YESW - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YESW - Rhamnogalacturonan endolyase YesW

UniProt:	O31526	Sequences: MRRSCLMIRRRKRMFTAVTLLVLLVMGTSVCPVKAEGAARQMEALNRGLVAVKTDGGIFVSWRFLGTENASVLFNVYRDGQKLNAAPVKTTNYVDKNGSAGSTYTVRAVVNGTEQPASEKASVWAQPYHSVPLDKPAGGTTPKGESYTYSANDASVGDVDGDGQYELILKWDPSNSKDNSQDGYTGDVLIDAYKLDGTKLWRINLGKNIRAGAHYTQFMVYDLDGDGKAEVAMKTADGTKDGTGKVIGNANADYRNEQGRVLSGPEYLTVFQGSTGKELVTANFEPARGNVSDWGDSYGNRVDRFLAGIAYLDGQRPSLIMTRGYYAKTMLVAYNFRDGKLSKLWTLDSSKSGNEAFAGQGNHNLSIADVDGDGKDEIIFGSMAVDHDGKGMYSTGLGHGDALHTGDLDPGRPGLEVFQVHEDKNAKYGLSFRDAATGKILWGVYAGKDVGRGMAADIDPRYPGQEVWANGSLYSAKGVKIGSGVPSSTNFGIWWDGDLLREQLDSNRIDKWDYQNGVSKNMLTASGAAANNGTKATPTLQADLLGDWREEVVWRTEDSSALRIYTTTIPTEHRLYTLMHDPVYRLGIAWQNIAYNQPPHTSFFLGDGMAEQPKPNMYTP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	620 (573)
Sequences:	493 (339)
Seq/√Len:	14.2

BACSU - YESW YESX

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
188_V	211_A	6.614	1.00
335_N	344_L	5.847	1.00
368_A	405_T	5.421	1.00
232_A	319_L	4.887	1.00
272_Q	279_L	4.684	1.00
187_D	204_N	4.490	1.00
157_G	220_V	4.148	1.00
407_D	416_E	4.123	1.00
165_Y	579_M	4.052	1.00
322_T	380_F	3.855	1.00
150_S	174_S	3.848	1.00
59_F	568_T	3.752	0.99
219_M	223_L	3.644	0.99
420_V	453_G	3.634	0.99
223_L	309_I	3.603	0.99
159_V	192_A	3.364	0.99
134_D	199_K	3.362	0.99
194_K	198_T	3.245	0.98
499_L	573_H	3.037	0.98
411_G	463_P	3.037	0.98
79_D	102_S	3.034	0.98
75_N	84_N	3.024	0.98
130_S	561_A	2.999	0.97
285_E	343_K	2.996	0.97
172_D	176_S	2.954	0.97
46_N	164_Q	2.891	0.97
362_N	419_Q	2.872	0.97
513_D	516_N	2.845	0.96
177_K	181_Q	2.789	0.96
66_G	580_H	2.687	0.95
269_T	278_E	2.671	0.95
219_M	309_I	2.633	0.94
84_N	88_V	2.592	0.94
539_T	555_R	2.559	0.93
329_T	383_M	2.541	0.93
513_D	520_K	2.540	0.93
272_Q	277_K	2.537	0.93
375_K	387_H	2.526	0.93
357_F	391_G	2.504	0.93
393_Y	433_R	2.497	0.93
190_I	233_M	2.468	0.92
135_K	559_S	2.467	0.92
542_A	588_I	2.450	0.92
457_D	466_E	2.421	0.91
475_S	479_V	2.415	0.91
494_W	501_R	2.310	0.89
320_I	331_L	2.287	0.89
521_N	524_T	2.268	0.88
182_D	260_R	2.252	0.88
455_A	467_V	2.243	0.88
75_N	114_E	2.227	0.87
583_V	587_G	2.221	0.87
556_T	561_A	2.209	0.87
506_S	536_A	2.158	0.86
228_K	274_S	2.123	0.85
164_Q	194_K	2.091	0.84
228_K	272_Q	2.072	0.83
292_S	297_S	2.012	0.81
84_N	87_P	2.007	0.81
302_V	305_F	2.006	0.81
159_V	168_I	2.002	0.81
542_A	579_M	1.968	0.80
171_W	191_D	1.911	0.78
154_A	169_L	1.902	0.77
109_V	114_E	1.901	0.77
454_M	492_G	1.870	0.76
75_N	82_K	1.841	0.75
428_Y	443_G	1.839	0.75
154_A	539_T	1.825	0.74
575_L	603_F	1.820	0.74
217_Q	234_K	1.818	0.74
308_G	364_N	1.818	0.74
291_V	302_V	1.818	0.74
581_D	602_S	1.811	0.74
