PKSE - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PKSE - Polyketide biosynthesis protein PksE

UniProt:	O34787	Sequences: MITYVFPGQGSQQKGMGQGLFEQYQHLTDQADQILGYSIEKLCTEKSYLDVNHTEYTQPALYVVNALSYLKRVEETGRKPDFAAGHSLGEYNALMAAGAFDFETGLRLVKKRGELMGRITGGGMAAVIGLSKEQVTAVLEEHRLYDIDVANENTPQQIVISGPKKEIEKARAVFENTKDVKLFHPLNVSGAFHSRYMNEAKQVFKQYIDSFQFAPLAIPVISNVYAEPYHQDRLKDTLSEQMDNTVKWTDSIRFLMGRGEMEFAEIGPGTVLTGLIHRIKNEAEPLTYIPKKNPAISAHLKEQRNVQAGITAESLGSAEFKQDYHLTYAYLAGGMYRGIASKEMVVKLSRAGMMGFFGTGGLSLKEVEDAIHAIQGELGKGQAYGINLVHNMKHTESEEKMIDLLLRNQVSIVEASAFLSVTPVLVRYRAKGVKRNQNGDVICSNRLIAKISRPEVAESFLSPAPENMLQKLLGENKITMNEAELLRCIPMADDICVEADSGGHTDGGVAYSLMPAMTSLRDEMMKKYQYRKKIRVGAAGGIGTPEAAMAAFMLGADFILTGSINQCTVEAATSDKVKDLLQQMNVQDTAYAPAGDMFESGSKVQVLKKGVFFPARANKLYELYQRYGSIRELDAKMLAQLEEKYFKRSIEDIYKDIALHYPAADIEKAEQNPKHKMALIFRWYFRYSSKLAISGSEHSKVDYQIHCGPALGAFNQWVKGSQLENWRNRHVDEIGKKLMTETAVLLHERMQSMYQPSHETDNIKIKV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	767 (730)
Sequences:	126 (119)
Seq/√Len:	4.4

BACSU - PKSE

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
496_C	558_F	9.221	1.00
124_M	127_V	6.551	0.99
332_A	348_L	4.940	0.95
595_G	685_F	4.749	0.94
559_I	742_T	4.576	0.93
431_K	482_E	4.377	0.91
3_T	260_E	4.360	0.91
386_I	405_L	3.812	0.83
148_D	195_R	3.741	0.82
110_K	114_E	3.691	0.81
70_L	95_M	3.633	0.80
99_A	216_L	3.439	0.76
384_Y	703_Y	3.435	0.76
144_L	170_A	3.370	0.75
347_K	732_D	3.366	0.74
634_D	637_M	3.150	0.69
542_I	548_A	2.966	0.64
536_V	705_I	2.961	0.64
323_D	535_R	2.874	0.62
353_M	735_G	2.758	0.58
597_M	602_S	2.699	0.56
88_L	272_L	2.626	0.54
23_Q	428_Y	2.580	0.53
340_A	417_A	2.576	0.53
356_F	385_G	2.549	0.52
82_F	421_V	2.536	0.51
430_A	486_L	2.530	0.51
354_M	644_K	2.523	0.51
349_S	384_Y	2.523	0.51
154_T	367_V	2.507	0.51
357_F	362_L	2.479	0.50
584_M	607_L	2.447	0.49
542_I	674_K	2.446	0.49
357_F	370_A	2.425	0.48
469_L	487_R	2.334	0.45
630_I	680_I	2.312	0.45
22_E	40_E	2.298	0.44
430_A	469_L	2.293	0.44
257_G	286_L	2.285	0.44
497_V	508_G	2.268	0.43
577_V	705_I	2.262	0.43
455_E	596_D	2.253	0.43
110_K	187_N	2.250	0.43
148_D	196_Y	2.227	0.42
67_L	70_L	2.205	0.41
576_K	703_Y	2.204	0.41
330_Y	735_G	2.199	0.41
30_Q	103_E	2.164	0.40
360_G	594_A	2.161	0.40
117_G	149_V	2.142	0.40
324_Y	494_D	2.118	0.39
23_Q	71_K	2.099	0.38
494_D	535_R	2.092	0.38
259_G	410_V	2.081	0.38
426_V	472_L	2.076	0.38
638_L	642_E	2.073	0.38
110_K	207_Y	2.063	0.37
482_E	512_S	2.055	0.37
410_V	413_V	2.055	0.37
334_G	696_S	2.048	0.37
62_Y	106_L	2.040	0.37
331_L	354_M	2.016	0.36
390_H	418_F	2.009	0.36
417_A	595_G	2.008	0.36
266_I	742_T	2.002	0.36
330_Y	447_L	1.987	0.35
174_F	183_F	1.982	0.35
495_I	609_K	1.979	0.35
642_E	649_S	1.975	0.35
435_R	488_C	1.971	0.35
676_K	703_Y	1.970	0.35
461_L	609_K	1.956	0.34
216_L	231_Q	1.952	0.34
367_V	633_L	1.950	0.34
334_G	419_L	1.943	0.34
685_F	706_H	1.932	0.34
462_S	742_T	1.925	0.33
135_V	312_A	1.924	0.33
499_A	539_A	1.921	0.33
630_I	669_A	1.903	0.33
504_H	706_H	1.901	0.33
275_L	721_S	1.898	0.33
348_L	355_G	1.895	0.33
149_V	244_N	1.890	0.33
65_N	92_N	1.846	0.31
266_I	346_V	1.829	0.31
417_A	596_D	1.826	0.31
504_H	596_D	1.800	0.30
158_I	742_T	1.786	0.30
191_A	624_Y	1.775	0.30
370_A	586_V	1.774	0.30
245_T	608_K	1.769	0.29
455_E	594_A	1.768	0.29
334_G	388_L	1.760	0.29
165_K	495_I	1.759	0.29
332_A	340_A	1.757	0.29
501_S	594_A	1.748	0.29
8_G	12_Q	1.739	0.29
