YLQG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YLQG - Uncharacterized protein YlqG

UniProt:	O31745	Sequences: MNIRNDVQKALQHLFGRTAVPQETSKVNEALNGEKRLLLGKVLRLLGDQHALIQVGNQTVQGKLETQLRPQAYYWFSYEKKTAEQTGRLQVVQSFDQNPKTIQDAAGKLLNAISVKTSNAALMMTGAMLKSKTPVTENDIKTAVRWMDTLPSQDTKKAVETVLFALKRDLPIHSEILNGVHAVKSPVPLHQHVSQLLQAIDQNPQQSQMMSKLKEAVTVLLNSEIDVHAERLIDKLISLTDNTKAPSPTNTAGSRELSTPAGSPGKASLPIANHTAEQGSIQEEPVKTAADIPIKEARQLLVKLTESAEKNSLQIVKEAANWIKAAASSGDSKSLAASAVLQAAQVTDQEAEVFLKAVQQTAPHLADKADVLSFLSKVKTAIGARDEVAFIKAFEQGSAVTSGEMQSIKLALSALRASHEVAEPVKQEADQLFHKLNGQLFMQQDHPSYSQIVMSFPMFSKSGVQDMTVLFKGKKEADGKLDPSHCRLLFLLQLDTLKETVVDCLVQQKVMTITIETDFELQAAIDPMVPALKQGLKEMGYSLSGVNAKKRVHTEEKASIDQYITSISDQEVDVKI	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	576 (526)
Sequences:	259 (252)
Seq/√Len:	11.0

BACSU - YLQG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
383_G	387_E	4.762	1.00
118_S	121_A	4.348	1.00
498_K	540_G	3.931	0.99
162_V	165_A	3.636	0.98
62_G	78_Y	3.485	0.98
438_G	490_F	3.316	0.97
485_H	498_K	3.130	0.96
486_C	490_F	3.059	0.95
383_G	490_F	2.873	0.93
62_G	89_L	2.788	0.92
79_E	90_Q	2.787	0.92
438_G	441_F	2.728	0.91
51_A	409_K	2.727	0.91
387_E	490_F	2.702	0.90
387_E	438_G	2.695	0.90
55_V	515_I	2.638	0.89
42_V	57_N	2.553	0.88
467_M	491_L	2.498	0.86
383_G	407_S	2.491	0.86
268_S	271_I	2.476	0.86
490_F	517_T	2.449	0.85
64_L	171_P	2.435	0.85
437_N	440_L	2.433	0.85
435_K	498_K	2.423	0.85
409_K	517_T	2.406	0.84
128_M	170_L	2.392	0.84
473_G	498_K	2.369	0.83
471_F	498_K	2.341	0.83
40_G	76_F	2.337	0.82
440_L	517_T	2.320	0.82
483_P	506_V	2.278	0.81
382_I	387_E	2.251	0.80
383_G	438_G	2.239	0.80
441_F	490_F	2.226	0.79
486_C	503_D	2.223	0.79
487_R	503_D	2.214	0.79
453_V	470_L	2.214	0.79
383_G	441_F	2.191	0.78
165_A	488_L	2.182	0.78
485_H	540_G	2.165	0.77
193_V	200_I	2.155	0.77
466_D	473_G	2.145	0.76
129_L	458_M	2.105	0.75
493_Q	499_E	2.071	0.74
44_R	47_G	2.062	0.73
40_G	68_L	2.059	0.73
472_K	483_P	2.022	0.72
383_G	412_L	2.013	0.72
215_E	220_L	2.010	0.71
35_K	78_Y	1.977	0.70
383_G	409_K	1.971	0.70
383_G	486_C	1.964	0.70
162_V	172_I	1.930	0.68
177_L	501_V	1.908	0.67
471_F	540_G	1.902	0.67
40_G	64_L	1.899	0.67
91_V	504_C	1.888	0.66
64_L	494_L	1.863	0.65
467_M	490_F	1.848	0.65
442_M	466_D	1.835	0.64
183_V	439_Q	1.834	0.64
494_L	500_T	1.829	0.64
59_T	89_L	1.812	0.63
456_F	500_T	1.805	0.63
64_L	78_Y	1.796	0.62
383_G	386_D	1.792	0.62
498_K	501_V	1.791	0.62
473_G	478_D	1.771	0.61
