YONF - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YONF - SPBc2 prophage-derived uncharacterized protein YonF

UniProt:	O31952	Sequences: MTSHKNFTTDRNKHSRGINIFKKGNNFKKKSKSERLMDGIGAWTSFYRANPHRFVKEYLGITLKLFQCILIYMMVHNHYFMYLASRGQGKTWLTSVYCCVQAILFPGTKIVIASGTKGQAREVIEKIDDLRKESPNLRREIEDLKTSTNDAKVEFHNGSWIKIVASNDGARSKRANLLIVDEFRMVDFEIISKVLRKFLTAPRSPKYLEKEEYAHLKERNKEIYLSSCWYKVHWSFNRFITYYNAMMKGSKYFVCGLPYQIAIKEGLLDKDQVRDEMAEEDFDPIGWSMEMEALWFGESEKAYFKFEDIEKNRKLASPLFPPDYYSLIKDSNFKYEGKKPGEIRLVSNDIAGMAGKDNDASVYTVFRLIPNSNGYDRHIVYMESIVGGHTGTQATRIRQIYEDYDCDYIVLDTQSIGLGVYDALCQPLYDKERAKEYEPFSCINDERMAARCTYQNAEKVIYSIKGNAQLNSEIAVLLKDGFKRGKIKIPINENEGKEYLKRFKGYEGLSPEVKGKFLSSYAQITLLINEMINLEAEYSDNGQVKLKEPKSKRKDRYSSVAYGNYIATVLERQLNKQTEYDVEDELVYF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	589 (470)
Sequences:	177 (143)
Seq/√Len:	6.6

BACSU - YONF

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
171_R	290_E	6.388	1.00
102_A	110_I	4.034	0.95
348_N	397_I	3.834	0.94
56_K	68_C	3.676	0.92
226_S	359_D	3.533	0.91
182_E	349_D	3.298	0.87
166_S	304_F	3.243	0.86
346_V	365_V	3.185	0.85
365_V	400_I	2.903	0.79
290_E	359_D	2.862	0.78
226_S	290_E	2.816	0.77
67_Q	89_G	2.740	0.75
180_V	365_V	2.717	0.74
91_T	225_L	2.638	0.72
273_V	276_E	2.555	0.69
386_V	483_K	2.494	0.67
171_R	359_D	2.477	0.67
171_R	226_S	2.420	0.65
159_S	224_Y	2.418	0.65
269_D	479_K	2.341	0.62
348_N	363_Y	2.333	0.62
273_V	277_M	2.324	0.62
157_N	417_G	2.302	0.61
130_L	350_I	2.293	0.60
172_S	348_N	2.284	0.60
541_N	545_K	2.267	0.60
171_R	344_R	2.240	0.59
61_I	436_E	2.239	0.59
255_C	291_M	2.230	0.58
239_F	254_V	2.183	0.57
527_L	531_M	2.172	0.56
67_Q	182_E	2.130	0.55
67_Q	349_D	2.130	0.55
199_L	410_V	2.093	0.53
179_I	225_L	2.075	0.53
67_Q	86_R	2.063	0.52
55_V	71_I	2.034	0.51
412_D	466_G	2.017	0.50
63_L	67_Q	2.003	0.50
51_P	352_G	1.975	0.49
51_P	181_D	1.975	0.49
203_R	266_G	1.918	0.47
112_I	299_S	1.899	0.46
344_R	365_V	1.897	0.46
239_F	295_W	1.872	0.45
86_R	182_E	1.850	0.44
86_R	349_D	1.850	0.44
63_L	74_M	1.831	0.43
92_W	295_W	1.826	0.43
90_K	181_D	1.797	0.42
495_E	498_E	1.792	0.42
87_G	412_D	1.751	0.41
159_S	417_G	1.748	0.40
181_D	256_G	1.744	0.40
61_I	298_E	1.725	0.40
181_D	293_A	1.714	0.39
