YEEB - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YEEB - Putative ATP-dependent helicase YeeB

UniProt:	O34469	Sequences: MENIIEINYNQTGKSKKTNEYGMREMQARAFEKRNSQYLLVKAPPASGKSRALMFIGLDKLINQGLRKVIVAVPERSIGSSFKNTDLKSYGFFENWKVDPRNNLTVGGDNSKVKSFVRFMESDDQVLICTHSTLRFAFEKIDDKAFDNCLLAIDEFHHVSADVNSRLGELLRSIIHNSSAHIVAMTGSYFRGDSVPILLPEDEELFDKVTYSYYEQLDGYEYLKGFGIGYHFYQGQYTSAINEVLDTNKKTIVHIPNVNSGESTKDKYDEVGKILDMIGEVEYQDDDTGIIYVKRHSDGKTLKIADLVDDQVGRENVVAYLRNIEALDDLDIIIALGMAKEGFDWPFCEHTLTVGYRGSLTEIVQIIGRCTRDSYNKTYAQFTNLIAMPDAKDEVVTYTVNTMLKAISASLLMEQVLTPDFKFKRRRNESEKSSTTGELFVKGLKEPSTENVKKIIENDINDLKAKIMQDSQVQKTFSGEVDPKVLNKVLIPKVIQKVYPNLSDEEIEEVRQHVVLDTVMKGAKSEVVGSKEFIRMADKFINIEDLDINLIDSINPFQKAFEVLSKELNSPVLKLIQETIDAKRINFDEDELVFIWPKV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	599 (592)
Sequences:	210 (103)
Seq/√Len:	4.2

BACSU - YEEB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
30_A	56_I	9.810	1.00
86_D	89_S	5.731	0.98
348_C	370_C	4.692	0.93
290_I	317_V	4.033	0.86
247_T	278_I	3.933	0.84
68_K	149_C	3.928	0.84
511_R	552_D	3.918	0.84
241_I	354_V	3.755	0.81
21_Y	31_F	3.732	0.81
295_R	298_D	3.691	0.80
113_V	136_F	3.421	0.74
441_V	588_D	3.237	0.70
253_V	354_V	3.152	0.68
151_L	174_I	3.117	0.67
452_V	509_E	3.086	0.66
102_N	124_D	3.070	0.65
549_N	564_L	2.968	0.63
257_N	545_D	2.944	0.62
114_K	140_K	2.924	0.61
282_E	294_K	2.908	0.61
105_T	226_F	2.805	0.58
408_S	568_L	2.792	0.58
364_V	473_V	2.767	0.57
453_K	463_L	2.664	0.54
171_L	494_V	2.642	0.53
53_L	152_A	2.641	0.53
29_R	215_E	2.568	0.51
304_I	319_A	2.564	0.51
30_A	41_V	2.539	0.50
508_E	511_R	2.491	0.49
30_A	348_C	2.383	0.45
293_V	304_I	2.377	0.45
448_S	509_E	2.355	0.45
162_D	195_V	2.351	0.44
102_N	118_R	2.331	0.44
166_R	310_D	2.331	0.44
226_F	592_L	2.331	0.44
69_V	278_I	2.307	0.43
128_I	376_N	2.306	0.43
41_V	56_I	2.299	0.43
327_L	376_N	2.287	0.43
122_S	278_I	2.235	0.41
348_C	574_K	2.214	0.40
205_L	534_I	2.173	0.39
132_S	136_F	2.163	0.39
241_I	554_I	2.142	0.38
148_N	303_K	2.140	0.38
350_H	494_V	2.132	0.38
56_I	183_V	2.097	0.37
30_A	183_V	2.084	0.37
282_E	301_T	2.082	0.37
126_V	563_V	2.044	0.36
111_S	140_K	2.025	0.35
33_K	207_D	2.017	0.35
470_D	580_I	2.005	0.35
21_Y	294_K	1.979	0.34
105_T	165_S	1.970	0.34
269_D	272_G	1.958	0.33
71_V	501_N	1.954	0.33
172_R	463_L	1.934	0.33
399_T	452_V	1.932	0.33
388_M	393_D	1.931	0.33
218_D	226_F	1.920	0.32
464_K	517_D	1.907	0.32
247_T	298_D	1.897	0.32
295_R	446_E	1.888	0.32
253_V	525_S	1.880	0.31
142_D	145_A	1.847	0.30
105_T	218_D	1.840	0.30
143_D	177_N	1.839	0.30
264_T	270_E	1.827	0.30
31_F	534_I	1.818	0.30
248_N	295_R	1.779	0.29
227_G	379_Y	1.771	0.29
28_A	43_A	1.770	0.29
422_K	457_E	1.769	0.29
98_V	102_N	1.768	0.29
455_I	502_L	1.767	0.28
506_E	509_E	1.742	0.28