171_P	504_C	1.770	0.61
183_V	491_L	1.770	0.61
40_G	524_A	1.761	0.61
74_Y	466_D	1.743	0.60
491_L	504_C	1.734	0.60
491_L	503_D	1.729	0.59
162_V	524_A	1.725	0.59
277_E	281_I	1.725	0.59
36_R	56_G	1.698	0.58
479_G	494_L	1.691	0.58
455_S	491_L	1.690	0.57
469_V	532_L	1.683	0.57
473_G	489_L	1.681	0.57
492_L	541_Y	1.671	0.57
462_S	493_Q	1.669	0.57
485_H	507_Q	1.632	0.55
132_K	442_M	1.625	0.54
244_K	261_A	1.623	0.54
510_V	542_S	1.619	0.54
138_N	172_I	1.613	0.54
390_F	415_L	1.612	0.54
42_V	144_V	1.610	0.54
469_V	488_L	1.601	0.53
455_S	470_L	1.593	0.53
295_K	302_V	1.575	0.52
38_L	53_I	1.569	0.52
143_A	488_L	1.550	0.51
74_Y	473_G	1.546	0.51
472_K	491_L	1.546	0.51
502_V	520_E	1.539	0.50
438_G	486_C	1.531	0.50
129_L	139_D	1.504	0.49
44_R	540_G	1.497	0.48
383_G	440_L	1.479	0.47
136_T	139_D	1.472	0.47
64_L	500_T	1.471	0.47
455_S	564_I	1.468	0.47
472_K	516_E	1.467	0.47
251_T	272_A	1.462	0.47
489_L	532_L	1.459	0.46
51_A	545_G	1.458	0.46
109_L	179_G	1.451	0.46
45_L	489_L	1.450	0.46
488_L	535_G	1.438	0.45
38_L	89_L	1.437	0.45
47_G	70_P	1.436	0.45
87_G	548_A	1.435	0.45
275_T	283_E	1.433	0.45
487_R	490_F	1.426	0.45
56_G	462_S	1.422	0.45
138_N	406_Q	1.421	0.45
438_G	501_V	1.418	0.45
90_Q	117_T	1.414	0.44
437_N	490_F	1.407	0.44
487_R	501_V	1.406	0.44
494_L	530_P	1.404	0.44
236_L	285_P	1.400	0.44
448_S	505_L	1.394	0.43
487_R	505_L	1.381	0.43
509_K	517_T	1.378	0.43
51_A	486_C	1.376	0.43
58_Q	131_S	1.375	0.42
35_K	62_G	1.370	0.42
491_L	501_V	1.367	0.42
435_K	471_F	1.364	0.42
470_L	487_R	1.359	0.42
497_L	502_V	1.357	0.42
42_V	316_V	1.356	0.42
55_V	469_V	1.342	0.41
114_S	424_P	1.338	0.41
479_G	490_F	1.327	0.40
129_L	163_L	1.327	0.40
40_G	53_I	1.324	0.40
216_A	219_V	1.316	0.40
413_S	440_L	1.314	0.40
109_L	113_I	1.311	0.39
437_N	486_C	1.306	0.39
165_A	172_I	1.306	0.39
468_T	472_K	1.305	0.39
486_C	539_M	1.305	0.39
134_P	434_H	1.302	0.39
48_D	52_L	1.298	0.39
490_F	501_V	1.298	0.39
215_E	218_T	1.294	0.39
36_R	516_E	1.294	0.39
74_Y	498_K	1.293	0.39
43_L	54_Q	1.291	0.39
56_G	433_F	1.280	0.38
75_W	494_L	1.275	0.38
412_L	543_L	1.274	0.38
90_Q	137_E	1.273	0.38
84_E	458_M	1.272	0.38
491_L	494_L	1.272	0.38
473_G	479_G	1.271	0.38
165_A	511_M	1.270	0.38
494_L	503_D	1.270	0.38
165_A	188_P	1.259	0.37
97_Q	233_I	1.258	0.37
278_Q	502_V	1.254	0.37
42_V	170_L	1.241	0.36
56_G	442_M	1.241	0.36
56_G	375_L	1.234	0.36
271_I	297_A	1.232	0.36
115_V	354_F	1.231	0.36
488_L	491_L	1.227	0.36
71_Q	78_Y	1.219	0.35
