YTOI - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YTOI - Uncharacterized protein YtoI

UniProt:	O34921	Sequences: MATKHEQILTYIDSLPVGEKISVRRIAKEMKVSEGTAYRAIKEAENKGFVSTIERVGTIRIEQKKKENIEKLTYAEVVNVIDGQVLGGRAGLHKTLNKFVIGAMELDAMMRYTAAGNLLIVGNRINAHRQALEAGAAVLVTGGFNTDDSIVQLADELELPILSTSYDTFTVAAMINRAIYDQLIKKEIVLVEDILTPADRTVYLSPKDKLEKWYEKNFETGHGRFPVVDDQMKIHGILTSKDIAGHDRNASIEKVMTKNPVTVIGKTSVASAAQMMVWEGIEVLPVTDGHQKLIGMISRQDVLKALQMIQKQPQVGEKLDDIVSRGFKDEGDDKEDQTVYEYEVTPQMTNQLGTISYGVFTTILTQAANRFLRSKKRGELVIESITIFFLKPVQMESVIEVKPRILEAGRKFGKMEVEVHSQGHIVSKAMLMVQLMERS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	439 (432)
Sequences:	343 (231)
Seq/√Len:	11.1

BACSU - YTOI

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
90_A	158_E	5.563	1.00
404_R	418_E	4.382	1.00
152_Q	156_E	3.769	0.99
227_V	252_I	3.767	0.99
229_D	267_T	3.324	0.97
43_E	389_F	3.312	0.97
125_I	147_D	3.270	0.97
59_I	296_M	3.221	0.96
8_I	32_V	3.092	0.95
283_V	296_M	2.823	0.92
53_I	56_V	2.792	0.92
3_T	34_E	2.790	0.92
413_G	423_G	2.750	0.91
8_I	26_I	2.692	0.91
277_V	342_Y	2.676	0.90
237_I	363_I	2.668	0.90
315_V	409_G	2.630	0.89
9_L	272_A	2.565	0.88
212_K	215_E	2.535	0.88
241_K	282_E	2.507	0.87
215_E	219_E	2.494	0.87
200_R	219_E	2.482	0.86
113_T	360_F	2.446	0.86
129_R	133_E	2.437	0.85
150_I	161_I	2.403	0.85
186_K	313_P	2.352	0.83
234_I	262_T	2.299	0.82
224_R	282_E	2.293	0.82
263_V	267_T	2.269	0.81
263_V	286_V	2.262	0.81
185_K	396_E	2.220	0.79
133_E	147_D	2.201	0.79
105_E	126_N	2.195	0.79
327_F	342_Y	2.133	0.76
186_K	314_Q	2.128	0.76
277_V	323_V	2.102	0.75
16_P	433_V	2.097	0.75
240_S	387_I	2.074	0.74
145_N	151_V	2.053	0.74
391_K	407_E	2.053	0.74
253_E	258_K	2.050	0.73
75_A	93_H	2.024	0.72
135_G	177_R	1.989	0.71
109_M	127_A	1.921	0.68
43_E	404_R	1.920	0.68
346_P	394_Q	1.914	0.68
310_Q	416_E	1.875	0.66
85_V	155_D	1.861	0.66
64_K	146_T	1.836	0.65
117_N	284_L	1.827	0.64
208_D	212_K	1.823	0.64
128_H	155_D	1.813	0.64
51_S	61_I	1.809	0.63
157_L	284_L	1.805	0.63
375_K	405_I	1.794	0.63
361_T	385_I	1.756	0.61
214_Y	248_R	1.746	0.61
286_V	297_I	1.722	0.59
252_I	258_K	1.713	0.59
277_V	298_S	1.691	0.58
201_T	238_L	1.681	0.58
204_L	368_A	1.680	0.57
49_F	369_N	1.678	0.57
237_I	283_V	1.672	0.57
54_E	434_Q	1.669	0.57
382_I	431_L	1.659	0.56
368_A	431_L	1.654	0.56
221_G	258_K	1.644	0.56
