YKCB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YKCB - Putative mannosyltransferase YkcB

UniProt:	O34575	Sequences: MEKKKRELDIVLLLILLASAFLNIYNIWKDDTVNPYYTAAVTSMMQSFHNFFYASFDAAGFITVDKPPVTYQIQTISALIFGMHGWSVILPQALAGVGSVLLMYLLIKPTFGKTAARIASFVMACTPIAVAVARTNNVDALLVFFLLLATWLLFKAIRKGKLIWLLAAFFVVGVGFNTKMLQAYMILPAFLLFYLIAANATIKKKIVSLVSALAVLAAVSLSWPLIVDNIPASKRPYIGSSQTNSVLELAFGYNGIQRLTGQNSGGGQGAPNKDASKEMSSSDNTQAPPNQSSSNSSSSDGKSSNGNMAAPPSNGQMPSGGQGGPPSGGDGGQGGPGGDGGKGGTGTGSKMQSGSGMFGTGTPGPLRLFQQELSDQISWLLPFAIFGIAGLLIAGARERRRLSVEQKETVFWVAWLVPIAGFFSVAEFFHHYYLIMLAPPIAALVGAGWVALVHLYRNQTGWKAWLLPGAIIATTGFELFILRNYNDQIGVGWSIGVGVIGVLSAIALLLFKQRQKPFSYYVSLAALLALLVMPMYWASTPLLYGGNSSLPETGPQLASMSGKGMGMSDATVNEKLIKYLEENNSGAEYLFATTDSNTAAPYIIKTKKAVMAIGGYSGSDPAITLTQFKKLVKEGKVKYFLASGMGRGGNNDIVEWVEKNGKEVASEKWQSSSDQKTENTDSADTSSSKASGENGKMGGPGGMNQSATLYELHADE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	716 (656)
Sequences:	127 (102)
Seq/√Len:	4.0

BACSU - YKCB YYCA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
191_L	213_L	5.901	0.98
625_L	653_I	4.806	0.93
625_L	628_F	4.242	0.87
588_E	636_K	3.711	0.78
614_G	618_G	3.376	0.70
628_F	653_I	3.282	0.68
61_F	611_M	3.218	0.66
16_L	101_L	3.177	0.65
629_K	660_N	3.098	0.63
77_S	637_V	3.075	0.63
77_S	80_I	2.904	0.58
23_N	95_A	2.892	0.58
62_I	622_A	2.885	0.57
73_I	77_S	2.845	0.56
74_Q	220_S	2.811	0.55
137_N	250_A	2.776	0.54
45_M	669_W	2.763	0.54
106_L	205_K	2.640	0.50
47_S	225_L	2.561	0.48
39_A	61_F	2.531	0.47
80_I	629_K	2.510	0.47
242_Q	248_E	2.507	0.47
76_I	238_I	2.479	0.46
240_S	661_G	2.417	0.44
98_G	144_F	2.374	0.43
666_S	670_Q	2.369	0.43
390_G	452_L	2.365	0.42
389_A	502_V	2.351	0.42
612_A	623_I	2.342	0.42
117_R	205_K	2.305	0.41
168_A	575_K	2.255	0.39
92_Q	143_V	2.238	0.39
380_L	383_F	2.183	0.37
143_V	205_K	2.180	0.37
88_V	116_A	2.169	0.37
613_I	657_V	2.164	0.37
149_A	168_A	2.157	0.37
268_Q	664_V	2.147	0.36
186_I	530_L	2.139	0.36
76_I	385_I	2.128	0.36
238_I	246_V	2.115	0.36
47_S	564_G	2.111	0.35
591_F	602_Y	2.099	0.35
393_I	577_I	2.050	0.34
186_I	190_F	2.050	0.34
422_F	426_A	2.048	0.34
315_G	499_V	2.019	0.33
475_T	478_E	2.019	0.33
174_V	320_G	2.011	0.33
242_Q	621_P	1.990	0.32
48_F	75_T	1.969	0.32
232_A	344_G	1.938	0.31
89_I	544_Y	1.934	0.31
611_M	623_I	1.926	0.31
39_A	611_M	1.925	0.31
631_L	636_K	1.922	0.31
19_S	363_P	1.914	0.30
575_K	669_W	1.913	0.30
248_E	614_G	1.899	0.30
493_W	577_I	1.880	0.30
375_D	628_F	1.871	0.29
36_Y	240_S	1.867	0.29
42_T	406_Q	1.857	0.29
99_S	147_L	1.850	0.29
74_Q	92_Q	1.841	0.29
148_L	478_E	1.831	0.28
146_L	182_Q	1.830	0.28
23_N	140_A	1.813	0.28
86_W	143_V	1.813	0.28
320_G	324_G	1.795	0.28
155_K	389_A	1.792	0.28
197_A	229_N	1.785	0.27
431_H	552_E	1.783	0.27
340_G	346_G	1.782	0.27
613_I	661_G	1.778	0.27
377_I	384_A	1.765	0.27
27_I	602_Y	1.761	0.27
71_Y	184_Y	1.754	0.27
135_T	250_A	1.731	0.26
54_A	637_V	1.723	0.26
69_V	174_V	1.722	0.26
137_N	253_Y	1.720	0.26
76_I	80_I	1.718	0.26
186_I	452_L	1.715	0.26
53_Y	217_A	1.705	0.26
64_V	250_A	1.702	0.26
171_V	347_T	1.694	0.25