89_G	359_D	1.714	0.39
380_V	414_Q	1.712	0.39
100_V	123_V	1.706	0.39
330_D	335_Y	1.698	0.39
471_N	506_Y	1.672	0.38
89_G	181_D	1.656	0.37
336_E	378_H	1.652	0.37
102_A	155_F	1.640	0.37
168_D	286_G	1.638	0.37
185_M	289_M	1.635	0.36
175_A	178_L	1.633	0.36
180_V	311_K	1.628	0.36
66_F	258_P	1.622	0.36
349_D	417_G	1.620	0.36
182_E	417_G	1.620	0.36
276_E	279_E	1.620	0.36
229_W	289_M	1.618	0.36
106_P	444_N	1.614	0.36
473_E	523_Q	1.587	0.35
412_D	415_S	1.573	0.34
515_G	519_S	1.572	0.34
181_D	266_G	1.569	0.34
361_S	416_I	1.564	0.34
161_I	226_S	1.558	0.34
87_G	295_W	1.553	0.34
172_S	182_E	1.550	0.34
172_S	349_D	1.550	0.34
361_S	401_Y	1.521	0.33
184_R	188_F	1.519	0.33
541_N	544_V	1.502	0.32
270_K	274_R	1.494	0.32
361_S	393_Q	1.488	0.32
373_N	378_H	1.487	0.32
226_S	390_T	1.485	0.31
84_A	90_K	1.485	0.31
254_V	412_D	1.483	0.31
89_G	168_D	1.480	0.31
287_W	291_M	1.467	0.31
109_K	160_W	1.467	0.31
157_N	221_K	1.462	0.31
330_D	333_F	1.453	0.30
316_A	320_F	1.429	0.30
55_V	61_I	1.425	0.30
331_S	336_E	1.425	0.30
86_R	290_E	1.406	0.29
227_S	290_E	1.401	0.29
152_K	347_S	1.395	0.29
295_W	414_Q	1.391	0.29
181_D	359_D	1.387	0.28
181_D	186_V	1.380	0.28
158_G	417_G	1.378	0.28
56_K	96_V	1.378	0.28
47_Y	53_R	1.369	0.28
85_S	251_K	1.366	0.28
66_F	197_K	1.365	0.28
542_G	545_K	1.355	0.27
135_P	227_S	1.354	0.27
242_Y	254_V	1.348	0.27
99_C	393_Q	1.341	0.27
174_R	412_D	1.334	0.27
337_G	503_F	1.330	0.27
482_F	489_I	1.328	0.27
121_R	226_S	1.327	0.27
87_G	227_S	1.323	0.26
110_I	177_L	1.313	0.26
332_N	336_E	1.311	0.26
330_D	336_E	1.311	0.26
86_R	171_R	1.302	0.26
67_Q	359_D	1.302	0.26
87_G	92_W	1.298	0.26
158_G	351_A	1.298	0.26
181_D	225_L	1.288	0.25
47_Y	57_E	1.272	0.25
459_K	479_K	1.271	0.25
229_W	233_H	1.269	0.25
242_Y	412_D	1.264	0.25
90_K	287_W	1.254	0.25
320_F	346_V	1.247	0.24
318_P	321_P	1.246	0.24
412_D	534_L	1.244	0.24
230_Y	471_N	1.240	0.24
463_S	467_N	1.236	0.24
263_I	268_L	1.230	0.24
86_R	135_P	1.230	0.24
123_V	169_G	1.226	0.24
181_D	228_C	1.225	0.24
522_A	526_L	1.224	0.24
512_E	516_K	1.222	0.24
91_T	251_K	1.217	0.24
539_S	543_Q	1.214	0.23
66_F	90_K	1.209	0.23
47_Y	104_L	1.206	0.23
109_K	155_F	1.205	0.23
189_E	499_Y	1.204	0.23
289_M	518_L	1.198	0.23