9_Q	12_Q	1.739	0.29
88_L	194_S	1.732	0.28
82_F	436_N	1.714	0.28
122_G	127_V	1.711	0.28
334_G	386_I	1.697	0.28
497_V	586_V	1.692	0.27
519_S	546_E	1.691	0.27
548_A	559_I	1.690	0.27
233_R	671_Q	1.687	0.27
428_Y	445_N	1.685	0.27
5_V	536_V	1.680	0.27
450_K	562_G	1.670	0.27
417_A	504_H	1.669	0.27
194_S	272_L	1.668	0.27
375_Q	384_Y	1.657	0.27
57_T	279_I	1.651	0.27
347_K	476_N	1.650	0.26
462_S	741_E	1.643	0.26
609_K	705_I	1.643	0.26
699_S	702_D	1.640	0.26
642_E	650_I	1.638	0.26
512_S	693_I	1.628	0.26
417_A	685_F	1.626	0.26
32_D	707_C	1.616	0.26
423_P	464_A	1.614	0.26
83_A	218_I	1.607	0.25
205_K	447_L	1.595	0.25
170_A	174_F	1.593	0.25
328_Y	608_K	1.587	0.25
360_G	389_V	1.584	0.25
455_E	587_Q	1.579	0.25
416_S	735_G	1.568	0.25
371_I	417_A	1.566	0.25
3_T	261_M	1.564	0.25
32_D	38_S	1.561	0.24
528_Y	531_R	1.549	0.24
387_N	595_G	1.545	0.24
146_D	536_V	1.529	0.24
247_K	250_D	1.518	0.23
389_V	594_A	1.505	0.23
501_S	595_G	1.505	0.23
252_I	716_Q	1.502	0.23
498_E	597_M	1.502	0.23
35_L	105_G	1.500	0.23
238_L	272_L	1.496	0.23
596_D	685_F	1.494	0.23
350_R	377_E	1.488	0.23
285_P	608_K	1.481	0.23
360_G	498_E	1.474	0.23
402_I	722_Q	1.461	0.22
40_E	471_K	1.461	0.22
76_T	475_E	1.458	0.22
61_L	96_A	1.453	0.22
506_D	594_A	1.452	0.22
503_G	506_D	1.450	0.22
490_P	547_A	1.446	0.22
501_S	685_F	1.445	0.22
603_K	609_K	1.443	0.22
417_A	501_S	1.441	0.22
6_F	9_Q	1.434	0.22
6_F	12_Q	1.434	0.22
360_G	597_M	1.433	0.22
455_E	618_N	1.430	0.22
631_R	638_L	1.413	0.21
286_L	749_R	1.411	0.21
637_M	690_K	1.409	0.21
522_D	634_D	1.397	0.21
683_W	704_Q	1.391	0.21
421_V	469_L	1.388	0.21
185_P	535_R	1.388	0.21
418_F	422_T	1.387	0.21
161_S	421_V	1.387	0.21
50_D	56_Y	1.383	0.21
389_V	597_M	1.378	0.21
389_V	602_S	1.378	0.21
251_S	389_V	1.367	0.20
428_Y	493_D	1.364	0.20
166_E	169_K	1.362	0.20
417_A	706_H	1.359	0.20
412_I	428_Y	1.355	0.20
336_Y	504_H	1.354	0.20
167_I	174_F	1.354	0.20
336_Y	360_G	1.353	0.20
225_Y	702_D	1.352	0.20
720_G	724_E	1.348	0.20
388_L	402_I	1.344	0.20
107_R	638_L	1.335	0.20
611_V	614_P	1.330	0.20
676_K	735_G	1.329	0.20
433_V	485_L	1.329	0.20
634_D	707_C	1.323	0.19
207_Y	706_H	1.322	0.19
161_S	607_L	1.321	0.19
88_L	273_T	1.318	0.19
359_T	666_I	1.317	0.19
350_R	571_A	1.317	0.19
190_G	711_L	1.311	0.19
392_M	405_L	1.311	0.19
52_N	82_F	1.309	0.19
201_K	735_G	1.301	0.19
594_A	602_S	1.295	0.19
55_E	247_K	1.294	0.19
344_M	652_D	1.284	0.19
357_F	386_I	1.284	0.19
421_V	495_I	1.282	0.19
208_I	239_S	1.281	0.19
403_D	705_I	1.280	0.19
160_I	552_F	1.276	0.19
5_V	276_I	1.273	0.19
154_T	275_L	1.272	0.19
207_Y	611_V	1.267	0.18
505_T	591_Y	1.266	0.18
530_Y	587_Q	1.266	0.18
504_H	594_A	1.265	0.18
552_F	559_I	1.261	0.18
311_T	314_S	1.257	0.18
345_V	503_G	1.251	0.18
222_S	693_I	1.250	0.18
118_R	203_V	1.249	0.18
516_A	552_F	1.247	0.18
194_S	279_I	1.247	0.18
56_Y	135_V	1.247	0.18
283_A	286_L	1.235	0.18
500_D	557_D	1.233	0.18
633_L	641_L	1.232	0.18
122_G	125_A	1.228	0.18
360_G	501_S	1.226	0.18
401_M	409_Q	1.226	0.18
47_S	103_E	1.225	0.18
216_L	476_N	1.225	0.18
113_G	255_L	1.224	0.18
396_E	656_D	1.222	0.18
342_K	346_V	1.221	0.18
165_K	381_G	1.220	0.18
349_S	392_M	1.213	0.17
349_S	713_A	1.211	0.17
274_G	688_S	1.208	0.17
513_L	586_V	1.208	0.17
154_T	624_Y	1.206	0.17
379_G	382_Q	1.206	0.17
533_K	700_K	1.204	0.17
7_P	12_Q	1.203	0.17
82_F	402_I	1.202	0.17
34_I	728_N	1.198	0.17
357_F	374_I	1.193	0.17
244_N	362_L	1.192	0.17