173_H	537_K	1.218	0.35
437_N	441_F	1.218	0.35
553_H	556_E	1.212	0.35
470_L	490_F	1.212	0.35
467_M	529_V	1.211	0.35
479_G	487_R	1.204	0.35
455_S	532_L	1.203	0.35
249_T	254_S	1.202	0.35
457_P	492_L	1.198	0.34
409_K	490_F	1.197	0.34
438_G	517_T	1.197	0.34
76_F	532_L	1.194	0.34
75_W	500_T	1.193	0.34
102_I	475_K	1.189	0.34
135_V	459_F	1.186	0.34
126_G	173_H	1.179	0.34
383_G	433_F	1.177	0.34
452_I	478_D	1.174	0.33
158_A	491_L	1.170	0.33
104_D	107_G	1.169	0.33
465_Q	468_T	1.168	0.33
387_E	412_L	1.165	0.33
467_M	473_G	1.165	0.33
129_L	165_A	1.165	0.33
379_K	413_S	1.163	0.33
74_Y	494_L	1.163	0.33
91_V	549_K	1.160	0.33
463_G	524_A	1.160	0.33
490_F	513_I	1.159	0.33
269_L	285_P	1.159	0.33
183_V	469_V	1.158	0.33
474_K	506_V	1.156	0.33
433_F	486_C	1.154	0.33
490_F	515_I	1.147	0.32
425_V	432_L	1.145	0.32
457_P	541_Y	1.144	0.32
229_A	283_E	1.144	0.32
180_V	543_L	1.143	0.32
240_T	251_T	1.140	0.32
40_G	78_Y	1.136	0.32
473_G	490_F	1.135	0.32
479_G	503_D	1.133	0.32
232_L	246_P	1.126	0.31
217_V	261_A	1.121	0.31
466_D	498_K	1.120	0.31
439_Q	488_L	1.119	0.31
433_F	525_I	1.109	0.31
486_C	543_L	1.109	0.31
473_G	481_L	1.108	0.31
440_L	490_F	1.106	0.31
160_E	415_L	1.092	0.30
110_L	493_Q	1.090	0.30
472_K	490_F	1.088	0.30
491_L	498_K	1.086	0.30
418_S	506_V	1.086	0.30
406_Q	495_D	1.085	0.30
470_L	517_T	1.085	0.30
218_T	221_L	1.084	0.30
466_D	488_L	1.080	0.30
422_A	426_K	1.079	0.29
68_L	78_Y	1.077	0.29
36_R	503_D	1.075	0.29
441_F	488_L	1.068	0.29
70_P	106_A	1.065	0.29
115_V	121_A	1.063	0.29
168_R	469_V	1.059	0.29
439_Q	469_V	1.056	0.29
42_V	542_S	1.055	0.29
133_T	194_S	1.052	0.28
103_Q	239_L	1.052	0.28
196_L	379_K	1.048	0.28
438_G	467_M	1.047	0.28
466_D	485_H	1.046	0.28
435_K	470_L	1.045	0.28
53_I	159_V	1.043	0.28
51_A	521_L	1.036	0.28
316_V	319_A	1.034	0.28
515_I	536_L	1.034	0.28
375_L	389_A	1.034	0.28
473_G	543_L	1.030	0.28
471_F	491_L	1.028	0.27
455_S	495_D	1.028	0.27
331_D	334_S	1.028	0.27
302_V	305_T	1.027	0.27
374_F	491_L	1.027	0.27
247_S	254_S	1.025	0.27
467_M	513_I	1.021	0.27
90_Q	124_M	1.021	0.27
252_A	256_E	1.020	0.27
447_P	471_F	1.019	0.27
191_Q	341_L	1.019	0.27
134_P	436_L	1.016	0.27
177_L	498_K	1.014	0.27
44_R	109_L	1.013	0.27
473_G	492_L	1.013	0.27
387_E	506_V	1.012	0.27
375_L	525_I	1.012	0.27
481_L	506_V	1.011	0.27
109_L	515_I	1.007	0.27
51_A	383_G	1.006	0.27
461_K	473_G	1.005	0.27
451_Q	486_C	1.003	0.27
454_M	497_L	1.003	0.27
490_F	506_V	1.002	0.26
479_G	501_V	1.000	0.26
