YCEG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YCEG - Uncharacterized protein YceG

UniProt:	O34809	Sequences: MRQEELTIHKALPADGDWKSLLFQPLPERDHYETAQGLSFSRLAGQILGTPIDETDYYNELYELSVNDRITILSETLDKTIEPETFQKLQHIHSINQKEKGLSVSRFVAFLDGEKLIAKHSNPLMHRHLRKALMTLLHTFADSHEKGLNHPDFRRVLLDVSKFSLNHLNPWLEKTDIEREMPKVVWYGDATKSQLYFLYYLMLVGCDVLLFHPAGTDQLALVDPKQELGFTEKLPDVSELQPFPKEKPDRKSTVAYRSTKEIEHVLNHEESMLYKPWQFRDHTPVSVTLKTTYDELFLITKERAFIRPNFKADKHSIEIPNVFAKIMGVSKDNKEYWNRLHTLADYQETEMVRSFPFTEEIKSNYQFHYSHALDQEGNIDPDKLMASNVWQYKQLPAGVQTAIAKTISRMCRYPRLKALHQEQVKDVQIYLFKQTTNLPANLLKLIQMFDYAQTVPKLVLYHTEMSGGLTRSDAAALLFLNEIGIDIIIYNPPGHQDIEQFIEEDQYDIHWLDDMVFQQDYKEPSLVKRLFRTITQK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	537 (495)
Sequences:	118 (100)
Seq/√Len:	4.5

BACSU - YCEG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
356_P	473_D	3.516	0.79
295_E	299_I	3.361	0.75
144_H	332_D	3.257	0.73
46_Q	223_D	3.171	0.71
379_I	383_K	3.104	0.69
347_Q	448_M	2.972	0.65
108_V	134_M	2.855	0.62
117_I	161_S	2.821	0.61
196_Y	277_W	2.781	0.60
296_L	472_S	2.694	0.57
117_I	185_V	2.657	0.56
288_T	481_N	2.654	0.56
340_L	349_T	2.549	0.53
104_V	144_H	2.530	0.52
393_K	443_L	2.529	0.52
302_E	524_P	2.405	0.48
92_I	161_S	2.349	0.47
168_L	487_I	2.273	0.44
223_D	229_G	2.265	0.44
435_T	483_I	2.239	0.43
408_S	412_R	2.194	0.42
260_K	340_L	2.185	0.42
163_F	272_M	2.179	0.41
151_P	210_L	2.157	0.41
291_T	295_E	2.125	0.40
501_F	514_D	2.114	0.40
255_A	299_I	2.103	0.39
158_L	270_E	2.080	0.39
42_R	258_S	2.072	0.38
155_R	497_D	2.062	0.38
250_R	273_L	2.051	0.38
329_V	457_K	2.038	0.37
25_P	29_R	2.017	0.37
160_V	317_I	2.014	0.37
266_L	290_K	2.006	0.36
296_L	515_M	1.996	0.36
73_L	451_Y	1.991	0.36
41_S	452_A	1.982	0.36
321_N	384_L	1.977	0.36
78_D	469_L	1.959	0.35
207_D	336_Y	1.929	0.34
431_L	482_E	1.919	0.34
137_L	347_Q	1.910	0.34
222_V	505_D	1.904	0.34
79_K	217_D	1.894	0.33
165_L	389_V	1.882	0.33
251_K	526_L	1.860	0.32
22_L	487_I	1.858	0.32
352_V	445_L	1.855	0.32
255_A	295_E	1.839	0.32
352_V	487_I	1.827	0.31
379_I	384_L	1.815	0.31
246_E	261_E	1.815	0.31
29_R	33_E	1.807	0.31
431_L	476_A	1.806	0.31
287_V	383_K	1.781	0.30
441_N	459_V	1.717	0.29
246_E	524_P	1.712	0.29
379_I	444_K	1.697	0.28
367_F	523_E	1.695	0.28
67_N	129_L	1.689	0.28
255_A	261_E	1.661	0.27
28_E	403_I	1.658	0.27
267_N	457_K	1.658	0.27