217_N	406_L	1.638	0.55
127_A	136_A	1.617	0.54
380_L	437_E	1.616	0.54
158_E	298_S	1.614	0.54
9_L	116_G	1.609	0.54
113_T	136_A	1.607	0.54
185_K	416_E	1.604	0.54
250_A	383_E	1.586	0.53
238_L	252_I	1.582	0.53
268_S	310_Q	1.579	0.53
284_L	413_G	1.578	0.53
212_K	225_F	1.573	0.52
278_W	304_K	1.570	0.52
13_D	49_F	1.569	0.52
146_T	407_E	1.566	0.52
303_L	384_S	1.566	0.52
63_Q	368_A	1.548	0.51
191_V	409_G	1.529	0.50
195_L	413_G	1.525	0.50
266_K	396_E	1.524	0.50
288_D	292_K	1.516	0.50
87_G	138_V	1.515	0.50
220_T	257_T	1.511	0.49
286_V	295_G	1.503	0.49
56_V	391_K	1.496	0.49
412_F	430_M	1.495	0.49
238_L	255_V	1.482	0.48
228_V	425_I	1.480	0.48
43_E	363_I	1.479	0.48
174_M	390_L	1.474	0.48
366_Q	383_E	1.472	0.47
131_A	194_I	1.458	0.47
341_E	400_E	1.450	0.46
116_G	173_A	1.447	0.46
106_L	314_Q	1.437	0.46
364_L	417_V	1.434	0.46
156_E	238_L	1.419	0.45
412_F	419_V	1.415	0.45
182_Q	342_Y	1.405	0.44
3_T	7_Q	1.393	0.44
43_E	46_N	1.370	0.43
278_W	313_P	1.357	0.42
31_K	156_E	1.353	0.42
15_L	50_V	1.333	0.41
29_E	419_V	1.318	0.40
230_D	235_H	1.315	0.40
371_F	425_I	1.313	0.40
274_Q	433_V	1.310	0.40
340_Y	361_T	1.300	0.39
335_E	408_A	1.297	0.39
28_K	434_Q	1.295	0.39
363_I	425_I	1.294	0.39
238_L	243_I	1.293	0.39
164_T	342_Y	1.290	0.39
180_Y	349_T	1.285	0.39
432_M	437_E	1.282	0.38
56_V	187_E	1.281	0.38
274_Q	318_K	1.281	0.38
90_A	218_F	1.280	0.38
397_S	406_L	1.269	0.38
163_S	229_D	1.269	0.38
379_E	384_S	1.268	0.38
8_I	69_I	1.268	0.38
148_D	152_Q	1.259	0.37
402_K	419_V	1.259	0.37
84_Q	303_L	1.258	0.37
150_I	411_K	1.249	0.37
383_E	434_Q	1.243	0.37
85_V	92_L	1.242	0.37
20_K	352_L	1.242	0.37
322_I	433_V	1.239	0.37
20_K	187_E	1.238	0.37
358_G	411_K	1.227	0.36
417_V	432_M	1.221	0.36
366_Q	430_M	1.218	0.36
180_Y	362_T	1.217	0.36
77_V	82_D	1.214	0.35
195_L	419_V	1.207	0.35
165_S	436_M	1.202	0.35
127_A	238_L	1.198	0.35
194_I	297_I	1.196	0.35
268_S	352_L	1.193	0.35
127_A	320_D	1.191	0.34
151_V	240_S	1.190	0.34
405_I	416_E	1.186	0.34
85_V	218_F	1.184	0.34
105_E	273_A	1.184	0.34
98_K	192_E	1.173	0.34
206_P	235_H	1.171	0.34
229_D	292_K	1.171	0.34
97_N	117_N	1.151	0.33
218_F	375_K	1.149	0.33
59_I	147_D	1.147	0.33
89_R	93_H	1.143	0.32
390_L	396_E	1.143	0.32
32_V	39_R	1.143	0.32
239_T	282_E	1.137	0.32
43_E	269_V	1.137	0.32
340_Y	370_R	1.136	0.32
203_Y	232_M	1.136	0.32
