YHFA - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YHFA - Uncharacterized membrane protein YhfA

UniProt:	O07599	Sequences: MMEVGILPVHVLYVFFIGAIILFMLLRKDTTFISLFGIFIISLWASHSLSASVSSLFHSFIYAAGELLPTIFIICFIVSMSDLLTKTGINEAMISPFASLVRGPVTAYWLIGGLMFAISLFFWPSPGVALIGAVLLPAAARAGLTPLAAAMAMNLFGHGFALSGDFVIQAAPKLTADAAGIPVGDVVSASIPLVLIMGVTTTTAAFIMIQRERKKQEHPTSFSPVLSGEQDNSLYLPKRLRSILAFLIPLAFLADIACMLLFNLQGNDATALIGGSAICILFTVHFFVYKHKGLEKITGYFIDGFKFGFKVFGPVIPIAAFFYLGDSGYESILGTSLPKGSHGIVNDLGIALSHMMPMSKELAATALTAAGAITGLDGSGFSGISLAGSIAKLFSSALHADPAILTALGQISAIWVGGGTLVPWALIPAAAICKVDPFELARKNFIPVAIGLLVTTLAAVMML	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	463 (456)
Sequences:	276 (191)
Seq/√Len:	8.9

BACSU - YHFA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
175_T	387_A	5.353	1.00
80_M	280_I	4.749	0.99
244_L	287_F	3.696	0.97
42_S	333_L	3.584	0.96
16_F	37_G	3.560	0.96
42_S	55_S	3.552	0.96
395_S	402_P	3.402	0.95
286_F	293_G	3.273	0.94
181_I	402_P	3.086	0.92
426_L	441_A	3.057	0.91
197_M	455_T	2.943	0.89
152_A	205_A	2.898	0.89
148_A	209_I	2.887	0.88
65_G	166_F	2.707	0.85
120_L	164_G	2.684	0.84
122_F	317_P	2.660	0.84
154_N	158_H	2.643	0.83
34_S	75_C	2.592	0.82
12_L	43_L	2.539	0.81
204_A	450_I	2.529	0.81
14_V	78_V	2.506	0.80
195_L	199_V	2.488	0.79
9_V	41_I	2.413	0.77
11_V	27_R	2.351	0.75
136_L	433_C	2.333	0.75
305_F	314_P	2.244	0.72
214_K	283_T	2.186	0.70
110_L	114_L	2.097	0.66
189_A	403_A	2.073	0.65
254_A	279_C	2.048	0.64
428_P	433_C	2.045	0.64
39_F	278_I	2.032	0.64
21_I	332_I	2.027	0.63
101_V	138_A	2.026	0.63
146_P	211_R	2.024	0.63
151_M	421_L	2.006	0.63
20_I	32_F	1.969	0.61
25_L	301_F	1.964	0.61
132_G	302_I	1.942	0.60
246_F	453_L	1.938	0.60
46_S	250_L	1.907	0.58
197_M	201_T	1.894	0.58
12_L	373_I	1.832	0.55
101_V	461_M	1.807	0.54
164_G	194_V	1.793	0.54
382_S	414_I	1.790	0.53
28_K	256_I	1.783	0.53
93_M	211_R	1.780	0.53
381_F	409_G	1.775	0.53
42_S	170_A	1.772	0.53
22_L	453_L	1.765	0.52
69_P	170_A	1.764	0.52
78_V	434_K	1.763	0.52
39_F	43_L	1.756	0.52
16_F	75_C	1.748	0.52
208_M	446_I	1.741	0.51
169_Q	444_N	1.740	0.51
181_I	263_N	1.732	0.51
35_L	76_F	1.732	0.51
30_T	356_M	1.731	0.51
73_I	436_D	1.729	0.51
426_L	435_V	1.728	0.51
147_L	151_M	1.711	0.50
131_I	174_L	1.709	0.50
249_P	315_V	1.698	0.49
282_F	299_G	1.688	0.49
112_G	156_F	1.686	0.49
27_R	151_M	1.678	0.49
120_L	146_P	1.668	0.48
40_I	365_T	1.650	0.47
199_V	203_T	1.648	0.47
359_S	450_I	1.631	0.47
