YOBL - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YOBL - Ribonuclease YobL

UniProt:	O34330	Sequences: MKVFEADSLLFEADKRTKEYKELRSQMVKLKKAFKEVANLDDSEFSGKGADNIKAFYHGHVGVTDQWIDLIDMKIAFLSSMSATLEDAKMSDAYIEESFLEHELANAYAKSKSIMSEQKKAMKDILNNINDILPLEIFSTEDFKDKLSSADDKREKTIDKLNKLDEDLKTEYAETEPNEQFIQQDFKKLQESTGKGKNATPIHYNAKAYRESDIHKKKGDIEKHSEAYLSVKKEEAKEREIKELKKKLNDGVSDPDEYLEIAKKVGYENLEPTQVQLAVQIEQAKQLEGAGEITWDIVKGVGVGLYDVGKDTVTGIWDFITDPGETLSALGNAAMHPVKTYDAISAAIEESYQKDMVNGDAYSRSRWVTYAIGSVAVAVVGTKGAGAINKADAAGKVINKASQAGKKIKDVKIPDLLPYNPKYKLALADNVPYNVVDSQNLKNELLTNAKKIPDGTRKPFTGQKKSPPWLNKEKYDAYEIEGKVKAKGKVKDVSRRVYTMKDIDINQKTEFGVTNLQLMKNGNAPYAKDGTQINLHHLIQEEPGPMLEIPNSLHTKYSDVIHQLKSDGESFRNDKVLKAQYESFRKRYWKWRAKQFENEN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	600 (491)
Sequences:	111 (80)
Seq/√Len:	3.6

BACSU - YOBL YOKI YXID YEEF YWQJ YQCG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
57_Y	143_F	4.489	0.87
477_A	482_G	3.733	0.75
462_G	467_P	3.486	0.69
34_F	78_L	3.400	0.67
472_K	477_A	3.189	0.62
468_P	471_N	3.148	0.61
78_L	85_L	2.795	0.51
15_K	82_S	2.785	0.51
482_G	487_K	2.687	0.48
37_V	145_D	2.656	0.47
27_M	94_Y	2.620	0.46
462_G	465_K	2.558	0.44
479_E	483_K	2.522	0.43
482_G	490_V	2.509	0.43
460_F	471_N	2.501	0.43
477_A	480_I	2.462	0.42
471_N	477_A	2.437	0.41
57_Y	93_A	2.422	0.41
14_D	85_L	2.261	0.37
89_K	164_L	2.250	0.36
469_W	474_K	2.208	0.35
489_K	493_V	2.197	0.35
37_V	113_S	2.188	0.35
475_Y	482_G	2.161	0.34
473_E	482_G	2.130	0.33
487_K	490_V	2.122	0.33
467_P	482_G	2.101	0.33
265_V	277_L	2.099	0.33
12_E	37_V	2.093	0.32
70_L	88_A	2.078	0.32
477_A	488_G	2.076	0.32
14_D	78_L	2.031	0.31
482_G	486_A	2.020	0.31
66_Q	93_A	2.017	0.31
121_A	134_P	2.012	0.30
462_G	470_L	2.002	0.30
477_A	484_V	1.995	0.30
468_P	472_K	1.941	0.29
480_I	487_K	1.926	0.28
109_A	142_D	1.894	0.28
10_L	35_K	1.867	0.27
483_K	486_A	1.866	0.27
431_V	441_L	1.866	0.27
34_F	70_L	1.861	0.27
357_V	372_I	1.858	0.27
78_L	82_S	1.852	0.27
96_E	114_I	1.837	0.27
124_D	127_N	1.831	0.26
468_P	477_A	1.811	0.26
469_W	477_A	1.805	0.26
152_D	183_Q	1.804	0.26
78_L	108_Y	1.797	0.26
477_A	483_K	1.787	0.25
477_A	486_A	1.770	0.25
460_F	477_A	1.765	0.25
461_T	471_N	1.751	0.25
78_L	169_K	1.737	0.24
480_I	492_D	1.729	0.24
471_N	482_G	1.728	0.24
152_D	169_K	1.724	0.24
