MAEN - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

MAEN - Na(+)-malate symporter

UniProt:	O05256	Sequences: MGAIPKTGTISPEQKDSQEKNLFQKIWSWEIGVIPLPLYTVLAVIIILAAYYNELPANMLGGFAIIMILGVFLGDIGQRIPILKDIGGPAILSLFVPSFLVFYNVLNSTSLDAVTNLMKTSNFLYFYIACLVVGSILGMNRIVLIQGFIRMFVPLVAGTIAAVAAGILVGFIFGYSAYDSFFFVVVPIIAGGIGEGILPLSIAYSQILGSSADVFVSQLVPAAIIGNVFAIICAALMKKLGDKRPDLNGNGRLVKSKKANEIFNQKEAEAKIDFKLMGAGVLLACTFFIFGGLLEKFIFIPGAILMIISAAAVKYANILPKKMEEGAYQLYKFISSSFTWPLMVGLGILFIPLDDVASVISIPFVIICISVVIAMIGSGYFVGKLMNMYPVESAIVTCCHSGLGGTGDVAILSASGRMGLMPFAQISTRLGGAGTVICATVLLRFFTS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	448 (421)
Sequences:	381 (252)
Seq/√Len:	12.3

BACSU - MAEN CIMH

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
99_F	103_Y	4.993	1.00
287_F	313_V	4.543	1.00
75_D	79_R	4.148	1.00
95_F	228_V	4.069	1.00
236_L	240_L	4.058	1.00
167_I	177_A	3.876	0.99
127_Y	339_T	3.600	0.99
169_V	370_S	3.294	0.98
227_N	403_L	3.285	0.98
155_L	400_H	3.106	0.97
400_H	428_T	2.988	0.96
124_L	194_G	2.984	0.96
170_G	180_S	2.973	0.96
229_F	369_I	2.881	0.95
395_I	415_S	2.745	0.93
166_G	185_V	2.737	0.93
409_V	421_M	2.713	0.93
291_G	306_M	2.641	0.92
118_M	345_G	2.546	0.90
188_I	226_G	2.523	0.90
332_K	336_S	2.521	0.90
238_K	242_D	2.453	0.89
376_I	394_A	2.452	0.89
278_G	337_S	2.310	0.85
245_P	248_N	2.284	0.85
295_E	302_G	2.253	0.84
106_L	284_A	2.215	0.83
115_T	349_L	2.079	0.78
293_L	308_I	2.055	0.78
314_K	324_E	2.041	0.77
56_P	61_G	2.027	0.77
220_V	225_I	2.025	0.77
248_N	392_E	2.015	0.76
164_A	366_I	2.013	0.76
374_A	378_S	1.994	0.75
126_F	430_L	1.990	0.75
395_I	418_M	1.970	0.74
123_F	342_L	1.969	0.74
147_G	423_F	1.948	0.74
308_I	312_A	1.941	0.73
221_P	314_K	1.938	0.73
222_A	403_L	1.918	0.72
293_L	297_F	1.907	0.72
197_I	223_A	1.893	0.71
159_T	375_M	1.883	0.71
217_S	430_L	1.882	0.71
117_L	343_M	1.878	0.71
190_A	428_T	1.873	0.71
139_M	314_K	1.870	0.70
314_K	422_P	1.861	0.70
44_V	373_I	1.849	0.69
159_T	400_H	1.828	0.69
339_T	406_T	1.820	0.68
167_I	185_V	1.816	0.68
348_I	351_I	1.808	0.68
237_M	351_I	1.799	0.67
297_F	413_S	1.793	0.67
59_M	127_Y	1.783	0.67
284_A	394_A	1.777	0.66
278_G	334_I	1.769	0.66
108_S	112_D	1.768	0.66
99_F	357_A	1.768	0.66
225_I	368_C	1.744	0.65
301_P	428_T	1.732	0.64
44_V	312_A	1.727	0.64
