YDAL - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YDAL - Uncharacterized protein YdaL

UniProt:	O31487	Sequences: MLCVMMLLFSAIASFPVSAQAKDQDAGILIIYSTLDGKESSQVKMLDLLAGHFTSHVTVKKDSDVEASDFKGKDHVIYYGQTKRKLSQKLLSLISGVKKPVVAIGYNAGQISQFSGLSLARKENVFQVHSRSEKADVSLESGLNVLSVSGLKGTALYTFKADEGTTHSFIWKTKKGNVYIGLTNLLNDNLIVAKQLREAFGEKAGTTLLYLRLEDISPMSDEKLLLQAGTYLHKRHIPFILAVIPVYLNPETGDKVYLSNQPKMVKVLKKLQSMGGSIIVHGYTHAYRYSETGEGFEFWDAKADQPITSGNAEDPPSILEKEQDFPNEQAYHSYLEPFREKEETYTKQKLTRAIEDLTSSGLYPLAFEAPHYTMSEYGYQIASQYFTSIFGQVQLSSTTWKTSGAPPFVTAPSMLHGMTLYPETIGFVDTSKQNPLGEMEEHISQMIDFEGGVAGGFYHPYLGMKYLPELVDQMERIPDSEWLDLKKTKQTVKTDKVEIHTSGDGTIQVKNGVSPIYEFFDHHRQTPLEKALWILSAVVLLFVIMFVSYTFYLRATLKKRIFKERRSLG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	569 (450)
Sequences:	130 (108)
Seq/√Len:	5.1

BACSU - YDAL

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
229_G	271_L	6.117	0.99
283_Y	386_F	4.312	0.93
280_V	386_F	4.287	0.93
258_L	265_V	4.251	0.93
287_Y	340_E	4.005	0.90
458_Y	463_G	3.744	0.87
217_S	244_I	2.763	0.64
125_V	471_V	2.748	0.64
244_I	369_A	2.687	0.62
216_I	241_L	2.645	0.61
50_A	77_I	2.620	0.60
198_E	450_E	2.614	0.60
300_D	303_A	2.544	0.58
65_V	93_L	2.475	0.55
218_P	362_L	2.465	0.55
355_E	359_S	2.464	0.55
239_F	276_G	2.423	0.54
76_V	367_F	2.417	0.53
242_A	367_F	2.398	0.53
242_A	368_E	2.347	0.51
75_H	200_F	2.316	0.50
264_M	267_V	2.300	0.50
240_I	390_F	2.299	0.50
374_M	485_L	2.280	0.49
67_A	89_K	2.252	0.48
299_W	306_P	2.249	0.48
212_R	371_H	2.242	0.48
225_L	271_L	2.161	0.45
213_L	460_P	2.089	0.43
211_L	456_G	2.083	0.43
229_G	241_L	2.037	0.41
349_K	361_G	2.015	0.40
300_D	306_P	2.011	0.40
235_R	475_E	2.005	0.40
285_H	426_G	1.995	0.40
264_M	271_L	1.995	0.40
278_I	357_L	1.993	0.40
83_K	109_G	1.925	0.38
391_G	418_M	1.902	0.37
213_L	482_W	1.876	0.36
235_R	472_D	1.875	0.36
369_A	374_M	1.868	0.36
280_V	283_Y	1.862	0.36
383_S	387_T	1.832	0.35
257_Y	356_D	1.829	0.35
457_F	461_Y	1.812	0.34
262_P	362_L	1.796	0.34
102_V	199_A	1.785	0.34
244_I	285_H	1.776	0.33
77_I	100_P	1.726	0.32
90_L	454_A	1.716	0.32
129_H	269_K	1.710	0.31
241_L	271_L	1.686	0.31
212_R	372_Y	1.686	0.31
368_E	390_F	1.675	0.30
294_E	392_Q	1.671	0.30
239_F	248_L	1.668	0.30
267_V	270_K	1.665	0.30
85_K	276_G	1.664	0.30
369_A	391_G	1.650	0.30
260_N	388_S	1.641	0.29
156_L	213_L	1.639	0.29
374_M	382_A	1.637	0.29
281_H	372_Y	1.624	0.29
372_Y	459_H	1.607	0.29
281_H	371_H	1.601	0.28
285_H	372_Y	1.601	0.28
