YITJ - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YITJ - Bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase

UniProt:	O06745	Sequences: MGLLEDLQRQVLIGDGAMGTLLYSYGIDRCFEELNISKPEEIQRIHKAYVEAGANIIQTNTYGANYIKLSRHGLEDDIKKMNQEAVKIARASAGDAYVLGTMGGIRTFNKNAYSLDEIKRSFREQLYLLLHEEPDGLLLETYYDLEEAREVLKIARKETDLPIMLNVSMHEQGVLQDGTPLSDALRSIADLGADIVGINCRLGPYHMIEALSEVPIFDDVFLSVYPNSSLPSLEEGRLVYETDDTYFQNSASEFRKQGARIIGGCCGTTPNHIRAMAEAVGGLAPITEKEVKTRAKEFISVHHERTEPGLDEIAAKKRSIIVELDPPKKLSFDKFLSAAAELKEAGIDALTLADNSLATPRISNVACGALVKQQLDMRSLVHITCRDRNIIGLQSHLMGLDTLGLNDVLAITGDPSKIGDFPGATSVYDLTSFDLIRLIKQFNEGLSLSGKPLGKKTNFSVAAAFNPNVRHLDKAVKRLEKKIDCGADYFVSQPVYSEQQLVDIHNETKHLKTPIYIGIMPLTSSRNAEFIHNEIPGIKLSDTIREKMAHAGEDKEKQKAEGLAIARSLLDTACELFNGIYLITPFLRSDLTAELTSYIQQKDEQRQNIFLH	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	612 (595)
Sequences:	370 (288)
Seq/√Len:	11.8

BACSU - YITJ

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
166_N	223_S	7.095	1.00
319_S	516_Y	6.072	1.00
50_V	96_A	5.439	1.00
6_D	10_Q	4.344	1.00
93_A	98_V	4.325	1.00
102_M	126_L	4.182	1.00
99_L	136_G	4.098	0.99
77_D	80_K	3.945	0.99
410_A	439_I	3.713	0.99
43_Q	91_A	3.656	0.99
47_K	51_E	3.322	0.98
149_R	191_L	3.221	0.97
561_E	564_A	3.176	0.97
224_V	259_A	3.159	0.97
126_L	155_A	3.159	0.97
562_G	566_A	3.141	0.96
56_I	261_I	3.085	0.96
547_K	568_S	3.051	0.96
148_A	165_L	2.925	0.95
100_G	137_L	2.836	0.94
350_L	371_V	2.819	0.94
325_D	353_A	2.786	0.93
57_I	93_A	2.722	0.92
83_Q	132_E	2.658	0.91
13_I	276_M	2.649	0.91
480_E	510_H	2.620	0.91
461_V	488_D	2.617	0.91
12_L	55_N	2.615	0.91
86_V	134_P	2.600	0.90
58_Q	101_T	2.554	0.90
329_K	454_G	2.512	0.89
66_Y	124_E	2.491	0.88
483_I	513_T	2.466	0.88
61_T	85_A	2.451	0.87
465_F	479_L	2.425	0.87
86_V	132_E	2.402	0.86
35_N	85_A	2.400	0.86
571_D	598_Y	2.386	0.86
436_I	463_A	2.359	0.85
332_F	336_L	2.347	0.85
529_E	549_A	2.344	0.85
274_R	278_E	2.342	0.85
378_R	407_D	2.293	0.84
490_F	513_T	2.248	0.82
529_E	545_R	2.238	0.82
444_E	456_K	2.205	0.81
42_I	45_I	2.190	0.81
180_P	347_I	2.188	0.80
189_A	219_D	2.168	0.80
127_Y	154_I	2.127	0.78
483_I	511_L	2.126	0.78
582_L	592_T	2.126	0.78
313_I	544_I	2.109	0.78
525_S	545_R	2.097	0.77
363_S	559_K	2.094	0.77
360_P	384_T	2.076	0.77
440_K	488_D	2.070	0.77
368_G	381_V	2.068	0.76
5_E	8_Q	2.041	0.75
50_V	57_I	2.036	0.75
479_L	511_L	2.005	0.74
463_A	490_F	2.004	0.74
86_V	129_L	1.979	0.73
498_E	572_T	1.970	0.73
65_N	105_I	1.967	0.73
505_H	576_L	1.960	0.72
35_N	60_N	1.950	0.72
78_I	347_I	1.944	0.72
169_M	210_A	1.896	0.70
440_K	461_V	1.883	0.69
8_Q	164_M	1.864	0.68
325_D	538_I	1.837	0.67
353_A	583_I	1.817	0.66
166_N	495_V	1.812	0.66
469_V	475_A	1.802	0.66
127_Y	158_E	1.791	0.65
79_K	83_Q	1.787	0.65
462_A	489_Y	1.785	0.65
96_A	555_K	1.784	0.65