163_P	166_E	1.190	0.17
149_V	559_I	1.188	0.17
501_S	504_H	1.187	0.17
135_V	174_F	1.186	0.17
714_F	718_V	1.183	0.17
252_I	357_F	1.183	0.17
350_R	405_L	1.179	0.17
460_F	493_D	1.178	0.17
522_D	609_K	1.175	0.17
323_D	532_K	1.174	0.17
363_S	473_L	1.173	0.17
548_A	742_T	1.170	0.17
367_V	533_K	1.169	0.17
388_L	522_D	1.168	0.17
564_I	741_E	1.168	0.17
121_G	127_V	1.167	0.17
23_Q	74_E	1.165	0.17
334_G	560_L	1.165	0.17
668_K	672_N	1.161	0.17
468_M	552_F	1.159	0.17
276_I	514_M	1.158	0.17
559_I	564_I	1.158	0.17
462_S	527_K	1.158	0.17
596_D	706_H	1.158	0.17
83_A	642_E	1.157	0.17
207_Y	211_F	1.157	0.17
362_L	508_G	1.153	0.16
480_M	676_K	1.151	0.16
654_Y	735_G	1.150	0.16
187_N	703_Y	1.148	0.16
154_T	533_K	1.148	0.16
216_L	347_K	1.147	0.16
481_N	679_L	1.147	0.16
585_N	716_Q	1.146	0.16
6_F	10_G	1.145	0.16
332_A	573_T	1.144	0.16
334_G	389_V	1.139	0.16
286_L	493_D	1.138	0.16
474_G	633_L	1.137	0.16
390_H	510_A	1.136	0.16
530_Y	594_A	1.136	0.16
346_V	374_I	1.136	0.16
129_G	190_G	1.135	0.16
165_K	422_T	1.133	0.16
677_M	704_Q	1.133	0.16
608_K	643_E	1.129	0.16
349_S	405_L	1.128	0.16
334_G	597_M	1.128	0.16
417_A	594_A	1.127	0.16
341_S	503_G	1.125	0.16
56_Y	421_V	1.124	0.16
594_A	605_Q	1.119	0.16
222_S	536_V	1.119	0.16
394_H	529_Q	1.119	0.16
592_A	596_D	1.119	0.16
372_H	403_D	1.119	0.16
26_H	227_E	1.117	0.16
113_G	422_T	1.114	0.16
215_P	384_Y	1.113	0.16
275_L	650_I	1.111	0.16
437_Q	659_L	1.108	0.16
609_K	619_K	1.107	0.16
185_P	272_L	1.102	0.16
403_D	427_R	1.099	0.16
280_K	738_L	1.093	0.15
649_S	702_D	1.093	0.15
124_M	129_G	1.089	0.15
25_Q	179_D	1.087	0.15
146_D	166_E	1.085	0.15
92_N	643_E	1.084	0.15
63_V	495_I	1.082	0.15
336_Y	706_H	1.082	0.15
34_I	502_G	1.079	0.15
637_M	701_V	1.077	0.15
394_H	642_E	1.077	0.15
135_V	183_F	1.077	0.15
34_I	399_E	1.076	0.15
66_A	92_N	1.074	0.15
501_S	605_Q	1.074	0.15
374_I	741_E	1.070	0.15
19_G	629_S	1.067	0.15
174_F	441_V	1.066	0.15
53_H	478_I	1.064	0.15
473_L	478_I	1.054	0.15
3_T	82_F	1.053	0.15
498_E	706_H	1.053	0.15
476_N	528_Y	1.051	0.15
3_T	168_E	1.047	0.15
496_C	739_M	1.045	0.15
594_A	685_F	1.045	0.15
455_E	530_Y	1.044	0.15
208_I	625_Q	1.044	0.15
243_D	560_L	1.043	0.15
317_S	416_S	1.043	0.15
508_G	523_E	1.043	0.15
128_I	707_C	1.037	0.15
496_C	553_M	1.037	0.15
185_P	438_N	1.036	0.15
11_S	135_V	1.036	0.15
390_H	538_A	1.033	0.15
374_I	603_K	1.032	0.15
418_F	469_L	1.032	0.15
11_S	390_H	1.030	0.14
14_K	203_V	1.028	0.14
421_V	689_S	1.023	0.14
503_G	704_Q	1.023	0.14
95_M	484_E	1.022	0.14
213_F	216_L	1.018	0.14
452_S	594_A	1.018	0.14
474_G	580_L	1.012	0.14
144_L	615_A	1.009	0.14
106_L	190_G	1.008	0.14
318_A	413_V	1.005	0.14
49_L	274_G	1.003	0.14
503_G	646_F	1.003	0.14
194_S	494_D	1.000	0.14
367_V	639_A	0.999	0.14
130_L	624_Y	0.997	0.14
67_L	71_K	0.995	0.14
105_G	567_C	0.993	0.14
679_L	711_L	0.993	0.14
353_M	676_K	0.992	0.14
5_V	525_M	0.992	0.14
390_H	587_Q	0.989	0.14
208_I	272_L	0.989	0.14
670_E	724_E	0.989	0.14
315_L	743_A	0.989	0.14
631_R	676_K	0.989	0.14
4_Y	99_A	0.986	0.14
25_Q	245_T	0.985	0.14
510_A	587_Q	0.985	0.14
514_M	600_S	0.984	0.14
160_I	426_V	0.982	0.14
342_K	357_F	0.980	0.14
433_V	482_E	0.979	0.14
596_D	683_W	0.977	0.14
443_C	489_I	0.974	0.14
485_L	622_E	0.974	0.14
514_M	627_Y	0.972	0.14
340_A	402_I	0.971	0.14
462_S	626_R	0.971	0.14
677_M	730_H	0.969	0.14
387_N	500_D	0.967	0.14
467_N	608_K	0.966	0.14
354_M	377_E	0.965	0.14