29_D	320_A	1.630	0.47
22_L	26_L	1.628	0.46
240_L	421_L	1.615	0.46
384_I	406_T	1.613	0.46
452_L	456_T	1.605	0.45
93_M	249_P	1.600	0.45
70_T	345_V	1.596	0.45
260_L	273_I	1.588	0.45
42_S	69_P	1.576	0.44
21_I	326_D	1.564	0.44
243_I	283_T	1.561	0.44
73_I	91_E	1.531	0.42
259_M	374_T	1.522	0.42
180_G	407_A	1.508	0.41
53_V	331_S	1.485	0.40
17_I	167_V	1.473	0.40
67_L	317_P	1.471	0.40
154_N	437_P	1.470	0.40
201_T	455_T	1.462	0.39
211_R	398_L	1.462	0.39
67_L	135_L	1.452	0.39
141_R	426_L	1.445	0.39
225_V	364_A	1.438	0.38
303_D	310_K	1.437	0.38
93_M	435_V	1.424	0.38
75_C	308_G	1.424	0.38
103_G	142_A	1.419	0.38
297_I	441_A	1.415	0.37
115_M	129_A	1.405	0.37
33_I	89_I	1.401	0.37
101_V	111_I	1.399	0.37
43_L	52_S	1.396	0.37
309_F	313_G	1.380	0.36
102_R	273_I	1.372	0.36
134_V	197_M	1.366	0.35
92_A	241_R	1.353	0.35
5_G	27_R	1.343	0.35
90_N	111_I	1.341	0.35
77_I	428_P	1.341	0.35
105_V	206_F	1.338	0.34
204_A	208_M	1.338	0.34
47_H	359_S	1.337	0.34
250_L	300_Y	1.336	0.34
125_S	394_F	1.333	0.34
21_I	47_H	1.332	0.34
67_L	319_A	1.330	0.34
115_M	154_N	1.326	0.34
23_F	33_I	1.323	0.34
12_L	44_W	1.315	0.34
135_L	319_A	1.312	0.33
18_G	254_A	1.309	0.33
156_F	423_P	1.301	0.33
243_I	247_L	1.293	0.33
86_K	421_L	1.291	0.33
295_E	362_L	1.288	0.32
99_S	243_I	1.287	0.32
156_F	312_F	1.287	0.32
214_K	254_A	1.286	0.32
92_A	138_A	1.283	0.32
259_M	311_V	1.279	0.32
48_S	100_L	1.279	0.32
11_V	135_L	1.279	0.32
64_A	72_F	1.277	0.32
97_F	140_A	1.272	0.32
177_D	248_I	1.269	0.32
20_I	441_A	1.266	0.32
90_N	323_Y	1.257	0.31
394_F	455_T	1.256	0.31
65_G	331_S	1.254	0.31
27_R	300_Y	1.251	0.31
47_H	166_F	1.250	0.31
57_F	63_A	1.250	0.31
221_S	224_P	1.245	0.31
70_T	384_I	1.245	0.31
145_T	422_V	1.238	0.31
341_S	455_T	1.238	0.31
248_I	265_Q	1.234	0.30
41_I	311_V	1.229	0.30
77_I	305_F	1.227	0.30
12_L	258_C	1.213	0.30
425_A	428_P	1.213	0.30
301_F	310_K	1.205	0.29
322_F	409_G	1.205	0.29
78_V	324_L	1.204	0.29
156_F	168_I	1.202	0.29
99_S	226_L	1.202	0.29
248_I	376_L	1.198	0.29
204_A	331_S	1.196	0.29
35_L	43_L	1.190	0.29
99_S	253_L	1.189	0.29
134_V	421_L	1.187	0.29
80_M	142_A	1.183	0.29
42_S	52_S	1.179	0.28
250_L	303_D	1.178	0.28
293_G	297_I	1.176	0.28
113_G	246_F	1.174	0.28
256_I	334_G	1.173	0.28
174_L	367_L	1.168	0.28
200_T	454_V	1.164	0.28
115_M	431_A	1.162	0.28
33_I	191_I	1.159	0.28
345_V	406_T	1.156	0.28
80_M	310_K	1.156	0.28
33_I	422_V	1.154	0.28
17_I	134_V	1.154	0.28
84_L	271_A	1.153	0.28
