FADG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FADG - Uncharacterized protein FadG

UniProt:	O34320	Sequences: MDEMVLLTQEWLNETYKGKSGYNSIEENGKTGWKTMYALTRALQLELGITQTSDSFGPTTLRKLKELGPISTSTNSKKNIVKIIQGALYCKGYGPGGLTGTFGQGTKEAIAEMQLHMGLSKTDGVVTPKVFKALLNMDSYILLNGASEKVRSIQQWLNNKYYNRENFYFMPCDGLYSRDTQKSLVYAIQYEEGLSDSIANGNFGPTTQRLIPVLRIGETDEKNSFIHLFQAALIFNGYNVPFDGVYSESVRSKVKAFQSFAKLQQSGTADFQTWASLLVSTGDPNRKGVACDSITQITSDRAESLKRAGYKIVGRYLTNAPGSTLNKKIQPGELETILKSGLNVFPIYQTYGGATNYFNKEQGKKDAFAAYKAAKEYGFKNNTVIYFAVDYDAYGNDLNNNIIPHFEGINEIMNGFLGSTYKIGIYAPRNVCTIVSKKGLAFASFVSGMSTGFSGNLGYPLPYNWAFDQISTITVGNGSGMIEIDNDICSGLDNGVNTINIVPSENKKFFDQIDVLYETAEKYAQMQSDLNNGVKKTQLANELVAQYLRKDDYKGWKWVPTAGQIDPIYREWAVKR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	576 (511)
Sequences:	187 (143)
Seq/√Len:	6.3

BACSU - FADG YBFG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
395_G	434_I	4.118	0.95
441_A	464_N	4.095	0.95
41_R	54_D	3.888	0.94
230_Q	244_G	3.519	0.89
472_T	483_E	3.367	0.87
288_G	488_I	3.310	0.86
334_L	344_V	3.229	0.85
59_T	63_K	3.206	0.84
8_T	86_G	3.194	0.84
444_S	464_N	3.194	0.84
272_Q	283_D	3.189	0.84
147_S	234_I	3.095	0.82
151_R	155_Q	3.030	0.81
436_S	464_N	2.927	0.78
367_A	412_I	2.900	0.77
345_F	445_F	2.892	0.77
360_K	408_G	2.865	0.77
321_P	325_L	2.855	0.76
399_N	434_I	2.855	0.76
33_W	137_M	2.788	0.75
362_Q	367_A	2.787	0.74
357_Y	366_D	2.740	0.73
86_G	98_L	2.674	0.71
436_S	444_S	2.491	0.65
357_Y	362_Q	2.414	0.63
102_F	126_V	2.334	0.60
403_I	407_E	2.334	0.60
41_R	50_T	2.311	0.59
281_T	451_T	2.279	0.58
25_I	38_A	2.271	0.58
230_Q	243_D	2.245	0.57
83_I	135_L	2.205	0.56
230_Q	250_V	2.178	0.55
176_Y	181_Q	2.153	0.54
261_A	461_L	2.126	0.53
335_E	339_K	2.123	0.53
258_Q	273_T	2.121	0.52
52_T	99_T	2.114	0.52
131_F	135_L	2.096	0.52
428_P	459_Y	2.078	0.51
319_N	350_T	2.073	0.51
326_N	330_Q	2.065	0.50
367_A	408_G	2.055	0.50
383_T	496_V	2.020	0.49
371_Y	413_M	2.016	0.49
395_G	399_N	2.012	0.48
276_S	468_D	2.004	0.48
19_K	45_L	1.994	0.48
304_S	308_A	1.990	0.48
306_K	311_K	1.987	0.48
288_G	470_I	1.960	0.47
413_M	423_I	1.956	0.46
375_K	420_T	1.927	0.45
362_Q	366_D	1.914	0.45
285_N	306_K	1.895	0.44
318_T	373_A	1.893	0.44
69_P	114_Q	1.862	0.43
64_L	131_F	1.858	0.43
359_N	405_H	1.807	0.41
421_Y	464_N	1.800	0.41
36_M	140_Y	1.780	0.40
338_L	499_I	1.776	0.40
349_Q	453_F	1.765	0.40
472_T	484_I	1.763	0.40