434_K	608_K	0.964	0.14
53_H	725_N	0.963	0.14
331_L	355_G	0.963	0.14
602_S	660_H	0.962	0.13
194_S	238_L	0.962	0.13
35_L	38_S	0.960	0.13
591_Y	646_F	0.960	0.13
252_I	608_K	0.960	0.13
152_E	250_D	0.959	0.13
346_V	377_E	0.959	0.13
257_G	284_E	0.959	0.13
430_A	489_I	0.959	0.13
62_Y	492_A	0.958	0.13
499_A	745_L	0.956	0.13
328_Y	734_I	0.956	0.13
56_Y	434_K	0.956	0.13
448_I	706_H	0.954	0.13
685_F	699_S	0.953	0.13
125_A	190_G	0.953	0.13
423_P	703_Y	0.951	0.13
342_K	373_A	0.950	0.13
282_E	399_E	0.948	0.13
146_D	421_V	0.947	0.13
199_E	354_M	0.944	0.13
34_I	328_Y	0.941	0.13
441_V	647_K	0.938	0.13
111_K	728_N	0.937	0.13
235_K	741_E	0.936	0.13
372_H	408_N	0.933	0.13
412_I	427_R	0.933	0.13
413_V	686_R	0.933	0.13
127_V	190_G	0.931	0.13
257_G	283_A	0.926	0.13
669_A	679_L	0.926	0.13
118_R	211_F	0.925	0.13
611_V	711_L	0.923	0.13
266_I	384_Y	0.921	0.13
270_T	274_G	0.921	0.13
142_H	218_I	0.920	0.13
24_Y	676_K	0.920	0.13
250_D	283_A	0.918	0.13
25_Q	438_N	0.918	0.13
454_P	704_Q	0.916	0.13
113_G	550_A	0.916	0.13
249_T	286_L	0.915	0.13
469_L	473_L	0.915	0.13
426_V	592_A	0.912	0.13
657_I	667_E	0.911	0.13
7_P	10_G	0.910	0.13
367_V	512_S	0.910	0.13
455_E	517_M	0.909	0.13
470_Q	627_Y	0.909	0.13
384_Y	410_V	0.907	0.13
428_Y	614_P	0.906	0.13
641_L	650_I	0.906	0.13
409_Q	502_G	0.905	0.13
130_L	536_V	0.904	0.13
530_Y	535_R	0.903	0.13
405_L	522_D	0.902	0.13
62_Y	173_V	0.899	0.13
114_E	459_S	0.898	0.13
32_D	538_A	0.892	0.13
265_E	362_L	0.889	0.12
136_T	350_R	0.888	0.12
359_T	533_K	0.886	0.12
719_K	728_N	0.885	0.12
24_Y	106_L	0.885	0.12
355_G	573_T	0.884	0.12
266_I	374_I	0.882	0.12
263_F	682_R	0.882	0.12
417_A	498_E	0.882	0.12
386_I	401_M	0.878	0.12
357_F	621_Y	0.878	0.12
447_L	584_M	0.878	0.12
263_F	701_V	0.876	0.12
265_E	281_N	0.876	0.12
340_A	419_L	0.873	0.12
99_A	682_R	0.872	0.12
372_H	627_Y	0.871	0.12
506_D	704_Q	0.871	0.12
584_M	611_V	0.869	0.12
534_I	741_E	0.867	0.12
215_P	365_K	0.867	0.12
552_F	739_M	0.867	0.12
119_I	200_A	0.866	0.12
416_S	502_G	0.864	0.12
221_I	251_S	0.861	0.12
341_S	345_V	0.861	0.12
81_D	558_F	0.861	0.12
575_D	727_R	0.861	0.12
618_N	646_F	0.861	0.12
409_Q	631_R	0.859	0.12
217_A	413_V	0.858	0.12
14_K	259_G	0.858	0.12
245_T	630_I	0.857	0.12
322_Q	480_M	0.856	0.12
446_R	642_E	0.854	0.12
344_M	533_K	0.853	0.12
334_G	362_L	0.852	0.12
612_F	701_V	0.851	0.12
318_A	517_M	0.849	0.12
103_E	252_I	0.847	0.12
29_D	615_A	0.846	0.12
117_G	739_M	0.846	0.12
239_S	609_K	0.845	0.12
347_K	357_F	0.844	0.12
103_E	440_D	0.842	0.12
194_S	269_G	0.842	0.12
165_K	309_G	0.842	0.12
130_L	154_T	0.841	0.12
397_S	671_Q	0.841	0.12
343_E	469_L	0.837	0.12
5_V	682_R	0.836	0.12
365_K	413_V	0.836	0.12
417_A	506_D	0.834	0.12
455_E	501_S	0.832	0.12
252_I	697_E	0.832	0.12
668_K	688_S	0.832	0.12
141_E	487_R	0.831	0.12
73_V	651_E	0.830	0.12
625_Q	749_R	0.830	0.12
602_S	685_F	0.830	0.12
421_V	602_S	0.827	0.12
435_R	621_Y	0.826	0.12
142_H	173_V	0.824	0.12
229_Y	329_A	0.824	0.12
125_A	128_I	0.823	0.12
251_S	449_A	0.822	0.12
2_I	461_L	0.822	0.12
506_D	683_W	0.822	0.12
32_D	127_V	0.820	0.12
110_K	484_E	0.819	0.12
250_D	366_E	0.819	0.12
264_A	672_N	0.819	0.12
519_S	634_D	0.817	0.12
88_L	390_H	0.817	0.12
30_Q	635_A	0.815	0.12
348_L	590_A	0.814	0.12
371_I	511_Y	0.812	0.11
369_D	480_M	0.811	0.11
575_D	639_A	0.809	0.11
371_I	705_I	0.808	0.11
504_H	685_F	0.806	0.11
334_G	474_G	0.806	0.11
99_A	512_S	0.805	0.11
