YFMR - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YFMR - Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YfmR

UniProt:	O06476	Sequences: MSILKAENLYKTYGDKTLFDHISFHIEENERIGLIGPNGTGKSTLLKVIAGLESIEEGEITKSGSVQVEFLHQDPELPAGQTVLEHIYSGESAVMKTLREYEKALYELGKDPENEQRQKHLLAAQAKMDANNAWDANTLAKTVLSKLGVNDVTKPVNELSGGQKKRVAIAKNLIQPADLLILDEPTNHLDNETIEWLEGYLSQYPGAVMLVTHDRYFLNRVTNRIYELERGSLYTYKGNYEVFLEKRAEREAQAEQKETKRQNLLRRELAWLRRGAKARSTKQKARIDRVETLKEQTGPQSSGSLDFAIGSHRLGKQVIEAENVMIAYDGRMLVDRFNELVIPGERIGIIGPNGIGKTTLLNALAGRHTPDGGDITIGQTVRIGYYTQDHSEMNGELKVIDYIKETAEVVKTADGDMITAEQMLERFLFPRSMQQTYIRKLSGGEKRRLYLLQVLMQEPNVLFLDEPTNDLDTETLSVLEDYIDQFPGVVITVSHDRYFLDRVVDRLIVFEGNGVISRFQGSYSDYMEESKAKKAAPKPAAEEKTAEAEPKKKRKKLSYKDQLEWDGIEDKIAQLEEKHEQLEADIAAAGSDFGKIQELMAEQAKTAEELEAAMDRWTELSLMIEELES	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	629 (503)
Sequences:	457 (261)
Seq/√Len:	11.6

ECOLI - UUP YHES ETTA GSIA YBIT YBHF
BACSU - YFMR YDIF YFMM YKPA EXPZ YKOD
SULSO - Y1893 Q980K5 Y2030

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
8_N	21_H	5.106	1.00
219_N	241_E	4.018	0.99
48_V	60_I	3.778	0.99
436_T	440_K	3.747	0.99
85_E	88_Y	3.243	0.97
105_L	108_L	3.233	0.97
398_K	401_D	3.195	0.97
83_V	86_H	3.146	0.96
31_R	221_V	3.068	0.96
285_A	288_D	3.065	0.96
84_L	87_I	2.980	0.95
78_P	89_S	2.920	0.94
46_L	211_V	2.918	0.94
102_E	105_L	2.912	0.94
311_S	487_P	2.855	0.94
101_Y	105_L	2.756	0.92
248_A	252_A	2.749	0.92
6_A	24_F	2.704	0.92
400_I	434_Q	2.670	0.91
279_R	286_R	2.590	0.90
322_E	374_D	2.588	0.90
78_P	85_E	2.535	0.89
88_Y	91_E	2.469	0.87
276_A	279_R	2.463	0.87
80_G	85_E	2.447	0.87
125_Q	129_D	2.428	0.87
111_D	114_N	2.409	0.86
78_P	83_V	2.378	0.85
275_G	279_R	2.362	0.85
81_Q	85_E	2.358	0.85
90_G	105_L	2.334	0.84
263_N	266_R	2.326	0.84
79_A	87_I	2.312	0.84
83_V	87_I	2.285	0.83
78_P	87_I	2.237	0.81
79_A	86_H	2.228	0.81
82_T	85_E	2.211	0.81
149_V	159_L	2.202	0.80
344_G	347_I	2.172	0.79
101_Y	108_L	2.164	0.79
269_L	273_R	2.135	0.78
445_E	460_N	2.113	0.77
187_N	214_D	2.079	0.76
321_A	339_E	2.054	0.75
198_E	220_R	2.049	0.75
78_P	84_L	2.015	0.74
101_Y	104_A	2.009	0.74
273_R	287_I	1.966	0.72
288_D	292_T	1.952	0.71
79_A	85_E	1.948	0.71
277_K	283_Q	1.943	0.71
7_E	11_K	1.937	0.71
80_G	157_N	1.933	0.71
188_H	427_F	1.917	0.70
258_E	262_Q	1.912	0.70
433_M	436_T	1.879	0.68
215_R	479_L	1.868	0.68
