YESX - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YESX - Rhamnogalacturonan exolyase YesX

UniProt:	O31527	Sequences: MKPKKRQMEYLTRGLIAVQTEQGVFVSWRFLGTDHETTAFHLYRDGKRITRDPIAESTNFLDQNGTADSVYQVAAVNKGREEKLSKKARVWQENVLEVPLAKPEGGVTPDGKPYTYSANDASVGDIDGDGEYEMILKWDPSNSKDNAHDGYTGEVLIDAYKLDGTFLWRINLGRNIRAGAHYTQFMVYDLDGDGKAEIAMKTADGTTDGKGHIIGDEQADFRNEQGRILSGPEYLTVFKGETGEALTTVEYEPPRGKLEDWGDGYGNRMDRFLAGTAYLDGERPSLVMARGYYTRTVLVAYDFRNGRLKKRWVFDSNQPGHEAYAGQGNHSLSVADVDGDGKDEIIYGAMAVDHDGTGLYSTGLGHGDAMHVGDLDPSRKGLEVFQVHEDATKPYGLSLRDAGTGEILWGVHAGTDVGRGMAAHIDPSYKGSLVWGIDPPGNDGMSYGLFTSKGEKISDKAPSSANFAIWWDGDLVRELLDHDWDGTIGRPKIEKWDAENGCLKTIFQPAGVLSNNGTKGNPVLQANLFGDWREEVIWRTEDSSALRIYTTTHLTRHCFYTLMHDPVYRLGIAWQNTAYNQPPHTSFYLGTGMKKPPKPALYIAGSKAEAPL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	612 (572)
Sequences:	484 (331)
Seq/√Len:	13.8

BACSU - YESX YESW

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
155_V	178_A	6.436	1.00
302_D	311_R	5.854	1.00
335_A	372_V	5.329	1.00
199_A	286_L	4.952	1.00
239_K	246_L	4.688	1.00
154_E	171_N	4.464	1.00
124_G	187_V	4.178	1.00
374_D	383_E	4.022	1.00
132_Y	563_M	4.004	1.00
117_S	141_S	3.903	1.00
289_A	347_Y	3.818	1.00
25_F	552_T	3.739	0.99
186_M	190_L	3.639	0.99
387_V	420_G	3.564	0.99
190_L	276_T	3.519	0.99
101_A	166_F	3.330	0.99
126_I	159_A	3.294	0.98
45_D	69_S	3.034	0.97
161_K	165_T	3.027	0.97
97_E	545_A	3.021	0.97
139_D	143_S	3.002	0.97
41_H	50_T	2.963	0.97
475_L	557_H	2.931	0.97
12_T	131_E	2.891	0.96
252_E	310_K	2.825	0.96
378_S	430_K	2.805	0.96
329_N	386_Q	2.800	0.96
144_K	148_H	2.753	0.95
186_M	276_T	2.631	0.94
50_T	53_P	2.627	0.94
296_T	350_M	2.571	0.93
497_D	500_N	2.566	0.93
32_G	564_H	2.520	0.92
523_V	539_R	2.519	0.92
324_Y	358_G	2.515	0.92
342_K	354_H	2.501	0.92
236_T	245_A	2.499	0.92
360_Y	400_R	2.490	0.92
239_K	244_E	2.448	0.91
497_D	504_K	2.438	0.91
526_A	572_I	2.415	0.91
157_I	200_M	2.408	0.91
424_H	433_L	2.404	0.91
505_T	508_Q	2.360	0.90
451_T	455_E	2.346	0.89
149_D	227_R	2.337	0.89
50_T	54_I	2.327	0.89
470_W	477_R	2.293	0.88
494_E	505_T	2.285	0.88
54_I	57_S	2.262	0.88
287_V	298_L	2.245	0.87
41_H	81_E	2.245	0.87
567_V	571_G	2.242	0.87
102_K	543_S	2.234	0.87
422_A	434_V	2.201	0.86
540_T	545_A	2.184	0.86
482_H	520_G	2.178	0.85
131_E	161_K	2.013	0.80
259_E	264_G	2.009	0.80
195_K	241_E	1.987	0.80
126_I	135_I	1.964	0.79
526_A	563_M	1.960	0.79
195_K	239_K	1.957	0.79
269_M	272_F	1.946	0.78
138_W	158_D	1.914	0.77
76_V	81_E	1.902	0.76
373_G	432_S	1.900	0.76
41_H	48_R	1.891	0.76
6_R	343_D	1.869	0.75
121_A	136_L	1.841	0.74
98_V	548_I	1.831	0.74
275_G	331_S	1.821	0.73
65_G	69_S	1.816	0.73
559_F	587_F	1.816	0.73
421_M	468_A	1.814	0.73