181_Q	185_V	1.761	0.39
4_M	7_L	1.758	0.39
357_Y	467_F	1.750	0.39
194_L	206_T	1.726	0.38
16_Y	39_L	1.722	0.38
40_T	54_D	1.712	0.38
87_A	135_L	1.707	0.38
217_G	220_D	1.697	0.37
55_S	182_K	1.669	0.36
200_N	203_F	1.667	0.36
106_T	109_A	1.649	0.36
304_S	475_V	1.637	0.35
344_V	379_F	1.628	0.35
405_H	409_I	1.626	0.35
8_T	98_L	1.608	0.34
283_D	399_N	1.607	0.34
138_D	274_W	1.606	0.34
353_G	447_S	1.598	0.34
310_Y	467_F	1.595	0.34
296_Q	330_Q	1.594	0.34
298_T	334_L	1.593	0.34
128_P	131_F	1.585	0.34
293_S	487_D	1.575	0.33
156_W	167_F	1.562	0.33
142_L	183_S	1.561	0.33
42_A	83_I	1.547	0.32
25_I	199_A	1.544	0.32
55_S	59_T	1.542	0.32
359_N	409_I	1.542	0.32
53_S	167_F	1.529	0.32
329_I	332_G	1.516	0.31
403_I	440_L	1.516	0.31
433_T	437_K	1.514	0.31
38_A	464_N	1.507	0.31
50_T	54_D	1.500	0.31
147_S	175_L	1.498	0.31
327_K	349_Q	1.495	0.31
436_S	441_A	1.488	0.30
349_Q	447_S	1.485	0.30
32_G	35_T	1.475	0.30
11_W	22_Y	1.474	0.30
84_I	134_L	1.474	0.30
472_T	488_I	1.473	0.30
117_M	169_F	1.472	0.30
180_T	212_P	1.471	0.30
294_I	329_I	1.470	0.30
206_T	264_Q	1.463	0.30
68_G	448_G	1.460	0.30
291_C	337_I	1.458	0.30
267_G	283_D	1.451	0.29
161_Y	191_E	1.451	0.29
288_G	293_S	1.436	0.29
322_G	325_L	1.433	0.29
181_Q	235_F	1.421	0.28
93_Y	274_W	1.421	0.28
472_T	487_D	1.418	0.28
62_R	141_I	1.417	0.28
16_Y	46_E	1.411	0.28
281_T	461_L	1.411	0.28
320_A	328_K	1.411	0.28
352_G	384_V	1.402	0.28
398_L	431_V	1.402	0.28
19_K	52_T	1.386	0.27
28_N	343_N	1.383	0.27
288_G	482_I	1.383	0.27
382_N	427_A	1.378	0.27
394_Y	428_P	1.375	0.27
41_R	52_T	1.374	0.27
330_Q	377_Y	1.370	0.27
472_T	475_V	1.369	0.27
394_Y	459_Y	1.366	0.27
297_I	301_R	1.366	0.27
297_I	330_Q	1.358	0.27
425_I	474_T	1.357	0.27
310_Y	457_L	1.354	0.26
297_I	332_G	1.343	0.26
129_K	156_W	1.340	0.26
348_Y	490_S	1.339	0.26
288_G	472_T	1.336	0.26
6_L	27_E	1.333	0.26
49_I	87_A	1.330	0.26
195_S	198_I	1.328	0.26
258_Q	274_W	1.326	0.26
301_R	332_G	1.320	0.26
384_V	442_F	1.320	0.26
261_A	276_S	1.319	0.26
15_T	79_N	1.316	0.25
294_I	297_I	1.305	0.25
5_V	31_T	1.299	0.25
386_Y	457_L	1.296	0.25
52_T	59_T	1.290	0.25
89_Y	131_F	1.288	0.25
435_V	441_A	1.282	0.24
31_T	171_P	1.281	0.24
93_Y	116_H	1.280	0.24
129_K	167_F	1.273	0.24
295_T	472_T	1.259	0.24
117_M	234_I	1.255	0.24
23_N	41_R	1.254	0.24
386_Y	467_F	1.254	0.24
246_Y	269_A	1.253	0.24
279_V	470_I	1.252	0.24
434_I	438_K	1.249	0.24
5_V	32_G	1.247	0.24