464_K	467_I	1.742	0.28
57_G	69_V	1.738	0.28
172_R	197_I	1.730	0.28
33_K	67_R	1.687	0.27
370_C	574_K	1.683	0.26
294_K	301_T	1.665	0.26
338_M	356_Y	1.662	0.26
394_E	501_N	1.652	0.26
322_R	329_D	1.644	0.26
14_K	126_V	1.639	0.25
56_I	66_L	1.621	0.25
36_S	207_D	1.614	0.25
587_F	592_L	1.608	0.25
94_E	103_N	1.607	0.25
30_A	370_C	1.573	0.24
212_S	532_E	1.567	0.24
84_N	100_P	1.562	0.24
59_D	64_Q	1.560	0.24
98_V	128_I	1.553	0.24
75_E	135_R	1.545	0.23
563_V	569_N	1.542	0.23
289_G	317_V	1.532	0.23
261_G	347_F	1.522	0.23
198_L	352_L	1.520	0.23
84_N	97_K	1.519	0.23
463_L	491_I	1.518	0.23
105_T	592_L	1.515	0.23
497_K	539_K	1.513	0.23
409_A	443_G	1.512	0.23
441_V	469_Q	1.510	0.23
226_F	587_F	1.508	0.23
182_I	380_A	1.472	0.22
354_V	400_V	1.468	0.22
564_L	595_I	1.465	0.22
290_I	330_L	1.457	0.22
211_Y	449_T	1.451	0.21
56_I	122_S	1.447	0.21
215_E	230_Y	1.441	0.21
303_K	329_D	1.434	0.21
450_E	454_K	1.434	0.21
66_L	150_L	1.427	0.21
172_R	537_A	1.427	0.21
109_D	147_D	1.422	0.21
228_I	404_L	1.421	0.21
120_M	149_C	1.421	0.21
533_F	565_S	1.413	0.21
467_I	490_L	1.413	0.21
426_R	460_I	1.408	0.21
175_I	520_M	1.407	0.21
113_V	130_T	1.404	0.21
249_K	381_Q	1.399	0.20
76_R	443_G	1.393	0.20
311_Q	318_V	1.391	0.20
270_E	508_E	1.390	0.20
208_K	376_N	1.389	0.20
88_K	95_N	1.379	0.20
271_V	400_V	1.371	0.20
565_S	576_I	1.371	0.20
543_I	547_D	1.367	0.20
298_D	348_C	1.363	0.20
246_D	249_K	1.362	0.20
12_T	148_N	1.361	0.20
107_G	582_A	1.361	0.20
379_Y	533_F	1.361	0.20
211_Y	230_Y	1.354	0.20
69_V	246_D	1.351	0.20
298_D	370_C	1.346	0.19
468_M	558_Q	1.345	0.19
281_V	452_V	1.341	0.19
258_V	263_S	1.337	0.19
503_S	542_N	1.334	0.19
93_F	568_L	1.330	0.19
212_S	518_T	1.330	0.19
212_S	561_F	1.329	0.19
199_L	399_T	1.327	0.19
320_Y	492_P	1.327	0.19
229_G	244_V	1.326	0.19
105_T	330_L	1.324	0.19
67_R	378_T	1.321	0.19
290_I	374_S	1.321	0.19
197_I	226_F	1.319	0.19
176_H	280_E	1.313	0.19
539_K	546_L	1.312	0.19
275_L	402_T	1.308	0.19
509_E	517_D	1.306	0.19
9_Y	13_G	1.300	0.19
489_V	519_V	1.299	0.19
290_I	549_N	1.297	0.19
531_K	535_R	1.296	0.18
130_T	136_F	1.295	0.18
61_L	390_D	1.288	0.18
111_S	240_A	1.283	0.18
208_K	329_D	1.281	0.18
283_Y	292_Y	1.279	0.18
205_L	533_F	1.277	0.18
76_R	275_L	1.277	0.18
304_I	431_E	1.275	0.18
354_V	569_N	1.273	0.18
136_F	139_E	1.272	0.18
443_G	463_L	1.270	0.18
12_T	449_T	1.270	0.18
238_T	273_K	1.269	0.18
124_D	347_F	1.268	0.18
12_T	240_A	1.259	0.18
115_S	221_E	1.257	0.18
272_G	393_D	1.253	0.18
114_K	118_R	1.250	0.18
463_L	467_I	1.249	0.18
495_I	507_I	1.248	0.18
111_S	151_L	1.246	0.18
153_I	540_F	1.245	0.18
264_T	390_D	1.243	0.18
579_T	582_A	1.236	0.17
25_E	210_T	1.232	0.17
197_I	460_I	1.231	0.17
205_L	301_T	1.229	0.17
194_S	238_T	1.229	0.17
346_P	408_S	1.227	0.17