258_S	295_E	1.650	0.27
380_D	519_Q	1.645	0.27
259_T	513_D	1.636	0.27
314_K	393_K	1.634	0.27
304_A	455_V	1.626	0.26
90_Q	439_P	1.618	0.26
337_W	356_P	1.612	0.26
462_H	469_L	1.610	0.26
72_I	158_L	1.609	0.26
369_Y	439_P	1.607	0.26
137_L	295_E	1.587	0.25
384_L	490_Y	1.585	0.25
343_L	480_L	1.582	0.25
17_D	208_V	1.562	0.25
459_V	528_K	1.558	0.25
421_Q	470_T	1.549	0.25
125_M	498_I	1.549	0.25
204_V	476_A	1.545	0.25
200_Y	516_V	1.542	0.24
289_L	449_F	1.535	0.24
253_T	325_K	1.523	0.24
295_E	508_D	1.523	0.24
17_D	125_M	1.519	0.24
382_D	505_D	1.518	0.24
104_V	332_D	1.494	0.23
88_K	166_N	1.493	0.23
184_V	421_Q	1.488	0.23
197_F	271_S	1.488	0.23
165_L	298_L	1.486	0.23
487_I	500_Q	1.482	0.23
454_T	459_V	1.482	0.23
16_G	351_M	1.472	0.23
219_L	417_K	1.471	0.23
274_Y	294_D	1.467	0.23
207_D	457_K	1.453	0.22
126_H	306_I	1.451	0.22
19_K	489_I	1.446	0.22
145_E	204_V	1.440	0.22
396_P	511_W	1.433	0.22
151_P	326_I	1.427	0.22
213_P	416_L	1.415	0.22
46_Q	442_L	1.413	0.22
302_E	431_L	1.411	0.22
164_S	268_H	1.411	0.22
44_A	272_M	1.410	0.22
255_A	291_T	1.410	0.22
304_A	382_D	1.405	0.21
46_Q	219_L	1.403	0.21
208_V	349_T	1.402	0.21
144_H	272_M	1.401	0.21
197_F	494_G	1.401	0.21
344_A	351_M	1.399	0.21
109_A	127_R	1.398	0.21
292_T	508_D	1.397	0.21
107_F	151_P	1.392	0.21
294_D	508_D	1.389	0.21
442_L	476_A	1.387	0.21
253_T	400_Q	1.386	0.21
122_N	506_Q	1.382	0.21
46_Q	229_G	1.381	0.21
440_A	485_I	1.381	0.21
246_E	302_E	1.380	0.21
400_Q	492_P	1.369	0.21
244_P	289_L	1.363	0.21
192_K	306_I	1.359	0.21
255_A	258_S	1.357	0.20
446_I	483_I	1.352	0.20
92_I	501_F	1.351	0.20
194_Q	410_M	1.337	0.20
258_S	499_E	1.336	0.20
267_N	406_T	1.320	0.20
268_H	274_Y	1.316	0.20
92_I	117_I	1.316	0.20
481_N	507_Y	1.310	0.20
117_I	355_F	1.302	0.19
19_K	442_L	1.298	0.19
332_D	335_E	1.298	0.19
89_L	94_S	1.297	0.19
272_M	305_F	1.297	0.19
144_H	353_R	1.292	0.19
196_Y	512_L	1.288	0.19
244_P	337_W	1.287	0.19
107_F	192_K	1.282	0.19
296_L	321_N	1.281	0.19
209_L	324_A	1.276	0.19
385_M	401_T	1.276	0.19
255_A	473_D	1.272	0.19
121_S	442_L	1.272	0.19
96_N	111_L	1.271	0.19
293_Y	356_P	1.267	0.19
312_A	316_S	1.263	0.19
164_S	173_E	1.260	0.19
78_D	239_E	1.258	0.19
294_D	302_E	1.258	0.19
45_G	387_S	1.255	0.19
17_D	20_S	1.249	0.18
46_Q	387_S	1.249	0.18
114_E	381_P	1.248	0.18
197_F	201_L	1.248	0.18