70_L	391_G	1.194	0.23
268_L	273_V	1.189	0.23
90_K	293_A	1.183	0.23
166_S	497_K	1.181	0.23
165_A	184_R	1.180	0.23
99_C	363_Y	1.177	0.22
397_I	477_L	1.172	0.22
404_Y	516_K	1.170	0.22
193_K	467_N	1.166	0.22
120_A	365_V	1.166	0.22
89_G	235_S	1.165	0.22
62_T	276_E	1.164	0.22
259_Y	515_G	1.164	0.22
351_A	362_V	1.163	0.22
226_S	299_S	1.161	0.22
86_R	227_S	1.159	0.22
47_Y	50_N	1.157	0.22
91_T	363_Y	1.156	0.22
290_E	344_R	1.151	0.22
81_M	226_S	1.151	0.22
86_R	157_N	1.151	0.22
61_I	84_A	1.147	0.22
487_I	527_L	1.145	0.22
244_N	519_S	1.140	0.22
90_K	197_K	1.139	0.22
497_K	501_K	1.138	0.21
347_S	366_F	1.135	0.21
344_R	404_Y	1.135	0.21
126_K	157_N	1.131	0.21
183_F	224_Y	1.118	0.21
126_K	174_R	1.117	0.21
412_D	463_S	1.109	0.21
366_F	379_I	1.108	0.21
227_S	259_Y	1.104	0.21
185_M	229_W	1.101	0.21
86_R	91_T	1.099	0.21
258_P	293_A	1.099	0.21
344_R	516_K	1.097	0.20
470_L	497_K	1.092	0.20
344_R	414_Q	1.091	0.20
149_N	159_S	1.090	0.20
283_D	427_P	1.084	0.20
172_S	287_W	1.082	0.20
284_P	510_S	1.082	0.20
141_I	189_E	1.082	0.20
50_N	55_V	1.076	0.20
478_L	522_A	1.075	0.20
44_T	249_G	1.073	0.20
102_A	127_I	1.072	0.20
172_S	195_L	1.067	0.20
134_S	228_C	1.064	0.20
97_Y	393_Q	1.061	0.20
107_G	168_D	1.060	0.20
487_I	500_L	1.060	0.20
344_R	367_R	1.057	0.20
97_Y	226_S	1.050	0.19
87_G	515_G	1.049	0.19
91_T	121_R	1.047	0.19
89_G	230_Y	1.043	0.19
364_T	379_I	1.041	0.19
70_L	84_A	1.038	0.19
266_G	294_L	1.034	0.19
397_I	424_L	1.032	0.19
171_R	227_S	1.030	0.19
70_L	153_V	1.027	0.19
362_V	365_V	1.026	0.19
227_S	230_Y	1.026	0.19
251_K	419_G	1.024	0.19
86_R	159_S	1.022	0.19
463_S	466_G	1.020	0.19
188_F	192_S	1.020	0.19
496_G	502_R	1.016	0.19
66_F	179_I	1.015	0.19
240_I	409_I	1.014	0.19
55_V	153_V	1.013	0.19
131_R	334_K	1.008	0.18
163_I	201_A	1.008	0.18
102_A	161_I	1.006	0.18
317_S	397_I	0.999	0.18
349_D	412_D	0.999	0.18
182_E	412_D	0.999	0.18
348_N	361_S	0.998	0.18
488_K	519_S	0.998	0.18
386_V	389_H	0.995	0.18
331_S	337_G	0.992	0.18
99_C	140_E	0.991	0.18
330_D	334_K	0.991	0.18
47_Y	58_Y	0.990	0.18
261_I	415_S	0.984	0.18
221_K	455_Q	0.983	0.18
61_I	65_L	0.979	0.18
201_A	257_L	0.977	0.18
304_F	394_A	0.975	0.18
67_Q	290_E	0.974	0.18
48_R	111_V	0.974	0.18
463_S	497_K	0.973	0.18