198_A	229_D	1.136	0.32
239_T	283_V	1.133	0.32
76_E	307_Q	1.133	0.32
166_Y	222_H	1.130	0.32
177_R	181_D	1.127	0.32
78_V	284_L	1.124	0.32
217_N	416_E	1.119	0.31
213_W	282_E	1.119	0.31
85_V	137_A	1.113	0.31
281_I	317_E	1.106	0.31
237_I	319_L	1.106	0.31
291_Q	296_M	1.104	0.31
229_D	379_E	1.103	0.31
8_I	409_G	1.102	0.31
222_H	301_D	1.093	0.30
3_T	28_K	1.093	0.30
64_K	403_P	1.089	0.30
400_E	420_H	1.088	0.30
182_Q	327_F	1.087	0.30
81_I	162_L	1.085	0.30
186_K	278_W	1.080	0.30
107_D	261_V	1.079	0.30
394_Q	425_I	1.078	0.30
128_H	262_T	1.076	0.30
272_A	327_F	1.069	0.29
278_W	307_Q	1.067	0.29
229_D	262_T	1.067	0.29
5_H	39_R	1.063	0.29
298_S	301_D	1.063	0.29
177_R	347_Q	1.061	0.29
229_D	284_L	1.058	0.29
91_G	160_P	1.054	0.29
181_D	434_Q	1.050	0.29
228_V	232_M	1.048	0.28
106_L	277_V	1.048	0.28
119_L	131_A	1.037	0.28
235_H	286_V	1.035	0.28
213_W	389_F	1.031	0.28
59_I	192_E	1.026	0.28
30_M	437_E	1.026	0.28
117_N	413_G	1.025	0.28
152_Q	363_I	1.022	0.27
192_E	266_K	1.021	0.27
49_F	111_R	1.018	0.27
195_L	327_F	1.015	0.27
388_F	392_P	1.007	0.27
272_A	412_F	1.000	0.27
321_D	350_N	0.996	0.26
364_L	430_M	0.996	0.26
162_L	390_L	0.994	0.26
83_G	96_L	0.990	0.26
317_E	392_P	0.985	0.26
210_L	328_K	0.980	0.26
16_P	419_V	0.978	0.26
63_Q	308_M	0.972	0.26
48_G	224_R	0.971	0.26
119_L	128_H	0.970	0.26
81_I	272_A	0.968	0.25
113_T	125_I	0.968	0.25
360_F	432_M	0.967	0.25
357_Y	427_S	0.965	0.25
251_S	297_I	0.962	0.25
9_L	73_T	0.962	0.25
238_L	343_E	0.961	0.25
11_Y	305_A	0.960	0.25
361_T	372_L	0.960	0.25
157_L	423_G	0.959	0.25
148_D	330_E	0.959	0.25
26_I	76_E	0.959	0.25
173_A	268_S	0.959	0.25
370_R	407_E	0.953	0.25
174_M	436_M	0.951	0.25
129_R	149_S	0.949	0.25
390_L	437_E	0.947	0.25
409_G	432_M	0.945	0.25
222_H	226_P	0.944	0.25
54_E	173_A	0.944	0.25
171_V	238_L	0.943	0.25
307_Q	318_K	0.942	0.24
215_E	400_E	0.942	0.24
195_L	246_H	0.942	0.24
364_L	409_G	0.941	0.24
98_K	173_A	0.940	0.24
71_K	284_L	0.939	0.24
11_Y	155_D	0.936	0.24
342_Y	395_M	0.932	0.24
164_T	171_V	0.931	0.24
406_L	437_E	0.931	0.24
56_V	150_I	0.929	0.24
7_Q	28_K	0.928	0.24
141_T	171_V	0.927	0.24
150_I	264_I	0.926	0.24
44_A	85_V	0.926	0.24
62_E	85_V	0.924	0.24
330_E	415_M	0.924	0.24
21_I	391_K	0.919	0.24
281_I	392_P	0.914	0.24
360_F	424_H	0.914	0.24
12_I	27_A	0.911	0.23
98_K	314_Q	0.910	0.23
