PTN3B - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTN3B - PTS system mannose-specific EIIBCA component

UniProt:	O31645	Sequences: MKLLAITSCPNGIAHTYMAAENLQKAADRLGVSIKVETQGGIGVENKLTEEEIREADAIIIAADRSVNKDRFIGKKLLSVGVQDGIRKPEELIQKALNGDIPVYRSATKSESGNHQEKKQNPIYRHLMNGVSFMVPFIVVGGLLIAVALTLGGEKTPKGLVIPDDSFWKTIEQIGSASFSFMIPILAGYIAYSIADKPGLVPGMIGGYIAATGSFYDSASGAGFLGGIIAGFLAGYAALWIKKLKVPKAIQPIMPIIIIPVFASLIVGLAFVFLIGAPVAQIFASLTVWLAGMKGSSSILLALILGAMISFDMGGPVNKVAFLFGSAMIGEGNYEIMGPIAVAICIPPIGLGIATFLGKRKFEASQREMGKAAFTMGLFGITEGAIPFAAQDPLRVIPSIMAGSMTGSVIAMIGNVGDRVAHGGPIVAVLGAVDHVLMFFIAVIAGSLVTALFVNVLKKDITASPVLSETAPTSAPSEAAAANEIKQPIQSQKAEMSEFKKLTDIISPELIEPNLSGETSDDIIDELIQKLSRRGALLSESGFKQAILNREQQGTTAIGMNIAIPHGKSEAVREPSVAFGIKRSGVDWNSLDGSEAKLIFMIAVPKESGGNQHLKILQMLSRKLMDDNYRERLLSVQTTEEAYKLLEEIE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	650 (505)
Sequences:	377 (233)
Seq/√Len:	10.4

ECOLI - PTFLB PTFBC HRSA PTM3C
BACSU - PTN3B PTF3A

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
638_T	641_E	5.227	1.00
508_P	640_E	4.754	1.00
402_A	453_F	4.177	0.99
518_E	522_D	4.062	0.99
546_A	571_A	3.681	0.98
475_A	479_A	3.555	0.98
416_V	438_M	3.552	0.98
416_V	439_F	3.514	0.97
253_I	258_I	3.472	0.97
406_T	445_A	3.353	0.96
279_V	407_G	3.308	0.96
529_Q	533_R	3.278	0.96
471_A	479_A	3.259	0.96
572_V	600_F	3.161	0.95
549_N	552_Q	3.140	0.95
317_V	401_M	3.067	0.94
587_D	593_G	3.042	0.94
305_L	341_A	3.015	0.94
589_N	593_G	2.629	0.88
245_K	459_K	2.614	0.87
510_L	536_A	2.496	0.85
581_I	588_W	2.451	0.84
351_L	400_I	2.441	0.83
287_T	321_A	2.436	0.83
322_F	341_A	2.435	0.83
472_P	479_A	2.394	0.82
411_A	442_A	2.368	0.81
512_E	526_E	2.365	0.81
560_M	621_S	2.360	0.81
511_I	616_I	2.229	0.77
471_A	478_E	2.192	0.76
471_A	475_A	2.182	0.76
185_I	410_I	2.175	0.75
468_S	479_A	2.139	0.74
472_P	480_A	2.126	0.74
235_G	276_G	2.078	0.72
206_G	568_K	2.072	0.72
530_K	533_R	2.037	0.70
480_A	483_N	2.010	0.69
475_A	478_E	2.009	0.69
360_R	443_V	2.009	0.69
399_S	454_V	1.970	0.67
491_S	498_E	1.963	0.67
477_S	482_A	1.912	0.65
469_E	479_A	1.906	0.65
476_P	480_A	1.897	0.64
174_I	216_Y	1.883	0.64
616_I	645_L	1.882	0.64
429_V	440_F	1.874	0.63
508_P	573_R	1.846	0.62
402_A	454_V	1.845	0.62
377_G	443_V	1.834	0.62
311_F	317_V	1.823	0.61
237_A	646_L	1.819	0.61
286_L	289_W	1.817	0.61
640_E	644_K	1.803	0.60
323_L	327_A	1.791	0.60
129_N	225_L	1.781	0.59
575_P	616_I	1.775	0.59
