YFMG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YFMG - Uncharacterized protein YfmG

UniProt:	O34722	Sequences: MTLLMQDHKSIYNKDIEILIEVEELITSVPENKKNDFKSLIDNRIMTLLNKIQHPVAAENVFGMCIAYPNTYIRYRLIDFVEKWVPYFSAVETIINLTQDPDDLVSFKAMDVCANHKIEESVAYLSSIIDDVRESISYPKKPVGLGAQKVLSTLLDIFGVEKHEELVMLKNYFDQNGILPNNFDFEEKIPQSLIEEFEKTEEDGMILIPGGFFEFGLNENEIPDKTFNWKDAVPRQKVWLPPFFIDKYPVTNKDYDIFTEFIEENGHIFCHPNEPQNKQHRRNTYWDDRYLDNHPVTGIDFYDAFAYARYKGKELPTEFQWEKAARGEKGNVWPWGDKFDPAKVQYAGSLYNEPITSLKSWRENLLKAHADKELNHLTSDIFEQNGESPYGVCGMIGGTWEWTRSELKTKRAFHPIFENVPFNSVNSFAVLKGGSFFSHPGLMFPSFRAKDIPFCRHNEMGIRCVKNIPVYKIRESINGPITNKAIY	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	487 (395)
Sequences:	144 (128)
Seq/√Len:	6.4

BACSU - YFMG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
314_E	320_Q	8.544	1.00
245_I	465_V	3.605	0.91
258_F	310_Y	3.587	0.91
345_Q	382_F	3.235	0.85
252_N	297_T	2.976	0.80
346_Y	395_M	2.781	0.75
286_W	289_R	2.744	0.74
255_Y	264_E	2.736	0.74
415_P	418_E	2.735	0.74
258_F	297_T	2.654	0.71
324_A	402_W	2.529	0.67
259_T	310_Y	2.514	0.67
297_T	310_Y	2.486	0.66
193_L	197_F	2.457	0.65
255_Y	310_Y	2.455	0.65
252_N	258_F	2.452	0.65
408_K	421_P	2.425	0.64
299_I	384_Q	2.401	0.63
218_N	235_R	2.390	0.63
203_D	258_F	2.339	0.61
307_Y	334_P	2.291	0.59
215_F	392_V	2.290	0.59
258_F	307_Y	2.256	0.58
252_N	310_Y	2.246	0.58
417_F	420_V	2.241	0.58
296_V	299_I	2.181	0.55
182_N	185_F	2.122	0.53
203_D	307_Y	2.120	0.53
266_G	310_Y	2.040	0.50
296_V	311_K	2.014	0.49
317_T	418_E	2.006	0.49
259_T	264_E	2.003	0.49
264_E	310_Y	1.997	0.49
194_I	262_I	1.995	0.49
216_G	402_W	1.994	0.49
258_F	335_W	1.987	0.48
432_K	444_F	1.971	0.48
262_I	310_Y	1.910	0.45
415_P	420_V	1.887	0.45
415_P	421_P	1.878	0.44
392_V	448_R	1.875	0.44
380_D	432_K	1.844	0.43
255_Y	266_G	1.831	0.43
269_F	310_Y	1.830	0.43
165_E	169_L	1.819	0.42
177_G	180_P	1.811	0.42
391_G	434_G	1.807	0.42
325_A	335_W	1.803	0.42
444_F	448_R	1.800	0.41
203_D	310_Y	1.785	0.41
307_Y	466_K	1.777	0.41
297_T	307_Y	1.743	0.39
336_G	382_F	1.741	0.39
252_N	291_L	1.723	0.39
286_W	310_Y	1.716	0.38
209_P	448_R	1.712	0.38
246_D	250_V	1.710	0.38
203_D	334_P	1.699	0.38
406_E	429_A	1.695	0.38
307_Y	310_Y	1.670	0.37
203_D	297_T	1.665	0.37
263_E	310_Y	1.661	0.37
451_D	459_E	1.656	0.36
317_T	325_A	1.638	0.36
259_T	307_Y	1.635	0.36
333_W	376_H	1.633	0.36
255_Y	306_A	1.626	0.35
408_K	414_H	1.624	0.35
264_E	267_H	1.617	0.35
304_A	397_G	1.614	0.35
259_T	269_F	1.611	0.35
400_W	440_P	1.608	0.35
240_L	309_R	1.585	0.34
