YBCC - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YBCC - UPF0753 protein YbcC

UniProt:	O34688	Sequences: MGITSVLTKDNVKKIDTDIDVQERDLNVFITSASRVIAPLWPISTFAARNPWMGLENQPFDQVASWLKNTRDVDIYPSASMIRSAKNKGEIDEDFVEMGLQRWLDSHSYHIPRDVAERFCHAALKLDPLPSDLLSSHELEKLVSECSGLDHIENVFMQPLSSYIENQDGERLVNILDHHVIKWSKLYLDDSQAGWTMPNREEGFYRAWQHLIQYDPALSKKQRERVKGWPKEAHLALQEALFALEIPESEIQTYLEGHLLSLPGWAGMMLWRSQQSSHEHALLTEYLAVRISMEWALIKPYLPLTNERSKKTISIAPLIAAWIHWGGLTLEEWSQMTASEQNEYLSFAYSFDEKLRKKLWLEAWEQTYTDRLSQKIISKQRETGREKSALAQLAFCIDVRSEPFRRQLEKEGPFETIGIAGFFGVPIATCELGSKHSHASLPIIQKPQNKIKEFADEDVFKKYNQRKQAIHSLSHTFKTMKQNALSSLLLPELSGPWLTLQMAARSFVPRKAGRFIRNLREAWLRKPDTKLSLHHDATEAEIPVGFTDEEKVNYARQALKMMGLTENIAPLVVICGHGSQSTNNPYSAALDCGACGGAAGGFNARVLAALCNLSEVREALLAEGIKIPEDTVFAAAEHNTTVDELHWLYVPELSEAAQEAFEQIEAVMPKVRHHVNAERLAQLPNFQSKLKNPKAEANRFAEDWSEIRPEWGLARNAAFIIGKRELTQDCDLEGRAFLHNYDWKQDESGELLANIIVGPGTVAQWINLQYYASTVAPHYYGSGNKATQTVTAGLGVMQGNASDLLAGLPWQSVMESDHEAYHSPLRLLILIQAPREYVERLLNHDSAFLQKVQNGWVRLASLDPEGCWESW	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	871 (683)
Sequences:	410 (336)
Seq/√Len:	12.9

BACSU - YBCC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
570_P	660_A	9.121	1.00
388_S	630_D	8.992	1.00
552_V	619_A	6.596	1.00
556_R	623_E	6.352	1.00
553_N	623_E	6.161	1.00
575_C	636_A	5.533	1.00
756_I	831_I	5.130	1.00
760_G	829_I	4.770	1.00
440_S	603_N	4.673	1.00
555_A	611_C	4.156	1.00
570_P	657_A	4.010	1.00
580_Q	639_N	3.863	0.99
392_Q	569_A	3.596	0.99
810_W	813_V	3.591	0.99
621_L	626_K	3.535	0.99
368_Y	717_A	3.065	0.97
189_D	192_Q	3.044	0.97
838_V	861_S	3.035	0.97
726_L	832_Q	3.007	0.97
441_L	740_N	3.000	0.96
603_N	616_V	2.834	0.95
657_A	660_A	2.800	0.95
586_Y	809_P	2.760	0.94
415_E	740_N	2.759	0.94
643_D	679_R	2.731	0.94
259_L	266_A	2.730	0.94
394_A	417_I	2.726	0.94
281_A	285_E	2.723	0.94
551_K	613_L	2.699	0.94
753_A	844_H	2.659	0.93
828_L	860_A	2.633	0.93
572_V	633_F	2.616	0.92
393_L	573_V	2.611	0.92
849_L	853_Q	2.563	0.92
233_A	285_E	2.529	0.91
787_T	798_Q	2.527	0.91
393_L	575_C	2.438	0.89
565_T	568_I	2.418	0.89
573_V	668_M	2.375	0.88
547_T	550_E	2.347	0.88
394_A	574_I	2.336	0.87
568_I	628_P	2.312	0.87
399_V	590_L	2.300	0.86
237_L	288_A	2.283	0.86
721_I	759_P	2.266	0.86
634_A	705_S	2.252	0.85
555_A	610_L	2.214	0.84
441_L	607_L	2.209	0.84
590_L	812_S	2.184	0.83
556_R	560_K	2.147	0.82
797_M	802_S	2.146	0.82
764_Q	768_L	2.112	0.81
601_G	637_E	2.082	0.80
771_Y	775_V	2.052	0.79
403_P	675_V	2.036	0.79
605_R	649_Y	2.018	0.78
364_W	825_L	2.001	0.77
718_A	736_A	1.985	0.77
207_A	252_Q	1.984	0.77
361_L	786_A	1.978	0.77
176_L	413_P	1.934	0.75
417_I	562_M	1.916	0.74
176_L	791_T	1.898	0.73
684_P	777_P	1.887	0.73
255_L	368_Y	1.869	0.72
721_I	763_A	1.835	0.71
204_F	720_I	1.835	0.71
753_A	845_D	1.827	0.70
421_G	600_G	1.817	0.70
591_D	606_V	1.806	0.70
582_T	712_G	1.806	0.70
717_A	735_R	1.805	0.69
776_A	813_V	1.803	0.69
444_I	600_G	1.800	0.69
572_V	631_T	1.779	0.68
611_C	723_K	1.758	0.67
364_W	367_T	1.724	0.66
632_V	654_S	1.724	0.66
713_L	812_S	1.720	0.66
204_F	281_A	1.715	0.65
181_I	802_S	1.711	0.65
503_A	794_L	1.708	0.65
251_I	855_G	1.683	0.64
723_K	832_Q	1.678	0.64
229_W	292_S	1.669	0.63
568_I	627_I	1.664	0.63
451_I	591_D	1.664	0.63