565_D	586_S	1.808	0.73
121_A	523_V	1.806	0.73
458_S	461_A	1.795	0.72
401_D	404_T	1.792	0.72
186_M	286_L	1.791	0.72
395_Y	410_G	1.782	0.71
246_L	303_F	1.775	0.71
184_Q	201_K	1.763	0.71
190_L	286_L	1.755	0.70
30_F	58_T	1.735	0.69
560_Y	599_P	1.717	0.69
158_D	169_R	1.709	0.68
563_M	572_I	1.693	0.67
571_G	585_T	1.692	0.67
115_T	141_S	1.691	0.67
114_Y	153_G	1.677	0.67
513_L	539_R	1.675	0.67
247_T	303_F	1.646	0.65
329_N	370_M	1.640	0.65
476_V	591_T	1.637	0.65
122_S	187_V	1.623	0.64
105_G	115_T	1.616	0.64
118_A	543_S	1.598	0.63
335_A	567_V	1.594	0.63
375_L	422_A	1.579	0.62
323_A	361_S	1.559	0.61
204_D	215_G	1.556	0.61
474_D	478_E	1.553	0.60
494_E	508_Q	1.538	0.60
258_L	269_M	1.534	0.59
425_I	449_L	1.526	0.59
385_F	420_G	1.523	0.59
275_G	287_V	1.519	0.59
351_A	360_Y	1.512	0.58
399_L	434_V	1.507	0.58
121_A	546_L	1.504	0.58
139_D	178_A	1.501	0.58
26_V	42_L	1.498	0.58
358_G	361_S	1.488	0.57
370_M	384_V	1.482	0.57
127_D	161_K	1.480	0.57
428_S	496_W	1.479	0.57
132_Y	526_A	1.476	0.56
388_H	398_S	1.469	0.56
297_V	313_V	1.466	0.56
111_G	153_G	1.466	0.56
285_S	302_D	1.463	0.56
295_R	315_D	1.463	0.56
280_D	283_R	1.440	0.55
457_I	496_W	1.440	0.55
376_D	453_K	1.433	0.54
199_A	237_V	1.429	0.54
133_E	159_A	1.424	0.54
327_Q	365_G	1.421	0.53
41_H	76_V	1.417	0.53
372_V	567_V	1.414	0.53
32_G	560_Y	1.410	0.53
283_R	304_R	1.406	0.53
76_V	79_G	1.401	0.52
467_F	583_P	1.385	0.52
468_A	477_R	1.384	0.51
299_V	313_V	1.379	0.51
525_Q	567_V	1.378	0.51
571_G	574_W	1.372	0.51
25_F	59_N	1.369	0.51
139_D	155_V	1.368	0.51
237_V	286_L	1.368	0.51
430_K	588_Y	1.354	0.50
409_W	434_V	1.353	0.50
472_D	478_E	1.349	0.50
472_D	495_K	1.347	0.50
458_S	462_P	1.342	0.49
423_A	468_A	1.336	0.49
478_E	495_K	1.335	0.49
540_T	547_R	1.335	0.49
350_M	358_G	1.333	0.49
375_L	399_L	1.328	0.48
122_S	185_F	1.324	0.48
561_T	564_H	1.322	0.48
123_V	528_L	1.319	0.48
44_R	62_D	1.314	0.48
493_I	536_V	1.307	0.47
354_H	374_D	1.306	0.47
199_A	288_M	1.303	0.47
111_G	114_Y	1.301	0.47
370_M	386_Q	1.298	0.47
195_K	342_K	1.296	0.47
285_S	311_R	1.295	0.47
43_Y	81_E	1.289	0.46
135_I	159_A	1.281	0.46
25_F	553_H	1.275	0.46
427_P	497_D	1.270	0.45
375_L	432_S	1.270	0.45
123_V	548_I	1.269	0.45
379_R	401_D	1.268	0.45
296_T	324_Y	1.265	0.45
17_A	24_V	1.262	0.45
360_Y	388_H	1.262	0.45
473_G	554_L	1.260	0.45
346_I	351_A	1.258	0.45
100_L	118_A	1.250	0.44
229_L	266_G	1.246	0.44
121_A	134_M	1.240	0.44
227_R	265_Y	1.234	0.43
60_F	195_K	1.233	0.43
102_K	544_S	1.231	0.43
379_R	406_E	1.226	0.43
346_I	372_V	1.226	0.43
385_F	409_W	1.226	0.43
567_V	586_S	1.218	0.43
138_W	169_R	1.217	0.43
16_I	550_T	1.206	0.42
34_D	75_A	1.201	0.42
119_N	516_N	1.200	0.42
