FADN - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FADN - Probable 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase

UniProt:	O32178	Sequences: MHKHIRKAAVLGSGVMGSGIAAHLANIGIPVLLLDIVPNDLTKEEEKKGLTKDSSEVRSRLSRQAMKKLLKQKPAPLTSAKNTSYITPGNLEDDAEKLKEADWIIEVVVENLEVKKKIFALVDEHRKTGSIVSSNTSGISVQEMAEGRSDDFKAHFLGTHFFNPARYLKLLEIIPIKETDPDILKFMTAFGENVLGKGVVTAKDTPNFIANRIGTYGLLVTVQEMLKGGYQVGEVDSITGPLIGRPKSATFRTLDVVGLDTFAHVARNVYDKADGDEKEVFRIPSFMNDMLEKGWIGSKAGQGFYKKEGKTIYELDPVTLTYGERTKMKSPALEAAKQAKGTKAKMKALIYSDDRAGRLLWNITSQTLLYSAELLGEIADDIHAIDQAMKWGFGWELGPFEMWDAIGLKQSAEKLEQLGADMPGWIKEMLDKGNETFYIKENGTVFYYDRGEYRAVKENKKRIHLQALKETKGVIAKNSGASLIDLGDDVALLEFHSKSNAIGLDIIQMIHKGLEETERNYKGLVIGNQGKNFCVGANLAMILMEVQDDNFLEVDFVIRRFQETMMKIKYSAKPVVAAPFGMTLGGGTEACLPAARIQAASEAYMGLVESGVGLIPGGGGNKELYINHLRRGHDPMNAAMKTFETIAMAKVSASAQEAREMNILKETDQISVNQDHLLYDAKQLAASLYDTGWRPPVKEKVKVPGETGYAALLLGAEQMKLSGYISEHDFKIAKKLAYVIAGGKVPFGTEVDEEYLLEIEREAFLSLSGEAKSQARMQHMLVKGKPLRN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	789 (771)
Sequences:	763 (496)
Seq/√Len:	17.8

BACSU - FADN
HALSA - Q9HQ61
SULSO - Q97VU5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
316_D	323_G	5.628	1.00
416_E	427_K	5.523	1.00
153_K	178_E	4.974	1.00
577_A	594_A	4.917	1.00
493_L	510_I	4.778	1.00
754_E	758_E	4.456	1.00
535_V	582_M	4.279	1.00
523_G	685_A	4.266	1.00
154_A	180_D	4.260	1.00
108_V	114_V	4.020	1.00
11_L	91_L	3.984	1.00
104_I	126_R	3.974	1.00
615_I	736_L	3.955	1.00
482_S	496_H	3.932	1.00
94_D	97_K	3.837	1.00
559_R	563_E	3.827	1.00
490_V	685_A	3.756	1.00
598_Q	671_S	3.705	1.00
671_S	680_D	3.650	1.00
728_H	770_E	3.545	1.00
515_E	567_K	3.538	1.00
296_I	300_A	3.443	1.00
79_S	660_E	3.149	0.99
87_T	97_K	3.110	0.99
596_R	684_L	3.100	0.99
158_G	174_I	3.074	0.99
409_K	435_E	3.020	0.99
52_K	57_V	3.013	0.99
11_L	122_V	2.964	0.99
361_W	414_K	2.956	0.99
126_R	155_H	2.886	0.98
381_D	384_A	2.869	0.98
491_A	521_Y	2.841	0.98
248_S	253_T	2.814	0.98
598_Q	680_D	2.808	0.98
309_G	313_Y	2.802	0.98
516_E	520_N	2.781	0.98
542_I	768_S	2.741	0.98
693_W	696_P	2.708	0.98
289_D	293_K	2.698	0.98
577_A	591_C	2.688	0.98
779_H	783_K	2.673	0.97
310_K	313_Y	2.615	0.97
57_V	60_R	2.606	0.97
728_H	731_K	2.581	0.97
267_R	271_D	2.578	0.97
230_Y	355_R	2.517	0.96
648_M	725_I	2.488	0.96
475_I	491_A	2.475	0.96
69_L	72_Q	2.456	0.96
720_K	727_E	2.432	0.95
97_K	100_E	2.362	0.95
95_A	121_L	2.344	0.94
8_A	24_L	2.338	0.94
129_G	155_H	2.332	0.94
32_L	97_K	2.301	0.94
224_E	227_K	2.277	0.94
376_G	385_I	2.259	0.93
600_A	674_Q	2.259	0.93
701_V	705_G	2.249	0.93
475_I	521_Y	2.210	0.92
77_L	86_I	2.200	0.92
189_A	193_N	2.181	0.92
27_I	672_V	2.175	0.92
474_V	477_K	2.175	0.92
239_T	250_T	2.165	0.92
705_G	708_G	2.160	0.92
476_A	512_K	2.146	0.91
249_A	253_T	2.145	0.91
52_K	60_R	2.138	0.91
91_L	95_A	2.136	0.91
716_A	730_F	2.098	0.90
352_S	357_G	2.095	0.90
480_G	505_D	2.068	0.90
53_D	57_V	2.067	0.90
82_N	85_Y	2.047	0.89
302_Q	306_K	2.029	0.89
103_W	133_S	2.026	0.89
108_V	118_I	2.025	0.89
433_G	438_Y	2.015	0.88
634_D	638_A	2.010	0.88
34_L	89_G	2.003	0.88
198_G	391_W	1.997	0.88
117_K	120_A	1.992	0.88
762_E	766_S	1.975	0.87
720_K	730_F	1.973	0.87
30_P	85_Y	1.968	0.87
54_S	58_R	1.967	0.87
309_G	312_I	1.967	0.87
766_S	769_G	1.966	0.87
13_S	107_V	1.935	0.86
497_S	535_V	1.935	0.86
123_D	149_S	1.930	0.86
361_W	365_S	1.930	0.86
413_E	417_Q	1.930	0.86
234_E	355_R	1.924	0.86
735_K	766_S	1.914	0.86
168_L	394_G	1.913	0.86
489_D	689_Y	1.908	0.85
499_S	535_V	1.904	0.85
192_E	676_H	1.903	0.85
118_I	121_L	1.901	0.85
569_K	623_E	1.900	0.85