351_T	516_L	1.226	0.17
515_V	580_I	1.219	0.17
151_L	179_S	1.218	0.17
463_L	470_D	1.211	0.17
241_I	470_D	1.207	0.17
508_E	512_Q	1.202	0.17
443_G	580_I	1.201	0.17
122_S	175_I	1.201	0.17
464_K	491_I	1.200	0.17
222_Y	259_N	1.200	0.17
462_D	558_Q	1.198	0.17
459_D	499_Y	1.198	0.17
16_K	563_V	1.198	0.17
275_L	293_V	1.195	0.17
338_M	417_L	1.192	0.17
30_A	574_K	1.189	0.17
195_V	466_K	1.187	0.17
396_V	556_P	1.187	0.17
36_S	522_G	1.182	0.17
120_M	590_D	1.180	0.16
16_K	466_K	1.179	0.16
197_I	592_L	1.176	0.16
471_S	514_V	1.174	0.16
348_C	564_L	1.170	0.16
90_Y	304_I	1.165	0.16
166_R	170_L	1.163	0.16
165_S	370_C	1.161	0.16
240_A	542_N	1.152	0.16
263_S	270_E	1.151	0.16
208_K	322_R	1.148	0.16
125_Q	179_S	1.147	0.16
351_T	417_L	1.144	0.16
230_Y	303_K	1.141	0.16
126_V	309_D	1.140	0.16
76_R	515_V	1.140	0.16
66_L	86_D	1.140	0.16
215_E	257_N	1.135	0.16
113_V	132_S	1.133	0.16
165_S	363_I	1.133	0.16
114_K	363_I	1.129	0.16
61_L	391_A	1.129	0.16
159_V	351_T	1.128	0.16
86_D	95_N	1.127	0.16
374_S	487_N	1.123	0.16
350_H	383_T	1.123	0.16
225_G	379_Y	1.120	0.16
229_G	423_F	1.114	0.15
102_N	122_S	1.110	0.15
34_R	59_D	1.108	0.15
169_E	172_R	1.107	0.15
162_D	222_Y	1.102	0.15
205_L	420_D	1.102	0.15
197_I	241_I	1.099	0.15
98_V	441_V	1.097	0.15
427_R	584_R	1.096	0.15
572_V	588_D	1.091	0.15
354_V	589_E	1.088	0.15
508_E	552_D	1.088	0.15
443_G	537_A	1.084	0.15
421_F	443_G	1.082	0.15
310_D	592_L	1.082	0.15
165_S	315_E	1.079	0.15
443_G	460_I	1.078	0.15
197_I	318_V	1.076	0.15
28_A	563_V	1.072	0.15
354_V	534_I	1.069	0.15
354_V	425_R	1.065	0.15
211_Y	477_F	1.065	0.15
309_D	582_A	1.064	0.15
489_V	569_N	1.063	0.15
378_T	563_V	1.061	0.15
33_K	392_K	1.058	0.15
76_R	194_S	1.053	0.15
11_Q	195_V	1.053	0.15
376_N	487_N	1.049	0.14
76_R	311_Q	1.049	0.14
102_N	145_A	1.046	0.14
443_G	524_K	1.045	0.14
21_Y	56_I	1.044	0.14
409_A	580_I	1.043	0.14
317_V	454_K	1.042	0.14
159_V	266_D	1.036	0.14
467_I	580_I	1.035	0.14
161_A	295_R	1.035	0.14
240_A	249_K	1.034	0.14
31_F	94_E	1.033	0.14
174_I	201_E	1.029	0.14
539_K	561_F	1.024	0.14
338_M	351_T	1.023	0.14
464_K	490_L	1.023	0.14
153_I	195_V	1.022	0.14
182_I	390_D	1.021	0.14
166_R	465_A	1.020	0.14
354_V	514_V	1.018	0.14
107_G	204_E	1.014	0.14
43_A	577_Q	1.012	0.14
5_I	580_I	1.011	0.14
194_S	306_D	1.011	0.14
327_L	374_S	1.009	0.14
347_F	374_S	1.008	0.14
317_V	330_L	1.006	0.14
448_S	452_V	1.003	0.14
397_T	563_V	0.997	0.14
5_I	21_Y	0.993	0.14
399_T	402_T	0.993	0.14
245_L	348_C	0.989	0.14
509_E	537_A	0.989	0.14
262_E	549_N	0.988	0.14
236_Q	495_I	0.986	0.14
208_K	533_F	0.986	0.14
120_M	393_D	0.983	0.13
354_V	364_V	0.978	0.13
182_I	498_V	0.975	0.13
273_K	466_K	0.975	0.13
444_L	588_D	0.975	0.13
12_T	77_S	0.974	0.13
443_G	516_L	0.971	0.13
421_F	426_R	0.970	0.13