76_I	156_V	1.725	0.64
30_E	446_F	1.707	0.63
126_F	299_F	1.706	0.63
374_A	402_G	1.698	0.63
245_P	250_N	1.679	0.62
135_S	291_G	1.657	0.61
171_F	177_A	1.650	0.60
347_G	399_C	1.647	0.60
94_L	351_I	1.614	0.59
73_L	96_V	1.613	0.58
282_L	415_S	1.582	0.57
375_M	400_H	1.582	0.57
357_A	427_S	1.564	0.56
151_M	155_L	1.558	0.56
203_A	436_V	1.553	0.55
250_N	419_G	1.552	0.55
59_M	288_F	1.547	0.55
74_G	340_W	1.544	0.55
133_V	430_L	1.528	0.54
343_M	371_V	1.527	0.54
103_Y	353_L	1.508	0.53
165_A	374_A	1.496	0.53
415_S	419_G	1.484	0.52
34_I	160_I	1.464	0.51
221_P	423_F	1.463	0.51
84_K	446_F	1.458	0.51
189_I	197_I	1.444	0.50
277_M	326_G	1.432	0.49
349_L	406_T	1.431	0.49
373_I	381_F	1.427	0.49
184_V	314_K	1.413	0.48
401_S	428_T	1.411	0.48
182_F	436_V	1.410	0.48
44_V	164_A	1.388	0.47
161_A	374_A	1.380	0.47
150_R	184_V	1.379	0.47
167_I	181_F	1.354	0.45
83_L	218_Q	1.349	0.45
40_T	76_I	1.347	0.45
44_V	168_L	1.333	0.44
124_L	425_Q	1.323	0.44
53_N	109_T	1.315	0.43
411_I	428_T	1.306	0.43
384_K	390_P	1.306	0.43
93_S	197_I	1.304	0.43
281_V	338_F	1.298	0.43
130_C	330_L	1.279	0.42
173_F	363_P	1.274	0.41
338_F	437_I	1.262	0.41
290_F	309_S	1.260	0.41
312_A	394_A	1.255	0.40
59_M	345_G	1.252	0.40
241_G	245_P	1.252	0.40
98_S	352_P	1.247	0.40
246_D	250_N	1.246	0.40
53_N	318_I	1.240	0.40
237_M	391_V	1.238	0.40
151_M	402_G	1.237	0.40
401_S	408_D	1.234	0.39
114_V	342_L	1.234	0.39
330_L	392_E	1.229	0.39
210_S	214_V	1.222	0.39
222_A	341_P	1.213	0.38
173_F	176_S	1.212	0.38
100_L	105_V	1.206	0.38
386_M	446_F	1.197	0.38
316_A	327_A	1.195	0.38
83_L	92_L	1.193	0.37
240_L	247_L	1.192	0.37
24_Q	427_S	1.182	0.37
220_V	392_E	1.182	0.37
335_S	343_M	1.181	0.37
411_I	436_V	1.179	0.37
195_E	303_A	1.176	0.37
410_A	425_Q	1.171	0.36
426_I	430_L	1.169	0.36
84_K	208_L	1.164	0.36
216_V	423_F	1.163	0.36
88_G	425_Q	1.163	0.36
47_I	51_Y	1.161	0.36
39_Y	72_F	1.159	0.36
259_A	416_G	1.158	0.36
248_N	334_I	1.157	0.36
400_H	411_I	1.154	0.36
94_L	117_L	1.149	0.35
126_F	281_V	1.146	0.35
30_E	361_S	1.144	0.35
339_T	342_L	1.138	0.35
193_I	388_M	1.138	0.35
31_I	225_I	1.131	0.35
197_I	241_G	1.124	0.34
302_G	352_P	1.116	0.34
329_Q	337_S	1.114	0.34
217_S	313_V	1.109	0.34
30_E	76_I	1.106	0.33
89_P	342_L	1.104	0.33
199_P	425_Q	1.095	0.33
80_I	241_G	1.094	0.33