424_G	428_E	1.896	0.85
526_I	568_I	1.895	0.85
555_D	559_R	1.893	0.85
634_D	637_N	1.878	0.85
568_I	595_A	1.874	0.84
238_I	359_L	1.867	0.84
52_K	58_R	1.861	0.84
230_Y	359_L	1.859	0.84
41_L	60_R	1.858	0.84
254_L	262_F	1.841	0.83
150_D	153_K	1.837	0.83
91_L	122_V	1.832	0.83
488_D	682_K	1.803	0.82
119_F	144_M	1.802	0.82
643_F	646_I	1.791	0.82
409_K	413_E	1.787	0.81
7_K	100_E	1.779	0.81
501_A	535_V	1.778	0.81
517_T	573_K	1.778	0.81
766_S	770_E	1.774	0.81
487_G	682_K	1.762	0.80
598_Q	669_Q	1.755	0.80
390_K	401_E	1.734	0.79
56_E	60_R	1.731	0.79
41_L	52_K	1.702	0.78
514_L	526_I	1.701	0.78
54_S	60_R	1.698	0.78
731_K	770_E	1.694	0.78
9_A	98_L	1.692	0.78
779_H	787_L	1.691	0.78
365_S	420_A	1.686	0.77
120_A	148_R	1.686	0.77
595_A	693_W	1.681	0.77
310_K	314_E	1.678	0.77
490_V	523_G	1.677	0.77
78_T	601_S	1.677	0.77
142_Q	177_K	1.664	0.76
133_S	157_L	1.650	0.76
332_A	352_S	1.645	0.76
263_A	291_L	1.641	0.75
143_E	146_E	1.641	0.75
37_V	58_R	1.626	0.75
406_I	411_S	1.623	0.75
127_K	130_S	1.620	0.74
256_V	394_G	1.618	0.74
40_D	57_V	1.614	0.74
561_F	618_G	1.613	0.74
38_P	41_L	1.612	0.74
117_K	121_L	1.611	0.74
227_K	362_N	1.610	0.74
433_G	437_F	1.601	0.73
9_A	101_A	1.594	0.73
408_L	430_L	1.592	0.73
569_K	622_K	1.585	0.73
295_W	302_Q	1.583	0.73
126_R	130_S	1.567	0.72
123_D	148_R	1.560	0.71
726_S	729_D	1.542	0.71
656_Q	659_R	1.527	0.70
132_V	152_F	1.521	0.69
369_L	422_M	1.511	0.69
23_H	26_N	1.511	0.69
134_S	141_V	1.510	0.69
434_N	439_I	1.505	0.69
294_G	300_A	1.505	0.69
591_C	594_A	1.500	0.68
522_K	690_D	1.500	0.68
53_D	60_R	1.499	0.68
82_N	656_Q	1.493	0.68
225_M	251_F	1.469	0.67
15_V	261_T	1.468	0.67
652_S	658_A	1.456	0.66
238_I	360_L	1.454	0.66
615_I	763_A	1.453	0.66
95_A	118_I	1.445	0.65
123_D	152_F	1.445	0.65
569_K	626_I	1.442	0.65
527_G	678_L	1.431	0.65
669_Q	684_L	1.430	0.65
542_I	617_G	1.428	0.64
599_A	664_L	1.423	0.64
414_K	418_L	1.421	0.64
59_S	62_S	1.413	0.64
558_I	765_L	1.410	0.63
346_M	402_M	1.408	0.63
500_N	528_N	1.407	0.63
642_T	646_I	1.393	0.62
216_Y	366_Q	1.389	0.62
727_E	772_K	1.375	0.61
518_E	572_A	1.373	0.61
610_S	736_L	1.370	0.61
210_A	379_A	1.367	0.61
69_L	73_K	1.354	0.60
288_N	292_E	1.354	0.60
142_Q	176_I	1.353	0.60
682_K	686_A	1.353	0.60
465_L	529_Q	1.350	0.60
104_I	155_H	1.348	0.60
60_R	64_Q	1.347	0.60
477_K	496_H	1.346	0.60
440_K	470_E	1.343	0.60
599_A	655_A	1.341	0.59
59_S	69_L	1.338	0.59
495_F	528_N	1.336	0.59
97_K	127_K	1.332	0.59
439_I	442_N	1.331	0.59
703_V	706_E	1.331	0.59
256_V	298_S	1.329	0.59
545_E	550_N	1.328	0.59
339_A	344_A	1.327	0.59
706_E	744_K	1.327	0.59
580_F	677_L	1.326	0.59
645_T	661_M	1.318	0.58
243_I	360_L	1.317	0.58
147_G	152_F	1.317	0.58
54_S	57_V	1.317	0.58
104_I	125_H	1.307	0.57
522_K	689_Y	1.301	0.57
565_M	590_A	1.299	0.57
495_F	500_N	1.297	0.57
623_E	626_I	1.295	0.57
248_S	393_F	1.294	0.57
645_T	663_I	1.292	0.56
387_Q	390_K	1.291	0.56
55_S	59_S	1.289	0.56
132_V	148_R	1.288	0.56
126_R	129_G	1.281	0.56
623_E	627_N	1.279	0.56
622_K	626_I	1.277	0.56
148_R	152_F	1.276	0.56
213_I	371_S	1.270	0.55
341_G	344_A	1.268	0.55
78_T	672_V	1.266	0.55
171_L	191_G	1.262	0.55
636_M	640_M	1.258	0.54
116_K	147_G	1.256	0.54
713_L	734_K	1.252	0.54
412_A	415_L	1.251	0.54
372_A	423_P	1.242	0.53
104_I	122_V	1.239	0.53
491_A	517_T	1.238	0.53
71_K	74_P	1.233	0.53
365_S	414_K	1.229	0.53
650_K	657_E	1.228	0.53
96_E	99_K	1.226	0.52
692_G	696_P	1.217	0.52
248_S	252_R	1.215	0.52
15_V	23_H	1.212	0.52
123_D	126_R	1.211	0.52
566_M	622_K	1.205	0.51
8_A	29_I	1.204	0.51
58_R	62_S	1.203	0.51
11_L	23_H	1.200	0.51
144_M	261_T	1.200	0.51