75_W	88_R	0.998	0.26
335_L	538_E	0.996	0.26
529_V	535_G	0.993	0.26
42_V	459_F	0.991	0.26
91_V	494_L	0.990	0.26
151_P	526_D	0.990	0.26
495_D	553_H	0.990	0.26
78_Y	90_Q	0.989	0.26
76_F	180_V	0.987	0.26
40_G	77_S	0.986	0.26
485_H	491_L	0.986	0.26
52_L	59_T	0.985	0.26
213_L	217_V	0.984	0.26
44_R	91_V	0.983	0.26
435_K	468_T	0.983	0.26
438_G	491_L	0.983	0.26
40_G	91_V	0.982	0.26
163_L	472_K	0.980	0.26
143_A	177_L	0.980	0.26
386_D	490_F	0.978	0.26
42_V	553_H	0.977	0.26
171_P	503_D	0.975	0.25
342_Q	496_T	0.968	0.25
467_M	470_L	0.968	0.25
71_Q	115_V	0.966	0.25
244_K	300_L	0.965	0.25
387_E	441_F	0.964	0.25
67_Q	436_L	0.961	0.25
44_R	502_V	0.959	0.25
74_Y	491_L	0.957	0.25
409_K	486_C	0.953	0.25
36_R	54_Q	0.950	0.25
193_V	197_L	0.949	0.25
360_Q	389_A	0.946	0.24
135_V	183_V	0.944	0.24
504_C	511_M	0.944	0.24
128_M	144_V	0.942	0.24
212_K	218_T	0.942	0.24
386_D	437_N	0.942	0.24
469_V	491_L	0.940	0.24
32_N	500_T	0.940	0.24
51_A	517_T	0.939	0.24
103_Q	448_S	0.937	0.24
299_Q	302_V	0.937	0.24
171_P	494_L	0.936	0.24
76_F	89_L	0.934	0.24
105_A	108_K	0.934	0.24
226_D	242_N	0.933	0.24
383_G	517_T	0.932	0.24
134_P	528_M	0.930	0.24
268_S	272_A	0.930	0.24
57_N	90_Q	0.929	0.24
71_Q	469_V	0.929	0.24
383_G	506_V	0.927	0.24
32_N	468_T	0.920	0.24
62_G	511_M	0.920	0.24
486_C	494_L	0.917	0.23
199_A	375_L	0.916	0.23
53_I	553_H	0.915	0.23
269_L	274_H	0.914	0.23
441_F	486_C	0.912	0.23
135_V	473_G	0.909	0.23
233_I	241_D	0.908	0.23
472_K	501_V	0.903	0.23
440_L	470_L	0.902	0.23
144_V	504_C	0.902	0.23
412_L	479_G	0.900	0.23
179_G	534_Q	0.895	0.23
435_K	451_Q	0.895	0.23
466_D	478_D	0.894	0.23
109_L	494_L	0.893	0.23
55_V	510_V	0.890	0.23
473_G	491_L	0.888	0.22
257_L	261_A	0.887	0.22
49_Q	53_I	0.886	0.22
160_E	172_I	0.885	0.22
51_A	440_L	0.879	0.22
412_L	486_C	0.879	0.22
76_F	165_A	0.876	0.22
435_K	540_G	0.876	0.22
232_L	257_L	0.874	0.22
54_Q	543_L	0.870	0.22
433_F	438_G	0.868	0.22
56_G	502_V	0.868	0.22
226_D	277_E	0.867	0.22
214_K	306_E	0.865	0.22
83_A	316_V	0.863	0.22
527_P	531_A	0.862	0.22
61_Q	507_Q	0.858	0.21
482_D	541_Y	0.857	0.21
438_G	487_R	0.854	0.21
63_K	88_R	0.853	0.21
183_V	442_M	0.852	0.21
47_G	508_Q	0.850	0.21
383_G	401_T	0.848	0.21
435_K	491_L	0.846	0.21
387_E	491_L	0.845	0.21
426_K	510_V	0.845	0.21
468_T	501_V	0.843	0.21
95_F	390_F	0.843	0.21
437_N	466_D	0.843	0.21
180_V	428_E	0.843	0.21
196_L	204_P	0.842	0.21
383_G	437_N	0.840	0.21
265_G	359_Q	0.840	0.21
179_G	490_F	0.840	0.21
488_L	507_Q	0.837	0.21