136_P	311_F	1.759	0.58
135_V	345_C	1.688	0.55
476_P	479_A	1.687	0.55
562_I	624_L	1.685	0.55
400_I	404_S	1.685	0.55
358_G	455_N	1.684	0.55
533_R	586_V	1.682	0.55
642_A	645_L	1.672	0.54
597_K	634_L	1.665	0.54
209_I	235_G	1.661	0.54
492_Q	503_T	1.641	0.53
587_D	636_V	1.639	0.53
561_N	597_K	1.633	0.53
631_E	635_S	1.633	0.53
614_L	617_L	1.625	0.52
275_I	600_F	1.620	0.52
621_S	625_M	1.614	0.52
139_V	301_L	1.611	0.51
469_E	476_P	1.610	0.51
508_P	643_Y	1.605	0.51
360_R	459_K	1.603	0.51
257_I	324_F	1.599	0.51
473_T	477_S	1.598	0.51
402_A	514_N	1.595	0.51
446_G	450_T	1.590	0.50
127_L	347_P	1.589	0.50
405_M	409_V	1.582	0.50
131_V	143_L	1.578	0.50
475_A	480_A	1.561	0.49
448_L	552_Q	1.558	0.49
545_Q	549_N	1.558	0.49
558_I	636_V	1.555	0.49
526_E	530_K	1.553	0.49
622_R	626_D	1.547	0.48
457_L	575_P	1.541	0.48
194_I	225_L	1.533	0.48
218_S	280_A	1.518	0.47
209_I	229_I	1.517	0.47
205_I	628_N	1.489	0.46
480_A	486_K	1.487	0.46
302_A	361_K	1.471	0.45
577_V	600_F	1.468	0.45
506_I	537_L	1.465	0.45
476_P	481_A	1.457	0.44
421_A	558_I	1.440	0.44
129_N	194_I	1.432	0.43
517_G	582_K	1.427	0.43
469_E	480_A	1.419	0.43
472_P	476_P	1.416	0.42
345_C	443_V	1.406	0.42
268_G	321_A	1.401	0.42
209_I	271_F	1.399	0.42
343_A	428_A	1.399	0.42
594_S	621_S	1.398	0.42
174_I	555_T	1.388	0.41
148_A	433_V	1.386	0.41
543_F	567_G	1.383	0.41
470_T	473_T	1.373	0.40
179_F	252_P	1.371	0.40
569_S	624_L	1.370	0.40
534_R	631_E	1.369	0.40
249_A	346_I	1.365	0.40
564_I	617_L	1.356	0.40
514_N	633_L	1.354	0.40
598_L	634_L	1.353	0.40
529_Q	541_S	1.349	0.39
536_A	576_S	1.340	0.39
288_V	638_T	1.328	0.38
234_A	618_Q	1.320	0.38
579_F	642_A	1.320	0.38
360_R	364_A	1.318	0.38
469_E	481_A	1.316	0.38
304_I	321_A	1.313	0.38
411_A	439_F	1.312	0.38
473_T	481_A	1.312	0.38
293_M	323_L	1.311	0.38
261_V	330_G	1.307	0.38
414_G	438_M	1.306	0.37
578_A	598_L	1.304	0.37
240_W	243_K	1.295	0.37
595_E	598_L	1.294	0.37
543_F	603_A	1.294	0.37
493_K	500_K	1.291	0.37
468_S	480_A	1.288	0.37
411_A	416_V	1.282	0.36
441_I	445_A	1.278	0.36
357_L	489_I	1.266	0.36
261_V	631_E	1.266	0.36
414_G	441_I	1.264	0.36
560_M	624_L	1.264	0.36
188_G	217_D	1.261	0.36
230_A	370_G	1.259	0.35
560_M	630_R	1.258	0.35
534_R	579_F	1.255	0.35
374_F	378_L	1.254	0.35
305_L	430_L	1.248	0.35
448_L	452_L	1.243	0.35
569_S	617_L	1.240	0.35
594_S	627_D	1.235	0.34
188_G	265_L	1.235	0.34
479_A	482_A	1.235	0.34
218_S	274_L	1.233	0.34
477_S	483_N	1.231	0.34