134_A	431_L	0.909	0.23
34_E	272_A	0.909	0.23
74_Y	375_K	0.908	0.23
190_L	296_M	0.908	0.23
158_E	238_L	0.901	0.23
90_A	405_I	0.899	0.23
150_I	305_A	0.896	0.23
41_I	99_F	0.896	0.23
82_D	227_V	0.895	0.23
280_G	316_G	0.890	0.23
182_Q	357_Y	0.888	0.23
55_R	160_P	0.887	0.23
139_L	318_K	0.886	0.23
349_T	376_K	0.883	0.22
138_V	293_L	0.880	0.22
70_E	80_V	0.875	0.22
79_N	391_K	0.873	0.22
364_L	368_A	0.873	0.22
282_E	301_D	0.873	0.22
94_K	158_E	0.873	0.22
35_G	50_V	0.871	0.22
82_D	307_Q	0.869	0.22
59_I	311_K	0.869	0.22
305_A	431_L	0.868	0.22
4_K	50_V	0.866	0.22
41_I	295_G	0.862	0.22
210_L	298_S	0.858	0.22
323_V	330_E	0.857	0.22
263_V	363_I	0.854	0.21
161_I	262_T	0.851	0.21
229_D	431_L	0.851	0.21
166_Y	350_N	0.850	0.21
233_K	436_M	0.844	0.21
151_V	387_I	0.844	0.21
107_D	147_D	0.843	0.21
235_H	435_L	0.842	0.21
341_E	398_V	0.839	0.21
258_K	354_T	0.839	0.21
22_S	38_Y	0.837	0.21
20_K	56_V	0.837	0.21
298_S	307_Q	0.837	0.21
71_K	430_M	0.834	0.21
170_T	358_G	0.833	0.21
21_I	96_L	0.830	0.21
304_K	307_Q	0.826	0.21
37_A	76_E	0.826	0.21
211_E	248_R	0.826	0.21
317_E	388_F	0.826	0.21
17_V	343_E	0.822	0.20
202_V	225_F	0.820	0.20
165_S	366_Q	0.819	0.20
363_I	387_I	0.814	0.20
405_I	415_M	0.813	0.20
148_D	425_I	0.810	0.20
75_A	137_A	0.806	0.20
127_A	253_E	0.803	0.20
5_H	32_V	0.801	0.20
108_A	189_V	0.797	0.20
347_Q	434_Q	0.796	0.20
49_F	80_V	0.792	0.20
137_A	380_L	0.790	0.19
268_S	394_Q	0.789	0.19
33_S	52_T	0.787	0.19
10_T	161_I	0.785	0.19
173_A	273_A	0.783	0.19
166_Y	349_T	0.783	0.19
188_I	280_G	0.782	0.19
314_Q	317_E	0.781	0.19
28_K	217_N	0.781	0.19
228_V	364_L	0.779	0.19
164_T	344_V	0.779	0.19
36_T	42_K	0.778	0.19
82_D	166_Y	0.777	0.19
188_I	302_V	0.776	0.19
328_K	331_G	0.770	0.19
223_G	364_L	0.770	0.19
396_E	431_L	0.769	0.19
199_D	237_I	0.767	0.19
181_D	345_T	0.764	0.19
362_T	379_E	0.759	0.19
201_T	405_I	0.759	0.19
3_T	6_E	0.756	0.18
187_E	391_K	0.756	0.18
211_E	249_N	0.755	0.18
319_L	430_M	0.755	0.18
113_T	294_I	0.755	0.18
261_V	373_R	0.754	0.18
385_I	436_M	0.754	0.18
342_Y	360_F	0.753	0.18
8_I	372_L	0.750	0.18
30_M	50_V	0.750	0.18
59_I	134_A	0.749	0.18
49_F	335_E	0.748	0.18
56_V	241_K	0.747	0.18
23_V	38_Y	0.747	0.18
184_I	318_K	0.746	0.18
129_R	150_I	0.744	0.18
182_Q	347_Q	0.742	0.18
70_E	78_V	0.738	0.18
145_N	155_D	0.735	0.18
69_I	78_V	0.734	0.18