253_L	257_A	1.151	0.27
79_S	305_F	1.144	0.27
116_F	160_F	1.143	0.27
17_I	269_A	1.138	0.27
77_I	80_M	1.137	0.27
31_T	384_I	1.136	0.27
99_S	196_I	1.135	0.27
27_R	134_V	1.135	0.27
187_V	260_L	1.134	0.27
260_L	330_E	1.131	0.27
174_L	206_F	1.130	0.27
134_V	297_I	1.127	0.27
21_I	359_S	1.127	0.27
115_M	158_H	1.125	0.27
32_F	224_P	1.121	0.26
73_I	326_D	1.115	0.26
441_A	445_F	1.115	0.26
90_N	385_S	1.105	0.26
24_M	422_V	1.105	0.26
78_V	314_P	1.104	0.26
110_L	140_A	1.104	0.26
7_L	208_M	1.101	0.26
63_A	198_G	1.098	0.26
45_A	344_I	1.095	0.26
248_I	281_L	1.090	0.25
11_V	138_A	1.087	0.25
218_H	303_D	1.086	0.25
322_F	381_F	1.086	0.25
167_V	198_G	1.085	0.25
43_L	47_H	1.081	0.25
246_F	254_A	1.078	0.25
22_L	211_R	1.074	0.25
22_L	56_L	1.066	0.25
64_A	68_L	1.065	0.25
34_S	76_F	1.063	0.25
269_A	343_G	1.061	0.24
220_T	434_K	1.053	0.24
76_F	281_L	1.050	0.24
151_M	443_K	1.048	0.24
129_A	425_A	1.047	0.24
28_K	291_H	1.044	0.24
136_L	264_L	1.039	0.24
242_S	301_F	1.035	0.24
7_L	449_A	1.032	0.24
357_P	371_G	1.032	0.24
446_I	450_I	1.031	0.24
199_V	261_L	1.031	0.24
71_I	312_F	1.029	0.23
366_A	455_T	1.029	0.23
75_C	89_I	1.027	0.23
122_F	319_A	1.027	0.23
22_L	458_A	1.027	0.23
196_I	458_A	1.025	0.23
170_A	300_Y	1.024	0.23
35_L	84_L	1.021	0.23
72_F	317_P	1.021	0.23
27_R	31_T	1.017	0.23
309_F	317_P	1.016	0.23
116_F	120_L	1.015	0.23
104_P	300_Y	1.014	0.23
197_M	394_F	1.011	0.23
282_F	429_A	1.007	0.23
89_I	202_T	1.005	0.23
215_K	254_A	1.004	0.23
20_I	291_H	1.003	0.23
148_A	443_K	1.003	0.23
169_Q	324_L	1.001	0.23
194_V	198_G	1.000	0.23
7_L	39_F	1.000	0.23
40_I	332_I	0.999	0.23
44_W	285_H	0.998	0.23
248_I	390_I	0.997	0.22
77_I	280_I	0.996	0.22
125_S	158_H	0.993	0.22
103_G	462_M	0.991	0.22
129_A	158_H	0.982	0.22
374_T	389_S	0.979	0.22
257_A	458_A	0.979	0.22
25_L	149_A	0.979	0.22
71_I	154_N	0.979	0.22
112_G	312_F	0.978	0.22
265_Q	269_A	0.978	0.22
252_F	272_L	0.971	0.22
100_L	330_E	0.967	0.22
211_R	450_I	0.964	0.22
73_I	363_A	0.962	0.21
199_V	457_L	0.960	0.21
280_I	305_F	0.958	0.21
69_P	287_F	0.951	0.21
428_P	431_A	0.949	0.21
100_L	286_F	0.949	0.21
196_I	462_M	0.947	0.21
122_F	456_T	0.941	0.21
33_I	73_I	0.939	0.21
167_V	330_E	0.938	0.21
81_S	431_A	0.938	0.21
70_T	406_T	0.937	0.21
249_P	333_L	0.934	0.21
55_S	170_A	0.934	0.21
153_M	428_P	0.932	0.21
252_F	277_A	0.932	0.21
39_F	377_D	0.931	0.21
286_F	457_L	0.928	0.20
250_L	279_C	0.926	0.20
269_A	353_S	0.924	0.20