237_A	262_F	1.227	0.34
631_E	644_K	1.226	0.34
174_I	194_I	1.224	0.34
225_L	526_E	1.220	0.34
480_A	484_E	1.219	0.34
618_Q	621_S	1.214	0.34
191_A	391_Q	1.213	0.34
286_L	572_V	1.203	0.33
515_L	596_A	1.194	0.33
280_A	618_Q	1.193	0.33
297_S	447_S	1.192	0.33
237_A	266_I	1.191	0.33
452_L	503_T	1.190	0.33
394_L	575_P	1.190	0.33
474_S	522_D	1.183	0.32
535_G	612_Q	1.182	0.32
229_I	279_V	1.182	0.32
512_E	618_Q	1.182	0.32
478_E	486_K	1.178	0.32
564_I	614_L	1.176	0.32
620_L	646_L	1.175	0.32
496_M	545_Q	1.173	0.32
561_N	577_V	1.168	0.32
551_E	556_T	1.167	0.32
304_I	329_I	1.154	0.31
388_F	446_G	1.151	0.31
474_S	481_A	1.150	0.31
370_G	604_V	1.150	0.31
457_L	579_F	1.146	0.31
496_M	519_T	1.144	0.31
213_G	218_S	1.144	0.31
219_A	222_A	1.142	0.31
479_A	483_N	1.141	0.31
174_I	217_D	1.136	0.30
341_A	604_V	1.136	0.30
287_T	420_V	1.135	0.30
136_P	256_I	1.130	0.30
224_F	279_V	1.127	0.30
123_I	126_H	1.124	0.30
267_V	368_E	1.124	0.30
577_V	625_M	1.123	0.30
471_A	481_A	1.120	0.30
224_F	408_S	1.119	0.30
527_L	601_M	1.114	0.30
482_A	487_Q	1.110	0.29
471_A	477_S	1.106	0.29
455_N	465_P	1.106	0.29
342_V	345_C	1.105	0.29
309_I	345_C	1.105	0.29
469_E	493_K	1.103	0.29
478_E	481_A	1.103	0.29
467_L	475_A	1.103	0.29
490_Q	522_D	1.101	0.29
488_P	498_E	1.088	0.29
401_M	447_S	1.086	0.28
151_L	185_I	1.084	0.28
469_E	472_P	1.083	0.28
138_I	172_E	1.076	0.28
339_P	407_G	1.076	0.28
575_P	621_S	1.074	0.28
125_R	578_A	1.072	0.28
218_S	586_V	1.072	0.28
468_S	489_I	1.070	0.28
543_F	547_I	1.070	0.28
472_P	483_N	1.069	0.28
512_E	530_K	1.067	0.28
125_R	515_L	1.062	0.28
575_P	604_V	1.059	0.27
136_P	217_D	1.058	0.27
193_S	525_D	1.056	0.27
580_G	593_G	1.055	0.27
561_N	617_L	1.055	0.27
322_F	338_G	1.054	0.27
522_D	552_Q	1.048	0.27
304_I	416_V	1.047	0.27
469_E	545_Q	1.040	0.27
511_I	642_A	1.037	0.27
230_A	322_F	1.034	0.27
217_D	220_S	1.032	0.26
135_V	351_L	1.031	0.26
300_L	631_E	1.030	0.26
283_F	420_V	1.029	0.26
498_E	647_E	1.028	0.26
411_A	606_K	1.027	0.26
543_F	576_S	1.027	0.26
585_G	597_K	1.025	0.26
524_I	544_K	1.023	0.26
464_S	533_R	1.020	0.26
347_P	382_T	1.019	0.26
532_S	537_L	1.019	0.26
283_F	411_A	1.016	0.26
588_W	597_K	1.016	0.26
463_A	519_T	1.015	0.26
125_R	338_G	1.015	0.26
350_G	450_T	1.015	0.26
327_A	419_R	1.010	0.26
558_I	621_S	1.006	0.26
304_I	332_G	1.003	0.25
415_N	488_P	1.002	0.25
348_P	377_G	1.002	0.25
469_E	483_N	0.999	0.25
477_S	484_E	0.996	0.25
210_A	370_G	0.994	0.25