79_A	83_V	1.858	0.68
365_A	505_D	1.841	0.67
11_K	48_V	1.838	0.67
91_E	94_V	1.835	0.67
255_E	333_L	1.822	0.66
82_T	87_I	1.822	0.66
321_A	324_V	1.812	0.65
218_L	227_E	1.810	0.65
403_I	434_Q	1.808	0.65
86_H	89_S	1.807	0.65
278_A	283_Q	1.802	0.65
323_N	336_R	1.761	0.63
271_W	470_D	1.735	0.62
85_E	89_S	1.717	0.61
79_A	84_L	1.675	0.59
272_L	287_I	1.658	0.58
78_P	86_H	1.650	0.58
20_D	60_I	1.646	0.58
24_F	226_Y	1.645	0.58
80_G	89_S	1.641	0.58
348_G	370_P	1.634	0.57
187_N	469_N	1.626	0.57
285_A	294_K	1.613	0.56
90_G	109_G	1.609	0.56
363_A	370_P	1.596	0.55
268_E	271_W	1.595	0.55
326_I	329_D	1.590	0.55
90_G	96_K	1.589	0.55
16_K	43_S	1.574	0.54
397_L	405_E	1.568	0.54
217_F	350_I	1.567	0.54
239_N	242_V	1.562	0.54
100_E	120_H	1.552	0.53
202_S	220_R	1.551	0.53
212_T	239_N	1.550	0.53
160_S	354_G	1.545	0.53
124_A	483_I	1.542	0.53
358_T	449_L	1.538	0.52
341_V	347_I	1.538	0.52
199_G	202_S	1.527	0.52
80_G	83_V	1.509	0.51
144_L	479_L	1.495	0.50
255_E	336_R	1.489	0.50
180_L	494_S	1.485	0.50
80_G	87_I	1.477	0.49
311_S	486_F	1.475	0.49
24_F	87_I	1.473	0.49
205_P	386_Y	1.470	0.49
443_G	488_G	1.469	0.49
36_G	41_G	1.468	0.49
96_K	100_E	1.466	0.49
269_L	287_I	1.461	0.49
392_E	450_Y	1.455	0.48
215_R	286_R	1.450	0.48
231_G	245_E	1.445	0.48
46_L	426_R	1.438	0.48
79_A	89_S	1.433	0.47
146_K	149_V	1.426	0.47
21_H	80_G	1.414	0.46
173_L	448_R	1.410	0.46
78_P	81_Q	1.406	0.46
228_L	233_L	1.404	0.46
356_G	466_E	1.402	0.46
91_E	105_L	1.402	0.46
281_T	285_A	1.398	0.46
46_L	56_E	1.397	0.46
315_G	378_G	1.392	0.45
26_I	32_I	1.380	0.45
100_E	105_L	1.378	0.45
268_E	278_A	1.375	0.44
319_I	461_V	1.373	0.44
239_N	252_A	1.367	0.44
126_A	131_N	1.367	0.44
38_N	353_N	1.364	0.44
268_E	470_D	1.357	0.44
275_G	280_S	1.348	0.43
20_D	52_L	1.344	0.43
103_K	107_E	1.343	0.43
263_N	341_V	1.339	0.43
90_G	93_A	1.337	0.43
220_R	483_I	1.333	0.42
282_K	470_D	1.331	0.42
126_A	130_A	1.330	0.42
80_G	84_L	1.330	0.42
400_I	403_I	1.328	0.42
106_Y	109_G	1.328	0.42
68_V	80_G	1.327	0.42
448_R	471_L	1.314	0.41
322_E	376_T	1.312	0.41
87_I	177_A	1.307	0.41
149_V	292_T	1.301	0.41
123_A	127_K	1.298	0.41
275_G	278_A	1.297	0.41
277_K	282_K	1.297	0.41
148_G	166_R	1.297	0.41
91_E	101_Y	1.295	0.41
427_F	452_L	1.292	0.40
268_E	283_Q	1.290	0.40
204_Y	208_V	1.286	0.40
97_T	127_K	1.283	0.40
81_Q	87_I	1.283	0.40
78_P	88_Y	1.277	0.40
90_G	100_E	1.274	0.40