14_D	82_S	1.721	0.24
480_I	484_V	1.720	0.24
462_G	468_P	1.703	0.24
487_K	492_D	1.701	0.24
471_N	486_A	1.682	0.23
474_K	478_Y	1.666	0.23
299_K	306_Y	1.664	0.23
459_P	479_E	1.653	0.23
421_P	433_Y	1.652	0.23
479_E	482_G	1.650	0.23
33_A	98_S	1.650	0.23
79_S	134_P	1.646	0.23
432_P	435_V	1.637	0.22
459_P	477_A	1.633	0.22
482_G	488_G	1.632	0.22
57_Y	121_A	1.603	0.22
484_V	492_D	1.589	0.22
445_L	457_R	1.570	0.21
64_T	89_K	1.570	0.21
484_V	487_K	1.568	0.21
255_P	259_L	1.568	0.21
306_Y	310_K	1.567	0.21
460_F	469_W	1.539	0.21
57_Y	95_I	1.535	0.21
130_N	134_P	1.534	0.21
57_Y	84_T	1.532	0.21
488_G	493_V	1.532	0.21
37_V	170_T	1.527	0.20
21_K	148_S	1.523	0.20
475_Y	485_K	1.518	0.20
22_E	94_Y	1.518	0.20
467_P	483_K	1.504	0.20
252_V	255_P	1.493	0.20
460_F	488_G	1.489	0.20
133_L	202_I	1.477	0.20
12_E	94_Y	1.469	0.19
85_L	113_S	1.465	0.19
488_G	492_D	1.463	0.19
270_L	274_Q	1.462	0.19
489_K	492_D	1.456	0.19
467_P	486_A	1.454	0.19
437_D	470_L	1.452	0.19
35_K	85_L	1.449	0.19
93_A	133_L	1.445	0.19
34_F	108_Y	1.443	0.19
140_T	178_N	1.439	0.19
440_N	443_N	1.439	0.19
433_Y	449_A	1.434	0.19
46_S	204_Y	1.434	0.19
11_F	198_N	1.418	0.19
475_Y	480_I	1.411	0.18
27_M	137_I	1.402	0.18
490_V	493_V	1.399	0.18
475_Y	487_K	1.396	0.18
478_Y	491_K	1.391	0.18
466_S	471_N	1.390	0.18
460_F	468_P	1.389	0.18
477_A	487_K	1.389	0.18
456_T	460_F	1.388	0.18
79_S	89_K	1.378	0.18
68_I	113_S	1.376	0.18
57_Y	66_Q	1.374	0.18
468_P	484_V	1.372	0.18
477_A	485_K	1.368	0.18
480_I	489_K	1.360	0.18
470_L	474_K	1.358	0.18
284_A	291_G	1.352	0.17
434_N	438_S	1.347	0.17
457_R	461_T	1.347	0.17
474_K	493_V	1.339	0.17
191_E	222_E	1.336	0.17
465_K	468_P	1.334	0.17
421_P	431_V	1.331	0.17
82_S	108_Y	1.325	0.17
473_E	486_A	1.324	0.17
12_E	145_D	1.323	0.17
466_S	482_G	1.321	0.17
484_V	488_G	1.315	0.17
423_Y	457_R	1.314	0.17
421_P	441_L	1.313	0.17
473_E	477_A	1.310	0.17
94_Y	166_E	1.299	0.17
288_E	292_E	1.299	0.17
461_T	469_W	1.299	0.17
462_G	466_S	1.299	0.17
435_V	439_Q	1.297	0.17
434_N	439_Q	1.292	0.17
40_L	104_L	1.289	0.16
145_D	166_E	1.282	0.16
383_K	432_P	1.282	0.16
15_K	108_Y	1.280	0.16
458_K	474_K	1.278	0.16
435_V	453_P	1.274	0.16
79_S	111_S	1.271	0.16
265_V	269_N	1.270	0.16
479_E	488_G	1.269	0.16
4_F	96_E	1.267	0.16
25_S	82_S	1.266	0.16
424_K	427_L	1.265	0.16