399_V	713_L	1.660	0.63
664_I	668_M	1.660	0.63
713_L	765_W	1.656	0.63
241_L	255_L	1.649	0.62
395_F	424_G	1.647	0.62
509_P	563_G	1.634	0.61
570_P	630_D	1.628	0.61
607_L	611_C	1.602	0.60
555_A	607_L	1.599	0.60
399_V	734_G	1.598	0.60
481_K	590_L	1.586	0.59
704_W	759_P	1.581	0.59
624_G	727_T	1.581	0.59
397_I	739_H	1.579	0.59
588_A	748_S	1.576	0.59
401_S	713_L	1.568	0.58
397_I	600_G	1.559	0.58
429_T	440_S	1.558	0.58
243_A	299_K	1.558	0.58
236_A	292_S	1.554	0.57
760_G	848_F	1.550	0.57
585_P	790_V	1.540	0.57
788_Q	798_Q	1.538	0.57
221_K	836_E	1.524	0.56
189_D	193_A	1.523	0.56
210_H	249_S	1.512	0.55
568_I	625_I	1.509	0.55
711_W	734_G	1.498	0.55
713_L	759_P	1.497	0.55
644_E	698_N	1.483	0.54
189_D	195_W	1.480	0.54
207_A	755_I	1.472	0.53
251_I	258_H	1.471	0.53
193_A	604_A	1.450	0.52
757_V	845_D	1.447	0.52
703_D	706_E	1.444	0.52
616_V	701_A	1.442	0.52
563_G	864_P	1.441	0.52
421_G	424_G	1.440	0.52
649_Y	707_I	1.433	0.51
632_V	657_A	1.425	0.51
507_F	657_A	1.424	0.51
394_A	729_D	1.423	0.51
204_F	289_V	1.412	0.50
361_L	758_G	1.406	0.50
571_L	720_I	1.402	0.50
555_A	723_K	1.401	0.50
401_S	765_W	1.401	0.50
596_G	825_L	1.399	0.49
237_L	503_A	1.397	0.49
205_Y	242_F	1.395	0.49
603_N	751_L	1.392	0.49
401_S	711_W	1.387	0.49
589_A	655_E	1.387	0.49
587_S	590_L	1.385	0.49
590_L	713_L	1.384	0.49
213_Q	451_I	1.383	0.49
759_P	765_W	1.381	0.48
491_P	704_W	1.379	0.48
401_S	759_P	1.374	0.48
590_L	834_P	1.368	0.48
558_A	740_N	1.367	0.48
706_E	727_T	1.366	0.48
172_L	857_V	1.363	0.48
197_M	200_R	1.362	0.48
798_Q	805_L	1.355	0.47
272_R	275_Q	1.350	0.47
599_A	711_W	1.345	0.47
581_S	769_Q	1.344	0.47
600_G	605_R	1.336	0.46
763_A	829_I	1.331	0.46
780_Y	831_I	1.329	0.46
453_E	803_D	1.324	0.46
161_S	164_I	1.321	0.45
665_E	748_S	1.318	0.45
670_K	673_H	1.318	0.45
701_A	831_I	1.317	0.45
553_N	627_I	1.316	0.45
684_P	776_A	1.316	0.45
625_I	662_E	1.314	0.45
505_R	707_I	1.313	0.45
848_F	852_V	1.304	0.45
777_P	786_A	1.302	0.44
222_Q	226_V	1.301	0.44
634_A	649_Y	1.292	0.44
191_S	832_Q	1.291	0.44
189_D	545_G	1.291	0.44
198_P	545_G	1.287	0.44
629_E	747_E	1.286	0.44
389_A	567_N	1.282	0.43
418_G	737_F	1.280	0.43
453_E	545_G	1.279	0.43
359_L	384_G	1.273	0.43
547_T	864_P	1.270	0.43
704_W	713_L	1.270	0.43
647_W	661_F	1.266	0.43
184_S	716_N	1.263	0.42
547_T	819_E	1.261	0.42
777_P	810_W	1.258	0.42
492_E	834_P	1.257	0.42
392_Q	564_L	1.256	0.42
430_C	450_K	1.256	0.42
713_L	739_H	1.241	0.41
737_F	767_N	1.240	0.41
496_P	776_A	1.239	0.41
181_I	262_L	1.235	0.41
736_A	831_I	1.235	0.41
246_I	564_L	1.227	0.41
611_C	769_Q	1.222	0.40
618_E	636_A	1.216	0.40
582_T	791_T	1.215	0.40
187_Y	254_Y	1.210	0.40
590_L	765_W	1.209	0.40
605_R	678_E	1.208	0.40
293_M	784_N	1.208	0.40
571_L	664_I	1.207	0.40
579_S	641_T	1.207	0.40
399_V	711_W	1.206	0.40
165_E	786_A	1.205	0.39
596_G	810_W	1.204	0.39
407_Q	428_A	1.199	0.39
174_N	725_E	1.196	0.39
285_E	736_A	1.190	0.39
241_L	772_A	1.186	0.39
440_S	616_V	1.182	0.38
751_L	754_N	1.181	0.38
185_K	791_T	1.176	0.38
291_I	373_S	1.175	0.38
788_Q	805_L	1.174	0.38
768_L	771_Y	1.174	0.38
791_T	802_S	1.173	0.38
734_G	782_S	1.172	0.38
441_L	793_G	1.172	0.38
682_Q	821_Y	1.172	0.38
720_I	727_T	1.171	0.38
444_I	757_V	1.170	0.38