78_Y	171_P	0.836	0.21
250_N	253_G	0.835	0.21
179_G	481_L	0.831	0.21
466_D	490_F	0.830	0.21
168_R	486_C	0.829	0.21
42_V	476_E	0.828	0.21
180_V	427_Q	0.826	0.20
386_D	441_F	0.825	0.20
176_I	501_V	0.823	0.20
87_G	103_Q	0.822	0.20
72_A	493_Q	0.820	0.20
59_T	78_Y	0.818	0.20
490_F	494_L	0.817	0.20
409_K	412_L	0.816	0.20
271_I	281_I	0.816	0.20
387_E	437_N	0.813	0.20
451_Q	503_D	0.810	0.20
183_V	438_G	0.808	0.20
230_E	251_T	0.806	0.20
433_F	490_F	0.805	0.20
235_K	257_L	0.803	0.20
157_K	436_L	0.802	0.20
77_S	451_Q	0.799	0.20
249_T	283_E	0.798	0.20
438_G	479_G	0.797	0.20
424_P	456_F	0.797	0.20
54_Q	475_K	0.796	0.20
111_N	456_F	0.795	0.19
68_L	171_P	0.794	0.19
323_I	375_L	0.794	0.19
78_Y	504_C	0.793	0.19
133_T	402_S	0.792	0.19
188_P	329_S	0.791	0.19
178_N	191_Q	0.790	0.19
27_V	436_L	0.788	0.19
244_K	280_S	0.788	0.19
235_K	304_L	0.786	0.19
39_L	79_E	0.785	0.19
62_G	76_F	0.784	0.19
490_F	503_D	0.784	0.19
179_G	438_G	0.782	0.19
386_D	438_G	0.782	0.19
177_L	509_K	0.778	0.19
66_T	426_K	0.777	0.19
32_N	38_L	0.776	0.19
514_T	549_K	0.775	0.19
468_T	491_L	0.774	0.19
511_M	548_A	0.774	0.19
165_A	532_L	0.772	0.19
51_A	68_L	0.771	0.19
165_A	176_I	0.771	0.19
84_E	94_S	0.771	0.19
188_P	456_F	0.770	0.19
143_A	498_K	0.769	0.19
433_F	441_F	0.767	0.19
267_A	334_S	0.765	0.19
74_Y	486_C	0.763	0.19
109_L	176_I	0.763	0.19
109_L	490_F	0.761	0.18
447_P	465_Q	0.759	0.18
40_G	114_S	0.758	0.18
41_K	55_V	0.758	0.18
33_G	42_V	0.758	0.18
409_K	487_R	0.757	0.18
225_I	262_G	0.757	0.18
247_S	268_S	0.756	0.18
47_G	91_V	0.756	0.18
473_G	494_L	0.754	0.18
359_Q	511_M	0.753	0.18
62_G	77_S	0.751	0.18
238_S	303_K	0.750	0.18
107_G	535_G	0.749	0.18
252_A	255_R	0.748	0.18
78_Y	158_A	0.743	0.18
408_I	432_L	0.743	0.18
210_M	220_L	0.743	0.18
494_L	522_Q	0.743	0.18
42_V	433_F	0.742	0.18
378_V	450_S	0.742	0.18
269_L	273_N	0.742	0.18
471_F	485_H	0.742	0.18
471_F	532_L	0.739	0.18
43_L	77_S	0.738	0.18
387_E	486_C	0.736	0.18
78_Y	200_I	0.735	0.18
263_S	271_I	0.735	0.18
49_Q	103_Q	0.734	0.18
492_L	516_E	0.732	0.18
75_W	486_C	0.731	0.18
249_T	272_A	0.731	0.18
138_N	525_I	0.731	0.18
37_L	165_A	0.730	0.18
63_K	73_Y	0.730	0.18
451_Q	483_P	0.730	0.18
479_G	491_L	0.730	0.18
479_G	515_I	0.730	0.18
412_L	487_R	0.730	0.18
283_E	541_Y	0.729	0.18
183_V	474_K	0.729	0.18
312_S	353_V	0.728	0.18
491_L	540_G	0.728	0.18
91_V	132_K	0.727	0.18
86_T	433_F	0.727	0.18
44_R	75_W	0.726	0.17
413_S	437_N	0.725	0.17
425_V	537_K	0.724	0.17