175_I	408_S	0.969	0.13
209_V	263_S	0.968	0.13
32_E	563_V	0.968	0.13
248_N	291_I	0.968	0.13
138_F	261_G	0.967	0.13
16_K	439_L	0.967	0.13
166_R	196_P	0.960	0.13
265_K	540_F	0.958	0.13
80_S	481_V	0.958	0.13
41_V	458_N	0.957	0.13
152_A	262_E	0.954	0.13
231_H	310_D	0.951	0.13
5_I	106_V	0.949	0.13
329_D	574_K	0.946	0.13
288_T	429_E	0.944	0.13
470_D	490_L	0.943	0.13
123_D	236_Q	0.939	0.13
33_K	41_V	0.938	0.13
9_Y	15_S	0.938	0.13
463_L	520_M	0.935	0.13
111_S	426_R	0.934	0.13
350_H	483_P	0.933	0.13
351_T	580_I	0.929	0.13
327_L	347_F	0.925	0.13
20_E	38_Y	0.920	0.13
467_I	491_I	0.919	0.13
29_R	449_T	0.919	0.13
178_S	482_D	0.919	0.13
315_E	588_D	0.918	0.13
165_S	420_D	0.915	0.13
128_I	488_K	0.913	0.13
25_E	379_Y	0.912	0.13
496_Q	563_V	0.910	0.13
495_I	511_R	0.910	0.13
288_T	494_V	0.909	0.12
311_Q	584_R	0.908	0.12
178_S	320_Y	0.906	0.12
212_S	370_C	0.905	0.12
356_Y	417_L	0.901	0.12
498_V	590_D	0.901	0.12
222_Y	554_I	0.899	0.12
517_D	521_K	0.898	0.12
65_G	567_E	0.898	0.12
76_R	318_V	0.896	0.12
165_S	194_S	0.895	0.12
226_F	350_H	0.894	0.12
205_L	326_A	0.892	0.12
463_L	512_Q	0.888	0.12
16_K	248_N	0.885	0.12
153_I	182_I	0.883	0.12
161_A	197_I	0.883	0.12
290_I	327_L	0.881	0.12
21_Y	32_E	0.880	0.12
427_R	443_G	0.879	0.12
53_L	132_S	0.879	0.12
83_K	494_V	0.876	0.12
197_I	524_K	0.874	0.12
219_G	412_L	0.873	0.12
163_V	170_L	0.873	0.12
302_L	398_Y	0.872	0.12
246_D	278_I	0.871	0.12
71_V	513_H	0.869	0.12
234_Q	506_E	0.869	0.12
449_T	478_S	0.868	0.12
43_A	476_T	0.868	0.12
491_I	532_E	0.867	0.12
449_T	579_T	0.867	0.12
141_I	574_K	0.867	0.12
443_G	470_D	0.866	0.12
165_S	559_K	0.865	0.12
57_G	428_N	0.865	0.12
489_V	493_K	0.863	0.12
273_K	306_D	0.860	0.12
212_S	241_I	0.858	0.12
13_G	19_N	0.857	0.12
295_R	561_F	0.856	0.12
226_F	566_K	0.854	0.12
204_E	497_K	0.848	0.12
41_V	399_T	0.847	0.12
30_A	564_L	0.847	0.12
248_N	332_I	0.846	0.12
409_A	534_I	0.846	0.12
226_F	404_L	0.845	0.12
66_L	473_V	0.845	0.12
21_Y	94_E	0.845	0.12
358_G	475_K	0.842	0.12
230_Y	348_C	0.839	0.12
293_V	489_V	0.837	0.12
492_P	506_E	0.837	0.12
501_N	576_I	0.836	0.12
241_I	426_R	0.835	0.12
142_D	346_P	0.835	0.12
386_I	390_D	0.834	0.12
278_I	549_N	0.830	0.12
268_Y	282_E	0.829	0.11
315_E	318_V	0.829	0.11
80_S	324_I	0.828	0.11
61_L	69_V	0.828	0.11
225_G	276_D	0.827	0.11
172_R	443_G	0.827	0.11
159_V	459_D	0.826	0.11
320_Y	374_S	0.825	0.11
316_N	392_K	0.825	0.11
212_S	509_E	0.825	0.11
90_Y	114_K	0.824	0.11
543_I	568_L	0.824	0.11
243_E	294_K	0.823	0.11
122_S	280_E	0.822	0.11
332_I	425_R	0.822	0.11
98_V	124_D	0.821	0.11
541_I	589_E	0.821	0.11
278_I	425_R	0.820	0.11
347_F	402_T	0.820	0.11
443_G	456_I	0.819	0.11
177_N	330_L	0.819	0.11
275_L	378_T	0.819	0.11
312_V	399_T	0.818	0.11
228_I	265_K	0.817	0.11