212_R	459_H	1.601	0.28
200_F	424_T	1.589	0.28
364_P	368_E	1.587	0.28
128_V	398_T	1.581	0.28
91_L	239_F	1.569	0.28
124_N	155_A	1.566	0.27
241_L	305_Q	1.560	0.27
152_K	428_V	1.556	0.27
456_G	474_M	1.555	0.27
290_S	369_A	1.551	0.27
78_Y	107_N	1.543	0.27
65_V	194_K	1.537	0.27
30_I	77_I	1.536	0.27
363_Y	486_K	1.533	0.27
189_N	390_F	1.513	0.26
330_A	334_Y	1.511	0.26
425_I	439_M	1.499	0.26
232_L	457_F	1.494	0.26
294_E	385_Y	1.487	0.25
239_F	292_T	1.487	0.25
107_N	362_L	1.485	0.25
207_T	450_E	1.466	0.25
170_I	448_D	1.459	0.25
231_Y	287_Y	1.453	0.25
215_D	459_H	1.444	0.24
52_H	409_V	1.443	0.24
107_N	417_G	1.439	0.24
248_L	255_K	1.434	0.24
238_P	364_P	1.429	0.24
280_V	391_G	1.429	0.24
77_I	102_V	1.423	0.24
178_V	182_L	1.418	0.24
253_G	293_G	1.416	0.24
84_R	239_F	1.414	0.24
259_S	351_T	1.414	0.24
247_Y	250_P	1.414	0.24
243_V	250_P	1.405	0.23
84_R	292_T	1.391	0.23
213_L	463_G	1.387	0.23
43_V	62_D	1.383	0.23
212_R	215_D	1.379	0.23
213_L	373_T	1.377	0.23
383_S	418_M	1.372	0.23
463_G	482_W	1.368	0.23
214_E	372_Y	1.367	0.23
364_P	367_F	1.365	0.23
61_K	109_G	1.365	0.23
178_V	389_I	1.362	0.22
230_T	270_K	1.362	0.22
211_L	242_A	1.348	0.22
98_K	304_D	1.346	0.22
359_S	397_S	1.345	0.22
125_V	185_L	1.344	0.22
215_D	372_Y	1.340	0.22
53_F	207_T	1.340	0.22
50_A	62_D	1.337	0.22
169_F	178_V	1.333	0.22
391_G	394_Q	1.331	0.22
57_V	369_A	1.330	0.22
242_A	279_I	1.329	0.22
51_G	367_F	1.319	0.22
239_F	390_F	1.318	0.21
265_V	437_G	1.315	0.21
32_Y	53_F	1.306	0.21
197_R	450_E	1.300	0.21
109_G	392_Q	1.293	0.21
268_L	357_L	1.292	0.21
213_L	237_I	1.290	0.21
102_V	216_I	1.283	0.21
215_D	426_G	1.280	0.21
214_E	285_H	1.279	0.21
242_A	276_G	1.278	0.21
39_E	284_T	1.274	0.21
49_L	407_P	1.257	0.20
88_Q	119_L	1.255	0.20
215_D	285_H	1.251	0.20
30_I	421_Y	1.247	0.20
53_F	198_E	1.247	0.20
78_Y	375_S	1.245	0.20
91_L	276_G	1.241	0.20
214_E	232_L	1.237	0.20
243_V	379_Y	1.236	0.20
214_E	457_F	1.227	0.20
30_I	349_K	1.227	0.20
407_P	450_E	1.221	0.19
361_G	407_P	1.216	0.19
369_A	382_A	1.215	0.19
268_L	417_G	1.214	0.19
215_D	423_E	1.210	0.19
135_A	157_Y	1.202	0.19
349_K	407_P	1.200	0.19
274_M	399_T	1.196	0.19
233_H	239_F	1.195	0.19
296_F	425_I	1.191	0.19
419_T	458_Y	1.191	0.19
372_Y	457_F	1.188	0.19
264_M	362_L	1.187	0.19
215_D	232_L	1.187	0.19
107_N	110_Q	1.186	0.19
78_Y	268_L	1.179	0.19
108_A	443_I	1.179	0.19
375_S	451_G	1.175	0.19
215_D	457_F	1.172	0.18
244_I	426_G	1.170	0.18