727_E	730_F	1.198	0.51
702_K	705_G	1.193	0.50
279_E	282_R	1.188	0.50
475_I	483_L	1.187	0.50
593_P	622_K	1.186	0.50
532_N	535_V	1.183	0.50
490_V	690_D	1.182	0.50
69_L	77_L	1.178	0.50
103_W	159_T	1.178	0.50
510_I	514_L	1.177	0.49
253_T	262_F	1.176	0.49
480_G	503_G	1.171	0.49
480_G	561_F	1.165	0.49
6_R	417_Q	1.165	0.49
242_L	360_L	1.159	0.48
579_P	603_A	1.156	0.48
493_L	524_L	1.150	0.48
62_S	69_L	1.150	0.48
308_E	311_T	1.146	0.48
245_R	253_T	1.145	0.48
101_A	130_S	1.144	0.47
482_S	485_D	1.140	0.47
365_S	418_L	1.140	0.47
547_Q	778_Q	1.140	0.47
592_L	652_S	1.139	0.47
130_S	155_H	1.138	0.47
291_L	301_G	1.137	0.47
566_M	623_E	1.136	0.47
771_A	775_A	1.134	0.47
591_C	605_M	1.133	0.47
361_W	418_L	1.133	0.47
481_A	509_M	1.131	0.47
218_L	254_L	1.131	0.47
534_C	588_T	1.130	0.47
169_K	198_G	1.129	0.47
184_L	201_T	1.128	0.46
487_G	686_A	1.123	0.46
596_R	669_Q	1.123	0.46
248_S	281_F	1.119	0.46
263_A	283_I	1.114	0.46
210_A	367_T	1.112	0.46
703_V	708_G	1.112	0.46
563_E	754_E	1.111	0.45
720_K	725_I	1.111	0.45
486_L	492_L	1.110	0.45
92_E	121_L	1.109	0.45
427_K	431_D	1.108	0.45
309_G	314_E	1.108	0.45
331_P	334_E	1.105	0.45
157_L	187_M	1.103	0.45
354_D	357_G	1.101	0.45
603_A	652_S	1.098	0.45
499_S	534_C	1.096	0.45
433_G	436_T	1.096	0.45
627_N	665_K	1.096	0.45
11_L	125_H	1.095	0.44
60_R	69_L	1.095	0.44
37_V	41_L	1.093	0.44
53_D	93_D	1.091	0.44
438_Y	443_G	1.085	0.44
262_F	393_F	1.080	0.44
133_S	159_T	1.079	0.44
53_D	56_E	1.077	0.43
751_V	755_Y	1.071	0.43
551_F	769_G	1.070	0.43
38_P	60_R	1.068	0.43
253_T	281_F	1.066	0.43
23_H	349_L	1.065	0.43
286_F	290_M	1.062	0.43
610_S	732_I	1.058	0.42
617_G	621_N	1.055	0.42
489_D	685_A	1.054	0.42
662_N	722_S	1.054	0.42
217_G	253_T	1.054	0.42
315_L	320_L	1.052	0.42
104_I	130_S	1.047	0.42
207_N	268_N	1.047	0.42
628_H	632_G	1.045	0.41
438_Y	442_N	1.041	0.41
501_A	506_I	1.039	0.41
527_G	580_F	1.038	0.41
40_D	70_L	1.038	0.41
503_G	561_F	1.038	0.41
644_E	650_K	1.037	0.41
507_I	564_T	1.035	0.41
243_I	346_M	1.030	0.41
253_T	393_F	1.028	0.40
316_D	319_T	1.026	0.40
168_L	256_V	1.025	0.40
468_L	472_K	1.020	0.40
777_M	781_L	1.017	0.40
365_S	411_S	1.014	0.40
498_K	534_C	1.014	0.40
641_K	644_E	1.013	0.40
758_E	762_E	1.012	0.40
625_Y	740_I	1.007	0.39
397_L	405_A	1.007	0.39
735_K	770_E	1.004	0.39
476_A	516_E	1.004	0.39
289_D	292_E	1.003	0.39
489_D	522_K	1.001	0.39
591_C	597_I	1.001	0.39
54_S	59_S	0.999	0.39
40_D	53_D	0.998	0.39
98_L	122_V	0.996	0.39
615_I	739_V	0.992	0.38
332_A	354_D	0.992	0.38
408_L	426_I	0.992	0.38
410_Q	414_K	0.990	0.38
133_S	187_M	0.986	0.38
29_I	85_Y	0.985	0.38
126_R	151_D	0.984	0.38
59_S	64_Q	0.977	0.38
514_L	564_T	0.976	0.37
56_E	64_Q	0.976	0.37
422_M	722_S	0.975	0.37
287_M	614_L	0.974	0.37
679_Y	683_Q	0.971	0.37
542_I	614_L	0.971	0.37
677_L	680_D	0.971	0.37
109_V	114_V	0.966	0.37
225_M	253_T	0.965	0.37
486_L	529_Q	0.962	0.37
203_K	247_K	0.962	0.37
10_V	14_G	0.959	0.36
37_V	92_E	0.957	0.36
659_R	667_T	0.953	0.36
150_D	617_G	0.950	0.36
642_T	740_I	0.949	0.36
5_I	8_A	0.948	0.36
639_A	712_L	0.947	0.36
242_L	333_L	0.946	0.36
54_S	62_S	0.943	0.36
705_G	709_Y	0.942	0.36
478_N	483_L	0.941	0.35
693_W	705_G	0.940	0.35
353_D	358_R	0.940	0.35
122_V	132_V	0.939	0.35
257_V	651_V	0.939	0.35
709_Y	741_A	0.937	0.35
497_S	506_I	0.937	0.35
330_S	354_D	0.937	0.35
64_Q	69_L	0.936	0.35
475_I	478_N	0.934	0.35
374_L	377_E	0.934	0.35
121_L	153_K	0.933	0.35
758_E	761_R	0.932	0.35
627_N	630_R	0.931	0.35
169_K	675_D	0.929	0.35
77_L	83_T	0.927	0.35
56_E	59_S	0.927	0.35
58_R	69_L	0.926	0.35
53_D	59_S	0.926	0.35
122_V	125_H	0.926	0.35
