YOKI - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YOKI - Probable ribonuclease YokI

UniProt:	O31998	Sequences: MKVFEADSLLSEADKRTKEYKELRSQMVKLKKAFKAVADLDDSKFSGKGADNIKAFYHDHVGVTDQWIDLIDMKIVFLSSISAKLEDAKMSDAYIEESFLEHELVNAYTKSKSIMSEQKKAMKDILNDINDILPLEIFSTEDFKDKLSSADDKREKTIDKINKLDEDLKTEYAETEQNEQFIQQDFKKLQESTGKGKNATPIHYSAKAYRESDIHKKKGDIEQHSEAYLTVKKEEAKEREIKELKKKLNDGVSDPDEYLEIAKKVGYENLEPAQVQLAVQIEQAKQLEGAGEITWDIVKGVGVGLYDVGKDTVTGLWDFITDPGETLSALGNAVIHPVKTYDAISAAIEESYQKDMVNGDAYSRSRWVTYAIGSVAAAVIGTKGAGAINKADAAGKVINKASQAGKKIKDVKIPDLLPYNPKYDLAMAGDVPYNVVDGENLKNQLMSFAKGSDKEVKPFDVVDYRPSNSPLENHHGVMDVWAKHNVPNYVSRGSNTPTVALTKEQHNATKKVYREWLFEKTGKKVGGKVNWKEVSPREIQELTEKMFDAANVPKEARQQYYNAFNQYNFRK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	571 (492)
Sequences:	119 (79)
Seq/√Len:	3.6

BACSU - YOKI YOBL YEEF YXID YWQJ YQCG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
57_Y	143_F	4.758	0.90
78_L	85_L	3.263	0.63
152_D	169_K	3.144	0.60
34_F	78_L	2.947	0.54
109_T	142_D	2.642	0.46
475_H	488_N	2.446	0.41
57_Y	93_A	2.424	0.40
484_H	487_P	2.382	0.39
124_D	127_N	2.354	0.38
255_P	259_L	2.331	0.38
453_D	457_K	2.320	0.37
94_Y	222_E	2.298	0.37
132_I	189_L	2.255	0.36
488_N	494_S	2.249	0.36
485_N	488_N	2.240	0.35
467_S	475_H	2.239	0.35
118_Q	138_F	2.209	0.35
15_K	82_S	2.208	0.35
89_K	164_L	2.200	0.34
485_N	489_Y	2.199	0.34
483_K	488_N	2.189	0.34
70_L	88_A	2.145	0.33
78_L	169_K	2.145	0.33
491_S	494_S	2.134	0.33
145_D	166_E	2.120	0.32
271_E	297_I	2.075	0.31
492_R	495_N	2.066	0.31
152_D	183_Q	2.057	0.31
484_H	488_N	2.048	0.31
462_V	494_S	2.044	0.31
478_M	484_H	2.043	0.31
14_D	78_L	2.002	0.30
81_I	94_Y	1.996	0.30
66_Q	93_A	1.975	0.29
477_V	486_V	1.955	0.29
279_V	286_Q	1.938	0.28
435_V	447_S	1.934	0.28
37_V	145_D	1.932	0.28
8_S	82_S	1.912	0.28
353_Q	367_W	1.908	0.28
436_V	441_L	1.897	0.27
37_V	113_S	1.886	0.27
289_G	310_K	1.883	0.27
405_G	410_D	1.876	0.27
246_K	250_D	1.843	0.26
352_Y	367_W	1.836	0.26
96_E	114_I	1.829	0.26
471_L	481_W	1.829	0.26
51_D	146_K	1.825	0.26
481_W	486_V	1.809	0.26
355_D	367_W	1.807	0.25
470_P	478_M	1.804	0.25
475_H	478_M	1.797	0.25
478_M	488_N	1.791	0.25
391_A	397_V	1.786	0.25
484_H	494_S	1.770	0.25
471_L	484_H	1.766	0.25
414_P	441_L	1.765	0.25
93_A	133_L	1.755	0.24
268_E	350_E	1.752	0.24
486_V	490_V	1.746	0.24