92_S	101_Y	1.260	0.39
98_L	104_A	1.252	0.39
178_D	372_G	1.251	0.38
93_A	108_L	1.244	0.38
324_V	392_E	1.237	0.38
276_A	280_S	1.236	0.38
245_E	249_E	1.233	0.38
43_S	47_K	1.230	0.38
89_S	92_S	1.225	0.37
281_T	287_I	1.223	0.37
210_L	222_T	1.212	0.37
326_I	371_D	1.209	0.37
233_L	270_A	1.209	0.37
50_A	62_K	1.208	0.36
100_E	104_A	1.207	0.36
91_E	95_M	1.203	0.36
335_D	372_G	1.200	0.36
92_S	95_M	1.199	0.36
276_A	283_Q	1.199	0.36
147_L	196_W	1.195	0.36
6_A	494_S	1.194	0.36
429_F	445_E	1.193	0.36
424_L	427_F	1.193	0.36
55_I	60_I	1.193	0.36
324_V	380_T	1.190	0.36
188_H	469_N	1.188	0.36
278_A	282_K	1.186	0.35
47_K	52_L	1.180	0.35
194_I	460_N	1.178	0.35
13_Y	56_E	1.168	0.35
272_L	290_V	1.161	0.34
287_I	294_K	1.159	0.34
247_R	496_D	1.157	0.34
452_L	507_L	1.155	0.34
160_S	356_G	1.153	0.34
160_S	466_E	1.153	0.34
162_G	466_E	1.153	0.34
162_G	356_G	1.153	0.34
96_K	105_L	1.145	0.34
400_I	405_E	1.145	0.34
214_D	469_N	1.142	0.34
363_A	375_I	1.134	0.33
170_A	326_I	1.130	0.33
163_Q	212_T	1.128	0.33
44_T	201_L	1.127	0.33
464_L	468_T	1.127	0.33
81_Q	86_H	1.122	0.33
160_S	495_H	1.121	0.33
122_L	129_D	1.121	0.33
79_A	88_Y	1.120	0.33
95_M	105_L	1.111	0.32
197_L	443_G	1.109	0.32
397_L	401_D	1.106	0.32
314_L	507_L	1.102	0.32
202_S	487_P	1.101	0.32
171_K	247_R	1.096	0.32
190_D	351_G	1.095	0.31
462_L	488_G	1.093	0.31
188_H	452_L	1.088	0.31
160_S	183_D	1.087	0.31
19_F	180_L	1.086	0.31
30_E	224_R	1.084	0.31
213_H	353_N	1.079	0.31
219_N	363_A	1.077	0.31
213_H	444_G	1.075	0.31
315_G	460_N	1.075	0.31
265_L	507_L	1.073	0.31
163_Q	461_V	1.073	0.31
26_I	439_R	1.072	0.31
394_N	500_L	1.071	0.30
36_G	39_G	1.068	0.30
320_E	375_I	1.065	0.30
10_Y	57_E	1.062	0.30
282_K	285_A	1.062	0.30
190_D	495_H	1.061	0.30
268_E	279_R	1.057	0.30
354_G	466_E	1.056	0.30
122_L	126_A	1.054	0.30
419_T	422_Q	1.052	0.30
334_V	459_P	1.050	0.30
18_L	443_G	1.049	0.30
179_L	318_V	1.046	0.29
416_D	419_T	1.044	0.29
427_F	469_N	1.043	0.29
210_L	225_I	1.041	0.29
183_D	190_D	1.038	0.29
4_L	116_Q	1.037	0.29
90_G	108_L	1.032	0.29
197_L	448_R	1.031	0.29
146_K	159_L	1.031	0.29
388_Q	466_E	1.029	0.29
356_G	388_Q	1.029	0.29
118_Q	126_A	1.027	0.29
83_V	88_Y	1.022	0.28
166_R	471_L	1.020	0.28
362_N	397_L	1.016	0.28
354_G	495_H	1.015	0.28
9_L	45_L	1.015	0.28
120_H	124_A	1.013	0.28
489_V	499_F	1.013	0.28
149_V	165_K	1.013	0.28
328_Y	333_L	1.012	0.28