598_Q	684_L	0.925	0.35
235_V	248_S	0.924	0.35
95_A	316_D	0.923	0.34
702_K	750_E	0.922	0.34
54_S	61_L	0.916	0.34
534_C	773_S	0.914	0.34
477_K	482_S	0.913	0.34
54_S	69_L	0.913	0.34
728_H	772_K	0.911	0.34
53_D	58_R	0.909	0.34
658_A	664_L	0.909	0.34
765_L	769_G	0.909	0.34
538_N	541_M	0.906	0.34
57_V	725_I	0.906	0.34
506_I	569_K	0.906	0.34
383_H	456_V	0.899	0.33
432_K	438_Y	0.896	0.33
131_I	554_V	0.894	0.33
652_S	677_L	0.894	0.33
329_K	334_E	0.894	0.33
429_M	433_G	0.893	0.33
476_A	513_G	0.892	0.33
19_G	107_V	0.891	0.33
670_I	680_D	0.890	0.33
732_I	740_I	0.890	0.33
184_L	259_L	0.889	0.33
63_R	88_P	0.887	0.32
395_W	561_F	0.885	0.32
621_N	756_L	0.885	0.32
290_M	295_W	0.885	0.32
70_L	74_P	0.885	0.32
191_G	199_V	0.884	0.32
33_L	107_V	0.883	0.32
735_K	763_A	0.880	0.32
30_P	87_T	0.879	0.32
54_S	64_Q	0.877	0.32
547_Q	774_Q	0.877	0.32
305_Y	541_M	0.876	0.32
422_M	427_K	0.875	0.32
224_E	366_Q	0.874	0.32
511_H	567_K	0.873	0.32
207_N	391_W	0.871	0.32
91_L	118_I	0.871	0.32
514_L	568_I	0.866	0.31
188_T	201_T	0.865	0.31
104_I	149_S	0.864	0.31
703_V	745_V	0.863	0.31
483_L	491_A	0.863	0.31
116_K	278_K	0.862	0.31
81_K	660_E	0.862	0.31
53_D	64_Q	0.861	0.31
474_V	482_S	0.860	0.31
717_E	721_L	0.860	0.31
505_D	508_Q	0.859	0.31
205_T	378_I	0.858	0.31
222_V	254_L	0.855	0.31
198_G	213_I	0.855	0.31
725_I	730_F	0.854	0.31
645_T	648_M	0.853	0.31
522_K	686_A	0.853	0.31
210_A	592_L	0.853	0.31
59_S	63_R	0.851	0.31
745_V	748_G	0.851	0.31
228_G	355_R	0.851	0.31
566_M	569_K	0.850	0.31
550_N	553_E	0.847	0.30
437_F	442_N	0.847	0.30
117_K	422_M	0.846	0.30
469_K	529_Q	0.846	0.30
41_L	53_D	0.845	0.30
6_R	151_D	0.845	0.30
228_G	362_N	0.844	0.30
447_Y	727_E	0.843	0.30
248_S	284_P	0.840	0.30
252_R	301_G	0.838	0.30
24_L	213_I	0.838	0.30
460_K	465_L	0.838	0.30
438_Y	441_E	0.837	0.30
385_I	754_E	0.837	0.30
375_L	422_M	0.836	0.30
439_I	453_Y	0.836	0.30
630_R	699_E	0.835	0.30
307_K	312_I	0.832	0.30
341_G	345_K	0.831	0.30
485_D	682_K	0.831	0.30
669_Q	680_D	0.830	0.30
241_P	261_T	0.830	0.30
731_K	772_K	0.829	0.29
469_K	482_S	0.827	0.29
570_Y	753_E	0.826	0.29
141_V	145_A	0.825	0.29
122_V	390_K	0.823	0.29
38_P	58_R	0.823	0.29
575_V	595_A	0.822	0.29
728_H	773_S	0.822	0.29
68_K	121_L	0.821	0.29
780_M	787_L	0.820	0.29
491_A	516_E	0.819	0.29
772_K	775_A	0.818	0.29
146_E	727_E	0.818	0.29
529_Q	674_Q	0.816	0.29
71_K	653_A	0.815	0.29
254_L	393_F	0.813	0.29
649_A	654_S	0.812	0.29
665_K	668_D	0.810	0.29
593_P	623_E	0.809	0.28
41_L	55_S	0.809	0.28
158_G	239_T	0.809	0.28
218_L	262_F	0.809	0.28
120_A	124_E	0.808	0.28
350_I	406_I	0.808	0.28
305_Y	495_F	0.807	0.28
81_K	84_S	0.806	0.28
416_E	426_I	0.805	0.28
218_L	221_T	0.803	0.28
758_E	769_G	0.803	0.28
437_F	443_G	0.801	0.28
659_R	664_L	0.801	0.28
702_K	706_E	0.799	0.28
149_S	152_F	0.799	0.28
460_K	463_I	0.799	0.28
459_N	676_H	0.797	0.28
228_G	359_L	0.797	0.28
347_K	410_Q	0.795	0.28
684_L	687_S	0.795	0.28
650_K	653_A	0.794	0.28
504_L	508_Q	0.793	0.28
231_Q	354_D	0.793	0.28
604_Y	611_G	0.793	0.28
532_N	582_M	0.791	0.28
277_E	374_L	0.789	0.27
190_F	599_A	0.787	0.27
739_V	759_I	0.787	0.27
758_E	766_S	0.785	0.27
390_K	416_E	0.784	0.27
731_K	735_K	0.783	0.27
70_L	569_K	0.783	0.27
491_A	513_G	0.780	0.27
464_H	529_Q	0.780	0.27
718_Q	722_S	0.779	0.27
8_A	31_V	0.777	0.27
232_V	317_P	0.776	0.27
123_D	132_V	0.776	0.27
535_V	545_E	0.775	0.27
69_L	105_I	0.775	0.27
112_L	143_E	0.774	0.27
287_M	535_V	0.774	0.27
663_I	747_F	0.773	0.27
394_G	506_I	0.772	0.27
5_I	605_M	0.769	0.26
108_V	286_F	0.767	0.26
431_D	436_T	0.767	0.26
229_G	318_V	0.766	0.26