226_L	472_D	1.169	0.18
204_A	450_E	1.166	0.18
256_V	264_M	1.166	0.18
232_L	283_Y	1.165	0.18
231_Y	472_D	1.159	0.18
241_L	278_I	1.157	0.18
280_V	353_A	1.156	0.18
170_I	180_I	1.151	0.18
214_E	459_H	1.150	0.18
176_G	438_E	1.148	0.18
379_Y	391_G	1.139	0.18
181_G	209_L	1.139	0.18
218_P	221_D	1.136	0.18
48_L	290_S	1.132	0.18
150_G	154_T	1.129	0.18
76_V	368_E	1.128	0.18
287_Y	291_E	1.127	0.18
229_G	270_K	1.126	0.18
299_W	389_I	1.124	0.18
116_G	304_D	1.124	0.18
152_K	430_T	1.124	0.18
236_H	296_F	1.122	0.17
192_V	195_Q	1.118	0.17
98_K	248_L	1.117	0.17
42_Q	87_S	1.115	0.17
110_Q	417_G	1.112	0.17
239_F	368_E	1.107	0.17
237_I	276_G	1.106	0.17
182_L	410_T	1.104	0.17
374_M	391_G	1.099	0.17
379_Y	458_Y	1.097	0.17
169_F	218_P	1.095	0.17
392_Q	403_S	1.094	0.17
65_V	103_A	1.093	0.17
239_F	278_I	1.092	0.17
37_G	428_V	1.090	0.17
78_Y	417_G	1.085	0.17
212_R	457_F	1.084	0.17
246_V	293_G	1.083	0.17
163_E	353_A	1.083	0.17
171_W	471_V	1.082	0.17
195_Q	448_D	1.081	0.17
210_Y	240_I	1.077	0.17
217_S	390_F	1.070	0.17
247_Y	460_P	1.070	0.17
87_S	207_T	1.069	0.17
27_G	409_V	1.068	0.16
65_V	406_P	1.066	0.16
30_I	222_E	1.062	0.16
247_Y	372_Y	1.054	0.16
474_M	478_P	1.041	0.16
243_V	362_L	1.041	0.16
256_V	350_L	1.039	0.16
261_Q	334_Y	1.038	0.16
179_Y	283_Y	1.038	0.16
53_F	192_V	1.036	0.16
263_K	388_S	1.032	0.16
61_K	90_L	1.031	0.16
214_E	423_E	1.027	0.16
51_G	452_G	1.026	0.16
87_S	107_N	1.019	0.16
175_K	181_G	1.014	0.16
214_E	426_G	1.013	0.16
367_F	391_G	1.010	0.15
427_F	457_F	1.009	0.15
284_T	372_Y	1.007	0.15
148_V	154_T	0.997	0.15
165_T	236_H	0.997	0.15
229_G	283_Y	0.996	0.15
51_G	393_V	0.994	0.15
46_L	299_W	0.994	0.15
194_K	414_M	0.993	0.15
183_T	374_M	0.992	0.15
122_K	148_V	0.986	0.15
398_T	439_M	0.984	0.15
30_I	180_I	0.984	0.15
23_D	273_S	0.981	0.15
386_F	391_G	0.976	0.15
86_L	110_Q	0.974	0.15
52_H	361_G	0.974	0.15
231_Y	467_L	0.969	0.15
369_A	386_F	0.969	0.15
76_V	279_I	0.966	0.15
105_G	379_Y	0.965	0.15
256_V	261_Q	0.965	0.15
279_I	368_E	0.963	0.15
53_F	197_R	0.962	0.15
27_G	72_G	0.961	0.15
363_Y	485_L	0.958	0.15
233_H	292_T	0.958	0.15
88_Q	116_G	0.955	0.15
73_K	373_T	0.955	0.15
184_N	414_M	0.954	0.15
181_G	296_F	0.953	0.15
425_I	456_G	0.951	0.14
103_A	194_K	0.950	0.14
197_R	204_A	0.949	0.14
220_S	248_L	0.948	0.14
22_K	185_L	0.948	0.14
151_L	237_I	0.947	0.14
197_R	207_T	0.942	0.14
71_K	287_Y	0.930	0.14
284_T	461_Y	0.925	0.14
203_K	279_I	0.923	0.14
77_I	125_V	0.920	0.14