169_I	469_N	1.010	0.28
155_P	363_A	1.010	0.28
382_R	422_Q	1.008	0.28
186_T	373_G	1.007	0.28
384_G	505_D	0.998	0.28
385_Y	424_L	0.997	0.27
49_I	99_R	0.995	0.27
40_T	370_P	0.994	0.27
396_E	401_D	0.992	0.27
357_K	465_D	0.992	0.27
183_D	354_G	0.990	0.27
90_G	101_Y	0.989	0.27
159_L	165_K	0.982	0.27
80_G	395_G	0.979	0.27
22_I	115_E	0.973	0.27
173_L	196_W	0.973	0.27
365_A	463_F	0.973	0.27
213_H	488_G	0.972	0.26
188_H	424_L	0.968	0.26
242_V	375_I	0.965	0.26
378_G	460_N	0.964	0.26
91_E	102_E	0.964	0.26
364_L	471_L	0.962	0.26
323_N	439_R	0.958	0.26
30_E	48_V	0.957	0.26
220_R	249_E	0.953	0.26
46_L	458_E	0.953	0.26
211_V	461_V	0.953	0.26
124_A	127_K	0.949	0.26
271_W	279_R	0.948	0.26
390_H	470_D	0.947	0.26
4_L	103_K	0.946	0.26
184_E	353_N	0.935	0.25
180_L	218_L	0.933	0.25
93_A	101_Y	0.928	0.25
280_S	285_A	0.927	0.25
19_F	22_I	0.925	0.25
32_I	491_I	0.923	0.25
39_G	42_K	0.921	0.25
247_R	329_D	0.917	0.24
91_E	100_E	0.912	0.24
84_L	88_Y	0.908	0.24
84_L	89_S	0.908	0.24
399_V	406_T	0.905	0.24
187_N	213_H	0.904	0.24
9_L	112_P	0.901	0.24
97_T	363_A	0.900	0.24
23_S	60_I	0.900	0.24
277_K	284_K	0.899	0.24
202_S	491_I	0.899	0.24
326_I	363_A	0.894	0.24
208_V	221_V	0.893	0.24
161_G	468_T	0.887	0.23
396_E	483_I	0.887	0.23
283_Q	294_K	0.886	0.23
284_K	288_D	0.885	0.23
186_T	469_N	0.885	0.23
73_Q	488_G	0.881	0.23
258_E	261_R	0.881	0.23
47_K	54_S	0.873	0.23
8_N	82_T	0.872	0.23
96_K	103_K	0.867	0.23
266_R	434_Q	0.867	0.23
268_E	277_K	0.866	0.23
248_A	366_G	0.866	0.23
99_R	102_E	0.864	0.23
4_L	267_R	0.864	0.23
388_Q	472_D	0.862	0.22
69_E	172_N	0.862	0.22
259_T	263_N	0.861	0.22
279_R	282_K	0.861	0.22
68_V	96_K	0.856	0.22
408_E	421_E	0.854	0.22
6_A	31_R	0.853	0.22
167_V	270_A	0.853	0.22
426_R	478_V	0.849	0.22
160_S	190_D	0.849	0.22
161_G	472_D	0.846	0.22
88_Y	104_A	0.846	0.22
8_N	52_L	0.845	0.22
38_N	42_K	0.844	0.22
314_L	318_V	0.841	0.22
226_Y	403_I	0.839	0.22
280_S	290_V	0.839	0.22
35_I	355_I	0.838	0.22
38_N	73_Q	0.837	0.22
275_G	283_Q	0.836	0.22
38_N	444_G	0.836	0.22
192_E	240_Y	0.835	0.22
7_E	13_Y	0.835	0.22
276_A	285_A	0.834	0.22
378_G	381_V	0.834	0.22
249_E	252_A	0.834	0.22
185_P	467_P	0.833	0.21
26_I	89_S	0.832	0.21
98_L	101_Y	0.832	0.21
238_G	242_V	0.831	0.21
319_I	331_R	0.829	0.21
41_G	351_G	0.829	0.21
201_L	208_V	0.827	0.21
21_H	59_E	0.823	0.21
273_R	284_K	0.822	0.21
329_D	332_M	0.822	0.21