31_K	79_S	1.744	0.24
133_L	202_I	1.732	0.24
481_W	484_H	1.731	0.24
452_S	457_K	1.725	0.24
10_L	35_K	1.712	0.24
10_L	21_K	1.711	0.24
68_I	143_F	1.705	0.23
464_Y	468_N	1.703	0.23
364_R	367_W	1.696	0.23
481_W	488_N	1.692	0.23
121_A	128_D	1.683	0.23
16_R	20_Y	1.680	0.23
471_L	480_V	1.665	0.23
121_A	134_P	1.657	0.22
42_D	176_E	1.644	0.22
450_K	457_K	1.640	0.22
339_K	342_D	1.638	0.22
149_S	183_Q	1.634	0.22
64_T	164_L	1.633	0.22
479_D	491_S	1.629	0.22
57_Y	95_I	1.618	0.22
464_Y	472_E	1.617	0.22
485_N	493_G	1.616	0.22
475_H	484_H	1.616	0.22
483_K	487_P	1.604	0.22
34_F	70_L	1.598	0.21
432_P	435_V	1.594	0.21
473_N	484_H	1.589	0.21
480_V	484_H	1.581	0.21
124_D	133_L	1.575	0.21
93_A	202_I	1.567	0.21
259_L	281_I	1.564	0.21
306_Y	310_K	1.562	0.21
37_V	68_I	1.556	0.21
456_V	461_V	1.555	0.21
90_M	139_S	1.552	0.21
483_K	490_V	1.547	0.20
10_L	27_M	1.542	0.20
482_A	490_V	1.536	0.20
343_A	353_Q	1.527	0.20
471_L	483_K	1.526	0.20
486_V	489_Y	1.524	0.20
35_K	85_L	1.515	0.20
78_L	108_Y	1.508	0.20
118_Q	129_I	1.508	0.20
471_L	486_V	1.480	0.19
455_E	470_P	1.473	0.19
149_S	152_D	1.471	0.19
446_M	452_S	1.466	0.19
94_Y	166_E	1.466	0.19
463_D	472_E	1.459	0.19
482_A	495_N	1.443	0.19
116_S	145_D	1.437	0.19
64_T	89_K	1.435	0.19
471_L	485_N	1.433	0.19
394_A	432_P	1.433	0.19
482_A	487_P	1.429	0.18
461_V	464_Y	1.422	0.18
466_P	474_H	1.422	0.18
473_N	478_M	1.419	0.18
467_S	487_P	1.415	0.18
422_K	435_V	1.400	0.18
43_S	46_S	1.400	0.18
481_W	491_S	1.384	0.18
14_D	85_L	1.382	0.18
27_M	94_Y	1.381	0.18
299_K	306_Y	1.378	0.18
478_M	494_S	1.372	0.18
487_P	490_V	1.371	0.18
320_I	325_E	1.367	0.17
15_K	108_Y	1.360	0.17
25_S	79_S	1.357	0.17
265_V	277_L	1.351	0.17
479_D	494_S	1.346	0.17
431_V	434_N	1.338	0.17
471_L	491_S	1.331	0.17
12_E	37_V	1.329	0.17
109_T	152_D	1.328	0.17
57_Y	66_Q	1.323	0.17
393_A	408_I	1.320	0.17
481_W	489_Y	1.317	0.17
68_I	121_A	1.309	0.17
12_E	145_D	1.308	0.17
115_M	215_H	1.307	0.17
480_V	488_N	1.300	0.16
393_A	405_G	1.299	0.16
484_H	490_V	1.297	0.16
57_Y	130_N	1.293	0.16
454_K	458_P	1.290	0.16
468_N	489_Y	1.287	0.16
468_N	486_V	1.284	0.16
142_D	156_K	1.282	0.16
473_N	481_W	1.277	0.16
465_R	486_V	1.276	0.16
130_N	142_D	1.273	0.16
488_N	492_R	1.267	0.16
57_Y	188_K	1.265	0.16
481_W	485_N	1.265	0.16
473_N	479_D	1.259	0.16
336_H	340_T	1.258	0.16
