YKOS - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YKOS - Uncharacterized membrane protein YkoS

UniProt:	O34830	Sequences: MLRLMRQQKKETYYLWIALFLLLLYVSPLFILKEDAHIRVHDNLDSNIAWYKVLADSGEIVGKVDAAIPQIINGLPRDAFGTEWSGIVWLHAFFSSMTAYAISQTVTRVVAFFGMYVLLKKHIIPEPKAAFIRIGVSLAFALTPFWPSGMLSTLGYPLALWAFLNIRKGDISWREWLTLGLLPLYSSFVLGFFFFLAGMACFWLYDAITKRRWNLMFLGSIAFMTSIYLFVEYRLVYSMLFEHAPMHRIEFISSRHDVWHSLRLSIKNFVYGHNHVMTVHTVVILPILMVVFAALLFKRNRTKPENVYLFLCVLNYGLSLWYAFWFNKIWAVPKQKFAFLAEFNFARFHFLRPLVIYVSFALALYLIWRMGKGWKWLVYAAVAAQLMVLAPFNEEYTYGVHYNAPTFREFYASEQFKEIKEYIGRPQDSYRVASIGLHPSIAQYNGFYTLDTYNNLYPLSYKYEFRKIIEKELEKNSRLKQYFDEWGSRCYLFVDELGKRYDFKKNSKKTINNLQLNTDVFKKMGGRYIFSSVPIMNAEQNHLALVKTFDHKDSAWRIYLYETR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	564 (551)
Sequences:	145 (116)
Seq/√Len:	5.0

BACSU - YKOS

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
433_A	521_F	5.430	0.98
186_S	228_Y	4.482	0.94
466_R	484_D	4.469	0.94
72_I	452_T	4.349	0.93
412_A	415_Q	4.336	0.93
412_A	555_A	3.895	0.88
464_E	523_K	3.631	0.84
197_A	348_F	3.327	0.78
521_F	526_G	3.301	0.78
546_V	562_E	3.254	0.77
420_K	427_Q	3.233	0.76
180_G	223_F	3.220	0.76
464_E	520_V	3.191	0.75
250_E	463_Y	3.162	0.74
524_M	547_K	3.145	0.74
211_R	413_S	3.033	0.71
94_F	98_T	3.005	0.70
83_E	234_R	2.977	0.70
211_R	355_V	2.974	0.69
520_V	523_K	2.781	0.64
520_V	524_M	2.710	0.62
416_F	445_N	2.708	0.62
285_L	362_L	2.667	0.60
247_H	488_S	2.604	0.59
169_G	216_M	2.556	0.57
251_F	334_K	2.553	0.57
359_S	364_L	2.528	0.56
52_K	56_D	2.519	0.56
409_E	415_Q	2.497	0.55
468_I	521_F	2.472	0.54
35_D	220_S	2.437	0.53
492_L	524_M	2.390	0.52
228_Y	298_K	2.374	0.51
343_F	458_P	2.374	0.51
418_E	474_E	2.368	0.51
266_I	316_Y	2.354	0.51
249_I	338_A	2.353	0.50
410_F	438_H	2.330	0.50
30_F	105_T	2.299	0.49
415_Q	554_S	2.297	0.49
43_N	100_Y	2.286	0.48
437_L	492_L	2.285	0.48
211_R	283_V	2.278	0.48
35_D	408_R	2.272	0.48
96_S	407_F	2.254	0.47
24_L	211_R	2.232	0.47
261_S	265_S	2.228	0.46
494_V	511_I	2.214	0.46
269_F	463_Y	2.175	0.45
291_V	415_Q	2.163	0.44
47_N	50_W	2.133	0.43
40_V	137_S	2.098	0.42
479_L	511_I	2.080	0.42
122_H	165_N	2.078	0.42
73_N	450_L	2.077	0.42
188_F	246_M	2.066	0.41
15_L	22_L	2.057	0.41
72_I	454_N	2.057	0.41
265_S	320_L	2.051	0.41
34_E	408_R	2.039	0.40
47_N	146_W	2.038	0.40
331_A	341_A	2.035	0.40
483_F	490_C	2.009	0.40
473_L	484_D	1.979	0.39
471_K	515_Q	1.960	0.38
293_A	377_L	1.952	0.38
479_L	494_V	1.935	0.37
437_L	532_S	1.921	0.37
75_L	452_T	1.916	0.37
495_D	509_K	1.859	0.35
406_T	520_V	1.857	0.35
477_S	480_K	1.856	0.35