65_I	288_F	1.093	0.33
88_G	131_L	1.091	0.33
237_M	248_N	1.085	0.32
278_G	307_I	1.084	0.32
132_V	201_S	1.076	0.32
409_V	433_A	1.076	0.32
39_Y	392_E	1.076	0.32
189_I	194_G	1.073	0.32
63_F	76_I	1.071	0.32
114_V	232_I	1.070	0.32
150_R	314_K	1.070	0.32
205_S	212_A	1.065	0.32
305_L	440_T	1.052	0.31
293_L	361_S	1.048	0.31
31_I	36_L	1.048	0.31
107_N	189_I	1.043	0.31
266_K	373_I	1.041	0.31
188_I	427_S	1.037	0.30
95_F	206_Q	1.036	0.30
46_I	391_V	1.034	0.30
76_I	80_I	1.032	0.30
369_I	373_I	1.030	0.30
151_M	428_T	1.030	0.30
233_C	373_I	1.030	0.30
119_K	350_F	1.027	0.30
47_I	100_L	1.025	0.30
184_V	222_A	1.023	0.30
128_I	306_M	1.021	0.30
226_G	406_T	1.017	0.30
155_L	428_T	1.016	0.29
91_I	441_V	1.015	0.29
40_T	160_I	1.015	0.29
159_T	428_T	1.013	0.29
237_M	241_G	1.011	0.29
206_Q	381_F	1.004	0.29
30_E	96_V	1.004	0.29
148_F	154_P	1.003	0.29
378_S	402_G	1.002	0.29
97_P	304_I	1.000	0.29
44_V	210_S	1.000	0.29
162_A	230_A	0.999	0.29
413_S	436_V	0.997	0.29
156_V	274_F	0.995	0.29
34_I	167_I	0.994	0.29
295_E	312_A	0.990	0.28
139_M	423_F	0.987	0.28
132_V	426_I	0.981	0.28
31_I	299_F	0.981	0.28
43_A	91_I	0.980	0.28
221_P	410_A	0.980	0.28
95_F	216_V	0.978	0.28
325_E	386_M	0.977	0.28
193_I	346_L	0.975	0.28
301_P	401_S	0.973	0.28
188_I	408_D	0.973	0.28
160_I	258_K	0.971	0.28
304_I	411_I	0.970	0.28
158_G	444_R	0.969	0.28
80_I	366_I	0.969	0.28
34_I	53_N	0.968	0.28
56_P	345_G	0.968	0.28
318_I	392_E	0.967	0.27
421_M	433_A	0.967	0.27
190_A	364_F	0.964	0.27
226_G	425_Q	0.963	0.27
422_P	426_I	0.962	0.27
335_S	437_I	0.958	0.27
169_V	430_L	0.957	0.27
335_S	361_S	0.957	0.27
298_I	365_V	0.956	0.27
69_L	143_V	0.952	0.27
201_S	209_G	0.947	0.27
46_I	50_A	0.947	0.27
237_M	364_F	0.944	0.27
99_F	360_I	0.940	0.26
180_S	184_V	0.937	0.26
313_V	319_L	0.934	0.26
240_L	244_R	0.933	0.26
298_I	435_T	0.932	0.26
231_I	392_E	0.930	0.26
114_V	209_G	0.928	0.26
283_L	366_I	0.923	0.26
100_L	326_G	0.922	0.26
253_L	426_I	0.918	0.26
138_G	307_I	0.918	0.26
408_D	428_T	0.918	0.26
170_G	410_A	0.917	0.25
214_V	247_L	0.916	0.25
306_M	333_F	0.913	0.25
230_A	351_I	0.912	0.25
180_S	310_A	0.910	0.25
220_V	413_S	0.910	0.25
400_H	408_D	0.908	0.25
139_M	234_A	0.908	0.25
212_A	356_V	0.907	0.25
304_I	436_V	0.904	0.25
301_P	436_V	0.902	0.25
350_F	356_V	0.899	0.25