466_S	486_A	1.265	0.16
7_D	143_F	1.265	0.16
78_L	204_Y	1.259	0.16
37_V	68_I	1.257	0.16
12_E	68_I	1.256	0.16
121_A	128_N	1.252	0.16
464_K	482_G	1.251	0.16
470_L	485_K	1.248	0.16
16_R	20_Y	1.245	0.16
471_N	487_K	1.245	0.16
480_I	493_V	1.244	0.16
483_K	487_K	1.243	0.16
446_L	474_K	1.231	0.16
323_P	434_N	1.231	0.16
354_K	403_Q	1.226	0.16
473_E	478_Y	1.223	0.15
106_N	116_S	1.221	0.15
94_Y	145_D	1.218	0.15
14_D	25_S	1.217	0.15
118_Q	138_F	1.215	0.15
460_F	466_S	1.214	0.15
466_S	473_E	1.214	0.15
134_P	144_K	1.210	0.15
37_V	222_E	1.208	0.15
132_I	189_L	1.205	0.15
202_I	205_N	1.201	0.15
311_D	370_Y	1.199	0.15
25_S	159_D	1.192	0.15
433_Y	441_L	1.192	0.15
417_L	441_L	1.189	0.15
149_S	183_Q	1.188	0.15
456_T	472_K	1.187	0.15
477_A	489_K	1.186	0.15
461_T	468_P	1.178	0.15
474_K	488_G	1.176	0.15
467_P	480_I	1.174	0.15
485_K	489_K	1.173	0.15
252_V	297_I	1.172	0.15
474_K	477_A	1.171	0.15
92_D	129_I	1.170	0.15
472_K	480_I	1.170	0.15
456_T	477_A	1.167	0.15
352_Y	357_V	1.163	0.15
18_K	48_K	1.163	0.15
462_G	471_N	1.162	0.15
116_S	145_D	1.159	0.15
467_P	471_N	1.155	0.15
81_M	94_Y	1.153	0.15
98_S	103_E	1.152	0.14
342_D	354_K	1.148	0.14
483_K	489_K	1.147	0.14
460_F	470_L	1.143	0.14
324_G	354_K	1.142	0.14
4_F	114_I	1.138	0.14
384_G	391_A	1.135	0.14
289_G	310_K	1.135	0.14
482_G	493_V	1.133	0.14
68_I	143_F	1.128	0.14
466_S	487_K	1.127	0.14
35_K	164_L	1.119	0.14
458_K	471_N	1.118	0.14
116_S	119_K	1.117	0.14
467_P	473_E	1.115	0.14
31_K	79_S	1.115	0.14
25_S	79_S	1.114	0.14
280_Q	344_I	1.111	0.14
434_N	437_D	1.109	0.14
299_K	381_G	1.109	0.14
439_Q	453_P	1.105	0.14
68_I	121_A	1.104	0.14
109_A	152_D	1.103	0.14
476_D	485_K	1.102	0.14
459_P	471_N	1.100	0.14
471_N	479_E	1.093	0.14
478_Y	481_E	1.089	0.14
422_K	435_V	1.086	0.14
472_K	482_G	1.085	0.14
474_K	480_I	1.084	0.14
278_A	281_I	1.083	0.14
243_E	253_S	1.080	0.14
48_K	94_Y	1.077	0.13
454_D	467_P	1.077	0.13
46_S	102_H	1.075	0.13
338_V	354_K	1.074	0.13
15_K	78_L	1.073	0.13
488_G	491_K	1.072	0.13
452_I	460_F	1.072	0.13
464_K	473_E	1.068	0.13
485_K	490_V	1.067	0.13
462_G	469_W	1.067	0.13
261_I	286_Q	1.066	0.13
106_N	166_E	1.066	0.13
74_K	115_M	1.065	0.13
480_I	490_V	1.064	0.13
480_I	488_G	1.064	0.13
477_A	493_V	1.060	0.13
474_K	479_E	1.057	0.13
109_A	183_Q	1.053	0.13
94_Y	137_I	1.050	0.13