121_N	239_L	0.993	0.25
287_T	600_F	0.992	0.25
545_Q	573_R	0.989	0.25
564_I	595_E	0.986	0.25
558_I	564_I	0.985	0.25
234_A	441_I	0.984	0.25
302_A	405_M	0.984	0.25
353_I	531_L	0.983	0.25
185_I	303_L	0.977	0.24
262_F	452_L	0.976	0.24
473_T	485_I	0.972	0.24
414_G	442_A	0.972	0.24
542_G	640_E	0.969	0.24
148_A	324_F	0.964	0.24
242_K	324_F	0.964	0.24
517_G	526_E	0.962	0.24
302_A	408_S	0.962	0.24
338_G	625_M	0.961	0.24
271_F	442_A	0.961	0.24
485_I	489_I	0.961	0.24
488_P	540_E	0.961	0.24
483_N	487_Q	0.959	0.24
542_G	628_N	0.959	0.24
504_D	639_T	0.958	0.24
125_R	643_Y	0.955	0.24
464_S	628_N	0.955	0.24
560_M	593_G	0.954	0.24
310_S	389_A	0.952	0.24
212_T	433_V	0.952	0.24
494_A	500_K	0.949	0.24
306_G	382_T	0.948	0.24
572_V	598_L	0.947	0.23
519_T	522_D	0.946	0.23
357_L	490_Q	0.946	0.23
437_L	497_S	0.946	0.23
407_G	567_G	0.941	0.23
500_K	644_K	0.932	0.23
637_Q	641_E	0.932	0.23
124_Y	128_M	0.931	0.23
235_G	575_P	0.929	0.23
595_E	621_S	0.929	0.23
173_Q	180_S	0.927	0.23
585_G	616_I	0.926	0.23
589_N	594_S	0.925	0.23
249_A	326_S	0.924	0.23
188_G	365_S	0.920	0.23
628_N	631_E	0.919	0.23
321_A	627_D	0.917	0.22
588_W	596_A	0.916	0.22
553_Q	572_V	0.916	0.22
585_G	611_N	0.914	0.22
589_N	595_E	0.913	0.22
536_A	581_I	0.910	0.22
247_P	573_R	0.909	0.22
124_Y	139_V	0.909	0.22
475_A	483_N	0.908	0.22
183_I	377_G	0.905	0.22
310_S	400_I	0.899	0.22
519_T	533_R	0.895	0.22
561_N	594_S	0.893	0.22
494_A	640_E	0.893	0.22
149_L	246_V	0.883	0.21
188_G	252_P	0.882	0.21
289_W	557_A	0.880	0.21
126_H	138_I	0.878	0.21
143_L	210_A	0.876	0.21
404_S	408_S	0.876	0.21
306_G	348_P	0.876	0.21
564_I	621_S	0.876	0.21
293_M	542_G	0.876	0.21
516_S	631_E	0.875	0.21
452_L	491_S	0.873	0.21
496_M	639_T	0.872	0.21
425_P	443_V	0.872	0.21
508_P	536_A	0.872	0.21
235_G	266_I	0.871	0.21
241_I	620_L	0.871	0.21
345_C	380_G	0.870	0.21
305_L	322_F	0.869	0.21
389_A	397_I	0.868	0.21
384_G	430_L	0.867	0.21
600_F	629_Y	0.863	0.21
187_A	230_A	0.861	0.21
411_A	432_A	0.861	0.21
553_Q	588_W	0.859	0.21
313_M	399_S	0.858	0.21
416_V	432_A	0.855	0.21
477_S	486_K	0.855	0.21
448_L	483_N	0.855	0.21
522_D	581_I	0.854	0.20
470_T	477_S	0.853	0.20
224_F	564_I	0.852	0.20
256_I	311_F	0.852	0.20
570_E	628_N	0.850	0.20
250_I	506_I	0.850	0.20
635_S	638_T	0.849	0.20
210_A	234_A	0.849	0.20
237_A	448_L	0.848	0.20
323_L	421_A	0.847	0.20
325_G	338_G	0.845	0.20
303_L	509_E	0.845	0.20
436_V	440_F	0.845	0.20