30_F	40_F	1.196	0.41
529_F	548_I	1.193	0.41
26_V	552_T	1.192	0.41
102_K	105_G	1.178	0.41
351_A	370_M	1.173	0.40
181_H	267_N	1.172	0.40
141_S	153_G	1.170	0.40
515_N	539_R	1.159	0.40
18_V	550_T	1.155	0.39
376_D	399_L	1.153	0.39
500_N	504_K	1.152	0.39
195_K	244_E	1.147	0.39
542_D	547_R	1.146	0.39
140_P	158_D	1.143	0.39
566_P	570_L	1.143	0.39
105_G	114_Y	1.141	0.39
314_F	324_Y	1.139	0.38
181_H	292_Y	1.133	0.38
75_A	82_E	1.130	0.38
512_V	540_T	1.129	0.38
210_K	244_E	1.125	0.38
32_G	599_P	1.118	0.37
249_V	301_Y	1.117	0.37
105_G	113_P	1.116	0.37
123_V	537_I	1.116	0.37
157_I	213_I	1.115	0.37
8_M	32_G	1.113	0.37
537_I	548_I	1.109	0.37
34_D	560_Y	1.105	0.37
204_D	214_I	1.104	0.37
275_G	334_V	1.104	0.37
470_W	590_G	1.092	0.36
257_K	260_D	1.091	0.36
159_A	563_M	1.088	0.36
216_D	412_H	1.087	0.36
124_G	196_A	1.085	0.36
374_D	380_K	1.080	0.36
119_N	137_K	1.080	0.36
331_S	370_M	1.076	0.35
370_M	571_G	1.071	0.35
317_N	325_A	1.070	0.35
46_G	65_G	1.068	0.35
429_Y	457_I	1.066	0.35
525_Q	583_P	1.065	0.35
19_Q	65_G	1.058	0.34
25_F	550_T	1.057	0.34
298_L	352_V	1.057	0.34
417_V	436_G	1.055	0.34
422_A	432_S	1.054	0.34
324_Y	350_M	1.054	0.34
154_E	174_R	1.053	0.34
274_A	576_N	1.051	0.34
57_S	554_L	1.049	0.34
360_Y	577_T	1.049	0.34
69_S	90_V	1.047	0.34
593_M	596_P	1.041	0.34
42_L	49_I	1.037	0.33
397_L	411_V	1.037	0.33
267_N	292_Y	1.036	0.33
343_D	570_L	1.032	0.33
423_A	479_L	1.032	0.33
186_M	577_T	1.031	0.33
157_I	185_F	1.030	0.33
74_A	81_E	1.028	0.33
8_M	566_P	1.026	0.33
462_P	496_W	1.020	0.33
429_Y	496_W	1.018	0.33
497_D	501_G	1.014	0.32
237_V	308_L	1.014	0.32
397_L	436_G	1.013	0.32
428_S	497_D	1.013	0.32
463_S	479_L	1.010	0.32
260_D	264_G	1.009	0.32
567_V	570_L	1.009	0.32
57_S	555_T	1.007	0.32
42_L	73_V	1.005	0.32
132_Y	572_I	1.004	0.32
135_I	187_V	1.000	0.32
294_T	365_G	0.997	0.32
158_D	178_A	0.995	0.31
426_D	429_Y	0.995	0.31
49_I	54_I	0.993	0.31
239_K	242_T	0.990	0.31
362_T	384_V	0.988	0.31
138_W	178_A	0.988	0.31
237_V	303_F	0.988	0.31
333_S	574_W	0.988	0.31
7_Q	192_G	0.985	0.31
111_G	151_Y	0.984	0.31
50_T	60_F	0.980	0.31
277_A	345_I	0.979	0.31
451_T	457_I	0.974	0.30
33_T	42_L	0.971	0.30
102_K	118_A	0.969	0.30
310_K	313_V	0.967	0.30
23_G	65_G	0.963	0.30
371_H	584_H	0.963	0.30
149_D	225_Q	0.962	0.30
287_V	334_V	0.960	0.30
30_F	560_Y	0.960	0.30
77_N	82_E	0.960	0.30
273_L	347_Y	0.960	0.30
145_D	181_H	0.959	0.30
388_H	400_R	0.957	0.30
45_D	65_G	0.957	0.30
386_Q	400_R	0.956	0.30
139_D	171_N	0.954	0.30
296_T	358_G	0.951	0.29
41_H	77_N	0.945	0.29
227_R	269_M	0.944	0.29
387_V	523_V	0.936	0.29
35_H	38_T	0.933	0.29
97_E	540_T	0.930	0.29
393_K	410_G	0.929	0.28
62_D	71_Y	0.928	0.28