148_T	174_S	1.790	0.73
279_L	336_F	1.785	0.73
223_L	319_L	1.781	0.72
482_G	485_V	1.777	0.72
434_D	437_T	1.750	0.71
64_F	91_T	1.733	0.70
406_G	465_Q	1.732	0.70
131_V	564_I	1.720	0.70
219_M	319_L	1.708	0.69
40_R	376_D	1.705	0.69
191_D	202_R	1.705	0.69
579_M	588_I	1.694	0.68
147_Y	186_G	1.691	0.68
529_A	555_R	1.683	0.68
138_G	148_T	1.676	0.68
154_A	562_L	1.663	0.67
51_A	58_I	1.661	0.67
280_V	336_F	1.652	0.66
461_R	512_W	1.645	0.66
98_G	102_S	1.638	0.66
408_L	455_A	1.633	0.65
368_A	583_V	1.624	0.65
587_G	601_T	1.619	0.65
362_N	403_L	1.617	0.65
500_L	607_D	1.607	0.64
318_S	335_N	1.594	0.63
308_G	320_I	1.592	0.63
155_S	220_V	1.582	0.63
384_A	393_Y	1.564	0.62
172_D	211_A	1.550	0.61
160_D	194_K	1.547	0.61
313_D	316_R	1.542	0.61
432_F	467_V	1.541	0.61
75_N	109_V	1.536	0.61
418_F	453_G	1.532	0.60
510_D	521_N	1.525	0.60
498_D	502_E	1.521	0.60
421_H	431_S	1.514	0.59
330_M	346_T	1.507	0.59
66_G	576_Y	1.501	0.59
356_A	394_S	1.498	0.59
360_Q	398_G	1.497	0.58
151_A	559_S	1.495	0.58
165_Y	542_A	1.489	0.58
232_A	270_V	1.488	0.58
328_K	348_D	1.482	0.58
405_T	583_V	1.482	0.58
458_I	473_L	1.469	0.57
587_G	590_W	1.464	0.57
156_V	544_L	1.449	0.56
442_W	467_V	1.439	0.55
497_G	570_P	1.438	0.55
391_G	394_S	1.426	0.55
60_V	76_V	1.424	0.55
456_A	492_G	1.424	0.55
492_G	501_R	1.421	0.54
172_D	188_V	1.417	0.54
166_E	192_A	1.410	0.54
509_I	552_V	1.405	0.54
228_K	375_K	1.401	0.53
556_T	563_R	1.395	0.53
318_S	344_L	1.389	0.53
409_D	477_K	1.389	0.53
59_F	92_N	1.388	0.53
237_D	248_G	1.388	0.53
577_T	580_H	1.388	0.53
316_R	337_R	1.387	0.53
408_L	432_F	1.375	0.52
463_P	604_F	1.370	0.52
461_R	514_Y	1.370	0.52
270_V	319_L	1.363	0.51
332_V	346_T	1.360	0.51
262_L	299_G	1.355	0.51
491_F	599_P	1.349	0.50
412_R	434_D	1.349	0.50
541_Q	583_V	1.345	0.50
387_H	407_D	1.340	0.50
144_G	186_G	1.338	0.50
50_V	566_T	1.335	0.50
155_S	218_F	1.332	0.50
133_L	151_A	1.328	0.49
232_A	321_M	1.322	0.49
168_I	192_A	1.317	0.49
383_M	391_G	1.317	0.49
144_G	147_Y	1.308	0.48
482_G	486_P	1.308	0.48
496_D	502_E	1.305	0.48
152_N	532_N	1.295	0.48
93_Y	228_K	1.289	0.47
85_A	93_Y	1.289	0.47
403_L	417_V	1.287	0.47
412_R	439_K	1.285	0.47
393_Y	421_H	1.277	0.47
77_Y	114_E	1.272	0.46
516_N	520_K	1.270	0.46
68_E	576_Y	1.266	0.46
379_I	384_A	1.266	0.46
154_A	167_L	1.265	0.46
481_I	512_W	1.263	0.46
418_F	442_W	1.262	0.46
90_T	570_P	1.262	0.46
583_V	602_S	1.255	0.45
60_V	568_T	1.244	0.45
403_L	419_Q	1.241	0.45
408_L	465_Q	1.241	0.45
384_A	403_L	1.238	0.44
500_L	514_Y	1.236	0.44
59_F	569_I	1.231	0.44
135_K	560_S	1.226	0.44
190_I	246_V	1.221	0.44
174_S	186_G	1.219	0.43
171_W	202_R	1.217	0.43
52_V	566_T	1.215	0.43
531_N	555_R	1.209	0.43
329_T	357_F	1.208	0.43
