SACB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SACB - Levansucrase

UniProt:	P05655	Sequences: MNIKKFAKQATVLTFTTALLAGGATQAFAKETNQKPYKETYGISHITRHDMLQIPEQQKNEKYQVPEFDSSTIKNISSAKGLDVWDSWPLQNADGTVANYHGYHIVFALAGDPKNADDTSIYMFYQKVGETSIDSWKNAGRVFKDSDKFDANDSILKDQTQEWSGSATFTSDGKIRLFYTDFSGKHYGKQTLTTAQVNVSASDSSLNINGVEDYKSIFDGDGKTYQNVQQFIDEGNYSSGDNHTLRDPHYVEDKGHKYLVFEANTGTEDGYQGEESLFNKAYYGKSTSFFRQESQKLLQSDKKRTAELANGALGMIELNDDYTLKKVMKPLIASNTVTDEIERANVFKMNGKWYLFTDSRGSKMTIDGITSNDIYMLGYVSNSLTGPYKPLNKTGLVLKMDLDPNDVTFTYSHFAVPQAKGNNVVITSYMTNRGFYADKQSTFAPSFLLNIKGKKTSVVKDSILEQGQLTVNK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	473 (401)
Sequences:	168 (108)
Seq/√Len:	5.4

BACSU - SACB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
391_L	456_T	11.911	1.00
451_I	456_T	6.686	1.00
108_A	412_S	5.395	0.99
263_A	312_A	3.913	0.91
244_T	264_N	3.318	0.81
167_A	177_L	3.303	0.81
87_S	412_S	3.151	0.78
128_V	135_S	2.981	0.73
107_F	121_I	2.962	0.73
393_K	449_L	2.953	0.73
245_L	311_G	2.896	0.71
421_G	424_V	2.891	0.71
350_N	422_N	2.739	0.66
241_D	339_D	2.629	0.63
123_M	139_A	2.611	0.62
319_N	451_I	2.433	0.57
64_Q	424_V	2.416	0.56
199_V	208_I	2.403	0.56
128_V	448_L	2.379	0.55
218_F	327_V	2.294	0.52
263_A	358_D	2.188	0.48
400_M	412_S	2.135	0.47
175_I	215_K	2.072	0.45
160_T	192_L	2.067	0.44
430_M	442_T	2.031	0.43
264_N	311_G	2.014	0.43
88_W	167_A	2.011	0.43
90_L	107_F	1.963	0.41
43_I	333_A	1.944	0.40
87_S	370_T	1.915	0.39
205_S	326_K	1.875	0.38
319_N	326_K	1.873	0.38
237_Y	359_S	1.858	0.38
87_S	108_A	1.852	0.37
178_F	449_L	1.847	0.37
219_D	334_S	1.825	0.37
162_E	167_A	1.825	0.37
391_L	448_L	1.814	0.36
222_G	230_Q	1.801	0.36
109_L	142_V	1.787	0.35
92_N	96_T	1.783	0.35
129_G	356_F	1.765	0.35
108_A	456_T	1.737	0.34
224_T	227_N	1.734	0.34
122_Y	383_S	1.715	0.33
83_D	340_E	1.712	0.33
231_F	239_S	1.707	0.33
173_G	311_G	1.696	0.33
256_H	317_E	1.672	0.32
48_R	368_G	1.671	0.32
344_A	371_S	1.666	0.32
199_V	315_M	1.663	0.32
218_F	254_K	1.644	0.31
230_Q	247_D	1.640	0.31
99_N	437_A	1.636	0.31
391_L	451_I	1.634	0.31
143_F	195_A	1.629	0.31
117_D	161_Q	1.623	0.31
158_D	182_F	1.608	0.30
340_E	358_D	1.603	0.30
104_H	128_V	1.587	0.30
382_N	391_L	1.577	0.29
333_A	386_G	1.570	0.29
157_K	183_S	1.556	0.29
164_S	339_D	1.556	0.29
178_F	389_K	1.553	0.29
278_F	283_Y	1.544	0.28
382_N	456_T	1.528	0.28
225_Y	261_F	1.522	0.28
290_F	328_M	1.515	0.28
143_F	166_S	1.508	0.27
175_I	202_S	1.505	0.27
106_V	317_E	1.500	0.27
53_Q	386_G	1.498	0.27
426_I	429_Y	1.498	0.27
321_D	389_K	1.497	0.27