424_G	533_V	1.834	0.34
431_R	448_Y	1.818	0.34
29_L	96_S	1.812	0.34
377_L	539_E	1.811	0.34
137_S	364_L	1.782	0.33
251_F	254_S	1.778	0.33
517_N	524_M	1.753	0.32
137_S	240_L	1.721	0.31
450_L	526_G	1.714	0.31
296_L	299_R	1.712	0.31
480_K	520_V	1.696	0.30
265_S	316_Y	1.689	0.30
220_S	364_L	1.688	0.30
333_P	467_K	1.679	0.30
166_I	179_L	1.669	0.30
409_E	476_N	1.663	0.29
422_Y	549_F	1.658	0.29
232_E	235_L	1.644	0.29
165_N	175_E	1.632	0.29
269_F	288_L	1.615	0.28
127_P	290_V	1.596	0.28
228_Y	532_S	1.590	0.28
230_F	424_G	1.583	0.27
254_S	334_K	1.583	0.27
420_K	460_S	1.577	0.27
192_F	224_M	1.573	0.27
450_L	524_M	1.572	0.27
545_L	548_T	1.570	0.27
78_D	239_M	1.556	0.27
483_F	502_D	1.552	0.27
461_Y	465_F	1.551	0.27
38_I	123_I	1.531	0.26
290_V	519_D	1.530	0.26
204_L	221_I	1.509	0.26
464_E	524_M	1.509	0.26
232_E	456_L	1.506	0.25
388_V	424_G	1.495	0.25
474_E	480_K	1.483	0.25
160_L	164_L	1.478	0.25
114_G	360_F	1.476	0.25
320_L	421_E	1.472	0.25
44_L	230_F	1.470	0.25
255_R	485_E	1.456	0.24
35_D	230_F	1.455	0.24
419_I	558_I	1.455	0.24
109_V	220_S	1.447	0.24
185_Y	351_L	1.446	0.24
15_L	106_V	1.446	0.24
262_L	266_I	1.445	0.24
344_N	349_H	1.439	0.24
28_P	115_M	1.437	0.24
369_R	428_D	1.435	0.24
294_A	521_F	1.430	0.24
29_L	363_A	1.427	0.24
23_L	406_T	1.425	0.24
457_Y	490_C	1.387	0.23
123_I	289_M	1.387	0.23
298_K	380_A	1.380	0.23
253_S	334_K	1.380	0.23
16_W	407_F	1.377	0.22
29_L	394_E	1.376	0.22
339_F	406_T	1.374	0.22
194_F	232_E	1.373	0.22
94_F	102_I	1.364	0.22
273_H	493_F	1.361	0.22
275_H	350_F	1.353	0.22
80_F	414_E	1.344	0.22
74_G	465_F	1.342	0.22
182_L	192_F	1.341	0.22
547_K	560_L	1.336	0.22
290_V	388_V	1.335	0.22
19_L	517_N	1.326	0.21
415_Q	555_A	1.326	0.21
159_A	192_F	1.323	0.21
84_W	137_S	1.322	0.21
68_I	197_A	1.321	0.21
422_Y	560_L	1.313	0.21
22_L	287_I	1.312	0.21
425_R	527_R	1.309	0.21
75_L	454_N	1.309	0.21
424_G	559_Y	1.303	0.21
298_K	545_L	1.295	0.21
236_V	246_M	1.293	0.21
18_A	138_L	1.291	0.21
482_Y	489_R	1.290	0.21
150_M	179_L	1.279	0.20
200_A	364_L	1.273	0.20
49_A	433_A	1.272	0.20
246_M	456_L	1.272	0.20
219_G	542_H	1.272	0.20
177_L	258_V	1.263	0.20
287_I	358_V	1.263	0.20
292_F	300_N	1.259	0.20
129_A	551_H	1.257	0.20
466_R	473_L	1.255	0.20
136_V	415_Q	1.255	0.20
36_A	189_V	1.254	0.20
207_A	213_W	1.247	0.20
430_Y	448_Y	1.242	0.20
247_H	456_L	1.242	0.20
189_V	455_N	1.237	0.19
367_I	470_E	1.232	0.19
435_I	529_I	1.225	0.19
476_N	495_D	1.204	0.19
76_P	378_V	1.198	0.19
56_D	66_A	1.187	0.18
128_K	134_I	1.184	0.18
80_F	154_L	1.178	0.18
235_L	280_H	1.175	0.18
552_K	557_R	1.175	0.18
137_S	283_V	1.171	0.18