570_L	599_I	1.778	0.65
548_M	562_G	1.768	0.64
259_A	262_I	1.767	0.64
563_L	591_L	1.755	0.63
425_T	429_D	1.744	0.63
254_F	312_E	1.738	0.63
351_T	527_N	1.735	0.63
499_Q	503_D	1.724	0.62
177_D	363_S	1.716	0.62
271_N	274_R	1.702	0.61
433_F	436_I	1.701	0.61
436_I	461_V	1.701	0.61
97_Y	492_S	1.699	0.61
88_I	237_R	1.697	0.61
59_T	134_P	1.696	0.61
317_K	348_D	1.670	0.59
499_Q	564_A	1.666	0.59
547_K	566_A	1.665	0.59
5_E	97_Y	1.659	0.59
63_G	363_S	1.658	0.59
317_K	320_I	1.638	0.58
367_C	442_F	1.601	0.56
559_K	588_R	1.597	0.56
436_I	487_A	1.596	0.56
13_I	280_V	1.569	0.55
540_L	543_T	1.557	0.54
87_K	132_E	1.529	0.53
166_N	228_S	1.529	0.53
398_M	457_T	1.525	0.52
525_S	550_H	1.519	0.52
370_L	374_Q	1.506	0.51
55_N	277_A	1.498	0.51
483_I	512_K	1.495	0.51
254_F	276_M	1.494	0.51
178_G	540_L	1.494	0.51
14_G	225_Y	1.493	0.51
531_I	535_I	1.491	0.51
137_L	425_T	1.490	0.51
120_R	126_L	1.490	0.51
478_R	573_A	1.488	0.51
43_Q	88_I	1.481	0.50
57_I	571_D	1.477	0.50
149_R	187_S	1.473	0.50
166_N	591_L	1.466	0.49
231_P	454_G	1.459	0.49
309_G	312_E	1.457	0.49
100_G	134_P	1.457	0.49
204_P	562_G	1.451	0.49
31_F	231_P	1.436	0.48
65_N	78_I	1.425	0.47
79_K	131_H	1.421	0.47
318_R	599_I	1.420	0.47
516_Y	544_I	1.417	0.47
362_I	402_T	1.415	0.47
229_S	243_D	1.414	0.47
527_N	585_P	1.411	0.47
62_Y	216_I	1.405	0.46
84_E	87_K	1.399	0.46
352_L	416_S	1.396	0.46
385_C	585_P	1.369	0.45
522_L	566_A	1.368	0.45
198_I	207_M	1.368	0.45
397_L	435_L	1.366	0.44
198_I	244_D	1.363	0.44
347_I	512_K	1.359	0.44
181_L	210_A	1.358	0.44
160_D	560_A	1.358	0.44
85_A	134_P	1.357	0.44
353_A	538_I	1.345	0.43
64_A	81_M	1.344	0.43
412_T	432_S	1.332	0.43
326_P	367_C	1.329	0.43
479_L	490_F	1.321	0.42
508_T	515_I	1.319	0.42
497_S	513_T	1.313	0.42
13_I	255_R	1.310	0.42
56_I	99_L	1.310	0.42
240_Y	244_D	1.301	0.41
38_K	98_V	1.299	0.41
217_F	222_L	1.296	0.41
338_A	589_S	1.294	0.41
381_V	398_M	1.290	0.41
547_K	564_A	1.289	0.41
166_N	504_I	1.285	0.41
566_A	591_L	1.282	0.40
94_G	560_A	1.278	0.40
56_I	401_D	1.275	0.40
371_V	377_M	1.265	0.40
229_S	462_A	1.257	0.39
62_Y	104_G	1.256	0.39
224_V	262_I	1.255	0.39
66_Y	120_R	1.255	0.39
271_N	344_E	1.252	0.39
498_E	568_S	1.247	0.39
97_Y	575_E	1.245	0.39
313_I	319_S	1.244	0.39
126_L	137_L	1.240	0.38
211_L	245_T	1.239	0.38
324_L	339_A	1.228	0.38
178_G	519_I	1.228	0.38
152_L	193_A	1.226	0.38
15_D	59_T	1.221	0.38
352_L	402_T	1.216	0.37
357_L	595_L	1.215	0.37
72_H	77_D	1.214	0.37
147_E	422_P	1.213	0.37
525_S	529_E	1.212	0.37
120_R	127_Y	1.207	0.37
490_F	555_K	1.205	0.37
403_L	408_V	1.204	0.37
39_P	94_G	1.201	0.37
254_F	545_R	1.192	0.36
56_I	225_Y	1.187	0.36
142_Y	462_A	1.186	0.36
544_I	565_I	1.184	0.36
10_Q	55_N	1.181	0.36
417_K	425_T	1.178	0.36
319_S	544_I	1.175	0.35
156_R	163_I	1.170	0.35