291_T	299_I	1.247	0.18
77_L	193_S	1.244	0.18
231_T	437_N	1.235	0.18
277_W	512_L	1.232	0.18
261_E	299_I	1.230	0.18
301_K	351_M	1.229	0.18
458_L	498_I	1.228	0.18
243_F	271_S	1.228	0.18
56_D	282_H	1.227	0.18
201_L	480_L	1.220	0.18
198_L	323_F	1.220	0.18
348_E	470_T	1.217	0.18
464_E	467_G	1.216	0.18
321_N	428_Q	1.215	0.18
246_E	347_Q	1.211	0.18
310_F	456_P	1.206	0.18
307_R	450_D	1.206	0.18
310_F	328_G	1.206	0.18
307_R	486_D	1.206	0.18
328_G	450_D	1.206	0.18
328_G	456_P	1.206	0.18
310_F	450_D	1.206	0.18
328_G	486_D	1.206	0.18
307_R	310_F	1.206	0.18
307_R	456_P	1.206	0.18
307_R	328_G	1.206	0.18
310_F	486_D	1.206	0.18
49_G	328_G	1.206	0.18
45_G	477_L	1.206	0.18
49_G	456_P	1.206	0.18
49_G	450_D	1.206	0.18
450_D	456_P	1.206	0.18
456_P	486_D	1.206	0.18
49_G	486_D	1.206	0.18
49_G	310_F	1.206	0.18
450_D	486_D	1.206	0.18
49_G	307_R	1.206	0.18
204_V	489_I	1.204	0.18
403_I	528_K	1.197	0.17
29_R	507_Y	1.196	0.17
190_A	408_S	1.195	0.17
403_I	479_F	1.193	0.17
187_Y	461_Y	1.188	0.17
378_N	507_Y	1.187	0.17
300_T	406_T	1.187	0.17
232_E	326_I	1.168	0.17
62_Y	234_L	1.166	0.17
395_L	499_E	1.165	0.17
205_G	461_Y	1.161	0.17
258_S	299_I	1.160	0.17
192_K	433_K	1.157	0.17
62_Y	80_T	1.156	0.17
205_G	512_L	1.150	0.17
259_T	496_Q	1.150	0.17
152_D	521_Y	1.148	0.17
133_L	295_E	1.146	0.17
98_K	122_N	1.141	0.16
267_N	279_F	1.141	0.16
119_K	286_S	1.139	0.16
325_K	499_E	1.137	0.16
258_S	395_L	1.137	0.16
131_K	350_E	1.136	0.16
198_L	208_V	1.135	0.16
232_E	312_A	1.131	0.16
229_G	251_K	1.128	0.16
155_R	186_W	1.125	0.16
59_N	256_Y	1.123	0.16
104_V	272_M	1.123	0.16
54_E	477_L	1.122	0.16
170_P	209_L	1.120	0.16
162_K	471_R	1.118	0.16
171_W	390_W	1.118	0.16
22_L	46_Q	1.117	0.16
333_N	412_R	1.116	0.16
194_Q	490_Y	1.116	0.16
244_P	473_D	1.111	0.16
62_Y	314_K	1.107	0.16
289_L	295_E	1.106	0.16
281_D	460_L	1.105	0.16
185_V	198_L	1.103	0.16
384_L	462_H	1.102	0.16
62_Y	180_E	1.098	0.16
402_A	406_T	1.097	0.16
458_L	510_H	1.097	0.16
317_I	320_P	1.093	0.16
431_L	475_A	1.091	0.16
160_V	185_V	1.091	0.16
246_E	323_F	1.086	0.16
297_F	516_V	1.081	0.16
167_H	414_P	1.078	0.15
58_Y	161_S	1.077	0.15
252_S	392_Y	1.076	0.15
378_N	470_T	1.076	0.15
171_W	272_M	1.075	0.15
40_F	436_T	1.070	0.15
393_K	500_Q	1.066	0.15
157_L	211_F	1.063	0.15
29_R	243_F	1.057	0.15
261_E	271_S	1.054	0.15
141_A	340_L	1.053	0.15