562_I	581_I	0.844	0.20
188_G	211_A	0.844	0.20
188_G	276_G	0.843	0.20
257_I	379_F	0.842	0.20
191_A	317_V	0.842	0.20
468_S	488_P	0.842	0.20
606_K	617_L	0.838	0.20
447_S	486_K	0.837	0.20
328_M	338_G	0.836	0.20
227_G	458_K	0.835	0.20
201_V	578_A	0.834	0.20
415_N	579_F	0.834	0.20
190_I	441_I	0.834	0.20
509_E	533_R	0.833	0.20
485_I	611_N	0.833	0.20
474_S	479_A	0.831	0.20
300_L	396_V	0.828	0.20
530_K	632_R	0.826	0.20
317_V	447_S	0.822	0.20
131_V	627_D	0.822	0.20
409_V	413_I	0.821	0.20
414_G	511_I	0.821	0.20
244_L	564_I	0.821	0.20
474_S	480_A	0.819	0.19
138_I	230_A	0.819	0.19
521_D	571_A	0.818	0.19
416_V	435_H	0.815	0.19
262_F	573_R	0.815	0.19
572_V	646_L	0.814	0.19
604_V	617_L	0.812	0.19
305_L	452_L	0.811	0.19
483_N	486_K	0.810	0.19
560_M	587_D	0.808	0.19
616_I	619_M	0.808	0.19
141_G	424_G	0.807	0.19
348_P	382_T	0.804	0.19
577_V	619_M	0.803	0.19
265_L	357_L	0.802	0.19
303_L	337_M	0.798	0.19
497_S	501_K	0.798	0.19
196_D	636_V	0.795	0.19
536_A	623_K	0.794	0.19
627_D	631_E	0.792	0.19
533_R	632_R	0.790	0.19
473_T	482_A	0.788	0.19
499_F	519_T	0.786	0.18
302_A	371_K	0.784	0.18
448_L	471_A	0.783	0.18
175_G	427_V	0.782	0.18
117_E	353_I	0.782	0.18
210_A	323_L	0.780	0.18
481_A	484_E	0.779	0.18
469_E	473_T	0.779	0.18
344_I	380_G	0.779	0.18
545_Q	554_G	0.777	0.18
507_S	520_S	0.775	0.18
413_I	474_S	0.773	0.18
555_T	638_T	0.771	0.18
413_I	555_T	0.766	0.18
139_V	388_F	0.764	0.18
506_I	577_V	0.763	0.18
577_V	585_G	0.763	0.18
410_I	445_A	0.762	0.18
596_A	621_S	0.759	0.18
477_S	480_A	0.759	0.18
519_T	639_T	0.759	0.18
475_A	485_I	0.757	0.18
611_N	618_Q	0.757	0.18
532_S	638_T	0.756	0.18
293_M	330_G	0.755	0.18
135_V	378_L	0.755	0.18
414_G	616_I	0.755	0.18
384_G	446_G	0.754	0.18
587_D	644_K	0.753	0.18
521_D	525_D	0.752	0.18
135_V	342_V	0.752	0.18
131_V	152_G	0.751	0.18
505_I	615_K	0.749	0.17
611_N	633_L	0.749	0.17
528_I	544_K	0.748	0.17
488_P	496_M	0.748	0.17
126_H	193_S	0.745	0.17
432_A	436_V	0.744	0.17
448_L	495_E	0.744	0.17
536_A	555_T	0.743	0.17
210_A	614_L	0.742	0.17
230_A	341_A	0.741	0.17
376_M	425_P	0.741	0.17
476_P	484_E	0.740	0.17
523_I	641_E	0.737	0.17
491_S	541_S	0.736	0.17
558_I	568_K	0.736	0.17
589_N	634_L	0.735	0.17
492_Q	496_M	0.730	0.17
336_I	344_I	0.730	0.17
514_N	639_T	0.730	0.17
130_G	141_G	0.729	0.17
252_P	350_G	0.728	0.17
489_I	492_Q	0.727	0.17
179_F	310_S	0.727	0.17
477_S	481_A	0.725	0.17
558_I	646_L	0.724	0.17
458_K	630_R	0.724	0.17