247_D	353_W	1.492	0.27
187_Y	192_L	1.487	0.27
206_L	371_S	1.484	0.27
87_S	400_M	1.483	0.27
230_Q	353_W	1.475	0.26
321_D	388_Y	1.458	0.26
88_W	124_F	1.452	0.26
54_I	346_V	1.452	0.26
121_I	287_T	1.441	0.26
226_Q	398_L	1.423	0.25
47_T	54_I	1.411	0.25
169_F	332_I	1.408	0.25
89_P	95_G	1.406	0.25
87_S	409_F	1.403	0.25
84_V	124_F	1.394	0.24
246_R	310_N	1.392	0.24
350_N	453_G	1.391	0.24
89_P	306_A	1.389	0.24
218_F	333_A	1.378	0.24
205_S	388_Y	1.370	0.24
366_I	371_S	1.355	0.23
190_Q	246_R	1.353	0.23
340_E	363_K	1.353	0.23
264_N	357_T	1.351	0.23
313_L	456_T	1.347	0.23
82_L	415_A	1.342	0.23
338_T	373_D	1.331	0.23
287_T	394_T	1.329	0.23
179_Y	190_Q	1.325	0.23
64_Q	350_N	1.317	0.23
57_Q	404_P	1.315	0.22
39_E	174_K	1.313	0.22
107_F	135_S	1.309	0.22
85_W	262_E	1.306	0.22
262_E	343_R	1.306	0.22
86_D	343_R	1.306	0.22
86_D	354_Y	1.306	0.22
262_E	354_Y	1.306	0.22
86_D	342_E	1.306	0.22
262_E	342_E	1.306	0.22
86_D	262_E	1.306	0.22
85_W	354_Y	1.306	0.22
343_R	354_Y	1.306	0.22
85_W	343_R	1.306	0.22
85_W	342_E	1.306	0.22
342_E	354_Y	1.306	0.22
175_I	414_F	1.304	0.22
105_I	123_M	1.300	0.22
331_L	384_L	1.300	0.22
242_N	339_D	1.286	0.22
90_L	396_L	1.278	0.22
53_Q	394_T	1.276	0.22
92_N	414_F	1.269	0.21
346_V	370_T	1.256	0.21
105_I	371_S	1.251	0.21
204_S	434_G	1.251	0.21
230_Q	327_V	1.249	0.21
347_F	403_D	1.225	0.20
187_Y	323_T	1.209	0.20
183_S	239_S	1.198	0.20
73_I	340_E	1.193	0.20
46_I	119_T	1.190	0.20
220_G	427_T	1.187	0.20
344_A	403_D	1.186	0.20
359_S	368_G	1.184	0.20
318_L	349_M	1.180	0.19
101_H	449_L	1.179	0.19
381_S	456_T	1.178	0.19
44_S	84_V	1.178	0.19
338_T	363_K	1.178	0.19
366_I	414_F	1.176	0.19
121_I	394_T	1.169	0.19
384_L	417_P	1.153	0.19
315_M	351_G	1.152	0.19
229_Q	449_L	1.149	0.19
190_Q	310_N	1.145	0.19
123_M	178_F	1.143	0.19
313_L	408_T	1.140	0.19
191_T	311_G	1.138	0.19
210_G	380_V	1.136	0.19
269_D	410_T	1.130	0.18
414_F	456_T	1.127	0.18
276_S	307_E	1.122	0.18
381_S	391_L	1.117	0.18
104_H	126_Q	1.106	0.18
50_D	428_S	1.105	0.18
315_M	384_L	1.102	0.18
217_I	442_T	1.102	0.18
60_N	398_L	1.101	0.18
226_Q	247_D	1.101	0.18
313_L	332_I	1.098	0.18
110_A	161_Q	1.096	0.18
311_G	338_T	1.088	0.18
117_D	183_S	1.083	0.18
100_Y	173_G	1.083	0.18
175_I	253_D	1.081	0.17
39_E	173_G	1.076	0.17
245_L	305_T	1.067	0.17
266_G	330_P	1.065	0.17
179_Y	214_Y	1.064	0.17
98_A	246_R	1.051	0.17
338_T	377_L	1.047	0.17
136_W	344_A	1.046	0.17
357_T	375_Y	1.045	0.17
120_S	409_F	1.042	0.17
212_E	434_G	1.041	0.17
182_F	214_Y	1.034	0.17
51_M	264_N	1.029	0.16
334_S	424_V	1.029	0.16
241_D	251_V	1.022	0.16