186_S	462_K	1.170	0.18
30_F	106_V	1.168	0.18
470_E	524_M	1.167	0.18
476_N	494_V	1.165	0.18
83_E	107_T	1.164	0.18
239_M	334_K	1.163	0.18
228_Y	364_L	1.158	0.18
220_S	427_Q	1.148	0.18
15_L	228_Y	1.146	0.18
522_K	529_I	1.146	0.18
78_D	246_M	1.144	0.18
41_H	345_F	1.142	0.18
249_I	337_F	1.142	0.18
87_I	153_T	1.140	0.18
183_P	234_R	1.138	0.18
418_E	506_N	1.137	0.18
75_L	132_I	1.136	0.17
199_M	220_S	1.135	0.17
467_K	539_E	1.123	0.17
137_S	390_A	1.118	0.17
91_H	142_L	1.115	0.17
20_F	553_D	1.115	0.17
437_L	533_V	1.114	0.17
269_F	513_N	1.100	0.17
49_A	54_L	1.099	0.17
82_T	339_F	1.099	0.17
134_I	524_M	1.098	0.17
180_G	477_S	1.095	0.17
95_S	433_A	1.092	0.17
346_A	352_R	1.090	0.17
147_P	357_Y	1.089	0.17
417_K	548_T	1.088	0.17
114_G	459_L	1.083	0.17
48_I	284_I	1.082	0.17
15_L	548_T	1.078	0.16
258_V	265_S	1.078	0.16
110_V	126_E	1.078	0.16
74_G	461_Y	1.074	0.16
272_G	483_F	1.074	0.16
39_R	146_W	1.073	0.16
73_N	408_R	1.072	0.16
385_Q	458_P	1.066	0.16
281_T	378_V	1.066	0.16
290_V	492_L	1.065	0.16
517_N	529_I	1.063	0.16
340_L	440_S	1.063	0.16
311_L	505_K	1.061	0.16
483_F	553_D	1.060	0.16
201_C	460_S	1.057	0.16
40_V	282_V	1.049	0.16
292_F	519_D	1.048	0.16
123_I	557_R	1.044	0.16
82_T	355_V	1.043	0.16
143_T	154_L	1.043	0.16
22_L	366_L	1.042	0.16
22_L	523_K	1.039	0.16
359_S	363_A	1.039	0.16
50_W	146_W	1.037	0.16
102_I	220_S	1.037	0.16
68_I	179_L	1.037	0.16
201_C	420_K	1.036	0.16
54_L	77_R	1.035	0.16
239_M	254_S	1.035	0.16
208_I	411_Y	1.024	0.15
101_A	269_F	1.023	0.15
54_L	232_E	1.020	0.15
318_L	344_N	1.020	0.15
377_L	381_A	1.017	0.15
240_L	288_L	1.016	0.15
294_A	474_E	1.010	0.15
12_T	299_R	1.007	0.15
526_G	563_T	1.007	0.15
226_S	527_R	1.006	0.15
260_H	274_N	1.004	0.15
146_W	190_L	1.002	0.15
319_S	352_R	1.001	0.15
319_S	360_F	1.001	0.15
34_E	40_V	1.000	0.15
183_P	350_F	0.999	0.15
220_S	552_K	0.997	0.15
149_G	224_M	0.996	0.15
122_H	555_A	0.995	0.15
85_S	232_E	0.994	0.15
48_I	292_F	0.993	0.15
147_P	323_A	0.993	0.15
12_T	215_L	0.991	0.15
83_E	183_P	0.989	0.15
225_T	229_L	0.989	0.15
146_W	149_G	0.987	0.15
49_A	521_F	0.986	0.15
376_W	532_S	0.984	0.15
209_T	283_V	0.982	0.15
339_F	540_Q	0.981	0.15
22_L	558_I	0.974	0.15
20_F	228_Y	0.974	0.15
175_E	471_K	0.974	0.15
212_R	320_L	0.972	0.15
449_T	465_F	0.972	0.15
162_A	497_L	0.970	0.15
96_S	301_R	0.970	0.15
456_L	488_S	0.969	0.15
91_H	532_S	0.968	0.15
212_R	261_S	0.966	0.15
183_P	233_Y	0.966	0.15
85_S	521_F	0.961	0.14
550_D	557_R	0.956	0.14
212_R	471_K	0.956	0.14
393_N	542_H	0.954	0.14
149_G	319_S	0.952	0.14
23_L	136_V	0.949	0.14