388_F	393_V	0.734	0.18
342_Y	357_Y	0.733	0.18
181_D	347_Q	0.733	0.18
49_F	395_M	0.731	0.18
339_V	425_I	0.730	0.18
98_K	387_I	0.729	0.18
192_E	396_E	0.728	0.18
97_N	113_T	0.728	0.18
44_A	92_L	0.728	0.18
166_Y	307_Q	0.727	0.18
186_K	312_Q	0.726	0.18
216_K	258_K	0.725	0.18
153_L	239_T	0.724	0.18
271_S	355_I	0.721	0.17
5_H	42_K	0.720	0.17
145_N	148_D	0.719	0.17
19_E	342_Y	0.718	0.17
205_S	230_D	0.718	0.17
64_K	67_E	0.717	0.17
130_Q	209_K	0.712	0.17
190_L	388_F	0.712	0.17
164_T	238_L	0.711	0.17
89_R	155_D	0.709	0.17
205_S	225_F	0.709	0.17
367_A	431_L	0.707	0.17
268_S	358_G	0.707	0.17
376_K	390_L	0.705	0.17
324_S	364_L	0.705	0.17
42_K	45_E	0.705	0.17
133_E	228_V	0.704	0.17
233_K	291_Q	0.703	0.17
195_L	284_L	0.702	0.17
364_L	385_I	0.701	0.17
222_H	319_L	0.701	0.17
165_S	307_Q	0.701	0.17
171_V	403_P	0.700	0.17
10_T	17_V	0.700	0.17
28_K	240_S	0.699	0.17
355_I	405_I	0.698	0.17
165_S	304_K	0.697	0.17
291_Q	342_Y	0.691	0.17
221_G	244_A	0.691	0.17
246_H	368_A	0.691	0.17
305_A	368_A	0.691	0.17
210_L	240_S	0.690	0.17
71_K	413_G	0.689	0.17
81_I	433_V	0.688	0.17
398_V	431_L	0.688	0.17
380_L	436_M	0.686	0.17
114_A	117_N	0.685	0.16
288_D	437_E	0.683	0.16
244_A	337_Q	0.682	0.16
49_F	223_G	0.682	0.16
140_V	161_I	0.679	0.16
215_E	248_R	0.677	0.16
233_K	254_K	0.677	0.16
74_Y	306_L	0.675	0.16
371_F	437_E	0.671	0.16
43_E	117_N	0.670	0.16
190_L	386_T	0.670	0.16
108_A	253_E	0.669	0.16
199_D	290_H	0.669	0.16
137_A	187_E	0.668	0.16
306_L	398_V	0.668	0.16
148_D	179_I	0.667	0.16
27_A	183_L	0.666	0.16
246_H	327_F	0.666	0.16
63_Q	327_F	0.666	0.16
23_V	57_G	0.665	0.16
277_V	282_E	0.665	0.16
320_D	328_K	0.664	0.16
219_E	400_E	0.664	0.16
98_K	323_V	0.661	0.16
113_T	129_R	0.661	0.16
91_G	410_R	0.659	0.16
179_I	349_T	0.659	0.16
350_N	434_Q	0.659	0.16
163_S	304_K	0.659	0.16
193_D	313_P	0.657	0.16
406_L	423_G	0.657	0.16
77_V	234_I	0.656	0.16
357_Y	360_F	0.656	0.16
349_T	391_K	0.655	0.16
97_N	309_I	0.655	0.16
16_P	19_E	0.654	0.16
351_Q	362_T	0.654	0.16
228_V	311_K	0.652	0.16
66_K	427_S	0.652	0.16
53_I	66_K	0.652	0.16
133_E	387_I	0.651	0.16
54_E	352_L	0.650	0.16
59_I	357_Y	0.649	0.16
160_P	172_A	0.647	0.16
138_V	160_P	0.646	0.15
192_E	393_V	0.645	0.15
385_I	429_A	0.644	0.15
4_K	15_L	0.643	0.15
61_I	80_V	0.642	0.15
59_I	131_A	0.640	0.15
203_Y	294_I	0.640	0.15