171_S	382_N	1.022	0.16
80_K	214_Y	1.014	0.16
76_I	80_K	1.010	0.16
177_L	255_G	1.006	0.16
246_R	249_H	1.005	0.16
110_A	338_T	1.005	0.16
175_I	352_K	1.004	0.16
242_N	363_K	1.003	0.16
386_G	395_G	1.002	0.16
36_P	320_D	1.001	0.16
168_T	333_A	0.998	0.16
54_I	394_T	0.992	0.16
312_A	386_G	0.991	0.16
313_L	414_F	0.989	0.16
111_G	441_S	0.988	0.16
383_S	386_G	0.985	0.16
251_V	254_K	0.983	0.16
381_S	385_T	0.981	0.16
208_I	444_A	0.981	0.16
110_A	373_D	0.979	0.16
160_T	185_K	0.978	0.16
313_L	320_D	0.978	0.16
414_F	427_T	0.977	0.16
178_F	190_Q	0.975	0.15
44_S	209_N	0.975	0.15
245_L	357_T	0.974	0.15
100_Y	213_D	0.973	0.15
313_L	452_K	0.972	0.15
83_D	312_A	0.970	0.15
263_A	449_L	0.967	0.15
126_Q	135_S	0.965	0.15
329_K	375_Y	0.964	0.15
179_Y	246_R	0.963	0.15
136_W	380_V	0.962	0.15
356_F	378_G	0.959	0.15
41_Y	281_A	0.958	0.15
87_S	344_A	0.956	0.15
106_V	192_L	0.955	0.15
318_L	376_M	0.952	0.15
237_Y	412_S	0.951	0.15
291_R	294_S	0.950	0.15
101_H	186_H	0.949	0.15
126_Q	372_N	0.948	0.15
371_S	403_D	0.945	0.15
279_N	321_D	0.944	0.15
88_W	143_F	0.944	0.15
162_E	264_N	0.940	0.15
309_A	339_D	0.938	0.15
108_A	143_F	0.936	0.15
120_S	161_Q	0.930	0.15
47_T	284_G	0.915	0.14
169_F	230_Q	0.914	0.14
314_G	342_E	0.911	0.14
262_E	314_G	0.911	0.14
85_W	314_G	0.911	0.14
314_G	354_Y	0.911	0.14
314_G	343_R	0.911	0.14
86_D	314_G	0.911	0.14
57_Q	458_V	0.911	0.14
258_Y	328_M	0.910	0.14
259_L	309_A	0.908	0.14
329_K	423_N	0.904	0.14
244_T	311_G	0.902	0.14
192_L	408_T	0.901	0.14
59_K	64_Q	0.900	0.14
334_S	421_G	0.895	0.14
358_D	412_S	0.895	0.14
352_K	380_V	0.893	0.14
185_K	189_K	0.893	0.14
338_T	364_M	0.890	0.14
177_L	408_T	0.883	0.14
38_K	288_S	0.882	0.14
100_Y	202_S	0.882	0.14
93_A	168_T	0.880	0.14
103_Y	127_K	0.880	0.14
324_L	327_V	0.878	0.14
203_D	320_D	0.878	0.14
319_N	323_T	0.873	0.14
264_N	363_K	0.869	0.14
97_V	121_I	0.868	0.14
247_D	330_P	0.868	0.14
81_G	288_S	0.864	0.14
162_E	193_T	0.862	0.14
47_T	92_N	0.861	0.14
81_G	199_V	0.858	0.14
333_A	387_P	0.854	0.13
82_L	389_K	0.852	0.13
296_K	424_V	0.852	0.13
344_A	358_D	0.850	0.13
72_T	458_V	0.849	0.13
283_Y	430_M	0.848	0.13
49_H	359_S	0.848	0.13
383_S	387_P	0.848	0.13
122_Y	138_N	0.847	0.13
359_S	412_S	0.845	0.13
264_N	305_T	0.844	0.13
43_I	313_L	0.843	0.13
208_I	320_D	0.843	0.13
400_M	409_F	0.843	0.13
44_S	97_V	0.842	0.13
146_S	359_S	0.840	0.13
178_F	317_E	0.840	0.13
377_L	423_N	0.836	0.13
64_Q	421_G	0.836	0.13
53_Q	315_M	0.835	0.13
192_L	247_D	0.833	0.13
251_V	421_G	0.832	0.13
410_T	432_N	0.830	0.13
158_D	195_A	0.828	0.13