483_P	501_V	0.723	0.17
247_S	270_P	0.718	0.17
38_L	58_Q	0.718	0.17
179_G	473_G	0.715	0.17
125_T	524_A	0.715	0.17
168_R	438_G	0.714	0.17
380_T	415_L	0.713	0.17
473_G	485_H	0.713	0.17
371_V	469_V	0.712	0.17
467_M	501_V	0.707	0.17
76_F	79_E	0.707	0.17
290_A	345_Q	0.707	0.17
51_A	490_F	0.707	0.17
211_S	216_A	0.706	0.17
45_L	450_S	0.706	0.17
451_Q	470_L	0.705	0.17
121_A	144_V	0.704	0.17
494_L	501_V	0.702	0.17
196_L	205_Q	0.702	0.17
518_D	523_A	0.702	0.17
288_T	297_A	0.701	0.17
409_K	413_S	0.700	0.17
91_V	472_K	0.699	0.17
75_W	521_L	0.699	0.17
471_F	497_L	0.697	0.17
230_E	541_Y	0.697	0.17
234_D	260_P	0.696	0.17
439_Q	455_S	0.696	0.17
191_Q	194_S	0.696	0.17
512_T	518_D	0.695	0.17
447_P	491_L	0.695	0.17
468_T	471_F	0.694	0.17
407_S	446_H	0.693	0.17
76_F	469_V	0.692	0.17
384_A	460_S	0.691	0.17
355_L	368_K	0.690	0.17
474_K	520_E	0.690	0.17
482_D	485_H	0.690	0.17
283_E	312_S	0.690	0.17
479_G	483_P	0.688	0.16
167_K	191_Q	0.686	0.16
450_S	526_D	0.684	0.16
437_N	488_L	0.683	0.16
51_A	429_A	0.682	0.16
79_E	111_N	0.682	0.16
63_K	77_S	0.681	0.16
233_I	300_L	0.680	0.16
67_Q	135_V	0.679	0.16
308_A	319_A	0.679	0.16
451_Q	472_K	0.677	0.16
128_M	163_L	0.677	0.16
40_G	475_K	0.677	0.16
323_I	345_Q	0.677	0.16
56_G	501_V	0.676	0.16
177_L	384_A	0.676	0.16
64_L	69_R	0.675	0.16
133_T	280_S	0.675	0.16
479_G	500_T	0.675	0.16
497_L	520_E	0.674	0.16
534_Q	538_E	0.673	0.16
379_K	414_A	0.672	0.16
77_S	535_G	0.672	0.16
334_S	342_Q	0.670	0.16
113_I	491_L	0.669	0.16
276_A	334_S	0.669	0.16
168_R	179_G	0.669	0.16
483_P	543_L	0.666	0.16
278_Q	358_V	0.666	0.16
53_I	525_I	0.664	0.16
459_F	504_C	0.663	0.16
474_K	488_L	0.661	0.16
261_A	276_A	0.657	0.16
467_M	492_L	0.656	0.16
186_P	529_V	0.656	0.16
116_K	508_Q	0.654	0.16
384_A	450_S	0.654	0.16
413_S	490_F	0.654	0.16
71_Q	76_F	0.653	0.16
216_A	497_L	0.652	0.16
136_T	170_L	0.651	0.16
63_K	103_Q	0.650	0.15
110_L	475_K	0.648	0.15
193_V	547_N	0.646	0.15
269_L	370_D	0.645	0.15
334_S	417_A	0.642	0.15
168_R	490_F	0.641	0.15
472_K	475_K	0.640	0.15
451_Q	468_T	0.639	0.15
429_A	547_N	0.639	0.15
316_V	330_G	0.638	0.15
436_L	537_K	0.638	0.15
484_S	509_K	0.637	0.15
187_V	529_V	0.637	0.15
494_L	516_E	0.637	0.15
60_V	437_N	0.636	0.15
43_L	84_E	0.636	0.15
91_V	128_M	0.635	0.15
438_G	472_K	0.634	0.15
479_G	486_C	0.634	0.15
158_A	466_D	0.633	0.15
378_V	418_S	0.633	0.15
387_E	513_I	0.632	0.15
64_L	89_L	0.631	0.15
240_T	326_A	0.630	0.15
383_G	503_D	0.629	0.15
139_D	437_N	0.629	0.15