461_V	468_N	1.256	0.16
79_S	134_P	1.249	0.16
471_L	490_V	1.245	0.16
481_W	494_S	1.244	0.16
464_Y	480_V	1.239	0.16
85_L	164_L	1.237	0.15
468_N	493_G	1.233	0.15
128_D	145_D	1.232	0.15
337_P	340_T	1.226	0.15
459_F	462_V	1.226	0.15
31_K	61_V	1.226	0.15
57_Y	121_A	1.221	0.15
481_W	487_P	1.212	0.15
401_A	426_A	1.209	0.15
422_K	427_M	1.207	0.15
421_P	441_L	1.201	0.15
123_K	133_L	1.197	0.15
310_K	374_S	1.192	0.15
22_E	27_M	1.192	0.15
487_P	494_S	1.188	0.15
467_S	488_N	1.188	0.15
91_S	94_Y	1.187	0.15
425_L	446_M	1.187	0.15
421_P	427_M	1.183	0.15
481_W	490_V	1.181	0.15
481_W	492_R	1.181	0.15
431_V	438_G	1.179	0.15
111_S	206_A	1.179	0.15
475_H	479_D	1.179	0.15
78_L	82_S	1.175	0.15
105_V	146_K	1.174	0.15
446_M	454_K	1.173	0.15
478_M	482_A	1.170	0.15
483_K	486_V	1.159	0.14
482_A	485_N	1.156	0.14
35_K	164_L	1.152	0.14
453_D	456_V	1.149	0.14
459_F	473_N	1.145	0.14
95_I	159_D	1.144	0.14
456_V	473_N	1.144	0.14
37_V	222_E	1.142	0.14
456_V	479_D	1.142	0.14
487_P	493_G	1.141	0.14
483_K	489_Y	1.139	0.14
144_K	202_I	1.137	0.14
462_V	475_H	1.136	0.14
479_D	492_R	1.134	0.14
484_H	489_Y	1.133	0.14
19_E	203_H	1.133	0.14
411_V	416_L	1.124	0.14
364_R	370_Y	1.121	0.14
469_S	484_H	1.121	0.14
104_L	189_L	1.121	0.14
149_S	175_T	1.118	0.14
457_K	475_H	1.117	0.14
7_D	130_N	1.117	0.14
433_Y	444_Q	1.114	0.14
461_V	486_V	1.113	0.14
473_N	492_R	1.111	0.14
259_L	278_A	1.109	0.14
473_N	494_S	1.100	0.14
337_P	341_Y	1.097	0.14
46_S	74_K	1.089	0.13
456_V	464_Y	1.089	0.13
473_N	477_V	1.088	0.13
471_L	477_V	1.088	0.13
490_V	493_G	1.085	0.13
152_D	155_E	1.083	0.13
454_K	459_F	1.079	0.13
134_P	202_I	1.076	0.13
340_T	343_A	1.076	0.13
169_K	191_E	1.076	0.13
484_H	493_G	1.074	0.13
475_H	487_P	1.066	0.13
478_M	495_N	1.066	0.13
468_N	478_M	1.066	0.13
323_P	328_S	1.064	0.13
82_S	108_Y	1.064	0.13
422_K	445_L	1.061	0.13
68_I	93_A	1.059	0.13
398_I	401_A	1.059	0.13
387_A	445_L	1.058	0.13
170_T	191_E	1.058	0.13
12_E	94_Y	1.058	0.13
477_V	480_V	1.057	0.13
450_K	458_P	1.054	0.13
70_L	78_L	1.050	0.13
422_K	425_L	1.049	0.13
150_A	154_R	1.046	0.13
461_V	480_V	1.045	0.13
21_K	143_F	1.043	0.13
177_Q	184_Q	1.040	0.13
473_N	490_V	1.040	0.13
387_A	427_M	1.037	0.13
463_D	470_P	1.037	0.13
468_N	471_L	1.036	0.13
473_N	482_A	1.035	0.13
357_V	372_I	1.034	0.13
478_M	483_K	1.034	0.13