46_I	423_N	0.824	0.13
309_A	376_M	0.823	0.13
130_E	382_N	0.823	0.13
90_L	109_L	0.822	0.13
110_A	438_D	0.820	0.13
109_L	338_T	0.818	0.13
345_N	403_D	0.818	0.13
236_N	313_L	0.807	0.13
350_N	380_V	0.807	0.13
415_A	421_G	0.806	0.13
176_R	196_Q	0.805	0.13
68_F	177_L	0.804	0.13
396_L	443_F	0.803	0.13
264_N	373_D	0.802	0.13
109_L	264_N	0.800	0.13
379_Y	412_S	0.799	0.13
60_N	299_Q	0.799	0.13
119_T	360_R	0.799	0.13
61_E	292_Q	0.796	0.13
209_N	319_N	0.795	0.13
161_Q	185_K	0.794	0.13
318_L	391_L	0.792	0.13
363_K	440_Q	0.792	0.13
166_S	190_Q	0.791	0.13
292_Q	296_K	0.791	0.13
350_N	404_P	0.790	0.13
46_I	245_L	0.790	0.13
408_T	438_D	0.789	0.12
52_L	394_T	0.788	0.12
83_D	122_Y	0.787	0.12
312_A	329_K	0.787	0.12
191_T	270_G	0.784	0.12
119_T	403_D	0.778	0.12
253_D	449_L	0.777	0.12
181_D	214_Y	0.775	0.12
64_Q	400_M	0.773	0.12
181_D	412_S	0.764	0.12
88_W	166_S	0.764	0.12
210_G	359_S	0.764	0.12
202_S	209_N	0.764	0.12
427_T	431_T	0.758	0.12
190_Q	266_G	0.753	0.12
244_T	305_T	0.753	0.12
117_D	186_H	0.752	0.12
381_S	387_P	0.749	0.12
143_F	247_D	0.748	0.12
122_Y	249_H	0.748	0.12
47_T	339_D	0.748	0.12
207_N	351_G	0.747	0.12
138_N	315_M	0.747	0.12
351_G	453_G	0.743	0.12
64_Q	440_Q	0.742	0.12
313_L	381_S	0.737	0.12
335_N	451_I	0.737	0.12
88_W	178_F	0.736	0.12
107_F	332_I	0.735	0.12
166_S	310_N	0.735	0.12
435_F	439_K	0.735	0.12
284_G	339_D	0.733	0.12
185_K	388_Y	0.730	0.12
129_G	268_E	0.730	0.12
51_M	245_L	0.729	0.12
87_S	164_S	0.727	0.12
206_L	380_V	0.726	0.12
397_V	442_T	0.725	0.12
127_K	200_S	0.723	0.12
263_A	340_E	0.722	0.12
268_E	451_I	0.722	0.12
158_D	237_Y	0.721	0.12
166_S	247_D	0.721	0.12
378_G	397_V	0.721	0.12
193_T	216_S	0.720	0.12
49_H	254_K	0.717	0.11
244_T	362_S	0.716	0.11
173_G	208_I	0.715	0.11
171_S	431_T	0.715	0.11
319_N	335_N	0.710	0.11
62_K	423_N	0.709	0.11
115_N	423_N	0.708	0.11
115_N	440_Q	0.705	0.11
113_P	340_E	0.705	0.11
166_S	246_R	0.702	0.11
230_Q	459_V	0.701	0.11
75_N	265_T	0.701	0.11
208_I	416_V	0.701	0.11
332_I	460_K	0.700	0.11
162_E	339_D	0.699	0.11
82_L	252_E	0.697	0.11
320_D	456_T	0.696	0.11
204_S	442_T	0.696	0.11
371_S	409_F	0.696	0.11
287_T	291_R	0.693	0.11
93_A	327_V	0.692	0.11
313_L	450_N	0.689	0.11
103_Y	207_N	0.689	0.11
108_A	429_Y	0.689	0.11
161_Q	164_S	0.689	0.11
298_L	379_Y	0.686	0.11
202_S	319_N	0.686	0.11
178_F	335_N	0.684	0.11
82_L	135_S	0.684	0.11
105_I	436_Y	0.683	0.11
245_L	264_N	0.680	0.11
191_T	216_S	0.679	0.11
278_F	385_T	0.678	0.11
372_N	400_M	0.678	0.11
161_Q	183_S	0.675	0.11
128_V	407_V	0.673	0.11
344_A	350_N	0.672	0.11