158_G	250_T	0.765	0.26
104_I	696_P	0.764	0.26
731_K	766_S	0.764	0.26
671_S	677_L	0.763	0.26
63_R	70_L	0.763	0.26
121_L	288_N	0.762	0.26
64_Q	68_K	0.762	0.26
593_P	773_S	0.762	0.26
554_V	768_S	0.762	0.26
478_N	497_S	0.760	0.26
489_D	601_S	0.759	0.26
269_V	273_A	0.758	0.26
775_A	779_H	0.753	0.26
696_P	700_K	0.752	0.26
104_I	129_G	0.752	0.26
463_I	486_L	0.752	0.26
474_V	480_G	0.750	0.26
121_L	124_E	0.750	0.26
275_G	688_L	0.749	0.26
529_Q	580_F	0.748	0.26
416_E	422_M	0.746	0.25
94_D	348_A	0.745	0.25
11_L	365_S	0.743	0.25
411_S	414_K	0.743	0.25
80_A	122_V	0.742	0.25
561_F	565_M	0.742	0.25
752_D	768_S	0.741	0.25
116_K	148_R	0.740	0.25
546_V	554_V	0.738	0.25
7_K	32_L	0.738	0.25
434_N	438_Y	0.737	0.25
56_E	69_L	0.737	0.25
709_Y	738_Y	0.737	0.25
173_I	349_L	0.735	0.25
685_A	689_Y	0.735	0.25
108_V	120_A	0.733	0.25
132_V	147_G	0.732	0.25
98_L	104_I	0.732	0.25
52_K	55_S	0.732	0.25
91_L	114_V	0.731	0.25
711_A	715_G	0.731	0.25
482_S	494_E	0.730	0.25
650_K	661_M	0.729	0.25
248_S	262_F	0.729	0.25
99_K	353_D	0.729	0.25
736_L	739_V	0.728	0.25
436_T	441_E	0.728	0.25
229_G	232_V	0.728	0.25
604_Y	651_V	0.728	0.25
683_Q	687_S	0.727	0.25
55_S	94_D	0.727	0.25
116_K	120_A	0.727	0.25
492_L	621_N	0.725	0.24
499_S	784_G	0.724	0.24
588_T	605_M	0.724	0.24
98_L	125_H	0.724	0.24
113_E	556_F	0.723	0.24
501_A	596_R	0.723	0.24
62_S	88_P	0.721	0.24
249_A	281_F	0.720	0.24
133_S	171_L	0.719	0.24
250_T	751_V	0.717	0.24
122_V	194_V	0.717	0.24
465_L	468_L	0.717	0.24
96_E	124_E	0.716	0.24
558_I	698_K	0.716	0.24
726_S	731_K	0.713	0.24
41_L	57_V	0.713	0.24
379_A	385_I	0.712	0.24
217_G	245_R	0.711	0.24
178_E	594_A	0.710	0.24
435_E	447_Y	0.709	0.24
111_N	114_V	0.708	0.24
465_L	492_L	0.707	0.24
241_P	345_K	0.706	0.24
571_S	653_A	0.706	0.24
173_I	698_K	0.706	0.24
336_A	339_A	0.705	0.24
565_M	580_F	0.705	0.24
140_S	748_G	0.703	0.23
728_H	732_I	0.701	0.23
210_A	670_I	0.701	0.23
369_L	420_A	0.701	0.23
330_S	359_L	0.701	0.23
478_N	485_D	0.700	0.23
95_A	117_K	0.698	0.23
52_K	59_S	0.697	0.23
469_K	481_A	0.696	0.23
228_G	358_R	0.696	0.23
7_K	30_P	0.694	0.23
11_L	19_G	0.693	0.23
239_T	406_I	0.693	0.23
122_V	134_S	0.692	0.23
39_N	61_L	0.692	0.23
736_L	777_M	0.692	0.23
511_H	564_T	0.692	0.23
57_V	64_Q	0.691	0.23
621_N	740_I	0.691	0.23
126_R	132_V	0.689	0.23
669_Q	685_A	0.689	0.23
403_W	411_S	0.689	0.23
111_N	412_A	0.686	0.23
37_V	90_N	0.686	0.23
139_I	357_G	0.686	0.23
465_L	500_N	0.685	0.23
88_P	213_I	0.682	0.23
128_T	315_L	0.682	0.23
7_K	428_E	0.681	0.23
501_A	627_N	0.681	0.23
122_V	126_R	0.681	0.23
542_I	554_V	0.681	0.23
503_G	538_N	0.680	0.22
502_I	591_C	0.680	0.22
409_K	430_L	0.679	0.22
486_L	508_Q	0.679	0.22
378_I	515_E	0.678	0.22
98_L	423_P	0.678	0.22
478_N	482_S	0.677	0.22
615_I	779_H	0.677	0.22
78_T	656_Q	0.677	0.22
40_D	60_R	0.676	0.22
13_S	33_L	0.676	0.22
241_P	249_A	0.675	0.22
475_I	485_D	0.674	0.22
496_H	501_A	0.674	0.22
225_M	249_A	0.672	0.22
621_N	646_I	0.670	0.22
147_G	319_T	0.669	0.22
154_A	182_D	0.669	0.22
539_L	581_G	0.669	0.22
732_I	763_A	0.669	0.22
224_E	362_N	0.668	0.22
9_A	122_V	0.668	0.22
128_T	132_V	0.668	0.22
409_K	431_D	0.667	0.22
368_L	406_I	0.664	0.22
53_D	62_S	0.664	0.22
762_E	770_E	0.664	0.22
385_I	402_M	0.662	0.22
403_W	426_I	0.661	0.22
491_A	648_M	0.660	0.22
644_E	740_I	0.660	0.22
433_G	443_G	0.659	0.22
460_K	605_M	0.658	0.22
210_A	597_I	0.656	0.21
476_A	509_M	0.656	0.21
712_L	741_A	0.656	0.21
96_E	128_T	0.655	0.21
728_H	763_A	0.654	0.21
283_I	287_M	0.654	0.21
238_I	669_Q	0.652	0.21
209_I	688_L	0.651	0.21
762_E	769_G	0.651	0.21
56_E	62_S	0.650	0.21