34_E	38_D	0.973	0.18
241_T	252_Y	0.971	0.18
91_T	263_I	0.968	0.18
172_S	299_S	0.968	0.18
178_L	502_R	0.966	0.17
172_S	303_Y	0.966	0.17
420_V	424_L	0.960	0.17
171_R	252_Y	0.959	0.17
157_N	287_W	0.959	0.17
530_E	533_N	0.958	0.17
87_G	259_Y	0.958	0.17
350_I	420_V	0.957	0.17
276_E	480_D	0.957	0.17
536_A	544_V	0.955	0.17
53_R	519_S	0.954	0.17
124_I	478_L	0.954	0.17
89_G	226_S	0.954	0.17
419_G	423_A	0.953	0.17
81_M	348_N	0.953	0.17
381_Y	412_D	0.952	0.17
361_S	390_T	0.951	0.17
479_K	483_K	0.951	0.17
115_G	119_Q	0.946	0.17
475_A	478_L	0.946	0.17
172_S	483_K	0.943	0.17
235_S	318_P	0.942	0.17
351_A	358_N	0.942	0.17
278_A	363_Y	0.941	0.17
230_Y	361_S	0.940	0.17
71_I	93_L	0.940	0.17
76_H	398_R	0.939	0.17
412_D	515_G	0.936	0.17
225_L	314_K	0.933	0.17
42_A	45_S	0.933	0.17
67_Q	424_L	0.932	0.17
84_A	225_L	0.931	0.17
51_P	225_L	0.930	0.17
120_A	163_I	0.930	0.17
401_Y	407_D	0.930	0.17
268_L	281_D	0.927	0.17
112_I	471_N	0.927	0.17
114_S	281_D	0.926	0.17
67_Q	91_T	0.926	0.17
168_D	445_D	0.925	0.17
412_D	509_L	0.925	0.17
379_I	415_S	0.924	0.17
50_N	224_Y	0.924	0.17
172_S	297_G	0.923	0.17
31_S	45_S	0.920	0.17
116_T	347_S	0.917	0.16
438_E	445_D	0.916	0.16
169_G	228_C	0.915	0.16
149_N	236_F	0.915	0.16
363_Y	427_P	0.914	0.16
447_R	456_N	0.911	0.16
135_P	414_Q	0.910	0.16
76_H	298_E	0.907	0.16
312_N	482_F	0.904	0.16
344_R	509_L	0.901	0.16
230_Y	289_M	0.901	0.16
460_V	465_K	0.901	0.16
397_I	417_G	0.900	0.16
91_T	171_R	0.899	0.16
87_G	174_R	0.898	0.16
267_L	270_K	0.898	0.16
178_L	195_L	0.897	0.16
334_K	337_G	0.896	0.16
63_L	351_A	0.896	0.16
122_E	172_S	0.896	0.16
84_A	256_G	0.894	0.16
130_L	233_H	0.893	0.16
48_R	445_D	0.893	0.16
221_K	253_F	0.893	0.16
232_V	289_M	0.891	0.16
159_S	286_G	0.890	0.16
184_R	226_S	0.890	0.16
228_C	293_A	0.890	0.16
305_K	397_I	0.890	0.16
67_Q	226_S	0.887	0.16
344_R	407_D	0.886	0.16
47_Y	228_C	0.886	0.16
316_A	488_K	0.884	0.16
85_S	308_D	0.884	0.16
66_F	225_L	0.883	0.16
66_F	123_V	0.882	0.16
182_E	359_D	0.881	0.16
349_D	359_D	0.881	0.16
414_Q	466_G	0.881	0.16
237_N	279_E	0.881	0.16
186_V	359_D	0.879	0.16
380_V	404_Y	0.879	0.16
67_Q	227_S	0.877	0.16
345_L	438_E	0.875	0.16
105_F	351_A	0.874	0.16
366_F	503_F	0.873	0.16
83_L	412_D	0.873	0.16