294_L	305_L	0.899	0.25
141_R	145_I	0.894	0.25
400_H	427_S	0.894	0.25
117_L	193_I	0.893	0.25
48_L	286_T	0.888	0.24
61_G	118_M	0.887	0.24
204_Y	234_A	0.886	0.24
126_F	278_G	0.884	0.24
317_N	324_E	0.882	0.24
45_I	137_L	0.881	0.24
122_N	125_Y	0.881	0.24
427_S	430_L	0.875	0.24
157_A	378_S	0.874	0.24
74_G	367_I	0.874	0.24
303_A	436_V	0.872	0.24
211_S	297_F	0.870	0.24
97_P	154_P	0.870	0.24
89_P	153_V	0.868	0.24
312_A	444_R	0.868	0.24
236_L	268_A	0.867	0.24
250_N	348_I	0.867	0.24
154_P	379_G	0.866	0.24
75_D	371_V	0.865	0.24
65_I	298_I	0.864	0.23
345_G	430_L	0.863	0.23
259_A	389_Y	0.862	0.23
104_N	419_G	0.862	0.23
140_N	319_L	0.856	0.23
223_A	388_M	0.854	0.23
92_L	226_G	0.854	0.23
168_L	287_F	0.852	0.23
319_L	324_E	0.851	0.23
360_I	393_S	0.849	0.23
193_I	324_E	0.847	0.23
100_L	214_V	0.847	0.23
196_G	199_P	0.843	0.23
37_P	41_V	0.843	0.23
255_K	308_I	0.842	0.23
96_V	394_A	0.841	0.23
70_G	93_S	0.838	0.23
168_L	172_I	0.837	0.23
209_G	308_I	0.836	0.22
233_C	376_I	0.835	0.22
405_G	409_V	0.835	0.22
258_K	266_K	0.831	0.22
164_A	309_S	0.831	0.22
156_V	164_A	0.830	0.22
266_K	323_M	0.830	0.22
140_N	277_M	0.826	0.22
181_F	416_G	0.826	0.22
426_I	435_T	0.823	0.22
158_G	379_G	0.821	0.22
116_N	236_L	0.814	0.22
200_L	213_D	0.813	0.22
375_M	428_T	0.807	0.21
223_A	403_L	0.807	0.21
53_N	105_V	0.805	0.21
168_L	171_F	0.805	0.21
290_F	294_L	0.804	0.21
313_V	361_S	0.800	0.21
226_G	235_A	0.799	0.21
155_L	401_S	0.793	0.21
281_V	307_I	0.793	0.21
97_P	411_I	0.793	0.21
357_A	361_S	0.793	0.21
35_P	38_L	0.790	0.21
59_M	354_D	0.789	0.21
220_V	437_I	0.787	0.21
307_I	341_P	0.786	0.21
186_V	436_V	0.785	0.21
143_V	151_M	0.785	0.21
114_V	435_T	0.785	0.21
236_L	318_I	0.784	0.21
128_I	194_G	0.784	0.21
94_L	343_M	0.783	0.21
44_V	48_L	0.783	0.21
88_G	227_N	0.783	0.21
173_F	244_R	0.783	0.21
195_E	436_V	0.780	0.21
408_D	427_S	0.778	0.21
273_D	307_I	0.778	0.21
375_M	411_I	0.778	0.21
112_D	357_A	0.774	0.20
74_G	97_P	0.773	0.20
63_F	242_D	0.772	0.20
126_F	213_D	0.771	0.20
106_L	348_I	0.771	0.20
216_V	403_L	0.771	0.20
226_G	403_L	0.769	0.20
193_I	423_F	0.767	0.20
106_L	409_V	0.767	0.20
47_I	255_K	0.766	0.20
102_F	354_D	0.766	0.20
141_R	244_R	0.765	0.20
208_L	225_I	0.765	0.20
172_I	180_S	0.763	0.20
164_A	168_L	0.763	0.20
203_A	301_P	0.762	0.20