186_I	246_V	1.685	0.25
223_W	467_L	1.679	0.25
349_S	352_Q	1.666	0.25
174_V	186_I	1.663	0.25
185_M	239_G	1.659	0.25
573_N	664_V	1.644	0.24
36_Y	434_L	1.627	0.24
382_P	443_A	1.627	0.24
377_I	611_M	1.614	0.24
320_G	332_G	1.613	0.24
581_E	608_K	1.610	0.24
42_T	58_A	1.602	0.23
547_N	583_N	1.601	0.23
323_G	326_P	1.600	0.23
55_S	446_G	1.587	0.23
380_L	537_W	1.586	0.23
626_T	648_G	1.586	0.23
537_W	540_T	1.574	0.23
50_N	85_G	1.572	0.23
623_I	631_L	1.569	0.23
233_S	627_Q	1.568	0.23
131_A	418_P	1.568	0.23
69_V	148_L	1.563	0.23
145_F	542_L	1.562	0.23
174_V	499_V	1.561	0.23
70_T	250_A	1.548	0.22
358_F	638_K	1.545	0.22
242_Q	612_A	1.544	0.22
92_Q	220_S	1.532	0.22
329_G	574_E	1.530	0.22
201_T	538_A	1.528	0.22
182_Q	436_M	1.523	0.22
324_G	340_G	1.522	0.22
393_I	500_I	1.515	0.22
92_Q	141_L	1.512	0.22
128_I	613_I	1.511	0.22
85_G	607_K	1.511	0.22
249_L	367_R	1.497	0.21
77_S	470_A	1.489	0.21
73_I	637_V	1.478	0.21
71_Y	89_I	1.474	0.21
23_N	93_A	1.469	0.21
135_T	253_Y	1.469	0.21
214_A	284_N	1.467	0.21
74_Q	434_L	1.463	0.21
63_T	196_I	1.463	0.21
58_A	533_M	1.458	0.21
216_L	453_V	1.456	0.21
50_N	60_G	1.456	0.21
16_L	653_I	1.455	0.20
26_N	221_L	1.454	0.20
38_T	250_A	1.451	0.20
27_I	144_F	1.448	0.20
19_S	478_E	1.446	0.20
18_A	648_G	1.446	0.20
239_G	620_D	1.445	0.20
271_P	497_V	1.444	0.20
97_V	165_L	1.443	0.20
530_L	544_Y	1.438	0.20
456_Y	468_P	1.432	0.20
48_F	505_A	1.431	0.20
48_F	441_I	1.431	0.20
482_L	622_A	1.430	0.20
478_E	619_S	1.429	0.20
58_A	596_S	1.422	0.20
39_A	596_S	1.414	0.20
74_Q	222_S	1.414	0.20
378_S	537_W	1.414	0.20
239_G	259_L	1.413	0.20
435_I	604_I	1.399	0.19
61_F	634_E	1.387	0.19
109_P	163_I	1.383	0.19
156_A	377_I	1.379	0.19
53_Y	221_L	1.376	0.19
387_G	451_A	1.376	0.19
167_A	212_A	1.375	0.19
475_T	538_A	1.372	0.19
148_L	596_S	1.371	0.19
10_I	47_S	1.369	0.19
92_Q	544_Y	1.367	0.19
52_F	74_Q	1.362	0.19
233_S	663_E	1.362	0.19
117_R	602_Y	1.360	0.19
474_T	548_S	1.357	0.19
62_I	75_T	1.356	0.19
596_S	623_I	1.354	0.19
335_G	469_G	1.342	0.18
45_M	75_T	1.339	0.18
19_S	184_Y	1.336	0.18
185_M	609_A	1.333	0.18
74_Q	219_V	1.333	0.18
58_A	611_M	1.332	0.18
159_K	182_Q	1.331	0.18
54_A	216_L	1.330	0.18
257_Q	557_L	1.327	0.18
27_I	548_S	1.320	0.18
64_V	137_N	1.317	0.18
89_I	92_Q	1.317	0.18
210_V	499_V	1.313	0.18
621_P	671_S	1.312	0.18
128_I	453_V	1.306	0.18
47_S	631_L	1.306	0.18
98_G	541_P	1.303	0.18
417_V	474_T	1.300	0.18
55_S	141_L	1.300	0.18
71_Y	138_V	1.299	0.18
611_M	614_G	1.298	0.18
58_A	606_T	1.297	0.18
323_G	526_A	1.296	0.18
536_Y	547_N	1.296	0.18
313_S	564_G	1.294	0.18
609_A	651_N	1.293	0.18
27_I	86_W	1.288	0.18
361_G	537_W	1.282	0.17
588_E	634_E	1.282	0.17
579_Y	638_K	1.276	0.17
293_S	296_S	1.274	0.17
666_S	671_S	1.263	0.17
58_A	61_F	1.258	0.17
74_Q	95_A	1.257	0.17
137_N	358_F	1.256	0.17
230_I	482_L	1.254	0.17
540_T	544_Y	1.249	0.17
125_C	524_L	1.246	0.17
175_G	475_T	1.245	0.17
494_S	499_V	1.244	0.17
137_N	140_A	1.240	0.17
281_S	320_G	1.240	0.17
128_I	546_G	1.237	0.17
238_I	330_D	1.236	0.17
361_G	428_F	1.236	0.17