165_S	306_D	0.814	0.11
449_T	456_I	0.813	0.11
282_E	588_D	0.809	0.11
241_I	248_N	0.808	0.11
244_V	423_F	0.807	0.11
76_R	295_R	0.806	0.11
128_I	422_K	0.806	0.11
116_F	120_M	0.805	0.11
31_F	453_K	0.803	0.11
376_N	422_K	0.802	0.11
14_K	590_D	0.801	0.11
93_F	566_K	0.800	0.11
280_E	582_A	0.800	0.11
101_R	205_L	0.800	0.11
212_S	479_G	0.799	0.11
272_G	388_M	0.799	0.11
439_L	451_N	0.798	0.11
16_K	221_E	0.795	0.11
587_F	595_I	0.795	0.11
165_S	452_V	0.795	0.11
43_A	462_D	0.794	0.11
453_K	491_I	0.790	0.11
379_Y	422_K	0.789	0.11
226_F	330_L	0.787	0.11
518_T	580_I	0.786	0.11
294_K	319_A	0.785	0.11
273_K	481_V	0.784	0.11
125_Q	317_V	0.783	0.11
278_I	479_G	0.783	0.11
29_R	146_F	0.782	0.11
420_D	462_D	0.780	0.11
309_D	316_N	0.780	0.11
446_E	449_T	0.778	0.11
159_V	461_N	0.776	0.11
443_G	513_H	0.776	0.11
128_I	375_Y	0.775	0.11
404_L	415_Q	0.774	0.11
30_A	218_D	0.773	0.11
249_K	570_S	0.772	0.11
278_I	539_K	0.770	0.11
258_V	328_D	0.770	0.11
143_D	541_I	0.769	0.11
428_N	463_L	0.768	0.11
197_I	398_Y	0.767	0.11
275_L	304_I	0.767	0.11
210_T	399_T	0.766	0.11
584_R	593_V	0.765	0.11
39_L	100_P	0.765	0.11
140_K	589_E	0.764	0.11
113_V	276_D	0.764	0.11
376_N	592_L	0.763	0.11
403_M	561_F	0.762	0.11
261_G	597_P	0.761	0.11
311_Q	466_K	0.761	0.11
350_H	564_L	0.758	0.11
121_E	225_G	0.758	0.11
164_N	562_E	0.758	0.11
121_E	145_A	0.758	0.11
319_A	481_V	0.757	0.11
302_L	505_E	0.753	0.11
218_D	566_K	0.752	0.11
228_I	489_V	0.746	0.11
551_I	555_N	0.746	0.11
212_S	425_R	0.742	0.10
261_G	543_I	0.742	0.10
226_F	348_C	0.742	0.10
589_E	593_V	0.740	0.10
53_L	262_E	0.740	0.10
61_L	107_G	0.739	0.10
174_I	178_S	0.738	0.10
208_K	358_G	0.735	0.10
165_S	348_C	0.734	0.10
587_F	596_W	0.733	0.10
426_R	512_Q	0.731	0.10
41_V	587_F	0.728	0.10
278_I	528_V	0.728	0.10
393_D	397_T	0.726	0.10
226_F	310_D	0.726	0.10
323_N	541_I	0.724	0.10
402_T	549_N	0.723	0.10
107_G	113_V	0.723	0.10
363_I	531_K	0.719	0.10
266_D	269_D	0.719	0.10
120_M	363_I	0.719	0.10
85_T	116_F	0.719	0.10
272_G	497_K	0.718	0.10
149_C	273_K	0.717	0.10
19_N	526_E	0.716	0.10
161_A	404_L	0.716	0.10
21_Y	409_A	0.714	0.10
218_D	592_L	0.711	0.10
93_F	584_R	0.709	0.10
418_T	484_K	0.708	0.10
426_R	443_G	0.708	0.10
502_L	548_I	0.708	0.10
165_S	170_L	0.707	0.10
457_E	491_I	0.706	0.10
88_K	142_D	0.706	0.10
218_D	229_G	0.706	0.10
199_L	584_R	0.705	0.10
14_K	71_V	0.705	0.10
207_D	563_V	0.705	0.10
161_A	298_D	0.705	0.10
170_L	568_L	0.703	0.10
7_I	450_E	0.702	0.10
208_K	549_N	0.701	0.10
30_A	66_L	0.700	0.10
236_Q	240_A	0.700	0.10
348_C	403_M	0.700	0.10
71_V	358_G	0.699	0.10
29_R	584_R	0.699	0.10
14_K	257_N	0.699	0.10
239_S	554_I	0.698	0.10
240_A	381_Q	0.697	0.10
102_N	120_M	0.697	0.10
67_R	457_E	0.696	0.10
107_G	132_S	0.696	0.10
248_N	446_E	0.696	0.10