353_D	357_T	0.928	0.28
519_K	580_N	0.926	0.28
135_I	157_I	0.926	0.28
61_L	550_T	0.925	0.28
184_Q	578_A	0.922	0.28
11_L	14_G	0.917	0.28
159_A	168_W	0.917	0.28
105_G	112_K	0.916	0.28
142_N	153_G	0.912	0.28
467_F	472_D	0.912	0.28
483_D	520_G	0.910	0.28
469_I	536_V	0.909	0.28
275_G	289_A	0.906	0.27
105_G	141_S	0.905	0.27
570_L	585_T	0.905	0.27
115_T	153_G	0.903	0.27
121_A	200_M	0.903	0.27
388_H	417_V	0.903	0.27
33_T	564_H	0.902	0.27
209_G	244_E	0.895	0.27
481_D	494_E	0.885	0.27
204_D	245_A	0.885	0.27
427_P	496_W	0.884	0.27
223_N	227_R	0.884	0.27
177_R	182_Y	0.881	0.26
141_S	155_V	0.877	0.26
384_V	400_R	0.876	0.26
353_D	359_L	0.876	0.26
514_S	536_V	0.876	0.26
452_S	523_V	0.876	0.26
477_R	590_G	0.874	0.26
273_L	292_Y	0.874	0.26
391_A	394_P	0.869	0.26
102_K	234_Y	0.869	0.26
395_Y	414_G	0.862	0.26
45_D	234_Y	0.861	0.26
104_E	217_E	0.858	0.25
216_D	219_A	0.856	0.25
289_A	298_L	0.856	0.25
59_N	554_L	0.855	0.25
357_T	406_E	0.855	0.25
456_K	462_P	0.854	0.25
20_T	23_G	0.851	0.25
42_L	57_S	0.850	0.25
212_H	307_R	0.849	0.25
321_H	325_A	0.847	0.25
168_W	470_W	0.847	0.25
181_H	271_R	0.847	0.25
136_L	523_V	0.845	0.25
191_D	253_P	0.843	0.25
15_L	42_L	0.838	0.25
360_Y	403_G	0.837	0.25
562_L	589_L	0.834	0.24
124_G	135_I	0.834	0.24
221_F	230_S	0.832	0.24
513_L	520_G	0.830	0.24
15_L	26_V	0.830	0.24
43_Y	48_R	0.830	0.24
275_G	298_L	0.829	0.24
567_V	585_T	0.828	0.24
103_P	138_W	0.824	0.24
257_K	264_G	0.824	0.24
30_F	34_D	0.822	0.24
157_I	198_I	0.821	0.24
420_G	523_V	0.820	0.24
60_F	157_I	0.820	0.24
103_P	248_T	0.820	0.24
327_Q	352_V	0.819	0.24
369_A	582_P	0.817	0.24
182_Y	267_N	0.817	0.24
142_N	158_D	0.817	0.24
497_D	506_I	0.815	0.24
15_L	88_A	0.813	0.24
252_E	301_Y	0.813	0.24
352_V	402_A	0.812	0.24
267_N	271_R	0.812	0.24
65_G	91_W	0.812	0.24
528_L	537_I	0.811	0.24
410_G	414_G	0.809	0.23
483_D	514_S	0.809	0.23
355_D	504_K	0.807	0.23
256_G	259_E	0.806	0.23
245_A	303_F	0.805	0.23
410_G	496_W	0.805	0.23
26_V	49_I	0.804	0.23
6_R	570_L	0.804	0.23
41_H	53_P	0.804	0.23
354_H	383_E	0.802	0.23
14_G	34_D	0.802	0.23
393_K	413_A	0.801	0.23
103_P	158_D	0.799	0.23
117_S	543_S	0.799	0.23
136_L	548_I	0.798	0.23
42_L	406_E	0.798	0.23
34_D	343_D	0.798	0.23
304_R	309_K	0.796	0.23
285_S	480_L	0.793	0.23
449_L	526_A	0.792	0.23
208_D	212_H	0.789	0.23
119_N	369_A	0.787	0.23
77_N	81_E	0.787	0.23
297_V	325_A	0.786	0.23
145_D	267_N	0.785	0.23
512_V	520_G	0.785	0.23
289_A	342_K	0.783	0.22
6_R	566_P	0.782	0.22
476_V	592_G	0.782	0.22
25_F	201_K	0.779	0.22
305_N	339_G	0.776	0.22
305_N	355_D	0.775	0.22
171_N	174_R	0.775	0.22
201_K	578_A	0.773	0.22
105_G	153_G	0.773	0.22
119_N	143_S	0.772	0.22
483_D	521_N	0.772	0.22