105_G	245_P	0.920	0.14
125_V	164_G	0.916	0.14
193_A	470_L	0.915	0.14
203_K	458_Y	0.915	0.14
279_I	367_F	0.915	0.14
396_S	439_M	0.913	0.14
77_I	127_Q	0.912	0.14
44_K	200_F	0.911	0.14
169_F	182_L	0.910	0.14
286_A	372_Y	0.909	0.14
294_E	369_A	0.899	0.14
117_L	241_L	0.899	0.14
13_A	16_P	0.899	0.14
475_E	482_W	0.898	0.14
241_L	270_K	0.898	0.14
134_K	237_I	0.895	0.14
61_K	458_Y	0.895	0.14
281_H	298_F	0.895	0.14
379_Y	387_T	0.895	0.14
110_Q	463_G	0.894	0.14
371_H	459_H	0.892	0.14
282_G	297_E	0.892	0.14
425_I	458_Y	0.890	0.14
362_L	441_E	0.889	0.14
246_V	292_T	0.889	0.14
458_Y	464_M	0.887	0.13
52_H	78_Y	0.887	0.13
138_S	239_F	0.886	0.13
281_H	370_P	0.886	0.13
294_E	300_D	0.886	0.13
265_V	467_L	0.885	0.13
84_R	237_I	0.884	0.13
241_L	384_Q	0.884	0.13
193_A	379_Y	0.882	0.13
200_F	416_H	0.881	0.13
80_G	268_L	0.878	0.13
179_Y	375_S	0.877	0.13
109_G	479_D	0.876	0.13
62_D	90_L	0.876	0.13
269_K	272_Q	0.874	0.13
128_V	467_L	0.873	0.13
296_F	429_D	0.872	0.13
221_D	467_L	0.869	0.13
220_S	244_I	0.868	0.13
84_R	410_T	0.866	0.13
116_G	428_V	0.866	0.13
353_A	442_H	0.865	0.13
80_G	107_N	0.865	0.13
408_F	437_G	0.862	0.13
229_G	267_V	0.862	0.13
197_R	360_S	0.861	0.13
260_N	368_E	0.858	0.13
200_F	290_S	0.858	0.13
238_P	368_E	0.857	0.13
184_N	455_G	0.852	0.13
135_A	448_D	0.852	0.13
295_G	392_Q	0.848	0.13
109_G	144_N	0.847	0.13
205_G	260_N	0.845	0.13
23_D	98_K	0.845	0.13
225_L	269_K	0.845	0.13
459_H	462_L	0.845	0.13
107_N	243_V	0.844	0.13
233_H	269_K	0.844	0.13
244_I	299_W	0.840	0.13
184_N	404_G	0.839	0.13
353_A	468_P	0.838	0.13
180_I	227_Q	0.837	0.13
31_I	249_N	0.836	0.13
94_I	273_S	0.836	0.13
357_L	417_G	0.835	0.13
212_R	281_H	0.832	0.13
155_A	447_I	0.830	0.13
65_V	410_T	0.828	0.13
248_L	467_L	0.825	0.13
200_F	476_R	0.820	0.13
32_Y	207_T	0.820	0.13
52_H	443_I	0.820	0.13
363_Y	374_M	0.820	0.13
103_A	473_Q	0.819	0.12
218_P	262_P	0.818	0.12
267_V	472_D	0.817	0.12
238_P	367_F	0.816	0.12
232_L	426_G	0.815	0.12
302_K	394_Q	0.815	0.12
105_G	146_L	0.810	0.12
65_V	68_S	0.808	0.12
48_L	404_G	0.808	0.12
369_A	418_M	0.808	0.12
21_A	101_V	0.803	0.12
121_R	241_L	0.802	0.12
229_G	392_Q	0.797	0.12
167_H	468_P	0.796	0.12
154_T	221_D	0.794	0.12
299_W	391_G	0.792	0.12
30_I	175_K	0.791	0.12
28_I	171_W	0.788	0.12
276_G	388_S	0.786	0.12
272_Q	485_L	0.786	0.12
385_Y	484_D	0.785	0.12
44_K	47_D	0.784	0.12
250_P	284_T	0.781	0.12
342_E	345_Y	0.780	0.12
249_N	341_K	0.780	0.12
130_S	157_Y	0.779	0.12