148_D	194_S	0.803	0.11
119_I	625_Q	0.803	0.11
242_M	512_S	0.802	0.11
265_E	272_L	0.802	0.11
194_S	324_Y	0.801	0.11
334_G	371_I	0.801	0.11
237_T	642_E	0.801	0.11
166_E	629_S	0.801	0.11
686_R	745_L	0.800	0.11
225_Y	624_Y	0.796	0.11
280_K	622_E	0.795	0.11
253_R	286_L	0.793	0.11
646_F	653_I	0.792	0.11
374_I	641_L	0.791	0.11
77_G	266_I	0.787	0.11
553_M	649_S	0.787	0.11
346_V	742_T	0.787	0.11
348_L	735_G	0.786	0.11
165_K	411_S	0.785	0.11
249_T	403_D	0.785	0.11
330_Y	496_C	0.785	0.11
430_A	614_P	0.784	0.11
239_S	263_F	0.782	0.11
95_M	702_D	0.782	0.11
388_L	498_E	0.782	0.11
354_M	607_L	0.781	0.11
254_F	619_K	0.780	0.11
167_I	274_G	0.779	0.11
308_A	344_M	0.776	0.11
262_E	389_V	0.774	0.11
68_S	71_K	0.773	0.11
96_A	398_E	0.772	0.11
103_E	728_N	0.772	0.11
597_M	604_V	0.772	0.11
161_S	590_A	0.771	0.11
203_V	459_S	0.770	0.11
396_E	516_A	0.767	0.11
503_G	688_S	0.767	0.11
374_I	700_K	0.767	0.11
269_G	275_L	0.766	0.11
657_I	697_E	0.766	0.11
274_G	509_V	0.766	0.11
227_E	340_A	0.765	0.11
455_E	510_A	0.764	0.11
370_A	512_S	0.764	0.11
284_E	749_R	0.764	0.11
227_E	254_F	0.764	0.11
187_N	196_Y	0.763	0.11
163_P	392_M	0.763	0.11
229_Y	582_Q	0.763	0.11
454_P	589_T	0.763	0.11
659_L	675_H	0.762	0.11
149_V	285_P	0.761	0.11
75_E	262_E	0.761	0.11
357_F	580_L	0.761	0.11
534_I	609_K	0.761	0.11
422_T	549_M	0.760	0.11
375_Q	485_L	0.760	0.11
341_S	613_F	0.758	0.11
340_A	504_H	0.757	0.11
693_I	727_R	0.756	0.11
360_G	504_H	0.756	0.11
55_E	117_G	0.755	0.11
560_L	597_M	0.755	0.11
569_V	645_Y	0.755	0.11
417_A	503_G	0.755	0.11
40_E	160_I	0.755	0.11
480_M	667_E	0.754	0.11
482_E	643_E	0.754	0.11
433_V	612_F	0.753	0.11
73_V	473_L	0.752	0.11
597_M	649_S	0.752	0.11
646_F	683_W	0.752	0.11
595_G	706_H	0.751	0.11
218_I	283_A	0.750	0.11
222_S	711_L	0.748	0.11
113_G	116_M	0.748	0.11
388_L	413_V	0.747	0.11
447_L	711_L	0.747	0.11
124_M	128_I	0.747	0.11
127_V	479_T	0.747	0.11
135_V	344_M	0.747	0.11
230_H	367_V	0.746	0.11
147_I	558_F	0.746	0.11
315_L	618_N	0.745	0.11
187_N	244_N	0.745	0.11
452_S	566_Q	0.745	0.11
225_Y	582_Q	0.745	0.11
225_Y	703_Y	0.745	0.11
60_A	64_V	0.743	0.11
111_K	328_Y	0.743	0.11
62_Y	459_S	0.742	0.11
152_E	270_T	0.742	0.11
56_Y	716_Q	0.742	0.11
106_L	218_I	0.742	0.11
386_I	397_S	0.741	0.11
52_N	491_M	0.741	0.11
125_A	191_A	0.741	0.11
55_E	357_F	0.741	0.11
367_V	401_M	0.740	0.11
38_S	707_C	0.739	0.11
418_F	523_E	0.738	0.11
530_Y	604_V	0.738	0.11
111_K	683_W	0.737	0.11
152_E	441_V	0.737	0.11
667_E	671_Q	0.737	0.11
342_K	370_A	0.735	0.11
417_A	687_Y	0.735	0.11
452_S	605_Q	0.733	0.11
142_H	571_A	0.732	0.11
374_I	674_K	0.732	0.11
390_H	580_L	0.731	0.11
314_S	401_M	0.731	0.11
171_R	324_Y	0.730	0.11
211_F	479_T	0.730	0.11
104_T	703_Y	0.729	0.11
132_K	448_I	0.729	0.11
682_R	725_N	0.728	0.10
648_R	656_D	0.728	0.10
33_Q	236_D	0.727	0.10
642_E	697_E	0.727	0.10
336_Y	448_I	0.727	0.10
666_I	669_A	0.725	0.10
508_G	618_N	0.725	0.10
57_T	62_Y	0.724	0.10
388_L	535_R	0.724	0.10
92_N	418_F	0.723	0.10
14_K	218_I	0.723	0.10
52_N	469_L	0.722	0.10
154_T	590_A	0.722	0.10
100_F	105_G	0.722	0.10
268_P	707_C	0.721	0.10
438_N	531_R	0.721	0.10
52_N	478_I	0.721	0.10
80_P	218_I	0.721	0.10
360_G	706_H	0.721	0.10
2_I	339_I	0.721	0.10
532_K	680_I	0.721	0.10
128_I	353_M	0.721	0.10
166_E	658_A	0.720	0.10
107_R	131_S	0.720	0.10
511_Y	703_Y	0.719	0.10
452_S	456_V	0.719	0.10
394_H	632_E	0.718	0.10
256_M	286_L	0.717	0.10