56_F	611_M	1.234	0.17
583_N	636_K	1.231	0.17
98_G	370_Q	1.227	0.17
203_K	573_N	1.225	0.16
239_G	541_P	1.222	0.16
528_L	670_Q	1.220	0.16
32_T	453_V	1.216	0.16
596_S	611_M	1.214	0.16
664_V	671_S	1.212	0.16
350_K	564_G	1.210	0.16
503_L	512_K	1.205	0.16
97_V	161_K	1.203	0.16
48_F	226_I	1.200	0.16
628_F	640_F	1.199	0.16
260_T	617_S	1.196	0.16
97_V	606_T	1.194	0.16
245_S	253_Y	1.192	0.16
108_K	240_S	1.191	0.16
116_A	579_Y	1.190	0.16
256_I	260_T	1.187	0.16
142_L	255_G	1.183	0.16
277_K	281_S	1.181	0.16
117_R	408_E	1.178	0.16
143_V	435_I	1.170	0.16
596_S	612_A	1.169	0.16
503_L	583_N	1.168	0.16
611_M	618_G	1.167	0.16
15_I	121_F	1.164	0.16
388_I	413_V	1.164	0.16
107_I	460_T	1.162	0.16
18_A	121_F	1.161	0.16
73_I	145_F	1.160	0.15
11_V	259_L	1.159	0.15
169_F	182_Q	1.159	0.15
39_A	58_A	1.157	0.15
267_G	622_A	1.153	0.15
536_Y	570_A	1.153	0.15
118_I	429_F	1.153	0.15
128_I	543_L	1.147	0.15
496_G	670_Q	1.146	0.15
52_F	220_S	1.143	0.15
104_Y	146_L	1.143	0.15
61_F	623_I	1.142	0.15
27_I	370_Q	1.142	0.15
477_F	638_K	1.140	0.15
85_G	111_F	1.140	0.15
253_Y	555_P	1.135	0.15
47_S	380_L	1.135	0.15
14_L	644_G	1.134	0.15
148_L	600_A	1.131	0.15
19_S	23_N	1.131	0.15
19_S	158_R	1.128	0.15
170_F	200_A	1.127	0.15
508_L	616_Y	1.122	0.15
40_A	169_F	1.120	0.15
58_A	623_I	1.118	0.15
211_S	214_A	1.117	0.15
64_V	71_Y	1.114	0.15
41_V	482_L	1.108	0.15
34_N	249_L	1.106	0.15
34_N	367_R	1.106	0.15
118_I	122_V	1.105	0.15
283_D	324_G	1.105	0.15
248_E	612_A	1.105	0.15
94_L	548_S	1.104	0.15
219_V	270_A	1.103	0.15
386_F	677_T	1.103	0.15
134_R	432_Y	1.100	0.15
286_Q	331_G	1.100	0.15
217_A	583_N	1.099	0.15
625_L	629_K	1.099	0.15
177_N	228_D	1.098	0.15
27_I	480_F	1.097	0.15
103_M	420_A	1.096	0.15
594_T	653_I	1.094	0.15
164_W	242_Q	1.087	0.14
283_D	469_G	1.085	0.14
129_A	435_I	1.078	0.14
212_A	552_E	1.076	0.14
356_G	378_S	1.076	0.14
52_F	222_S	1.072	0.14
125_C	670_Q	1.070	0.14
196_I	323_G	1.069	0.14
422_F	428_F	1.065	0.14
18_A	172_V	1.063	0.14
24_I	93_A	1.063	0.14
133_A	607_K	1.063	0.14
149_A	588_E	1.061	0.14
119_A	585_S	1.060	0.14
569_D	631_L	1.059	0.14
32_T	607_K	1.057	0.14
107_I	403_S	1.056	0.14
45_M	49_H	1.056	0.14
364_G	552_E	1.056	0.14
361_G	378_S	1.056	0.14
592_A	637_V	1.055	0.14
386_F	672_S	1.053	0.14
532_V	641_L	1.052	0.14
110_T	542_L	1.052	0.14
383_F	449_W	1.050	0.14
28_W	602_Y	1.049	0.14
225_L	377_I	1.048	0.14
445_V	664_V	1.044	0.14
146_L	185_M	1.041	0.14
437_L	647_R	1.039	0.14
253_Y	592_A	1.036	0.14
229_N	238_I	1.035	0.14
342_K	675_Q	1.034	0.14
261_G	358_F	1.033	0.14
75_T	130_V	1.033	0.14
165_L	198_A	1.033	0.14
323_G	335_G	1.033	0.14
345_T	673_S	1.032	0.14
262_Q	453_V	1.031	0.14
243_T	592_A	1.030	0.14
158_R	602_Y	1.025	0.14
47_S	272_N	1.022	0.14
473_A	677_T	1.022	0.14
70_T	135_T	1.020	0.13
222_S	548_S	1.018	0.13
117_R	172_V	1.017	0.13
419_I	440_P	1.013	0.13
598_T	643_S	1.013	0.13
13_L	667_E	1.012	0.13
144_F	541_P	1.011	0.13
52_F	95_A	1.009	0.13
75_T	488_Q	1.008	0.13
128_I	465_W	1.007	0.13
56_F	61_F	1.007	0.13
137_N	261_G	1.005	0.13
187_L	521_Y	1.005	0.13