479_E	493_V	1.049	0.13
52_N	149_S	1.047	0.13
21_K	86_E	1.036	0.13
471_N	480_I	1.035	0.13
5_E	107_A	1.035	0.13
75_I	182_I	1.030	0.13
482_G	492_D	1.027	0.13
482_G	489_K	1.023	0.13
323_P	331_G	1.021	0.13
149_S	175_T	1.018	0.13
130_N	133_L	1.018	0.13
355_D	367_W	1.018	0.13
265_V	276_Q	1.016	0.13
85_L	108_Y	1.016	0.13
457_R	470_L	1.016	0.13
4_F	17_T	1.013	0.13
486_A	491_K	1.009	0.13
34_F	61_V	1.008	0.13
182_I	194_G	1.007	0.13
37_V	61_V	1.006	0.13
70_L	82_S	1.005	0.13
466_S	483_K	1.004	0.13
58_H	121_A	0.999	0.13
453_P	456_T	0.997	0.12
461_T	476_D	0.995	0.12
301_V	354_K	0.994	0.12
8_S	82_S	0.993	0.12
433_Y	457_R	0.992	0.12
334_A	446_L	0.992	0.12
477_A	490_V	0.986	0.12
271_E	297_I	0.984	0.12
93_A	202_I	0.982	0.12
37_V	188_K	0.980	0.12
46_S	74_K	0.974	0.12
18_K	156_K	0.971	0.12
471_N	488_G	0.968	0.12
364_R	367_W	0.968	0.12
68_I	93_A	0.966	0.12
473_E	489_K	0.966	0.12
480_I	486_A	0.965	0.12
89_K	108_Y	0.962	0.12
465_K	471_N	0.956	0.12
27_M	33_A	0.955	0.12
320_I	328_S	0.955	0.12
14_D	192_S	0.955	0.12
355_D	433_Y	0.952	0.12
457_R	462_G	0.949	0.12
482_G	485_K	0.948	0.12
30_L	67_W	0.945	0.12
425_L	446_L	0.945	0.12
94_Y	170_T	0.939	0.12
486_A	492_D	0.938	0.12
298_V	365_S	0.933	0.12
124_D	133_L	0.932	0.12
479_E	487_K	0.932	0.12
469_W	479_E	0.929	0.12
468_P	473_E	0.928	0.12
323_P	340_T	0.927	0.12
374_S	381_G	0.926	0.12
51_D	142_D	0.925	0.12
12_E	166_E	0.925	0.12
455_G	462_G	0.922	0.12
66_Q	133_L	0.921	0.12
473_E	480_I	0.921	0.12
465_K	470_L	0.919	0.12
22_E	27_M	0.917	0.12
95_I	220_D	0.916	0.12
477_A	481_E	0.916	0.12
85_L	89_K	0.913	0.12
133_L	144_K	0.912	0.12
410_D	414_P	0.909	0.11
421_P	432_P	0.907	0.11
433_Y	444_E	0.907	0.11
356_M	368_V	0.902	0.11
111_S	206_A	0.901	0.11
344_I	358_N	0.900	0.11
461_T	470_L	0.897	0.11
7_D	130_N	0.895	0.11
323_P	328_S	0.895	0.11
327_L	340_T	0.893	0.11
313_V	372_I	0.888	0.11
31_K	61_V	0.887	0.11
456_T	481_E	0.886	0.11
204_Y	210_R	0.885	0.11
170_T	191_E	0.884	0.11
91_S	119_K	0.882	0.11
252_V	276_Q	0.880	0.11
93_A	143_F	0.878	0.11
305_L	365_S	0.876	0.11
468_P	482_G	0.876	0.11
480_I	483_K	0.875	0.11
58_H	61_V	0.874	0.11
14_D	156_K	0.873	0.11
14_D	163_K	0.873	0.11
460_F	473_E	0.873	0.11
338_V	353_Q	0.870	0.11
192_S	201_P	0.869	0.11
3_V	98_S	0.866	0.11
475_Y	479_E	0.862	0.11
400_K	403_Q	0.860	0.11