144_L	177_A	0.821	0.21
218_L	269_L	0.820	0.21
165_K	470_D	0.819	0.21
399_V	402_Y	0.818	0.21
183_D	472_D	0.816	0.21
97_T	124_A	0.811	0.21
394_N	397_L	0.810	0.21
92_S	105_L	0.809	0.21
346_R	494_S	0.808	0.21
196_W	448_R	0.808	0.21
162_G	354_G	0.806	0.21
193_T	243_F	0.806	0.21
448_R	462_L	0.805	0.21
318_V	449_L	0.802	0.20
339_E	508_I	0.801	0.20
42_K	184_E	0.798	0.20
195_E	224_R	0.795	0.20
212_T	238_G	0.795	0.20
367_R	376_T	0.795	0.20
357_K	466_E	0.793	0.20
356_G	465_D	0.793	0.20
6_A	22_I	0.792	0.20
100_E	127_K	0.786	0.20
231_G	483_I	0.786	0.20
21_H	483_I	0.785	0.20
24_F	45_L	0.781	0.20
160_S	388_Q	0.780	0.20
162_G	388_Q	0.780	0.20
166_R	170_A	0.779	0.20
105_L	109_G	0.779	0.20
345_E	505_D	0.778	0.20
494_S	501_D	0.777	0.20
146_K	470_D	0.775	0.20
161_G	354_G	0.775	0.20
213_H	442_S	0.775	0.20
323_N	394_N	0.775	0.20
36_G	42_K	0.774	0.20
7_E	103_K	0.772	0.20
187_N	448_R	0.772	0.20
358_T	510_F	0.771	0.20
163_Q	261_R	0.770	0.19
42_K	442_S	0.769	0.19
11_K	181_I	0.769	0.19
80_G	96_K	0.769	0.19
196_W	488_G	0.768	0.19
35_I	48_V	0.767	0.19
18_L	147_L	0.764	0.19
54_S	99_R	0.764	0.19
226_Y	481_D	0.763	0.19
448_R	488_G	0.762	0.19
92_S	108_L	0.762	0.19
4_L	48_V	0.762	0.19
375_I	504_V	0.761	0.19
429_F	451_L	0.758	0.19
120_H	205_P	0.758	0.19
212_T	425_E	0.758	0.19
224_R	376_T	0.757	0.19
321_A	364_L	0.756	0.19
265_L	271_W	0.755	0.19
42_K	444_G	0.754	0.19
326_I	368_H	0.753	0.19
95_M	108_L	0.753	0.19
102_E	108_L	0.752	0.19
184_E	442_S	0.751	0.19
281_T	288_D	0.751	0.19
386_Y	391_S	0.750	0.19
190_D	354_G	0.750	0.19
250_R	365_A	0.749	0.19
166_R	196_W	0.747	0.19
488_G	496_D	0.747	0.19
33_G	218_L	0.747	0.19
131_N	508_I	0.747	0.19
115_E	119_K	0.745	0.19
351_G	357_K	0.744	0.19
351_G	465_D	0.744	0.19
185_P	353_N	0.741	0.19
276_A	282_K	0.740	0.19
31_R	231_G	0.738	0.18
82_T	88_Y	0.736	0.18
447_R	455_L	0.736	0.18
13_Y	241_E	0.736	0.18
122_L	333_L	0.736	0.18
183_D	465_D	0.729	0.18
183_D	357_K	0.729	0.18
216_Y	226_Y	0.729	0.18
23_S	202_S	0.729	0.18
88_Y	93_A	0.726	0.18
52_L	57_E	0.725	0.18
318_V	460_N	0.724	0.18
106_Y	130_A	0.723	0.18
184_E	444_G	0.722	0.18
213_H	496_D	0.722	0.18
90_G	106_Y	0.721	0.18
477_S	492_T	0.721	0.18
262_Q	345_E	0.720	0.18
136_A	140_A	0.719	0.18
265_L	292_T	0.719	0.18
39_G	44_T	0.719	0.18
355_I	510_F	0.718	0.18
88_Y	105_L	0.716	0.18
83_V	494_S	0.714	0.18
233_L	490_V	0.714	0.18
82_T	89_S	0.713	0.18