231_A	234_I	1.243	0.23
297_I	329_I	1.234	0.23
273_T	393_A	1.232	0.23
406_F	435_V	1.229	0.23
233_L	468_D	1.227	0.23
69_P	135_L	1.227	0.23
203_F	393_A	1.223	0.23
275_A	284_P	1.217	0.23
41_R	53_S	1.217	0.23
397_D	400_N	1.204	0.22
21_G	50_T	1.200	0.22
352_G	391_Y	1.198	0.22
288_G	487_D	1.197	0.22
126_V	135_L	1.193	0.22
42_A	412_I	1.184	0.22
287_K	486_N	1.183	0.22
185_V	233_L	1.181	0.22
59_T	348_Y	1.180	0.22
302_A	342_L	1.178	0.22
94_G	106_T	1.178	0.22
250_V	418_G	1.174	0.22
329_I	377_Y	1.173	0.22
37_Y	137_M	1.170	0.22
476_G	484_I	1.169	0.22
153_I	402_I	1.168	0.22
50_T	121_K	1.166	0.22
274_W	284_P	1.161	0.21
380_K	472_T	1.161	0.21
206_T	210_L	1.161	0.21
251_R	255_K	1.157	0.21
353_G	453_F	1.157	0.21
28_N	65_K	1.155	0.21
37_Y	54_D	1.155	0.21
421_Y	487_D	1.146	0.21
171_P	454_S	1.129	0.21
128_P	290_A	1.129	0.21
425_I	439_G	1.127	0.21
177_S	180_T	1.125	0.21
88_L	177_S	1.124	0.20
293_S	488_I	1.123	0.20
12_L	22_Y	1.119	0.20
510_F	513_I	1.119	0.20
126_V	143_L	1.119	0.20
185_V	235_F	1.117	0.20
293_S	482_I	1.116	0.20
266_S	270_D	1.115	0.20
439_G	451_T	1.115	0.20
8_T	89_Y	1.113	0.20
64_L	128_P	1.109	0.20
217_G	269_A	1.109	0.20
395_G	438_K	1.107	0.20
212_P	225_F	1.107	0.20
176_Y	235_F	1.106	0.20
375_K	402_I	1.102	0.20
145_G	193_G	1.102	0.20
21_G	33_W	1.101	0.20
20_S	354_A	1.100	0.20
112_E	453_F	1.099	0.20
349_Q	353_G	1.099	0.20
150_V	245_V	1.096	0.20
464_N	484_I	1.088	0.20
119_L	169_F	1.087	0.20
310_Y	386_Y	1.081	0.19
288_G	486_N	1.079	0.19
348_Y	492_L	1.075	0.19
338_L	344_V	1.065	0.19
55_S	435_V	1.061	0.19
270_D	459_Y	1.061	0.19
15_T	309_G	1.058	0.19
402_I	440_L	1.057	0.19
12_L	35_T	1.054	0.19
350_T	482_I	1.054	0.19
108_E	250_V	1.051	0.19
308_A	340_S	1.049	0.19
22_Y	25_I	1.049	0.19
408_G	412_I	1.047	0.19
348_Y	362_Q	1.045	0.19
168_Y	212_P	1.042	0.19
100_G	246_Y	1.042	0.19
4_M	89_Y	1.042	0.19
348_Y	405_H	1.042	0.19
123_D	127_T	1.041	0.19
423_I	441_A	1.039	0.19
472_T	482_I	1.037	0.18
93_Y	258_Q	1.035	0.18
58_P	435_V	1.035	0.18
294_I	332_G	1.034	0.18
448_G	468_D	1.025	0.18
294_I	472_T	1.021	0.18
475_V	484_I	1.018	0.18
109_A	351_Y	1.009	0.18
85_Q	100_G	1.008	0.18
430_N	455_G	1.008	0.18
13_N	29_G	0.999	0.18
290_A	489_C	0.997	0.18
423_I	492_L	0.993	0.18
12_L	175_L	0.991	0.18
119_L	122_T	0.990	0.17
50_T	75_N	0.985	0.17
203_F	211_I	0.984	0.17
127_T	409_I	0.983	0.17
398_L	434_I	0.981	0.17
294_I	483_E	0.979	0.17