62_I	195_L	1.003	0.13
42_T	165_L	1.003	0.13
87_S	250_A	1.001	0.13
198_A	417_V	1.001	0.13
257_Q	538_A	0.998	0.13
175_G	671_S	0.995	0.13
361_G	640_F	0.994	0.13
42_T	46_Q	0.992	0.13
117_R	250_A	0.992	0.13
216_L	221_L	0.986	0.13
257_Q	260_T	0.985	0.13
219_V	222_S	0.984	0.13
324_G	675_Q	0.983	0.13
576_L	611_M	0.981	0.13
340_G	469_G	0.981	0.13
224_P	616_Y	0.979	0.13
231_P	266_G	0.977	0.13
612_A	618_G	0.977	0.13
250_A	253_Y	0.976	0.13
228_D	240_S	0.975	0.13
411_F	452_L	0.973	0.13
36_Y	55_S	0.972	0.13
40_A	428_F	0.970	0.13
638_K	657_V	0.970	0.13
46_Q	529_A	0.965	0.13
38_T	117_R	0.964	0.13
134_R	147_L	0.962	0.13
463_K	528_L	0.960	0.13
102_L	170_F	0.959	0.13
402_L	533_M	0.959	0.13
477_F	481_I	0.959	0.13
27_I	98_G	0.957	0.13
87_S	588_E	0.957	0.13
505_A	587_A	0.957	0.13
327_S	330_D	0.956	0.13
417_V	588_E	0.955	0.13
211_S	633_K	0.954	0.13
575_K	655_E	0.953	0.13
641_L	664_V	0.952	0.13
38_T	88_V	0.951	0.13
192_L	425_V	0.948	0.13
580_L	639_Y	0.946	0.13
331_G	339_D	0.938	0.12
611_M	622_A	0.937	0.12
95_A	434_L	0.936	0.12
70_T	137_N	0.935	0.12
26_N	42_T	0.933	0.12
233_S	315_G	0.932	0.12
613_I	653_I	0.932	0.12
221_L	567_M	0.930	0.12
310_A	343_G	0.928	0.12
147_L	180_M	0.927	0.12
177_N	249_L	0.925	0.12
177_N	367_R	0.925	0.12
76_I	499_V	0.923	0.12
19_S	130_V	0.923	0.12
357_M	360_T	0.922	0.12
61_F	377_I	0.921	0.12
377_I	543_L	0.921	0.12
119_A	454_H	0.920	0.12
67_P	249_L	0.919	0.12
67_P	367_R	0.919	0.12
137_N	245_S	0.917	0.12
86_W	92_Q	0.917	0.12
493_W	501_G	0.916	0.12
534_P	554_G	0.915	0.12
498_G	539_S	0.915	0.12
240_S	246_V	0.914	0.12
166_L	359_G	0.912	0.12
365_P	602_Y	0.911	0.12
56_F	614_G	0.909	0.12
117_R	169_F	0.908	0.12
420_A	507_A	0.906	0.12
559_S	629_K	0.905	0.12
245_S	250_A	0.904	0.12
39_A	623_I	0.904	0.12
276_S	385_I	0.903	0.12
50_N	62_I	0.903	0.12
184_Y	465_W	0.900	0.12
24_I	631_L	0.899	0.12
184_Y	674_D	0.898	0.12
199_N	240_S	0.898	0.12
152_L	397_R	0.898	0.12
195_L	359_G	0.898	0.12
315_G	339_D	0.898	0.12
606_T	609_A	0.896	0.12
434_L	547_N	0.896	0.12
344_G	470_A	0.894	0.12
84_H	129_A	0.893	0.12
164_W	253_Y	0.893	0.12
109_P	548_S	0.893	0.12
38_T	137_N	0.892	0.12
485_Y	537_W	0.892	0.12
316_Q	329_G	0.892	0.12
102_L	466_L	0.890	0.12
135_T	638_K	0.889	0.12
425_V	428_F	0.889	0.12
178_T	542_L	0.888	0.12
83_M	117_R	0.888	0.12
320_G	564_G	0.887	0.12
87_S	185_M	0.887	0.12
428_F	640_F	0.886	0.12
380_L	499_V	0.885	0.12
610_V	656_W	0.884	0.12
220_S	434_L	0.884	0.12
79_L	628_F	0.883	0.12
38_T	109_P	0.881	0.12
359_G	431_H	0.880	0.12
61_F	596_S	0.879	0.12
195_L	471_I	0.879	0.12
9_D	250_A	0.879	0.12
138_V	399_R	0.879	0.12
63_T	238_I	0.878	0.12
36_Y	368_L	0.876	0.12
35_P	596_S	0.875	0.12
359_G	451_A	0.875	0.12
162_L	165_L	0.873	0.12
171_V	437_L	0.872	0.12
211_S	664_V	0.871	0.12
39_A	634_E	0.871	0.12
39_A	196_I	0.870	0.12
581_E	633_K	0.870	0.12
181_L	531_L	0.870	0.12
661_G	665_A	0.867	0.12
62_I	539_S	0.866	0.12
172_V	606_T	0.866	0.12
603_I	618_G	0.864	0.12
271_P	333_Q	0.863	0.12
6_R	122_V	0.861	0.11
116_A	598_T	0.860	0.11
445_V	665_A	0.860	0.11