438_E	576_I	0.691	0.10
358_G	370_C	0.691	0.10
549_N	595_I	0.691	0.10
80_S	225_G	0.690	0.10
290_I	320_Y	0.690	0.10
5_I	443_G	0.690	0.10
161_A	210_T	0.688	0.10
57_G	543_I	0.687	0.10
417_L	447_P	0.684	0.10
210_T	430_S	0.684	0.10
480_E	503_S	0.684	0.10
433_S	563_V	0.683	0.10
66_L	453_K	0.682	0.10
417_L	441_V	0.681	0.10
197_I	212_S	0.679	0.10
68_K	138_F	0.678	0.10
69_V	358_G	0.676	0.10
463_L	514_V	0.674	0.10
106_V	541_I	0.674	0.10
443_G	448_S	0.673	0.10
247_T	303_K	0.673	0.10
33_K	403_M	0.670	0.10
99_D	124_D	0.670	0.10
399_T	573_L	0.667	0.10
123_D	441_V	0.667	0.10
163_V	166_R	0.666	0.10
549_N	559_K	0.666	0.10
376_N	488_K	0.666	0.10
66_L	148_N	0.666	0.10
221_E	375_Y	0.665	0.10
68_K	260_S	0.665	0.10
109_D	545_D	0.665	0.10
243_E	562_E	0.664	0.10
77_S	135_R	0.662	0.10
147_D	175_I	0.661	0.10
103_N	195_V	0.660	0.10
238_T	261_G	0.659	0.10
108_G	590_D	0.658	0.10
9_Y	565_S	0.657	0.10
290_I	375_Y	0.657	0.10
556_P	560_A	0.654	0.10
379_Y	574_K	0.654	0.10
395_V	554_I	0.652	0.10
111_S	398_Y	0.652	0.10
467_I	524_K	0.652	0.10
8_N	207_D	0.651	0.09
67_R	166_R	0.651	0.09
227_G	381_Q	0.651	0.09
351_T	360_L	0.650	0.09
66_L	539_K	0.650	0.09
521_K	580_I	0.648	0.09
10_N	354_V	0.647	0.09
416_V	462_D	0.647	0.09
180_A	498_V	0.646	0.09
363_I	515_V	0.645	0.09
63_N	570_S	0.645	0.09
309_D	585_I	0.644	0.09
117_V	301_T	0.644	0.09
320_Y	576_I	0.643	0.09
391_A	493_K	0.643	0.09
268_Y	425_R	0.643	0.09
211_Y	215_E	0.643	0.09
268_Y	506_E	0.643	0.09
57_G	149_C	0.642	0.09
29_R	430_S	0.641	0.09
383_T	418_T	0.641	0.09
514_V	521_K	0.641	0.09
266_D	582_A	0.641	0.09
208_K	393_D	0.640	0.09
423_F	566_K	0.640	0.09
132_S	204_E	0.639	0.09
13_G	391_A	0.637	0.09
174_I	471_S	0.636	0.09
524_K	580_I	0.636	0.09
95_N	436_T	0.636	0.09
164_N	354_V	0.635	0.09
115_S	118_R	0.635	0.09
98_V	473_V	0.632	0.09
364_V	590_D	0.630	0.09
261_G	452_V	0.630	0.09
333_I	387_A	0.629	0.09
422_K	462_D	0.628	0.09
162_D	265_K	0.628	0.09
324_I	596_W	0.628	0.09
354_V	392_K	0.627	0.09
21_Y	30_A	0.626	0.09
83_K	585_I	0.626	0.09
68_K	379_Y	0.625	0.09
169_E	239_S	0.625	0.09
144_K	151_L	0.624	0.09
466_K	486_L	0.623	0.09
124_D	163_V	0.619	0.09
165_S	291_I	0.619	0.09
17_K	57_G	0.617	0.09
128_I	469_Q	0.617	0.09
159_V	338_M	0.616	0.09
240_A	591_E	0.615	0.09
183_V	310_D	0.615	0.09
165_S	226_F	0.614	0.09
106_V	515_V	0.614	0.09
202_D	302_L	0.613	0.09
429_E	524_K	0.613	0.09
416_V	469_Q	0.613	0.09
84_N	395_V	0.613	0.09
183_V	346_P	0.611	0.09
5_I	241_I	0.611	0.09
109_D	442_K	0.608	0.09
554_I	563_V	0.608	0.09
460_I	493_K	0.608	0.09
130_T	383_T	0.608	0.09
476_T	538_D	0.607	0.09
41_V	212_S	0.605	0.09
103_N	394_E	0.604	0.09
212_S	525_S	0.603	0.09
364_V	440_F	0.603	0.09
19_N	103_N	0.602	0.09
30_A	596_W	0.601	0.09
470_D	493_K	0.601	0.09
222_Y	364_V	0.601	0.09