408_K	415_P	1.577	0.34
216_G	318_E	1.575	0.34
172_Y	179_L	1.575	0.34
215_F	323_K	1.570	0.34
414_H	421_P	1.568	0.33
216_G	324_A	1.567	0.33
252_N	307_Y	1.558	0.33
339_F	432_K	1.545	0.33
318_E	402_W	1.545	0.33
203_D	252_N	1.513	0.32
286_W	290_Y	1.510	0.32
328_E	462_I	1.508	0.32
316_P	321_W	1.493	0.31
325_A	352_N	1.474	0.30
321_W	325_A	1.470	0.30
259_T	266_G	1.465	0.30
261_F	307_Y	1.463	0.30
175_Q	205_M	1.462	0.30
432_K	448_R	1.452	0.30
414_H	418_E	1.436	0.29
297_T	443_M	1.425	0.29
98_T	147_A	1.422	0.29
184_D	192_S	1.419	0.29
213_F	234_P	1.416	0.29
347_A	350_L	1.408	0.28
208_I	250_V	1.406	0.28
384_Q	393_C	1.406	0.28
335_W	396_I	1.405	0.28
252_N	255_Y	1.403	0.28
215_F	444_F	1.393	0.28
325_A	396_I	1.380	0.28
352_N	396_I	1.376	0.27
406_E	426_N	1.373	0.27
325_A	418_E	1.371	0.27
246_D	464_C	1.364	0.27
382_F	390_Y	1.364	0.27
264_E	268_I	1.360	0.27
310_Y	466_K	1.360	0.27
303_D	310_Y	1.356	0.27
123_A	460_M	1.351	0.27
438_S	449_A	1.345	0.27
234_P	415_P	1.342	0.27
297_T	466_K	1.339	0.26
318_E	322_E	1.338	0.26
213_F	301_F	1.335	0.26
250_V	320_Q	1.332	0.26
52_I	59_E	1.331	0.26
251_T	434_G	1.325	0.26
53_Q	60_N	1.320	0.26
289_R	310_Y	1.315	0.26
249_P	430_V	1.301	0.25
262_I	333_W	1.299	0.25
389_P	396_I	1.295	0.25
297_T	335_W	1.292	0.25
258_F	466_K	1.291	0.25
255_Y	258_F	1.286	0.25
297_T	375_N	1.285	0.25
346_Y	371_D	1.285	0.25
319_F	405_S	1.285	0.25
263_E	266_G	1.274	0.25
333_W	347_A	1.273	0.25
420_V	423_N	1.256	0.24
171_N	208_I	1.256	0.24
415_P	464_C	1.250	0.24
295_P	463_R	1.249	0.24
262_I	297_T	1.231	0.23
171_N	250_V	1.216	0.23
251_T	379_S	1.215	0.23
433_G	461_G	1.208	0.23
78_I	82_E	1.207	0.23
347_A	352_N	1.201	0.23
436_F	462_I	1.199	0.23
230_K	404_R	1.199	0.23
255_Y	335_W	1.189	0.22
320_Q	436_F	1.187	0.22
255_Y	396_I	1.185	0.22
388_S	392_V	1.182	0.22
398_G	461_G	1.181	0.22
323_K	392_V	1.181	0.22
321_W	434_G	1.179	0.22
334_P	396_I	1.176	0.22
263_E	267_H	1.170	0.22
381_I	390_Y	1.165	0.22
212_F	237_K	1.164	0.22
216_G	463_R	1.160	0.22
325_A	347_A	1.158	0.22
258_F	403_T	1.156	0.22
232_A	408_K	1.153	0.21
318_E	405_S	1.151	0.21
165_E	168_M	1.151	0.21
297_T	403_T	1.147	0.21
323_K	388_S	1.145	0.21
326_R	336_G	1.145	0.21
395_M	451_D	1.143	0.21
307_Y	375_N	1.139	0.21
204_G	230_K	1.136	0.21
34_K	57_A	1.118	0.21
323_K	432_K	1.118	0.21
326_R	391_G	1.116	0.21
64_M	103_D	1.112	0.20
388_S	398_G	1.112	0.20
314_E	436_F	1.107	0.20
238_V	243_F	1.106	0.20
299_I	394_G	1.104	0.20
215_F	432_K	1.097	0.20
263_E	269_F	1.095	0.20
335_W	377_L	1.093	0.20
139_P	147_A	1.084	0.20