481_A	484_I	0.650	0.21
481_A	485_D	0.650	0.21
88_P	150_D	0.650	0.21
413_E	416_E	0.650	0.21
558_I	677_L	0.650	0.21
436_T	443_G	0.650	0.21
514_L	518_E	0.649	0.21
543_L	547_Q	0.648	0.21
202_A	219_L	0.648	0.21
475_I	768_S	0.647	0.21
502_I	565_M	0.647	0.21
446_F	569_K	0.647	0.21
71_K	657_E	0.647	0.21
430_L	433_G	0.646	0.21
390_K	683_Q	0.646	0.21
436_T	440_K	0.646	0.21
209_I	732_I	0.645	0.21
775_A	778_Q	0.644	0.21
53_D	69_L	0.643	0.21
573_K	595_A	0.642	0.21
134_S	144_M	0.641	0.21
668_D	728_H	0.641	0.21
80_A	660_E	0.641	0.21
221_T	502_I	0.639	0.21
704_P	708_G	0.639	0.21
583_T	588_T	0.638	0.21
425_W	429_M	0.637	0.21
498_K	535_V	0.637	0.21
394_G	551_F	0.636	0.21
359_L	366_Q	0.635	0.21
475_I	484_I	0.635	0.21
469_K	494_E	0.634	0.21
104_I	132_V	0.633	0.21
429_M	432_K	0.633	0.21
139_I	366_Q	0.633	0.21
720_K	723_G	0.633	0.21
253_T	284_P	0.632	0.20
516_E	521_Y	0.631	0.20
243_I	350_I	0.631	0.20
124_E	128_T	0.630	0.20
290_M	336_A	0.630	0.20
429_M	448_Y	0.630	0.20
168_L	243_I	0.630	0.20
13_S	744_K	0.629	0.20
129_G	146_E	0.629	0.20
59_S	72_Q	0.628	0.20
454_R	581_G	0.628	0.20
218_L	222_V	0.628	0.20
256_V	492_L	0.628	0.20
7_K	756_L	0.628	0.20
441_E	444_T	0.628	0.20
568_I	594_A	0.628	0.20
347_K	351_Y	0.627	0.20
180_D	234_E	0.627	0.20
16_M	21_A	0.626	0.20
17_G	21_A	0.626	0.20
522_K	685_A	0.626	0.20
424_G	695_P	0.626	0.20
182_D	186_F	0.626	0.20
290_M	389_M	0.626	0.20
77_L	101_A	0.625	0.20
252_R	298_S	0.625	0.20
365_S	369_L	0.625	0.20
220_V	366_Q	0.625	0.20
625_Y	639_A	0.625	0.20
123_D	147_G	0.623	0.20
326_T	614_L	0.622	0.20
597_I	664_L	0.622	0.20
738_Y	741_A	0.622	0.20
331_P	335_A	0.621	0.20
701_V	756_L	0.621	0.20
523_G	689_Y	0.620	0.20
686_A	690_D	0.620	0.20
225_M	583_T	0.620	0.20
527_G	677_L	0.620	0.20
246_P	535_V	0.619	0.20
221_T	708_G	0.619	0.20
232_V	569_K	0.619	0.20
177_K	274_D	0.616	0.20
508_Q	558_I	0.615	0.20
595_A	688_L	0.615	0.20
241_P	301_G	0.615	0.20
267_R	270_Y	0.615	0.20
128_T	184_L	0.614	0.20
650_K	663_I	0.614	0.20
96_E	125_H	0.613	0.20
173_I	179_T	0.613	0.20
654_S	657_E	0.613	0.20
530_G	580_F	0.612	0.20
140_S	679_Y	0.612	0.20
179_T	183_I	0.612	0.20
680_D	684_L	0.612	0.20
513_G	517_T	0.611	0.20
375_L	425_W	0.611	0.20
446_F	455_A	0.611	0.20
305_Y	678_L	0.611	0.20
599_A	658_A	0.611	0.20
431_D	435_E	0.610	0.20
222_V	266_A	0.610	0.20
469_K	475_I	0.609	0.20
715_G	736_L	0.609	0.20
475_I	497_S	0.608	0.20
662_N	747_F	0.608	0.20
239_T	245_R	0.607	0.20
168_L	360_L	0.607	0.20
340_K	521_Y	0.607	0.20
360_L	363_I	0.607	0.20
598_Q	670_I	0.607	0.20
433_G	439_I	0.607	0.20
410_Q	413_E	0.607	0.20
734_K	738_Y	0.607	0.20
267_R	288_N	0.606	0.19
73_K	653_A	0.606	0.19
31_V	557_V	0.606	0.19
709_Y	744_K	0.605	0.19
429_M	434_N	0.605	0.19
332_A	336_A	0.604	0.19
248_S	298_S	0.604	0.19
756_L	771_A	0.603	0.19
25_A	615_I	0.603	0.19
154_A	288_N	0.602	0.19
6_R	132_V	0.602	0.19
18_S	100_E	0.602	0.19
412_A	416_E	0.602	0.19
104_I	146_E	0.602	0.19
512_K	516_E	0.602	0.19
260_D	299_K	0.601	0.19
113_E	610_S	0.600	0.19
300_A	431_D	0.600	0.19
504_L	617_G	0.600	0.19
554_V	591_C	0.600	0.19
474_V	484_I	0.600	0.19
534_C	593_P	0.599	0.19
151_D	154_A	0.598	0.19
150_D	367_T	0.598	0.19
6_R	476_A	0.597	0.19
209_I	501_A	0.596	0.19
104_I	693_W	0.596	0.19
239_T	751_V	0.595	0.19
347_K	413_E	0.595	0.19
393_F	725_I	0.593	0.19
311_T	596_R	0.592	0.19
709_Y	713_L	0.592	0.19
168_L	492_L	0.592	0.19
510_I	702_K	0.592	0.19
610_S	733_A	0.591	0.19
517_T	520_N	0.591	0.19
36_I	296_I	0.590	0.19
636_M	711_A	0.589	0.19
446_F	449_D	0.589	0.19
209_I	465_L	0.589	0.19
671_S	684_L	0.589	0.19
91_L	575_V	0.588	0.19