473_L	581_S	1.169	0.38
616_V	751_L	1.168	0.38
492_E	590_L	1.167	0.38
743_W	749_G	1.164	0.37
431_E	434_S	1.162	0.37
699_R	706_E	1.160	0.37
394_A	562_M	1.159	0.37
713_L	731_D	1.158	0.37
401_S	734_G	1.157	0.37
217_A	294_E	1.157	0.37
549_E	619_A	1.154	0.37
369_T	858_R	1.153	0.37
241_L	251_I	1.153	0.37
607_L	707_I	1.152	0.37
359_L	553_N	1.151	0.37
581_S	716_N	1.151	0.37
590_L	787_T	1.149	0.37
561_M	754_N	1.146	0.37
259_L	495_G	1.130	0.36
208_W	753_A	1.130	0.36
359_L	688_S	1.126	0.36
372_L	718_A	1.123	0.36
395_F	708_R	1.122	0.35
399_V	765_W	1.117	0.35
835_R	861_S	1.115	0.35
401_S	590_L	1.112	0.35
285_E	368_Y	1.112	0.35
492_E	800_N	1.110	0.35
704_W	765_W	1.108	0.35
590_L	711_W	1.106	0.35
739_H	769_Q	1.106	0.35
359_L	427_I	1.102	0.35
258_H	294_E	1.101	0.34
438_H	558_A	1.097	0.34
704_W	711_W	1.095	0.34
386_E	614_S	1.094	0.34
761_T	768_L	1.094	0.34
237_L	246_I	1.094	0.34
588_A	685_N	1.093	0.34
283_L	509_P	1.093	0.34
426_P	712_G	1.091	0.34
183_W	764_Q	1.089	0.34
555_A	739_H	1.088	0.34
361_L	825_L	1.086	0.34
590_L	759_P	1.084	0.34
716_N	767_N	1.083	0.34
502_M	636_A	1.083	0.34
655_E	843_N	1.080	0.33
195_W	775_V	1.077	0.33
386_E	725_E	1.068	0.33
452_K	732_L	1.067	0.33
840_R	844_H	1.065	0.33
702_E	740_N	1.059	0.33
563_G	716_N	1.059	0.33
260_L	705_S	1.059	0.33
168_D	552_V	1.059	0.33
570_P	728_Q	1.058	0.32
610_L	813_V	1.057	0.32
367_T	823_S	1.057	0.32
413_P	621_L	1.057	0.32
368_Y	825_L	1.053	0.32
711_W	759_P	1.052	0.32
615_E	687_Q	1.048	0.32
266_A	610_L	1.047	0.32
399_V	733_E	1.045	0.32
579_S	591_D	1.042	0.32
359_L	636_A	1.040	0.32
254_Y	271_W	1.039	0.32
636_A	647_W	1.038	0.32
184_S	706_E	1.037	0.32
392_Q	417_I	1.037	0.32
224_E	831_I	1.036	0.31
832_Q	864_P	1.035	0.31
184_S	820_A	1.035	0.31
353_E	634_A	1.035	0.31
399_V	812_S	1.034	0.31
391_A	664_I	1.034	0.31
512_A	862_L	1.033	0.31
492_E	759_P	1.033	0.31
580_Q	797_M	1.031	0.31
619_A	622_A	1.031	0.31
216_P	219_S	1.030	0.31
579_S	582_T	1.030	0.31
429_T	789_T	1.029	0.31
680_L	693_P	1.029	0.31
764_Q	851_K	1.029	0.31
685_N	693_P	1.027	0.31
791_T	797_M	1.026	0.31
391_A	394_A	1.025	0.31
491_P	502_M	1.025	0.31
733_E	846_S	1.020	0.31
662_E	683_L	1.019	0.31
758_G	788_Q	1.017	0.31
627_I	633_F	1.013	0.30
391_A	504_A	1.011	0.30
590_L	704_W	1.009	0.30
504_A	636_A	1.006	0.30
501_Q	507_F	1.006	0.30
719_F	763_A	1.006	0.30
715_R	821_Y	1.006	0.30
552_V	622_A	1.005	0.30
586_Y	682_Q	1.003	0.30
787_T	812_S	1.002	0.30
456_D	701_A	1.001	0.30
492_E	713_L	1.001	0.30
714_A	775_V	0.997	0.30
531_L	727_T	0.996	0.30
765_W	812_S	0.996	0.30
433_G	445_Q	0.994	0.30
429_T	453_E	0.991	0.29
616_V	866_G	0.991	0.29
843_N	846_S	0.991	0.29
588_A	767_N	0.990	0.29
425_V	607_L	0.988	0.29
676_N	814_M	0.986	0.29
182_K	716_N	0.986	0.29
734_G	784_N	0.986	0.29
739_H	759_P	0.984	0.29
634_A	707_I	0.983	0.29
579_S	831_I	0.982	0.29
160_L	517_R	0.982	0.29
769_Q	812_S	0.982	0.29
729_D	751_L	0.976	0.29
269_M	277_S	0.975	0.29
182_K	797_M	0.975	0.29
570_P	656_A	0.974	0.29
361_L	376_I	0.973	0.29
290_R	703_D	0.972	0.29
371_R	701_A	0.964	0.28
503_A	699_R	0.962	0.28
687_Q	720_I	0.962	0.28
224_E	454_F	0.960	0.28
415_E	817_D	0.958	0.28
177_D	684_P	0.958	0.28
401_S	704_W	0.956	0.28
204_F	439_A	0.956	0.28
204_F	269_M	0.954	0.28