8_S	130_N	1.033	0.13
37_V	170_T	1.032	0.13
469_S	473_N	1.030	0.13
484_H	491_S	1.030	0.13
467_S	485_N	1.028	0.13
85_L	108_Y	1.026	0.13
472_E	476_G	1.025	0.13
34_F	109_T	1.023	0.13
34_F	108_Y	1.021	0.13
460_D	470_P	1.017	0.13
461_V	489_Y	1.016	0.13
14_D	82_S	1.014	0.13
469_S	477_V	1.013	0.13
5_E	8_S	1.007	0.12
479_D	486_V	1.005	0.12
383_K	424_D	1.005	0.12
455_E	464_Y	1.003	0.12
114_I	179_E	0.998	0.12
462_V	470_P	0.996	0.12
488_N	491_S	0.995	0.12
464_Y	474_H	0.990	0.12
12_E	144_K	0.988	0.12
440_N	443_N	0.988	0.12
412_K	443_N	0.988	0.12
485_N	490_V	0.987	0.12
85_L	89_K	0.985	0.12
74_K	115_M	0.984	0.12
474_H	484_H	0.984	0.12
337_P	343_A	0.984	0.12
480_V	491_S	0.976	0.12
31_K	70_L	0.976	0.12
456_V	459_F	0.975	0.12
446_M	450_K	0.974	0.12
469_S	478_M	0.974	0.12
12_E	93_A	0.973	0.12
462_V	476_G	0.973	0.12
469_S	475_H	0.971	0.12
461_V	477_V	0.970	0.12
36_A	51_D	0.969	0.12
271_E	286_Q	0.968	0.12
252_V	281_I	0.967	0.12
11_S	198_N	0.966	0.12
22_E	94_Y	0.961	0.12
170_T	188_K	0.961	0.12
14_D	25_S	0.960	0.12
474_H	486_V	0.958	0.12
485_N	495_N	0.958	0.12
459_F	465_R	0.957	0.12
487_P	491_S	0.946	0.12
474_H	489_Y	0.944	0.12
479_D	490_V	0.941	0.12
462_V	478_M	0.941	0.12
471_L	475_H	0.940	0.12
278_A	281_I	0.940	0.12
254_D	257_E	0.938	0.12
482_A	488_N	0.938	0.12
475_H	481_W	0.937	0.12
93_A	123_K	0.937	0.12
58_H	61_V	0.937	0.12
473_N	480_V	0.933	0.12
418_P	433_Y	0.932	0.12
352_Y	370_Y	0.931	0.12
37_V	116_S	0.929	0.12
452_S	458_P	0.926	0.12
440_N	444_Q	0.926	0.12
14_D	31_K	0.925	0.12
405_G	433_Y	0.924	0.12
70_L	82_S	0.922	0.12
461_V	471_L	0.919	0.11
134_P	144_K	0.913	0.11
477_V	492_R	0.911	0.11
116_S	119_K	0.910	0.11
452_S	463_D	0.909	0.11
128_D	202_I	0.909	0.11
457_K	461_V	0.907	0.11
7_D	143_F	0.907	0.11
475_H	490_V	0.906	0.11
483_K	493_G	0.906	0.11
31_K	51_D	0.902	0.11
12_E	95_I	0.901	0.11
108_Y	159_D	0.899	0.11
457_K	485_N	0.899	0.11
469_S	482_A	0.897	0.11
27_M	137_I	0.896	0.11
355_D	433_Y	0.895	0.11
471_L	479_D	0.893	0.11
467_S	484_H	0.892	0.11
461_V	484_H	0.891	0.11
10_L	22_E	0.890	0.11
14_D	51_D	0.889	0.11
478_M	485_N	0.887	0.11
462_V	465_R	0.884	0.11
457_K	464_Y	0.882	0.11
102_H	136_E	0.881	0.11
475_H	491_S	0.880	0.11
109_T	113_S	0.880	0.11
360_D	370_Y	0.880	0.11
450_K	453_D	0.879	0.11
57_Y	175_T	0.879	0.11
464_Y	487_P	0.879	0.11