207_N	431_T	0.670	0.11
64_Q	449_L	0.670	0.11
46_I	379_Y	0.669	0.11
251_V	424_V	0.667	0.11
223_K	450_N	0.667	0.11
115_N	161_Q	0.666	0.11
210_G	270_G	0.664	0.11
141_R	350_N	0.664	0.11
201_A	205_S	0.663	0.11
87_S	372_N	0.662	0.11
197_V	211_V	0.662	0.11
210_G	325_K	0.661	0.11
354_Y	412_S	0.661	0.11
262_E	412_S	0.661	0.11
342_E	412_S	0.661	0.11
85_W	412_S	0.661	0.11
86_D	412_S	0.661	0.11
343_R	412_S	0.661	0.11
220_G	245_L	0.660	0.11
437_A	451_I	0.660	0.11
292_Q	295_Q	0.658	0.11
87_S	99_N	0.658	0.11
215_K	451_I	0.658	0.11
142_V	208_I	0.657	0.11
64_Q	415_A	0.656	0.11
172_D	208_I	0.656	0.11
117_D	185_K	0.654	0.11
126_Q	370_T	0.654	0.11
191_T	367_D	0.652	0.11
243_H	315_M	0.652	0.11
366_I	409_F	0.651	0.11
327_V	346_V	0.649	0.11
53_Q	331_L	0.649	0.11
363_K	377_L	0.648	0.11
237_Y	248_P	0.645	0.11
62_K	121_I	0.644	0.11
188_G	308_L	0.644	0.11
44_S	393_K	0.643	0.10
263_A	329_K	0.643	0.10
42_G	270_G	0.642	0.10
121_I	327_V	0.642	0.10
160_T	237_Y	0.641	0.10
164_S	409_F	0.640	0.10
105_I	291_R	0.640	0.10
251_V	426_I	0.640	0.10
115_N	210_G	0.639	0.10
181_D	409_F	0.637	0.10
334_S	368_G	0.635	0.10
256_H	323_T	0.634	0.10
108_A	178_F	0.631	0.10
177_L	356_F	0.630	0.10
403_D	407_V	0.630	0.10
39_E	287_T	0.630	0.10
46_I	51_M	0.629	0.10
103_Y	310_N	0.628	0.10
310_N	429_Y	0.627	0.10
92_N	103_Y	0.625	0.10
135_S	176_R	0.625	0.10
259_L	310_N	0.624	0.10
88_W	108_A	0.624	0.10
396_L	414_F	0.623	0.10
344_A	400_M	0.623	0.10
127_K	176_R	0.623	0.10
68_F	208_I	0.620	0.10
61_E	299_Q	0.619	0.10
173_G	199_V	0.618	0.10
191_T	443_F	0.616	0.10
51_M	305_T	0.614	0.10
169_F	412_S	0.613	0.10
142_V	244_T	0.611	0.10
122_Y	341_I	0.610	0.10
54_I	421_G	0.610	0.10
275_E	292_Q	0.608	0.10
320_D	452_K	0.608	0.10
304_R	307_E	0.607	0.10
350_N	359_S	0.606	0.10
65_V	107_F	0.605	0.10
278_F	333_A	0.605	0.10
235_G	311_G	0.604	0.10
227_N	256_H	0.603	0.10
100_Y	311_G	0.602	0.10
186_H	388_Y	0.601	0.10
142_V	177_L	0.599	0.10
453_G	458_V	0.598	0.10
231_F	416_V	0.596	0.10
235_G	245_L	0.594	0.10
182_F	231_F	0.593	0.10
88_W	195_A	0.591	0.10
230_Q	330_P	0.591	0.10
253_D	346_V	0.591	0.10
427_T	430_M	0.590	0.10
266_G	429_Y	0.588	0.10
48_R	270_G	0.587	0.10
391_L	415_A	0.587	0.10
108_A	400_M	0.587	0.10
270_G	425_V	0.585	0.10
46_I	344_A	0.585	0.10
241_D	415_A	0.583	0.10
167_A	178_F	0.582	0.10
415_A	424_V	0.581	0.10
340_E	362_S	0.578	0.10
87_S	136_W	0.576	0.10
263_A	341_I	0.576	0.10
122_Y	360_R	0.576	0.10
315_M	331_L	0.575	0.10
245_L	379_Y	0.573	0.10
102_G	355_L	0.573	0.10
391_L	445_P	0.573	0.10
48_R	284_G	0.572	0.10