185_V	377_G	1.038	0.15
187_Y	196_Y	1.038	0.15
46_Q	82_E	1.034	0.15
395_L	400_Q	1.034	0.15
289_L	400_Q	1.034	0.15
44_A	390_W	1.029	0.15
193_S	390_W	1.026	0.15
298_L	306_I	1.023	0.15
348_E	479_F	1.018	0.15
155_R	406_T	1.017	0.14
25_P	33_E	1.016	0.14
118_A	389_V	1.010	0.14
260_K	469_L	1.009	0.14
87_Q	271_S	1.008	0.14
159_D	190_A	1.003	0.14
36_Q	326_I	1.002	0.14
244_P	447_Q	1.002	0.14
148_L	200_Y	1.001	0.14
83_P	459_V	1.000	0.14
255_A	395_L	0.999	0.14
265_V	458_L	0.998	0.14
244_P	356_P	0.997	0.14
319_I	322_V	0.994	0.14
194_Q	300_T	0.993	0.14
274_Y	443_L	0.989	0.14
214_A	309_N	0.988	0.14
71_T	129_L	0.986	0.14
258_S	379_I	0.986	0.14
232_E	443_L	0.984	0.14
243_F	325_K	0.980	0.14
496_Q	499_E	0.976	0.14
126_H	133_L	0.971	0.14
82_E	98_K	0.968	0.14
151_P	398_G	0.964	0.14
259_T	399_V	0.962	0.14
244_P	291_T	0.961	0.14
221_L	229_G	0.958	0.14
344_A	521_Y	0.958	0.14
61_L	207_D	0.958	0.14
109_A	368_H	0.958	0.14
247_K	259_T	0.953	0.14
109_A	186_W	0.948	0.13
377_G	449_F	0.948	0.13
324_A	510_H	0.947	0.13
87_Q	467_G	0.947	0.13
340_L	500_Q	0.943	0.13
410_M	428_Q	0.943	0.13
325_K	400_Q	0.937	0.13
299_I	499_E	0.934	0.13
302_E	350_E	0.934	0.13
272_M	487_I	0.929	0.13
172_L	380_D	0.929	0.13
163_F	343_L	0.926	0.13
124_L	476_A	0.925	0.13
438_L	447_Q	0.924	0.13
280_R	432_F	0.921	0.13
212_H	265_V	0.917	0.13
295_E	395_L	0.916	0.13
349_T	518_Q	0.915	0.13
69_R	176_D	0.909	0.13
244_P	255_A	0.908	0.13
203_L	451_Y	0.906	0.13
352_V	520_D	0.904	0.13
370_S	445_L	0.903	0.13
92_I	279_F	0.902	0.13
422_E	451_Y	0.901	0.13
117_I	265_V	0.899	0.13
36_Q	136_L	0.896	0.13
61_L	481_N	0.894	0.13
158_L	299_I	0.893	0.13
78_D	439_P	0.892	0.13
232_E	329_V	0.888	0.13
79_K	127_R	0.888	0.13
441_N	458_L	0.885	0.13
276_P	512_L	0.885	0.13
95_I	161_S	0.885	0.13
287_V	340_L	0.883	0.13
160_V	429_I	0.882	0.13
84_E	270_E	0.882	0.13
129_L	374_D	0.881	0.13
457_K	480_L	0.878	0.13
290_K	299_I	0.875	0.12
233_K	438_L	0.874	0.12
89_L	402_A	0.872	0.12
175_T	178_E	0.861	0.12
408_S	471_R	0.859	0.12
302_E	323_F	0.856	0.12
44_A	171_W	0.853	0.12
117_I	213_P	0.852	0.12
298_L	446_I	0.852	0.12
436_T	459_V	0.851	0.12
136_L	335_E	0.851	0.12
278_Q	486_D	0.849	0.12
49_G	278_Q	0.849	0.12
278_Q	328_G	0.849	0.12
278_Q	310_F	0.849	0.12
278_Q	450_D	0.849	0.12
278_Q	307_R	0.849	0.12
278_Q	456_P	0.849	0.12
352_V	459_V	0.848	0.12