475_S	481_I	1.196	0.42
64_F	74_F	1.183	0.41
173_P	191_D	1.180	0.41
545_L	564_I	1.179	0.41
290_N	293_D	1.178	0.41
582_P	586_L	1.178	0.41
450_V	469_A	1.174	0.41
409_D	432_F	1.171	0.41
42_M	66_G	1.168	0.41
76_V	83_L	1.164	0.40
135_K	138_G	1.158	0.40
347_L	357_F	1.151	0.40
260_R	298_Y	1.146	0.40
528_A	556_T	1.145	0.40
214_H	325_Y	1.140	0.39
228_K	277_K	1.138	0.39
461_R	513_D	1.136	0.39
78_R	95_D	1.131	0.39
455_A	465_Q	1.130	0.39
331_L	385_V	1.129	0.39
558_D	563_R	1.128	0.39
308_G	367_I	1.128	0.39
214_H	300_N	1.123	0.38
190_I	218_F	1.118	0.38
127_P	568_T	1.112	0.38
157_G	229_A	1.105	0.37
407_D	413_P	1.104	0.37
496_D	511_K	1.099	0.37
168_I	190_I	1.098	0.37
68_E	108_A	1.095	0.37
553_V	564_I	1.093	0.37
109_V	112_G	1.093	0.37
152_N	170_K	1.088	0.37
192_A	579_M	1.088	0.37
156_V	553_V	1.087	0.37
609_M	612_Q	1.083	0.36
69_N	72_V	1.078	0.36
379_I	405_T	1.076	0.36
156_V	564_I	1.076	0.36
219_M	593_I	1.074	0.36
494_W	606_G	1.070	0.36
307_A	592_N	1.069	0.36
354_N	391_G	1.068	0.36
73_L	89_K	1.067	0.36
282_A	334_Y	1.067	0.36
237_D	247_I	1.066	0.35
357_F	383_M	1.064	0.35
456_A	503_Q	1.051	0.35
487_S	503_Q	1.050	0.35
541_Q	599_P	1.050	0.35
430_L	444_V	1.042	0.34
393_Y	593_I	1.040	0.34
376_D	586_L	1.038	0.34
270_V	341_L	1.036	0.34
187_D	207_K	1.035	0.34
462_Y	512_W	1.033	0.34
270_V	336_F	1.029	0.34
80_G	98_G	1.029	0.34
512_W	515_Q	1.028	0.34
102_S	123_V	1.026	0.33
217_Q	594_A	1.025	0.33
583_V	586_L	1.024	0.33
493_I	552_V	1.020	0.33
64_F	576_Y	1.020	0.33
502_E	511_K	1.020	0.33
110_V	115_Q	1.020	0.33
300_N	325_Y	1.015	0.33
350_S	358_A	1.011	0.33
53_K	98_G	1.010	0.33
242_G	277_K	1.009	0.33
386_D	392_M	1.000	0.32
459_D	512_W	1.000	0.32
59_F	566_T	0.998	0.32
459_D	462_Y	0.998	0.32
165_Y	588_I	0.998	0.32
67_T	580_H	0.998	0.32
42_M	582_P	0.997	0.32
327_A	398_G	0.994	0.32
343_K	346_T	0.993	0.32
168_I	220_V	0.991	0.32
144_G	184_Y	0.990	0.32
586_L	601_T	0.985	0.32
171_W	211_A	0.985	0.32
175_N	186_G	0.979	0.31
395_T	417_V	0.979	0.31
191_D	211_A	0.978	0.31
135_K	267_Y	0.974	0.31
130_S	556_T	0.974	0.31
306_L	380_F	0.973	0.31
272_Q	275_T	0.973	0.31
254_Y	263_S	0.972	0.31
90_T	571_T	0.971	0.31
403_L	587_G	0.967	0.31
386_D	390_K	0.967	0.31
364_N	403_L	0.967	0.31
310_A	378_I	0.966	0.31
293_D	297_S	0.965	0.31
260_R	302_V	0.963	0.31
67_T	76_V	0.963	0.31
430_L	469_A	0.961	0.30
138_G	147_Y	0.958	0.30
366_S	590_W	0.957	0.30
57_G	98_G	0.957	0.30
421_H	433_R	0.956	0.30
544_L	553_V	0.954	0.30
462_Y	481_I	0.952	0.30
178_D	214_H	0.952	0.30
82_K	228_K	0.951	0.30
83_L	88_V	0.950	0.30
138_G	146_S	0.950	0.30
154_A	233_M	0.947	0.30
76_V	90_T	0.942	0.30
135_K	151_A	0.942	0.30
54_T	57_G	0.940	0.29
289_G	293_D	0.940	0.29
460_P	512_W	0.939	0.29