319_L	382_V	0.762	0.20
237_M	408_D	0.761	0.20
172_I	243_K	0.761	0.20
373_I	439_A	0.760	0.20
70_G	231_I	0.760	0.20
224_I	403_L	0.760	0.20
41_V	313_V	0.758	0.20
221_P	443_L	0.757	0.20
165_A	378_S	0.756	0.20
114_V	415_S	0.755	0.20
184_V	219_L	0.755	0.20
117_L	216_V	0.752	0.20
195_E	402_G	0.752	0.20
39_Y	58_N	0.747	0.19
346_L	403_L	0.746	0.19
377_G	446_F	0.744	0.19
140_N	406_T	0.744	0.19
307_I	440_T	0.744	0.19
342_L	409_V	0.743	0.19
175_Y	413_S	0.740	0.19
133_V	306_M	0.739	0.19
180_S	226_G	0.734	0.19
307_I	410_A	0.732	0.19
362_I	366_I	0.729	0.19
132_V	231_I	0.728	0.19
399_C	424_A	0.728	0.19
85_D	215_F	0.727	0.19
216_V	221_P	0.726	0.19
258_K	262_I	0.725	0.19
177_A	367_I	0.724	0.19
80_I	211_S	0.722	0.19
303_A	380_Y	0.721	0.19
59_M	361_S	0.720	0.19
273_D	370_S	0.719	0.19
45_I	212_A	0.719	0.19
96_V	304_I	0.719	0.19
157_A	257_K	0.718	0.19
94_L	403_L	0.718	0.19
230_A	237_M	0.718	0.19
112_D	171_F	0.716	0.19
132_V	287_F	0.716	0.19
293_L	298_I	0.714	0.18
307_I	338_F	0.714	0.18
131_L	427_S	0.714	0.18
73_L	164_A	0.713	0.18
248_N	295_E	0.713	0.18
58_N	283_L	0.710	0.18
69_L	76_I	0.708	0.18
221_P	403_L	0.707	0.18
342_L	433_A	0.707	0.18
43_A	282_L	0.706	0.18
93_S	349_L	0.705	0.18
105_V	176_S	0.704	0.18
66_I	346_L	0.702	0.18
254_V	335_S	0.700	0.18
61_G	347_G	0.698	0.18
56_P	280_G	0.697	0.18
258_K	389_Y	0.695	0.18
348_I	442_L	0.695	0.18
246_D	372_V	0.695	0.18
145_I	204_Y	0.695	0.18
352_P	396_V	0.690	0.18
61_G	230_A	0.689	0.18
168_L	323_M	0.688	0.18
35_P	48_L	0.688	0.18
208_L	293_L	0.688	0.18
219_L	314_K	0.688	0.18
64_A	282_L	0.686	0.18
116_N	393_S	0.686	0.18
241_G	391_V	0.685	0.18
380_Y	411_I	0.685	0.18
281_V	413_S	0.683	0.18
248_N	351_I	0.682	0.18
46_I	90_A	0.681	0.17
276_L	319_L	0.680	0.17
271_K	446_F	0.679	0.17
55_L	231_I	0.679	0.17
195_E	397_T	0.678	0.17
401_S	427_S	0.676	0.17
203_A	411_I	0.675	0.17
131_L	307_I	0.674	0.17
92_L	305_L	0.672	0.17
184_V	413_S	0.672	0.17
104_N	177_A	0.672	0.17
238_K	381_F	0.672	0.17
94_L	222_A	0.672	0.17
197_I	216_V	0.670	0.17
193_I	221_P	0.669	0.17
407_G	432_G	0.668	0.17
47_I	434_G	0.667	0.17
151_M	400_H	0.662	0.17
190_A	215_F	0.660	0.17
193_I	216_V	0.659	0.17
143_V	377_G	0.659	0.17
421_M	425_Q	0.659	0.17
157_A	400_H	0.659	0.17
363_P	367_I	0.655	0.17