296_M	432_M	0.638	0.15
3_T	300_Q	0.638	0.15
359_V	385_I	0.637	0.15
69_I	99_F	0.637	0.15
365_T	399_I	0.637	0.15
253_E	385_I	0.637	0.15
298_S	319_L	0.635	0.15
87_G	96_L	0.634	0.15
77_V	86_L	0.633	0.15
70_E	419_V	0.631	0.15
105_E	225_F	0.630	0.15
12_I	83_G	0.630	0.15
365_T	370_R	0.629	0.15
274_Q	304_K	0.629	0.15
106_L	180_Y	0.629	0.15
205_S	331_G	0.628	0.15
156_E	311_K	0.628	0.15
209_K	404_R	0.626	0.15
323_V	435_L	0.625	0.15
239_T	257_T	0.624	0.15
402_K	420_H	0.623	0.15
232_M	244_A	0.622	0.15
55_R	91_G	0.621	0.15
111_R	384_S	0.621	0.15
106_L	147_D	0.621	0.15
189_V	420_H	0.621	0.15
243_I	396_E	0.620	0.15
46_N	416_E	0.619	0.15
48_G	359_V	0.619	0.15
113_T	196_T	0.619	0.15
294_I	360_F	0.618	0.15
11_Y	168_T	0.618	0.15
189_V	364_L	0.617	0.15
327_F	392_P	0.617	0.15
262_T	281_I	0.617	0.15
129_R	296_M	0.615	0.15
105_E	373_R	0.615	0.15
235_H	395_M	0.614	0.15
265_G	363_I	0.614	0.15
14_S	302_V	0.613	0.15
195_L	416_E	0.613	0.15
100_V	136_A	0.612	0.15
165_S	349_T	0.612	0.15
340_Y	403_P	0.612	0.15
180_Y	316_G	0.611	0.15
22_S	58_T	0.611	0.15
328_K	399_I	0.611	0.15
203_Y	234_I	0.611	0.15
43_E	252_I	0.610	0.15
284_L	292_K	0.610	0.15
230_D	252_I	0.609	0.15
14_S	337_Q	0.608	0.15
41_I	166_Y	0.608	0.15
179_I	278_W	0.605	0.14
190_L	356_S	0.605	0.14
21_I	409_G	0.604	0.14
223_G	282_E	0.604	0.14
377_R	435_L	0.604	0.14
368_A	371_F	0.602	0.14
28_K	54_E	0.601	0.14
398_V	420_H	0.601	0.14
123_N	193_D	0.600	0.14
79_N	298_S	0.598	0.14
386_T	401_V	0.598	0.14
273_A	381_V	0.598	0.14
294_I	311_K	0.598	0.14
225_F	324_S	0.597	0.14
416_E	420_H	0.594	0.14
195_L	265_G	0.594	0.14
196_T	360_F	0.592	0.14
268_S	411_K	0.592	0.14
28_K	406_L	0.591	0.14
3_T	44_A	0.591	0.14
269_V	355_I	0.590	0.14
182_Q	406_L	0.589	0.14
78_V	93_H	0.588	0.14
164_T	182_Q	0.587	0.14
371_F	413_G	0.587	0.14
308_M	342_Y	0.587	0.14
32_V	118_L	0.586	0.14
215_E	343_E	0.586	0.14
234_I	370_R	0.585	0.14
212_K	306_L	0.584	0.14
327_F	433_V	0.583	0.14
108_A	352_L	0.582	0.14
6_E	10_T	0.582	0.14
97_N	116_G	0.582	0.14
34_E	37_A	0.581	0.14
320_D	356_S	0.581	0.14
252_I	339_V	0.580	0.14
261_V	281_I	0.580	0.14
364_L	431_L	0.580	0.14
81_I	179_I	0.580	0.14
158_E	385_I	0.579	0.14
282_E	302_V	0.576	0.14
65_K	383_E	0.575	0.14
157_L	413_G	0.574	0.14
162_L	389_F	0.574	0.14
362_T	368_A	0.573	0.14
264_I	272_A	0.573	0.14