587_S	621_L	0.952	0.28
490_L	715_R	0.951	0.28
831_I	864_P	0.949	0.28
158_Q	161_S	0.947	0.28
188_L	550_E	0.946	0.28
249_S	629_E	0.945	0.28
386_E	727_T	0.944	0.27
165_E	204_F	0.943	0.27
413_P	841_L	0.943	0.27
591_D	716_N	0.943	0.27
505_R	568_I	0.943	0.27
417_I	790_V	0.942	0.27
166_N	294_E	0.937	0.27
507_F	698_N	0.936	0.27
723_K	802_S	0.936	0.27
672_R	793_G	0.933	0.27
392_Q	631_T	0.933	0.27
181_I	797_M	0.931	0.27
513_G	634_A	0.931	0.27
360_W	661_F	0.930	0.27
442_P	709_P	0.930	0.27
590_L	596_G	0.929	0.27
224_E	394_A	0.928	0.27
352_D	571_L	0.928	0.27
467_K	663_Q	0.926	0.27
387_K	457_E	0.925	0.27
546_F	610_L	0.923	0.27
473_L	852_V	0.923	0.27
636_A	645_L	0.923	0.27
600_G	760_G	0.922	0.27
168_D	648_L	0.920	0.27
558_A	567_N	0.920	0.27
621_L	794_L	0.920	0.27
359_L	663_Q	0.917	0.26
647_W	650_V	0.916	0.26
591_D	701_A	0.911	0.26
558_A	722_G	0.909	0.26
672_R	676_N	0.905	0.26
295_W	299_K	0.905	0.26
500_L	571_L	0.904	0.26
232_E	235_L	0.903	0.26
547_T	572_V	0.901	0.26
453_E	568_I	0.901	0.26
427_I	451_I	0.901	0.26
202_E	662_E	0.900	0.26
716_N	839_E	0.900	0.26
292_S	839_E	0.898	0.26
169_G	284_T	0.897	0.26
286_Y	771_Y	0.896	0.26
711_W	765_W	0.896	0.26
844_H	852_V	0.895	0.26
491_P	734_G	0.894	0.25
549_E	836_E	0.893	0.25
288_A	838_V	0.892	0.25
507_F	830_L	0.891	0.25
591_D	598_A	0.889	0.25
459_V	530_K	0.889	0.25
704_W	834_P	0.888	0.25
200_R	283_L	0.888	0.25
441_L	562_M	0.888	0.25
497_W	503_A	0.887	0.25
159_P	836_E	0.886	0.25
756_I	797_M	0.883	0.25
789_T	802_S	0.882	0.25
662_E	665_E	0.882	0.25
399_V	589_A	0.879	0.25
200_R	207_A	0.879	0.25
320_A	571_L	0.878	0.25
407_Q	445_Q	0.878	0.25
438_H	598_A	0.877	0.25
607_L	797_M	0.876	0.25
399_V	715_R	0.873	0.25
240_A	727_T	0.873	0.25
704_W	731_D	0.871	0.25
588_A	749_G	0.869	0.25
397_I	757_V	0.868	0.24
187_Y	562_M	0.865	0.24
731_D	812_S	0.865	0.24
294_E	390_L	0.865	0.24
208_W	703_D	0.863	0.24
474_S	656_A	0.862	0.24
587_S	711_W	0.862	0.24
208_W	229_W	0.862	0.24
713_L	769_Q	0.859	0.24
734_G	800_N	0.856	0.24
227_K	459_V	0.855	0.24
739_H	755_I	0.855	0.24
676_N	680_L	0.855	0.24
713_L	734_G	0.854	0.24
272_R	637_E	0.854	0.24
603_N	641_T	0.853	0.24
239_E	295_W	0.853	0.24
509_P	581_S	0.853	0.24
288_A	701_A	0.851	0.24
243_A	552_V	0.851	0.24
173_V	177_D	0.849	0.24
549_E	771_Y	0.848	0.24
599_A	763_A	0.848	0.24
649_Y	819_E	0.847	0.24
215_D	445_Q	0.847	0.24
175_I	426_P	0.846	0.24
217_A	300_P	0.845	0.24
830_L	840_R	0.844	0.24
269_M	599_A	0.843	0.24
619_A	729_D	0.842	0.23
581_S	591_D	0.841	0.23
556_R	695_A	0.839	0.23
715_R	734_G	0.839	0.23
245_E	390_L	0.839	0.23
629_E	729_D	0.838	0.23
639_N	780_Y	0.835	0.23
397_I	763_A	0.834	0.23
403_P	734_G	0.833	0.23
614_S	717_A	0.832	0.23
233_A	666_A	0.832	0.23
490_L	496_P	0.831	0.23
488_L	492_E	0.831	0.23
362_E	706_E	0.829	0.23
749_G	837_Y	0.828	0.23
359_L	588_A	0.827	0.23
492_E	765_W	0.826	0.23
716_N	764_Q	0.825	0.23
547_T	655_E	0.823	0.23
193_A	825_L	0.823	0.23
722_G	814_M	0.820	0.23
401_S	492_E	0.818	0.23
249_S	549_E	0.818	0.23
286_Y	791_T	0.815	0.22
622_A	666_A	0.814	0.22
615_E	728_Q	0.810	0.22
267_G	761_T	0.810	0.22
452_K	658_Q	0.808	0.22
352_D	551_K	0.807	0.22
582_T	587_S	0.807	0.22
195_W	198_P	0.806	0.22
451_I	706_E	0.806	0.22
415_E	614_S	0.806	0.22
