_K	329_N	0.563	0.17
93_I	103_E	0.563	0.17
122_E	132_A	0.562	0.17
597_L	690_A	0.562	0.17
26_M	244_Y	0.562	0.17
29_N	76_E	0.562	0.17
388_S	538_Y	0.562	0.17
12_Q	70_E	0.561	0.17
506_A	666_L	0.561	0.17
8_N	104_M	0.561	0.17
29_N	94_N	0.561	0.17
397_N	653_S	0.559	0.17
27_I	63_Q	0.559	0.17
577_D	606_I	0.559	0.17
701_T	704_A	0.559	0.17
48_L	60_E	0.558	0.17
509_W	656_F	0.558	0.17
23_K	54_S	0.557	0.17
627_F	693_P	0.557	0.17
541_N	637_I	0.556	0.17
537_G	574_T	0.556	0.17
527_F	640_L	0.555	0.17
28_E	68_L	0.554	0.17
22_Q	601_L	0.554	0.17
384_V	473_W	0.553	0.17
478_L	516_N	0.553	0.17
17_F	55_E	0.553	0.17
509_W	541_N	0.553	0.17
28_E	48_L	0.552	0.17
456_R	641_Y	0.551	0.17
389_F	638_R	0.550	0.17
479_K	680_R	0.549	0.17
387_E	527_F	0.548	0.17
47_E	77_S	0.548	0.17
514_S	519_S	0.547	0.17
124_E	127_L	0.547	0.17
53_D	64_L	0.546	0.17
27_I	64_L	0.546	0.17
480_R	663_R	0.545	0.17
158_K	428_E	0.545	0.17
262_R	266_R	0.544	0.17
649_T	652_S	0.544	0.17
666_L	704_A	0.544	0.17
111_Y	115_R	0.543	0.17
396_C	475_G	0.543	0.17
226_R	229_H	0.542	0.17
84_T	163_I	0.542	0.17
23_K	53_D	0.542	0.17
519_S	522_I	0.542	0.17
103_E	107_T	0.541	0.17
44_G	47_E	0.541	0.17
9_K	101_P	0.541	0.17
31_V	111_Y	0.540	0.17
38_S	707_Q	0.540	0.17
54_S	75_T	0.540	0.17
654_V	670_P	0.538	0.17
662_K	724_D	0.538	0.17
317_K	648_I	0.538	0.17
472_T	658_F	0.538	0.17
395_S	484_D	0.536	0.16
13_K	44_G	0.536	0.16
388_S	640_L	0.536	0.16
476_T	518_Y	0.536	0.16
225_E	229_H	0.535	0.16
568_V	606_I	0.535	0.16
661_L	726_F	0.535	0.16
22_Q	73_S	0.534	0.16
250_V	253_K	0.534	0.16
527_F	667_F	0.532	0.16
309_A	331_Y	0.532	0.16
17_F	50_I	0.531	0.16
233_N	237_D	0.531	0.16
514_S	541_N	0.531	0.16
396_C	474_H	0.531	0.16
458_P	636_D	0.531	0.16
170_K	448_A	0.530	0.16
423_S	470_L	0.530	0.16
207_I	210_K	0.529	0.16
368_K	461_I	0.529	0.16
476_T	722_F	0.528	0.16
398_P	463_K	0.528	0.16
456_R	469_Y	0.526	0.16
601_L	675_Y	0.526	0.16
388_S	416_W	0.526	0.16
293_R	305_K	0.526	0.16
456_R	484_D	0.526	0.16
723_Y	727_C	0.525	0.16
90_K	166_K	0.525	0.16
65_F	82_Q	0.525	0.16
26_M	85_G	0.525	0.16
389_F	515_P	0.524	0.16
574_T	681_G	0.524	0.16
715_L	718_S	0.524	0.16
203_N	210_K	0.522	0.16
294_K	297_L	0.522	0.16
693_P	708_I	0.521	0.16
509_W	526_A	0.520	0.16
477_P	541_N	0.520	0.16
578_D	646_L	0.519	0.16
588_F	661_L	0.519	0.16
267_L	316_F	0.517	0.16
476_T	655_F	0.517	0.16
608_I	634_Y	0.516	0.16
454_N	476_T	0.516	0.16
590_L	670_P	0.514	0.16
505_E	611_M	0.514	0.16
509_W	681_G	0.512	0.16
396_C	538_Y	0.512	0.16
74_G	631_F	0.512	0.16
475_G	541_N	0.511	0.16
473_W	594_L	0.511	0.16
481_L	679_L	0.510	0.16
453_V	519_S	0.510	0.16
286_T	289_V	0.510	0.16
17_F	54_S	0.510	0.16
476_T	613_Y	0.510	0.16
388_S	418_V	0.508	0.16
610_R	640_L	0.507	0.16
48_L	82_Q	0.507	0.16
591_D	660_N	0.507	0.16
243_L	246_F	0.507	0.16
394_Y	535_E	0.507	0.16
468_T	511_Y	0.507	0.16
572_A	732_G	0.506	0.15
77_S	97_V	0.506	0.15
579_Q	648_I	0.506	0.15
21_E	210_K	0.505	0.15
649_T	656_F	0.505	0.15
122_E	126_L	0.505	0.15
438_S	540_R	0.505	0.15
620_D	624_F	0.505	0.15
485_M	614_L	0.504	0.15
451_W	467_T	0.503	0.15
11_K	95_A	0.503	0.15
473_W	585_R	0.503	0.15
482_A	691_P	0.503	0.15
178_E	181_S	0.502	0.15
299_G	303_I	0.502	0.15
235_R	242_E	0.502	0.15
353_K	357_K	0.502	0.15
82_Q	109_D	0.502	0.15
240_V	252_L	0.502	0.15
383_T	447_R	0.502	0.15
394_Y	512_L	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3l7iA	4	0.5416	100	0.392	Contact Map
3bcvA	2	0.2413	100	0.816	Contact Map
1qg8A	1	0.2936	100	0.83	Contact Map
2z86A	2	0.3338	100	0.842	Contact Map
1fo8A	1	0.4062	99.9	0.863	Contact Map
3ckjA	2	0.3418	99.9	0.87	Contact Map
2nxvA	4	0.3003	99.9	0.873	Contact Map
2d7iA	1	0.5442	99.9	0.873	Contact Map
2bo4A	4	0.4638	99.9	0.875	Contact Map
4fixA	3	0.5697	99.9	0.876	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0173 seconds.