318_T	468_D	0.979	0.17
288_G	461_L	0.977	0.17
409_I	413_M	0.975	0.17
366_D	467_F	0.973	0.17
291_C	482_I	0.970	0.17
252_S	283_D	0.970	0.17
328_K	377_Y	0.970	0.17
228_L	301_R	0.968	0.17
258_Q	406_F	0.967	0.17
50_T	63_K	0.966	0.17
206_T	270_D	0.959	0.17
293_S	472_T	0.958	0.17
194_L	210_L	0.957	0.17
301_R	493_D	0.957	0.17
97_G	106_T	0.957	0.17
117_M	231_A	0.956	0.17
274_W	470_I	0.955	0.17
52_T	105_G	0.951	0.17
4_M	42_A	0.950	0.17
6_L	405_H	0.949	0.17
153_I	235_F	0.945	0.17
55_S	152_S	0.941	0.16
40_T	55_S	0.940	0.16
151_R	200_N	0.938	0.16
131_F	418_G	0.937	0.16
185_V	448_G	0.936	0.16
294_I	330_Q	0.936	0.16
11_W	35_T	0.935	0.16
383_T	493_D	0.935	0.16
450_S	454_S	0.934	0.16
345_F	349_Q	0.934	0.16
41_R	51_Q	0.933	0.16
109_A	112_E	0.932	0.16
318_T	350_T	0.932	0.16
18_G	24_S	0.929	0.16
454_S	457_L	0.928	0.16
39_L	43_L	0.926	0.16
283_D	393_A	0.925	0.16
302_A	466_A	0.925	0.16
119_L	141_I	0.922	0.16
304_S	373_A	0.920	0.16
228_L	393_A	0.918	0.16
24_S	354_A	0.914	0.16
171_P	458_G	0.913	0.16
276_S	488_I	0.913	0.16
98_L	103_G	0.913	0.16
376_E	386_Y	0.912	0.16
297_I	302_A	0.907	0.16
129_K	138_D	0.906	0.16
273_T	346_P	0.904	0.16
144_N	237_G	0.904	0.16
321_P	326_N	0.904	0.16
384_V	443_A	0.901	0.16
229_F	235_F	0.899	0.16
96_G	115_L	0.898	0.16
150_V	287_K	0.892	0.16
172_C	308_A	0.892	0.16
379_F	484_I	0.891	0.15
472_T	476_G	0.890	0.15
93_Y	276_S	0.889	0.15
288_G	300_D	0.888	0.15
102_F	371_Y	0.885	0.15
353_G	357_Y	0.885	0.15
140_Y	181_Q	0.882	0.15
116_H	208_Q	0.882	0.15
272_Q	411_E	0.881	0.15
444_S	487_D	0.880	0.15
180_T	233_L	0.878	0.15
245_V	248_E	0.877	0.15
97_G	340_S	0.877	0.15
8_T	12_L	0.877	0.15
9_Q	13_N	0.876	0.15
9_Q	29_G	0.876	0.15
66_E	130_V	0.876	0.15
33_W	87_A	0.876	0.15
310_Y	486_N	0.873	0.15
445_F	487_D	0.873	0.15
364_K	367_A	0.865	0.15
332_G	353_G	0.864	0.15
319_N	366_D	0.864	0.15
110_I	368_F	0.862	0.15
304_S	478_G	0.862	0.15
89_Y	405_H	0.862	0.15
454_S	458_G	0.860	0.15
6_L	409_I	0.857	0.15
37_Y	40_T	0.856	0.15
138_D	470_I	0.856	0.15
261_A	470_I	0.855	0.15
89_Y	128_P	0.853	0.15
136_N	176_Y	0.852	0.15
294_I	325_L	0.852	0.15
114_Q	124_G	0.851	0.15
346_P	493_D	0.843	0.15
325_L	377_Y	0.842	0.15
242_F	317_L	0.842	0.15
206_T	266_S	0.841	0.15
180_T	235_F	0.840	0.15
312_I	343_N	0.839	0.15
180_T	229_F	0.838	0.15
36_M	40_T	0.836	0.14
425_I	451_T	0.835	0.14
332_G	336_T	0.834	0.14
42_A	54_D	0.832	0.14