215_D	371_H	0.779	0.12
406_P	456_G	0.779	0.12
180_I	267_V	0.778	0.12
91_L	449_F	0.778	0.12
245_P	353_A	0.774	0.12
236_H	260_N	0.771	0.12
171_W	269_K	0.770	0.12
260_N	356_D	0.769	0.12
64_D	408_F	0.768	0.12
56_H	286_A	0.768	0.12
283_Y	364_P	0.767	0.12
243_V	432_K	0.766	0.12
378_G	458_Y	0.765	0.12
19_A	231_Y	0.765	0.12
218_P	458_Y	0.764	0.12
21_A	171_W	0.763	0.12
375_S	417_G	0.762	0.12
145_V	463_G	0.762	0.12
233_H	471_V	0.761	0.12
181_G	250_P	0.761	0.12
116_G	119_L	0.760	0.12
221_D	465_K	0.758	0.12
216_I	463_G	0.757	0.12
71_K	267_V	0.757	0.12
65_V	479_D	0.756	0.12
212_R	423_E	0.755	0.12
130_S	482_W	0.755	0.12
285_H	371_H	0.754	0.12
103_A	184_N	0.750	0.12
60_K	242_A	0.750	0.12
50_A	216_I	0.748	0.12
87_S	417_G	0.747	0.11
118_S	305_Q	0.746	0.11
150_G	273_S	0.745	0.11
265_V	421_Y	0.744	0.11
282_G	422_P	0.744	0.11
297_E	422_P	0.744	0.11
268_L	278_I	0.742	0.11
374_M	379_Y	0.740	0.11
110_Q	482_W	0.736	0.11
66_E	156_L	0.736	0.11
210_Y	393_V	0.736	0.11
212_R	370_P	0.734	0.11
82_T	181_G	0.732	0.11
61_K	83_K	0.732	0.11
211_L	421_Y	0.731	0.11
67_A	481_E	0.731	0.11
368_E	463_G	0.729	0.11
49_L	406_P	0.728	0.11
473_Q	480_S	0.728	0.11
77_I	410_T	0.726	0.11
415_L	484_D	0.726	0.11
189_N	239_F	0.724	0.11
259_S	359_S	0.724	0.11
246_V	418_M	0.722	0.11
220_S	334_Y	0.720	0.11
378_G	394_Q	0.718	0.11
253_G	358_T	0.716	0.11
276_G	466_Y	0.716	0.11
103_A	480_S	0.715	0.11
107_N	268_L	0.713	0.11
351_T	359_S	0.713	0.11
85_K	237_I	0.711	0.11
43_V	455_G	0.711	0.11
108_A	130_S	0.710	0.11
229_G	390_F	0.710	0.11
246_V	255_K	0.709	0.11
95_S	471_V	0.705	0.11
154_T	273_S	0.703	0.11
49_L	65_V	0.701	0.11
149_S	261_Q	0.699	0.11
217_S	369_A	0.699	0.11
64_D	76_V	0.697	0.11
91_L	368_E	0.696	0.11
204_A	278_I	0.694	0.11
128_V	243_V	0.693	0.11
177_N	482_W	0.691	0.11
245_P	275_G	0.691	0.11
116_G	142_G	0.690	0.11
362_L	417_G	0.689	0.11
217_S	295_G	0.688	0.11
249_N	375_S	0.688	0.11
241_L	471_V	0.688	0.11
154_T	167_H	0.687	0.11
244_I	306_P	0.687	0.11
378_G	396_S	0.682	0.11
225_L	394_Q	0.679	0.11
73_K	289_Y	0.679	0.11
278_I	349_K	0.679	0.11
55_S	152_K	0.678	0.11
156_L	362_L	0.678	0.11
162_D	413_S	0.677	0.11
64_D	98_K	0.676	0.11
290_S	342_E	0.675	0.11
97_V	485_L	0.674	0.11
81_Q	293_G	0.673	0.11
284_T	296_F	0.672	0.11
42_Q	90_L	0.671	0.11
30_I	155_A	0.670	0.11
211_L	406_P	0.670	0.11
231_Y	471_V	0.667	0.10
251_E	461_Y	0.667	0.10
149_S	293_G	0.667	0.10
19_A	52_H	0.664	0.10
448_D	472_D	0.664	0.10