422_F	425_V	1.082	0.20
322_E	463_R	1.072	0.20
213_F	318_E	1.072	0.20
258_F	262_I	1.070	0.19
232_A	444_F	1.065	0.19
252_N	403_T	1.055	0.19
411_R	415_P	1.053	0.19
418_E	421_P	1.050	0.19
388_S	394_G	1.050	0.19
335_W	417_F	1.050	0.19
308_A	443_M	1.048	0.19
252_N	289_R	1.046	0.19
216_G	295_P	1.043	0.19
255_Y	259_T	1.041	0.19
261_F	310_Y	1.038	0.19
174_D	180_P	1.030	0.19
258_F	306_A	1.029	0.19
258_F	264_E	1.028	0.19
249_P	377_L	1.025	0.18
254_D	287_D	1.023	0.18
310_Y	335_W	1.022	0.18
189_I	194_I	1.018	0.18
211_G	322_E	1.018	0.18
176_N	180_P	1.016	0.18
346_Y	352_N	1.011	0.18
345_Q	377_L	1.011	0.18
323_K	448_R	1.008	0.18
259_T	297_T	1.006	0.18
397_G	463_R	1.001	0.18
250_V	465_V	1.001	0.18
318_E	324_A	0.992	0.18
137_S	430_V	0.992	0.18
215_F	331_N	0.991	0.18
252_N	311_K	0.990	0.18
216_G	304_A	0.989	0.18
316_P	324_A	0.981	0.17
203_D	466_K	0.980	0.17
341_P	348_G	0.979	0.17
296_V	448_R	0.978	0.17
62_F	249_P	0.976	0.17
315_L	463_R	0.974	0.17
80_F	133_R	0.970	0.17
318_E	448_R	0.963	0.17
414_H	419_N	0.963	0.17
295_P	322_E	0.958	0.17
202_E	313_K	0.954	0.17
371_D	377_L	0.954	0.17
398_G	433_G	0.950	0.17
301_F	380_D	0.948	0.17
38_K	41_I	0.947	0.17
143_V	157_I	0.943	0.17
335_W	352_N	0.942	0.17
429_A	465_V	0.936	0.17
252_N	466_K	0.935	0.17
210_G	263_E	0.933	0.17
111_D	131_D	0.927	0.16
232_A	393_C	0.926	0.16
171_N	185_F	0.926	0.16
146_G	151_L	0.924	0.16
416_I	458_N	0.922	0.16
336_G	345_Q	0.921	0.16
316_P	463_R	0.917	0.16
244_F	283_N	0.916	0.16
252_N	308_A	0.916	0.16
331_N	445_P	0.913	0.16
199_K	205_M	0.908	0.16
304_A	402_W	0.907	0.16
317_T	408_K	0.907	0.16
297_T	334_P	0.906	0.16
211_G	318_E	0.906	0.16
390_Y	448_R	0.904	0.16
169_L	317_T	0.903	0.16
235_R	408_K	0.899	0.16
258_F	308_A	0.895	0.16
402_W	463_R	0.894	0.16
253_K	299_I	0.891	0.16
236_Q	421_P	0.891	0.16
433_G	463_R	0.888	0.16
258_F	325_A	0.888	0.16
255_Y	268_I	0.886	0.16
322_E	326_R	0.885	0.16
74_R	133_R	0.883	0.16
384_Q	389_P	0.882	0.15
300_D	397_G	0.873	0.15
295_P	397_G	0.873	0.15
198_E	341_P	0.872	0.15
332_V	338_K	0.869	0.15
176_N	240_L	0.868	0.15
74_R	110_M	0.866	0.15
102_D	107_F	0.866	0.15
295_P	315_L	0.852	0.15
379_S	462_I	0.847	0.15
216_G	322_E	0.846	0.15
318_E	444_F	0.846	0.15
377_L	382_F	0.844	0.15
190_P	193_L	0.842	0.15
403_T	443_M	0.841	0.15
58_A	61_V	0.841	0.15
250_V	440_P	0.840	0.15
103_D	107_F	0.837	0.15
299_I	467_N	0.836	0.15
391_G	433_G	0.835	0.15
246_D	313_K	0.834	0.15
109_A	327_G	0.834	0.15
252_N	259_T	0.834	0.15
417_F	421_P	0.831	0.15
325_A	453_P	0.828	0.14