361_G	370_Q	0.859	0.11
88_V	193_F	0.858	0.11
371_Q	643_S	0.857	0.11
198_A	672_S	0.857	0.11
165_L	232_A	0.857	0.11
289_P	329_G	0.857	0.11
61_F	240_S	0.855	0.11
325_P	511_F	0.855	0.11
77_S	512_K	0.852	0.11
321_G	334_G	0.851	0.11
166_L	237_Y	0.849	0.11
268_Q	677_T	0.849	0.11
109_P	117_R	0.849	0.11
512_K	583_N	0.848	0.11
85_G	553_T	0.847	0.11
238_I	644_G	0.847	0.11
231_P	242_Q	0.846	0.11
9_D	38_T	0.841	0.11
229_N	240_S	0.841	0.11
535_M	585_S	0.840	0.11
198_A	637_V	0.839	0.11
92_Q	416_L	0.839	0.11
372_E	465_W	0.838	0.11
52_F	93_A	0.838	0.11
261_G	426_A	0.838	0.11
95_A	220_S	0.837	0.11
42_T	594_T	0.837	0.11
143_V	239_G	0.836	0.11
631_L	634_E	0.835	0.11
144_F	243_T	0.835	0.11
375_D	577_I	0.834	0.11
109_P	169_F	0.834	0.11
387_G	557_L	0.833	0.11
29_K	106_L	0.828	0.11
377_I	533_M	0.828	0.11
135_T	261_G	0.827	0.11
190_F	662_K	0.827	0.11
383_F	528_L	0.825	0.11
93_A	124_A	0.824	0.11
416_L	554_G	0.824	0.11
431_H	550_L	0.823	0.11
104_Y	182_Q	0.823	0.11
257_Q	387_G	0.823	0.11
557_L	560_M	0.823	0.11
71_Y	544_Y	0.822	0.11
93_A	427_E	0.822	0.11
92_Q	145_F	0.822	0.11
94_L	361_G	0.819	0.11
47_S	495_I	0.819	0.11
537_W	579_Y	0.818	0.11
136_N	249_L	0.818	0.11
136_N	367_R	0.818	0.11
161_K	500_I	0.817	0.11
370_Q	602_Y	0.816	0.11
182_Q	185_M	0.816	0.11
347_T	437_L	0.814	0.11
196_I	502_V	0.814	0.11
92_Q	124_A	0.814	0.11
150_T	391_L	0.813	0.11
388_I	454_H	0.813	0.11
478_E	530_L	0.811	0.11
335_G	560_M	0.808	0.11
161_K	404_V	0.806	0.11
97_V	624_T	0.805	0.11
34_N	60_G	0.804	0.11
17_L	211_S	0.803	0.11
38_T	70_T	0.802	0.11
176_F	415_W	0.800	0.11
496_G	500_I	0.800	0.11
361_G	426_A	0.800	0.11
511_F	608_K	0.800	0.11
218_A	539_S	0.799	0.11
19_S	120_S	0.799	0.11
28_W	591_F	0.799	0.11
94_L	381_L	0.798	0.11
606_T	623_I	0.798	0.11
123_M	595_D	0.797	0.11
178_T	641_L	0.797	0.11
340_G	652_D	0.797	0.11
27_I	584_N	0.795	0.11
38_T	595_D	0.792	0.11
30_D	168_A	0.792	0.11
362_T	647_R	0.791	0.11
381_L	657_V	0.790	0.11
580_L	606_T	0.789	0.11
196_I	659_K	0.788	0.11
73_I	92_Q	0.788	0.11
146_L	246_V	0.788	0.11
540_T	590_L	0.785	0.11
52_F	434_L	0.784	0.11
34_N	551_P	0.783	0.11
342_K	630_K	0.781	0.11
47_S	118_I	0.781	0.11
606_T	611_M	0.781	0.11
323_G	341_G	0.779	0.11
387_G	653_I	0.779	0.11
196_I	658_E	0.778	0.11
49_H	462_W	0.778	0.11
286_Q	325_P	0.777	0.11
45_M	413_V	0.777	0.11
227_V	446_G	0.776	0.11
9_D	172_V	0.775	0.11
231_P	355_S	0.775	0.11
71_Y	240_S	0.774	0.10
177_N	418_P	0.768	0.10
231_P	549_S	0.767	0.10
7_E	79_L	0.766	0.10
16_L	86_W	0.766	0.10
117_R	370_Q	0.766	0.10
24_I	596_S	0.766	0.10
345_T	354_G	0.764	0.10
333_Q	457_R	0.761	0.10
385_I	400_R	0.761	0.10
325_P	672_S	0.760	0.10
214_A	219_V	0.759	0.10
219_V	573_N	0.758	0.10
388_I	657_V	0.756	0.10
323_G	485_Y	0.755	0.10
9_D	182_Q	0.754	0.10
129_A	408_E	0.753	0.10
623_I	636_K	0.753	0.10
361_G	371_Q	0.753	0.10
368_L	373_L	0.751	0.10
593_T	597_N	0.751	0.10
234_K	390_G	0.748	0.10
207_V	385_I	0.745	0.10
549_S	577_I	0.745	0.10
45_M	619_S	0.745	0.10
88_V	117_R	0.743	0.10
382_P	412_W	0.742	0.10
141_L	178_T	0.741	0.10
154_F	447_A	0.741	0.10