534_E	537_G	1.167	0.35
383_I	452_P	1.166	0.35
391_I	585_P	1.160	0.35
340_A	374_Q	1.153	0.34
155_A	496_Y	1.151	0.34
36_I	252_S	1.149	0.34
519_I	566_A	1.138	0.34
351_T	584_T	1.134	0.34
81_M	148_A	1.127	0.33
102_M	139_L	1.124	0.33
520_M	581_Y	1.122	0.33
505_H	515_I	1.121	0.33
340_A	390_I	1.121	0.33
547_K	562_G	1.120	0.33
359_T	454_G	1.119	0.33
542_D	546_E	1.117	0.33
335_F	584_T	1.117	0.33
387_D	412_T	1.117	0.33
431_T	468_N	1.112	0.33
497_S	500_Q	1.111	0.33
127_Y	131_H	1.111	0.33
560_A	564_A	1.109	0.32
59_T	85_A	1.106	0.32
248_Q	276_M	1.104	0.32
6_D	97_Y	1.100	0.32
321_I	516_Y	1.100	0.32
462_A	485_C	1.099	0.32
184_A	453_L	1.098	0.32
343_K	375_L	1.098	0.32
3_L	195_I	1.096	0.32
35_N	439_I	1.094	0.32
309_G	316_K	1.092	0.32
85_A	272_H	1.092	0.32
200_C	266_C	1.088	0.32
200_C	265_C	1.088	0.32
43_Q	92_S	1.086	0.31
231_P	237_R	1.084	0.31
431_T	434_D	1.083	0.31
104_G	516_Y	1.082	0.31
50_V	55_N	1.082	0.31
120_R	157_K	1.081	0.31
353_A	397_L	1.075	0.31
36_I	81_M	1.075	0.31
58_Q	362_I	1.075	0.31
388_R	479_L	1.070	0.31
363_S	434_D	1.069	0.31
41_E	44_R	1.069	0.31
69_L	204_P	1.067	0.31
384_T	533_N	1.066	0.31
88_I	377_M	1.066	0.31
559_K	591_L	1.065	0.31
167_V	198_I	1.065	0.31
50_V	93_A	1.064	0.31
55_N	80_K	1.060	0.30
477_K	513_T	1.059	0.30
42_I	254_F	1.057	0.30
325_D	584_T	1.055	0.30
410_A	468_N	1.053	0.30
62_Y	248_Q	1.052	0.30
382_H	414_D	1.051	0.30
102_M	155_A	1.051	0.30
40_E	301_V	1.049	0.30
86_V	100_G	1.049	0.30
445_G	450_G	1.048	0.30
386_R	493_Q	1.043	0.30
340_A	344_E	1.040	0.30
522_L	561_E	1.037	0.29
13_I	254_F	1.037	0.29
472_L	476_V	1.037	0.29
100_G	129_L	1.036	0.29
353_A	420_D	1.032	0.29
367_C	384_T	1.029	0.29
104_G	407_D	1.028	0.29
262_I	276_M	1.028	0.29
242_T	541_S	1.026	0.29
401_D	455_K	1.026	0.29
311_D	314_A	1.025	0.29
31_F	122_F	1.025	0.29
99_L	375_L	1.024	0.29
9_R	160_D	1.024	0.29
525_S	549_A	1.016	0.29
495_V	572_T	1.015	0.28
353_A	508_T	1.013	0.28
347_I	596_T	1.011	0.28
244_D	568_S	1.010	0.28
558_Q	562_G	1.007	0.28
14_G	45_I	1.000	0.28
496_Y	536_P	1.000	0.28
100_G	198_I	1.000	0.28
63_G	559_K	0.998	0.28
349_A	380_L	0.998	0.28
201_R	356_S	0.996	0.28
65_N	520_M	0.992	0.28
339_A	481_K	0.992	0.28
430_L	523_T	0.991	0.28
19_G	468_N	0.989	0.27
387_D	432_S	0.986	0.27
98_V	221_F	0.984	0.27
572_T	575_E	0.984	0.27
492_S	516_Y	0.983	0.27
382_H	493_Q	0.980	0.27
414_D	493_Q	0.980	0.27
386_R	414_D	0.980	0.27
382_H	386_R	0.980	0.27
51_E	274_R	0.980	0.27
102_M	333_D	0.978	0.27
90_R	151_V	0.962	0.26
526_R	560_A	0.960	0.26
357_L	496_Y	0.954	0.26
429_D	489_Y	0.949	0.26
381_V	578_N	0.948	0.26
119_K	150_E	0.947	0.26
390_I	430_L	0.943	0.26
123_R	154_I	0.941	0.26
40_E	344_E	0.934	0.25
386_R	518_G	0.933	0.25
493_Q	518_G	0.933	0.25
430_L	496_Y	0.933	0.25
537_G	581_Y	0.932	0.25