136_L	505_D	0.847	0.12
35_A	322_V	0.847	0.12
155_R	390_W	0.846	0.12
380_D	408_S	0.846	0.12
153_F	171_W	0.846	0.12
293_Y	473_D	0.845	0.12
295_E	510_H	0.845	0.12
159_D	162_K	0.844	0.12
442_L	470_T	0.842	0.12
235_P	488_I	0.841	0.12
130_R	409_R	0.840	0.12
164_S	204_V	0.838	0.12
395_L	473_D	0.836	0.12
72_I	371_H	0.836	0.12
90_Q	107_F	0.835	0.12
294_D	356_P	0.832	0.12
185_V	299_I	0.832	0.12
138_H	357_F	0.831	0.12
138_H	211_F	0.830	0.12
359_E	446_I	0.830	0.12
104_V	351_M	0.829	0.12
321_N	379_I	0.829	0.12
57_Y	328_G	0.828	0.12
57_Y	486_D	0.828	0.12
49_G	57_Y	0.828	0.12
57_Y	307_R	0.828	0.12
57_Y	456_P	0.828	0.12
57_Y	450_D	0.828	0.12
57_Y	310_F	0.828	0.12
262_I	496_Q	0.826	0.12
72_I	436_T	0.826	0.12
123_P	459_V	0.826	0.12
320_P	486_D	0.824	0.12
320_P	456_P	0.824	0.12
49_G	320_P	0.824	0.12
320_P	328_G	0.824	0.12
140_F	383_K	0.824	0.12
307_R	320_P	0.824	0.12
320_P	450_D	0.824	0.12
310_F	320_P	0.824	0.12
125_M	176_D	0.823	0.12
200_Y	224_P	0.820	0.12
311_K	518_Q	0.817	0.12
94_S	263_E	0.817	0.12
123_P	498_I	0.815	0.12
111_L	295_E	0.814	0.12
110_F	398_G	0.813	0.12
111_L	410_M	0.810	0.12
54_E	322_V	0.805	0.12
298_L	457_K	0.804	0.12
216_T	286_S	0.804	0.12
399_V	515_M	0.799	0.11
155_R	159_D	0.799	0.11
250_R	288_T	0.796	0.11
330_S	490_Y	0.795	0.11
200_Y	445_L	0.792	0.11
141_A	383_K	0.791	0.11
440_A	458_L	0.788	0.11
130_R	290_K	0.788	0.11
103_S	109_A	0.788	0.11
24_Q	80_T	0.786	0.11
272_M	470_T	0.786	0.11
207_D	486_D	0.785	0.11
207_D	456_P	0.785	0.11
207_D	450_D	0.785	0.11
207_D	328_G	0.785	0.11
207_D	310_F	0.785	0.11
49_G	207_D	0.785	0.11
207_D	307_R	0.785	0.11
343_L	395_L	0.785	0.11
170_P	523_E	0.783	0.11
324_A	395_L	0.781	0.11
304_A	319_I	0.778	0.11
261_E	295_E	0.777	0.11
130_R	280_R	0.775	0.11
298_L	484_G	0.768	0.11
392_Y	458_L	0.768	0.11
270_E	513_D	0.767	0.11
235_P	443_L	0.766	0.11
270_E	382_D	0.764	0.11
139_T	191_T	0.762	0.11
455_V	458_L	0.762	0.11
139_T	452_A	0.761	0.11
487_I	524_P	0.760	0.11
259_T	508_D	0.760	0.11
243_F	250_R	0.760	0.11
310_F	492_P	0.759	0.11
456_P	492_P	0.759	0.11
486_D	492_P	0.759	0.11
450_D	492_P	0.759	0.11
49_G	492_P	0.759	0.11
328_G	492_P	0.759	0.11
307_R	492_P	0.759	0.11
191_T	352_V	0.758	0.11
86_F	105_S	0.757	0.11
59_N	84_E	0.756	0.11
260_K	360_E	0.754	0.11
120_H	355_F	0.753	0.11
265_V	305_F	0.753	0.11
92_I	518_Q	0.753	0.11