241_T	267_L	0.872	0.16
350_I	441_S	0.872	0.16
481_G	521_Y	0.870	0.16
36_L	39_G	0.870	0.16
383_E	394_A	0.870	0.16
91_T	349_D	0.869	0.15
91_T	182_E	0.869	0.15
155_F	161_I	0.869	0.15
70_L	226_S	0.868	0.15
534_L	537_E	0.867	0.15
282_F	311_K	0.867	0.15
73_M	468_A	0.866	0.15
107_G	128_D	0.860	0.15
228_C	291_M	0.859	0.15
539_S	542_G	0.857	0.15
114_S	257_L	0.857	0.15
333_F	336_E	0.856	0.15
54_F	108_T	0.855	0.15
118_G	418_L	0.855	0.15
74_M	161_I	0.854	0.15
185_M	249_G	0.850	0.15
348_N	401_Y	0.849	0.15
261_I	397_I	0.848	0.15
512_E	515_G	0.844	0.15
405_D	438_E	0.840	0.15
420_V	490_P	0.840	0.15
89_G	182_E	0.840	0.15
89_G	349_D	0.840	0.15
71_I	528_I	0.839	0.15
186_V	275_D	0.839	0.15
96_V	184_R	0.833	0.15
436_E	487_I	0.832	0.15
351_A	527_L	0.832	0.15
60_G	187_D	0.831	0.15
526_L	530_E	0.831	0.15
118_G	147_S	0.829	0.15
74_M	103_I	0.828	0.15
163_I	295_W	0.827	0.15
224_Y	238_R	0.827	0.15
317_S	416_I	0.822	0.15
351_A	417_G	0.821	0.15
87_G	463_S	0.821	0.15
281_D	448_M	0.818	0.15
91_T	139_R	0.817	0.14
473_E	500_L	0.814	0.14
417_G	424_L	0.814	0.14
71_I	130_L	0.812	0.14
346_V	398_R	0.811	0.14
40_I	469_Q	0.810	0.14
290_E	471_N	0.810	0.14
171_R	185_M	0.809	0.14
228_C	295_W	0.808	0.14
61_I	91_T	0.808	0.14
176_N	291_M	0.806	0.14
352_G	422_D	0.805	0.14
226_S	349_D	0.805	0.14
182_E	226_S	0.805	0.14
98_C	142_E	0.804	0.14
63_L	86_R	0.803	0.14
37_M	44_T	0.800	0.14
483_K	487_I	0.799	0.14
398_R	402_E	0.798	0.14
94_T	226_S	0.796	0.14
521_Y	524_I	0.794	0.14
290_E	386_V	0.793	0.14
134_S	517_F	0.792	0.14
82_Y	112_I	0.787	0.14
312_N	487_I	0.787	0.14
70_L	485_G	0.787	0.14
39_G	62_T	0.786	0.14
90_K	417_G	0.786	0.14
227_S	414_Q	0.783	0.14
344_R	512_E	0.782	0.14
266_G	272_Q	0.779	0.14
277_M	394_A	0.778	0.14
220_N	484_R	0.778	0.14
153_V	460_V	0.776	0.14
525_T	529_N	0.775	0.14
54_F	355_G	0.774	0.14
86_R	417_G	0.774	0.14
42_A	144_L	0.773	0.14
495_E	501_K	0.772	0.14
502_R	521_Y	0.772	0.14
104_L	474_I	0.770	0.14
64_K	96_V	0.768	0.14
102_A	351_A	0.767	0.14
227_S	411_L	0.766	0.14
496_G	499_Y	0.765	0.14
77_N	85_S	0.765	0.14
70_L	236_F	0.764	0.14
48_R	203_R	0.764	0.14
227_S	298_E	0.763	0.14
330_D	438_E	0.762	0.14
66_F	88_Q	0.761	0.13
154_E	223_I	0.756	0.13
67_Q	114_S	0.756	0.13