126_L	139_L	0.932	0.25
242_T	402_T	0.931	0.25
206_H	230_L	0.929	0.25
433_F	485_C	0.927	0.25
96_A	495_V	0.924	0.25
584_T	592_T	0.923	0.25
64_A	69_L	0.923	0.25
8_Q	95_D	0.923	0.25
243_D	495_V	0.922	0.25
82_N	125_Q	0.921	0.25
14_G	56_I	0.921	0.25
355_N	595_L	0.918	0.25
79_K	128_L	0.915	0.25
36_I	304_E	0.914	0.25
56_I	375_L	0.913	0.25
45_I	503_D	0.911	0.24
516_Y	595_L	0.911	0.24
462_A	487_A	0.909	0.24
5_E	9_R	0.909	0.24
92_S	269_T	0.908	0.24
34_L	271_N	0.907	0.24
255_R	283_L	0.906	0.24
131_H	560_A	0.905	0.24
99_L	489_Y	0.904	0.24
312_E	316_K	0.903	0.24
414_D	518_G	0.903	0.24
382_H	518_G	0.903	0.24
592_T	596_T	0.902	0.24
77_D	249_N	0.899	0.24
487_A	566_A	0.899	0.24
245_T	492_S	0.897	0.24
326_P	339_A	0.897	0.24
177_D	202_L	0.896	0.24
50_V	88_I	0.896	0.24
26_G	69_L	0.896	0.24
505_H	508_T	0.896	0.24
4_L	261_I	0.895	0.24
320_I	596_T	0.895	0.24
11_V	152_L	0.894	0.24
198_I	240_Y	0.893	0.24
325_D	583_I	0.892	0.24
38_K	88_I	0.891	0.24
8_Q	142_Y	0.890	0.24
149_R	542_D	0.888	0.24
151_V	215_P	0.888	0.24
123_R	158_E	0.887	0.24
337_S	405_L	0.886	0.24
381_V	446_L	0.886	0.24
484_D	556_E	0.886	0.24
284_A	294_R	0.885	0.24
339_A	343_K	0.882	0.23
355_N	395_S	0.881	0.23
385_C	391_I	0.879	0.23
151_V	154_I	0.878	0.23
328_K	519_I	0.877	0.23
165_L	435_L	0.877	0.23
62_Y	229_S	0.877	0.23
372_K	484_D	0.875	0.23
185_L	491_V	0.874	0.23
430_L	484_D	0.873	0.23
19_G	35_N	0.872	0.23
101_T	362_I	0.871	0.23
88_I	485_C	0.868	0.23
353_A	592_T	0.866	0.23
357_L	417_K	0.866	0.23
126_L	154_I	0.866	0.23
167_V	175_L	0.866	0.23
437_R	481_K	0.865	0.23
88_I	93_A	0.865	0.23
400_L	584_T	0.861	0.23
320_I	581_Y	0.856	0.23
366_A	403_L	0.854	0.22
296_K	299_I	0.854	0.22
7_L	40_E	0.853	0.22
69_L	487_A	0.852	0.22
348_D	451_K	0.851	0.22
243_D	492_S	0.851	0.22
14_G	436_I	0.849	0.22
3_L	489_Y	0.849	0.22
139_L	342_L	0.849	0.22
379_S	400_L	0.848	0.22
36_I	42_I	0.846	0.22
135_D	147_E	0.846	0.22
438_L	490_F	0.845	0.22
352_L	364_N	0.844	0.22
156_R	543_T	0.844	0.22
353_A	581_Y	0.840	0.22
324_L	481_K	0.840	0.22
491_V	545_R	0.838	0.22
287_T	594_E	0.838	0.22
105_I	118_I	0.837	0.22
262_I	350_L	0.835	0.22
98_V	259_A	0.833	0.22
163_I	292_K	0.829	0.22
158_E	161_L	0.829	0.22
325_D	357_L	0.827	0.22
212_S	533_N	0.827	0.22
409_L	464_A	0.827	0.22
332_F	367_C	0.825	0.21
102_M	224_V	0.823	0.21
174_V	513_T	0.821	0.21
128_L	245_T	0.818	0.21
20_T	92_S	0.818	0.21
313_I	446_L	0.817	0.21
8_Q	156_R	0.817	0.21
492_S	576_L	0.816	0.21
45_I	79_K	0.815	0.21
162_P	450_G	0.815	0.21
92_S	139_L	0.815	0.21
243_D	248_Q	0.814	0.21
356_S	407_D	0.813	0.21
170_H	177_D	0.812	0.21
385_C	519_I	0.812	0.21
531_I	540_L	0.811	0.21
6_D	88_I	0.811	0.21
570_L	573_A	0.811	0.21
367_C	457_T	0.811	0.21
112_A	492_S	0.805	0.21
101_T	216_I	0.800	0.21
77_D	253_E	0.799	0.21