394_G	569_K	0.588	0.19
351_Y	410_Q	0.588	0.19
549_D	552_L	0.587	0.19
41_L	119_F	0.586	0.19
252_R	345_K	0.586	0.19
432_K	437_F	0.585	0.19
219_L	264_H	0.585	0.19
41_L	54_S	0.584	0.19
248_S	256_V	0.583	0.19
433_G	442_N	0.583	0.19
158_G	175_P	0.583	0.19
316_D	665_K	0.582	0.19
324_E	465_L	0.582	0.19
239_T	243_I	0.582	0.19
245_R	250_T	0.582	0.19
414_K	417_Q	0.582	0.19
80_A	357_G	0.582	0.19
217_G	618_G	0.581	0.19
218_L	708_G	0.580	0.18
431_D	434_N	0.580	0.18
580_F	594_A	0.579	0.18
513_G	524_L	0.579	0.18
417_Q	519_R	0.579	0.18
272_K	661_M	0.579	0.18
625_Y	629_L	0.578	0.18
531_K	535_V	0.578	0.18
314_E	355_R	0.577	0.18
213_I	378_I	0.577	0.18
605_M	664_L	0.577	0.18
217_G	561_F	0.577	0.18
440_K	443_G	0.577	0.18
173_I	188_T	0.576	0.18
711_A	741_A	0.576	0.18
257_V	506_I	0.576	0.18
481_A	513_G	0.575	0.18
127_K	571_S	0.575	0.18
436_T	564_T	0.574	0.18
97_K	321_T	0.573	0.18
657_E	696_P	0.573	0.18
483_L	493_L	0.573	0.18
306_K	330_S	0.573	0.18
411_S	415_L	0.573	0.18
353_D	489_D	0.572	0.18
99_K	306_K	0.572	0.18
138_G	207_N	0.572	0.18
145_A	180_D	0.571	0.18
111_N	267_R	0.571	0.18
659_R	669_Q	0.571	0.18
112_L	139_I	0.570	0.18
379_A	524_L	0.570	0.18
324_E	698_K	0.569	0.18
461_K	465_L	0.567	0.18
463_I	466_Q	0.566	0.18
437_F	441_E	0.565	0.18
508_Q	560_R	0.565	0.18
674_Q	677_L	0.565	0.18
501_A	652_S	0.564	0.18
7_K	470_E	0.563	0.18
250_T	425_W	0.563	0.18
485_D	488_D	0.563	0.18
514_L	675_D	0.563	0.18
365_S	415_L	0.562	0.18
305_Y	583_T	0.562	0.18
596_R	671_S	0.562	0.18
449_D	454_R	0.562	0.18
111_N	117_K	0.561	0.18
145_A	617_G	0.561	0.18
131_I	356_A	0.561	0.18
173_I	180_D	0.560	0.18
530_G	581_G	0.560	0.18
269_V	357_G	0.560	0.18
426_I	432_K	0.560	0.18
560_R	564_T	0.559	0.18
98_L	126_R	0.559	0.18
566_M	754_E	0.559	0.18
502_I	506_I	0.559	0.18
154_A	720_K	0.558	0.18
175_P	181_P	0.558	0.18
210_A	213_I	0.558	0.18
405_A	692_G	0.558	0.18
113_E	502_I	0.558	0.18
122_V	484_I	0.557	0.18
393_F	503_G	0.557	0.18
241_P	281_F	0.556	0.18
100_E	154_A	0.556	0.18
501_A	659_R	0.556	0.18
200_V	761_R	0.556	0.18
532_N	617_G	0.555	0.18
577_A	583_T	0.555	0.18
735_K	738_Y	0.554	0.18
330_S	333_L	0.554	0.18
18_S	364_T	0.554	0.18
538_N	544_M	0.554	0.18
428_E	526_I	0.553	0.18
652_S	666_E	0.553	0.18
221_T	274_D	0.553	0.18
469_K	496_H	0.552	0.17
698_K	754_E	0.552	0.17
221_T	557_V	0.552	0.17
339_A	345_K	0.552	0.17
445_V	449_D	0.551	0.17
78_T	82_N	0.550	0.17
453_Y	458_E	0.549	0.17
32_L	553_E	0.549	0.17
107_V	479_S	0.549	0.17
315_L	433_G	0.548	0.17
7_K	489_D	0.548	0.17
729_D	732_I	0.548	0.17
24_L	105_I	0.548	0.17
648_M	651_V	0.547	0.17
239_T	503_G	0.547	0.17
205_T	617_G	0.547	0.17
719_M	724_Y	0.547	0.17
157_L	179_T	0.546	0.17
722_S	749_T	0.546	0.17
188_T	394_G	0.546	0.17
660_E	666_E	0.546	0.17
129_G	151_D	0.546	0.17
700_K	749_T	0.546	0.17
231_Q	592_L	0.546	0.17
732_I	735_K	0.546	0.17
198_G	521_Y	0.546	0.17
139_I	359_L	0.545	0.17
622_K	754_E	0.545	0.17
113_E	517_T	0.545	0.17
238_I	242_L	0.544	0.17
636_M	643_F	0.544	0.17
360_L	394_G	0.543	0.17
205_T	213_I	0.543	0.17
40_D	305_Y	0.543	0.17
339_A	348_A	0.543	0.17
712_L	715_G	0.543	0.17
96_E	104_I	0.543	0.17
124_E	130_S	0.542	0.17
191_G	342_T	0.542	0.17
519_R	630_R	0.542	0.17
183_I	508_Q	0.542	0.17
203_K	378_I	0.542	0.17
485_D	489_D	0.541	0.17
193_N	676_H	0.540	0.17
346_M	364_T	0.540	0.17
202_A	307_K	0.539	0.17
478_N	509_M	0.539	0.17
361_W	748_G	0.539	0.17
472_K	482_S	0.539	0.17
16_M	20_I	0.538	0.17
17_G	20_I	0.538	0.17
579_P	591_C	0.538	0.17
599_A	659_R	0.538	0.17
11_L	638_A	0.538	0.17
379_A	711_A	0.538	0.17
6_R	436_T	0.536	0.17