56_D	59_E	0.948	0.14
132_I	407_F	0.948	0.14
192_F	203_W	0.946	0.14
192_F	323_A	0.943	0.14
334_K	367_I	0.942	0.14
117_V	125_P	0.942	0.14
134_I	386_L	0.942	0.14
422_Y	546_V	0.939	0.14
428_D	494_V	0.938	0.14
143_T	356_I	0.938	0.14
113_F	476_N	0.934	0.14
247_H	324_F	0.933	0.14
200_A	381_A	0.933	0.14
293_A	540_Q	0.932	0.14
299_R	375_K	0.932	0.14
205_Y	209_T	0.932	0.14
518_T	550_D	0.924	0.14
388_V	408_R	0.921	0.14
357_Y	501_Y	0.921	0.14
250_E	556_W	0.920	0.14
372_K	522_K	0.920	0.14
227_I	394_E	0.916	0.14
143_T	156_Y	0.914	0.14
49_A	440_S	0.913	0.14
343_F	349_H	0.913	0.14
286_P	322_Y	0.910	0.14
250_E	351_L	0.910	0.14
229_L	529_I	0.909	0.14
196_L	259_W	0.908	0.14
40_V	174_R	0.906	0.14
39_R	148_S	0.904	0.14
505_K	547_K	0.902	0.14
319_S	344_N	0.901	0.14
163_F	224_M	0.898	0.13
350_F	537_N	0.898	0.13
422_Y	547_K	0.892	0.13
230_F	542_H	0.885	0.13
54_L	89_W	0.884	0.13
477_S	495_D	0.883	0.13
17_I	126_E	0.882	0.13
252_I	460_S	0.880	0.13
47_N	190_L	0.880	0.13
121_K	124_I	0.874	0.13
268_N	349_H	0.874	0.13
69_P	188_F	0.873	0.13
288_L	463_Y	0.872	0.13
87_I	185_Y	0.871	0.13
120_K	305_E	0.870	0.13
505_K	549_F	0.869	0.13
152_S	549_F	0.866	0.13
433_A	542_H	0.863	0.13
128_K	547_K	0.862	0.13
23_L	290_V	0.861	0.13
265_S	323_A	0.860	0.13
93_F	222_A	0.859	0.13
44_L	355_V	0.859	0.13
58_G	106_V	0.857	0.13
116_Y	385_Q	0.857	0.13
184_L	228_Y	0.857	0.13
269_F	363_A	0.854	0.13
25_Y	395_E	0.851	0.13
470_E	494_V	0.851	0.13
23_L	524_M	0.848	0.13
193_F	558_I	0.847	0.13
468_I	526_G	0.847	0.13
38_I	97_M	0.844	0.13
299_R	460_S	0.844	0.13
406_T	418_E	0.844	0.13
24_L	67_A	0.839	0.13
299_R	383_A	0.839	0.13
97_M	407_F	0.839	0.13
69_P	74_G	0.839	0.13
429_S	539_E	0.838	0.13
155_G	228_Y	0.837	0.13
28_P	32_L	0.837	0.13
47_N	149_G	0.836	0.13
406_T	458_P	0.836	0.13
199_M	221_I	0.833	0.13
171_I	175_E	0.831	0.13
40_V	97_M	0.831	0.13
322_Y	449_T	0.831	0.13
352_R	356_I	0.830	0.12
239_M	494_V	0.830	0.12
115_M	152_S	0.830	0.12
127_P	228_Y	0.829	0.12
449_T	461_Y	0.828	0.12
31_I	477_S	0.828	0.12
177_L	222_A	0.827	0.12
49_A	193_F	0.826	0.12
158_L	410_F	0.824	0.12
23_L	230_F	0.821	0.12
470_E	517_N	0.821	0.12
23_L	377_L	0.820	0.12
340_L	492_L	0.817	0.12
172_S	175_E	0.817	0.12
76_P	137_S	0.817	0.12
275_H	530_F	0.815	0.12
235_L	433_A	0.811	0.12
79_A	483_F	0.811	0.12
261_S	382_V	0.809	0.12
151_L	231_V	0.809	0.12
94_F	503_F	0.806	0.12
149_G	192_F	0.805	0.12
106_V	317_G	0.803	0.12
77_R	233_Y	0.801	0.12
171_I	544_A	0.800	0.12
179_L	526_G	0.799	0.12
211_R	506_N	0.796	0.12
414_E	471_K	0.796	0.12
315_N	452_T	0.795	0.12
154_L	161_W	0.794	0.12