403_L	461_V	0.797	0.21
150_E	154_I	0.794	0.20
102_M	292_K	0.794	0.20
231_P	545_R	0.792	0.20
51_E	55_N	0.791	0.20
325_D	465_F	0.791	0.20
318_R	574_C	0.790	0.20
403_L	532_H	0.789	0.20
162_P	445_G	0.789	0.20
62_Y	286_I	0.789	0.20
13_I	39_P	0.788	0.20
380_L	584_T	0.786	0.20
362_I	388_R	0.785	0.20
280_V	547_K	0.782	0.20
431_T	465_F	0.782	0.20
410_A	461_V	0.782	0.20
450_G	459_F	0.781	0.20
383_I	527_N	0.781	0.20
322_V	548_M	0.779	0.20
12_L	113_Y	0.779	0.20
55_N	183_D	0.779	0.20
102_M	153_K	0.778	0.20
64_A	459_F	0.778	0.20
492_S	527_N	0.776	0.20
206_H	490_F	0.776	0.20
95_D	543_T	0.776	0.20
444_E	470_R	0.774	0.20
274_R	563_L	0.773	0.20
161_L	350_L	0.772	0.20
254_F	320_I	0.771	0.20
151_V	229_S	0.769	0.20
500_Q	503_D	0.768	0.20
343_K	377_M	0.767	0.20
100_G	161_L	0.767	0.20
50_V	372_K	0.767	0.20
76_D	120_R	0.766	0.20
278_E	456_K	0.765	0.20
171_E	202_L	0.765	0.20
160_D	222_L	0.764	0.19
135_D	445_G	0.764	0.19
66_Y	158_E	0.764	0.19
358_A	410_A	0.763	0.19
78_I	245_T	0.757	0.19
104_G	319_S	0.756	0.19
119_K	123_R	0.755	0.19
357_L	465_F	0.755	0.19
208_I	383_I	0.754	0.19
589_S	593_A	0.752	0.19
101_T	417_K	0.749	0.19
319_S	497_S	0.749	0.19
402_T	457_T	0.748	0.19
351_T	520_M	0.747	0.19
387_D	409_L	0.746	0.19
350_L	397_L	0.746	0.19
40_E	213_E	0.745	0.19
177_D	421_F	0.745	0.19
248_Q	279_A	0.744	0.19
169_M	243_D	0.743	0.19
402_T	456_K	0.743	0.19
501_L	576_L	0.743	0.19
180_P	183_D	0.742	0.19
223_S	408_V	0.739	0.19
328_K	394_Q	0.739	0.19
352_L	357_L	0.736	0.19
86_V	98_V	0.735	0.19
27_I	45_I	0.735	0.19
355_N	400_L	0.732	0.18
344_E	572_T	0.732	0.18
254_F	408_V	0.732	0.18
152_L	374_Q	0.731	0.18
72_H	188_I	0.731	0.18
32_E	432_S	0.728	0.18
84_E	495_V	0.728	0.18
400_L	577_F	0.727	0.18
211_L	214_V	0.725	0.18
313_I	316_K	0.724	0.18
295_A	546_E	0.723	0.18
164_M	183_D	0.723	0.18
522_L	529_E	0.723	0.18
452_P	455_K	0.723	0.18
64_A	85_A	0.722	0.18
28_D	495_V	0.722	0.18
489_Y	562_G	0.721	0.18
5_E	91_A	0.720	0.18
341_E	589_S	0.720	0.18
296_K	572_T	0.720	0.18
167_V	191_L	0.720	0.18
301_V	546_E	0.719	0.18
169_M	198_I	0.719	0.18
223_S	504_I	0.718	0.18
298_F	600_Q	0.718	0.18
560_A	594_E	0.718	0.18
381_V	453_L	0.718	0.18
101_T	221_F	0.717	0.18
555_K	559_K	0.716	0.18
166_N	425_T	0.716	0.18
36_I	77_D	0.716	0.18
156_R	214_V	0.715	0.18
357_L	538_I	0.714	0.18
87_K	297_E	0.711	0.18
50_V	454_G	0.709	0.18
497_S	547_K	0.709	0.18
468_N	584_T	0.708	0.18
19_G	393_L	0.708	0.18
295_A	299_I	0.708	0.18
186_R	484_D	0.707	0.18
501_L	572_T	0.707	0.18
425_T	599_I	0.706	0.18
18_M	45_I	0.706	0.18
251_A	370_L	0.706	0.18
355_N	436_I	0.704	0.18
135_D	422_P	0.703	0.18
409_L	466_N	0.702	0.18
206_H	588_R	0.702	0.18
294_R	304_E	0.701	0.18
285_P	480_E	0.701	0.18
391_I	418_I	0.701	0.18
19_G	231_P	0.700	0.18
464_A	468_N	0.698	0.17