108_A	115_Q	0.937	0.29
192_A	201_W	0.935	0.29
329_T	391_G	0.934	0.29
243_T	277_K	0.934	0.29
510_D	524_T	0.934	0.29
491_F	496_D	0.929	0.29
420_V	539_T	0.927	0.29
98_G	124_W	0.926	0.29
182_D	258_Q	0.926	0.29
107_R	114_E	0.925	0.29
404_H	600_H	0.919	0.29
426_A	443_G	0.919	0.29
94_V	566_T	0.918	0.28
308_G	331_L	0.914	0.28
535_K	596_N	0.912	0.28
419_Q	433_R	0.911	0.28
421_H	450_V	0.906	0.28
84_N	89_K	0.903	0.28
215_Y	300_N	0.901	0.28
320_I	367_I	0.901	0.28
201_W	494_W	0.897	0.28
285_E	334_Y	0.896	0.27
83_L	261_V	0.896	0.27
424_K	427_K	0.893	0.27
49_L	76_V	0.893	0.27
210_R	215_Y	0.892	0.27
476_A	539_T	0.892	0.27
306_L	325_Y	0.886	0.27
43_E	577_T	0.885	0.27
172_D	204_N	0.882	0.27
79_D	98_G	0.881	0.27
174_S	188_V	0.877	0.27
138_G	145_E	0.876	0.27
98_G	123_V	0.874	0.27
41_Q	225_G	0.871	0.26
300_N	304_R	0.871	0.26
322_T	331_L	0.867	0.26
360_Q	385_V	0.865	0.26
45_L	48_G	0.859	0.26
237_D	278_E	0.857	0.26
583_V	601_T	0.857	0.26
337_R	342_S	0.856	0.26
393_Y	436_A	0.853	0.26
481_I	530_A	0.852	0.26
256_N	260_R	0.851	0.26
126_Q	228_K	0.851	0.26
308_G	322_T	0.850	0.26
93_Y	190_I	0.848	0.25
138_G	174_S	0.847	0.25
92_N	570_P	0.845	0.25
507_N	536_A	0.843	0.25
214_H	304_R	0.841	0.25
417_V	433_R	0.841	0.25
578_L	605_L	0.841	0.25
152_N	531_N	0.837	0.25
256_N	299_G	0.835	0.25
59_F	309_I	0.834	0.25
525_A	528_A	0.831	0.25
79_D	267_Y	0.830	0.25
83_L	231_V	0.828	0.25
387_H	416_E	0.826	0.25
402_A	598_P	0.825	0.25
453_G	539_T	0.824	0.24
171_W	175_N	0.823	0.24
49_L	60_V	0.822	0.24
169_L	564_I	0.821	0.24
175_N	191_D	0.821	0.24
49_L	121_A	0.821	0.24
501_R	606_G	0.816	0.24
76_V	106_V	0.814	0.24
42_M	580_H	0.813	0.24
411_G	477_K	0.808	0.24
249_N	445_Y	0.805	0.24
411_G	604_F	0.805	0.24
68_E	260_R	0.803	0.24
529_A	536_A	0.803	0.24
507_N	530_A	0.802	0.24
290_N	297_S	0.801	0.24
338_D	388_D	0.801	0.24
174_S	191_D	0.800	0.24
179_N	210_R	0.799	0.23
460_P	513_D	0.798	0.23
64_F	68_E	0.798	0.23
68_E	349_S	0.797	0.23
169_L	539_T	0.796	0.23
72_V	231_V	0.796	0.23
136_P	171_W	0.795	0.23
178_D	325_Y	0.794	0.23
504_L	552_V	0.793	0.23
280_V	319_L	0.792	0.23
371_D	377_E	0.790	0.23
148_T	186_G	0.788	0.23
59_F	234_K	0.787	0.23
50_V	76_V	0.787	0.23
204_N	207_K	0.786	0.23
180_S	260_R	0.785	0.23
172_D	187_D	0.785	0.23
152_N	402_A	0.783	0.23
278_E	336_F	0.782	0.23
136_P	191_D	0.780	0.23
157_G	168_I	0.780	0.23
601_T	605_L	0.778	0.23
171_W	271_F	0.777	0.23
426_A	446_A	0.777	0.23
338_D	372_G	0.777	0.23
40_R	582_P	0.776	0.23
48_G	68_E	0.775	0.23
82_K	245_K	0.774	0.23
224_D	286_P	0.773	0.22
190_I	231_V	0.772	0.22
164_Q	196_D	0.771	0.22
110_V	114_E	0.770	0.22
530_A	552_V	0.770	0.22
170_K	211_A	0.768	0.22
218_F	470_N	0.763	0.22