289_I	524_M	0.716	0.10
38_S	105_G	0.716	0.10
456_V	688_S	0.716	0.10
355_G	482_E	0.715	0.10
71_K	222_S	0.715	0.10
419_L	560_L	0.715	0.10
257_G	287_T	0.714	0.10
321_K	680_I	0.713	0.10
478_I	534_I	0.713	0.10
84_A	455_E	0.713	0.10
18_Q	349_S	0.713	0.10
368_E	375_Q	0.712	0.10
534_I	702_D	0.711	0.10
144_L	527_K	0.711	0.10
371_I	640_Q	0.710	0.10
103_E	239_S	0.710	0.10
511_Y	534_I	0.709	0.10
331_L	342_K	0.708	0.10
171_R	245_T	0.707	0.10
38_S	275_L	0.706	0.10
558_F	739_M	0.706	0.10
211_F	234_L	0.705	0.10
559_I	612_F	0.705	0.10
179_D	713_A	0.703	0.10
139_L	197_M	0.702	0.10
179_D	188_V	0.702	0.10
4_Y	321_K	0.702	0.10
360_G	709_P	0.701	0.10
29_D	33_Q	0.701	0.10
41_K	45_E	0.700	0.10
40_E	603_K	0.699	0.10
201_K	660_H	0.698	0.10
596_D	602_S	0.698	0.10
34_I	147_I	0.697	0.10
334_G	405_L	0.697	0.10
406_L	611_V	0.695	0.10
125_A	174_F	0.694	0.10
375_Q	408_N	0.694	0.10
596_D	660_H	0.694	0.10
190_G	657_I	0.694	0.10
492_A	707_C	0.694	0.10
21_F	37_Y	0.693	0.10
70_L	641_L	0.692	0.10
239_S	626_R	0.691	0.10
321_K	353_M	0.691	0.10
406_L	431_K	0.691	0.10
256_M	418_F	0.691	0.10
428_Y	651_E	0.689	0.10
249_T	494_D	0.689	0.10
479_T	705_I	0.689	0.10
452_S	731_V	0.687	0.10
232_D	672_N	0.686	0.10
436_N	698_H	0.685	0.10
387_N	498_E	0.685	0.10
161_S	191_A	0.685	0.10
469_L	546_E	0.684	0.10
503_G	591_Y	0.684	0.10
327_T	600_S	0.684	0.10
317_S	476_N	0.684	0.10
357_F	705_I	0.684	0.10
215_P	575_D	0.683	0.10
19_G	33_Q	0.682	0.10
161_S	513_L	0.680	0.10
17_G	64_V	0.680	0.10
342_K	727_R	0.680	0.10
147_I	216_L	0.679	0.10
275_L	642_E	0.677	0.10
390_H	688_S	0.677	0.10
105_G	229_Y	0.676	0.10
501_S	596_D	0.675	0.10
341_S	646_F	0.673	0.10
161_S	213_F	0.672	0.10
685_F	688_S	0.672	0.10
247_K	286_L	0.671	0.10
8_G	15_G	0.671	0.10
9_Q	15_G	0.671	0.10
12_Q	15_G	0.671	0.10
163_P	365_K	0.670	0.10
3_T	225_Y	0.669	0.10
357_F	559_I	0.669	0.10
65_N	161_S	0.669	0.10
138_V	278_R	0.668	0.10
185_P	265_E	0.667	0.10
161_S	710_A	0.667	0.10
81_D	196_Y	0.667	0.10
559_I	728_N	0.667	0.10
155_P	569_V	0.667	0.10
190_G	569_V	0.666	0.10
554_L	579_D	0.666	0.10
203_V	698_H	0.666	0.10
336_Y	417_A	0.664	0.10
464_A	742_T	0.664	0.10
99_A	286_L	0.663	0.10
745_L	749_R	0.663	0.10
418_F	456_V	0.662	0.10
685_F	716_Q	0.662	0.10
174_F	608_K	0.661	0.10
639_A	643_E	0.661	0.10
381_G	628_G	0.661	0.10
403_D	436_N	0.661	0.10
337_R	349_S	0.660	0.10
92_N	482_E	0.660	0.10
388_L	489_I	0.660	0.10
163_P	275_L	0.660	0.10
586_V	648_R	0.659	0.10
573_T	577_V	0.659	0.10
509_V	594_A	0.658	0.10
604_V	731_V	0.657	0.10
69_Y	644_K	0.655	0.10
367_V	632_E	0.655	0.10
349_S	519_S	0.654	0.10
410_V	421_V	0.653	0.10
207_Y	723_L	0.653	0.10
382_Q	703_Y	0.652	0.10
577_V	731_V	0.651	0.10
560_L	675_H	0.651	0.10
198_N	448_I	0.651	0.10
435_R	469_L	0.650	0.10
554_L	622_E	0.650	0.10
40_E	411_S	0.649	0.10
161_S	734_I	0.649	0.10
510_A	514_M	0.649	0.10
245_T	728_N	0.648	0.10
186_L	223_N	0.648	0.10
337_R	504_H	0.647	0.10
139_L	364_L	0.644	0.10
536_V	708_G	0.641	0.10
331_L	448_I	0.641	0.10
22_E	744_V	0.639	0.10
88_L	622_E	0.639	0.10
72_R	263_F	0.638	0.10
360_G	503_G	0.638	0.10
88_L	324_Y	0.637	0.10
456_V	706_H	0.637	0.10
504_H	604_V	0.636	0.09
339_I	344_M	0.635	0.09
199_E	344_M	0.634	0.09
553_M	558_F	0.634	0.09
19_G	120_T	0.633	0.09
117_G	636_K	0.632	0.09
277_H	367_V	0.632	0.09
252_I	745_L	0.631	0.09
458_E	670_E	0.631	0.09
154_T	190_G	0.631	0.09
20_L	271_V	0.630	0.09
215_P	231_Q	0.630	0.09