368_E	548_L	0.724	0.17
185_I	542_G	0.722	0.17
306_G	376_M	0.720	0.17
533_R	640_E	0.719	0.17
473_T	476_P	0.717	0.17
239_L	305_L	0.717	0.17
624_L	629_Y	0.716	0.17
498_E	508_P	0.715	0.17
179_F	400_I	0.715	0.17
149_L	418_D	0.714	0.17
169_K	172_E	0.708	0.16
207_G	330_G	0.708	0.16
138_I	221_G	0.706	0.16
579_F	617_L	0.705	0.16
519_T	571_A	0.705	0.16
271_F	373_A	0.705	0.16
303_L	518_E	0.703	0.16
135_V	201_V	0.703	0.16
301_L	440_F	0.702	0.16
602_I	620_L	0.700	0.16
494_A	570_E	0.699	0.16
196_D	376_M	0.697	0.16
209_I	354_A	0.697	0.16
545_Q	552_Q	0.697	0.16
309_I	382_T	0.696	0.16
241_I	588_W	0.696	0.16
515_L	578_A	0.695	0.16
121_N	208_Y	0.695	0.16
147_V	262_F	0.694	0.16
177_A	334_Y	0.694	0.16
225_L	357_L	0.692	0.16
325_G	600_F	0.691	0.16
323_L	588_W	0.689	0.16
624_L	646_L	0.689	0.16
340_I	404_S	0.688	0.16
138_I	252_P	0.686	0.16
331_E	627_D	0.685	0.16
477_S	494_A	0.682	0.16
330_G	402_A	0.681	0.16
235_G	392_D	0.681	0.16
468_S	475_A	0.681	0.16
515_L	580_G	0.680	0.16
474_S	477_S	0.678	0.16
253_I	317_V	0.678	0.16
523_I	582_K	0.678	0.16
577_V	588_W	0.676	0.16
129_N	179_F	0.676	0.16
477_S	493_K	0.675	0.16
394_L	461_I	0.675	0.16
492_Q	495_E	0.673	0.16
229_I	407_G	0.672	0.15
135_V	320_V	0.671	0.15
138_I	256_I	0.671	0.15
330_G	399_S	0.670	0.15
183_I	227_G	0.670	0.15
174_I	616_I	0.668	0.15
271_F	279_V	0.667	0.15
351_L	405_M	0.667	0.15
171_I	268_G	0.666	0.15
487_Q	545_Q	0.664	0.15
169_K	185_I	0.662	0.15
309_I	344_I	0.662	0.15
606_K	612_Q	0.662	0.15
203_G	207_G	0.661	0.15
323_L	338_G	0.661	0.15
561_N	569_S	0.660	0.15
394_L	646_L	0.657	0.15
604_V	622_R	0.657	0.15
209_I	556_T	0.657	0.15
514_N	596_A	0.656	0.15
626_D	631_E	0.656	0.15
470_T	480_A	0.656	0.15
215_F	528_I	0.655	0.15
195_A	370_G	0.655	0.15
586_V	599_I	0.653	0.15
507_S	534_R	0.653	0.15
469_E	611_N	0.652	0.15
441_I	554_G	0.651	0.15
489_I	509_E	0.651	0.15
520_S	576_S	0.650	0.15
411_A	630_R	0.649	0.15
136_P	304_I	0.648	0.15
473_T	584_S	0.648	0.15
562_I	631_E	0.647	0.15
557_A	588_W	0.647	0.15
400_I	407_G	0.647	0.15
514_N	632_R	0.646	0.15
392_D	461_I	0.645	0.15
495_E	552_Q	0.645	0.15
255_P	425_P	0.645	0.15
497_S	584_S	0.643	0.15
220_S	227_G	0.643	0.15
303_L	401_M	0.642	0.15
450_T	572_V	0.642	0.15
309_I	379_F	0.642	0.15
144_L	221_G	0.641	0.15
415_N	508_P	0.641	0.15
432_A	439_F	0.639	0.15
336_I	399_S	0.637	0.15
515_L	636_V	0.636	0.15
240_W	369_M	0.633	0.15
512_E	589_N	0.632	0.15
185_I	212_T	0.632	0.15