315_L	405_S	0.827	0.14
252_N	443_M	0.826	0.14
175_Q	179_L	0.824	0.14
322_E	432_K	0.824	0.14
111_D	114_A	0.821	0.14
258_F	286_W	0.820	0.14
235_R	243_F	0.820	0.14
183_F	291_L	0.818	0.14
145_L	154_L	0.815	0.14
338_K	377_L	0.815	0.14
317_T	405_S	0.809	0.14
286_W	403_T	0.808	0.14
123_A	126_S	0.806	0.14
321_W	463_R	0.804	0.14
238_V	402_W	0.803	0.14
97_L	108_K	0.802	0.14
56_V	67_A	0.802	0.14
326_R	382_F	0.801	0.14
352_N	377_L	0.795	0.14
162_K	184_D	0.794	0.14
219_E	325_A	0.792	0.14
190_P	431_L	0.790	0.14
253_K	293_N	0.789	0.14
66_I	124_Y	0.788	0.14
321_W	400_W	0.787	0.14
295_P	316_P	0.786	0.14
204_G	456_R	0.786	0.14
244_F	337_D	0.785	0.14
122_V	137_S	0.785	0.14
60_N	150_V	0.784	0.14
121_S	125_L	0.783	0.14
345_Q	399_T	0.781	0.14
449_A	458_N	0.781	0.14
248_Y	382_F	0.776	0.14
331_N	338_K	0.772	0.13
334_P	346_Y	0.771	0.13
312_G	344_V	0.769	0.13
65_C	82_E	0.768	0.13
295_P	402_W	0.766	0.13
255_Y	377_L	0.766	0.13
398_G	463_R	0.765	0.13
295_P	433_G	0.764	0.13
266_G	302_Y	0.757	0.13
203_D	443_M	0.754	0.13
266_G	286_W	0.754	0.13
98_T	145_L	0.753	0.13
301_F	429_A	0.752	0.13
215_F	301_F	0.751	0.13
252_N	464_C	0.750	0.13
252_N	264_E	0.746	0.13
333_W	338_K	0.746	0.13
395_M	445_P	0.745	0.13
302_Y	453_P	0.744	0.13
132_V	139_P	0.744	0.13
216_G	397_G	0.743	0.13
141_K	148_Q	0.740	0.13
34_K	41_I	0.739	0.13
250_V	303_D	0.733	0.13
139_P	376_H	0.732	0.13
83_K	99_Q	0.730	0.13
143_V	155_L	0.730	0.13
301_F	432_K	0.730	0.13
311_K	327_G	0.729	0.13
138_Y	154_L	0.729	0.13
262_I	286_W	0.728	0.13
335_W	403_T	0.727	0.13
326_R	376_H	0.727	0.13
310_Y	403_T	0.727	0.13
352_N	371_D	0.727	0.13
206_I	399_T	0.725	0.13
47_T	208_I	0.723	0.13
295_P	461_G	0.723	0.13
215_F	319_F	0.721	0.13
98_T	138_Y	0.720	0.13
413_F	438_S	0.718	0.13
301_F	405_S	0.714	0.13
297_T	308_A	0.713	0.13
216_G	315_L	0.712	0.12
324_A	463_R	0.711	0.12
213_F	391_G	0.711	0.12
251_T	321_W	0.709	0.12
372_K	436_F	0.706	0.12
311_K	411_R	0.706	0.12
286_W	307_Y	0.706	0.12
252_N	286_W	0.704	0.12
190_P	198_E	0.703	0.12
300_D	388_S	0.703	0.12
70_N	190_P	0.702	0.12
236_Q	411_R	0.699	0.12
305_F	328_E	0.696	0.12
69_P	92_E	0.695	0.12
217_L	410_K	0.695	0.12
371_D	396_I	0.693	0.12
213_F	216_G	0.689	0.12
111_D	135_S	0.689	0.12
104_L	135_S	0.685	0.12
248_Y	254_D	0.682	0.12
254_D	307_Y	0.681	0.12
79_D	115_N	0.681	0.12
211_G	336_G	0.679	0.12
157_I	160_V	0.679	0.12
323_K	444_F	0.677	0.12
377_L	396_I	0.676	0.12
322_E	397_G	0.673	0.12
420_V	440_P	0.668	0.12
245_I	324_A	0.664	0.12
200_T	415_P	0.664	0.12
166_L	171_N	0.662	0.12