107_T	118_I	0.698	0.17
355_N	364_N	0.697	0.17
389_N	518_G	0.697	0.17
388_R	396_H	0.697	0.17
195_I	223_S	0.697	0.17
493_Q	537_G	0.696	0.17
386_R	537_G	0.696	0.17
182_S	274_R	0.696	0.17
419_G	429_D	0.696	0.17
321_I	392_G	0.694	0.17
127_Y	151_V	0.694	0.17
320_I	496_Y	0.694	0.17
313_I	317_K	0.694	0.17
389_N	493_Q	0.691	0.17
47_K	114_S	0.691	0.17
386_R	389_N	0.691	0.17
320_I	411_I	0.689	0.17
32_E	385_C	0.688	0.17
416_S	447_S	0.686	0.17
109_N	231_P	0.683	0.17
170_H	176_Q	0.683	0.17
454_G	501_L	0.683	0.17
435_L	530_F	0.682	0.17
475_A	562_G	0.680	0.17
492_S	501_L	0.680	0.17
137_L	155_A	0.680	0.17
166_N	531_I	0.679	0.17
237_R	552_G	0.679	0.17
128_L	343_K	0.679	0.17
469_V	573_A	0.676	0.17
469_V	540_L	0.676	0.17
117_E	546_E	0.676	0.17
476_V	507_E	0.676	0.17
277_A	582_L	0.676	0.17
394_Q	589_S	0.675	0.17
219_D	563_L	0.675	0.17
432_S	538_I	0.674	0.17
232_S	428_Y	0.674	0.17
213_E	564_A	0.673	0.17
363_S	366_A	0.673	0.17
442_F	448_L	0.672	0.17
63_G	541_S	0.672	0.17
400_L	583_I	0.671	0.17
56_I	352_L	0.668	0.17
331_S	454_G	0.668	0.17
357_L	584_T	0.668	0.17
371_V	545_R	0.668	0.17
325_D	581_Y	0.668	0.17
133_E	492_S	0.668	0.17
243_D	259_A	0.668	0.17
439_I	473_D	0.667	0.17
81_M	132_E	0.667	0.17
357_L	536_P	0.666	0.17
181_L	368_G	0.666	0.17
208_I	257_Q	0.662	0.16
358_A	419_G	0.660	0.16
238_L	336_L	0.660	0.16
325_D	420_D	0.660	0.16
434_D	438_L	0.657	0.16
202_L	431_T	0.657	0.16
90_R	132_E	0.656	0.16
495_V	501_L	0.655	0.16
325_D	569_L	0.655	0.16
275_A	373_Q	0.653	0.16
69_L	135_D	0.653	0.16
433_F	489_Y	0.653	0.16
14_G	355_N	0.651	0.16
491_V	581_Y	0.649	0.16
383_I	563_L	0.649	0.16
430_L	558_Q	0.649	0.16
487_A	562_G	0.648	0.16
303_H	512_K	0.647	0.16
236_G	358_A	0.646	0.16
596_T	599_I	0.646	0.16
411_I	590_D	0.646	0.16
305_R	411_I	0.645	0.16
382_H	389_N	0.643	0.16
389_N	414_D	0.643	0.16
372_K	375_L	0.642	0.16
387_D	399_G	0.641	0.16
69_L	445_G	0.640	0.16
149_R	153_K	0.640	0.16
35_N	61_T	0.640	0.16
66_Y	127_Y	0.640	0.16
384_T	388_R	0.638	0.16
419_G	445_G	0.637	0.16
45_I	108_F	0.636	0.16
39_P	248_Q	0.635	0.16
459_F	535_I	0.635	0.16
148_A	190_D	0.634	0.16
567_R	598_Y	0.632	0.16
349_A	406_N	0.631	0.16
117_E	512_K	0.630	0.16
382_H	537_G	0.630	0.16
414_D	537_G	0.630	0.16
392_G	429_D	0.629	0.16
22_L	419_G	0.628	0.16
423_G	516_Y	0.628	0.16
308_P	376_D	0.627	0.16
8_Q	307_E	0.626	0.16
81_M	279_A	0.625	0.15
96_A	196_V	0.624	0.15
21_L	25_Y	0.623	0.15
22_L	100_G	0.622	0.15
357_L	520_M	0.621	0.15
292_K	297_E	0.621	0.15
175_L	417_K	0.620	0.15
91_A	411_I	0.620	0.15
125_Q	445_G	0.618	0.15
44_R	600_Q	0.618	0.15
61_T	405_L	0.618	0.15
167_V	230_L	0.618	0.15
564_A	568_S	0.617	0.15
345_A	597_S	0.617	0.15
292_K	304_E	0.616	0.15
50_V	499_Q	0.616	0.15
170_H	202_L	0.613	0.15
105_I	108_F	0.613	0.15