480_K	486_P	0.762	0.22
260_R	291_V	0.762	0.22
178_D	300_N	0.762	0.22
64_F	476_A	0.762	0.22
330_M	358_A	0.761	0.22
252_A	494_W	0.761	0.22
107_R	117_A	0.760	0.22
121_A	124_W	0.759	0.22
136_P	281_T	0.759	0.22
60_V	83_L	0.757	0.22
128_Y	565_Y	0.753	0.22
76_V	476_A	0.753	0.22
245_K	340_K	0.752	0.22
234_K	594_A	0.750	0.22
80_G	124_W	0.749	0.22
170_K	191_D	0.748	0.22
443_G	446_A	0.746	0.21
77_Y	82_K	0.746	0.21
504_L	530_A	0.746	0.21
249_N	252_A	0.745	0.21
190_I	461_R	0.743	0.21
528_A	563_R	0.742	0.21
322_T	375_K	0.739	0.21
40_R	586_L	0.739	0.21
587_G	602_S	0.738	0.21
261_V	592_N	0.737	0.21
591_Q	596_N	0.736	0.21
299_G	302_V	0.734	0.21
469_A	476_A	0.733	0.21
152_N	176_S	0.730	0.21
412_R	457_D	0.730	0.21
285_E	346_T	0.730	0.21
513_D	522_M	0.729	0.21
417_V	581_D	0.727	0.21
500_L	608_G	0.726	0.21
42_M	576_Y	0.725	0.21
334_Y	541_Q	0.725	0.21
233_M	385_V	0.724	0.21
575_L	580_H	0.724	0.21
261_V	380_F	0.724	0.21
241_D	245_K	0.722	0.21
306_L	322_T	0.721	0.21
213_A	540_L	0.719	0.20
331_L	380_F	0.717	0.20
185_T	271_F	0.716	0.20
318_S	504_L	0.715	0.20
170_K	202_R	0.715	0.20
390_K	544_L	0.715	0.20
419_Q	431_S	0.714	0.20
126_Q	566_T	0.713	0.20
175_N	185_T	0.712	0.20
150_S	559_S	0.710	0.20
72_V	138_G	0.710	0.20
355_E	358_A	0.710	0.20
180_S	183_G	0.708	0.20
98_G	334_Y	0.707	0.20
365_L	593_I	0.707	0.20
210_R	216_T	0.706	0.20
166_E	579_M	0.706	0.20
474_Y	480_K	0.705	0.20
457_D	460_P	0.701	0.20
68_E	376_D	0.701	0.20
413_P	416_E	0.701	0.20
159_V	337_R	0.701	0.20
114_E	117_A	0.700	0.20
127_P	566_T	0.699	0.20
180_S	236_A	0.695	0.20
406_G	455_A	0.695	0.20
149_Y	166_E	0.694	0.20
385_V	435_A	0.694	0.20
426_A	447_G	0.694	0.20
382_S	484_G	0.693	0.20
480_K	483_S	0.693	0.20
76_V	129_H	0.692	0.20
76_V	84_N	0.690	0.19
460_P	514_Y	0.690	0.19
528_A	554_W	0.690	0.19
377_E	386_D	0.689	0.19
183_G	210_R	0.689	0.19
75_N	110_V	0.689	0.19
284_F	328_K	0.689	0.19
173_P	202_R	0.689	0.19
90_T	574_R	0.688	0.19
364_N	384_A	0.688	0.19
215_Y	259_G	0.688	0.19
360_Q	378_I	0.687	0.19
397_L	440_I	0.685	0.19
144_G	175_N	0.684	0.19
47_R	51_A	0.684	0.19
237_D	347_L	0.684	0.19
358_A	385_V	0.684	0.19
72_V	134_D	0.684	0.19
166_E	194_K	0.682	0.19
159_V	342_S	0.682	0.19
280_V	341_L	0.682	0.19
428_Y	447_G	0.681	0.19
308_G	383_M	0.680	0.19
530_A	554_W	0.680	0.19
360_Q	380_F	0.680	0.19
99_S	102_S	0.680	0.19
130_S	563_R	0.679	0.19
128_Y	563_R	0.679	0.19
57_G	124_W	0.679	0.19
491_F	541_Q	0.679	0.19
368_A	408_L	0.678	0.19
68_E	393_Y	0.677	0.19
604_F	608_G	0.676	0.19
202_R	211_A	0.676	0.19
403_L	537_T	0.675	0.19
535_K	598_P	0.674	0.19
329_T	380_F	0.674	0.19
473_L	601_T	0.673	0.19
437_T	571_T	0.672	0.19
93_Y	128_Y	0.672	0.19
135_K	568_T	0.672	0.19