659_K	662_K	0.741	0.10
129_A	168_A	0.740	0.10
371_Q	383_F	0.740	0.10
34_N	136_N	0.739	0.10
132_V	585_S	0.737	0.10
472_I	504_S	0.736	0.10
118_I	560_M	0.736	0.10
19_S	475_T	0.735	0.10
593_T	598_T	0.735	0.10
260_T	619_S	0.733	0.10
271_P	607_K	0.732	0.10
484_N	529_A	0.732	0.10
53_Y	633_K	0.731	0.10
264_S	617_S	0.731	0.10
623_I	634_E	0.731	0.10
381_L	673_S	0.730	0.10
177_N	551_P	0.730	0.10
143_V	631_L	0.729	0.10
62_I	110_T	0.729	0.10
107_I	191_L	0.726	0.10
135_T	422_F	0.725	0.10
283_D	650_N	0.725	0.10
85_G	143_V	0.722	0.10
569_D	650_N	0.722	0.10
340_G	562_G	0.721	0.10
74_Q	215_V	0.721	0.10
196_I	558_A	0.721	0.10
111_F	177_N	0.718	0.10
19_S	125_C	0.716	0.10
641_L	658_E	0.716	0.10
32_T	191_L	0.716	0.10
331_G	348_G	0.716	0.10
381_L	541_P	0.715	0.10
34_N	67_P	0.715	0.10
172_V	500_I	0.715	0.10
216_L	505_A	0.715	0.10
410_V	518_F	0.713	0.10
103_M	507_A	0.713	0.10
63_T	672_S	0.713	0.10
171_V	478_E	0.713	0.10
132_V	536_Y	0.712	0.10
108_K	413_V	0.711	0.10
58_A	622_A	0.708	0.10
122_V	665_A	0.708	0.10
34_N	432_Y	0.708	0.10
627_Q	675_Q	0.708	0.10
86_W	416_L	0.706	0.10
391_L	613_I	0.706	0.10
128_I	377_I	0.703	0.10
399_R	671_S	0.703	0.10
350_K	532_V	0.702	0.10
67_P	551_P	0.701	0.10
41_V	224_P	0.700	0.10
50_N	133_A	0.699	0.10
386_F	664_V	0.697	0.10
62_I	434_L	0.697	0.10
39_A	152_L	0.697	0.10
590_L	651_N	0.696	0.10
36_Y	95_A	0.692	0.10
76_I	79_L	0.691	0.10
172_V	205_K	0.691	0.10
106_L	540_T	0.691	0.10
129_A	602_Y	0.690	0.10
30_D	92_Q	0.689	0.10
89_I	124_A	0.688	0.10
643_S	647_R	0.687	0.10
469_G	523_S	0.687	0.10
316_Q	327_S	0.683	0.10
40_A	237_Y	0.682	0.10
204_K	221_L	0.682	0.10
212_A	585_S	0.682	0.10
545_G	601_P	0.681	0.10
75_T	116_A	0.681	0.10
375_D	652_D	0.680	0.10
380_L	525_A	0.680	0.10
89_I	530_L	0.679	0.10
284_N	325_P	0.677	0.09
464_A	470_A	0.674	0.09
61_F	612_A	0.673	0.09
171_V	661_G	0.673	0.09
335_G	487_D	0.673	0.09
156_A	614_G	0.672	0.09
116_A	206_I	0.672	0.09
168_A	529_A	0.672	0.09
107_I	343_G	0.670	0.09
175_G	399_R	0.668	0.09
204_K	323_G	0.668	0.09
230_I	461_G	0.667	0.09
437_L	658_E	0.666	0.09
574_E	658_E	0.664	0.09
440_P	585_S	0.664	0.09
103_M	170_F	0.663	0.09
121_F	172_V	0.662	0.09
406_Q	533_M	0.661	0.09
285_T	315_G	0.660	0.09
437_L	507_A	0.659	0.09
262_Q	658_E	0.658	0.09
635_G	661_G	0.658	0.09
174_V	381_L	0.658	0.09
98_G	540_T	0.657	0.09
405_E	451_A	0.657	0.09
204_K	527_L	0.657	0.09
108_K	411_F	0.657	0.09
7_E	393_I	0.656	0.09
314_N	337_G	0.655	0.09
87_S	221_L	0.654	0.09
182_Q	550_L	0.653	0.09
608_K	661_G	0.652	0.09
230_I	234_K	0.651	0.09
32_T	355_S	0.651	0.09
565_M	651_N	0.650	0.09
335_G	345_T	0.648	0.09
216_L	531_L	0.648	0.09
84_H	237_Y	0.648	0.09
389_A	588_E	0.648	0.09
487_D	500_I	0.646	0.09
417_V	425_V	0.646	0.09
342_K	560_M	0.645	0.09
42_T	611_M	0.645	0.09
155_K	510_L	0.645	0.09
589_Y	631_L	0.644	0.09
17_L	666_S	0.644	0.09
117_R	591_F	0.644	0.09
158_R	212_A	0.644	0.09
119_A	616_Y	0.643	0.09
26_N	29_K	0.642	0.09
591_F	664_V	0.640	0.09
67_P	177_N	0.639	0.09
145_F	637_V	0.639	0.09
19_S	26_N	0.638	0.09