39_E	455_K	0.570	0.10
400_M	403_D	0.568	0.10
40_T	171_S	0.567	0.10
171_S	223_K	0.567	0.10
178_F	312_A	0.567	0.10
84_V	158_D	0.565	0.10
177_L	454_K	0.564	0.10
241_D	398_L	0.562	0.10
288_S	332_I	0.561	0.09
60_N	410_T	0.561	0.09
168_T	241_D	0.561	0.09
38_K	299_Q	0.559	0.09
143_F	167_A	0.558	0.09
423_N	441_S	0.558	0.09
72_T	431_T	0.556	0.09
381_S	386_G	0.555	0.09
145_D	220_G	0.555	0.09
210_G	367_D	0.555	0.09
105_I	459_V	0.554	0.09
360_R	441_S	0.552	0.09
202_S	391_L	0.552	0.09
108_A	443_F	0.551	0.09
63_Y	336_T	0.551	0.09
393_K	455_K	0.549	0.09
277_L	460_K	0.549	0.09
175_I	268_E	0.548	0.09
226_Q	353_W	0.547	0.09
409_F	440_Q	0.546	0.09
252_E	383_S	0.545	0.09
72_T	227_N	0.545	0.09
244_T	357_T	0.545	0.09
336_T	364_M	0.545	0.09
200_S	334_S	0.545	0.09
43_I	346_V	0.545	0.09
263_A	281_A	0.545	0.09
312_A	385_T	0.543	0.09
398_L	426_I	0.542	0.09
227_N	230_Q	0.542	0.09
282_Y	335_N	0.541	0.09
331_L	454_K	0.541	0.09
226_Q	425_V	0.540	0.09
168_T	318_L	0.540	0.09
125_Y	172_D	0.536	0.09
54_I	143_F	0.534	0.09
61_E	304_R	0.533	0.09
83_D	118_D	0.532	0.09
164_S	362_S	0.531	0.09
83_D	386_G	0.531	0.09
235_G	239_S	0.529	0.09
97_V	312_A	0.529	0.09
34_Q	105_I	0.528	0.09
406_D	443_F	0.527	0.09
119_T	446_S	0.527	0.09
398_L	447_F	0.526	0.09
319_N	328_M	0.524	0.09
75_N	429_Y	0.523	0.09
177_L	417_P	0.522	0.09
53_Q	59_K	0.522	0.09
426_I	432_N	0.522	0.09
359_S	366_I	0.520	0.09
231_F	240_G	0.519	0.09
193_T	205_S	0.519	0.09
171_S	175_I	0.519	0.09
162_E	239_S	0.519	0.09
142_V	351_G	0.518	0.09
157_K	181_D	0.516	0.09
313_L	344_A	0.515	0.09
197_V	325_K	0.515	0.09
239_S	387_P	0.515	0.09
371_S	400_M	0.515	0.09
317_E	328_M	0.514	0.09
141_R	162_E	0.512	0.09
170_T	213_D	0.510	0.09
203_D	457_S	0.510	0.09
346_V	359_S	0.509	0.09
125_Y	451_I	0.508	0.09
229_Q	391_L	0.508	0.09
121_I	385_T	0.507	0.09
159_Q	191_T	0.507	0.09
347_F	449_L	0.506	0.09
172_D	199_V	0.505	0.09
90_L	136_W	0.505	0.09
429_Y	447_F	0.504	0.09
114_K	120_S	0.504	0.09
211_V	425_V	0.502	0.09
92_N	315_M	0.502	0.09
69_D	310_N	0.502	0.09
44_S	146_S	0.501	0.09
183_S	238_S	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1oygA	1	0.9302	100	0.466	Contact Map
2yfrA	2	0.9662	100	0.541	Contact Map
1w18A	1	0.8985	100	0.576	Contact Map
3wpuA	1	0.8943	100	0.583	Contact Map
4d47A	3	0.8076	100	0.659	Contact Map
3vsfA	1	0.6427	99.6	0.913	Contact Map
3pijA	2	0.704	99.6	0.914	Contact Map
3qz4A	1	0.6047	99.6	0.914	Contact Map
1w2tA	1	0.6173	99.6	0.915	Contact Map
3nqhA	2	0.6173	99.5	0.918	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.012 seconds.