132_A	529_R	0.749	0.11
194_Q	281_D	0.748	0.11
188_G	377_G	0.748	0.11
163_F	317_I	0.747	0.11
306_I	430_Y	0.743	0.11
332_D	402_A	0.743	0.11
299_I	356_P	0.743	0.11
157_L	206_C	0.743	0.11
253_T	307_R	0.741	0.11
253_T	310_F	0.741	0.11
253_T	328_G	0.741	0.11
253_T	450_D	0.741	0.11
253_T	456_P	0.741	0.11
253_T	486_D	0.741	0.11
49_G	253_T	0.741	0.11
22_L	343_L	0.740	0.11
276_P	279_F	0.739	0.11
55_T	105_S	0.737	0.11
258_S	282_H	0.737	0.11
40_F	46_Q	0.732	0.11
334_K	514_D	0.732	0.11
246_E	403_I	0.732	0.11
315_H	445_L	0.731	0.11
36_Q	274_Y	0.728	0.11
279_F	496_Q	0.728	0.11
332_D	431_L	0.728	0.11
23_F	105_S	0.727	0.11
459_V	505_D	0.726	0.11
91_H	161_S	0.725	0.11
92_I	185_V	0.725	0.11
72_I	515_M	0.724	0.11
109_A	161_S	0.724	0.11
431_L	521_Y	0.721	0.11
349_T	457_K	0.720	0.11
126_H	512_L	0.719	0.11
62_Y	510_H	0.719	0.11
474_A	502_I	0.719	0.11
72_I	252_S	0.717	0.10
275_K	461_Y	0.713	0.10
296_L	397_A	0.713	0.10
155_R	312_A	0.712	0.10
64_L	160_V	0.712	0.10
234_L	338_N	0.710	0.10
121_S	157_L	0.706	0.10
179_R	436_T	0.704	0.10
73_L	103_S	0.702	0.10
410_M	495_H	0.702	0.10
293_Y	337_W	0.700	0.10
17_D	91_H	0.700	0.10
280_R	491_N	0.699	0.10
184_V	203_L	0.699	0.10
62_Y	266_L	0.699	0.10
156_V	193_S	0.698	0.10
210_L	287_V	0.698	0.10
303_R	513_D	0.695	0.10
99_E	364_N	0.695	0.10
40_F	479_F	0.694	0.10
206_C	513_D	0.694	0.10
78_D	464_E	0.692	0.10
247_K	250_R	0.690	0.10
58_Y	240_L	0.688	0.10
71_T	155_R	0.687	0.10
147_G	369_Y	0.687	0.10
271_S	443_L	0.687	0.10
305_F	327_M	0.685	0.10
170_P	443_L	0.685	0.10
321_N	472_S	0.685	0.10
110_F	156_V	0.684	0.10
107_F	526_L	0.684	0.10
238_S	470_T	0.683	0.10
257_R	292_T	0.682	0.10
255_A	495_H	0.681	0.10
395_L	492_P	0.680	0.10
114_E	376_E	0.676	0.10
258_S	479_F	0.675	0.10
137_L	518_Q	0.675	0.10
204_V	343_L	0.675	0.10
326_I	354_S	0.674	0.10
158_L	394_Q	0.674	0.10
336_Y	457_K	0.672	0.10
216_T	460_L	0.672	0.10
442_L	489_I	0.671	0.10
129_L	490_Y	0.671	0.10
290_K	478_L	0.670	0.10
376_E	485_I	0.670	0.10
309_N	477_L	0.669	0.10
84_E	265_V	0.668	0.10
299_I	511_W	0.667	0.10
255_A	400_Q	0.667	0.10
132_A	176_D	0.666	0.10
243_F	253_T	0.665	0.10
256_Y	495_H	0.664	0.10
373_L	451_Y	0.662	0.10
432_F	445_L	0.661	0.10
103_S	337_W	0.660	0.10
251_K	309_N	0.658	0.10
509_I	513_D	0.657	0.10
444_K	480_L	0.656	0.10
92_I	402_A	0.656	0.10
182_P	335_E	0.654	0.10