114_V	171_F	0.654	0.17
41_V	317_N	0.653	0.17
299_F	444_R	0.652	0.17
38_L	162_A	0.652	0.17
209_G	215_F	0.652	0.17
387_N	438_C	0.651	0.17
109_T	394_A	0.649	0.17
44_V	377_G	0.649	0.17
108_S	209_G	0.649	0.17
157_A	375_M	0.648	0.17
351_I	391_V	0.648	0.17
152_F	188_I	0.648	0.17
126_F	334_I	0.640	0.16
151_M	427_S	0.640	0.16
312_A	316_A	0.638	0.16
98_S	415_S	0.635	0.16
200_L	436_V	0.635	0.16
195_E	411_I	0.635	0.16
344_V	440_T	0.635	0.16
97_P	224_I	0.635	0.16
207_I	443_L	0.633	0.16
26_I	283_L	0.632	0.16
170_G	414_A	0.631	0.16
314_K	343_M	0.628	0.16
39_Y	91_I	0.628	0.16
365_V	392_E	0.627	0.16
217_S	380_Y	0.624	0.16
98_S	411_I	0.623	0.16
66_I	350_F	0.623	0.16
40_T	245_P	0.622	0.16
194_G	425_Q	0.622	0.16
71_V	340_W	0.622	0.16
288_F	395_I	0.622	0.16
80_I	92_L	0.621	0.16
49_A	344_V	0.621	0.16
390_P	424_A	0.619	0.16
199_P	414_A	0.619	0.16
33_V	153_V	0.619	0.16
55_L	259_A	0.618	0.16
26_I	165_A	0.617	0.16
402_G	408_D	0.616	0.16
269_E	286_T	0.615	0.16
152_F	323_M	0.613	0.16
280_G	383_G	0.613	0.16
227_N	327_A	0.612	0.16
162_A	408_D	0.611	0.16
73_L	280_G	0.610	0.15
250_N	286_T	0.608	0.15
150_R	288_F	0.608	0.15
150_R	414_A	0.608	0.15
412_L	431_G	0.606	0.15
283_L	324_E	0.606	0.15
307_I	334_I	0.601	0.15
98_S	428_T	0.601	0.15
159_T	351_I	0.600	0.15
59_M	384_K	0.600	0.15
65_I	155_L	0.598	0.15
409_V	423_F	0.597	0.15
301_P	400_H	0.596	0.15
151_M	401_S	0.596	0.15
206_Q	298_I	0.595	0.15
255_K	287_F	0.594	0.15
55_L	70_G	0.594	0.15
188_I	284_A	0.593	0.15
295_E	299_F	0.593	0.15
139_M	410_A	0.591	0.15
221_P	425_Q	0.590	0.15
188_I	439_A	0.589	0.15
152_F	317_N	0.589	0.15
97_P	402_G	0.588	0.15
294_L	392_E	0.588	0.15
375_M	396_V	0.587	0.15
101_V	125_Y	0.587	0.15
146_Q	319_L	0.587	0.15
287_F	300_I	0.587	0.15
110_S	362_I	0.585	0.15
211_S	236_L	0.584	0.15
180_S	323_M	0.582	0.15
131_L	300_I	0.582	0.15
144_L	395_I	0.582	0.15
127_Y	409_V	0.581	0.15
35_P	102_F	0.580	0.15
45_I	228_V	0.579	0.15
339_T	409_V	0.579	0.15
375_M	427_S	0.577	0.15
380_Y	383_G	0.574	0.15
226_G	433_A	0.574	0.15
80_I	446_F	0.574	0.15
34_I	51_Y	0.573	0.15
53_N	385_L	0.572	0.15
88_G	397_T	0.572	0.15
139_M	221_P	0.572	0.15
147_G	324_E	0.571	0.14
133_V	327_A	0.570	0.14
151_M	396_V	0.570	0.14
353_L	411_I	0.567	0.14
58_N	122_N	0.567	0.14
73_L	76_I	0.566	0.14
157_A	385_L	0.566	0.14