288_E	292_E	0.878	0.11
408_I	411_V	0.877	0.11
474_H	478_M	0.876	0.11
64_T	179_E	0.876	0.11
361_A	369_T	0.875	0.11
352_Y	355_D	0.871	0.11
474_H	487_P	0.871	0.11
22_E	25_S	0.870	0.11
431_V	441_L	0.870	0.11
466_P	494_S	0.868	0.11
344_I	358_N	0.864	0.11
471_L	488_N	0.862	0.11
482_A	486_V	0.861	0.11
261_I	281_I	0.861	0.11
404_A	411_V	0.860	0.11
470_P	490_V	0.858	0.11
489_Y	493_G	0.858	0.11
474_H	481_W	0.857	0.11
471_L	487_P	0.856	0.11
12_E	68_I	0.856	0.11
474_H	488_N	0.853	0.11
5_E	67_W	0.852	0.11
388_I	392_D	0.852	0.11
461_V	490_V	0.851	0.11
471_L	478_M	0.851	0.11
456_V	468_N	0.849	0.11
246_K	259_L	0.848	0.11
338_V	353_Q	0.848	0.11
484_H	495_N	0.846	0.11
43_S	64_T	0.843	0.11
468_N	484_H	0.843	0.11
466_P	469_S	0.841	0.11
479_D	489_Y	0.840	0.11
252_V	271_E	0.839	0.11
434_N	444_Q	0.839	0.11
94_Y	116_S	0.839	0.11
95_I	220_D	0.836	0.11
421_P	452_S	0.833	0.11
68_I	113_S	0.832	0.11
59_D	185_D	0.830	0.11
296_D	361_A	0.829	0.11
25_S	70_L	0.829	0.11
468_N	490_V	0.827	0.10
21_K	148_S	0.825	0.10
127_N	134_P	0.821	0.10
444_Q	450_K	0.820	0.10
41_D	242_K	0.820	0.10
329_A	337_P	0.819	0.10
34_F	68_I	0.818	0.10
286_Q	297_I	0.816	0.10
35_K	144_K	0.815	0.10
121_A	143_F	0.814	0.10
473_N	491_S	0.813	0.10
14_D	152_D	0.811	0.10
64_T	190_Q	0.811	0.10
475_H	486_V	0.808	0.10
480_V	492_R	0.807	0.10
33_A	98_S	0.806	0.10
480_V	489_Y	0.805	0.10
454_K	457_K	0.805	0.10
94_Y	134_P	0.801	0.10
4_F	17_T	0.800	0.10
366_R	375_V	0.800	0.10
68_I	124_D	0.800	0.10
250_D	253_S	0.799	0.10
447_S	451_G	0.797	0.10
257_E	270_L	0.797	0.10
34_F	88_A	0.796	0.10
488_N	495_N	0.795	0.10
422_K	428_A	0.794	0.10
469_S	481_W	0.794	0.10
57_Y	84_K	0.793	0.10
59_D	111_S	0.791	0.10
451_G	456_V	0.791	0.10
78_L	88_A	0.790	0.10
467_S	490_V	0.786	0.10
191_E	222_E	0.784	0.10
467_S	478_M	0.782	0.10
158_I	163_K	0.781	0.10
12_E	166_E	0.780	0.10
469_S	488_N	0.775	0.10
262_A	269_N	0.773	0.10
130_N	133_L	0.772	0.10
472_E	486_V	0.772	0.10
474_H	493_G	0.772	0.10
37_V	52_N	0.771	0.10
464_Y	481_W	0.770	0.10
3_V	98_S	0.770	0.10
470_P	480_V	0.764	0.10
472_E	481_W	0.763	0.10
310_K	364_R	0.761	0.10
478_M	490_V	0.761	0.10
468_N	475_H	0.758	0.10
164_L	192_S	0.757	0.10
323_P	327_L	0.756	0.10
432_P	450_K	0.756	0.10
79_S	105_V	0.755	0.10
354_K	372_I	0.755	0.10
456_V	493_G	0.754	0.10
170_T	222_E	0.752	0.10