41_V	74_Q	0.638	0.09
83_M	109_P	0.638	0.09
155_K	476_G	0.637	0.09
387_G	511_F	0.636	0.09
67_P	228_D	0.633	0.09
103_M	452_L	0.633	0.09
147_L	540_T	0.633	0.09
166_L	595_D	0.633	0.09
42_T	533_M	0.632	0.09
61_F	164_W	0.631	0.09
39_A	612_A	0.630	0.09
116_A	377_I	0.629	0.09
280_S	457_R	0.629	0.09
218_A	560_M	0.628	0.09
87_S	169_F	0.628	0.09
269_G	574_E	0.628	0.09
333_Q	342_K	0.628	0.09
52_F	124_A	0.628	0.09
135_T	426_A	0.626	0.09
439_P	595_D	0.626	0.09
325_P	336_P	0.625	0.09
182_Q	246_V	0.625	0.09
47_S	542_L	0.624	0.09
169_F	425_V	0.624	0.09
141_L	234_K	0.623	0.09
468_P	616_Y	0.623	0.09
40_A	122_V	0.623	0.09
172_V	365_P	0.623	0.09
577_I	641_L	0.622	0.09
320_G	339_D	0.622	0.09
27_I	117_R	0.621	0.09
538_A	644_G	0.620	0.09
38_T	356_G	0.618	0.09
169_F	250_A	0.616	0.09
405_E	493_W	0.615	0.09
87_S	591_F	0.615	0.09
53_Y	63_T	0.614	0.09
122_V	380_L	0.614	0.09
47_S	264_S	0.612	0.09
129_A	591_F	0.612	0.09
280_S	450_V	0.612	0.09
284_N	317_M	0.611	0.09
370_Q	435_I	0.611	0.09
531_L	636_K	0.610	0.09
52_F	132_V	0.610	0.09
109_P	250_A	0.609	0.09
378_S	428_F	0.609	0.09
16_L	55_S	0.608	0.09
222_S	434_L	0.608	0.09
256_I	617_S	0.608	0.09
239_G	416_L	0.608	0.09
414_A	631_L	0.607	0.09
541_P	545_G	0.607	0.09
12_L	40_A	0.607	0.09
34_N	134_R	0.605	0.09
49_H	411_F	0.605	0.09
277_K	630_K	0.605	0.09
33_V	83_M	0.605	0.09
243_T	250_A	0.605	0.09
23_N	434_L	0.604	0.09
612_A	620_D	0.604	0.09
354_G	364_G	0.603	0.09
343_G	532_V	0.603	0.09
371_Q	537_W	0.602	0.09
166_L	507_A	0.602	0.09
593_T	643_S	0.602	0.09
135_T	358_F	0.602	0.09
230_I	316_Q	0.602	0.09
125_C	449_W	0.601	0.09
533_M	609_A	0.601	0.09
374_S	440_P	0.600	0.09
114_T	621_P	0.599	0.09
193_F	555_P	0.599	0.09
311_P	326_P	0.599	0.09
13_L	207_V	0.598	0.09
165_L	635_G	0.598	0.09
282_S	672_S	0.595	0.09
470_A	503_L	0.593	0.09
246_V	527_L	0.593	0.09
48_F	54_A	0.593	0.09
175_G	456_Y	0.593	0.09
239_G	540_T	0.592	0.09
251_F	471_I	0.592	0.09
49_H	529_A	0.592	0.09
491_V	598_T	0.592	0.09
374_S	477_F	0.591	0.09
30_D	69_V	0.591	0.09
250_A	422_F	0.590	0.09
568_S	648_G	0.590	0.09
510_L	517_P	0.589	0.09
472_I	658_E	0.589	0.09
515_Q	664_V	0.589	0.09
54_A	64_V	0.587	0.09
78_A	209_L	0.587	0.09
373_L	418_P	0.587	0.09
482_L	593_T	0.587	0.09
168_A	624_T	0.585	0.09
110_T	195_L	0.585	0.09
6_R	366_L	0.585	0.09
321_G	499_V	0.585	0.09
172_V	358_F	0.583	0.09
574_E	652_D	0.583	0.09
58_A	105_L	0.583	0.09
665_A	669_W	0.582	0.09
506_I	630_K	0.580	0.09
315_G	320_G	0.579	0.09
551_P	639_Y	0.579	0.09
605_K	674_D	0.579	0.09
99_S	373_L	0.579	0.09
83_M	88_V	0.578	0.09
359_G	552_E	0.578	0.09
246_V	637_V	0.577	0.09
186_I	336_P	0.575	0.09
417_V	543_L	0.575	0.09
135_T	435_I	0.573	0.09
59_A	341_G	0.573	0.09
271_P	507_A	0.573	0.09
71_Y	128_I	0.573	0.09
245_S	378_S	0.572	0.08
73_I	351_M	0.571	0.08
185_M	436_M	0.571	0.08
38_T	229_N	0.570	0.08
345_T	454_H	0.570	0.08
17_L	505_A	0.569	0.08
544_Y	598_T	0.568	0.08
103_M	346_G	0.568	0.08
148_L	567_M	0.568	0.08
171_V	613_I	0.568	0.08
89_I	478_E	0.567	0.08
358_F	435_I	0.567	0.08
62_I	395_G	0.567	0.08