635_A	829_I	0.803	0.22
193_A	771_Y	0.802	0.22
285_E	675_V	0.802	0.22
364_W	496_P	0.802	0.22
447_P	653_L	0.802	0.22
195_W	283_L	0.801	0.22
379_K	556_R	0.799	0.22
320_A	551_K	0.799	0.22
220_K	707_I	0.797	0.22
233_A	373_S	0.797	0.22
555_A	672_R	0.797	0.22
384_G	572_V	0.796	0.22
418_G	767_N	0.796	0.22
616_V	697_A	0.796	0.22
488_L	491_P	0.795	0.22
414_F	798_Q	0.794	0.22
477_F	490_L	0.794	0.22
401_S	719_F	0.793	0.22
401_S	812_S	0.792	0.22
713_L	834_P	0.791	0.22
262_L	777_P	0.791	0.22
323_I	547_T	0.789	0.22
420_A	635_A	0.787	0.21
691_K	854_N	0.786	0.21
207_A	771_Y	0.785	0.21
451_I	520_R	0.784	0.21
176_L	354_K	0.784	0.21
399_V	704_W	0.783	0.21
578_G	768_L	0.782	0.21
438_H	706_E	0.782	0.21
642_V	671_V	0.782	0.21
187_Y	201_E	0.781	0.21
696_E	706_E	0.778	0.21
419_I	561_M	0.778	0.21
615_E	659_E	0.777	0.21
505_R	582_T	0.776	0.21
567_N	725_E	0.776	0.21
161_S	806_A	0.776	0.21
582_T	591_D	0.776	0.21
676_N	693_P	0.775	0.21
184_S	205_Y	0.774	0.21
492_E	704_W	0.774	0.21
682_Q	849_L	0.773	0.21
777_P	793_G	0.773	0.21
545_G	855_G	0.772	0.21
589_A	777_P	0.772	0.21
274_Q	829_I	0.769	0.21
491_P	800_N	0.769	0.21
289_V	443_I	0.768	0.21
428_A	649_Y	0.768	0.21
502_M	708_R	0.767	0.21
402_E	703_D	0.767	0.21
759_P	834_P	0.762	0.21
283_L	453_E	0.761	0.21
196_T	589_A	0.761	0.21
487_S	557_Q	0.761	0.21
160_L	220_K	0.760	0.21
357_K	645_L	0.758	0.20
271_W	275_Q	0.757	0.20
448_Q	558_A	0.755	0.20
217_A	407_Q	0.755	0.20
417_I	564_L	0.754	0.20
574_I	720_I	0.753	0.20
549_E	655_E	0.752	0.20
216_P	642_V	0.752	0.20
375_K	558_A	0.752	0.20
228_G	380_Q	0.751	0.20
581_S	715_R	0.751	0.20
481_K	704_W	0.751	0.20
243_A	819_E	0.750	0.20
263_P	749_G	0.750	0.20
687_Q	693_P	0.749	0.20
241_L	733_E	0.748	0.20
189_D	604_A	0.746	0.20
487_S	682_Q	0.745	0.20
682_Q	715_R	0.744	0.20
232_E	388_S	0.743	0.20
728_Q	830_L	0.741	0.20
177_D	205_Y	0.740	0.20
626_K	692_N	0.740	0.20
713_L	719_F	0.738	0.20
215_D	230_P	0.737	0.20
270_L	274_Q	0.737	0.20
293_M	805_L	0.737	0.20
558_A	562_M	0.737	0.20
399_V	596_G	0.736	0.20
676_N	784_N	0.735	0.20
765_W	834_P	0.735	0.20
576_G	714_A	0.734	0.20
427_I	579_S	0.733	0.20
390_L	721_I	0.731	0.20
585_P	771_Y	0.730	0.20
774_T	820_A	0.729	0.20
841_L	859_L	0.728	0.19
821_Y	850_Q	0.726	0.19
183_W	204_F	0.726	0.19
259_L	794_L	0.725	0.19
443_I	596_G	0.723	0.19
444_I	758_G	0.723	0.19
561_M	857_V	0.723	0.19
704_W	734_G	0.723	0.19
531_L	830_L	0.722	0.19
731_D	765_W	0.722	0.19
441_L	723_K	0.722	0.19
765_W	793_G	0.721	0.19
556_R	700_F	0.719	0.19
202_E	549_E	0.719	0.19
337_T	552_V	0.719	0.19
233_A	857_V	0.718	0.19
453_E	591_D	0.717	0.19
706_E	743_W	0.717	0.19
696_E	756_I	0.716	0.19
397_I	421_G	0.716	0.19
208_W	271_W	0.716	0.19
247_P	728_Q	0.716	0.19
371_R	566_E	0.715	0.19
368_Y	756_I	0.715	0.19
723_K	789_T	0.713	0.19
231_K	630_D	0.713	0.19
753_A	841_L	0.713	0.19
428_A	589_A	0.711	0.19
422_F	714_A	0.711	0.19
353_E	547_T	0.710	0.19
444_I	502_M	0.709	0.19
420_A	759_P	0.709	0.19
361_L	369_T	0.709	0.19
480_M	755_I	0.709	0.19
238_Q	560_K	0.709	0.19
588_A	673_H	0.709	0.19
187_Y	354_K	0.708	0.19
427_I	603_N	0.708	0.19
271_W	277_S	0.707	0.19
433_G	585_P	0.706	0.19
487_S	496_P	0.706	0.19
231_K	236_A	0.705	0.19
371_R	458_D	0.705	0.19
734_G	765_W	0.704	0.19