12_E	116_S	0.857	0.11
340_T	367_W	0.857	0.11
94_Y	134_P	0.856	0.11
482_G	491_K	0.856	0.11
447_T	455_G	0.855	0.11
116_S	144_K	0.855	0.11
459_P	485_K	0.855	0.11
143_F	151_D	0.855	0.11
48_K	51_D	0.854	0.11
425_L	440_N	0.853	0.11
54_K	172_Y	0.851	0.11
460_F	472_K	0.849	0.11
134_P	202_I	0.846	0.11
466_S	472_K	0.846	0.11
432_P	449_A	0.845	0.11
441_L	457_R	0.844	0.11
241_I	248_L	0.842	0.11
455_G	459_P	0.842	0.11
454_D	471_N	0.841	0.11
479_E	486_A	0.838	0.11
180_Q	183_Q	0.837	0.11
458_K	479_E	0.837	0.11
472_K	484_V	0.832	0.11
166_E	170_T	0.831	0.11
128_N	145_D	0.831	0.11
268_E	350_E	0.828	0.11
70_L	78_L	0.828	0.11
57_Y	144_K	0.828	0.11
419_Y	441_L	0.827	0.11
4_F	46_S	0.826	0.11
462_G	473_E	0.826	0.11
247_K	255_P	0.825	0.11
454_D	462_G	0.825	0.11
484_V	493_V	0.822	0.11
35_K	93_A	0.821	0.11
323_P	355_D	0.817	0.10
144_K	202_I	0.817	0.10
436_V	449_A	0.816	0.10
116_S	120_K	0.815	0.10
128_N	202_I	0.814	0.10
484_V	491_K	0.813	0.10
473_E	483_K	0.812	0.10
78_L	89_K	0.810	0.10
120_K	133_L	0.809	0.10
144_K	159_D	0.809	0.10
243_E	255_P	0.808	0.10
474_K	484_V	0.808	0.10
37_V	85_L	0.806	0.10
461_T	473_E	0.806	0.10
303_V	310_K	0.805	0.10
115_M	215_H	0.803	0.10
7_D	25_S	0.803	0.10
5_E	8_S	0.801	0.10
105_A	146_K	0.800	0.10
487_K	491_K	0.800	0.10
186_F	190_Q	0.797	0.10
479_E	484_V	0.795	0.10
457_R	467_P	0.795	0.10
145_D	191_E	0.792	0.10
342_D	350_E	0.792	0.10
79_S	109_A	0.791	0.10
433_Y	438_S	0.791	0.10
457_R	460_F	0.788	0.10
4_F	13_A	0.787	0.10
149_S	152_D	0.786	0.10
337_P	349_E	0.783	0.10
105_A	144_K	0.782	0.10
116_S	143_F	0.780	0.10
322_D	326_T	0.776	0.10
466_S	480_I	0.772	0.10
454_D	459_P	0.772	0.10
5_E	67_W	0.771	0.10
449_A	453_P	0.770	0.10
91_S	94_Y	0.769	0.10
411_V	418_P	0.769	0.10
456_T	470_L	0.768	0.10
89_K	192_S	0.766	0.10
407_K	441_L	0.764	0.10
471_N	483_K	0.763	0.10
4_F	93_A	0.760	0.10
25_S	36_E	0.756	0.10
20_Y	54_K	0.755	0.10
28_V	120_K	0.754	0.10
21_K	102_H	0.753	0.10
99_F	165_D	0.753	0.10
435_V	457_R	0.753	0.10
477_A	492_D	0.753	0.10
8_S	51_D	0.751	0.10
483_K	493_V	0.750	0.10
454_D	458_K	0.749	0.10
328_S	340_T	0.749	0.10
475_Y	484_V	0.748	0.10
462_G	475_Y	0.745	0.10
478_Y	488_G	0.745	0.10
411_V	417_L	0.745	0.10
462_G	472_K	0.744	0.10
462_G	478_Y	0.742	0.10
316_I	349_E	0.740	0.10
170_T	188_K	0.739	0.10
252_V	286_Q	0.738	0.10