342_T	528_K	0.653	0.10
442_L	459_V	0.652	0.10
374_D	483_I	0.649	0.10
174_K	236_D	0.647	0.10
133_L	231_T	0.644	0.10
35_A	108_V	0.644	0.10
203_L	458_L	0.643	0.10
26_L	296_L	0.642	0.10
42_R	202_M	0.642	0.10
300_T	457_K	0.642	0.10
136_L	403_I	0.641	0.10
298_L	438_L	0.639	0.10
509_I	518_Q	0.638	0.10
54_E	461_Y	0.638	0.10
235_P	239_E	0.638	0.10
475_A	495_H	0.636	0.10
185_V	240_L	0.636	0.10
485_I	526_L	0.636	0.10
333_N	361_I	0.636	0.10
371_H	436_T	0.635	0.10
290_K	334_K	0.634	0.10
324_A	378_N	0.634	0.10
17_D	376_E	0.632	0.10
290_K	338_N	0.630	0.10
73_L	123_P	0.628	0.10
402_A	479_F	0.628	0.10
261_E	288_T	0.628	0.10
475_A	482_E	0.627	0.09
159_D	471_R	0.626	0.09
263_E	306_I	0.625	0.09
377_G	510_H	0.625	0.09
349_T	375_Q	0.625	0.09
456_P	484_G	0.624	0.09
307_R	484_G	0.624	0.09
310_F	484_G	0.624	0.09
328_G	484_G	0.624	0.09
450_D	484_G	0.624	0.09
49_G	484_G	0.624	0.09
422_E	491_N	0.623	0.09
198_L	461_Y	0.623	0.09
432_F	475_A	0.622	0.09
294_D	407_I	0.621	0.09
97_Q	125_M	0.617	0.09
47_I	72_I	0.615	0.09
278_Q	449_F	0.614	0.09
324_A	527_V	0.613	0.09
208_V	345_D	0.612	0.09
382_D	386_A	0.612	0.09
198_L	359_E	0.610	0.09
358_T	434_Q	0.610	0.09
158_L	321_N	0.609	0.09
88_K	513_D	0.607	0.09
488_I	504_E	0.607	0.09
71_T	136_L	0.607	0.09
153_F	184_V	0.606	0.09
216_T	352_V	0.606	0.09
235_P	326_I	0.606	0.09
262_I	270_E	0.606	0.09
262_I	509_I	0.606	0.09
323_F	411_C	0.605	0.09
71_T	96_N	0.604	0.09
94_S	429_I	0.603	0.09
107_F	200_Y	0.601	0.09
213_P	404_A	0.601	0.09
238_S	382_D	0.601	0.09
259_T	438_L	0.601	0.09
164_S	403_I	0.597	0.09
47_I	314_K	0.596	0.09
86_F	152_D	0.596	0.09
282_H	379_I	0.596	0.09
392_Y	495_H	0.595	0.09
451_Y	513_D	0.595	0.09
73_L	404_A	0.592	0.09
43_L	210_L	0.592	0.09
279_F	430_Y	0.589	0.09
244_P	256_Y	0.585	0.09
458_L	502_I	0.585	0.09
148_L	512_L	0.585	0.09
79_K	187_Y	0.584	0.09
399_V	483_I	0.584	0.09
224_P	362_K	0.583	0.09
431_L	495_H	0.582	0.09
309_N	447_Q	0.582	0.09
64_L	436_T	0.580	0.09
274_Y	293_Y	0.580	0.09
117_I	197_F	0.577	0.09
69_R	326_I	0.577	0.09
197_F	398_G	0.574	0.09
290_K	369_Y	0.573	0.09
385_M	515_M	0.572	0.09
516_V	525_S	0.570	0.09
147_G	180_E	0.568	0.09
205_G	513_D	0.567	0.09
393_K	518_Q	0.566	0.09
79_K	103_S	0.565	0.09
128_H	446_I	0.565	0.09
84_E	267_N	0.564	0.09
294_D	451_Y	0.564	0.09
91_H	114_E	0.563	0.09
340_L	477_L	0.563	0.09