138_W	142_N	0.772	0.22
16_I	42_L	0.771	0.22
373_G	422_A	0.770	0.22
42_L	452_S	0.770	0.22
204_D	314_F	0.767	0.22
145_D	292_Y	0.767	0.22
34_D	227_R	0.765	0.22
137_K	178_A	0.763	0.22
266_G	269_M	0.762	0.22
49_I	228_I	0.761	0.22
42_L	228_I	0.760	0.22
424_H	427_P	0.760	0.22
509_P	512_V	0.759	0.22
349_A	460_K	0.759	0.22
378_S	588_Y	0.757	0.22
344_E	353_D	0.757	0.22
34_D	316_S	0.756	0.21
119_N	515_N	0.756	0.21
137_K	158_D	0.754	0.21
38_T	198_I	0.753	0.21
575_Q	580_N	0.753	0.21
25_F	276_T	0.752	0.21
39_A	55_A	0.752	0.21
585_T	589_L	0.749	0.21
501_G	504_K	0.748	0.21
13_R	17_A	0.748	0.21
217_E	355_D	0.748	0.21
426_D	497_D	0.748	0.21
247_T	301_Y	0.748	0.21
337_V	351_A	0.746	0.21
456_K	459_D	0.746	0.21
88_A	91_W	0.746	0.21
298_L	347_Y	0.744	0.21
95_V	549_Y	0.743	0.21
146_N	177_R	0.742	0.21
124_G	422_A	0.739	0.21
256_G	260_D	0.739	0.21
116_Y	133_E	0.739	0.21
247_T	309_K	0.737	0.21
185_F	437_I	0.737	0.21
52_D	234_Y	0.734	0.21
177_R	183_T	0.730	0.21
228_I	347_Y	0.728	0.20
94_N	552_T	0.728	0.20
182_Y	226_G	0.727	0.20
253_P	297_V	0.727	0.20
133_E	563_M	0.726	0.20
138_W	238_F	0.725	0.20
65_G	90_V	0.725	0.20
9_E	561_T	0.721	0.20
139_D	154_E	0.720	0.20
141_S	158_D	0.720	0.20
252_E	313_V	0.720	0.20
92_Q	157_I	0.720	0.20
65_G	301_Y	0.718	0.20
386_Q	398_S	0.718	0.20
571_G	586_S	0.717	0.20
502_C	505_T	0.717	0.20
588_Y	592_G	0.716	0.20
370_M	375_L	0.715	0.20
480_L	536_V	0.714	0.20
301_Y	525_Q	0.714	0.20
131_E	163_D	0.714	0.20
378_S	453_K	0.713	0.20
186_M	275_G	0.713	0.20
196_A	352_V	0.712	0.20
512_V	547_R	0.712	0.20
8_M	564_H	0.712	0.20
137_K	169_R	0.710	0.20
46_G	91_W	0.709	0.20
124_G	209_G	0.709	0.20
335_A	375_L	0.708	0.20
227_R	258_L	0.707	0.20
111_G	158_D	0.707	0.20
380_K	383_E	0.706	0.20
275_G	350_M	0.706	0.20
559_F	564_H	0.705	0.20
85_S	549_Y	0.705	0.20
379_R	424_H	0.705	0.20
279_L	345_I	0.703	0.20
338_D	344_E	0.702	0.20
331_S	351_A	0.702	0.20
247_T	286_L	0.701	0.20
48_R	195_K	0.701	0.20
332_L	577_T	0.701	0.20
426_D	496_W	0.701	0.20
273_L	289_A	0.700	0.20
72_Q	316_S	0.697	0.19
97_E	547_R	0.695	0.19
228_I	576_N	0.694	0.19
126_I	304_R	0.693	0.19
38_T	75_A	0.690	0.19
147_A	227_R	0.690	0.19
467_F	525_Q	0.688	0.19
140_P	169_R	0.688	0.19
321_H	358_G	0.688	0.19
219_A	470_W	0.685	0.19
519_K	582_P	0.685	0.19
480_L	514_S	0.685	0.19
200_M	352_V	0.685	0.19
318_Q	321_H	0.684	0.19
30_F	452_S	0.684	0.19
399_L	409_W	0.684	0.19
294_T	297_V	0.682	0.19
60_F	452_S	0.682	0.19
204_D	213_I	0.680	0.19
38_T	50_T	0.679	0.19
459_D	556_R	0.677	0.19
57_S	558_C	0.677	0.19
145_D	182_Y	0.676	0.19
6_R	560_Y	0.676	0.19
526_A	529_F	0.675	0.19
14_G	85_S	0.674	0.19
373_G	589_L	0.673	0.19
127_D	165_T	0.672	0.19