305_K	399_Q	0.755	0.13
348_N	393_Q	0.754	0.13
92_W	516_K	0.751	0.13
250_S	288_S	0.750	0.13
166_S	470_L	0.750	0.13
90_K	424_L	0.750	0.13
171_R	420_V	0.749	0.13
123_V	265_E	0.749	0.13
240_I	243_Y	0.748	0.13
464_I	528_I	0.746	0.13
93_L	225_L	0.741	0.13
114_S	361_S	0.740	0.13
452_C	455_Q	0.739	0.13
271_D	274_R	0.738	0.13
361_S	383_E	0.738	0.13
184_R	471_N	0.738	0.13
332_N	505_G	0.737	0.13
95_S	186_V	0.736	0.13
125_E	180_V	0.736	0.13
83_L	256_G	0.734	0.13
91_T	290_E	0.731	0.13
32_K	495_E	0.730	0.13
82_Y	362_V	0.729	0.13
495_E	502_R	0.728	0.13
230_Y	519_S	0.727	0.13
509_L	516_K	0.726	0.13
81_M	97_Y	0.726	0.13
109_K	351_A	0.723	0.13
227_S	381_Y	0.721	0.13
239_F	407_D	0.721	0.13
236_F	496_G	0.719	0.13
30_K	40_I	0.717	0.13
235_S	295_W	0.717	0.13
309_I	355_G	0.716	0.13
118_G	357_D	0.716	0.13
99_C	130_L	0.716	0.13
188_F	250_S	0.715	0.13
128_D	447_R	0.712	0.13
360_A	509_L	0.712	0.13
184_R	229_W	0.710	0.13
288_S	427_P	0.709	0.13
61_I	83_L	0.708	0.13
58_Y	503_F	0.707	0.13
57_E	102_A	0.705	0.13
393_Q	412_D	0.705	0.13
53_R	104_L	0.704	0.13
115_G	412_D	0.701	0.12
71_I	346_V	0.701	0.12
90_K	225_L	0.699	0.12
40_I	154_E	0.698	0.12
87_G	220_N	0.696	0.12
373_N	527_L	0.696	0.12
83_L	226_S	0.696	0.12
347_S	537_E	0.696	0.12
83_L	294_L	0.695	0.12
463_S	516_K	0.693	0.12
91_T	173_K	0.692	0.12
342_E	367_R	0.691	0.12
59_L	95_S	0.687	0.12
125_E	252_Y	0.687	0.12
436_E	545_K	0.686	0.12
290_E	295_W	0.686	0.12
172_S	222_E	0.686	0.12
127_I	178_L	0.685	0.12
181_D	191_I	0.685	0.12
495_E	531_M	0.684	0.12
334_K	400_I	0.684	0.12
184_R	289_M	0.682	0.12
308_D	348_N	0.682	0.12
344_R	380_V	0.682	0.12
128_D	146_T	0.681	0.12
389_H	483_K	0.679	0.12
274_R	489_I	0.678	0.12
224_Y	430_D	0.678	0.12
235_S	359_D	0.678	0.12
38_D	180_V	0.676	0.12
120_A	306_F	0.675	0.12
135_P	517_F	0.674	0.12
330_D	345_L	0.674	0.12
70_L	528_I	0.673	0.12
273_V	278_A	0.673	0.12
345_L	458_E	0.670	0.12
91_T	310_E	0.669	0.12
40_I	50_N	0.668	0.12
51_P	254_V	0.668	0.12
93_L	187_D	0.667	0.12
445_D	449_A	0.666	0.12
153_V	518_L	0.664	0.12
396_R	399_Q	0.664	0.12
319_L	344_R	0.663	0.12
30_K	347_S	0.660	0.12
259_Y	483_K	0.659	0.12
130_L	229_W	0.658	0.12
343_I	493_E	0.658	0.12
71_I	96_V	0.658	0.12