472_K	479_E	0.737	0.10
349_E	363_S	0.733	0.10
411_V	416_L	0.733	0.10
288_E	308_V	0.732	0.10
322_D	342_D	0.732	0.10
480_I	491_K	0.731	0.10
336_H	340_T	0.731	0.10
304_G	356_M	0.730	0.10
430_N	437_D	0.730	0.10
431_V	434_N	0.730	0.10
431_V	449_A	0.729	0.10
123_K	134_P	0.729	0.10
10_L	121_A	0.729	0.10
465_K	472_K	0.727	0.10
64_T	164_L	0.725	0.10
468_P	478_Y	0.724	0.10
469_W	472_K	0.723	0.10
64_T	179_E	0.722	0.10
481_E	484_V	0.720	0.10
467_P	478_Y	0.719	0.10
246_K	250_D	0.719	0.10
432_P	438_S	0.719	0.10
114_I	179_E	0.718	0.10
470_L	475_Y	0.718	0.10
417_L	420_N	0.717	0.09
146_K	151_D	0.717	0.09
434_N	449_A	0.717	0.09
14_D	23_L	0.714	0.09
472_K	487_K	0.714	0.09
411_V	415_D	0.713	0.09
95_I	143_F	0.710	0.09
84_T	163_K	0.708	0.09
467_P	484_V	0.708	0.09
420_N	424_K	0.706	0.09
486_A	493_V	0.704	0.09
295_W	326_T	0.703	0.09
14_D	108_Y	0.702	0.09
473_E	487_K	0.701	0.09
469_W	482_G	0.700	0.09
467_P	489_K	0.700	0.09
188_K	191_E	0.699	0.09
468_P	487_K	0.699	0.09
15_K	34_F	0.699	0.09
120_K	180_Q	0.696	0.09
453_P	458_K	0.696	0.09
361_A	369_T	0.695	0.09
145_D	188_K	0.694	0.09
270_L	354_K	0.692	0.09
169_K	191_E	0.692	0.09
247_K	264_K	0.691	0.09
385_A	388_I	0.689	0.09
121_A	143_F	0.688	0.09
42_D	48_K	0.687	0.09
460_F	464_K	0.687	0.09
449_A	456_T	0.686	0.09
129_I	149_S	0.685	0.09
15_K	158_I	0.684	0.09
22_E	121_A	0.684	0.09
470_L	487_K	0.681	0.09
363_S	381_G	0.679	0.09
45_F	221_I	0.678	0.09
95_I	159_D	0.677	0.09
459_P	462_G	0.676	0.09
472_K	491_K	0.675	0.09
454_D	460_F	0.675	0.09
101_E	107_A	0.675	0.09
20_Y	50_A	0.675	0.09
46_S	107_A	0.674	0.09
481_E	485_K	0.674	0.09
296_D	361_A	0.673	0.09
325_E	328_S	0.670	0.09
323_P	327_L	0.669	0.09
480_I	485_K	0.668	0.09
68_I	75_I	0.667	0.09
10_L	27_M	0.666	0.09
329_A	337_P	0.666	0.09
85_L	162_N	0.663	0.09
401_A	426_A	0.663	0.09
59_G	185_D	0.662	0.09
123_K	133_L	0.661	0.09
478_Y	493_V	0.660	0.09
78_L	88_A	0.659	0.09
456_T	459_P	0.655	0.09
486_A	490_V	0.655	0.09
12_E	93_A	0.654	0.09
421_P	449_A	0.654	0.09
27_M	68_I	0.654	0.09
237_K	240_E	0.653	0.09
484_V	489_K	0.653	0.09
194_G	198_N	0.652	0.09
60_H	161_L	0.651	0.09
465_K	473_E	0.650	0.09
81_M	92_D	0.650	0.09
303_V	374_S	0.649	0.09
279_V	286_Q	0.649	0.09
106_N	134_P	0.647	0.09
446_L	450_K	0.645	0.09
478_Y	490_V	0.644	0.09
23_L	27_M	0.643	0.09