641_L	680_I	0.630	0.09
107_R	527_K	0.629	0.09
154_T	405_L	0.626	0.09
232_D	741_E	0.626	0.09
216_L	523_E	0.624	0.09
589_T	702_D	0.624	0.09
49_L	55_E	0.623	0.09
500_D	595_G	0.623	0.09
417_A	641_L	0.623	0.09
225_Y	476_N	0.623	0.09
56_Y	516_A	0.621	0.09
500_D	613_F	0.620	0.09
111_K	142_H	0.619	0.09
594_A	597_M	0.619	0.09
37_Y	717_W	0.619	0.09
602_S	650_I	0.618	0.09
538_A	707_C	0.617	0.09
501_S	506_D	0.617	0.09
215_P	234_L	0.616	0.09
328_Y	728_N	0.616	0.09
359_T	604_V	0.615	0.09
111_K	464_A	0.615	0.09
180_V	513_L	0.615	0.09
628_G	632_E	0.615	0.09
498_E	685_F	0.614	0.09
56_Y	264_A	0.614	0.09
387_N	704_Q	0.614	0.09
107_R	349_S	0.613	0.09
330_Y	591_Y	0.612	0.09
81_D	631_R	0.610	0.09
317_S	682_R	0.610	0.09
309_G	469_L	0.610	0.09
341_S	704_Q	0.610	0.09
264_A	516_A	0.610	0.09
24_Y	705_I	0.609	0.09
171_R	175_E	0.609	0.09
273_T	494_D	0.609	0.09
436_N	440_D	0.608	0.09
179_D	418_F	0.608	0.09
390_H	622_E	0.608	0.09
600_S	711_L	0.608	0.09
367_V	645_Y	0.607	0.09
354_M	382_Q	0.606	0.09
496_C	735_G	0.606	0.09
501_S	505_T	0.606	0.09
235_K	652_D	0.606	0.09
668_K	687_Y	0.606	0.09
40_E	412_I	0.606	0.09
37_Y	57_T	0.605	0.09
19_G	748_E	0.605	0.09
317_S	479_T	0.605	0.09
262_E	441_V	0.605	0.09
530_Y	602_S	0.604	0.09
80_P	617_A	0.603	0.09
326_L	419_L	0.602	0.09
406_L	472_L	0.602	0.09
351_A	678_A	0.602	0.09
33_Q	675_H	0.601	0.09
511_Y	514_M	0.600	0.09
418_F	627_Y	0.600	0.09
468_M	652_D	0.600	0.09
482_E	572_A	0.599	0.09
190_G	624_Y	0.598	0.09
510_A	705_I	0.598	0.09
609_K	702_D	0.597	0.09
119_I	184_H	0.596	0.09
323_D	509_V	0.595	0.09
681_F	721_S	0.595	0.09
461_L	534_I	0.595	0.09
336_Y	689_S	0.594	0.09
438_N	470_Q	0.594	0.09
238_L	378_L	0.593	0.09
498_E	573_T	0.593	0.09
495_I	516_A	0.592	0.09
726_W	729_R	0.591	0.09
522_D	571_A	0.589	0.09
428_Y	461_L	0.589	0.09
619_K	707_C	0.588	0.09
659_L	690_K	0.587	0.09
394_H	402_I	0.586	0.09
518_T	705_I	0.585	0.09
656_D	662_P	0.583	0.09
587_Q	688_S	0.582	0.09
203_V	409_Q	0.581	0.09
387_N	690_K	0.581	0.09
589_T	730_H	0.580	0.09
103_E	366_E	0.579	0.09
154_T	711_L	0.579	0.09
258_R	451_I	0.578	0.09
163_P	247_K	0.577	0.09
121_G	372_H	0.577	0.09
661_Y	706_H	0.577	0.09
413_V	649_S	0.577	0.09
48_Y	641_L	0.576	0.09
259_G	366_E	0.575	0.09
417_A	509_V	0.574	0.09
34_I	185_P	0.573	0.09
68_S	72_R	0.573	0.09
18_Q	447_L	0.572	0.09
575_D	596_D	0.572	0.09
197_M	454_P	0.572	0.09
170_A	710_A	0.571	0.09
251_S	273_T	0.571	0.09
169_K	514_M	0.571	0.09
329_A	723_L	0.570	0.09
319_E	586_V	0.570	0.09
517_M	530_Y	0.569	0.09
639_A	680_I	0.569	0.09
138_V	334_G	0.568	0.09
529_Q	652_D	0.568	0.09
11_S	531_R	0.568	0.09
409_Q	446_R	0.568	0.09
503_G	609_K	0.568	0.09
504_H	602_S	0.567	0.09
27_L	117_G	0.567	0.09
405_L	517_M	0.567	0.09
476_N	635_A	0.566	0.09
22_E	355_G	0.565	0.09
618_N	621_Y	0.564	0.09
352_G	433_V	0.564	0.09
390_H	448_I	0.564	0.09
344_M	499_A	0.563	0.09
155_P	253_R	0.563	0.09
222_S	650_I	0.562	0.09
500_D	505_T	0.562	0.09
461_L	614_P	0.560	0.09
274_G	277_H	0.560	0.09
28_T	283_A	0.559	0.09
68_S	166_E	0.558	0.09
121_G	274_G	0.558	0.09
39_I	707_C	0.557	0.09
210_S	687_Y	0.557	0.09
180_V	679_L	0.556	0.09
144_L	422_T	0.555	0.09
444_S	688_S	0.555	0.09
200_A	514_M	0.555	0.09
100_F	703_Y	0.554	0.09
321_K	332_A	0.553	0.09
478_I	523_E	0.553	0.09
154_T	402_I	0.553	0.09
334_G	348_L	0.553	0.09
95_M	630_I	0.552	0.09
416_S	644_K	0.552	0.09
214_A	367_V	0.552	0.09
5_V	84_A	0.552	0.09