580_Q	707_I	0.704	0.19
213_Q	387_K	0.702	0.19
713_L	761_T	0.701	0.19
302_L	840_R	0.700	0.19
209_Q	829_I	0.700	0.19
444_I	706_E	0.699	0.19
410_K	699_R	0.699	0.19
716_N	755_I	0.699	0.19
622_A	665_E	0.699	0.19
687_Q	695_A	0.698	0.19
282_L	794_L	0.698	0.19
401_S	739_H	0.698	0.19
290_R	753_A	0.698	0.19
573_V	636_A	0.698	0.19
683_L	763_A	0.697	0.18
737_F	766_I	0.696	0.18
178_H	645_L	0.696	0.18
182_K	764_Q	0.695	0.18
394_A	561_M	0.695	0.18
411_E	782_S	0.694	0.18
831_I	838_V	0.693	0.18
273_S	283_L	0.693	0.18
420_A	738_L	0.693	0.18
359_L	652_E	0.692	0.18
798_Q	851_K	0.692	0.18
177_D	197_M	0.692	0.18
383_T	854_N	0.692	0.18
637_E	641_T	0.691	0.18
171_R	191_S	0.691	0.18
215_D	757_V	0.690	0.18
552_V	813_V	0.690	0.18
245_E	299_K	0.690	0.18
708_R	768_L	0.689	0.18
773_S	788_Q	0.688	0.18
587_S	812_S	0.686	0.18
212_I	780_Y	0.684	0.18
776_A	786_A	0.684	0.18
829_I	852_V	0.684	0.18
704_W	761_T	0.684	0.18
181_I	798_Q	0.683	0.18
717_A	803_D	0.680	0.18
218_L	481_K	0.680	0.18
549_E	663_Q	0.679	0.18
476_T	777_P	0.678	0.18
192_Q	195_W	0.677	0.18
263_P	267_G	0.676	0.18
234_H	655_E	0.676	0.18
298_I	604_A	0.676	0.18
684_P	760_G	0.675	0.18
500_L	547_T	0.674	0.18
413_P	736_A	0.673	0.18
258_H	798_Q	0.672	0.18
761_T	765_W	0.672	0.18
420_A	851_K	0.671	0.18
650_V	665_E	0.669	0.18
639_N	789_T	0.669	0.18
507_F	558_A	0.668	0.18
384_G	387_K	0.666	0.18
431_E	599_A	0.665	0.18
549_E	569_A	0.665	0.18
734_G	820_A	0.665	0.18
507_F	634_A	0.665	0.18
415_E	602_F	0.665	0.18
566_E	688_S	0.664	0.17
431_E	681_A	0.663	0.17
184_S	451_I	0.662	0.17
300_P	771_Y	0.662	0.17
703_D	774_T	0.662	0.17
716_N	803_D	0.661	0.17
426_P	554_Y	0.660	0.17
486_S	502_M	0.660	0.17
642_V	851_K	0.659	0.17
639_N	648_L	0.659	0.17
237_L	291_I	0.659	0.17
483_N	607_L	0.659	0.17
491_P	759_P	0.658	0.17
374_Q	514_R	0.657	0.17
184_S	433_G	0.657	0.17
322_W	610_L	0.657	0.17
570_P	705_S	0.656	0.17
360_W	613_L	0.656	0.17
371_R	379_K	0.656	0.17
528_D	636_A	0.655	0.17
435_K	852_V	0.655	0.17
713_L	793_G	0.654	0.17
249_S	733_E	0.653	0.17
586_Y	782_S	0.653	0.17
399_V	793_G	0.653	0.17
386_E	621_L	0.652	0.17
495_G	739_H	0.652	0.17
401_S	834_P	0.650	0.17
573_V	625_I	0.650	0.17
465_Q	669_P	0.649	0.17
501_Q	505_R	0.649	0.17
819_E	844_H	0.649	0.17
280_H	289_V	0.649	0.17
289_V	636_A	0.648	0.17
764_Q	769_Q	0.648	0.17
784_N	793_G	0.648	0.17
794_L	857_V	0.647	0.17
632_V	728_Q	0.646	0.17
357_K	753_A	0.645	0.17
415_E	660_A	0.644	0.17
557_Q	857_V	0.644	0.17
369_T	667_V	0.644	0.17
441_L	445_Q	0.643	0.17
387_K	622_A	0.642	0.17
269_M	289_V	0.642	0.17
498_L	802_S	0.642	0.17
722_G	850_Q	0.642	0.17
373_S	830_L	0.641	0.17
195_W	604_A	0.640	0.17
188_L	286_Y	0.640	0.17
283_L	550_E	0.640	0.17
431_E	712_G	0.640	0.17
788_Q	816_S	0.639	0.17
388_S	567_N	0.639	0.17
469_A	591_D	0.639	0.17
401_S	800_N	0.637	0.17
743_W	834_P	0.636	0.17
704_W	755_I	0.636	0.17
159_P	236_A	0.635	0.17
556_R	625_I	0.635	0.17
260_L	820_A	0.634	0.17
263_P	637_E	0.634	0.17
188_L	282_L	0.634	0.17
164_I	358_K	0.633	0.17
375_K	394_A	0.632	0.17
387_K	707_I	0.631	0.17
611_C	787_T	0.631	0.17
388_S	622_A	0.630	0.16
224_E	658_Q	0.630	0.16
636_A	750_E	0.629	0.16
182_K	439_A	0.629	0.16
165_E	776_A	0.628	0.16
321_A	657_A	0.628	0.16
486_S	600_G	0.626	0.16