294_I	320_A	0.829	0.14
218_E	221_E	0.829	0.14
94_G	105_G	0.827	0.14
428_P	453_F	0.826	0.14
227_H	305_L	0.818	0.14
28_N	66_E	0.818	0.14
180_T	231_A	0.818	0.14
129_K	140_Y	0.818	0.14
393_A	403_I	0.817	0.14
258_Q	276_S	0.815	0.14
313_V	326_N	0.815	0.14
318_T	369_A	0.815	0.14
304_S	340_S	0.814	0.14
281_T	288_G	0.814	0.14
200_N	271_F	0.813	0.14
36_M	470_I	0.810	0.14
33_W	49_I	0.808	0.14
41_R	382_N	0.806	0.14
4_M	359_N	0.804	0.14
45_L	52_T	0.803	0.14
8_T	36_M	0.803	0.14
53_S	246_Y	0.802	0.14
281_T	448_G	0.800	0.14
51_Q	54_D	0.799	0.14
24_S	109_A	0.795	0.14
117_M	212_P	0.795	0.14
476_G	480_G	0.794	0.14
95_P	180_T	0.794	0.14
396_N	400_N	0.793	0.14
274_W	301_R	0.791	0.14
176_Y	188_I	0.790	0.14
295_T	352_G	0.788	0.14
301_R	329_I	0.788	0.14
28_N	34_K	0.788	0.14
409_I	492_L	0.787	0.14
232_A	310_Y	0.786	0.14
157_L	191_E	0.786	0.14
2_D	9_Q	0.786	0.14
136_N	274_W	0.786	0.14
107_K	114_Q	0.785	0.14
511_D	515_V	0.785	0.14
332_G	377_Y	0.783	0.14
313_V	337_I	0.783	0.14
126_V	131_F	0.781	0.14
42_A	98_L	0.781	0.14
298_T	337_I	0.779	0.13
150_V	397_D	0.779	0.13
28_N	213_V	0.775	0.13
82_K	200_N	0.775	0.13
346_P	383_T	0.774	0.13
166_N	196_D	0.774	0.13
54_D	382_N	0.773	0.13
100_G	191_E	0.772	0.13
402_I	517_Y	0.769	0.13
430_N	454_S	0.768	0.13
409_I	496_V	0.764	0.13
302_A	391_Y	0.764	0.13
186_Y	373_A	0.763	0.13
382_N	487_D	0.762	0.13
276_S	423_I	0.760	0.13
349_Q	451_T	0.760	0.13
182_K	409_I	0.760	0.13
243_D	253_K	0.759	0.13
365_K	369_A	0.759	0.13
136_N	143_L	0.758	0.13
69_P	168_Y	0.756	0.13
7_L	97_G	0.756	0.13
138_D	279_V	0.756	0.13
129_K	246_Y	0.756	0.13
296_Q	332_G	0.755	0.13
319_N	476_G	0.754	0.13
246_Y	477_N	0.753	0.13
39_L	46_E	0.752	0.13
64_L	84_I	0.750	0.13
295_T	483_E	0.750	0.13
133_A	142_L	0.745	0.13
289_V	411_E	0.745	0.13
41_R	96_G	0.744	0.13
84_I	245_V	0.744	0.13
10_E	19_K	0.743	0.13
395_G	398_L	0.740	0.13
272_Q	310_Y	0.740	0.13
281_T	470_I	0.740	0.13
5_V	90_C	0.738	0.13
194_L	199_A	0.738	0.13
423_I	439_G	0.737	0.13
284_P	402_I	0.737	0.13
302_A	340_S	0.737	0.13
461_L	470_I	0.737	0.13
211_I	258_Q	0.736	0.13
186_Y	296_Q	0.736	0.13
4_M	8_T	0.734	0.13
367_A	431_V	0.733	0.13
288_G	484_I	0.732	0.13
89_Y	470_I	0.731	0.13
393_A	496_V	0.729	0.13
84_I	113_M	0.728	0.13
391_Y	394_Y	0.728	0.13
132_K	138_D	0.728	0.13
182_K	192_E	0.725	0.13
126_V	499_I	0.724	0.13
437_K	467_F	0.722	0.13
332_G	447_S	0.721	0.13
156_W	160_K	0.719	0.12