266_I	382_Q	0.552	0.09
25_Q	325_H	0.552	0.09
290_P	516_A	0.552	0.09
355_G	430_A	0.552	0.09
56_Y	134_Q	0.551	0.09
397_S	634_D	0.551	0.09
583_Q	680_I	0.550	0.09
642_E	666_I	0.550	0.09
203_V	210_S	0.550	0.09
333_G	566_Q	0.550	0.09
341_S	417_A	0.550	0.09
243_D	573_T	0.549	0.09
251_S	254_F	0.548	0.09
180_V	253_R	0.548	0.09
403_D	451_I	0.547	0.09
40_E	239_S	0.547	0.09
125_A	716_Q	0.547	0.09
376_G	641_L	0.547	0.09
385_G	685_F	0.547	0.09
503_G	602_S	0.546	0.09
72_R	264_A	0.545	0.09
456_V	504_H	0.544	0.09
14_K	46_K	0.544	0.09
242_M	355_G	0.543	0.09
100_F	337_R	0.543	0.09
337_R	408_N	0.543	0.09
224_V	582_Q	0.542	0.09
431_K	571_A	0.542	0.09
167_I	523_E	0.540	0.09
352_G	461_L	0.540	0.09
247_K	514_M	0.540	0.09
198_N	462_S	0.539	0.09
735_G	739_M	0.538	0.09
369_D	401_M	0.538	0.09
70_L	735_G	0.538	0.09
496_C	710_A	0.536	0.08
242_M	558_F	0.536	0.08
336_Y	602_S	0.534	0.08
66_A	69_Y	0.532	0.08
73_V	600_S	0.532	0.08
469_L	552_F	0.531	0.08
127_V	132_K	0.531	0.08
406_L	513_L	0.530	0.08
56_Y	312_A	0.530	0.08
504_H	688_S	0.529	0.08
282_E	473_L	0.529	0.08
430_A	466_E	0.527	0.08
178_K	584_M	0.526	0.08
485_L	745_L	0.526	0.08
367_V	698_H	0.525	0.08
431_K	628_G	0.525	0.08
206_Q	658_A	0.525	0.08
336_Y	389_V	0.525	0.08
4_Y	324_Y	0.525	0.08
342_K	632_E	0.525	0.08
575_D	703_Y	0.524	0.08
504_H	595_G	0.524	0.08
345_V	679_L	0.524	0.08
566_Q	573_T	0.523	0.08
61_L	346_V	0.523	0.08
544_T	716_Q	0.522	0.08
110_K	173_V	0.521	0.08
629_S	652_D	0.521	0.08
37_Y	105_G	0.520	0.08
504_H	704_Q	0.520	0.08
360_G	596_D	0.519	0.08
276_I	279_I	0.519	0.08
499_A	521_R	0.519	0.08
40_E	652_D	0.519	0.08
340_A	502_G	0.519	0.08
216_L	325_H	0.519	0.08
196_Y	347_K	0.519	0.08
674_K	700_K	0.518	0.08
78_R	475_E	0.518	0.08
604_V	633_L	0.518	0.08
6_F	539_A	0.518	0.08
461_L	723_L	0.517	0.08
131_S	247_K	0.517	0.08
426_V	497_V	0.517	0.08
257_G	285_P	0.516	0.08
362_L	502_G	0.514	0.08
517_M	667_E	0.513	0.08
110_K	311_T	0.513	0.08
430_A	478_I	0.513	0.08
19_G	22_E	0.512	0.08
657_I	662_P	0.512	0.08
163_P	580_L	0.512	0.08
413_V	528_Y	0.512	0.08
11_S	268_P	0.512	0.08
24_Y	82_F	0.512	0.08
464_A	647_K	0.512	0.08
266_I	507_G	0.511	0.08
167_I	252_I	0.511	0.08
506_D	602_S	0.510	0.08
326_L	353_M	0.509	0.08
334_G	479_T	0.509	0.08
354_M	640_Q	0.509	0.08
606_V	642_E	0.509	0.08
20_L	106_L	0.507	0.08
340_A	597_M	0.507	0.08
355_G	580_L	0.507	0.08
387_N	706_H	0.507	0.08
491_M	691_L	0.507	0.08
369_D	447_L	0.507	0.08
202_Q	703_Y	0.506	0.08
170_A	257_G	0.506	0.08
456_V	602_S	0.505	0.08
69_Y	544_T	0.505	0.08
454_P	503_G	0.505	0.08
165_K	621_Y	0.504	0.08
245_T	560_L	0.504	0.08
489_I	546_E	0.504	0.08
341_S	679_L	0.503	0.08
125_A	614_P	0.503	0.08
129_G	693_I	0.503	0.08
4_Y	654_Y	0.502	0.08
249_T	257_G	0.502	0.08
407_R	741_E	0.502	0.08
461_L	571_A	0.502	0.08
422_T	627_Y	0.501	0.08
503_G	594_A	0.501	0.08
25_Q	549_M	0.501	0.08
503_G	596_D	0.500	0.08
28_T	165_K	0.500	0.08
355_G	627_Y	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3zenD	6	0.8475	100	0.72	Contact Map
2uv8G	3	0.9022	100	0.732	Contact Map
4cw5A	2	0.5711	100	0.734	Contact Map
2uvaG	3	0.8918	100	0.738	Contact Map
3g87A	1	0.369	100	0.781	Contact Map
3sbmA	1	0.3664	100	0.786	Contact Map
4rr5A	1	0.3768	100	0.799	Contact Map
3ptwA	1	0.4003	100	0.8	Contact Map
3ezoA	1	0.3872	100	0.801	Contact Map
3im8A	1	0.3885	100	0.801	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0178 seconds.