403_P	793_G	0.625	0.16
590_L	784_N	0.625	0.16
605_R	651_P	0.625	0.16
241_L	863_D	0.625	0.16
618_E	654_S	0.622	0.16
504_A	782_S	0.622	0.16
417_I	455_A	0.621	0.16
573_V	603_N	0.621	0.16
813_V	845_D	0.621	0.16
387_K	658_Q	0.620	0.16
379_K	733_E	0.620	0.16
719_F	765_W	0.620	0.16
415_E	598_A	0.619	0.16
415_E	712_G	0.619	0.16
399_V	759_P	0.618	0.16
198_P	623_E	0.618	0.16
739_H	760_G	0.617	0.16
740_N	786_A	0.617	0.16
496_P	684_P	0.617	0.16
558_A	574_I	0.617	0.16
424_G	486_S	0.617	0.16
419_I	754_N	0.617	0.16
618_E	725_E	0.617	0.16
232_E	358_K	0.616	0.16
643_D	824_P	0.616	0.16
230_P	630_D	0.616	0.16
747_E	865_E	0.615	0.16
213_Q	844_H	0.615	0.16
831_I	866_G	0.615	0.16
567_N	844_H	0.615	0.16
268_M	820_A	0.614	0.16
275_Q	722_G	0.614	0.16
555_A	829_I	0.613	0.16
472_S	736_A	0.613	0.16
368_Y	735_R	0.612	0.16
390_L	634_A	0.611	0.16
488_L	759_P	0.611	0.16
653_L	657_A	0.610	0.16
363_A	634_A	0.610	0.16
381_R	691_K	0.610	0.16
266_A	747_E	0.609	0.16
242_F	843_N	0.609	0.16
156_F	204_F	0.609	0.16
351_F	802_S	0.608	0.16
415_E	727_T	0.608	0.16
611_C	637_E	0.608	0.16
616_V	641_T	0.608	0.16
614_S	632_V	0.606	0.16
440_S	763_A	0.606	0.16
207_A	775_V	0.605	0.16
782_S	852_V	0.605	0.16
249_S	665_E	0.605	0.16
198_P	447_P	0.604	0.16
262_L	771_Y	0.602	0.16
551_K	723_K	0.602	0.16
268_M	793_G	0.602	0.16
237_L	663_Q	0.600	0.16
713_L	820_A	0.600	0.16
268_M	491_P	0.599	0.16
267_G	832_Q	0.598	0.16
185_K	761_T	0.596	0.16
418_G	766_I	0.596	0.16
506_S	704_W	0.596	0.16
228_G	623_E	0.596	0.16
179_H	182_K	0.594	0.15
418_G	738_L	0.593	0.15
532_S	705_S	0.593	0.15
562_M	565_T	0.593	0.15
449_N	618_E	0.591	0.15
569_A	739_H	0.590	0.15
495_G	776_A	0.589	0.15
627_I	631_T	0.589	0.15
226_V	852_V	0.589	0.15
232_E	238_Q	0.587	0.15
212_I	487_S	0.587	0.15
448_Q	794_L	0.587	0.15
166_N	855_G	0.586	0.15
230_P	287_L	0.585	0.15
445_Q	600_G	0.584	0.15
451_I	476_T	0.583	0.15
517_R	634_A	0.582	0.15
417_I	740_N	0.580	0.15
205_Y	231_K	0.579	0.15
736_A	852_V	0.578	0.15
687_Q	706_E	0.578	0.15
579_S	756_I	0.576	0.15
387_K	588_A	0.574	0.15
383_T	655_E	0.574	0.15
722_G	726_L	0.573	0.15
408_L	849_L	0.573	0.15
208_W	372_L	0.572	0.15
399_V	784_N	0.572	0.15
361_L	637_E	0.571	0.15
260_L	499_T	0.571	0.15
176_L	767_N	0.569	0.15
235_L	254_Y	0.569	0.15
186_L	412_G	0.569	0.15
465_Q	519_L	0.568	0.15
383_T	550_E	0.567	0.15
492_E	711_W	0.567	0.15
662_E	688_S	0.566	0.15
218_L	858_R	0.565	0.15
615_E	618_E	0.565	0.15
694_K	714_A	0.565	0.15
376_I	437_S	0.563	0.15
229_W	614_S	0.563	0.15
201_E	410_K	0.563	0.15
213_Q	691_K	0.563	0.15
573_V	776_A	0.563	0.15
573_V	732_L	0.562	0.15
360_W	749_G	0.562	0.15
753_A	757_V	0.562	0.15
683_L	721_I	0.561	0.15
200_R	557_Q	0.561	0.15
212_I	809_P	0.561	0.15
759_P	812_S	0.561	0.15
748_S	794_L	0.560	0.15
440_S	756_I	0.560	0.15
633_F	789_T	0.559	0.15
491_P	590_L	0.558	0.15
600_G	718_A	0.558	0.15
410_K	431_E	0.558	0.15
193_A	682_Q	0.558	0.15
399_V	707_I	0.557	0.14
404_F	755_I	0.557	0.14
320_A	384_G	0.557	0.14
625_I	689_K	0.557	0.14
697_A	701_A	0.556	0.14
249_S	663_Q	0.556	0.14
322_W	485_L	0.553	0.14
420_A	829_I	0.553	0.14
418_G	795_G	0.552	0.14
444_I	816_S	0.552	0.14
456_D	636_A	0.552	0.14
324_H	579_S	0.552	0.14
189_D	708_R	0.552	0.14