69_I	166_Y	0.572	0.14
157_L	252_I	0.567	0.14
367_A	408_A	0.567	0.14
105_E	128_H	0.565	0.14
377_R	436_M	0.564	0.14
287_T	408_A	0.564	0.14
331_G	405_I	0.564	0.14
100_V	128_H	0.563	0.13
3_T	177_R	0.563	0.13
69_I	231_Q	0.563	0.13
136_A	181_D	0.561	0.13
174_M	368_A	0.559	0.13
13_D	111_R	0.559	0.13
340_Y	354_T	0.558	0.13
21_I	414_K	0.558	0.13
164_T	168_T	0.557	0.13
272_A	387_I	0.557	0.13
218_F	365_T	0.557	0.13
47_K	419_V	0.554	0.13
148_D	151_V	0.554	0.13
282_E	417_V	0.553	0.13
424_H	431_L	0.553	0.13
192_E	275_M	0.553	0.13
206_P	415_M	0.552	0.13
41_I	56_V	0.551	0.13
210_L	401_V	0.551	0.13
131_A	309_I	0.549	0.13
379_E	392_P	0.549	0.13
125_I	400_E	0.549	0.13
349_T	366_Q	0.549	0.13
272_A	297_I	0.546	0.13
166_Y	186_K	0.546	0.13
187_E	359_V	0.543	0.13
34_E	78_V	0.542	0.13
284_L	362_T	0.542	0.13
331_G	415_M	0.542	0.13
372_L	393_V	0.542	0.13
303_L	388_F	0.541	0.13
351_Q	387_I	0.541	0.13
406_L	414_K	0.541	0.13
397_S	435_L	0.538	0.13
137_A	315_V	0.536	0.13
384_S	432_M	0.536	0.13
177_R	432_M	0.535	0.13
120_I	142_G	0.535	0.13
179_I	304_K	0.534	0.13
119_L	155_D	0.531	0.13
189_V	427_S	0.530	0.13
209_K	294_I	0.529	0.13
349_T	434_Q	0.527	0.13
74_Y	98_K	0.526	0.13
56_V	304_K	0.526	0.13
41_I	58_T	0.525	0.13
47_K	113_T	0.524	0.13
373_R	395_M	0.523	0.13
30_M	221_G	0.523	0.13
344_V	431_L	0.522	0.13
117_N	195_L	0.520	0.13
392_P	433_V	0.519	0.13
166_Y	301_D	0.518	0.13
396_E	426_V	0.518	0.13
201_T	293_L	0.516	0.12
55_R	188_I	0.516	0.12
216_K	384_S	0.513	0.12
126_N	363_I	0.512	0.12
115_A	361_T	0.511	0.12
221_G	271_S	0.511	0.12
227_V	363_I	0.510	0.12
83_G	123_N	0.508	0.12
210_L	360_F	0.505	0.12
27_A	37_A	0.503	0.12
43_E	202_V	0.502	0.12
204_L	209_K	0.502	0.12
386_T	392_P	0.502	0.12
157_L	245_G	0.502	0.12
36_T	40_A	0.501	0.12
261_V	425_I	0.501	0.12
65_K	161_I	0.500	0.12
23_V	58_T	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3l2bA	2	0.5171	99.9	0.859	Contact Map
3k6eA	2	0.328	99.9	0.872	Contact Map
1vrdA	3	0.3804	99.9	0.873	Contact Map
1jcnA	6	0.5786	99.9	0.874	Contact Map
3usbA	4	0.7107	99.9	0.876	Contact Map
3sl7A	2	0.2893	99.9	0.876	Contact Map
3orgA	2	0.5968	99.9	0.877	Contact Map
3fhmA	2	0.2916	99.9	0.878	Contact Map
2j9lA	3	0.3052	99.9	0.879	Contact Map
1yavA	2	0.287	99.9	0.879	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0118 seconds.