89_K	479_D	0.663	0.10
31_I	187_N	0.663	0.10
463_G	478_P	0.662	0.10
373_T	394_Q	0.660	0.10
129_H	248_L	0.659	0.10
304_D	409_V	0.658	0.10
14_S	73_K	0.656	0.10
302_K	479_D	0.655	0.10
281_H	293_G	0.654	0.10
90_L	109_G	0.654	0.10
218_P	225_L	0.653	0.10
236_H	293_G	0.653	0.10
232_L	461_Y	0.653	0.10
181_G	353_A	0.653	0.10
256_V	467_L	0.650	0.10
365_L	378_G	0.644	0.10
195_Q	293_G	0.643	0.10
145_V	152_K	0.638	0.10
39_E	90_L	0.638	0.10
114_F	482_W	0.637	0.10
293_G	357_L	0.636	0.10
302_K	427_F	0.636	0.10
132_S	248_L	0.635	0.10
241_L	276_G	0.635	0.10
259_S	356_D	0.634	0.10
154_T	458_Y	0.631	0.10
299_W	484_D	0.630	0.10
272_Q	367_F	0.630	0.10
297_E	423_E	0.628	0.10
282_G	423_E	0.628	0.10
220_S	264_M	0.628	0.10
187_N	209_L	0.627	0.10
214_E	460_P	0.626	0.10
62_D	350_L	0.626	0.10
233_H	382_A	0.626	0.10
349_K	456_G	0.624	0.10
185_L	284_T	0.624	0.10
207_T	425_I	0.623	0.10
172_K	476_R	0.622	0.10
231_Y	242_A	0.621	0.10
110_Q	179_Y	0.621	0.10
131_R	337_P	0.620	0.10
363_Y	440_E	0.620	0.10
232_L	372_Y	0.620	0.10
51_G	80_G	0.619	0.10
408_F	442_H	0.618	0.10
93_L	406_P	0.614	0.10
374_M	394_Q	0.613	0.10
93_L	342_E	0.612	0.10
103_A	482_W	0.612	0.10
84_R	110_Q	0.609	0.10
272_Q	354_I	0.609	0.10
23_D	118_S	0.608	0.10
90_L	155_A	0.607	0.10
83_K	403_S	0.607	0.10
124_N	127_Q	0.605	0.10
25_D	69_D	0.604	0.10
235_R	279_I	0.603	0.10
87_S	94_I	0.602	0.10
46_L	350_L	0.602	0.10
348_Q	409_V	0.601	0.10
122_K	465_K	0.600	0.10
33_S	227_Q	0.599	0.10
87_S	198_E	0.599	0.10
87_S	278_I	0.599	0.10
137_V	178_V	0.598	0.10
250_P	286_A	0.598	0.10
99_K	279_I	0.597	0.10
93_L	249_N	0.596	0.10
244_I	283_Y	0.595	0.10
216_I	264_M	0.593	0.10
367_F	465_K	0.592	0.10
354_I	400_W	0.592	0.10
161_A	353_A	0.590	0.10
373_T	399_T	0.590	0.10
426_G	457_F	0.590	0.10
194_K	341_K	0.590	0.10
17_V	24_Q	0.589	0.10
82_T	435_P	0.584	0.10
170_I	182_L	0.583	0.09
79_Y	356_D	0.583	0.09
60_K	73_K	0.581	0.09
178_V	189_N	0.581	0.09
367_F	418_M	0.580	0.09
49_L	408_F	0.579	0.09
150_G	277_S	0.577	0.09
191_I	230_T	0.576	0.09
237_I	280_V	0.575	0.09
104_I	126_F	0.573	0.09
129_H	190_L	0.573	0.09
245_P	258_L	0.571	0.09
213_L	476_R	0.570	0.09
91_L	350_L	0.570	0.09
289_Y	388_S	0.569	0.09
213_L	276_G	0.567	0.09
231_Y	464_M	0.567	0.09
221_D	258_L	0.566	0.09
341_K	449_F	0.566	0.09
193_A	242_A	0.565	0.09
243_V	265_V	0.564	0.09
105_G	418_M	0.563	0.09
89_K	252_T	0.562	0.09
363_Y	455_G	0.561	0.09
264_M	353_A	0.560	0.09
249_N	343_E	0.560	0.09