599_A	637_E	0.552	0.14
627_I	736_A	0.551	0.14
650_V	855_G	0.551	0.14
810_W	820_A	0.551	0.14
571_L	736_A	0.550	0.14
230_P	719_F	0.549	0.14
466_R	555_A	0.549	0.14
635_A	842_L	0.548	0.14
565_T	745_Q	0.548	0.14
570_P	634_A	0.548	0.14
440_S	641_T	0.548	0.14
548_D	552_V	0.548	0.14
207_A	367_T	0.548	0.14
739_H	765_W	0.548	0.14
267_G	708_R	0.547	0.14
621_L	630_D	0.547	0.14
249_S	728_Q	0.546	0.14
666_A	748_S	0.546	0.14
725_E	736_A	0.546	0.14
178_H	551_K	0.546	0.14
509_P	774_T	0.546	0.14
564_L	809_P	0.545	0.14
375_K	733_E	0.544	0.14
713_L	764_Q	0.544	0.14
353_E	653_L	0.543	0.14
255_L	573_V	0.543	0.14
549_E	571_L	0.543	0.14
719_F	834_P	0.543	0.14
498_L	630_D	0.542	0.14
352_D	831_I	0.542	0.14
449_N	546_F	0.541	0.14
198_P	247_P	0.541	0.14
704_W	812_S	0.541	0.14
206_R	727_T	0.541	0.14
198_P	207_A	0.538	0.14
739_H	834_P	0.538	0.14
482_Q	677_A	0.538	0.14
660_A	728_Q	0.537	0.14
359_L	466_R	0.537	0.14
549_E	727_T	0.537	0.14
359_L	404_F	0.537	0.14
241_L	803_D	0.536	0.14
599_A	764_Q	0.535	0.14
739_H	812_S	0.535	0.14
249_S	291_I	0.535	0.14
393_L	571_L	0.535	0.14
412_G	504_A	0.535	0.14
237_L	768_L	0.534	0.14
607_L	610_L	0.534	0.14
156_F	782_S	0.533	0.14
193_A	605_R	0.533	0.14
709_P	808_L	0.533	0.14
412_G	426_P	0.532	0.14
237_L	755_I	0.532	0.14
486_S	784_N	0.532	0.14
361_L	567_N	0.530	0.14
338_A	507_F	0.529	0.14
393_L	788_Q	0.529	0.14
234_H	549_E	0.528	0.14
483_N	561_M	0.527	0.14
379_K	385_R	0.526	0.14
772_A	784_N	0.526	0.14
183_W	364_W	0.525	0.14
696_E	831_I	0.525	0.14
178_H	838_V	0.525	0.14
219_S	732_L	0.524	0.14
383_T	634_A	0.523	0.14
715_R	764_Q	0.519	0.14
176_L	673_H	0.519	0.14
794_L	835_R	0.518	0.14
564_L	567_N	0.518	0.14
607_L	821_Y	0.518	0.14
203_G	863_D	0.517	0.13
208_W	761_T	0.517	0.13
751_L	855_G	0.517	0.13
394_A	641_T	0.516	0.13
394_A	607_L	0.516	0.13
172_L	477_F	0.516	0.13
462_K	518_N	0.516	0.13
439_A	794_L	0.515	0.13
719_F	769_Q	0.515	0.13
290_R	605_R	0.514	0.13
236_A	283_L	0.513	0.13
172_L	369_T	0.513	0.13
426_P	711_W	0.512	0.13
444_I	739_H	0.512	0.13
450_K	645_L	0.511	0.13
554_Y	589_A	0.511	0.13
571_L	809_P	0.510	0.13
196_T	252_Q	0.510	0.13
528_D	531_L	0.510	0.13
361_L	680_L	0.509	0.13
705_S	831_I	0.509	0.13
233_A	237_L	0.508	0.13
176_L	468_Q	0.508	0.13
190_D	806_A	0.508	0.13
603_N	627_I	0.507	0.13
429_T	760_G	0.507	0.13
680_L	778_H	0.506	0.13
514_R	836_E	0.506	0.13
711_W	800_N	0.506	0.13
175_I	645_L	0.506	0.13
729_D	854_N	0.505	0.13
263_P	806_A	0.505	0.13
266_A	653_L	0.505	0.13
226_V	480_M	0.505	0.13
188_L	361_L	0.505	0.13
443_I	771_Y	0.504	0.13
657_A	705_S	0.504	0.13
669_P	720_I	0.503	0.13
533_L	606_V	0.503	0.13
562_M	574_I	0.503	0.13
750_E	836_E	0.503	0.13
662_E	843_N	0.502	0.13
420_A	655_E	0.502	0.13
200_R	414_F	0.502	0.13
507_F	850_Q	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2xwsA	2	0.1332	36.8	0.989	Contact Map
4m0nA	1	0.1343	27.9	0.99	Contact Map
3lyhA	2	0.1309	26.5	0.99	Contact Map
3ipzA	3	0.1183	14.5	0.991	Contact Map
3whtB	1	0.0654	14.3	0.991	Contact Map
2ct6A	1	0.101	14.2	0.991	Contact Map
3v3tA	1	0.0471	13.8	0.991	Contact Map
2ab1A	1	0.1183	13.4	0.991	Contact Map
3p0jA	1	0.1412	13.3	0.991	Contact Map
3ctgA	1	0.1091	13.2	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0168 seconds.