84_W	257_D	0.793	0.12
63_K	170_D	0.793	0.12
408_R	517_N	0.792	0.12
102_I	137_S	0.790	0.12
197_A	521_F	0.790	0.12
20_F	375_K	0.789	0.12
172_S	294_A	0.788	0.12
166_I	467_K	0.788	0.12
242_E	313_V	0.787	0.12
91_H	276_V	0.787	0.12
101_A	139_A	0.785	0.12
406_T	517_N	0.784	0.12
510_T	536_M	0.780	0.12
333_P	554_S	0.779	0.12
107_T	348_F	0.779	0.12
431_R	534_P	0.777	0.12
204_L	217_F	0.775	0.12
210_K	220_S	0.774	0.12
171_I	379_Y	0.773	0.12
117_V	161_W	0.772	0.12
440_S	457_Y	0.772	0.12
265_S	408_R	0.771	0.12
83_E	233_Y	0.771	0.12
237_Y	257_D	0.770	0.12
192_F	273_H	0.767	0.12
159_A	182_L	0.766	0.12
159_A	166_I	0.766	0.12
19_L	458_P	0.764	0.12
215_L	413_S	0.764	0.12
68_I	492_L	0.763	0.12
76_P	176_W	0.762	0.12
91_H	184_L	0.762	0.12
318_L	349_H	0.761	0.12
419_I	517_N	0.760	0.12
274_N	398_Y	0.760	0.12
417_K	517_N	0.760	0.12
96_S	109_V	0.759	0.12
28_P	549_F	0.757	0.11
48_I	411_Y	0.757	0.11
265_S	427_Q	0.757	0.11
141_A	144_P	0.756	0.11
14_Y	197_A	0.755	0.11
94_F	224_M	0.755	0.11
284_I	334_K	0.754	0.11
84_W	380_A	0.754	0.11
137_S	178_T	0.753	0.11
33_K	540_Q	0.753	0.11
422_Y	532_S	0.751	0.11
386_L	529_I	0.749	0.11
20_F	80_F	0.749	0.11
207_A	236_V	0.749	0.11
98_T	101_A	0.748	0.11
239_M	338_A	0.747	0.11
171_I	290_V	0.744	0.11
374_W	521_F	0.742	0.11
177_L	333_P	0.742	0.11
250_E	276_V	0.741	0.11
406_T	524_M	0.740	0.11
160_L	196_L	0.740	0.11
113_F	513_N	0.739	0.11
375_K	545_L	0.738	0.11
331_A	474_E	0.738	0.11
38_I	48_I	0.737	0.11
257_D	260_H	0.737	0.11
89_W	94_F	0.736	0.11
199_M	303_K	0.735	0.11
78_D	456_L	0.735	0.11
276_V	356_I	0.734	0.11
100_Y	235_L	0.733	0.11
192_F	315_N	0.732	0.11
354_L	407_F	0.730	0.11
46_S	50_W	0.730	0.11
40_V	287_I	0.730	0.11
107_T	247_H	0.730	0.11
265_S	523_K	0.729	0.11
135_G	413_S	0.728	0.11
174_R	378_V	0.728	0.11
67_A	177_L	0.726	0.11
197_A	201_C	0.725	0.11
132_I	137_S	0.724	0.11
313_V	375_K	0.723	0.11
237_Y	288_L	0.722	0.11
67_A	523_K	0.718	0.11
384_A	413_S	0.717	0.11
119_L	238_S	0.717	0.11
126_E	301_R	0.717	0.11
71_I	435_I	0.714	0.11
67_A	506_N	0.713	0.11
192_F	356_I	0.713	0.11
413_S	539_E	0.713	0.11
186_S	298_K	0.713	0.11
32_L	395_E	0.713	0.11
192_F	195_F	0.713	0.11
211_R	558_I	0.711	0.11
231_V	269_F	0.710	0.11
53_V	213_W	0.710	0.11
90_L	111_A	0.709	0.11
29_L	521_F	0.708	0.11
18_A	173_W	0.708	0.11
373_G	557_R	0.707	0.11
67_A	375_K	0.706	0.11
230_F	306_N	0.706	0.11
201_C	205_Y	0.704	0.11
23_L	129_A	0.703	0.11
159_A	315_N	0.703	0.11
159_A	398_Y	0.702	0.11
296_L	300_N	0.700	0.11
94_F	204_L	0.700	0.11
155_G	191_G	0.698	0.11
212_R	519_D	0.698	0.11
68_I	386_L	0.698	0.11