257_A	422_V	0.924	0.20
12_L	331_S	0.924	0.20
78_V	107_A	0.921	0.20
328_G	361_E	0.919	0.20
344_I	373_I	0.918	0.20
51_A	196_I	0.917	0.20
297_I	462_M	0.917	0.20
353_S	432_I	0.915	0.20
233_S	243_I	0.912	0.20
7_L	355_M	0.912	0.20
142_A	184_G	0.905	0.20
45_A	100_L	0.904	0.20
36_F	113_G	0.901	0.20
132_G	136_L	0.901	0.20
302_I	313_G	0.901	0.20
173_K	356_M	0.899	0.20
108_Y	286_F	0.898	0.20
129_A	312_F	0.896	0.20
66_E	84_L	0.890	0.19
173_K	177_D	0.887	0.19
361_E	427_I	0.886	0.19
434_K	444_N	0.883	0.19
269_A	344_I	0.883	0.19
58_H	268_D	0.882	0.19
372_A	416_V	0.882	0.19
168_I	422_V	0.881	0.19
330_E	341_S	0.878	0.19
9_V	18_G	0.878	0.19
70_T	326_D	0.877	0.19
261_L	365_T	0.876	0.19
42_S	328_G	0.872	0.19
166_F	462_M	0.871	0.19
135_L	138_A	0.871	0.19
77_I	422_V	0.868	0.19
265_Q	368_T	0.868	0.19
313_G	317_P	0.868	0.19
381_F	414_I	0.867	0.19
423_P	428_P	0.866	0.19
8_P	11_V	0.865	0.19
57_F	167_V	0.865	0.19
199_V	207_I	0.862	0.19
164_G	262_F	0.861	0.19
19_A	282_F	0.860	0.19
354_H	446_I	0.859	0.19
18_G	287_F	0.858	0.19
252_F	416_V	0.858	0.19
190_S	194_V	0.851	0.18
256_I	449_A	0.850	0.18
46_S	252_F	0.850	0.18
14_V	268_D	0.850	0.18
93_M	146_P	0.847	0.18
35_L	232_N	0.846	0.18
83_L	330_E	0.842	0.18
41_I	305_F	0.841	0.18
248_I	280_I	0.840	0.18
243_I	299_G	0.840	0.18
27_R	442_R	0.838	0.18
373_I	456_T	0.837	0.18
21_I	265_Q	0.837	0.18
50_S	108_Y	0.836	0.18
6_I	292_K	0.831	0.18
28_K	295_E	0.827	0.18
125_S	201_T	0.826	0.18
382_S	408_L	0.826	0.18
251_A	278_I	0.825	0.18
82_D	85_T	0.824	0.18
26_L	41_I	0.821	0.18
115_M	312_F	0.821	0.18
145_T	213_R	0.819	0.18
199_V	228_G	0.817	0.18
149_A	152_A	0.816	0.17
142_A	315_V	0.816	0.17
79_S	333_L	0.814	0.17
155_L	359_S	0.812	0.17
102_R	279_C	0.812	0.17
125_S	154_N	0.811	0.17
18_G	117_A	0.811	0.17
281_L	298_T	0.806	0.17
409_G	414_I	0.806	0.17
18_G	228_G	0.805	0.17
26_L	52_S	0.805	0.17
153_M	315_V	0.804	0.17
16_F	29_D	0.800	0.17
40_I	271_A	0.800	0.17
102_R	457_L	0.799	0.17
26_L	253_L	0.799	0.17
25_L	134_V	0.799	0.17
445_F	449_A	0.799	0.17
13_Y	309_F	0.798	0.17
202_T	315_V	0.796	0.17
15_F	217_E	0.795	0.17
189_A	192_P	0.795	0.17
208_M	450_I	0.794	0.17
128_V	186_V	0.792	0.17
31_T	89_I	0.791	0.17
53_V	361_E	0.791	0.17
131_I	421_L	0.791	0.17
49_L	369_A	0.789	0.17
252_F	297_I	0.786	0.17
13_Y	128_V	0.786	0.17
309_F	415_W	0.785	0.17
198_G	367_L	0.784	0.17
80_M	92_A	0.783	0.17
78_V	141_R	0.780	0.17
156_F	192_P	0.780	0.17
68_L	194_V	0.779	0.17