25_S	36_A	0.751	0.10
106_N	166_E	0.750	0.10
427_M	437_D	0.749	0.10
387_A	403_Q	0.745	0.10
12_E	66_Q	0.744	0.10
298_V	365_S	0.743	0.10
433_Y	450_K	0.741	0.10
93_A	144_K	0.739	0.10
463_D	486_V	0.735	0.10
456_V	462_V	0.735	0.10
461_V	494_S	0.735	0.10
116_S	143_F	0.734	0.10
120_K	133_L	0.732	0.10
126_L	140_T	0.731	0.10
471_L	474_H	0.731	0.10
462_V	467_S	0.730	0.10
93_A	143_F	0.729	0.10
469_S	480_V	0.728	0.10
25_S	108_Y	0.725	0.09
93_A	166_E	0.723	0.09
397_V	453_D	0.720	0.09
94_Y	145_D	0.718	0.09
299_K	310_K	0.718	0.09
126_L	208_A	0.718	0.09
143_F	148_S	0.717	0.09
3_V	52_N	0.716	0.09
133_L	144_K	0.716	0.09
453_D	478_M	0.715	0.09
175_T	225_S	0.712	0.09
286_Q	294_T	0.712	0.09
475_H	495_N	0.712	0.09
301_V	357_V	0.712	0.09
10_L	91_S	0.712	0.09
468_N	485_N	0.709	0.09
144_K	191_E	0.708	0.09
478_M	491_S	0.708	0.09
479_D	485_N	0.708	0.09
255_P	276_Q	0.707	0.09
410_D	435_V	0.707	0.09
320_I	328_S	0.706	0.09
89_K	190_Q	0.702	0.09
435_V	452_S	0.698	0.09
12_E	116_S	0.698	0.09
252_V	261_I	0.697	0.09
204_Y	210_R	0.695	0.09
4_F	114_I	0.692	0.09
485_N	492_R	0.692	0.09
448_F	453_D	0.691	0.09
477_V	481_W	0.691	0.09
433_Y	443_N	0.690	0.09
31_K	190_Q	0.690	0.09
85_L	143_F	0.690	0.09
327_L	332_N	0.689	0.09
188_K	191_E	0.689	0.09
250_D	272_P	0.689	0.09
94_Y	137_I	0.689	0.09
79_S	149_S	0.688	0.09
474_H	491_S	0.687	0.09
246_K	271_E	0.687	0.09
322_D	326_T	0.687	0.09
61_V	82_S	0.685	0.09
140_T	178_N	0.685	0.09
487_P	492_R	0.685	0.09
116_S	120_K	0.683	0.09
43_S	74_K	0.682	0.09
89_K	192_S	0.681	0.09
461_V	465_R	0.680	0.09
478_M	481_W	0.680	0.09
485_N	491_S	0.679	0.09
10_L	121_A	0.679	0.09
130_N	156_K	0.679	0.09
416_L	431_V	0.677	0.09
475_H	485_N	0.675	0.09
116_S	144_K	0.674	0.09
470_P	494_S	0.671	0.09
35_K	127_N	0.670	0.09
84_K	151_D	0.670	0.09
473_N	489_Y	0.669	0.09
480_V	490_V	0.669	0.09
410_D	419_Y	0.667	0.09
7_D	25_S	0.667	0.09
474_H	494_S	0.666	0.09
472_E	475_H	0.666	0.09
451_G	465_R	0.665	0.09
473_N	488_N	0.665	0.09
68_I	109_T	0.663	0.09
246_K	264_K	0.663	0.09
451_G	458_P	0.662	0.09
346_A	358_N	0.662	0.09
93_A	122_M	0.660	0.09
79_S	89_K	0.660	0.09
37_V	128_D	0.658	0.09
166_E	191_E	0.658	0.09
451_G	486_V	0.656	0.09
474_H	490_V	0.655	0.09
61_V	273_A	0.654	0.09
343_A	347_A	0.654	0.09
252_V	264_K	0.653	0.09
41_D	58_H	0.652	0.09