478_Y	485_K	0.643	0.09
470_L	478_Y	0.642	0.09
14_D	152_D	0.639	0.09
337_P	353_Q	0.638	0.09
116_S	166_E	0.637	0.09
473_E	491_K	0.636	0.09
472_K	483_K	0.636	0.09
323_P	347_A	0.635	0.09
25_S	121_A	0.635	0.09
22_E	134_P	0.635	0.09
461_T	474_K	0.634	0.09
472_K	486_A	0.633	0.09
341_Y	346_A	0.633	0.09
304_G	350_E	0.633	0.09
471_N	474_K	0.632	0.09
462_G	479_E	0.631	0.09
146_K	174_E	0.631	0.09
93_A	123_K	0.628	0.09
481_E	493_V	0.627	0.09
477_A	491_K	0.627	0.09
37_V	116_S	0.625	0.09
322_D	354_K	0.624	0.09
458_K	473_E	0.624	0.09
251_G	261_I	0.624	0.09
375_V	381_G	0.623	0.09
486_A	489_K	0.623	0.09
126_L	129_I	0.623	0.09
462_G	477_A	0.623	0.09
118_Q	129_I	0.622	0.09
43_S	46_S	0.621	0.09
210_R	215_H	0.621	0.09
2_K	132_I	0.620	0.09
150_A	157_T	0.619	0.09
38_A	51_D	0.618	0.09
8_S	130_N	0.617	0.09
344_I	347_A	0.617	0.09
61_V	82_S	0.617	0.09
455_G	458_K	0.616	0.09
455_G	479_E	0.616	0.09
152_D	156_K	0.615	0.09
246_K	259_L	0.615	0.09
166_E	191_E	0.615	0.09
422_K	444_E	0.614	0.09
66_Q	121_A	0.612	0.09
435_V	442_K	0.611	0.09
466_S	484_V	0.610	0.09
84_T	143_F	0.610	0.09
46_S	97_E	0.608	0.09
289_G	306_Y	0.608	0.09
464_K	471_N	0.608	0.09
88_A	108_Y	0.607	0.08
460_F	479_E	0.606	0.08
441_L	445_L	0.599	0.08
295_W	302_G	0.597	0.08
106_N	133_L	0.596	0.08
35_K	144_K	0.596	0.08
43_S	74_K	0.595	0.08
366_R	375_V	0.595	0.08
72_D	76_A	0.594	0.08
342_D	347_A	0.593	0.08
456_T	469_W	0.591	0.08
384_G	388_I	0.591	0.08
31_K	70_L	0.590	0.08
94_Y	116_S	0.589	0.08
464_K	478_Y	0.589	0.08
304_G	346_A	0.588	0.08
476_D	487_K	0.587	0.08
166_E	202_I	0.587	0.08
108_Y	148_S	0.586	0.08
34_F	88_A	0.586	0.08
342_D	403_Q	0.586	0.08
91_S	106_N	0.585	0.08
352_Y	433_Y	0.584	0.08
468_P	488_G	0.584	0.08
42_D	176_E	0.583	0.08
472_K	478_Y	0.583	0.08
463_Q	474_K	0.582	0.08
12_E	66_Q	0.581	0.08
10_L	22_E	0.581	0.08
452_I	458_K	0.580	0.08
57_Y	113_S	0.579	0.08
468_P	481_E	0.578	0.08
467_P	477_A	0.578	0.08
259_L	278_A	0.577	0.08
471_N	478_Y	0.577	0.08
64_T	74_K	0.575	0.08
121_A	144_K	0.573	0.08
128_N	167_D	0.573	0.08
104_L	189_L	0.571	0.08
463_Q	469_W	0.571	0.08
461_T	487_K	0.570	0.08
469_W	473_E	0.570	0.08
35_K	95_I	0.569	0.08
108_Y	159_D	0.569	0.08
411_V	435_V	0.569	0.08
121_A	124_D	0.569	0.08
471_N	493_V	0.567	0.08
462_G	474_K	0.565	0.08
93_A	113_S	0.565	0.08
105_A	108_Y	0.565	0.08