49_L	103_G	0.777	0.17
158_H	311_V	0.775	0.16
80_M	250_L	0.774	0.16
329_Y	376_L	0.774	0.16
79_S	301_F	0.773	0.16
257_A	400_A	0.771	0.16
201_T	431_A	0.769	0.16
315_V	348_L	0.767	0.16
246_F	283_T	0.767	0.16
23_F	249_P	0.767	0.16
129_A	154_N	0.766	0.16
125_S	455_T	0.762	0.16
266_G	271_A	0.761	0.16
89_I	425_A	0.761	0.16
447_P	451_G	0.760	0.16
122_F	313_G	0.759	0.16
18_G	147_L	0.759	0.16
92_A	131_I	0.756	0.16
313_G	437_P	0.756	0.16
379_S	409_G	0.755	0.16
182_P	203_T	0.752	0.16
420_T	448_V	0.750	0.16
260_L	402_P	0.746	0.16
64_A	328_G	0.745	0.16
42_S	95_S	0.745	0.16
298_T	455_T	0.744	0.16
28_K	462_M	0.744	0.16
63_A	244_L	0.743	0.16
145_T	212_E	0.742	0.16
79_S	390_I	0.738	0.16
30_T	429_A	0.738	0.16
32_F	291_H	0.734	0.16
103_G	344_I	0.734	0.16
200_T	443_K	0.733	0.16
173_K	269_A	0.731	0.15
160_F	202_T	0.730	0.15
35_L	94_I	0.730	0.15
113_G	254_A	0.730	0.15
207_I	285_H	0.727	0.15
374_T	413_A	0.726	0.15
132_G	169_Q	0.726	0.15
224_P	243_I	0.723	0.15
361_E	460_V	0.722	0.15
67_L	72_F	0.722	0.15
212_E	443_K	0.722	0.15
8_P	421_L	0.721	0.15
374_T	383_G	0.721	0.15
56_L	107_A	0.720	0.15
155_L	343_G	0.718	0.15
14_V	75_C	0.716	0.15
340_G	460_V	0.716	0.15
56_L	167_V	0.714	0.15
374_T	377_D	0.714	0.15
89_I	345_V	0.713	0.15
155_L	210_Q	0.713	0.15
430_A	448_V	0.712	0.15
134_V	332_I	0.711	0.15
78_V	155_L	0.710	0.15
176_A	247_L	0.709	0.15
258_C	262_F	0.706	0.15
55_S	98_A	0.704	0.15
377_D	413_A	0.704	0.15
210_Q	453_L	0.703	0.15
426_L	459_A	0.703	0.15
22_L	221_S	0.702	0.15
393_L	429_A	0.701	0.15
375_G	419_G	0.700	0.15
6_I	184_G	0.699	0.15
169_Q	314_P	0.699	0.15
5_G	233_S	0.697	0.15
230_Q	296_K	0.688	0.15
46_S	461_M	0.688	0.15
414_I	422_V	0.686	0.14
299_G	402_P	0.685	0.14
31_T	300_Y	0.685	0.14
53_V	391_A	0.684	0.14
266_G	318_I	0.683	0.14
363_A	398_L	0.680	0.14
333_L	345_V	0.679	0.14
394_F	428_P	0.679	0.14
453_L	461_M	0.678	0.14
99_S	363_A	0.678	0.14
113_G	235_Y	0.678	0.14
20_I	348_L	0.677	0.14
41_I	210_Q	0.677	0.14
278_I	369_A	0.676	0.14
15_F	141_R	0.675	0.14
149_A	187_V	0.675	0.14
225_V	285_H	0.675	0.14
41_I	87_T	0.674	0.14
103_G	218_H	0.674	0.14
36_F	340_G	0.673	0.14
270_T	312_F	0.673	0.14
379_S	386_L	0.673	0.14
117_A	147_L	0.673	0.14
437_P	444_N	0.672	0.14
82_D	262_F	0.672	0.14
266_G	307_F	0.671	0.14
36_F	238_K	0.670	0.14
317_P	456_T	0.668	0.14
70_T	116_F	0.666	0.14
348_L	351_A	0.666	0.14
199_V	215_K	0.662	0.14
110_L	147_L	0.662	0.14
6_I	298_T	0.661	0.14