51_D	142_D	0.652	0.09
25_S	82_S	0.651	0.09
468_N	474_H	0.651	0.09
186_F	190_Q	0.649	0.09
470_P	486_V	0.649	0.09
489_Y	492_R	0.649	0.09
4_F	96_E	0.647	0.09
477_V	491_S	0.647	0.09
489_Y	494_S	0.644	0.09
185_D	210_R	0.643	0.09
459_F	468_N	0.643	0.09
95_I	121_A	0.642	0.09
152_D	156_K	0.642	0.09
454_K	468_N	0.639	0.09
486_V	491_S	0.639	0.09
421_P	431_V	0.639	0.09
4_F	46_S	0.639	0.09
482_A	493_G	0.639	0.09
473_N	483_K	0.638	0.09
325_E	328_S	0.637	0.09
25_S	159_D	0.637	0.09
466_P	475_H	0.634	0.09
456_V	475_H	0.634	0.09
475_H	482_A	0.633	0.09
466_P	489_Y	0.632	0.09
67_W	139_S	0.632	0.09
414_P	450_K	0.630	0.09
280_Q	284_A	0.629	0.09
14_D	192_S	0.629	0.09
66_Q	133_L	0.628	0.09
389_N	392_D	0.626	0.09
128_D	169_K	0.626	0.09
459_F	494_S	0.626	0.09
120_K	148_S	0.625	0.09
452_S	456_V	0.623	0.09
97_E	161_I	0.622	0.09
283_Q	294_T	0.622	0.09
459_F	480_V	0.621	0.09
66_Q	95_I	0.620	0.09
452_S	462_V	0.620	0.09
454_K	465_R	0.620	0.09
28_V	120_K	0.618	0.09
284_A	291_G	0.617	0.09
97_E	204_Y	0.616	0.09
487_P	495_N	0.615	0.09
473_N	487_P	0.614	0.08
247_K	264_K	0.614	0.08
453_D	459_F	0.614	0.08
490_V	494_S	0.614	0.08
456_V	472_E	0.613	0.08
3_V	207_K	0.613	0.08
60_H	194_G	0.612	0.08
486_V	495_N	0.612	0.08
458_P	471_L	0.610	0.08
3_V	37_V	0.610	0.08
464_Y	490_V	0.609	0.08
329_A	354_K	0.605	0.08
464_Y	493_G	0.604	0.08
467_S	481_W	0.604	0.08
78_L	89_K	0.602	0.08
10_L	25_S	0.602	0.08
66_Q	127_N	0.600	0.08
251_G	259_L	0.600	0.08
455_E	459_F	0.599	0.08
70_L	109_T	0.597	0.08
59_D	204_Y	0.596	0.08
43_S	127_N	0.595	0.08
15_K	78_L	0.595	0.08
470_P	491_S	0.595	0.08
456_V	478_M	0.594	0.08
467_S	472_E	0.594	0.08
452_S	471_L	0.592	0.08
185_D	209_Y	0.592	0.08
269_N	360_D	0.592	0.08
474_H	480_V	0.592	0.08
66_Q	121_A	0.591	0.08
324_G	353_Q	0.590	0.08
182_I	194_G	0.590	0.08
468_N	491_S	0.590	0.08
316_L	349_E	0.590	0.08
153_K	205_S	0.589	0.08
466_P	488_N	0.586	0.08
478_M	493_G	0.586	0.08
29_K	85_L	0.584	0.08
467_S	480_V	0.584	0.08
32_K	150_A	0.582	0.08
311_D	364_R	0.582	0.08
146_K	151_D	0.582	0.08
463_D	475_H	0.581	0.08
479_D	487_P	0.580	0.08
435_V	462_V	0.580	0.08
356_M	368_V	0.579	0.08
27_M	62_G	0.578	0.08
18_K	48_K	0.577	0.08
347_A	355_D	0.577	0.08
408_I	425_L	0.575	0.08
11_S	22_E	0.575	0.08
253_S	272_P	0.574	0.08
477_V	489_Y	0.574	0.08
85_L	95_I	0.573	0.08