194_L	198_I	0.716	0.12
148_E	163_N	0.713	0.12
352_G	473_I	0.711	0.12
171_P	385_I	0.707	0.12
355_T	473_I	0.706	0.12
350_T	472_T	0.705	0.12
299_S	340_S	0.705	0.12
360_K	372_K	0.704	0.12
153_I	231_A	0.703	0.12
156_W	159_N	0.703	0.12
259_S	397_D	0.702	0.12
250_V	255_K	0.699	0.12
250_V	357_Y	0.698	0.12
6_L	25_I	0.697	0.12
191_E	232_A	0.697	0.12
175_L	228_L	0.696	0.12
34_K	246_Y	0.696	0.12
15_T	359_N	0.695	0.12
306_K	439_G	0.695	0.12
509_F	512_Q	0.694	0.12
234_I	266_S	0.694	0.12
266_S	501_I	0.694	0.12
83_I	310_Y	0.694	0.12
127_T	131_F	0.694	0.12
260_F	493_D	0.694	0.12
403_I	435_V	0.690	0.12
96_G	290_A	0.690	0.12
470_I	488_I	0.689	0.12
329_I	453_F	0.689	0.12
65_K	128_P	0.688	0.12
110_I	300_D	0.688	0.12
143_L	427_A	0.688	0.12
294_I	377_Y	0.687	0.12
459_Y	513_I	0.686	0.12
212_P	243_D	0.686	0.12
96_G	283_D	0.685	0.12
223_N	270_D	0.685	0.12
31_T	90_C	0.684	0.12
155_Q	318_T	0.679	0.12
423_I	468_D	0.678	0.12
73_S	131_F	0.675	0.12
439_G	490_S	0.674	0.12
5_V	9_Q	0.674	0.12
480_G	484_I	0.674	0.12
87_A	283_D	0.673	0.12
498_T	502_V	0.672	0.12
203_F	258_Q	0.672	0.12
212_P	230_Q	0.671	0.12
382_N	425_I	0.670	0.12
233_L	366_D	0.665	0.12
93_Y	391_Y	0.664	0.12
473_I	483_E	0.664	0.12
307_R	362_Q	0.664	0.12
194_L	200_N	0.662	0.12
25_I	185_V	0.660	0.12
259_S	399_N	0.659	0.12
45_L	402_I	0.659	0.12
190_Y	492_L	0.659	0.12
395_G	437_K	0.658	0.12
83_I	87_A	0.656	0.12
222_K	425_I	0.656	0.12
258_Q	393_A	0.655	0.12
99_T	105_G	0.654	0.11
220_D	260_F	0.653	0.11
10_E	27_E	0.652	0.11
12_L	140_Y	0.652	0.11
192_E	210_L	0.651	0.11
371_Y	468_D	0.646	0.11
483_E	488_I	0.646	0.11
439_G	468_D	0.645	0.11
65_K	69_P	0.645	0.11
35_T	358_F	0.644	0.11
248_E	479_S	0.643	0.11
138_D	275_A	0.643	0.11
398_L	425_I	0.642	0.11
231_A	271_F	0.641	0.11
110_I	505_E	0.640	0.11
156_W	223_N	0.640	0.11
274_W	461_L	0.639	0.11
97_G	283_D	0.638	0.11
229_F	448_G	0.636	0.11
379_F	431_V	0.634	0.11
8_T	181_Q	0.634	0.11
28_N	101_T	0.634	0.11
253_K	423_I	0.633	0.11
297_I	353_G	0.632	0.11
473_I	486_N	0.632	0.11
297_I	320_A	0.632	0.11
391_Y	397_D	0.631	0.11
87_A	408_G	0.631	0.11
64_L	168_Y	0.630	0.11
99_T	281_T	0.629	0.11
32_G	90_C	0.628	0.11
224_S	244_G	0.627	0.11
26_E	34_K	0.626	0.11
396_N	459_Y	0.625	0.11
319_N	348_Y	0.623	0.11
326_N	358_F	0.622	0.11
432_C	495_G	0.621	0.11
291_C	453_F	0.620	0.11
364_K	368_F	0.619	0.11
84_I	289_V	0.618	0.11
288_G	483_E	0.618	0.11