80_F	255_C	0.657	0.12
74_M	299_S	0.649	0.12
180_V	244_N	0.647	0.12
505_G	508_G	0.645	0.12
304_F	437_Y	0.644	0.12
115_G	172_S	0.643	0.12
155_F	417_G	0.642	0.12
71_I	153_V	0.642	0.12
142_E	388_G	0.642	0.12
315_L	320_F	0.641	0.12
192_S	196_R	0.639	0.12
135_P	259_Y	0.638	0.11
336_E	503_F	0.638	0.11
304_F	410_V	0.638	0.11
412_D	523_Q	0.637	0.11
223_I	426_Q	0.637	0.11
140_E	158_G	0.635	0.11
444_N	448_M	0.635	0.11
161_I	359_D	0.635	0.11
317_S	320_F	0.634	0.11
117_K	405_D	0.634	0.11
67_Q	171_R	0.633	0.11
157_N	290_E	0.633	0.11
176_N	282_F	0.632	0.11
127_I	155_F	0.631	0.11
277_M	480_D	0.631	0.11
250_S	308_D	0.630	0.11
135_P	515_G	0.629	0.11
87_G	113_A	0.628	0.11
114_S	352_G	0.627	0.11
271_D	363_Y	0.627	0.11
489_I	497_K	0.626	0.11
98_C	186_V	0.626	0.11
293_A	362_V	0.625	0.11
116_T	181_D	0.625	0.11
93_L	122_E	0.623	0.11
193_K	200_T	0.622	0.11
68_C	71_I	0.621	0.11
239_F	404_Y	0.618	0.11
71_I	118_G	0.618	0.11
70_L	102_A	0.617	0.11
295_W	360_A	0.617	0.11
50_N	54_F	0.617	0.11
161_I	527_L	0.617	0.11
42_A	47_Y	0.615	0.11
87_G	512_E	0.615	0.11
537_E	544_V	0.614	0.11
51_P	55_V	0.610	0.11
518_L	530_E	0.610	0.11
173_K	265_E	0.610	0.11
295_W	298_E	0.609	0.11
342_E	521_Y	0.608	0.11
336_E	356_K	0.608	0.11
175_A	199_L	0.607	0.11
285_I	300_E	0.607	0.11
85_S	225_L	0.606	0.11
404_Y	515_G	0.603	0.11
50_N	94_T	0.603	0.11
54_F	520_S	0.601	0.11
195_L	292_E	0.601	0.11
366_F	445_D	0.600	0.11
181_D	412_D	0.600	0.11
131_R	156_H	0.599	0.11
59_L	141_I	0.598	0.11
268_L	415_S	0.594	0.11
304_F	481_G	0.590	0.11
381_Y	404_Y	0.589	0.11
250_S	448_M	0.588	0.11
31_S	34_E	0.587	0.11
90_K	393_Q	0.587	0.11
75_V	441_S	0.587	0.11
463_S	515_G	0.585	0.11
230_Y	298_E	0.585	0.11
141_I	254_V	0.585	0.11
68_C	110_I	0.585	0.11
173_K	466_G	0.584	0.11
509_L	512_E	0.583	0.11
394_A	518_L	0.582	0.11
72_Y	76_H	0.582	0.11
119_Q	268_L	0.582	0.11
243_Y	337_G	0.582	0.11
52_H	467_N	0.580	0.11
38_D	474_I	0.577	0.11
82_Y	415_S	0.576	0.11
73_M	102_A	0.575	0.11
102_A	347_S	0.575	0.11
172_S	355_G	0.574	0.11
267_L	275_D	0.573	0.11
50_N	463_S	0.573	0.11
181_D	417_G	0.571	0.11
146_T	366_F	0.570	0.11
225_L	256_G	0.569	0.10
380_V	465_K	0.569	0.10
123_V	175_A	0.568	0.10
90_K	174_R	0.568	0.10
85_S	171_R	0.565	0.10