46_L	540_G	0.629	0.15
53_I	65_E	0.629	0.15
435_K	453_V	0.629	0.15
461_K	471_F	0.626	0.15
476_E	491_L	0.626	0.15
87_G	120_A	0.625	0.15
394_F	523_A	0.625	0.15
485_H	488_L	0.625	0.15
205_Q	262_G	0.625	0.15
438_G	492_L	0.625	0.15
116_K	379_K	0.624	0.15
251_T	275_T	0.623	0.15
45_L	64_L	0.621	0.15
511_M	534_Q	0.620	0.15
210_M	218_T	0.619	0.15
93_Q	493_Q	0.618	0.15
76_F	217_V	0.617	0.15
65_E	88_R	0.617	0.15
95_F	170_L	0.616	0.15
72_A	504_C	0.616	0.15
440_L	487_R	0.614	0.15
275_T	300_L	0.613	0.15
85_Q	485_H	0.612	0.15
139_D	432_L	0.609	0.14
76_F	158_A	0.609	0.14
43_L	78_Y	0.609	0.14
401_T	438_G	0.609	0.14
225_I	301_L	0.609	0.14
451_Q	516_E	0.608	0.14
173_H	507_Q	0.607	0.14
478_D	491_L	0.607	0.14
536_L	541_Y	0.606	0.14
409_K	438_G	0.605	0.14
511_M	516_E	0.605	0.14
302_V	356_K	0.605	0.14
213_L	478_D	0.604	0.14
501_V	532_L	0.603	0.14
437_N	470_L	0.601	0.14
383_G	543_L	0.601	0.14
78_Y	89_L	0.600	0.14
226_D	286_V	0.600	0.14
279_G	329_S	0.600	0.14
53_I	332_S	0.599	0.14
268_S	354_F	0.597	0.14
211_S	219_V	0.596	0.14
87_G	105_A	0.596	0.14
508_Q	517_T	0.596	0.14
47_G	432_L	0.596	0.14
200_I	376_S	0.594	0.14
476_E	539_M	0.593	0.14
511_M	543_L	0.593	0.14
233_I	243_T	0.593	0.14
186_P	485_H	0.592	0.14
24_T	28_N	0.592	0.14
137_E	325_A	0.592	0.14
185_S	374_F	0.592	0.14
258_S	264_P	0.592	0.14
35_K	511_M	0.591	0.14
74_Y	507_Q	0.591	0.14
127_A	468_T	0.590	0.14
364_H	368_K	0.589	0.14
74_Y	177_L	0.587	0.14
403_G	513_I	0.586	0.14
113_I	124_M	0.583	0.14
292_I	341_L	0.583	0.14
177_L	485_H	0.582	0.14
122_L	429_A	0.581	0.14
75_W	83_A	0.579	0.14
177_L	390_F	0.579	0.14
211_S	214_K	0.578	0.14
390_F	524_A	0.578	0.14
438_G	473_G	0.577	0.14
465_Q	471_F	0.576	0.14
488_L	504_C	0.576	0.14
42_V	455_S	0.575	0.14
248_P	252_A	0.575	0.14
438_G	470_L	0.574	0.14
412_L	490_F	0.573	0.14
492_L	502_V	0.573	0.14
110_L	324_K	0.573	0.14
143_A	163_L	0.573	0.14
51_A	133_T	0.572	0.14
57_N	139_D	0.571	0.14
124_M	159_V	0.571	0.14
55_V	439_Q	0.571	0.14
440_L	504_C	0.570	0.14
40_G	158_A	0.568	0.14
66_T	500_T	0.566	0.13
183_V	490_F	0.566	0.13
180_V	438_G	0.566	0.13
497_L	515_I	0.565	0.13
242_N	281_I	0.565	0.13
440_L	467_M	0.563	0.13
161_T	422_A	0.562	0.13
49_Q	116_K	0.562	0.13
242_N	288_T	0.562	0.13
57_N	165_A	0.561	0.13
211_S	221_L	0.561	0.13
162_V	502_V	0.560	0.13
128_M	410_L	0.559	0.13
128_M	493_Q	0.559	0.13
176_I	485_H	0.559	0.13
183_V	506_V	0.559	0.13
261_A	292_I	0.558	0.13
506_V	515_I	0.558	0.13
105_A	131_S	0.557	0.13