219_D	544_I	0.613	0.15
355_N	464_A	0.611	0.15
55_N	62_Y	0.611	0.15
432_S	534_E	0.611	0.15
172_Q	475_A	0.610	0.15
50_V	280_V	0.609	0.15
169_M	584_T	0.609	0.15
85_A	231_P	0.608	0.15
216_I	588_R	0.608	0.15
8_Q	90_R	0.608	0.15
246_Y	534_E	0.608	0.15
471_H	496_Y	0.607	0.15
62_Y	423_G	0.606	0.15
111_N	339_A	0.606	0.15
188_I	404_G	0.605	0.15
366_A	536_P	0.605	0.15
39_P	135_D	0.604	0.15
360_P	391_I	0.604	0.15
472_L	541_S	0.604	0.15
394_Q	445_G	0.602	0.15
419_G	467_P	0.601	0.15
175_L	198_I	0.600	0.15
57_I	87_K	0.600	0.15
118_I	375_L	0.600	0.15
593_A	597_S	0.598	0.15
357_L	391_I	0.598	0.15
296_K	301_V	0.597	0.15
285_P	423_G	0.597	0.15
529_E	548_M	0.597	0.15
319_S	492_S	0.596	0.15
419_G	532_H	0.595	0.15
438_L	531_I	0.594	0.15
516_Y	582_L	0.594	0.15
401_D	411_I	0.594	0.15
523_T	559_K	0.594	0.15
280_V	339_A	0.593	0.15
544_I	568_S	0.593	0.15
259_A	360_P	0.593	0.15
356_S	587_L	0.592	0.15
408_V	411_I	0.591	0.15
364_N	595_L	0.589	0.15
228_S	531_I	0.589	0.15
90_R	94_G	0.588	0.15
399_G	412_T	0.587	0.15
543_T	547_K	0.587	0.15
51_E	261_I	0.587	0.15
175_L	407_D	0.586	0.15
385_C	409_L	0.585	0.14
45_I	500_Q	0.585	0.14
224_V	337_S	0.585	0.14
229_S	416_S	0.584	0.14
14_G	407_D	0.583	0.14
385_C	584_T	0.583	0.14
21_L	371_V	0.583	0.14
365_V	377_M	0.583	0.14
548_M	561_E	0.582	0.14
183_D	428_Y	0.582	0.14
317_K	496_Y	0.582	0.14
65_N	68_K	0.581	0.14
13_I	426_S	0.581	0.14
207_M	286_I	0.581	0.14
118_I	142_Y	0.581	0.14
322_V	427_V	0.580	0.14
518_G	537_G	0.580	0.14
13_I	126_L	0.580	0.14
52_A	57_I	0.579	0.14
195_I	571_D	0.579	0.14
58_Q	62_Y	0.578	0.14
204_P	467_P	0.578	0.14
329_K	434_D	0.578	0.14
77_D	146_E	0.577	0.14
102_M	173_G	0.576	0.14
207_M	222_L	0.575	0.14
97_Y	591_L	0.575	0.14
12_L	163_I	0.575	0.14
76_D	79_K	0.575	0.14
22_L	532_H	0.573	0.14
126_L	276_M	0.573	0.14
319_S	470_R	0.572	0.14
30_C	552_G	0.572	0.14
221_F	279_A	0.572	0.14
236_G	466_N	0.571	0.14
249_N	277_A	0.571	0.14
90_R	148_A	0.570	0.14
63_G	237_R	0.570	0.14
331_S	371_V	0.569	0.14
85_A	88_I	0.569	0.14
58_Q	394_Q	0.566	0.14
168_S	421_F	0.566	0.14
357_L	423_G	0.565	0.14
144_D	278_E	0.564	0.14
166_N	331_S	0.564	0.14
37_S	85_A	0.564	0.14
357_L	364_N	0.564	0.14
133_E	388_R	0.562	0.14
136_G	567_R	0.562	0.14
271_N	565_I	0.560	0.14
80_K	84_E	0.560	0.14
362_I	570_L	0.560	0.14
321_I	380_L	0.559	0.14
532_H	536_P	0.559	0.14
426_S	437_R	0.558	0.14
119_K	122_F	0.558	0.14
12_L	549_A	0.557	0.14
318_R	447_S	0.557	0.14
50_V	485_C	0.557	0.14
10_Q	442_F	0.556	0.14
104_G	229_S	0.555	0.14
245_T	259_A	0.555	0.14
431_T	580_I	0.554	0.14
383_I	388_R	0.554	0.14
495_V	515_I	0.554	0.14
90_R	214_V	0.554	0.14
164_M	195_I	0.553	0.14
408_V	490_F	0.551	0.14
394_Q	429_D	0.551	0.14
66_Y	82_N	0.549	0.14
201_R	507_E	0.547	0.14
375_L	502_V	0.547	0.14