417_L	422_K	0.572	0.08
255_P	278_A	0.571	0.08
23_L	27_M	0.571	0.08
485_N	494_S	0.571	0.08
482_A	494_S	0.569	0.08
457_K	488_N	0.569	0.08
456_V	484_H	0.568	0.08
246_K	252_V	0.568	0.08
284_A	294_T	0.566	0.08
250_D	361_A	0.566	0.08
247_K	258_Y	0.565	0.08
340_T	353_Q	0.565	0.08
482_A	492_R	0.563	0.08
129_I	138_F	0.562	0.08
405_G	413_I	0.561	0.08
35_K	95_I	0.561	0.08
73_M	80_S	0.561	0.08
27_M	51_D	0.560	0.08
305_L	365_S	0.557	0.08
160_K	215_H	0.557	0.08
33_A	51_D	0.556	0.08
78_L	164_L	0.556	0.08
468_N	473_N	0.554	0.08
438_G	442_K	0.554	0.08
106_N	134_P	0.553	0.08
467_S	476_G	0.551	0.08
105_V	144_K	0.551	0.08
84_K	149_S	0.550	0.08
480_V	487_P	0.549	0.08
459_F	482_A	0.548	0.08
79_S	162_N	0.546	0.08
483_K	491_S	0.546	0.08
106_N	116_S	0.545	0.08
289_G	314_T	0.544	0.08
12_E	133_L	0.543	0.08
43_S	93_A	0.542	0.08
414_P	436_V	0.541	0.08
434_N	437_D	0.540	0.08
34_F	61_V	0.538	0.08
255_P	261_I	0.537	0.08
467_S	493_G	0.536	0.08
16_R	172_Y	0.535	0.08
5_E	107_A	0.534	0.08
321_T	324_G	0.534	0.08
302_G	314_T	0.534	0.08
464_Y	469_S	0.533	0.08
82_S	159_D	0.532	0.08
432_P	452_S	0.530	0.08
467_S	474_H	0.530	0.08
459_F	484_H	0.529	0.08
476_G	492_R	0.526	0.08
91_S	137_I	0.526	0.08
166_E	170_T	0.525	0.08
474_H	477_V	0.525	0.08
455_E	476_G	0.524	0.08
401_A	411_V	0.524	0.08
15_K	158_I	0.522	0.08
472_E	478_M	0.521	0.08
38_A	51_D	0.519	0.08
48_K	94_Y	0.518	0.08
469_S	490_V	0.517	0.08
49_G	100_L	0.517	0.08
278_A	282_E	0.516	0.08
453_D	469_S	0.515	0.08
130_N	143_F	0.515	0.08
484_H	492_R	0.514	0.08
116_S	166_E	0.514	0.08
417_L	441_L	0.514	0.08
149_S	155_E	0.512	0.08
255_P	285_K	0.510	0.08
365_S	369_T	0.510	0.08
288_E	306_Y	0.510	0.08
15_K	25_S	0.509	0.08
459_F	493_G	0.506	0.08
291_G	356_M	0.506	0.08
58_H	169_K	0.504	0.08
85_L	167_D	0.503	0.08
237_K	240_E	0.503	0.08
453_D	458_P	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2bk6A	6	0.2592	80.9	0.976	Contact Map
3kwoA	6	0.2522	78.9	0.977	Contact Map
1jigA	6	0.2487	77.4	0.977	Contact Map
2chpA	6	0.2522	75.5	0.977	Contact Map
1n1qA	6	0.2487	75.4	0.977	Contact Map
3iq1A	6	0.2644	73.7	0.978	Contact Map
1ji5A	6	0.2417	71.4	0.978	Contact Map
1o9rA	6	0.275	71.3	0.978	Contact Map
4m32A	6	0.2732	69.7	0.978	Contact Map
2yjkA	6	0.2662	66.3	0.979	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0131 seconds.