31_I	76_V	0.559	0.09
359_S	442_H	0.558	0.09
291_E	342_E	0.558	0.09
50_A	97_V	0.557	0.09
208_L	283_Y	0.557	0.09
227_Q	440_E	0.557	0.09
69_D	413_S	0.557	0.09
217_S	272_Q	0.555	0.09
284_T	298_F	0.555	0.09
119_L	228_A	0.554	0.09
182_L	349_K	0.554	0.09
376_E	414_M	0.553	0.09
295_G	414_M	0.551	0.09
237_I	420_L	0.549	0.09
254_D	355_E	0.549	0.09
237_I	353_A	0.549	0.09
75_H	424_T	0.548	0.09
196_L	450_E	0.547	0.09
444_S	448_D	0.546	0.09
444_S	469_E	0.545	0.09
26_A	171_W	0.545	0.09
194_K	482_W	0.545	0.09
351_T	472_D	0.544	0.09
271_L	466_Y	0.543	0.09
73_K	127_Q	0.542	0.09
70_F	264_M	0.542	0.09
75_H	341_K	0.541	0.09
102_V	165_T	0.541	0.09
118_S	441_E	0.540	0.09
37_G	70_F	0.540	0.09
77_I	430_T	0.540	0.09
239_F	466_Y	0.539	0.09
51_G	293_G	0.539	0.09
214_E	283_Y	0.538	0.09
137_V	182_L	0.537	0.09
220_S	271_L	0.536	0.09
77_I	163_E	0.536	0.09
213_L	220_S	0.534	0.09
53_F	299_W	0.533	0.09
169_F	410_T	0.531	0.09
215_D	460_P	0.531	0.09
109_G	405_A	0.531	0.09
52_H	452_G	0.530	0.09
217_S	240_I	0.528	0.09
209_L	417_G	0.528	0.09
65_V	90_L	0.528	0.09
110_Q	287_Y	0.527	0.09
362_L	400_W	0.527	0.09
246_V	383_S	0.527	0.09
140_E	385_Y	0.526	0.09
71_K	457_F	0.525	0.09
349_K	488_T	0.525	0.09
38_K	241_L	0.524	0.09
178_V	410_T	0.524	0.09
189_N	404_G	0.524	0.09
240_I	368_E	0.523	0.09
265_V	362_L	0.523	0.09
91_L	217_S	0.522	0.09
177_N	458_Y	0.519	0.09
45_M	458_Y	0.518	0.09
98_K	270_K	0.517	0.09
217_S	306_P	0.517	0.09
46_L	353_A	0.517	0.09
67_A	427_F	0.514	0.09
240_I	391_G	0.514	0.09
187_N	403_S	0.513	0.09
197_R	451_G	0.512	0.09
353_A	359_S	0.511	0.09
93_L	194_K	0.511	0.09
285_H	457_F	0.509	0.09
343_E	465_K	0.509	0.09
30_I	37_G	0.509	0.09
232_L	285_H	0.508	0.09
386_F	428_V	0.506	0.09
109_G	237_I	0.506	0.09
372_Y	423_E	0.505	0.09
48_L	395_L	0.503	0.09
213_L	383_S	0.503	0.09
229_G	386_F	0.502	0.09
53_F	200_F	0.501	0.09
387_T	402_T	0.501	0.09
217_S	388_S	0.501	0.09
131_R	157_Y	0.500	0.09
154_T	172_K	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4ly4A	3	0.4253	98.3	0.955	Contact Map
4m1bA	1	0.3392	98.3	0.955	Contact Map
2vyoA	1	0.3445	98.2	0.956	Contact Map
2cc0A	2	0.3322	98.2	0.956	Contact Map
3rxzA	3	0.4534	98.1	0.958	Contact Map
1ny1A	1	0.3989	98	0.958	Contact Map
2y8uA	1	0.3638	97.8	0.96	Contact Map
2j13A	1	0.3462	97.7	0.961	Contact Map
3cl6A	3	0.4798	97.3	0.964	Contact Map
2c71A	1	0.3497	97.2	0.964	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0125 seconds.