146_K	349_I	0.712	0.18
353_N	488_G	0.711	0.18
139_L	256_Q	0.711	0.18
167_V	383_I	0.711	0.18
263_N	295_E	0.710	0.18
433_M	440_K	0.710	0.18
49_I	72_H	0.708	0.18
167_V	426_R	0.706	0.18
188_H	385_Y	0.705	0.18
72_H	172_N	0.705	0.18
118_Q	204_Y	0.704	0.18
253_Q	438_I	0.703	0.17
92_S	102_E	0.703	0.17
275_G	480_E	0.702	0.17
400_I	404_K	0.697	0.17
80_G	153_T	0.697	0.17
427_F	494_S	0.696	0.17
353_N	444_G	0.696	0.17
95_M	102_E	0.695	0.17
173_L	197_L	0.692	0.17
104_A	108_L	0.692	0.17
282_K	288_D	0.690	0.17
133_A	459_P	0.688	0.17
276_A	288_D	0.687	0.17
212_T	362_N	0.687	0.17
397_L	404_K	0.686	0.17
68_V	209_M	0.686	0.17
61_T	396_E	0.685	0.17
401_D	404_K	0.684	0.17
397_L	400_I	0.683	0.17
323_N	372_G	0.681	0.17
354_G	388_Q	0.681	0.17
164_K	389_D	0.681	0.17
4_L	54_S	0.678	0.17
282_K	290_V	0.678	0.17
343_P	461_V	0.677	0.17
163_Q	386_Y	0.676	0.17
93_A	96_K	0.676	0.17
163_Q	349_I	0.674	0.17
196_W	315_G	0.673	0.17
373_G	388_Q	0.673	0.17
28_E	479_L	0.672	0.17
346_R	420_A	0.671	0.17
28_E	137_N	0.671	0.17
271_W	278_A	0.671	0.17
17_T	21_H	0.670	0.17
38_N	184_E	0.669	0.17
112_P	116_Q	0.669	0.17
263_N	505_D	0.668	0.17
13_Y	48_V	0.668	0.17
180_L	187_N	0.668	0.17
157_N	368_H	0.668	0.17
22_I	180_L	0.664	0.16
103_K	108_L	0.664	0.16
366_G	369_T	0.664	0.16
265_L	350_I	0.663	0.16
479_L	483_I	0.661	0.16
31_R	420_A	0.661	0.16
92_S	98_L	0.660	0.16
73_Q	213_H	0.660	0.16
93_A	98_L	0.659	0.16
95_M	101_Y	0.656	0.16
117_R	490_V	0.656	0.16
271_W	282_K	0.655	0.16
119_K	122_L	0.655	0.16
418_I	508_I	0.655	0.16
356_G	495_H	0.655	0.16
466_E	495_H	0.655	0.16
5_K	494_S	0.654	0.16
23_S	505_D	0.653	0.16
348_G	500_L	0.653	0.16
284_K	287_I	0.651	0.16
326_I	392_E	0.650	0.16
94_V	101_Y	0.649	0.16
353_N	496_D	0.648	0.16
48_V	360_L	0.648	0.16
7_E	17_T	0.643	0.16
204_Y	420_A	0.643	0.16
182_L	353_N	0.642	0.16
421_E	431_R	0.642	0.16
271_W	348_G	0.642	0.16
481_D	485_Q	0.641	0.16
164_K	333_L	0.641	0.16
483_I	490_V	0.639	0.16
43_S	121_L	0.637	0.16
186_T	427_F	0.637	0.16
428_L	440_K	0.636	0.16
265_L	272_L	0.636	0.16
38_N	187_N	0.636	0.16
239_N	399_V	0.635	0.16
326_I	450_Y	0.635	0.16
49_I	132_N	0.635	0.16
256_Q	449_L	0.633	0.16
275_G	293_L	0.633	0.16
26_I	57_E	0.631	0.16
9_L	56_E	0.631	0.16
239_N	257_K	0.631	0.16
209_M	481_D	0.630	0.15
6_A	19_F	0.629	0.15
271_W	277_K	0.629	0.15
31_R	52_L	0.628	0.15
131_N	200_Y	0.627	0.15