29_E	32_N	0.555	0.13
393_A	396_Q	0.555	0.13
129_L	162_V	0.555	0.13
135_V	454_M	0.555	0.13
42_V	348_D	0.555	0.13
38_L	62_G	0.554	0.13
354_F	358_V	0.554	0.13
496_T	523_A	0.554	0.13
248_P	349_Q	0.554	0.13
261_A	264_P	0.553	0.13
468_T	503_D	0.553	0.13
383_G	515_I	0.552	0.13
196_L	206_Q	0.551	0.13
48_D	75_W	0.549	0.13
56_G	515_I	0.549	0.13
488_L	522_Q	0.549	0.13
193_V	482_D	0.548	0.13
39_L	50_H	0.547	0.13
185_S	451_Q	0.546	0.13
91_V	466_D	0.546	0.13
440_L	509_K	0.544	0.13
88_R	460_S	0.544	0.13
455_S	492_L	0.544	0.13
458_M	465_Q	0.543	0.13
232_L	237_I	0.543	0.13
437_N	487_R	0.543	0.13
412_L	433_F	0.542	0.13
315_I	318_E	0.541	0.13
466_D	506_V	0.540	0.13
28_N	139_D	0.538	0.13
175_E	497_L	0.538	0.13
409_K	433_F	0.537	0.13
69_R	116_K	0.537	0.13
193_V	507_Q	0.536	0.13
89_L	483_P	0.536	0.13
522_Q	548_A	0.535	0.13
388_V	392_K	0.535	0.13
467_M	472_K	0.534	0.13
467_M	487_R	0.533	0.13
244_K	282_Q	0.532	0.13
178_N	248_P	0.532	0.13
124_M	507_Q	0.531	0.13
306_E	361_T	0.531	0.13
218_T	352_E	0.530	0.13
470_L	540_G	0.530	0.13
216_A	220_L	0.530	0.13
128_M	384_A	0.530	0.13
288_T	291_D	0.529	0.13
405_M	425_V	0.528	0.13
296_E	328_S	0.527	0.13
110_L	121_A	0.526	0.13
63_K	428_E	0.525	0.13
50_H	186_P	0.525	0.13
489_L	494_L	0.523	0.13
40_G	54_Q	0.523	0.13
486_C	513_I	0.523	0.13
60_V	116_K	0.522	0.13
503_D	543_L	0.522	0.13
112_A	440_L	0.522	0.13
36_R	173_H	0.521	0.13
248_P	261_A	0.521	0.13
472_K	551_R	0.521	0.13
274_H	318_E	0.520	0.12
65_E	409_K	0.520	0.12
61_Q	379_K	0.520	0.12
179_G	385_R	0.519	0.12
462_S	535_G	0.519	0.12
228_H	298_R	0.519	0.12
387_E	401_T	0.517	0.12
340_V	344_A	0.517	0.12
185_S	285_P	0.517	0.12
453_V	468_T	0.517	0.12
165_A	469_V	0.516	0.12
515_I	528_M	0.516	0.12
426_K	468_T	0.514	0.12
393_A	408_I	0.510	0.12
441_F	503_D	0.506	0.12
483_P	488_L	0.506	0.12
50_H	61_Q	0.506	0.12
415_L	436_L	0.504	0.12
232_L	328_S	0.504	0.12
32_N	279_G	0.503	0.12
146_W	507_Q	0.503	0.12
38_L	427_Q	0.501	0.12
455_S	471_F	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2rrlA	1	0.2778	93.2	0.953	Contact Map
2eqsA	1	0.151	79.9	0.962	Contact Map
1kl9A	2	0.2448	71.5	0.965	Contact Map
1gutA	5	0.099	68.1	0.966	Contact Map
2k52A	1	0.1094	67.6	0.966	Contact Map
4aidA	3	0.0243	57.6	0.968	Contact Map
4nbqA	3	0.1372	55.7	0.968	Contact Map
4toiA	2	0.1111	55.1	0.968	Contact Map
3cw2C	1	0.4062	54.3	0.968	Contact Map
2cqoA	1	0.1736	52	0.969	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0136 seconds.