408_D	431_G	0.565	0.14
105_V	115_T	0.565	0.14
222_A	226_G	0.565	0.14
125_Y	300_I	0.562	0.14
353_L	371_V	0.562	0.14
120_T	311_A	0.562	0.14
342_L	350_F	0.561	0.14
42_L	289_I	0.560	0.14
106_L	444_R	0.560	0.14
185_V	436_V	0.558	0.14
197_I	401_S	0.558	0.14
42_L	277_M	0.558	0.14
190_A	436_V	0.558	0.14
396_V	428_T	0.557	0.14
50_A	64_A	0.557	0.14
111_L	240_L	0.554	0.14
30_E	271_K	0.554	0.14
200_L	437_I	0.552	0.14
72_F	113_A	0.551	0.14
294_L	309_S	0.549	0.14
405_G	425_Q	0.549	0.14
104_N	318_I	0.547	0.14
48_L	312_A	0.546	0.14
300_I	384_K	0.546	0.14
165_A	370_S	0.542	0.14
40_T	44_V	0.540	0.14
48_L	393_S	0.539	0.14
167_I	171_F	0.539	0.14
410_A	423_F	0.537	0.14
30_E	69_L	0.536	0.14
40_T	156_V	0.534	0.14
326_G	391_V	0.534	0.14
224_I	346_L	0.533	0.14
90_A	390_P	0.531	0.13
89_P	212_A	0.531	0.13
159_T	401_S	0.531	0.13
138_G	278_G	0.531	0.13
92_L	274_F	0.529	0.13
320_P	391_V	0.529	0.13
26_I	36_L	0.528	0.13
319_L	386_M	0.526	0.13
157_A	389_Y	0.526	0.13
125_Y	305_L	0.526	0.13
219_L	371_V	0.525	0.13
231_I	249_G	0.525	0.13
339_T	433_A	0.523	0.13
66_I	347_G	0.523	0.13
58_N	248_N	0.522	0.13
98_S	226_G	0.522	0.13
45_I	156_V	0.521	0.13
202_I	301_P	0.521	0.13
62_G	113_A	0.520	0.13
133_V	217_S	0.520	0.13
250_N	384_K	0.519	0.13
125_Y	352_P	0.515	0.13
240_L	441_V	0.515	0.13
82_I	156_V	0.514	0.13
189_I	431_G	0.514	0.13
194_G	342_L	0.513	0.13
70_G	392_E	0.513	0.13
159_T	411_I	0.513	0.13
56_P	60_L	0.512	0.13
230_A	402_G	0.511	0.13
73_L	366_I	0.510	0.13
123_F	350_F	0.509	0.13
224_I	368_C	0.509	0.13
146_Q	151_M	0.508	0.13
195_E	301_P	0.507	0.13
44_V	236_L	0.507	0.13
74_G	146_Q	0.507	0.13
195_E	352_P	0.506	0.13
97_P	195_E	0.505	0.13
168_L	355_D	0.505	0.13
24_Q	393_S	0.504	0.13
84_K	396_V	0.503	0.13
193_I	403_L	0.501	0.13
63_F	176_S	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4bwzA	2	0.7812	95.8	0.96	Contact Map
4czbA	2	0.3728	90.1	0.968	Contact Map
4cz8A	2	0.3661	84.9	0.97	Contact Map
3zuxA	1	0.4397	49.9	0.977	Contact Map
1zcdA	1	0.7299	48.5	0.977	Contact Map
4r0cA	3	0.8214	38.5	0.979	Contact Map
4f35D	2	0.8214	35.8	0.979	Contact Map
3qe7A	2	0.6652	19.4	0.982	Contact Map
4r1iA	2	0.8638	16.6	0.982	Contact Map
2ksfA	1	0.2388	9.5	0.984	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0121 seconds.