258_I	401_M	0.632	0.15
156_T	171_I	0.630	0.14
322_F	380_G	0.628	0.14
137_F	257_I	0.628	0.14
467_L	631_E	0.627	0.14
465_P	497_S	0.627	0.14
324_F	379_F	0.623	0.14
243_K	642_A	0.623	0.14
273_F	599_I	0.622	0.14
141_G	422_H	0.621	0.14
516_S	584_S	0.620	0.14
466_V	492_Q	0.620	0.14
515_L	598_L	0.618	0.14
441_I	470_T	0.617	0.14
416_V	442_A	0.616	0.14
540_E	572_V	0.616	0.14
540_E	552_Q	0.613	0.14
176_S	180_S	0.612	0.14
302_A	404_S	0.612	0.14
564_I	587_D	0.611	0.14
510_L	575_P	0.610	0.14
209_I	571_A	0.609	0.14
220_S	279_V	0.609	0.14
561_N	624_L	0.608	0.14
321_A	600_F	0.606	0.14
245_K	570_E	0.605	0.14
282_I	327_A	0.604	0.14
132_S	141_G	0.604	0.14
499_F	645_L	0.604	0.14
522_D	640_E	0.603	0.14
296_S	453_F	0.602	0.14
133_F	263_A	0.602	0.14
471_A	486_K	0.601	0.14
469_E	477_S	0.601	0.14
489_I	493_K	0.599	0.14
265_L	552_Q	0.599	0.14
416_V	430_L	0.599	0.14
309_I	425_P	0.596	0.14
576_S	636_V	0.595	0.14
532_S	612_Q	0.595	0.14
463_A	628_N	0.594	0.14
322_F	646_L	0.593	0.14
593_G	625_M	0.593	0.14
574_E	632_R	0.592	0.14
246_V	373_A	0.591	0.14
452_L	511_I	0.591	0.14
506_I	644_K	0.591	0.14
501_K	637_Q	0.591	0.14
476_P	483_N	0.590	0.14
218_S	283_F	0.590	0.14
340_I	407_G	0.590	0.14
562_I	616_I	0.587	0.14
322_F	578_A	0.587	0.14
536_A	588_W	0.587	0.14
188_G	219_A	0.586	0.14
541_S	642_A	0.585	0.13
531_L	596_A	0.585	0.13
185_I	282_I	0.584	0.13
369_M	443_V	0.584	0.13
129_N	625_M	0.582	0.13
631_E	639_T	0.581	0.13
444_I	544_K	0.581	0.13
176_S	628_N	0.580	0.13
473_T	483_N	0.580	0.13
306_G	309_I	0.579	0.13
126_H	191_A	0.578	0.13
452_L	456_V	0.578	0.13
373_A	420_V	0.578	0.13
135_V	380_G	0.576	0.13
401_M	479_A	0.575	0.13
508_P	635_S	0.574	0.13
575_P	601_M	0.570	0.13
305_L	614_L	0.570	0.13
471_A	483_N	0.568	0.13
517_G	643_Y	0.568	0.13
377_G	388_F	0.567	0.13
460_D	504_D	0.566	0.13
262_F	644_K	0.566	0.13
177_A	399_S	0.565	0.13
133_F	189_Y	0.565	0.13
629_Y	634_L	0.565	0.13
413_I	643_Y	0.563	0.13
533_R	579_F	0.562	0.13
491_S	501_K	0.561	0.13
580_G	621_S	0.561	0.13
342_V	371_K	0.561	0.13
148_A	391_Q	0.560	0.13
498_E	502_L	0.559	0.13
577_V	645_L	0.559	0.13
235_G	429_V	0.559	0.13
593_G	636_V	0.557	0.13
339_P	346_I	0.556	0.13
452_L	481_A	0.556	0.13
444_I	584_S	0.556	0.13
357_L	619_M	0.556	0.13
303_L	308_M	0.555	0.13
312_D	315_G	0.554	0.13
580_G	604_V	0.553	0.13
516_S	552_Q	0.552	0.13
483_N	496_M	0.552	0.13
509_E	570_E	0.552	0.13
217_D	276_G	0.550	0.13