114_Q	135_L	0.617	0.11
236_N	254_V	0.617	0.11
67_L	84_I	0.616	0.11
40_T	126_V	0.615	0.11
8_T	63_K	0.615	0.11
102_F	110_I	0.615	0.11
100_G	302_A	0.615	0.11
177_S	470_I	0.614	0.11
379_F	496_V	0.612	0.11
130_V	135_L	0.611	0.11
8_T	129_K	0.610	0.11
366_D	386_Y	0.609	0.11
185_V	373_A	0.608	0.11
93_Y	261_A	0.608	0.11
298_T	330_Q	0.605	0.11
318_T	490_S	0.602	0.11
334_L	338_L	0.602	0.11
208_Q	275_A	0.602	0.11
234_I	244_G	0.602	0.11
143_L	175_L	0.601	0.11
181_Q	448_G	0.601	0.11
217_G	487_D	0.600	0.11
217_G	221_E	0.600	0.11
74_T	136_N	0.600	0.11
448_G	509_F	0.600	0.11
88_L	203_F	0.600	0.11
312_I	489_C	0.600	0.11
256_A	266_S	0.598	0.11
15_T	22_Y	0.598	0.11
120_S	269_A	0.597	0.11
266_S	367_A	0.596	0.11
423_I	490_S	0.596	0.11
230_Q	234_I	0.596	0.11
255_K	500_N	0.596	0.11
352_G	409_I	0.596	0.11
159_N	227_H	0.595	0.11
38_A	151_R	0.594	0.11
338_L	473_I	0.594	0.11
183_S	226_I	0.594	0.11
8_T	180_T	0.591	0.11
321_P	470_I	0.590	0.11
49_I	56_F	0.590	0.11
63_K	66_E	0.587	0.11
53_S	102_F	0.587	0.11
77_K	126_V	0.583	0.10
319_N	325_L	0.582	0.10
101_T	107_K	0.582	0.10
427_A	493_D	0.582	0.10
95_P	98_L	0.582	0.10
506_N	510_F	0.582	0.10
356_N	444_S	0.581	0.10
12_L	448_G	0.580	0.10
123_D	399_N	0.580	0.10
312_I	494_N	0.578	0.10
64_L	89_Y	0.577	0.10
391_Y	396_N	0.577	0.10
297_I	482_I	0.577	0.10
407_E	435_V	0.575	0.10
137_M	178_R	0.575	0.10
149_K	248_E	0.575	0.10
504_S	513_I	0.574	0.10
58_P	62_R	0.573	0.10
84_I	397_D	0.573	0.10
115_L	148_E	0.573	0.10
50_T	252_S	0.570	0.10
33_W	178_R	0.570	0.10
169_F	289_V	0.570	0.10
398_L	428_P	0.569	0.10
52_T	192_E	0.567	0.10
129_K	187_A	0.565	0.10
54_D	59_T	0.564	0.10
275_A	350_T	0.562	0.10
212_P	229_F	0.562	0.10
14_E	150_V	0.562	0.10
4_M	98_L	0.562	0.10
140_Y	188_I	0.562	0.10
200_N	206_T	0.562	0.10
428_P	472_T	0.562	0.10
276_S	350_T	0.561	0.10
290_A	466_A	0.561	0.10
24_S	102_F	0.560	0.10
95_P	109_A	0.560	0.10
471_S	486_N	0.560	0.10
97_G	122_T	0.559	0.10
190_Y	231_A	0.559	0.10
394_Y	509_F	0.559	0.10
323_S	348_Y	0.558	0.10
234_I	242_F	0.557	0.10
65_K	224_S	0.556	0.10
79_N	405_H	0.556	0.10
156_W	271_F	0.554	0.10
352_G	357_Y	0.553	0.10
324_T	504_S	0.552	0.10
223_N	251_R	0.552	0.10
234_I	414_N	0.552	0.10
115_L	367_A	0.551	0.10
166_N	190_Y	0.550	0.10
194_L	246_Y	0.550	0.10
67_L	199_A	0.550	0.10
208_Q	228_L	0.550	0.10
293_S	313_V	0.550	0.10
203_F	273_T	0.549	0.10
58_P	310_Y	0.548	0.10