51_A	123_V	0.672	0.19
219_M	308_G	0.672	0.19
312_L	378_I	0.669	0.19
229_A	385_V	0.667	0.19
334_Y	428_Y	0.665	0.19
432_F	442_W	0.665	0.19
157_G	455_A	0.665	0.19
68_E	74_F	0.664	0.19
160_D	196_D	0.663	0.19
327_A	330_M	0.662	0.19
48_G	118_S	0.661	0.19
121_A	250_A	0.661	0.19
44_A	441_L	0.660	0.18
54_T	94_V	0.659	0.18
156_V	579_M	0.658	0.18
499_L	605_L	0.657	0.18
472_S	482_G	0.656	0.18
280_V	342_S	0.655	0.18
127_P	223_L	0.654	0.18
77_Y	112_G	0.654	0.18
150_S	172_D	0.654	0.18
289_G	292_S	0.653	0.18
48_G	61_S	0.653	0.18
114_E	313_D	0.652	0.18
176_S	191_D	0.652	0.18
397_L	481_I	0.652	0.18
95_D	104_Y	0.651	0.18
231_V	319_L	0.651	0.18
105_T	117_A	0.650	0.18
108_A	544_L	0.650	0.18
153_D	535_K	0.649	0.18
409_D	476_A	0.649	0.18
423_D	427_K	0.647	0.18
191_D	271_F	0.646	0.18
406_G	413_P	0.646	0.18
475_S	576_Y	0.646	0.18
182_D	257_E	0.646	0.18
442_W	594_A	0.646	0.18
336_F	342_S	0.644	0.18
211_A	267_Y	0.643	0.18
499_L	604_F	0.642	0.18
503_Q	508_R	0.641	0.18
388_D	520_K	0.641	0.18
118_S	565_Y	0.641	0.18
382_S	439_K	0.641	0.18
367_I	587_G	0.640	0.18
168_I	231_V	0.639	0.18
427_K	443_G	0.639	0.18
340_K	474_Y	0.638	0.18
326_Y	361_G	0.637	0.18
548_W	605_L	0.636	0.18
439_K	515_Q	0.636	0.18
472_S	486_P	0.634	0.18
192_A	469_A	0.634	0.18
45_L	577_T	0.633	0.18
153_D	596_N	0.632	0.18
528_A	536_A	0.632	0.18
72_V	108_A	0.632	0.18
518_V	521_N	0.631	0.18
370_V	384_A	0.630	0.18
423_D	552_V	0.628	0.17
223_L	450_V	0.628	0.17
153_D	490_N	0.627	0.17
97_N	522_M	0.625	0.17
366_S	587_G	0.625	0.17
234_K	281_T	0.624	0.17
543_D	551_E	0.624	0.17
517_G	520_K	0.624	0.17
186_G	255_R	0.623	0.17
217_Q	307_A	0.620	0.17
322_T	383_M	0.620	0.17
274_S	388_D	0.619	0.17
259_G	304_R	0.619	0.17
255_R	574_R	0.619	0.17
101_G	557_E	0.618	0.17
364_N	447_G	0.617	0.17
237_D	246_V	0.617	0.17
335_N	346_T	0.616	0.17
513_D	517_G	0.615	0.17
467_V	476_A	0.615	0.17
365_L	380_F	0.614	0.17
223_L	432_F	0.613	0.17
280_V	334_Y	0.613	0.17
52_V	127_P	0.612	0.17
271_F	540_L	0.610	0.17
215_Y	303_D	0.610	0.17
259_G	303_D	0.610	0.17
96_K	122_S	0.609	0.17
215_Y	304_R	0.609	0.17
367_I	593_I	0.607	0.17
576_Y	613_P	0.607	0.17
144_G	191_D	0.607	0.17
416_E	590_W	0.606	0.17
93_Y	476_A	0.606	0.17
210_R	288_R	0.605	0.17
201_W	333_A	0.604	0.17
214_H	259_G	0.604	0.17
413_P	506_S	0.604	0.17
271_F	281_T	0.603	0.17
188_V	321_M	0.603	0.17
217_Q	325_Y	0.603	0.17
216_T	234_K	0.602	0.17
204_N	240_K	0.602	0.17
397_L	462_Y	0.601	0.17
56_G	97_N	0.601	0.17
138_G	186_G	0.601	0.17
75_N	524_T	0.601	0.17
283_N	289_G	0.600	0.17
497_G	571_T	0.600	0.17
40_R	576_Y	0.599	0.17
393_Y	431_S	0.599	0.17
364_N	417_V	0.599	0.17
170_K	188_V	0.599	0.17
420_V	449_D	0.598	0.17
403_L	408_L	0.598	0.17