158_H	425_A	0.660	0.14
41_I	55_S	0.656	0.14
57_F	198_G	0.651	0.14
20_I	173_K	0.650	0.14
14_V	225_V	0.650	0.14
141_R	258_C	0.649	0.14
359_S	457_L	0.648	0.14
52_S	170_A	0.646	0.14
83_L	285_H	0.644	0.14
118_I	149_A	0.640	0.14
168_I	180_G	0.640	0.14
170_A	312_F	0.639	0.13
375_G	383_G	0.638	0.13
419_G	447_P	0.638	0.13
446_I	453_L	0.637	0.13
84_L	305_F	0.636	0.13
283_T	364_A	0.635	0.13
141_R	254_A	0.635	0.13
32_F	221_S	0.635	0.13
117_A	233_S	0.634	0.13
102_R	462_M	0.632	0.13
38_I	175_T	0.628	0.13
300_Y	362_L	0.627	0.13
129_A	156_F	0.625	0.13
457_L	462_M	0.625	0.13
403_A	427_I	0.624	0.13
109_W	202_T	0.624	0.13
393_L	427_I	0.623	0.13
331_S	335_T	0.620	0.13
49_L	95_S	0.620	0.13
102_R	233_S	0.619	0.13
36_F	215_K	0.618	0.13
419_G	448_V	0.617	0.13
79_S	411_I	0.615	0.13
94_I	141_R	0.615	0.13
73_I	425_A	0.609	0.13
147_L	209_I	0.606	0.13
101_V	120_L	0.606	0.13
383_G	451_G	0.606	0.13
328_G	333_L	0.606	0.13
77_I	203_T	0.606	0.13
49_L	395_S	0.605	0.13
312_F	423_P	0.605	0.13
13_Y	387_A	0.605	0.13
215_K	243_I	0.603	0.13
56_L	244_L	0.601	0.13
80_M	164_G	0.600	0.13
76_F	113_G	0.599	0.13
147_L	175_T	0.599	0.13
222_F	369_A	0.599	0.13
258_C	302_I	0.595	0.13
131_I	372_A	0.595	0.13
109_W	338_P	0.594	0.13
387_A	413_A	0.592	0.13
346_N	431_A	0.590	0.13
427_I	442_R	0.588	0.12
448_V	451_G	0.586	0.12
412_S	452_L	0.586	0.12
87_T	225_V	0.585	0.12
148_A	454_V	0.585	0.12
229_E	254_A	0.585	0.12
49_L	99_S	0.584	0.12
223_S	457_L	0.583	0.12
53_V	181_I	0.582	0.12
69_P	344_I	0.582	0.12
232_N	254_A	0.579	0.12
29_D	444_N	0.579	0.12
144_L	459_A	0.579	0.12
329_Y	404_I	0.578	0.12
346_N	428_P	0.575	0.12
431_A	437_P	0.573	0.12
210_Q	434_K	0.572	0.12
423_P	431_A	0.571	0.12
222_F	254_A	0.571	0.12
309_F	362_L	0.570	0.12
142_A	251_A	0.570	0.12
16_F	78_V	0.570	0.12
97_F	224_P	0.570	0.12
89_I	241_R	0.568	0.12
12_L	332_I	0.568	0.12
313_G	404_I	0.568	0.12
419_G	451_G	0.567	0.12
90_N	330_E	0.567	0.12
158_H	312_F	0.567	0.12
122_F	309_F	0.567	0.12
376_L	382_S	0.566	0.12
215_K	462_M	0.566	0.12
302_I	309_F	0.565	0.12
35_L	373_I	0.564	0.12
98_A	141_R	0.564	0.12
14_V	258_C	0.563	0.12
83_L	359_S	0.563	0.12
394_F	431_A	0.562	0.12
413_A	462_M	0.562	0.12
280_I	308_G	0.561	0.12
142_A	412_S	0.560	0.12
186_V	373_I	0.560	0.12
267_N	430_A	0.559	0.12
78_V	164_G	0.559	0.12
158_H	377_D	0.558	0.12
386_L	409_G	0.557	0.12
256_I	264_L	0.557	0.12
252_F	305_F	0.556	0.12
371_G	376_L	0.556	0.12
250_L	330_E	0.554	0.12