512_V	538_W	0.671	0.19
364_L	407_I	0.670	0.19
247_T	308_L	0.670	0.19
218_Q	355_D	0.669	0.18
46_G	69_S	0.669	0.18
319_P	322_E	0.669	0.18
376_D	452_S	0.669	0.18
143_S	158_D	0.668	0.18
169_R	178_A	0.668	0.18
327_Q	347_Y	0.668	0.18
492_K	505_T	0.667	0.18
93_E	195_K	0.664	0.18
390_D	536_V	0.664	0.18
303_F	309_K	0.662	0.18
8_M	560_Y	0.661	0.18
333_S	571_G	0.660	0.18
296_T	347_Y	0.656	0.18
159_A	436_G	0.654	0.18
54_I	363_G	0.654	0.18
527_N	535_E	0.653	0.18
14_G	27_S	0.653	0.18
223_N	266_G	0.653	0.18
331_S	384_V	0.652	0.18
133_E	161_K	0.652	0.18
103_P	238_F	0.652	0.18
42_L	96_L	0.651	0.18
226_G	271_R	0.651	0.18
301_Y	395_Y	0.650	0.18
532_W	589_L	0.648	0.18
176_I	179_G	0.648	0.18
49_I	198_I	0.647	0.18
55_A	79_G	0.647	0.18
177_R	255_R	0.646	0.18
39_A	75_A	0.646	0.18
20_T	61_L	0.645	0.18
516_N	582_P	0.644	0.18
238_F	248_T	0.643	0.18
448_G	462_P	0.643	0.18
327_Q	345_I	0.643	0.18
157_I	428_S	0.642	0.18
404_T	555_T	0.641	0.18
409_W	578_A	0.640	0.18
123_V	563_M	0.640	0.18
41_H	74_A	0.639	0.18
120_D	519_K	0.639	0.18
35_H	587_F	0.638	0.18
39_A	57_S	0.637	0.17
134_M	537_I	0.637	0.17
152_T	238_F	0.635	0.17
222_R	558_C	0.634	0.17
393_K	414_G	0.633	0.17
322_E	325_A	0.633	0.17
293_Y	328_G	0.632	0.17
135_I	198_I	0.632	0.17
149_D	224_E	0.631	0.17
410_G	413_A	0.630	0.17
434_V	452_S	0.630	0.17
34_D	360_Y	0.630	0.17
337_V	402_A	0.629	0.17
120_D	580_N	0.628	0.17
473_G	555_T	0.628	0.17
384_V	565_D	0.627	0.17
111_G	169_R	0.626	0.17
436_G	452_S	0.626	0.17
74_A	84_L	0.624	0.17
450_F	456_K	0.624	0.17
360_Y	398_S	0.624	0.17
390_D	394_P	0.622	0.17
241_E	355_D	0.621	0.17
190_L	417_V	0.621	0.17
343_D	567_V	0.620	0.17
120_D	466_N	0.619	0.17
302_D	313_V	0.619	0.17
394_P	410_G	0.619	0.17
514_S	538_W	0.618	0.17
34_D	40_F	0.618	0.17
249_V	252_E	0.617	0.17
560_Y	597_P	0.615	0.17
370_M	549_Y	0.614	0.17
296_T	360_Y	0.613	0.17
63_Q	89_R	0.612	0.17
338_D	353_D	0.612	0.17
117_S	139_D	0.611	0.17
223_N	294_T	0.611	0.17
251_Y	295_R	0.610	0.17
38_T	101_A	0.610	0.17
147_A	203_A	0.610	0.17
27_S	216_D	0.609	0.17
380_K	482_H	0.608	0.17
137_K	155_V	0.608	0.17
475_L	591_T	0.608	0.17
167_L	401_D	0.608	0.17
364_L	398_S	0.608	0.17
157_I	171_N	0.608	0.17
450_F	578_A	0.607	0.17
331_S	571_G	0.607	0.17
475_L	588_Y	0.607	0.17
596_P	599_P	0.606	0.17
48_R	212_H	0.605	0.17
184_Q	292_Y	0.605	0.17
54_I	554_L	0.604	0.16
59_N	91_W	0.603	0.16
364_L	429_Y	0.603	0.16
155_V	288_M	0.601	0.16
127_D	163_D	0.601	0.16
244_E	510_A	0.601	0.16
150_G	177_R	0.600	0.16
182_Y	271_R	0.600	0.16
458_S	463_S	0.599	0.16
182_Y	270_D	0.598	0.16
177_R	267_N	0.598	0.16
221_F	257_K	0.598	0.16
42_L	93_E	0.597	0.16
147_A	269_M	0.597	0.16
332_L	347_Y	0.597	0.16