69_N	603_F	0.597	0.16
173_P	185_T	0.596	0.16
180_S	302_V	0.596	0.16
200_L	434_D	0.596	0.16
136_P	271_F	0.596	0.16
216_T	380_F	0.595	0.16
532_N	598_P	0.595	0.16
59_F	570_P	0.595	0.16
329_T	393_Y	0.593	0.16
393_Y	438_G	0.592	0.16
70_A	576_Y	0.592	0.16
167_L	553_V	0.591	0.16
301_R	326_Y	0.591	0.16
256_N	303_D	0.589	0.16
390_K	439_K	0.588	0.16
113_T	479_V	0.588	0.16
210_R	259_G	0.588	0.16
306_L	365_L	0.587	0.16
251_N	575_L	0.587	0.16
376_D	583_V	0.586	0.16
190_I	204_N	0.586	0.16
306_L	329_T	0.586	0.16
39_A	42_M	0.585	0.16
494_W	601_T	0.585	0.16
499_L	606_G	0.583	0.16
229_A	587_G	0.583	0.16
82_K	87_P	0.582	0.16
192_A	231_V	0.582	0.16
178_D	183_G	0.582	0.16
135_K	171_W	0.581	0.16
110_V	113_T	0.580	0.16
371_D	386_D	0.579	0.16
64_F	579_M	0.578	0.16
499_L	607_D	0.578	0.16
226_D	333_A	0.577	0.16
406_G	605_L	0.577	0.16
69_N	574_R	0.576	0.16
220_V	563_R	0.575	0.16
364_N	587_G	0.575	0.16
604_F	607_D	0.575	0.16
339_G	439_K	0.575	0.16
147_Y	184_Y	0.574	0.16
320_I	378_I	0.574	0.16
473_L	481_I	0.573	0.16
404_H	490_N	0.573	0.16
349_S	575_L	0.573	0.16
452_R	490_N	0.573	0.16
342_S	441_L	0.573	0.16
92_N	124_W	0.572	0.16
95_D	192_A	0.570	0.16
261_V	415_L	0.570	0.16
277_K	526_S	0.570	0.16
443_G	512_W	0.568	0.16
354_N	358_A	0.568	0.16
397_L	431_S	0.566	0.16
173_P	211_A	0.565	0.16
76_V	261_V	0.565	0.16
487_S	508_R	0.564	0.16
418_F	590_W	0.564	0.16
38_A	479_V	0.563	0.15
210_R	300_N	0.561	0.15
347_L	358_A	0.561	0.15
396_G	574_R	0.560	0.15
387_H	392_M	0.560	0.15
260_R	293_D	0.560	0.15
215_Y	325_Y	0.560	0.15
52_V	397_L	0.559	0.15
473_L	542_A	0.559	0.15
256_N	327_A	0.559	0.15
235_T	269_T	0.558	0.15
531_N	537_T	0.558	0.15
73_L	316_R	0.558	0.15
97_N	101_G	0.557	0.15
99_S	604_F	0.557	0.15
76_V	439_K	0.556	0.15
512_W	519_S	0.555	0.15
189_L	204_N	0.554	0.15
182_D	256_N	0.553	0.15
507_N	537_T	0.553	0.15
232_A	282_A	0.553	0.15
495_W	522_M	0.552	0.15
254_Y	290_N	0.551	0.15
205_L	216_T	0.550	0.15
76_V	516_N	0.550	0.15
168_I	194_K	0.550	0.15
75_N	107_R	0.549	0.15
144_G	202_R	0.549	0.15
152_N	404_H	0.549	0.15
171_W	281_T	0.548	0.15
186_G	202_R	0.547	0.15
483_S	572_E	0.547	0.15
459_D	513_D	0.547	0.15
76_V	343_K	0.547	0.15
393_Y	576_Y	0.547	0.15
131_V	250_A	0.547	0.15
210_R	303_D	0.546	0.15
454_M	553_V	0.545	0.15
500_L	513_D	0.544	0.15
262_L	303_D	0.544	0.15
576_Y	582_P	0.544	0.15
542_A	545_L	0.544	0.15
133_L	553_V	0.543	0.15
490_N	532_N	0.543	0.15
407_D	414_G	0.543	0.15
210_R	214_H	0.543	0.15
366_S	405_T	0.542	0.15
157_G	242_G	0.542	0.15
493_I	564_I	0.542	0.15
64_F	70_A	0.541	0.15
40_R	354_N	0.541	0.15
196_D	386_D	0.541	0.15
192_A	442_W	0.539	0.15
188_V	202_R	0.539	0.15
282_A	336_F	0.539	0.15
187_D	253_D	0.539	0.15