438_S	442_L	0.662	0.12
295_P	321_W	0.658	0.12
78_I	246_D	0.658	0.12
69_P	117_K	0.658	0.12
250_V	314_E	0.657	0.12
252_N	262_I	0.657	0.12
289_R	297_T	0.656	0.12
220_N	233_V	0.656	0.12
167_V	206_I	0.655	0.12
52_I	78_I	0.655	0.12
216_G	316_P	0.655	0.12
315_L	322_E	0.654	0.12
243_F	431_L	0.653	0.12
334_P	464_C	0.651	0.12
158_F	161_E	0.651	0.12
258_F	443_M	0.648	0.11
131_D	208_I	0.647	0.11
327_G	331_N	0.646	0.11
314_E	462_I	0.646	0.11
334_P	466_K	0.644	0.11
312_G	394_G	0.644	0.11
408_K	420_V	0.642	0.11
211_G	326_R	0.641	0.11
212_F	239_W	0.641	0.11
216_G	433_G	0.641	0.11
58_A	65_C	0.641	0.11
90_A	119_E	0.640	0.11
333_W	383_E	0.640	0.11
346_Y	396_I	0.640	0.11
295_P	398_G	0.638	0.11
258_F	289_R	0.636	0.11
345_Q	396_I	0.635	0.11
59_E	63_G	0.635	0.11
310_Y	443_M	0.635	0.11
42_D	48_L	0.634	0.11
245_I	343_K	0.632	0.11
284_T	287_D	0.630	0.11
332_V	337_D	0.629	0.11
133_R	242_P	0.628	0.11
308_A	403_T	0.625	0.11
236_Q	415_P	0.623	0.11
203_D	403_T	0.623	0.11
193_L	196_E	0.622	0.11
43_N	48_L	0.622	0.11
333_W	352_N	0.620	0.11
318_E	388_S	0.620	0.11
335_W	378_T	0.619	0.11
401_E	463_R	0.614	0.11
317_T	415_P	0.613	0.11
305_F	404_R	0.613	0.11
114_A	154_L	0.611	0.11
250_V	397_G	0.611	0.11
199_K	383_E	0.611	0.11
58_A	62_F	0.608	0.11
250_V	400_W	0.607	0.11
202_E	466_K	0.607	0.11
108_K	240_L	0.606	0.11
335_W	373_E	0.605	0.11
322_E	448_R	0.605	0.11
321_W	344_V	0.605	0.11
216_G	461_G	0.604	0.11
393_C	433_G	0.604	0.11
307_Y	389_P	0.604	0.11
255_Y	325_A	0.603	0.11
298_G	459_E	0.602	0.11
232_A	421_P	0.601	0.11
187_E	389_P	0.601	0.11
415_P	419_N	0.600	0.11
198_E	325_A	0.598	0.11
58_A	71_T	0.598	0.11
252_N	334_P	0.597	0.11
126_S	430_V	0.597	0.11
301_F	319_F	0.596	0.11
294_H	327_G	0.596	0.11
205_M	239_W	0.594	0.11
325_A	377_L	0.592	0.11
316_P	322_E	0.590	0.11
136_I	153_T	0.590	0.11
246_D	312_G	0.588	0.11
36_D	194_I	0.583	0.11
247_K	299_I	0.583	0.11
311_K	464_C	0.583	0.11
251_T	254_D	0.582	0.11
411_R	418_E	0.581	0.11
215_F	318_E	0.578	0.10
79_D	108_K	0.578	0.10
318_E	463_R	0.578	0.10
408_K	418_E	0.577	0.10
300_D	319_F	0.576	0.10
256_D	292_D	0.575	0.10
69_P	131_D	0.573	0.10
149_K	384_Q	0.573	0.10
68_Y	246_D	0.573	0.10
322_E	433_G	0.571	0.10
261_F	286_W	0.571	0.10
124_Y	127_S	0.570	0.10
311_K	466_K	0.569	0.10
240_L	259_T	0.569	0.10
401_E	462_I	0.568	0.10
298_G	449_A	0.567	0.10
295_P	324_A	0.567	0.10
321_W	376_H	0.566	0.10
286_W	443_M	0.564	0.10
78_I	97_L	0.563	0.10
124_Y	131_D	0.563	0.10
98_T	154_L	0.561	0.10
69_P	118_I	0.561	0.10
67_A	128_I	0.560	0.10