127_P	563_T	0.696	0.11
126_E	257_D	0.696	0.11
255_R	328_K	0.695	0.11
222_A	367_I	0.695	0.11
15_L	266_I	0.694	0.11
48_I	530_F	0.694	0.11
39_R	50_W	0.693	0.11
325_W	334_K	0.691	0.11
254_S	502_D	0.691	0.11
44_L	354_L	0.691	0.11
68_I	120_K	0.690	0.11
146_W	192_F	0.690	0.11
195_F	233_Y	0.690	0.11
211_R	551_H	0.690	0.11
384_A	485_E	0.689	0.11
246_M	251_F	0.689	0.11
110_V	333_P	0.689	0.11
35_D	58_G	0.689	0.11
270_V	554_S	0.689	0.11
133_R	380_A	0.688	0.11
94_F	290_V	0.688	0.11
258_V	261_S	0.687	0.11
403_N	518_T	0.684	0.11
312_C	359_S	0.684	0.11
409_E	412_A	0.684	0.11
502_D	533_V	0.683	0.11
296_L	563_T	0.682	0.11
297_F	303_K	0.681	0.11
27_S	137_S	0.681	0.11
166_I	217_F	0.681	0.11
481_Q	485_E	0.680	0.11
31_I	540_Q	0.680	0.11
134_I	378_V	0.679	0.11
131_F	522_K	0.679	0.11
310_F	394_E	0.679	0.11
345_F	526_G	0.679	0.11
108_R	344_N	0.679	0.11
333_P	492_L	0.678	0.10
195_F	325_W	0.678	0.10
244_A	247_H	0.677	0.10
540_Q	550_D	0.676	0.10
76_P	132_I	0.675	0.10
447_F	526_G	0.675	0.10
109_V	414_E	0.674	0.10
215_L	553_D	0.673	0.10
40_V	102_I	0.673	0.10
285_L	423_I	0.672	0.10
175_E	317_G	0.670	0.10
47_N	189_V	0.670	0.10
208_I	492_L	0.669	0.10
424_G	450_L	0.669	0.10
24_L	134_I	0.668	0.10
149_G	325_W	0.667	0.10
244_A	406_T	0.667	0.10
162_A	556_W	0.666	0.10
60_I	187_S	0.666	0.10
17_I	261_S	0.665	0.10
183_P	248_R	0.665	0.10
38_I	354_L	0.664	0.10
80_F	327_N	0.664	0.10
120_K	523_K	0.663	0.10
102_I	316_Y	0.663	0.10
179_L	322_Y	0.662	0.10
353_P	491_Y	0.662	0.10
141_A	164_L	0.662	0.10
287_I	384_A	0.662	0.10
145_F	178_T	0.661	0.10
405_P	556_W	0.661	0.10
76_P	163_F	0.658	0.10
396_Y	409_E	0.656	0.10
311_L	521_F	0.655	0.10
39_R	47_N	0.654	0.10
239_M	246_M	0.654	0.10
154_L	426_P	0.653	0.10
140_F	156_Y	0.650	0.10
468_I	563_T	0.650	0.10
32_L	459_L	0.648	0.10
72_I	225_T	0.648	0.10
483_F	544_A	0.648	0.10
34_E	444_Y	0.647	0.10
351_L	463_Y	0.647	0.10
24_L	503_F	0.647	0.10
126_E	373_G	0.647	0.10
89_W	264_L	0.646	0.10
318_L	330_W	0.645	0.10
49_A	504_K	0.645	0.10
154_L	499_K	0.645	0.10
121_K	306_N	0.645	0.10
62_G	91_H	0.643	0.10
100_Y	444_Y	0.643	0.10
387_M	535_I	0.642	0.10
340_L	358_V	0.642	0.10
120_K	367_I	0.641	0.10
111_A	195_F	0.640	0.10
76_P	348_F	0.638	0.10
201_C	240_L	0.638	0.10
22_L	215_L	0.638	0.10
319_S	398_Y	0.636	0.10
33_K	480_K	0.636	0.10
368_W	378_V	0.635	0.10
77_R	232_E	0.635	0.10
226_S	309_L	0.634	0.10
135_G	384_A	0.634	0.10
111_A	234_R	0.634	0.10
517_N	554_S	0.632	0.10
414_E	551_H	0.632	0.10
23_L	399_G	0.630	0.10
258_V	329_I	0.630	0.10
432_V	473_L	0.629	0.10
251_F	511_I	0.629	0.10