160_S	472_D	0.627	0.15
93_A	99_R	0.627	0.15
318_V	461_V	0.626	0.15
480_E	499_F	0.626	0.15
315_G	445_E	0.626	0.15
191_N	224_R	0.625	0.15
227_E	477_S	0.623	0.15
10_Y	115_E	0.623	0.15
443_G	496_D	0.623	0.15
151_D	154_K	0.621	0.15
169_I	214_D	0.620	0.15
202_S	235_T	0.620	0.15
100_E	333_L	0.620	0.15
232_S	336_R	0.619	0.15
249_E	316_K	0.618	0.15
279_R	285_A	0.617	0.15
22_I	97_T	0.616	0.15
277_K	280_S	0.616	0.15
391_S	483_I	0.615	0.15
6_A	508_I	0.615	0.15
19_F	46_L	0.614	0.15
188_H	428_L	0.614	0.15
17_T	65_S	0.613	0.15
104_A	505_D	0.613	0.15
176_P	363_A	0.612	0.15
104_A	116_Q	0.611	0.15
279_R	480_E	0.610	0.15
126_A	508_I	0.610	0.15
490_V	508_I	0.610	0.15
429_F	475_T	0.609	0.15
268_E	476_L	0.608	0.15
13_Y	221_V	0.607	0.15
351_G	495_H	0.606	0.15
279_R	292_T	0.605	0.15
20_D	81_Q	0.604	0.15
81_Q	89_S	0.603	0.15
208_V	386_Y	0.602	0.15
73_Q	443_G	0.601	0.15
52_L	55_I	0.601	0.15
132_N	247_R	0.600	0.15
268_E	276_A	0.600	0.15
112_P	150_N	0.597	0.15
38_N	213_H	0.596	0.15
5_K	8_N	0.595	0.15
113_E	122_L	0.594	0.15
189_L	468_T	0.593	0.15
164_K	243_F	0.593	0.15
257_K	325_M	0.592	0.15
401_D	406_T	0.592	0.15
122_L	131_N	0.591	0.15
349_I	461_V	0.591	0.15
265_L	290_V	0.587	0.14
282_K	459_P	0.587	0.14
263_N	483_I	0.585	0.14
203_Q	341_V	0.585	0.14
159_L	163_Q	0.582	0.14
219_N	333_L	0.581	0.14
446_K	489_V	0.581	0.14
236_Y	250_R	0.581	0.14
190_D	472_D	0.581	0.14
73_Q	448_R	0.580	0.14
203_Q	322_E	0.577	0.14
218_L	242_V	0.577	0.14
183_D	495_H	0.577	0.14
89_S	105_L	0.576	0.14
81_Q	84_L	0.575	0.14
378_G	496_D	0.575	0.14
396_E	439_R	0.574	0.14
185_P	442_S	0.574	0.14
7_E	21_H	0.574	0.14
144_L	178_D	0.571	0.14
364_L	463_F	0.570	0.14
54_S	126_A	0.569	0.14
165_K	279_R	0.569	0.14
91_E	98_L	0.569	0.14
73_Q	197_L	0.568	0.14
205_P	208_V	0.566	0.14
9_L	61_T	0.566	0.14
4_L	81_Q	0.565	0.14
468_T	471_L	0.565	0.14
217_F	499_F	0.563	0.14
83_V	155_P	0.563	0.14
45_L	97_T	0.562	0.14
280_S	387_T	0.562	0.14
113_E	116_Q	0.561	0.14
268_E	475_T	0.559	0.14
101_Y	134_W	0.557	0.14
20_D	232_S	0.557	0.14
348_G	504_V	0.556	0.14
5_K	27_E	0.555	0.14
258_E	297_T	0.555	0.14
283_Q	447_R	0.555	0.14
41_G	190_D	0.554	0.14
98_L	105_L	0.554	0.14
383_I	416_D	0.554	0.14
205_P	306_D	0.554	0.14
344_G	364_L	0.553	0.14
331_R	383_I	0.552	0.14
187_N	488_G	0.552	0.14
91_E	104_A	0.550	0.14
427_F	451_L	0.548	0.13
315_G	427_F	0.548	0.13