12_L	35_L	0.554	0.12
91_E	394_F	0.553	0.12
313_G	452_L	0.552	0.12
356_M	366_A	0.552	0.12
135_L	317_P	0.552	0.12
28_K	353_S	0.551	0.12
252_F	256_I	0.551	0.12
115_M	428_P	0.550	0.12
385_S	406_T	0.549	0.12
86_K	211_R	0.549	0.12
107_A	449_A	0.548	0.12
108_Y	146_P	0.547	0.12
201_T	394_F	0.547	0.12
214_K	264_L	0.545	0.12
63_A	167_V	0.544	0.12
47_H	254_A	0.543	0.12
271_A	341_S	0.543	0.12
69_P	333_L	0.542	0.12
95_S	450_I	0.541	0.12
106_T	457_L	0.541	0.12
132_G	314_P	0.540	0.12
19_A	76_F	0.540	0.12
367_L	397_A	0.539	0.12
87_T	328_G	0.538	0.12
73_I	364_A	0.538	0.12
372_A	453_L	0.538	0.12
87_T	164_G	0.538	0.12
71_I	115_M	0.537	0.12
424_W	447_P	0.537	0.12
112_G	433_C	0.536	0.12
71_I	431_A	0.536	0.12
42_S	316_I	0.535	0.12
421_L	435_V	0.535	0.12
21_I	241_R	0.535	0.12
250_L	268_D	0.535	0.12
37_G	444_N	0.534	0.12
341_S	414_I	0.534	0.12
16_F	20_I	0.531	0.11
29_D	37_G	0.531	0.11
208_M	215_K	0.530	0.11
23_F	437_P	0.530	0.11
87_T	389_S	0.529	0.11
17_I	37_G	0.529	0.11
77_I	273_I	0.529	0.11
80_M	241_R	0.528	0.11
256_I	391_A	0.527	0.11
89_I	406_T	0.526	0.11
312_F	358_M	0.524	0.11
103_G	111_I	0.524	0.11
211_R	273_I	0.523	0.11
6_I	234_L	0.523	0.11
40_I	44_W	0.523	0.11
142_A	280_I	0.522	0.11
171_A	275_G	0.521	0.11
5_G	256_I	0.520	0.11
195_L	332_I	0.519	0.11
50_S	90_N	0.519	0.11
278_I	370_A	0.519	0.11
15_F	211_R	0.518	0.11
11_V	131_I	0.518	0.11
198_G	244_L	0.517	0.11
109_W	112_G	0.517	0.11
109_W	300_Y	0.515	0.11
5_G	199_V	0.513	0.11
361_E	391_A	0.513	0.11
196_I	303_D	0.512	0.11
121_F	348_L	0.511	0.11
31_T	70_T	0.511	0.11
94_I	290_K	0.510	0.11
356_M	421_L	0.509	0.11
292_K	400_A	0.509	0.11
256_I	289_Y	0.507	0.11
272_L	356_M	0.506	0.11
49_L	58_H	0.506	0.11
97_F	114_L	0.506	0.11
207_I	244_L	0.505	0.11
12_L	49_L	0.505	0.11
148_A	151_M	0.504	0.11
303_D	363_A	0.504	0.11
42_S	136_L	0.503	0.11
238_K	242_S	0.503	0.11
309_F	367_L	0.503	0.11
411_I	455_T	0.502	0.11
141_R	434_K	0.501	0.11
94_I	251_A	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4f35D	2	0.8531	99.8	0.896	Contact Map
4r0cA	3	0.9179	98.8	0.942	Contact Map
4r1iA	2	0.9222	98.6	0.946	Contact Map
2kluA	1	0.1382	31.6	0.983	Contact Map
2m20A	2	0.1274	14.1	0.986	Contact Map
4j05A	3	0.4579	9.2	0.987	Contact Map
3giaA	1	0.4363	8.7	0.987	Contact Map
2ifoA	8	0.0821	8	0.987	Contact Map
3dl8E	1	0.1382	7.9	0.987	Contact Map
2kncA	1	0.1015	7.6	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0129 seconds.