287_I	362_L	0.628	0.10
63_K	237_Y	0.627	0.10
84_W	110_V	0.627	0.10
450_L	494_V	0.627	0.10
211_R	408_R	0.626	0.10
475_K	549_F	0.626	0.10
255_R	269_F	0.626	0.10
161_W	356_I	0.624	0.10
40_V	485_E	0.622	0.10
146_W	151_L	0.622	0.10
468_I	524_M	0.622	0.10
50_W	190_L	0.620	0.10
266_I	383_A	0.619	0.10
214_N	526_G	0.618	0.10
72_I	75_L	0.618	0.10
21_L	309_L	0.617	0.10
218_L	354_L	0.617	0.10
209_T	546_V	0.616	0.10
153_T	191_G	0.616	0.10
294_A	460_S	0.615	0.10
156_Y	247_H	0.615	0.10
470_E	522_K	0.615	0.10
373_G	417_K	0.614	0.10
34_E	135_G	0.614	0.10
339_F	470_E	0.612	0.10
194_F	445_N	0.611	0.10
219_G	536_M	0.611	0.10
303_K	414_E	0.611	0.10
109_V	240_L	0.611	0.10
27_S	418_E	0.610	0.10
144_P	430_Y	0.609	0.10
387_M	524_M	0.608	0.10
196_L	228_Y	0.606	0.10
381_A	407_F	0.605	0.10
209_T	562_E	0.605	0.10
247_H	338_A	0.605	0.10
311_L	355_V	0.604	0.10
254_S	407_F	0.604	0.10
347_R	561_Y	0.603	0.10
24_L	201_C	0.603	0.10
456_L	483_F	0.603	0.10
100_Y	416_F	0.603	0.10
310_F	524_M	0.603	0.10
262_L	316_Y	0.602	0.10
80_F	140_F	0.600	0.10
19_L	113_F	0.599	0.10
156_Y	420_K	0.599	0.10
145_F	276_V	0.599	0.10
248_R	462_K	0.597	0.10
207_A	220_S	0.596	0.10
71_I	523_K	0.593	0.10
426_P	513_N	0.592	0.10
415_Q	517_N	0.591	0.09
146_W	189_V	0.591	0.09
112_F	116_Y	0.590	0.09
146_W	443_Q	0.589	0.09
137_S	418_E	0.588	0.09
45_D	118_L	0.586	0.09
58_G	490_C	0.585	0.09
393_N	436_G	0.584	0.09
83_E	191_G	0.584	0.09
166_I	546_V	0.584	0.09
257_D	370_M	0.583	0.09
56_D	269_F	0.583	0.09
232_E	348_F	0.582	0.09
98_T	223_F	0.581	0.09
104_Q	108_R	0.581	0.09
218_L	528_Y	0.580	0.09
179_L	238_S	0.580	0.09
95_S	254_S	0.580	0.09
247_H	256_H	0.579	0.09
26_V	126_E	0.579	0.09
240_L	295_L	0.577	0.09
189_V	483_F	0.576	0.09
235_L	444_Y	0.575	0.09
256_H	327_N	0.575	0.09
138_L	286_P	0.574	0.09
288_L	309_L	0.573	0.09
32_L	560_L	0.573	0.09
50_W	501_Y	0.571	0.09
239_M	470_E	0.571	0.09
373_G	539_E	0.571	0.09
465_F	526_G	0.570	0.09
91_H	103_S	0.570	0.09
117_V	262_L	0.569	0.09
212_R	380_A	0.568	0.09
35_D	314_L	0.567	0.09
16_W	184_L	0.567	0.09
17_I	527_R	0.565	0.09
342_E	456_L	0.565	0.09
171_I	186_S	0.565	0.09
322_Y	456_L	0.564	0.09
93_F	460_S	0.564	0.09
136_V	554_S	0.563	0.09
155_G	442_A	0.562	0.09
488_S	511_I	0.562	0.09
257_D	288_L	0.562	0.09
350_F	530_F	0.561	0.09
174_R	278_T	0.559	0.09
329_I	402_Y	0.559	0.09
270_V	495_D	0.557	0.09
164_L	431_R	0.556	0.09
44_L	71_I	0.556	0.09
264_L	441_I	0.556	0.09
44_L	218_L	0.556	0.09
355_V	429_S	0.556	0.09
126_E	467_K	0.554	0.09
58_G	317_G	0.554	0.09
386_L	545_L	0.553	0.09
460_S	485_E	0.553	0.09
313_V	382_V	0.552	0.09