95_I	121_A	0.564	0.08
474_K	482_G	0.561	0.08
468_P	486_A	0.560	0.08
61_V	78_L	0.558	0.08
96_E	110_K	0.557	0.08
22_E	60_H	0.557	0.08
74_K	186_F	0.557	0.08
382_T	387_A	0.555	0.08
66_Q	143_F	0.554	0.08
449_A	458_K	0.553	0.08
255_P	276_Q	0.553	0.08
51_D	190_Q	0.552	0.08
10_L	31_K	0.550	0.08
25_S	134_P	0.549	0.08
35_K	57_Y	0.549	0.08
144_K	191_E	0.548	0.08
466_S	474_K	0.547	0.08
310_K	356_M	0.546	0.08
457_R	463_Q	0.546	0.08
70_L	109_A	0.545	0.08
93_A	96_E	0.544	0.08
17_T	96_E	0.543	0.08
264_K	272_P	0.543	0.08
431_V	436_V	0.542	0.08
470_L	480_I	0.541	0.08
66_Q	95_I	0.541	0.08
457_R	488_G	0.540	0.08
3_V	103_E	0.540	0.08
474_K	491_K	0.539	0.08
57_Y	108_Y	0.539	0.08
478_Y	489_K	0.538	0.08
67_W	90_M	0.537	0.08
355_D	358_N	0.537	0.08
464_K	469_W	0.536	0.08
441_L	444_E	0.535	0.08
469_W	492_D	0.535	0.08
472_K	481_E	0.535	0.08
487_K	493_V	0.533	0.08
337_P	343_A	0.532	0.08
50_A	172_Y	0.531	0.08
327_L	336_H	0.530	0.08
299_K	310_K	0.529	0.08
21_K	143_F	0.528	0.08
270_L	365_S	0.527	0.08
93_A	166_E	0.525	0.08
292_E	295_W	0.525	0.08
33_A	51_D	0.525	0.08
151_D	158_I	0.525	0.08
463_Q	477_A	0.524	0.08
250_D	253_S	0.523	0.08
11_F	163_K	0.522	0.08
466_S	490_V	0.522	0.08
478_Y	482_G	0.521	0.08
21_K	156_K	0.521	0.08
37_V	128_N	0.521	0.08
359_G	363_S	0.520	0.08
458_K	484_V	0.520	0.08
129_I	138_F	0.518	0.08
447_T	457_R	0.517	0.08
170_T	222_E	0.516	0.08
436_V	439_Q	0.515	0.08
177_P	184_Q	0.512	0.08
404_A	408_I	0.510	0.08
57_Y	130_N	0.510	0.08
144_K	188_K	0.510	0.08
133_L	156_K	0.510	0.08
411_V	452_I	0.509	0.08
98_S	102_H	0.509	0.08
469_W	488_G	0.509	0.08
246_K	252_V	0.506	0.08
433_Y	456_T	0.506	0.08
435_V	447_T	0.502	0.08
452_I	456_T	0.502	0.08
14_D	31_K	0.502	0.08
222_E	226_E	0.502	0.08
87_D	114_I	0.501	0.08
159_D	162_N	0.501	0.08
472_K	489_K	0.501	0.08
43_S	64_T	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4uhqA	1	0.195	95.1	0.97	Contact Map
1fr2B	1	0.1917	95.1	0.97	Contact Map
3zfkA	1	0.1867	94.9	0.97	Contact Map
7ceiB	1	0.185	94	0.971	Contact Map
4qkoB	2	0.195	91.5	0.974	Contact Map
3kwoA	6	0.24	80.2	0.978	Contact Map
1jigA	6	0.2367	80	0.978	Contact Map
2chpA	6	0.24	79	0.978	Contact Map
2bk6A	6	0.2467	77.9	0.978	Contact Map
3iq1A	6	0.2517	76.5	0.978	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0137 seconds.