102_K	552_T	0.596	0.16
198_I	567_V	0.596	0.16
225_Q	529_F	0.595	0.16
35_H	558_C	0.595	0.16
183_T	347_Y	0.594	0.16
18_V	364_L	0.594	0.16
457_I	514_S	0.594	0.16
470_W	593_M	0.593	0.16
153_G	169_R	0.593	0.16
316_S	559_F	0.591	0.16
226_G	270_D	0.590	0.16
64_N	68_D	0.590	0.16
157_I	453_K	0.590	0.16
373_G	546_L	0.589	0.16
42_L	54_I	0.588	0.16
17_A	90_V	0.588	0.16
476_V	497_D	0.588	0.16
111_G	142_N	0.588	0.16
360_Y	405_G	0.588	0.16
289_A	350_M	0.588	0.16
534_E	562_L	0.587	0.16
158_D	238_F	0.587	0.16
287_V	345_I	0.587	0.16
145_D	177_R	0.587	0.16
349_A	406_E	0.586	0.16
198_I	286_L	0.585	0.16
172_L	183_T	0.585	0.16
268_R	293_Y	0.584	0.16
475_L	589_L	0.583	0.16
325_A	358_G	0.582	0.16
142_N	152_T	0.581	0.16
373_G	387_V	0.580	0.16
273_L	296_T	0.580	0.16
387_V	416_D	0.579	0.16
33_T	599_P	0.578	0.16
383_E	574_W	0.578	0.16
203_A	230_S	0.577	0.16
142_N	155_V	0.577	0.16
325_A	352_V	0.576	0.16
178_A	234_Y	0.575	0.16
307_R	450_F	0.575	0.16
102_K	138_W	0.575	0.16
262_G	293_Y	0.575	0.16
190_L	399_L	0.574	0.16
314_F	325_A	0.573	0.16
379_R	408_L	0.572	0.16
183_T	201_K	0.572	0.16
227_R	260_D	0.571	0.16
333_S	372_V	0.570	0.15
588_Y	599_P	0.570	0.15
145_D	180_A	0.568	0.15
104_E	111_G	0.568	0.15
135_I	346_I	0.568	0.15
159_A	409_W	0.567	0.15
467_F	521_N	0.567	0.15
419_R	466_N	0.567	0.15
9_E	13_R	0.566	0.15
42_L	50_T	0.565	0.15
181_H	226_G	0.565	0.15
182_Y	292_Y	0.564	0.15
95_V	547_R	0.564	0.15
25_F	554_L	0.564	0.15
140_P	178_A	0.564	0.15
24_V	349_A	0.563	0.15
364_L	457_I	0.563	0.15
159_A	198_I	0.561	0.15
59_N	551_T	0.561	0.15
10_Y	408_L	0.561	0.15
60_F	95_V	0.561	0.15
385_F	574_W	0.560	0.15
475_L	590_G	0.560	0.15
23_G	91_W	0.559	0.15
78_K	318_Q	0.558	0.15
209_G	214_I	0.558	0.15
176_I	183_T	0.558	0.15
179_G	182_Y	0.558	0.15
151_Y	253_P	0.558	0.15
115_T	207_T	0.558	0.15
371_H	466_N	0.557	0.15
42_L	500_N	0.557	0.15
150_G	238_F	0.555	0.15
135_I	161_K	0.554	0.15
20_T	90_V	0.553	0.15
119_N	371_H	0.553	0.15
177_R	226_G	0.553	0.15
104_E	459_D	0.552	0.15
273_L	332_L	0.551	0.15
72_Q	578_A	0.550	0.15
180_A	524_L	0.550	0.15
53_P	334_V	0.550	0.15
314_F	358_G	0.550	0.15
238_F	524_L	0.549	0.15
379_R	451_T	0.548	0.15
376_D	409_W	0.548	0.15
47_K	72_Q	0.547	0.15
369_A	516_N	0.546	0.15
30_F	563_M	0.546	0.15
479_L	492_K	0.546	0.15
451_T	560_Y	0.544	0.15
588_Y	591_T	0.544	0.15
196_A	571_G	0.543	0.15
111_G	138_W	0.543	0.15
66_T	69_S	0.543	0.15
126_I	309_K	0.542	0.15
126_I	349_A	0.542	0.15
184_Q	274_A	0.542	0.15
168_W	300_A	0.541	0.15
470_W	585_T	0.541	0.15
518_T	580_N	0.541	0.15
155_V	169_R	0.540	0.15
39_A	50_T	0.540	0.15
229_L	258_L	0.538	0.15
360_Y	560_Y	0.538	0.15
571_G	583_P	0.536	0.15