129_A	562_E	0.552	0.09
31_I	177_L	0.552	0.09
96_S	562_E	0.552	0.09
342_E	556_W	0.552	0.09
406_T	478_R	0.552	0.09
135_G	394_E	0.551	0.09
159_A	179_L	0.551	0.09
91_H	557_R	0.551	0.09
48_I	72_I	0.551	0.09
439_P	451_D	0.551	0.09
177_L	397_T	0.550	0.09
291_V	539_E	0.549	0.09
22_L	292_F	0.549	0.09
29_L	338_A	0.547	0.09
446_G	558_I	0.547	0.09
191_G	318_L	0.544	0.09
19_L	563_T	0.544	0.09
222_A	492_L	0.544	0.09
37_H	217_F	0.541	0.09
403_N	481_Q	0.540	0.09
482_Y	537_N	0.540	0.09
156_Y	324_F	0.540	0.09
283_V	558_I	0.540	0.09
220_S	460_S	0.539	0.09
312_C	364_L	0.539	0.09
155_G	318_L	0.539	0.09
96_S	383_A	0.538	0.09
69_P	412_A	0.537	0.09
322_Y	484_D	0.536	0.09
373_G	527_R	0.535	0.09
113_F	387_M	0.535	0.09
65_D	313_V	0.534	0.09
69_P	555_A	0.534	0.09
20_F	418_E	0.533	0.09
22_L	218_L	0.533	0.09
42_D	45_D	0.532	0.09
137_S	265_S	0.532	0.09
272_G	487_G	0.532	0.09
71_I	121_K	0.532	0.09
289_M	292_F	0.531	0.09
200_A	282_V	0.529	0.09
223_F	540_Q	0.529	0.09
404_A	504_K	0.529	0.09
392_F	420_K	0.528	0.09
262_L	290_V	0.527	0.09
318_L	321_W	0.527	0.09
184_L	495_D	0.525	0.09
247_H	275_H	0.524	0.09
487_G	531_S	0.523	0.09
263_R	290_V	0.522	0.09
94_F	262_L	0.522	0.09
121_K	170_D	0.521	0.09
224_M	286_P	0.521	0.09
91_H	131_F	0.520	0.09
17_I	285_L	0.520	0.09
184_L	231_V	0.520	0.09
339_F	520_V	0.520	0.09
306_N	529_I	0.519	0.09
151_L	505_K	0.519	0.09
134_I	173_W	0.518	0.09
240_L	390_A	0.516	0.09
256_H	337_F	0.516	0.09
330_W	357_Y	0.514	0.09
114_G	549_F	0.513	0.09
527_R	562_E	0.512	0.09
393_N	482_Y	0.510	0.09
43_N	543_L	0.509	0.09
22_L	312_C	0.508	0.09
126_E	309_L	0.507	0.09
267_K	271_Y	0.507	0.09
121_K	382_V	0.507	0.09
192_F	344_N	0.506	0.09
19_L	425_R	0.505	0.09
193_F	236_V	0.505	0.09
459_L	472_E	0.505	0.09
364_L	378_V	0.504	0.09
132_I	378_V	0.504	0.09
138_L	149_G	0.504	0.09
274_N	350_F	0.504	0.09
143_T	426_P	0.503	0.09
268_N	325_W	0.503	0.09
240_L	392_F	0.502	0.09
123_I	372_K	0.502	0.09
38_I	445_N	0.502	0.09
71_I	142_L	0.501	0.09
112_F	165_N	0.501	0.09
273_H	325_W	0.501	0.09
41_H	537_N	0.501	0.09
437_L	516_L	0.501	0.09
199_M	224_M	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3wajA	1	0.7411	82.6	0.979	Contact Map
3rceA	1	0.8316	74.8	0.981	Contact Map
2i8dA	2	0.1791	35.2	0.985	Contact Map
2ehpA	2	0.1826	11.8	0.988	Contact Map
2m8rA	1	0.0656	8.5	0.989	Contact Map
2oc6A	1	0.1844	7.6	0.989	Contact Map
3hd7A	1	0.0585	7.3	0.989	Contact Map
2dt7A	1	0.0674	4.8	0.99	Contact Map
2b4wA	1	0.1986	4.7	0.99	Contact Map
1jx6A	1	0.1933	4.5	0.99	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.