117_M	225_F	0.548	0.10
93_Y	138_D	0.548	0.10
8_T	177_S	0.547	0.10
107_K	111_A	0.547	0.10
140_Y	470_I	0.546	0.10
440_L	502_V	0.546	0.10
6_L	10_E	0.545	0.10
113_M	196_D	0.545	0.10
357_Y	473_I	0.544	0.10
317_L	446_V	0.543	0.10
87_A	170_M	0.541	0.10
228_L	275_A	0.541	0.10
343_N	495_G	0.540	0.10
373_A	381_N	0.539	0.10
7_L	14_E	0.538	0.10
31_T	141_I	0.538	0.10
444_S	466_A	0.537	0.10
203_F	246_Y	0.536	0.10
40_T	406_F	0.536	0.10
380_K	459_Y	0.536	0.10
211_I	235_F	0.536	0.10
476_G	482_I	0.536	0.10
230_Q	397_D	0.534	0.10
10_E	97_G	0.534	0.10
88_L	229_F	0.534	0.10
102_F	109_A	0.533	0.10
306_K	438_K	0.533	0.10
236_N	449_M	0.532	0.10
190_Y	229_F	0.531	0.10
239_N	306_K	0.531	0.10
346_P	449_M	0.530	0.10
322_G	326_N	0.530	0.10
283_D	367_A	0.529	0.10
274_W	279_V	0.527	0.10
64_L	102_F	0.526	0.10
452_G	458_G	0.526	0.10
171_P	457_L	0.526	0.10
139_S	482_I	0.526	0.10
283_D	369_A	0.526	0.10
319_N	355_T	0.523	0.10
297_I	321_P	0.523	0.10
319_N	330_Q	0.522	0.10
233_L	276_S	0.522	0.10
19_K	423_I	0.521	0.10
232_A	393_A	0.521	0.10
388_A	457_L	0.520	0.10
273_T	406_F	0.520	0.10
40_T	115_L	0.519	0.10
402_I	413_M	0.518	0.10
177_S	461_L	0.517	0.10
200_N	495_G	0.517	0.10
319_N	329_I	0.515	0.10
382_N	445_F	0.515	0.10
259_S	421_Y	0.515	0.10
229_F	270_D	0.514	0.10
366_D	428_P	0.514	0.10
243_D	252_S	0.513	0.10
430_N	459_Y	0.513	0.10
267_G	273_T	0.513	0.10
107_K	266_S	0.512	0.10
88_L	153_I	0.511	0.10
254_V	358_F	0.511	0.10
108_E	300_D	0.510	0.10
360_K	367_A	0.508	0.09
357_Y	425_I	0.508	0.09
433_T	444_S	0.508	0.09
113_M	356_N	0.507	0.09
63_K	153_I	0.507	0.09
97_G	103_G	0.506	0.09
279_V	488_I	0.506	0.09
82_K	100_G	0.506	0.09
137_M	398_L	0.506	0.09
167_F	231_A	0.505	0.09
19_K	59_T	0.505	0.09
263_L	487_D	0.504	0.09
45_L	105_G	0.504	0.09
85_Q	448_G	0.504	0.09
468_D	490_S	0.502	0.09
87_A	139_S	0.501	0.09
319_N	486_N	0.501	0.09
86_G	95_P	0.500	0.09
113_M	135_L	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4pmoA	1	0.3507	100	0.766	Contact Map
1sfsA	1	0.3385	100	0.858	Contact Map
4nsoA	1	0.2465	98.2	0.963	Contact Map
4lpqA	1	0.2917	98.1	0.964	Contact Map
4xxtA	1	0.3229	97.9	0.965	Contact Map
4fetB	1	0.1736	97.9	0.966	Contact Map
1lbuA	1	0.3507	97.7	0.967	Contact Map
4g54A	1	0.2969	97.4	0.969	Contact Map
3bkhA	1	0.3698	97.4	0.969	Contact Map
5bmqA	3	0.3333	97	0.971	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0137 seconds.