220_V	224_E	0.536	0.17
428_E	754_E	0.536	0.17
647_A	733_A	0.535	0.17
635_P	638_A	0.533	0.17
564_T	712_L	0.533	0.17
142_Q	385_I	0.533	0.17
626_I	630_R	0.533	0.17
371_S	593_P	0.533	0.17
144_M	268_N	0.532	0.17
101_A	711_A	0.532	0.17
138_G	261_T	0.532	0.17
637_N	640_M	0.532	0.17
11_L	375_L	0.532	0.17
493_L	513_G	0.532	0.17
572_A	695_P	0.532	0.17
285_S	289_D	0.531	0.17
248_S	394_G	0.531	0.17
644_E	715_G	0.531	0.17
241_P	503_G	0.531	0.17
655_A	670_I	0.530	0.17
117_K	177_K	0.530	0.17
209_I	378_I	0.530	0.17
37_V	60_R	0.530	0.17
505_D	545_E	0.530	0.17
99_K	154_A	0.530	0.17
108_V	222_V	0.530	0.17
99_K	181_P	0.530	0.17
694_R	701_V	0.529	0.17
223_Q	366_Q	0.529	0.17
91_L	188_T	0.529	0.17
385_I	653_A	0.528	0.17
292_E	594_A	0.528	0.17
581_G	600_A	0.528	0.17
745_V	755_Y	0.528	0.17
543_L	644_E	0.528	0.17
8_A	480_G	0.527	0.17
320_L	426_I	0.527	0.17
57_V	62_S	0.527	0.17
235_V	250_T	0.527	0.17
13_S	583_T	0.527	0.17
90_N	93_D	0.526	0.17
605_M	652_S	0.525	0.17
367_T	554_V	0.525	0.17
182_D	614_L	0.525	0.17
601_S	672_V	0.524	0.17
768_S	778_Q	0.524	0.17
295_W	783_K	0.524	0.17
661_M	756_L	0.524	0.17
253_T	266_A	0.524	0.17
270_Y	278_K	0.523	0.16
314_E	546_V	0.523	0.16
185_K	189_A	0.522	0.16
259_L	495_F	0.522	0.16
39_N	57_V	0.522	0.16
179_T	575_V	0.522	0.16
11_L	489_D	0.522	0.16
720_K	739_V	0.522	0.16
555_D	746_P	0.521	0.16
150_D	227_K	0.521	0.16
422_M	430_L	0.521	0.16
349_L	357_G	0.520	0.16
580_F	583_T	0.520	0.16
579_P	583_T	0.519	0.16
112_L	390_K	0.519	0.16
233_G	305_Y	0.519	0.16
119_F	554_V	0.519	0.16
669_Q	687_S	0.518	0.16
412_A	430_L	0.518	0.16
318_V	362_N	0.518	0.16
15_V	18_S	0.517	0.16
138_G	252_R	0.517	0.16
475_I	482_S	0.517	0.16
408_L	436_T	0.517	0.16
118_I	409_K	0.517	0.16
468_L	473_G	0.517	0.16
461_K	676_H	0.516	0.16
349_L	352_S	0.515	0.16
513_G	708_G	0.515	0.16
13_S	119_F	0.515	0.16
670_I	677_L	0.514	0.16
528_N	580_F	0.514	0.16
490_V	672_V	0.514	0.16
19_G	91_L	0.513	0.16
226_L	317_P	0.513	0.16
532_N	716_A	0.510	0.16
10_V	21_A	0.510	0.16
559_R	761_R	0.509	0.16
165_A	603_A	0.509	0.16
130_S	134_S	0.509	0.16
302_Q	746_P	0.509	0.16
299_K	607_L	0.508	0.16
553_E	615_I	0.508	0.16
192_E	598_Q	0.508	0.16
334_E	784_G	0.508	0.16
175_P	184_L	0.508	0.16
11_L	139_I	0.507	0.16
732_I	736_L	0.507	0.16
507_I	561_F	0.507	0.16
237_S	246_P	0.507	0.16
217_G	367_T	0.507	0.16
132_V	149_S	0.507	0.16
735_K	772_K	0.507	0.16
437_F	763_A	0.507	0.16
252_R	710_A	0.506	0.16
168_L	393_F	0.506	0.16
538_N	542_I	0.506	0.16
84_S	700_K	0.506	0.16
291_L	396_E	0.506	0.16
222_V	559_R	0.505	0.16
97_K	238_I	0.505	0.16
28_G	93_D	0.505	0.16
408_L	412_A	0.505	0.16
94_D	686_A	0.504	0.16
58_R	64_Q	0.504	0.16
19_G	298_S	0.504	0.16
118_I	126_R	0.504	0.16
357_G	446_F	0.504	0.16
192_E	459_N	0.504	0.16
455_A	482_S	0.504	0.16
599_A	670_I	0.504	0.16
513_G	659_R	0.504	0.16
548_D	553_E	0.503	0.16
55_S	60_R	0.503	0.16
27_I	194_V	0.502	0.16
501_A	582_M	0.501	0.16
532_N	755_Y	0.501	0.16
596_R	725_I	0.501	0.16
763_A	770_E	0.501	0.16
215_T	254_L	0.501	0.16
642_T	730_F	0.500	0.16
62_S	68_K	0.500	0.16
263_A	292_E	0.500	0.16
267_R	597_I	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1wdkA	2	0.4943	100	0.761	Contact Map
3zwcA	1	0.512	100	0.768	Contact Map
2wtbA	1	0.4778	100	0.769	Contact Map
3k6jA	1	0.4766	100	0.772	Contact Map
1zcjA	1	0.5108	100	0.774	Contact Map
4b3hA	1	0.4905	100	0.793	Contact Map
3mogA	3	0.5234	100	0.795	Contact Map
4j0eA	2	0.3663	100	0.83	Contact Map
1f0yA	2	0.3663	100	0.837	Contact Map
1zejA	2	0.3549	100	0.84	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0179 seconds.