97_Y	262_I	0.547	0.14
394_Q	450_G	0.547	0.14
56_I	293_T	0.546	0.14
255_R	280_V	0.546	0.14
145_L	566_A	0.545	0.14
332_F	563_L	0.545	0.14
34_L	48_A	0.545	0.14
515_I	561_E	0.544	0.13
399_G	432_S	0.544	0.13
122_F	126_L	0.543	0.13
13_I	277_A	0.543	0.13
12_L	56_I	0.543	0.13
239_V	566_A	0.542	0.13
358_A	538_I	0.542	0.13
533_N	537_G	0.542	0.13
105_I	461_V	0.541	0.13
354_D	493_Q	0.540	0.13
354_D	386_R	0.540	0.13
196_V	524_S	0.539	0.13
336_L	375_L	0.539	0.13
40_E	92_S	0.538	0.13
40_E	278_E	0.537	0.13
315_A	512_K	0.537	0.13
325_D	520_M	0.537	0.13
163_I	307_E	0.537	0.13
156_R	192_G	0.536	0.13
354_D	518_G	0.536	0.13
363_S	523_T	0.536	0.13
340_A	375_L	0.536	0.13
398_M	453_L	0.535	0.13
419_G	424_A	0.535	0.13
529_E	566_A	0.534	0.13
404_G	580_I	0.534	0.13
66_Y	121_S	0.534	0.13
4_L	198_I	0.534	0.13
355_N	583_I	0.534	0.13
464_A	581_Y	0.534	0.13
429_D	467_P	0.533	0.13
391_I	396_H	0.533	0.13
179_T	491_V	0.532	0.13
311_D	460_S	0.532	0.13
102_M	402_T	0.532	0.13
364_N	577_F	0.531	0.13
473_D	546_E	0.531	0.13
26_G	419_G	0.530	0.13
33_E	75_E	0.530	0.13
442_F	485_C	0.530	0.13
88_I	112_A	0.529	0.13
26_G	422_P	0.529	0.13
231_P	326_P	0.528	0.13
543_T	558_Q	0.527	0.13
321_I	385_C	0.527	0.13
502_V	572_T	0.526	0.13
456_K	509_K	0.526	0.13
442_F	551_A	0.526	0.13
187_S	344_E	0.526	0.13
151_V	158_E	0.525	0.13
228_S	244_D	0.524	0.13
256_K	294_R	0.524	0.13
243_D	568_S	0.523	0.13
259_A	326_P	0.522	0.13
398_M	433_F	0.520	0.13
5_E	373_Q	0.520	0.13
71_R	202_L	0.519	0.13
22_L	459_F	0.518	0.13
281_G	549_A	0.518	0.13
34_L	398_M	0.517	0.13
417_K	438_L	0.517	0.13
79_K	564_A	0.517	0.13
185_L	546_E	0.515	0.13
296_K	337_S	0.514	0.13
91_A	405_L	0.514	0.13
42_I	295_A	0.514	0.13
44_R	48_A	0.514	0.13
385_C	556_E	0.513	0.13
139_L	563_L	0.511	0.13
34_L	485_C	0.511	0.13
85_A	549_A	0.511	0.13
439_I	466_N	0.511	0.13
354_D	414_D	0.511	0.13
354_D	382_H	0.511	0.13
357_L	431_T	0.510	0.13
51_E	317_K	0.509	0.13
450_G	514_P	0.507	0.13
148_A	444_E	0.507	0.13
11_V	244_D	0.505	0.13
166_N	517_I	0.505	0.13
71_R	533_N	0.505	0.13
191_L	563_L	0.505	0.13
531_I	536_P	0.503	0.13
357_L	527_N	0.502	0.13
230_L	356_S	0.502	0.13
222_L	245_T	0.502	0.13
433_F	478_R	0.502	0.13
23_Y	26_G	0.501	0.13
279_A	326_P	0.501	0.13
527_N	584_T	0.500	0.13
71_R	120_R	0.500	0.13
495_V	575_E	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1q7zA	1	0.8464	100	0.666	Contact Map
4m3pA	4	0.5588	100	0.674	Contact Map
4cczA	1	0.8382	100	0.683	Contact Map
3aptA	2	0.4592	100	0.752	Contact Map
3fstA	4	0.4542	100	0.766	Contact Map
3ijdA	2	0.4265	100	0.788	Contact Map
2h9aA	1	0.4199	97.9	0.966	Contact Map
1f76A	1	0.402	97.5	0.969	Contact Map
3noyA	2	0.5327	97.1	0.97	Contact Map
3igsA	1	0.348	97.1	0.971	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0155 seconds.