88_Y	101_Y	0.547	0.13
420_A	434_Q	0.546	0.13
162_G	357_K	0.545	0.13
162_G	465_D	0.545	0.13
182_L	185_P	0.545	0.13
166_R	468_T	0.545	0.13
160_S	359_T	0.545	0.13
199_G	323_N	0.544	0.13
384_G	507_L	0.544	0.13
351_G	356_G	0.544	0.13
351_G	466_E	0.544	0.13
160_S	465_D	0.543	0.13
160_S	357_K	0.543	0.13
59_E	62_K	0.542	0.13
226_Y	477_S	0.541	0.13
156_V	167_V	0.541	0.13
493_V	510_F	0.541	0.13
196_W	443_G	0.540	0.13
233_L	501_D	0.539	0.13
270_A	509_V	0.537	0.13
4_L	115_E	0.537	0.13
194_I	315_G	0.537	0.13
429_F	455_L	0.536	0.13
165_K	282_K	0.535	0.13
82_T	86_H	0.534	0.13
93_A	105_L	0.533	0.13
443_G	479_L	0.532	0.13
202_S	398_K	0.532	0.13
176_P	323_N	0.531	0.13
279_R	470_D	0.531	0.13
159_L	470_D	0.531	0.13
204_Y	456_M	0.531	0.13
135_D	333_L	0.529	0.13
182_L	444_G	0.529	0.13
418_I	422_Q	0.529	0.13
183_D	356_G	0.529	0.13
183_D	466_E	0.529	0.13
95_M	99_R	0.527	0.13
354_G	472_D	0.526	0.13
383_I	486_F	0.526	0.13
395_G	409_V	0.524	0.13
185_P	197_L	0.524	0.13
149_V	470_D	0.523	0.13
256_Q	259_T	0.523	0.13
92_S	104_A	0.522	0.13
425_E	431_R	0.521	0.13
280_S	283_Q	0.520	0.13
36_G	44_T	0.520	0.13
209_M	375_I	0.520	0.13
304_S	335_D	0.519	0.13
285_A	290_V	0.519	0.13
99_R	105_L	0.518	0.13
410_V	440_K	0.518	0.13
194_I	360_L	0.517	0.13
270_A	322_E	0.515	0.13
186_T	467_P	0.513	0.13
237_K	243_F	0.512	0.13
387_T	423_M	0.511	0.13
281_T	316_K	0.511	0.13
184_E	443_G	0.510	0.13
128_M	281_T	0.510	0.13
134_W	233_L	0.509	0.13
4_L	86_H	0.509	0.13
5_K	19_F	0.508	0.13
188_H	213_H	0.507	0.13
208_V	219_N	0.507	0.13
80_G	86_H	0.506	0.13
343_P	507_L	0.505	0.13
219_N	504_V	0.505	0.13
226_Y	255_E	0.504	0.13
190_D	357_K	0.503	0.12
190_D	465_D	0.503	0.12
59_E	107_E	0.503	0.12
187_N	471_L	0.503	0.12
399_V	405_E	0.502	0.12
350_I	387_T	0.501	0.12
200_Y	404_K	0.501	0.12
314_L	343_P	0.501	0.12
245_E	270_A	0.501	0.12
191_N	346_R	0.500	0.12
324_V	338_N	0.500	0.12
217_F	470_D	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4finA	2	0.8506	100	0.397	Contact Map
2iw3A	2	0.6979	100	0.484	Contact Map
4q9hA	1	0.7854	100	0.511	Contact Map
4f4cA	1	0.7409	100	0.517	Contact Map
3bk7A	1	0.8029	100	0.521	Contact Map
1yqtA	1	0.7949	100	0.526	Contact Map
3ozxA	1	0.8029	100	0.532	Contact Map
3j16B	1	0.8172	100	0.541	Contact Map
3ux8A	2	0.6725	100	0.573	Contact Map
2vf7A	2	0.7329	100	0.649	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.