445_V	499_V	0.567	0.08
446_G	616_Y	0.567	0.08
114_T	231_P	0.566	0.08
239_G	612_A	0.565	0.08
23_N	36_Y	0.564	0.08
191_L	431_H	0.564	0.08
169_F	407_K	0.563	0.08
205_K	634_E	0.563	0.08
494_S	538_A	0.562	0.08
288_P	319_S	0.561	0.08
12_L	47_S	0.561	0.08
101_L	380_L	0.561	0.08
312_P	315_G	0.561	0.08
39_A	377_I	0.559	0.08
213_L	359_G	0.558	0.08
102_L	190_F	0.558	0.08
182_Q	437_L	0.557	0.08
204_K	636_K	0.556	0.08
134_R	540_T	0.556	0.08
207_V	504_S	0.555	0.08
348_G	650_N	0.555	0.08
84_H	144_F	0.555	0.08
18_A	352_Q	0.554	0.08
64_V	169_F	0.554	0.08
190_F	628_F	0.554	0.08
58_A	614_G	0.553	0.08
43_S	51_F	0.553	0.08
89_I	143_V	0.552	0.08
88_V	602_Y	0.552	0.08
485_Y	540_T	0.551	0.08
93_A	224_P	0.551	0.08
499_V	530_L	0.551	0.08
30_D	89_I	0.549	0.08
164_W	623_I	0.549	0.08
89_I	240_S	0.549	0.08
417_V	597_N	0.546	0.08
80_I	341_G	0.545	0.08
404_V	630_K	0.545	0.08
624_T	649_G	0.545	0.08
14_L	556_Q	0.544	0.08
52_F	548_S	0.544	0.08
180_M	589_Y	0.543	0.08
341_G	630_K	0.542	0.08
130_V	557_L	0.541	0.08
35_P	198_A	0.541	0.08
347_T	678_E	0.540	0.08
231_P	557_L	0.539	0.08
410_V	664_V	0.538	0.08
313_S	346_G	0.538	0.08
566_G	616_Y	0.538	0.08
34_N	177_N	0.536	0.08
109_P	190_F	0.535	0.08
132_V	151_W	0.534	0.08
625_L	667_E	0.532	0.08
596_S	606_T	0.531	0.08
502_V	528_L	0.531	0.08
39_A	69_V	0.530	0.08
285_T	464_A	0.530	0.08
27_I	84_H	0.528	0.08
18_A	607_K	0.528	0.08
313_S	330_D	0.527	0.08
109_P	243_T	0.526	0.08
206_I	455_L	0.525	0.08
322_Q	346_G	0.524	0.08
614_G	623_I	0.523	0.08
85_G	446_G	0.523	0.08
95_A	141_L	0.522	0.08
37_Y	57_D	0.521	0.08
172_V	285_T	0.521	0.08
339_D	342_K	0.520	0.08
532_V	613_I	0.520	0.08
221_L	655_E	0.520	0.08
343_G	564_G	0.520	0.08
190_F	408_E	0.519	0.08
186_I	480_F	0.517	0.08
377_I	596_S	0.517	0.08
480_F	548_S	0.517	0.08
334_G	567_M	0.515	0.08
19_S	662_K	0.515	0.08
181_L	185_M	0.515	0.08
152_L	164_W	0.514	0.08
185_M	429_F	0.512	0.08
81_F	243_T	0.512	0.08
156_A	645_M	0.512	0.08
481_I	544_Y	0.512	0.08
25_Y	481_I	0.511	0.08
45_M	526_A	0.511	0.08
117_R	609_A	0.511	0.08
40_A	421_G	0.510	0.08
145_F	399_R	0.510	0.08
284_N	287_A	0.510	0.08
476_G	671_S	0.510	0.08
585_S	652_D	0.510	0.08
284_N	288_P	0.509	0.08
614_G	624_T	0.509	0.08
351_M	572_V	0.508	0.08
419_I	631_L	0.508	0.08
239_G	669_W	0.508	0.08
221_L	637_V	0.507	0.08
243_T	537_W	0.507	0.08
343_G	673_S	0.506	0.08
44_M	90_L	0.505	0.08
81_F	136_N	0.504	0.08
21_F	62_I	0.503	0.08
422_F	536_Y	0.502	0.08
58_A	494_S	0.501	0.08
200_A	556_Q	0.501	0.08
264_S	469_G	0.500	0.08
122_V	234_K	0.500	0.08
471_I	509_L	0.500	0.08
62_I	479_L	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3wajA	1	0.7346	100	0.911	Contact Map
3rceA	1	0.6844	99.9	0.926	Contact Map
1z4hA	1	0.0908	40.9	0.989	Contact Map
1y6uA	1	0.0559	38.2	0.989	Contact Map
4nv5A	1	0.3436	36	0.989	Contact Map
4j2nA	4	0.0768	34.8	0.989	Contact Map
4m8aA	4	0.088	17.1	0.991	Contact Map
2r751	1	0.2151	16.4	0.991	Contact Map
4maaA	1	0.2025	16	0.991	Contact Map
3d31C	2	0.2891	15.9	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0163 seconds.