106_V	120_M	0.601	0.09
392_K	584_R	0.601	0.09
21_Y	332_I	0.600	0.09
253_V	277_M	0.600	0.09
293_V	529_G	0.599	0.09
456_I	491_I	0.598	0.09
84_N	126_V	0.597	0.09
25_E	452_V	0.596	0.09
171_L	351_T	0.596	0.09
507_I	547_D	0.594	0.09
139_E	311_Q	0.594	0.09
194_S	378_T	0.594	0.09
16_K	496_Q	0.593	0.09
115_S	542_N	0.592	0.09
196_P	230_Y	0.591	0.09
199_L	553_S	0.590	0.09
272_G	549_N	0.588	0.09
330_L	449_T	0.588	0.09
95_N	222_Y	0.587	0.09
140_K	503_S	0.586	0.09
45_P	50_S	0.586	0.09
46_A	50_S	0.586	0.09
45_P	48_G	0.586	0.09
46_A	49_K	0.586	0.09
45_P	51_R	0.586	0.09
40_L	44_P	0.586	0.09
45_P	52_A	0.586	0.09
45_P	49_K	0.586	0.09
44_P	52_A	0.586	0.09
48_G	52_A	0.586	0.09
46_A	51_R	0.586	0.09
40_L	52_A	0.586	0.09
44_P	48_G	0.586	0.09
40_L	51_R	0.586	0.09
44_P	49_K	0.586	0.09
49_K	52_A	0.586	0.09
40_L	50_S	0.586	0.09
40_L	49_K	0.586	0.09
48_G	51_R	0.586	0.09
46_A	52_A	0.586	0.09
44_P	50_S	0.586	0.09
40_L	48_G	0.586	0.09
40_L	46_A	0.586	0.09
44_P	51_R	0.586	0.09
40_L	45_P	0.586	0.09
102_N	487_N	0.586	0.09
409_A	460_I	0.585	0.09
165_S	577_Q	0.582	0.09
194_S	488_K	0.580	0.09
142_D	290_I	0.580	0.09
67_R	306_D	0.580	0.09
196_P	518_T	0.579	0.09
166_R	375_Y	0.579	0.09
218_D	330_L	0.579	0.09
363_I	591_E	0.579	0.09
90_Y	394_E	0.578	0.09
557_F	592_L	0.577	0.09
449_T	574_K	0.577	0.09
475_K	521_K	0.577	0.09
273_K	364_V	0.577	0.09
257_N	569_N	0.576	0.09
261_G	402_T	0.576	0.09
171_L	174_I	0.576	0.09
249_K	439_L	0.575	0.09
322_R	393_D	0.575	0.09
9_Y	430_S	0.575	0.09
150_L	530_S	0.575	0.09
88_K	165_S	0.575	0.09
140_K	309_D	0.574	0.09
147_D	497_K	0.574	0.09
31_F	554_I	0.574	0.09
351_T	512_Q	0.573	0.09
263_S	390_D	0.573	0.09
11_Q	201_E	0.572	0.09
118_R	439_L	0.572	0.09
200_P	363_I	0.571	0.09
294_K	430_S	0.571	0.09
27_Q	91_G	0.570	0.09
479_G	569_N	0.570	0.09
329_D	393_D	0.569	0.09
348_C	596_W	0.568	0.09
514_V	540_F	0.568	0.09
243_E	519_V	0.568	0.09
195_V	541_I	0.568	0.09
108_G	272_G	0.567	0.09
319_A	545_D	0.567	0.09
370_C	498_V	0.567	0.09
334_I	495_I	0.567	0.09
72_A	162_D	0.567	0.09
301_T	534_I	0.566	0.09
364_V	379_Y	0.564	0.09
79_G	91_G	0.564	0.09
231_H	402_T	0.563	0.09
493_K	580_I	0.563	0.09
356_Y	447_P	0.562	0.09
59_D	63_N	0.562	0.09
150_L	474_Q	0.562	0.09
132_S	183_V	0.561	0.09
566_K	592_L	0.560	0.09
222_Y	528_V	0.560	0.09
453_K	527_V	0.559	0.09
364_V	398_Y	0.559	0.09
318_V	588_D	0.558	0.09
148_N	363_I	0.558	0.09
144_K	347_F	0.556	0.09
241_I	569_N	0.554	0.09
397_T	449_T	0.554	0.09
103_N	473_V	0.553	0.09
237_Y	274_I	0.552	0.09
509_E	575_L	0.552	0.09
115_S	549_N	0.552	0.09
240_A	316_N	0.551	0.09
24_R	52_A	0.551	0.09
24_R	51_R	0.551	0.09
24_R	50_S	0.551	0.09
24_R	44_P	0.551	0.09
24_R	45_P	0.551	0.09
24_R	49_K	0.551	0.09
24_R	46_A	0.551	0.09
24_R	48_G	0.551	0.09