557_A	581_I	0.550	0.13
185_I	416_V	0.550	0.13
340_I	396_V	0.548	0.13
498_E	640_E	0.547	0.13
474_S	529_Q	0.546	0.13
478_E	482_A	0.546	0.13
507_S	579_F	0.546	0.13
406_T	509_E	0.545	0.13
561_N	595_E	0.544	0.13
596_A	625_M	0.542	0.13
552_Q	574_E	0.542	0.13
537_L	543_F	0.541	0.13
639_T	644_K	0.538	0.12
233_L	626_D	0.537	0.12
344_I	432_A	0.537	0.12
192_Y	242_K	0.537	0.12
505_I	514_N	0.537	0.12
179_F	338_G	0.537	0.12
206_G	259_I	0.536	0.12
525_D	544_K	0.534	0.12
558_I	643_Y	0.534	0.12
440_F	594_S	0.534	0.12
469_E	486_K	0.532	0.12
409_V	412_M	0.532	0.12
224_F	400_I	0.532	0.12
494_A	498_E	0.532	0.12
487_Q	533_R	0.531	0.12
194_I	210_A	0.530	0.12
397_I	403_G	0.530	0.12
435_H	438_M	0.530	0.12
341_A	418_D	0.530	0.12
283_F	376_M	0.529	0.12
564_I	569_S	0.528	0.12
185_I	400_I	0.528	0.12
125_R	624_L	0.527	0.12
640_E	645_L	0.527	0.12
414_G	439_F	0.527	0.12
553_Q	569_S	0.527	0.12
576_S	588_W	0.525	0.12
513_P	616_I	0.524	0.12
397_I	450_T	0.524	0.12
551_E	600_F	0.524	0.12
548_L	569_S	0.523	0.12
210_A	630_R	0.523	0.12
463_A	570_E	0.521	0.12
471_A	484_E	0.521	0.12
210_A	230_A	0.520	0.12
214_S	217_D	0.519	0.12
522_D	635_S	0.519	0.12
441_I	496_M	0.518	0.12
560_M	643_Y	0.517	0.12
530_K	549_N	0.517	0.12
484_E	496_M	0.516	0.12
467_L	492_Q	0.515	0.12
233_L	493_K	0.515	0.12
477_S	488_P	0.514	0.12
231_G	370_G	0.514	0.12
400_I	408_S	0.514	0.12
182_M	313_M	0.513	0.12
253_I	401_M	0.513	0.12
560_M	604_V	0.512	0.12
309_I	376_M	0.512	0.12
302_A	396_V	0.511	0.12
577_V	606_K	0.511	0.12
189_Y	339_P	0.511	0.12
221_G	327_A	0.511	0.12
254_M	389_A	0.511	0.12
301_L	442_A	0.509	0.12
140_V	253_I	0.509	0.12
309_I	348_P	0.508	0.12
536_A	647_E	0.507	0.12
193_S	299_I	0.507	0.12
562_I	600_F	0.507	0.12
352_G	426_I	0.506	0.12
215_F	258_I	0.506	0.12
234_A	286_L	0.505	0.12
643_Y	647_E	0.505	0.12
569_S	616_I	0.504	0.12
205_I	606_K	0.503	0.12
560_M	646_L	0.502	0.12
586_V	596_A	0.502	0.12
227_G	506_I	0.502	0.12
583_R	635_S	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2r48A	1	0.16	100	0.831	Contact Map
1a6jA	4	0.2385	100	0.861	Contact Map
3qnqA	2	0.56	100	0.864	Contact Map
1a3aA	2	0.22	100	0.864	Contact Map
3urrA	2	0.2308	100	0.864	Contact Map
2r4qA	1	0.1569	100	0.865	Contact Map
2a0jA	1	0.2231	100	0.866	Contact Map
3oxpA	2	0.2231	100	0.868	Contact Map
2oq3A	1	0.2215	100	0.869	Contact Map
4m62S	1	0.2262	100	0.869	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.014 seconds.