93_Y	181_Q	0.538	0.15
406_G	420_V	0.538	0.15
93_Y	575_L	0.538	0.15
67_T	613_P	0.537	0.15
61_S	121_A	0.537	0.15
490_N	535_K	0.536	0.15
73_L	90_T	0.536	0.15
500_L	612_Q	0.535	0.15
430_L	481_I	0.534	0.15
188_V	191_D	0.533	0.15
424_K	428_Y	0.533	0.15
508_R	521_N	0.532	0.15
223_L	593_I	0.532	0.15
36_E	44_A	0.531	0.15
490_N	531_N	0.530	0.15
251_N	388_D	0.528	0.15
282_A	285_E	0.528	0.15
64_F	574_R	0.528	0.15
92_N	567_T	0.528	0.15
550_E	578_L	0.527	0.14
493_I	523_L	0.527	0.14
178_D	213_A	0.526	0.14
403_L	565_Y	0.526	0.14
336_F	469_A	0.525	0.14
540_L	588_I	0.525	0.14
453_G	608_G	0.525	0.14
135_K	188_V	0.524	0.14
185_T	281_T	0.524	0.14
347_L	391_G	0.524	0.14
57_G	104_Y	0.523	0.14
125_A	439_K	0.523	0.14
266_E	301_R	0.523	0.14
491_F	537_T	0.523	0.14
587_G	599_P	0.523	0.14
253_D	256_N	0.523	0.14
334_Y	568_T	0.522	0.14
81_Q	105_T	0.521	0.14
242_G	278_E	0.521	0.14
534_T	596_N	0.520	0.14
358_A	391_G	0.519	0.14
76_V	88_V	0.518	0.14
482_G	512_W	0.518	0.14
168_I	480_K	0.517	0.14
243_T	602_S	0.517	0.14
590_W	599_P	0.517	0.14
402_A	535_K	0.517	0.14
228_K	332_V	0.517	0.14
101_G	245_K	0.517	0.14
382_S	421_H	0.515	0.14
210_R	304_R	0.515	0.14
232_A	334_Y	0.515	0.14
183_G	213_A	0.514	0.14
412_R	441_L	0.514	0.14
351_K	355_E	0.513	0.14
573_H	576_Y	0.512	0.14
406_G	562_L	0.512	0.14
409_D	442_W	0.512	0.14
148_T	240_K	0.512	0.14
36_E	39_A	0.512	0.14
473_L	609_M	0.512	0.14
319_L	565_Y	0.511	0.14
367_I	590_W	0.511	0.14
458_I	522_M	0.511	0.14
302_V	327_A	0.511	0.14
351_K	354_N	0.511	0.14
75_N	87_P	0.510	0.14
380_F	383_M	0.510	0.14
65_L	382_S	0.510	0.14
336_F	406_G	0.510	0.14
282_A	398_G	0.509	0.14
67_T	609_M	0.509	0.14
409_D	462_Y	0.509	0.14
385_V	522_M	0.508	0.14
440_I	574_R	0.508	0.14
103_T	277_K	0.507	0.14
122_S	125_A	0.507	0.14
326_Y	422_E	0.506	0.14
60_V	516_N	0.506	0.14
59_F	68_E	0.505	0.14
175_N	188_V	0.504	0.14
173_P	271_F	0.504	0.14
99_S	103_T	0.503	0.14
152_N	490_N	0.503	0.14
402_A	532_N	0.502	0.14
254_Y	526_S	0.502	0.14
577_T	582_P	0.502	0.14
430_L	474_Y	0.502	0.14
347_L	592_N	0.502	0.14
442_W	453_G	0.502	0.14
420_V	454_M	0.501	0.14
348_D	563_R	0.501	0.14
231_V	583_V	0.500	0.14
83_L	602_S	0.500	0.14
260_R	327_A	0.500	0.14
514_Y	520_K	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zuyA	1	0.9403	100	0.359	Contact Map
2zuxA	1	0.9387	100	0.36	Contact Map
2bwrA	1	0.5468	98.1	0.968	Contact Map
4iglA	1	0.7484	97	0.974	Contact Map
4o9xA	1	0.7774	96.6	0.975	Contact Map
4a7kA	2	0.771	96.5	0.975	Contact Map
4tqjA	2	0.5468	96.5	0.975	Contact Map
1flgA	2	0.679	96.4	0.976	Contact Map
4immA	1	0.5081	96	0.976	Contact Map
4mh1A	4	0.6161	95.9	0.977	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0147 seconds.