24_R	40_L	0.551	0.09
152_A	263_S	0.550	0.09
90_Y	242_N	0.549	0.09
294_K	322_R	0.548	0.08
26_M	52_A	0.547	0.08
26_M	50_S	0.547	0.08
26_M	49_K	0.547	0.08
26_M	48_G	0.547	0.08
26_M	46_A	0.547	0.08
26_M	51_R	0.547	0.08
26_M	44_P	0.547	0.08
26_M	45_P	0.547	0.08
26_M	40_L	0.547	0.08
227_G	404_L	0.547	0.08
108_G	458_N	0.546	0.08
108_G	294_K	0.545	0.08
139_E	166_R	0.544	0.08
136_F	237_Y	0.544	0.08
227_G	452_V	0.544	0.08
19_N	473_V	0.543	0.08
165_S	464_K	0.543	0.08
285_D	288_T	0.543	0.08
446_E	453_K	0.542	0.08
243_E	400_V	0.542	0.08
68_K	238_T	0.542	0.08
226_F	423_F	0.542	0.08
89_S	287_D	0.541	0.08
354_V	501_N	0.541	0.08
320_Y	506_E	0.541	0.08
117_V	565_S	0.539	0.08
30_A	248_N	0.539	0.08
69_V	247_T	0.537	0.08
93_F	576_I	0.536	0.08
62_I	94_E	0.536	0.08
80_S	569_N	0.534	0.08
424_K	495_I	0.534	0.08
126_V	239_S	0.534	0.08
233_Y	252_I	0.533	0.08
483_P	561_F	0.533	0.08
477_F	561_F	0.532	0.08
153_I	180_A	0.532	0.08
21_Y	399_T	0.531	0.08
21_Y	93_F	0.531	0.08
14_K	293_V	0.531	0.08
107_G	137_A	0.531	0.08
481_V	533_F	0.529	0.08
247_T	370_C	0.529	0.08
233_Y	305_A	0.529	0.08
116_F	141_I	0.528	0.08
208_K	284_Q	0.527	0.08
559_K	596_W	0.527	0.08
225_G	506_E	0.526	0.08
569_N	587_F	0.525	0.08
38_Y	175_I	0.524	0.08
263_S	328_D	0.523	0.08
540_F	557_F	0.523	0.08
536_M	552_D	0.523	0.08
318_V	585_I	0.521	0.08
99_D	141_I	0.521	0.08
291_I	302_L	0.520	0.08
317_V	525_S	0.520	0.08
404_L	592_L	0.520	0.08
61_L	72_A	0.520	0.08
12_T	539_K	0.519	0.08
253_V	428_N	0.519	0.08
103_N	568_L	0.518	0.08
491_I	517_D	0.518	0.08
268_Y	400_V	0.518	0.08
327_L	475_K	0.517	0.08
173_S	265_K	0.515	0.08
170_L	402_T	0.514	0.08
174_I	374_S	0.514	0.08
289_G	441_V	0.513	0.08
392_K	528_V	0.513	0.08
132_S	418_T	0.513	0.08
429_E	498_V	0.510	0.08
182_I	589_E	0.508	0.08
561_F	572_V	0.507	0.08
115_S	350_H	0.507	0.08
388_M	594_F	0.506	0.08
234_Q	388_M	0.506	0.08
71_V	431_E	0.506	0.08
234_Q	521_K	0.506	0.08
162_D	243_E	0.506	0.08
140_K	395_V	0.505	0.08
56_I	315_E	0.504	0.08
147_D	479_G	0.504	0.08
490_L	517_D	0.504	0.08
408_S	578_E	0.504	0.08
247_T	348_C	0.503	0.08
195_V	460_I	0.503	0.08
244_V	570_S	0.502	0.08
170_L	569_N	0.501	0.08
316_N	332_I	0.501	0.08
38_Y	259_N	0.500	0.08
441_V	527_V	0.500	0.08
272_G	564_L	0.500	0.08
109_D	392_K	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4zcfC	1	0.6578	99.9	0.93	Contact Map
3oiyA	1	0.5977	99.9	0.93	Contact Map
2i4iA	1	0.6027	99.9	0.931	Contact Map
2db3A	1	0.5977	99.9	0.932	Contact Map
3h1tA	1	0.5159	99.9	0.932	Contact Map
1fuuA	2	0.5876	99.9	0.932	Contact Map
4ct4B	1	0.606	99.9	0.932	Contact Map
1hv8A	2	0.5743	99.9	0.932	Contact Map
3peyA	1	0.591	99.9	0.933	Contact Map
3fhtA	1	0.5776	99.9	0.933	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.014 seconds.