316_P	434_G	0.560	0.10
119_E	430_V	0.560	0.10
310_Y	334_P	0.557	0.10
322_E	402_W	0.556	0.10
87_Y	115_N	0.556	0.10
249_P	269_F	0.555	0.10
94_I	100_D	0.555	0.10
265_N	285_Y	0.555	0.10
212_F	249_P	0.554	0.10
260_E	299_I	0.553	0.10
34_K	46_M	0.553	0.10
143_V	153_T	0.552	0.10
304_A	461_G	0.552	0.10
306_A	310_Y	0.550	0.10
396_I	403_T	0.550	0.10
54_H	102_D	0.549	0.10
204_G	247_K	0.548	0.10
205_M	428_F	0.547	0.10
252_N	312_G	0.546	0.10
327_G	392_V	0.546	0.10
301_F	444_F	0.545	0.10
319_F	446_S	0.545	0.10
388_S	461_G	0.544	0.10
262_I	403_T	0.544	0.10
81_V	101_P	0.541	0.10
230_K	248_Y	0.541	0.10
43_N	206_I	0.539	0.10
113_C	299_I	0.536	0.10
449_A	457_H	0.533	0.10
213_F	402_W	0.532	0.10
261_F	317_T	0.531	0.10
407_L	415_P	0.531	0.10
200_T	408_K	0.531	0.10
414_H	417_F	0.530	0.10
344_V	371_D	0.530	0.10
40_L	115_N	0.529	0.10
322_E	461_G	0.529	0.10
208_I	211_G	0.528	0.10
57_A	70_N	0.528	0.10
300_D	304_A	0.528	0.10
315_L	397_G	0.526	0.10
81_V	127_S	0.526	0.10
258_F	334_P	0.525	0.10
252_N	306_A	0.524	0.10
317_T	401_E	0.521	0.10
295_P	462_I	0.520	0.10
134_E	146_G	0.520	0.10
413_F	427_S	0.519	0.10
268_I	298_G	0.519	0.10
255_Y	297_T	0.517	0.10
411_R	414_H	0.516	0.10
114_A	153_T	0.516	0.10
135_S	157_I	0.516	0.10
409_T	460_M	0.516	0.10
219_E	250_V	0.516	0.10
380_D	444_F	0.516	0.10
108_K	119_E	0.515	0.10
216_G	398_G	0.515	0.10
182_N	333_W	0.515	0.10
129_I	256_D	0.514	0.10
36_D	39_S	0.514	0.10
185_F	205_M	0.514	0.10
333_W	399_T	0.513	0.10
380_D	445_P	0.513	0.10
396_I	443_M	0.512	0.10
42_D	46_M	0.512	0.10
57_A	139_P	0.511	0.10
53_Q	296_V	0.511	0.10
104_L	298_G	0.510	0.10
138_Y	153_T	0.510	0.10
193_L	307_Y	0.510	0.10
214_E	253_K	0.510	0.10
122_V	129_I	0.510	0.10
64_M	69_P	0.509	0.10
287_D	307_Y	0.509	0.10
80_F	101_P	0.507	0.10
46_M	49_L	0.507	0.10
140_K	209_P	0.506	0.10
375_N	403_T	0.505	0.10
259_T	286_W	0.504	0.10
102_D	389_P	0.504	0.10
36_D	60_N	0.502	0.09
255_Y	436_F	0.501	0.09
255_Y	267_H	0.501	0.09
391_G	463_R	0.501	0.09
248_Y	380_D	0.500	0.09
212_F	375_N	0.500	0.09
216_G	321_W	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2q17A	1	0.5236	100	0.539	Contact Map
1z70X	1	0.5195	100	0.54	Contact Map
4x8eA	2	0.8131	100	0.553	Contact Map
1y4jA	2	0.4784	100	0.563	Contact Map
2y3cA	1	0.4743	100	0.594	Contact Map
1yu0A	3	0.7351	100	0.599	Contact Map
2dfsA	2	0.2936	88	0.969	Contact Map
3ojaB	1	0.2752	77.2	0.973	Contact Map
4iopA	1	0.2341	27	0.98	Contact Map
3dwaA	3	0.1355	26.4	0.98	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0119 seconds.