114_Y	151_Y	0.536	0.15
93_E	550_T	0.536	0.15
193_D	300_A	0.535	0.15
199_A	249_V	0.535	0.15
370_M	521_N	0.534	0.15
14_G	25_F	0.534	0.15
303_F	436_G	0.533	0.14
155_V	158_D	0.533	0.14
251_Y	297_V	0.531	0.14
141_S	169_R	0.531	0.14
391_A	395_Y	0.531	0.14
236_T	287_V	0.531	0.14
98_V	134_M	0.530	0.14
54_I	59_N	0.530	0.14
138_W	248_T	0.529	0.14
207_T	245_A	0.529	0.14
515_N	521_N	0.528	0.14
8_M	599_P	0.528	0.14
469_I	548_I	0.528	0.14
177_R	270_D	0.528	0.14
557_H	560_Y	0.527	0.14
171_N	207_T	0.527	0.14
397_L	438_D	0.526	0.14
363_G	558_C	0.525	0.14
214_I	477_R	0.525	0.14
145_D	150_G	0.524	0.14
524_L	572_I	0.523	0.14
103_P	140_P	0.523	0.14
147_A	258_L	0.523	0.14
373_G	380_K	0.522	0.14
153_G	158_D	0.522	0.14
469_I	563_M	0.521	0.14
70_V	157_I	0.521	0.14
140_P	143_S	0.520	0.14
436_G	526_A	0.520	0.14
342_K	430_K	0.520	0.14
153_G	222_R	0.519	0.14
38_T	286_L	0.518	0.14
22_Q	64_N	0.518	0.14
362_T	398_S	0.518	0.14
216_D	545_A	0.518	0.14
360_Y	402_A	0.517	0.14
25_F	34_D	0.517	0.14
298_L	586_S	0.516	0.14
500_N	506_I	0.516	0.14
104_E	153_G	0.516	0.14
38_T	77_N	0.516	0.14
234_Y	414_G	0.516	0.14
33_T	593_M	0.515	0.14
66_T	70_V	0.514	0.14
469_I	480_L	0.514	0.14
119_N	466_N	0.513	0.14
519_K	575_Q	0.513	0.14
449_L	593_M	0.513	0.14
286_L	549_Y	0.512	0.14
354_H	359_L	0.512	0.14
19_Q	552_T	0.512	0.14
202_T	236_T	0.512	0.14
574_W	583_P	0.512	0.14
218_Q	559_F	0.512	0.14
376_D	429_Y	0.512	0.14
102_K	155_V	0.512	0.14
307_R	455_E	0.511	0.14
409_W	420_G	0.511	0.14
354_H	449_L	0.511	0.14
60_F	559_F	0.510	0.14
55_A	541_E	0.509	0.14
400_R	404_T	0.509	0.14
421_M	537_I	0.509	0.14
344_E	383_E	0.509	0.14
67_A	403_G	0.509	0.14
399_L	453_K	0.508	0.14
316_S	320_G	0.508	0.14
48_R	54_I	0.507	0.14
201_K	248_T	0.507	0.14
297_V	470_W	0.507	0.14
223_N	270_D	0.507	0.14
466_N	519_K	0.506	0.14
374_D	381_G	0.505	0.14
387_V	421_M	0.505	0.14
190_L	577_T	0.505	0.14
317_N	463_S	0.505	0.14
351_A	372_V	0.505	0.14
118_A	192_G	0.504	0.14
302_D	456_K	0.504	0.14
147_A	181_H	0.504	0.14
19_Q	90_V	0.503	0.14
249_V	303_F	0.503	0.14
297_V	315_D	0.502	0.14
77_N	80_R	0.502	0.14
42_L	310_K	0.502	0.14
163_D	355_D	0.501	0.14
394_P	398_S	0.501	0.14
262_G	268_R	0.500	0.14
224_E	227_R	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zuyA	1	0.9853	100	0.345	Contact Map
2zuxA	1	0.951	100	0.358	Contact Map
2bwrA	1	0.5523	98.3	0.965	Contact Map
4iglA	1	0.7206	97.4	0.972	Contact Map
4o9xA	1	0.7451	97.3	0.972	Contact Map
4tqjA	2	0.5458	96.6	0.975	Contact Map
1flgA	2	0.6944	96.2	0.976	Contact Map
4mh1A	4	0.6111	94.8	0.978	Contact Map
2ad6A	2	0.701	94.5	0.979	Contact Map
1kv9A	1	0.7402	94.4	0.979	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.