347_S	371_N	0.564	0.10
133_E	393_Q	0.563	0.10
111_V	422_D	0.563	0.10
68_C	482_F	0.563	0.10
29_K	33_S	0.563	0.10
347_S	495_E	0.562	0.10
115_G	166_S	0.562	0.10
382_M	459_K	0.562	0.10
74_M	94_T	0.561	0.10
341_G	400_I	0.561	0.10
266_G	319_L	0.559	0.10
87_G	533_N	0.557	0.10
90_K	464_I	0.556	0.10
244_N	305_K	0.555	0.10
274_R	277_M	0.555	0.10
337_G	409_I	0.555	0.10
135_P	298_E	0.555	0.10
494_N	528_I	0.555	0.10
90_K	119_Q	0.553	0.10
106_P	187_D	0.552	0.10
194_V	232_V	0.552	0.10
43_W	178_L	0.551	0.10
56_K	97_Y	0.547	0.10
220_N	439_P	0.547	0.10
321_P	493_E	0.544	0.10
120_A	497_K	0.543	0.10
195_L	201_A	0.542	0.10
227_S	344_R	0.542	0.10
88_Q	197_K	0.542	0.10
314_K	440_F	0.541	0.10
237_N	317_S	0.541	0.10
110_I	234_W	0.540	0.10
47_Y	181_D	0.537	0.10
124_I	174_R	0.537	0.10
36_L	45_S	0.537	0.10
103_I	490_P	0.536	0.10
65_L	167_N	0.535	0.10
223_I	359_D	0.535	0.10
60_G	495_E	0.534	0.10
31_S	50_N	0.533	0.10
42_A	106_P	0.532	0.10
171_R	249_G	0.531	0.10
315_L	495_E	0.531	0.10
284_P	288_S	0.528	0.10
383_E	424_L	0.528	0.10
429_Y	474_I	0.528	0.10
273_V	279_E	0.527	0.10
242_Y	250_S	0.526	0.10
69_I	316_A	0.522	0.10
126_K	417_G	0.521	0.10
259_Y	289_M	0.520	0.10
93_L	175_A	0.518	0.10
443_I	453_T	0.518	0.10
181_D	294_L	0.518	0.10
181_D	474_I	0.516	0.10
135_P	230_Y	0.515	0.10
227_S	466_G	0.515	0.10
45_S	50_N	0.515	0.10
153_V	227_S	0.513	0.10
237_N	336_E	0.513	0.10
331_S	334_K	0.513	0.10
56_K	278_A	0.512	0.10
74_M	222_E	0.512	0.10
535_E	538_Y	0.512	0.10
78_H	221_K	0.509	0.10
380_V	427_P	0.507	0.10
169_G	332_N	0.507	0.10
255_C	356_K	0.506	0.10
320_F	520_S	0.505	0.10
114_S	500_L	0.504	0.10
311_K	402_E	0.504	0.10
288_S	340_P	0.503	0.10
53_R	222_E	0.502	0.10
355_G	383_E	0.501	0.10
177_L	223_I	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cpeA	1	0.8048	100	0.645	Contact Map
4idhA	1	0.7284	100	0.733	Contact Map
2o0jA	1	0.4618	100	0.739	Contact Map
4bijA	3	0.6842	100	0.774	Contact Map
4znkA	1	0.3939	100	0.793	Contact Map
3c6aA	1	0.3345	100	0.822	Contact Map
1vecA	2	0.3328	98.6	0.929	Contact Map
3iuyA	1	0.3447	98.5	0.932	Contact Map
2pl3A	1	0.3684	98.4	0.935	Contact Map
3fe2A	1	0.3684	98.4	0.935	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0131 seconds.