259_T	452_A	0.562	0.09
244_P	324_A	0.561	0.09
72_I	94_S	0.561	0.09
356_P	434_Q	0.561	0.09
104_V	335_E	0.561	0.09
266_L	520_D	0.560	0.09
130_R	334_K	0.559	0.09
29_R	185_V	0.558	0.09
299_I	337_W	0.556	0.09
246_E	290_K	0.555	0.09
250_R	508_D	0.555	0.09
258_S	325_K	0.554	0.09
161_S	185_V	0.554	0.09
197_F	513_D	0.553	0.09
431_L	434_Q	0.553	0.09
29_R	32_Y	0.552	0.09
341_H	517_F	0.550	0.09
406_T	482_E	0.548	0.09
132_A	457_K	0.548	0.09
34_T	522_K	0.547	0.09
268_H	408_S	0.545	0.09
344_A	381_P	0.542	0.09
192_K	477_L	0.541	0.09
347_Q	514_D	0.541	0.09
441_N	507_Y	0.541	0.09
202_M	258_S	0.541	0.09
286_S	402_A	0.540	0.09
187_Y	205_G	0.537	0.09
196_Y	224_P	0.537	0.09
375_Q	515_M	0.537	0.09
170_P	468_G	0.537	0.09
432_F	491_N	0.536	0.09
350_E	458_L	0.536	0.09
516_V	519_Q	0.535	0.09
261_E	291_T	0.534	0.09
112_D	117_I	0.534	0.09
350_E	498_I	0.534	0.09
87_Q	234_L	0.534	0.09
75_E	432_F	0.532	0.09
265_V	293_Y	0.532	0.09
163_F	476_A	0.531	0.09
68_D	185_V	0.531	0.09
276_P	496_Q	0.529	0.09
159_D	196_Y	0.528	0.08
181_M	505_D	0.527	0.08
188_G	207_D	0.527	0.08
159_D	186_W	0.526	0.08
364_N	438_L	0.526	0.08
204_V	214_A	0.526	0.08
36_Q	124_L	0.525	0.08
243_F	294_D	0.525	0.08
21_L	489_I	0.524	0.08
256_Y	392_Y	0.520	0.08
355_F	460_L	0.519	0.08
253_T	289_L	0.519	0.08
75_E	193_S	0.518	0.08
479_F	495_H	0.518	0.08
223_D	442_L	0.517	0.08
282_H	463_T	0.514	0.08
36_Q	391_Q	0.514	0.08
50_T	420_H	0.514	0.08
186_W	193_S	0.513	0.08
300_T	518_Q	0.513	0.08
159_D	491_N	0.511	0.08
352_V	473_D	0.511	0.08
268_H	403_I	0.511	0.08
124_L	158_L	0.510	0.08
446_I	499_E	0.510	0.08
187_Y	222_V	0.510	0.08
67_N	274_Y	0.510	0.08
295_E	400_Q	0.509	0.08
77_L	216_T	0.508	0.08
391_Q	412_R	0.507	0.08
200_Y	241_Q	0.507	0.08
196_Y	335_E	0.504	0.08
432_F	460_L	0.503	0.08
341_H	522_K	0.502	0.08
229_G	465_M	0.500	0.08
199_Y	402_A	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1j1jA	4	0.3557	15.3	0.986	Contact Map
1ccwA	1	0.1434	9.3	0.987	Contact Map
2k9lA	1	0.1341	8.5	0.987	Contact Map
3dkrA	1	0.1508	7.7	0.988	Contact Map
2pvbA	1	0.1918	7.7	0.988	Contact Map
2iw1A	1	0.1415	6.3	0.988	Contact Map
3axjA	1	0.378	6.2	0.988	Contact Map
2kwpA	1	0.1695	5.7	0.988	Contact Map
2yxbA	1	0.1453	5.1	0.989	Contact Map
2vycA	5	0.1397	5.1	0.989	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.013 seconds.